CC BY
8man Coulter). Анализ нуклеотидных последовательностей ВГА проводили программами Seqman и Mega 3.1.
Результаты. Из 98 сывороток, взятых от заболевших, 81 оказались положительными по анти-ВГА IgM; из них РНК ВГА была выявлена в 56 образцах, 50 из них были включены в филогенетический анализ. Из 267 работников предприятия по производству салатов у 9 были выявлены анти-ВГА IgM; из них в 5 случаях была найдена РНК ВГА (4 сотрудника были госпитализированы с диагнозом 'гепатит А"). Образцы воды, взятые в цехе по приготовлению салатоь до и после водоподготовки, также оказались положительными по РНК ВГА.
Филогенетический анализ последовательностей показал принадлежность выделенных изолятов ВГА к генотипу IA, наиболее часто встречающемуся на территории Российской
Федерации. Изолять: В1 А, выделенные из образцов воды, взятых в цехе приготовления са-латив на предприятии, и все 5 изолятов 8ГА, выделенные от инфицированных сотрудников предприятия, оказались идентичными между собой, а также 48 изо татам, выделенным от заболевших в г. Москва и образовали с ними на филогенетическом дереве единый кластер, что свидетельствует об их идентичности и происхождении из единого источника инфицирования.
Заключение. Полученные с помощью молекулярных методов анализа результаты свидетельствуют об общем источнике инфицирования для сотрудников предприятия и проанализированных 48 случаев гепатита А в г. Москва, и позволяют предполагать в качестве первичного источника инфицирования ВГА воду из цеха прш отовления салатов.
Молекулярно-эпидемиологическая характеристика вспышечной и спорадической заболеваемости вирусным гепатитом А в России и странах СНГ з 2С05-2009 гг.
H.H. Пименов, А.Д. Неверов, И.В. Кэрандашоьа, В.А. Долгин, Г В. Михайловская,
В.П. Чуланов
ФГУН Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва
Введение. Проблема вирусного гепатита А (ГА) в России в начале XXI века продолжает оставаться актуальной. Существенное снижение уровней заболеваемости Г Л в течение последних 20 лет привета к узеличению прослойки лиц, восприимчивых к этой инфекции. При отсутствии широкого охвата населения вакцинацией против ГА и кардинального улучшения санитарно-коммунального благоустройства территории России, а также высокой активности миграционных процессов создаются предпосылки к возникновению вспышек ГА с большим количеством заболевших. Только за 3 года, с 2005 г. по 2007 г., среди населения и в различных учреждениях страны было зарегистрировано 325 вспышек, во время которых пострадало более 7800 человек. Использование молекулярно-оиоло! ических методов исследования позволяет дополнить существующие методы эпидемиологического расследования вспышек.
Цель работы заключалась в определении молекулярно-эпидемиологических характеристик ряда вспышек ГА и случаев спорадической заболеваемости гепатитом А, зарегистри-
рованных на территории России и стран СНГ в 2005-2009 гоцах.
Материалы и методы. Были исследованы 792 изолята вируса гепатита А (ВГА), выделенных при спорадических случаях заболевания: 247 изо.мтов о" пациентов из России, 22 - от пациентов из Киргизии, 355 - от пациентов из Таджикистана и 168 - от пациентов из Украины.
Также быта исследовано 427 изо 1Ятов, выделенных во время вспышек/случаев групповой заболеваемости ГА, которые протекали в ряде регионов РФ в период с 2005 по 2009 гг.: г. Ржев (2005 г., 20 образцов), г. Нижний Новгород (2005 г., 36), г. Северодвинск (2006 г., 14), п. Коряжма (2006 г., 13), Сахалинская обл. (2006 г., 30; 2007 г., 18), Кемеровская обл. (2006 г., 14), г. Нерюнгри (Якутия) (2007 г., 11), г. Екатеринбург (2006 г., 11), Новгородская обл. (2007 г., 18), Республика Тыва (2008 г., 53 и 11), г. Махачкала (2008, 44), г. Рязань (2009 г., 14), г. Ка шнинград (2009 г., 8). г. Радужный (Ханты-Мансиискии АО) (2009 г., 10), г. Уфа (Башкортастан) (2009 г., 23), и п. Костичо Рязанской области (2009 г., 69), Красноярский край (2009 г., 10).
