ВЗАИМОСВЯЗЬ ДНРНК-HOXAAS3 И МИКРОРНК ПРИ РМЖ Текст научной статьи по специальности «Клиническая медицина»

ТЕЗИСЫ ПОСТЕРНЫХ ДОКЛАДОВ И ПРИНЯТЫЕ К ПУБЛИКАЦИИ

Онкогенетика

ВЗАИМОСВЯЗЬ ДНРНК-HOXA-AS3 И МИКРОРНК ПРИ РМЖ

С.В. Тимофеева, С.Ю. Филипоова, А.О. Ситковская,

Н. В. Гненная, Т.В. Шамова, И. В. Межевова, И.А. Новикова,

О.И. Кит

Место работы: ФГБУ «НМИЦ онкологии» Минздрава России,

Ростов-на-Дону, Россия

Эл. почта: timofeeva.sophia@gmail.com

Цель: Известно, что длинные некодирующие РНК (днРНК) регулируют экспрессию генов на транскрипционном и посттранскрипционном уровнях [1]. Растущее количество данных свидетельствует об онкогенной роли днРНК HOXA-AS3 в прогрессировании нескольких типов рака, в то время как влияние HOXA-AS3 на рак молочной железы (РМЖ) остается неясным. Целью нашего исследования был биоинформатический поиск взаимодействия днРНК HOXA-AS3 и микроРНК при РМЖ.

Материалы и методы: Комплексный анализ прогнозирования был проведен с помощью алгоритма LncRRisearch [2]. Lncrrisearch включает в себя множество анализов локальных взаимодействий оснований, предсказанных RibLast для каждой днРНК. Основными критериями, используемыми для определения наиболее вероятных взаимодействий между мРНК и днРНК, является минимальная свободная энергия (KCAL / MOL). Далее, мы проанализировали 3 установленных взаимодействий днРНК с тран-скриптом HOXA-AS3 (ENST00000518947), используя базу данных LNCRNASNP2-HUMAN [3], и определили связанные с ними микроРНК при RPM > = 1 (т. е. микроРНК с высокой экспрессий).

Результаты: Для транскрипта HOXA-AS3 (ENST00000518947) мы идентифицировали 3 днРНК, которые продемонстрировали наибольшую вероятность взаимодействия: RPGR-009 (ENST000003 78505), RP11-573D15.8-018 (ENST 00000627551) и SNX8-001 (ENST00000222990). Далее, мы провели поиск микроРНК с высокой экспресией в регионах выше упомянутых днРНК и установили, что RPGR-009 взаимодействует с 12 микроРНК: miR-339-5p, miR-146b-3p, miR-3651, miR-33a-5p, miR-33b-5p, miR-425-3p, miR-377-3p, miR-342-3p, miR-370-3p, miR-1270, miR-338-3p, miR-9-5p. miR-20b-5p. RP11-573D15.8-018 взаимодействует с 18-ю микроРНК miR-106a-5p, miR-20a-5p, miR-17-5p, miR-372-3p, miR-520e, miR-373-3p, miR-520d-3p, miR-512-3p, miR-93-5p, miR-106b-5p, miR-331-5p, miR-125a-5p, miR-328-3p, miR-1229-3p, miR-199a-5p, miR-488-3p, miR-150-3p, miR-145-5p. SNX8-001 связана с miR-330-3p, miR-188-3p, miR-378a-5p, miR-26a-1-3p, miR-26a-2-3p, miR-1224-5p, miR-125a-5p, miR-504-5p, miR-184, miR-589-5p, miR-214-3p, miR-214-3p, miR-485-5p, miR-509-3-5p, miR-892b, miR-767-5p.

Заключение: В результате мы получили функциональные карты, которые могут быть полезны для дальнейших исследований новых возможных маркеров для ранней диагностики РМЖ.

ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКИЕ АСПЕКТЫ НАСЛЕДСТВЕННОГО РАКА ЯИЧНИКОВ В БЕЛАРУСИ: РАБОТА НА ОПЕРЕЖЕНИЕ

Е.Л. Савоневич1, М.И. Василькевич1, В. И. Рапецкая2, Е.А. Максимович2, А.П. Соколенко3

Место работы: 1. УО «Гродненский государственный медицинский университет», Гродно, Беларусь; 2. УЗ «Гродненскаяуниверситетская клиника», Гродно, Беларусь; 3. ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Петрова» Минздрава России, Санкт-Петербург, Россия Эл. почта: elena.savonevich@icloud.com

Цель: Изучение молекулярной эпидемиологии наследственного рака яичников и молочной железы в Республике Беларусь. Исследование выполнено по гранту БРФФИ-РФФИ «Новые мутации в генах наследственного рака молочной железы и яичников у пациенток в Республике Беларусь» №М20Р-400 от 04.05.2020 года. Материалы и методы: Проведено молекулярно-генетиче-ское исследование 500 пациенток с раком яичников (РЯ), раком молочной железы (РМЖ), и первично-множественным раком (ПМР): 169 случаев раннего (до 50 лет включительно) или билатерального РМЖ, 224 последовательных случаев низкодифференцированной карциномы яичников и 107 случаев ПМР с поражением молочной железы и /или яичников. Все женщины проходили лечение в УЗ «Гродненская университетская клиника». 160 пациенток с РЯ ранее были протестированы нами на 13 частых «славянских» мутаций в генах БкСД1 и БкСД2, терминальные мутации были выявлены у 67. 433 женщинам было проведено секвенирование следующего поколения (ЫСБ) с использованием пользовательских биотинилированных зондов, охватывающих все экзоны БкСД1 и БкСД2 и границы экзон-интронных соединений. В качестве материала исследования была использована венозная кровь. Результаты: Изучение 224 последовательных, впервые диагностированных случаев низкодифференцирован-ной карциномы яичников после хирургического лечения, независимо от возраста и семейного анамнеза позволило нам оценить истинную частоту наследственных форм РЯ в Беларуси. Критериями включения в исследование были гистологическое подтверждение диагноза овариальной карциномы и славянское происхождение. В 77 из 224 случаев были выявлены полиморфизмы генов БкСД1/2 (34 %). Среди женщин с ПМР яичников и молочной железы нами установлена самая высокая частота герминальных мутаций в генах БкСД. У 27 из 42 женщин этой группы была обнаружена мутация в гене БкСД1, еще у 6-мутация в гене БкСД2, что суммарно составило 79 %. В общей группе пациенток с ПМР с поражением яичников или молочной железы мы наблюдали минимальную частоту выявления мутаций в генах БкСД1/ 2, она составила 14 %. У 169 пациенток с РМЖ и косвенными признаками наследственного рака одна из патогенных мутаций в гене БкСД1 была обнаружена у 41 женщины, еще у 7-полиморфизмы в гене

ЗЛОКАЧЕСТВЕННЫЕ ОПУХОЛИ Российское общество клинической онкологии

том / vol. 12 № 3s1 • 2022

MALIGNANT TUMOURS

Russian Society of Clinical Oncology