CC BY
0Анализ мутаций в гене PIK3CA при спектре синдромов
избыточного роста
Авторы:
(1) Жарнакова Юлия Сергеевна, zyulya02@gmail.com, ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Петрова» Минздрава России, Санкт-Петербург
(2) Венина Айгуль Рифовна, garifullina.aigul@gmail.com, ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Петрова» Минздрава России, Санкт-Петербург
(3) Соколова Татьяна Николаевна, stretanya@yandex.ru, ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Петрова» Минздрава России, Санкт-Петербург
(4) Мартьянов Александр Сергеевич, aleksandr.s.martianov@gmail.com, ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Петрова» Минздрава России, Санкт-Петербург
(5) Соловьева Татьяна Ильинична, tatab0x@yandex.ru, ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Петрова» Минздрава России, Санкт-Петербург
(6) Асадулаева Каримат Амирхановна, k.s.ch.a@mail.ru, ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Петрова» Минздрава России, Санкт-Петербург
(7) Имянитов Евгений Наумович, evgeny@imyanitov.spb.ru, ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Петрова» Минздрава России, Санкт-Петербург
Ключевые слова
PIK3CA, синдром избыточного роста, PROS, ПЦР
Актуальность
Crerap синдромов избыточного роста, связанный с мутациями PIK3CA [PIK3CA — Related Overgrowth Spectrum (PROS)] — термин, объединяющий редкие заболевания, которые характеризуются пороками развития и чрезмерным разрастанием различных тканей. Причиной этих заболеваний становится соматическая мутация в гене PIK3CA, возникшая на этапе эмбриогенеза. Данное повреждение обычно имеет мозаичный характер, что усложняет молекулярную диагностику. Соматические дефекты PIK3CA активируют фосфоинозитид-3-киназный путь — один из самых универсальных сигнальных путей, который контролирует апоптоз, рост и пролиферацию клеток. Гиперактивация этого пути может приводить к развитию опухолей, сосудистых аномалий и чрезмерному росту тканей. Детекция мутаций PIK3CA приобрела особую значимость после внедрения в практику ингибитора PI3K — алпелисиба. Изначально его применение было одобрено у пациентов с раком молочной железы, имеющих повреждение в гене PIK3CA, а в дальнейшем эффективность алпелисиба была продемонстрирована также и для пациентов с PROS.
Цель
Целью настоящего исследования стал анализ частоты мутаций PIK3CA у пациентов с подозрением на PROS.
Материалы и методы
В исследование вошли 33 пациента (возрастной диапазон от 2,6 мес до 18 лет; 14 человек мужского и 19 женского пола). Поиск мутаций в 2, 3, 7, 9, 20-м экзонах гена PIK3CA выполнялся с использованием комплекса методов: аллель-дискриминантной ПЦР, плавления ПЦР-продукта с высоким разрешением с дальнейшим секвенированием по Сэнгеру, цифровой капельной ПЦР, таргетного секвенирования нового поколения (NGS, next- generation sequencing).
Результаты
Мутации были детектированы в 16/33 (48,5%) случаев. Большинство выявленных повреждений (12/16, 75%) было представлено тремя частыми разновидностями миссенс-замен: p.E542K, p.E545K и p.H1047R. ПЦР-методики позволили обнаружить 13 мутаций, из которых 9 были детектированы только при помощи высокочувствительного метода — цифровой капельной ПЦР. В 20 случаях, негативных по результатам ПЦР-тестирования, был выполнен таргетный NGS-анализ, который идентифицировал еще 3 миссенс-мутации (C378Y, G106V, E109K).
Выводы
Частота мутаций в нашем исследовании (48,5%) оказалась ниже, чем, например, в недавнем анализе когорты из 162 пациентов с PROS (66,7%) при помощи секвенирования нового поколения. На основании этого можно заключить, что обычные ПЦР-методы не являются оптимальными для идентификации мутаций
PIK3CA при PROS. Для этой задачи требуются более чувствительные методики (такие как цифровая капельная ПЦР) или NGS, который охватывает больший спектр повреждений.