Для определения штаммов проводилось се-квепирование двух вариабельных областей генома (маркерных последовательностей МП) ВГА: VP1/P2B длиной 410 нт и 2С длиной 648 нт. Филогенетический анализ штаммов осуществлялся методом Minimum Evolution модель TN93 (MECA 3.1), статистическая значимость филогении оценивалась методом bootstrap 1000 повторов. Идентичность пары МП двух изолятов позволяет отнести их к одному штамму. К близкородственным штаммам относили штаммы, отличающиеся друг от друга не более чем на две замены в пределах двух МП.
Результаты. На исследуемых территориях обнаружены субтипы 1А и III A BIA, которые являются наиболее распространенными в мире. 1В субтип ВГА был обнаружен у жите.ля Москвы, который за месяц до появления симптомов заболевания находился на отдыхе в Египте. По результатам генотипирования к субтипу IA относились 71% изолягов из °Ф, остальные изотяты относились к IHA субтипу, причем этот суптип являлся доминирующим на территории Якутии.
Был проведен филогенетический анализ полученных последовательностей и порядка 300 последовательностей генома BIА из GenBank, которые пересекаются с отсеквениро-ванным нами фрагментом генома BIА более чем на 300 нт. IIa филогенетическом дереве были выделены территориальные кластеры штаммов 1А субтипа: средиземноморский, кластер стран СНГ, азиатский и американский. Среди российских штаммов субтипа 1А выделяется ветвь филогенетически близких штаммов, эндемичных для европейской части страны, вызывающих более 78% спорадических случаев заболеьания ГА субтипа IA на этой территории. Все отсеквенированные штаммы IA субтипа ВГА из среднеазиатских республик ЯБ,1ЯЮТСЯ эндемичными для стран СНГ, при этом большинство из них кластеризуются с изолятами, характерными для европейской части РФ. Также было определено, что IIIA субтип ВГА подразделяется на 3 подгруппы, две из которых содержат последовательности изолятов, циркулирующих на территории стран Юго-Восточной Азии. Третья подгруппа III А субтипа ВГА содержит изо.1яты, доминирующие на территории Индии и изоляты, выявляемые в России, Европе во время спорадических случаев заболевания. Эти данные согласуются с работой Kazunori Е. et al., 2007. Все исследуемые изо гяты III А субтипа относятся к третьей (индийской) подгруппе, причем гене-
тическая вариабельность якутской популяции III А суб гипа ВГА значимо выше (р<0,05), чем вариабельность популяции той же подгру ппы, циркулирующей на территории стран Средней Азии и России, а также популяции IA субтипа, циркулирующего на территории Европейской части РФ. Штаммы IIIA субтипа, обнаруженные на территории Киргизии и Таджикистана, образуют кластер штаммов, эндемичных для Средней Азии.
Большинсгво штаммов, выявленных во время вспышек ГА, протекавших на европейской части России, относятся к 1А субтипу и являются эндемичными для этого региона. Штаммы IA субтипа, выявленные в г. Махачкала, относятся к кластеру штаммов, эндемичных .для южной части РФ и Украины.
Штаммь. ША субтипа, вызвавшие вспышки в европейской части рФ, 1) относятся к кластеру штаммов эндемичных дтя стран Средней Азии (Калининград, Уфа) или 2) идентичны штамму, который встречается в Средней Азии, но не относится к эндемичному дтя этой территории кластеру (Калининград).
Штаммы, выявленные во время вспышек, протекавших в азиатской части России, относятся как к IA, так и к ША субтипам, причём, штаммы IA субтипа отличны от изо 1ятов эндемичных для европейской части РФ, но кластеризуются со штаммами 1) эндемичными для Средиземноморья (Сахалинская обл.) и 2) встречающимися на территории СНГ (Тыва). Ш~аммы ША субгипа 1) относятся к индийской подгруппе II суотипа ВГА, которая содержит в т.ч. изоляты, выявляемые в России (Кемеровская обл.), и 2) идентично! штамму, который встречается в Средней Азии, но не относится к эндемичному для этой территории кластеру (Нерюнгри).
В пределах каждой вспышки циркулировал^) 1) один штамм (большинство случаев); 2) несколько близкородственных штаммов (от 2 до 8) и 3) два различных штамма. Штаммы, выявленные в пределах нескольких вспышек, протекавших в одном регионе, являлись идентичными или близкородственными.
Заключение. Выявление нехарактерного для определенного региона штамма позволяет выдвигать гипотезу о завсзе этого штамма в исследуемый регион. Факт выявления близкородственных штаммов в пределах одной вспышки или нескольких вспышек в одном регионе может свидетельствовать о длительном существовании хронического очага вирусного гепатита А.
