Научная статья на тему 'Применение методов молекулярной эпидемиологии при расшифровке вспышки гепатита А'

Применение методов молекулярной эпидемиологии при расшифровке вспышки гепатита А Текст научной статьи по специальности «Науки о здоровье»

CC BY
30
10
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по наукам о здоровье , автор научной работы — К. К. Кюрегян, П. Н. Дмитриев, С. А. Солонин, О. В. Исаева, А. С. Океании

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Текст научной работы на тему «Применение методов молекулярной эпидемиологии при расшифровке вспышки гепатита А»

вивок против ГА. Плановая вакцинопрофи-лакгика ГА у детей с 2000 года проводилась в возрасте 6 лет, с 2009 года регламентирована в возрасте 20-26 месяцев и проводится за счет средств муниципалитетов и граждан. Приви-тость цетей против ГА различна в отдельных муниципалитетах и в отдельных возрастных группах; в частности в г. Екатеринбурге при-вигость детей различных возрастов составляет от 59,6% в возрасте 3 гот,а до 93,4% в возрасте 8 лет. С 2000 года в Свердловской области накоплен успешный опыт проведения вакцино-профилактики ГА по эпидемическим показаниям в организованных детских коллективах и в отдельных населённых пунктах. Привитость профессиональных групп риска по состоянию на 01.01.10 г.: из 282483 подлежащих привито без скрининга антител к вирусу ГА - 23698 человек (10,9%), обследовано 204147 человек (81,1% от подлежащих), выявлено 77055 сероче-

гативных (37,7% обследованных), из них однократно привито 12910 человек (16,8%), двукратно - 56050 человек (72,7%). Помимо указанных групп населения проведение закцино-профилактики ГА целесообразно среди клинических групп риска: больных хроническими заболеваниями печени, в т.ч. хроническими гепатитами В и С; "носителей" вирусов гепатитов В 4 С, лиц из их окружения, а также среди непривитых допризывников.

Заболеваемость ГА в Свердловской области снизилась с показателя 50,7 на 100 тыс. населения в 2000 году до показателя 2,8 в 2009 году. В то же время, остаются высокими риски эпидемического распространения ГА, в первую очередь в муниципальных образованиях с низкими показателями привитости детей, наличием открытых источников водоснабжения и высокой степенью изношенности водопроводных «.етей.

Применение методов молекулярной эпидемиологии при расшифровке вспышки гепатите А

К.К. Кюрегян1, П.Н. Дмитриев1, С.А. Солонин1. О.В. Исаева1, Л.С. Оксанич2, Е.Б. Файзулоев2, М И Михайлов1

1. ИПВЭ им. М.П. Чумакова РАМЧ;

2. НИИ вакцин и сывороток им. И.И. Мечникова РАМН

Гепатит А (ГА) по-прежнему занимает первое мес-о в этиологии ocipbix вирусных гепатитов в Российской Федерации. Вспышки данной инфекции случаются регулярно, и расшифровка данных вспышек невозможна без применения молекулярно-биологических методов, включающих анализ нуклеотидных последовательностей выделенных штаммов вируса гепатита А (ВГА) и выделение вируса из источников внешней среды. Целью данного исследования являлась расшифровка резкого подъема заболеваемости ГА в Москве в конце декабря 2009-январе 2010 г.

С 25 декабря 2009 г. по 15 марта 2010 г. в Москве были зарегистрированы 828 случаев ГА, при этом преимущественно болели взрослые -только 67 пациентов были моложе 17 лет. Эпидемиологический анализ показа i предположительную связь заболевания с употреблением в пищ)" готовых салатов одного из подмосковных предприятий.

Материалы и методы. Были исследованы образцы сыворотки крови от 98 пациентов клиник из разных районов Москвы и 267 ра

ботников предприятия по производству салатов. Анти-ВГА класса IgM определяли набором реаге'ттов ДС-ИФА-АНТТI-HAV -М-РЕКОМБ производства ООО «НПО ДС»; Из положительных по анти-ВГА IgM образцов выделяли генетический материал набором Quia gen RNA mini kit:, и проводили обратную гранскрип-цию-ППР, щя выявления РНК ВГА. Также РНК ВГА определяли в 5 образцах воды из разных источников в самом предприятии и за его пределами. Для этого образцы объемом 3 литра концентрировали до 1 мл с помощью набора сорбента на магнитных частицах, покрытых модифицированными аминогруппами полимером диоксида кремния (производства Научно-исследовательского института вакцин и сывороток им. И.И. Мечникова РАМН) по протоколу производителя. Из полученного материала вы цел ял и РНК и далее подвергали стандартной ПЦР. Амплифштированные участки генома ВГА выде;1яли из геля с набооом Quia-gen gel extraction kit и для подтверждения специфичности и филогенетического анализа подвергали прямому секвенированию (Beck

man Coulter). Анализ нуклеотидных последовательностей ВГА проводили программами Seqman и Mega 3.1.