Работа поддержана грантом РНФ № 21-75-30015.
Список литературы
1. Kuentz P et al . Molecular diagnosis of PIK3CA-related overgrowth spectrum (PROS) in 162 patients and recommendations
for genetic testing //Genetics in medicine . 2017 . V. 19 . № . 9 . P. 989-997 . 2 . Sagoyan G . B . , Kletskaya I . S ., Imyanitov E . N ., Mareeva Yu . M . , Zhukov N .V., Khagurov R A. , Suleymanova A . M . A spectrum of overgrowth syndromes associated with the PIK3CA mutation . Literature review // Russian Journal of Pediatric Hematology and Oncology. 2022;9(1):29-44. (In Russ . )
Экспрессия обратной транскриптазы ВИЧ-1 приводит к изменению метаболизма и фенотипических характеристик эпителиальных клеток, инфицированных вирусом папилломы человека типа 16
Авторы:
(1) Житкевич Алла Сергеевна, zhitkevich_as@chumakovs.su, ФГАНУ «Федеральный научный центр исследований и разработки иммунобиологических препаратов им. М.П. Чумакова РАН» (Институт полиомиелита), Москва
(2) Баюрова Екатерина Олеговна, bayurova_eo@chumakovs.su, ФГАНУ «Федеральный научный центр исследований и разработки иммунобиологических препаратов им. М.П. Чумакова РАН» (Институт полиомиелита), ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии им. почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России, Москва,
(3) Авдошина Дарья Валерьевна, avdoshina_dv@chumakovs.su, ФГАНУ «Федеральный научный центр исследований и разработки иммунобиологических препаратов им. М.П. Чумакова РАН» (Институт полиомиелита), Москва
(4) Городничева Татьяна Валерьевна, tatiana.gorod@evrogen.ru, ФГБУ «Национальный медико-хирургический центр им. Н.И. Пирогова» Минздрава России, Москва
(5) Иванов Александр Владимирович, aivanov@yandex.ru, ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии им. почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России, ФГБУН Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН, Москва
(6) Гордейчук Илья Владимирович, gordeychuk_iv@chumakovs.su, ФГАНУ «Федеральный научный центр исследований и разработки иммунобиологических препаратов им. М.П. Чумакова РАН» (Институт полиомиелита), ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии им. почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России, Институт трансляционной медицины и биотехнологии ФГАОУ ВО Первый МГМУ им. И.М. Сеченова Минздрава России (Сеченовский Университет), Москва
(7) Исагулянц Мария Георгиевна, issagouliantis@gmail.com, ФГАНУ «Федеральный научный центр исследований и разработки иммунобиологических препаратов им. М.П. Чумакова РАН» (Институт полиомиелита), ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии им. почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России, ФГАОУ ВО «Российский университет дружбы народов», Москва
Ключевые слова
ВИЧ-1, обратная транскриптаза, клетки рака шейки матки, ВПЧ16, аэробный гликолиз
Актуальность
Люди, живущие с вирусом иммунодефицита человека (ВИЧ-1), имеют повышенный риск развития злокачественных новообразований с поражением эпителиальных клеток даже при успешной антиретровирусной терапии. Это предполагает прямое канцерогенное действие белков ВИЧ-1. Показан прямой туморогенный эффект белков gp120, Tat, Rev, Nef и обратной транскриптазы (RT), отчасти связанный с индукцией ими окислительного стресса (ОС). ВИЧ-1 связывают также с коинфекциями онкогенными вирусами, в частности вирусом папилломы человека (ВПЧ). Можно предположить аддитивный эффект, приводящий к повышению агрессивности злокачественных заболеваний.
Цель
Оценить влияние стабильной экспрессии RT на свойства эпителиальных злокачественных клеток человека Ca Ski, инфицированных ВПЧ16.