Результаты. Из 98 сывороток, взятых от заболевших, 81 оказались положительными по анти-ВГА IgM; из них РНК ВГА была выявлена в 56 образцах, 50 из них были включены в филогенетический анализ. Из 267 работников предприятия по производству салатов у 9 были выявлены анти-ВГА IgM; из них в 5 случаях была найдена РНК ВГА (4 сотрудника были госпитализированы с диагнозом 'гепатит А"). Образцы воды, взятые в цехе по приготовлению салатоь до и после водоподготовки, также оказались положительными по РНК ВГА.

Филогенетический анализ последовательностей показал принадлежность выделенных изолятов ВГА к генотипу IA, наиболее часто встречающемуся на территории Российской

Федерации. Изолять: В1 А, выделенные из образцов воды, взятых в цехе приготовления са-латив на предприятии, и все 5 изолятов 8ГА, выделенные от инфицированных сотрудников предприятия, оказались идентичными между собой, а также 48 изо татам, выделенным от заболевших в г. Москва и образовали с ними на филогенетическом дереве единый кластер, что свидетельствует об их идентичности и происхождении из единого источника инфицирования.

Заключение. Полученные с помощью молекулярных методов анализа результаты свидетельствуют об общем источнике инфицирования для сотрудников предприятия и проанализированных 48 случаев гепатита А в г. Москва, и позволяют предполагать в качестве первичного источника инфицирования ВГА воду из цеха прш отовления салатов.

Молекулярно-эпидемиологическая характеристика вспышечной и спорадической заболеваемости вирусным гепатитом А в России и странах СНГ з 2С05-2009 гг.

H.H. Пименов, А.Д. Неверов, И.В. Кэрандашоьа, В.А. Долгин, Г В. Михайловская,

В.П. Чуланов

ФГУН Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва

Введение. Проблема вирусного гепатита А (ГА) в России в начале XXI века продолжает оставаться актуальной. Существенное снижение уровней заболеваемости Г Л в течение последних 20 лет привета к узеличению прослойки лиц, восприимчивых к этой инфекции. При отсутствии широкого охвата населения вакцинацией против ГА и кардинального улучшения санитарно-коммунального благоустройства территории России, а также высокой активности миграционных процессов создаются предпосылки к возникновению вспышек ГА с большим количеством заболевших. Только за 3 года, с 2005 г. по 2007 г., среди населения и в различных учреждениях страны было зарегистрировано 325 вспышек, во время которых пострадало более 7800 человек. Использование молекулярно-оиоло! ических методов исследования позволяет дополнить существующие методы эпидемиологического расследования вспышек.

Цель работы заключалась в определении молекулярно-эпидемиологических характеристик ряда вспышек ГА и случаев спорадической заболеваемости гепатитом А, зарегистри-

рованных на территории России и стран СНГ в 2005-2009 гоцах.

Материалы и методы. Были исследованы 792 изолята вируса гепатита А (ВГА), выделенных при спорадических случаях заболевания: 247 изо.мтов о" пациентов из России, 22 - от пациентов из Киргизии, 355 - от пациентов из Таджикистана и 168 - от пациентов из Украины.

Также быта исследовано 427 изо 1Ятов, выделенных во время вспышек/случаев групповой заболеваемости ГА, которые протекали в ряде регионов РФ в период с 2005 по 2009 гг.: г. Ржев (2005 г., 20 образцов), г. Нижний Новгород (2005 г., 36), г. Северодвинск (2006 г., 14), п. Коряжма (2006 г., 13), Сахалинская обл. (2006 г., 30; 2007 г., 18), Кемеровская обл. (2006 г., 14), г. Нерюнгри (Якутия) (2007 г., 11), г. Екатеринбург (2006 г., 11), Новгородская обл. (2007 г., 18), Республика Тыва (2008 г., 53 и 11), г. Махачкала (2008, 44), г. Рязань (2009 г., 14), г. Ка шнинград (2009 г., 8). г. Радужный (Ханты-Мансиискии АО) (2009 г., 10), г. Уфа (Башкортастан) (2009 г., 23), и п. Костичо Рязанской области (2009 г., 69), Красноярский край (2009 г., 10).

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.