Научная статья на тему 'СОСТАВ МИКРОБИОМА И ОПУХОЛЕВОЙ СТРОМЫ — НОВЫЙ ПОДХОД К ОПРЕДЕЛЕНИЮ ПРОГНОЗА ЗАБОЛЕВАНИЯ'

СОСТАВ МИКРОБИОМА И ОПУХОЛЕВОЙ СТРОМЫ — НОВЫЙ ПОДХОД К ОПРЕДЕЛЕНИЮ ПРОГНОЗА ЗАБОЛЕВАНИЯ Текст научной статьи по специальности «Фундаментальная медицина»

CC BY
15
4
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по фундаментальной медицине , автор научной работы — О.В. Ковалева

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Текст научной работы на тему «СОСТАВ МИКРОБИОМА И ОПУХОЛЕВОЙ СТРОМЫ — НОВЫЙ ПОДХОД К ОПРЕДЕЛЕНИЮ ПРОГНОЗА ЗАБОЛЕВАНИЯ»

ТЕЗИСЫ ПОСТЕРНЫХ ДОКЛАДОВ И ПРИНЯТЫЕ К ПУБЛИКАЦИИ

Конкурс молодых ученых

и метастатически измененных регионарных лимфоузлов. Гетерогенность по с1ММк также встречалась среди проанализированных образцов, однако для валидации полученных данных необходимо проведение исследования с включением большего количества пациентов. У 11,4% пациентов обнаружена гетерогенность между первичной опухолью и метастазами по экспрессии РР-И. Существование межопухолевой гетерогенности может иметь значительное предиктивное и прогностическое значение в лечение рака желудка и пищеводно-желудочного соединения и требует дальнейшего изучения.

ПОИСК ПРЕОДОЛЕНИЯ РЕЗИСТЕНТНОСТИ В ТЕРАПИИ ПЕРВИЧНОЙ МЕДИАСТИНАЛЬНОЙ В-КРУПНОКЛЕТОЧНОЙ ЛИМФОМЫ

И. А. Камаева

Место работы: ФГБУ «НМИЦ онкологии» Минздрава России,

Ростов-на-Дону, Россия

Эл. почта: inkamaeva@yandex.ru

Обоснование: Первичная медиастинальная В-крупнокле-точная лимфома (ПMВКЛ) характеризуется преимущественным поражением лимфоузлов средостения. ПMВКЛ встречается у молодых пациентов, медиана возраста — 35-40 лет. Химиотерапевтическое лечение на протяжении длительного времени остается стандартным. Применение лучевой терапии — обсуждаемый вопрос. Несмотря на наличие ответа у пациентов на терапию, у трети больных наблюдается рефрактерное течение, либо возникает рецидив. Ввиду поражения молодых пациентов создается необходимость выявления пациентов из группы неблагоприятного прогноза. Проведение секвенирования нового поколения (NGS) позволяет выявить мутации в генах, ингибирование которых в дальнейшем может быть использовано для новых терапевтических мишеней ПMВКЛ. Найденные молеку-лярно-генетические особенности данной лимфомы делают возможным понять механизмы развития резистентности у ряда пациентов с ПMВКЛ, что позволит скорректировать терапию еще на диагностическом этапе. Задачи. Усовершенствование методов диагностики ПMВКЛ путем проведения секвенирования нового поколения NGS. Поиск новых мишеней для их использования в качестве новых терапевтических опций. Mатериалы и методы.В исследование включены данные о пациентах с ПMВКЛ с 2O11 по 2O21 год. Опухолевый биоптат2З пациентов был исследован методом NGS-секвенирования нового поколения, который реализовали на секвенаторе illumina NextSeq 55O с применением таргетной панели AVENIO Tumor Expanded Panel, Roche, США, включающей в себя 77 генов. Аналитическая чувствительность детекции мутаций — 5%. Патогенность выявленных нуклеотидных замен оценивали согласно рекомендациям ACMG и AMP. Проведен анализ генетического

материала на наличие клинически значимых мутаций. Результаты. Аберрантные изменения сигнального пути РвРкЭ, который определяет резистентность к лучевой терапии, были ассоциированы с меньшей общей выживаемостью пациентов. Таким образом, целесообразно определять мутацию РвРкЭ у больных с первичной медиастинальной В-крупноклеточной лимфомой при планировании последующей лучевой терапии. Выводы. Полиморфизмы и связь мутированных генов с сигнальными путями ПМВКЛ могут служить новыми терапевтическими мишенями для пациентов с ПМВКЛ в дальнейших клинических исследованиях. Большое значение имеет активация сигнального пути РСРк, что необходимо учитывать при планировании лучевой терапии пациентов, так как активность данного сигнального пути задействована в развитии рефрактерности к терапии онкологических пациентов.

СОСТАВ МИКРОБИОМА И ОПУХОЛЕВОЙ СТРОМЫ - НОВЫЙ ПОДХОД К ОПРЕДЕЛЕНИЮ ПРОГНОЗА ЗАБОЛЕВАНИЯ

О.В. Ковалева

Место работы: ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Блохина» Минздрава России, Москва, Россия

Эл. почта: ovkovaleva@gmail.com

Немелкоклеточный рак легкого (НМРЛ) является одним из наиболее распространенных, неблагоприятных и трудно поддающихся лечению онкологических заболеваний в мире. Этиология данного заболевания достаточно хорошо изучена, однако надежные прогностические критерии данной патологии недостаточно убедительны. Одним из новых подходов к прогнозированию течения и, возможно, предсказанию эффективности иммунотерапии (которая на сегодняшний день активно используется в терапии НМРЛ) может стать комплексный анализ фенотипических характеристик опухолевой стромы, а именно клеточного состава воспалительного инфильтрата совместно с характеристиками ее микробиома.

Целью данной работы является изучение прогностической значимости общей бактериальной нагрузки опухолей легкого в зависимости от фенотипа клеток воспалительного инфильтрата стромы опухолей. В исследование включены 100 пациентов, оперированных по поводу НМРЛ. Исследование фенотипа клеток воспалительного инфильтрата опухолевой стромы проводилось методом иммуногистохимии с использованием антител к маркерам макрофагов классической М1 (iNOS) и альтернативной М2 (CD163, CD206) активации, а также различных типов Т-клеток (CD3, CD8 и FOXP3). Оценку общей бактериальной нагрузки опухолей проводили по уровню экспрессии гена 16S рРНК методом ПЦР в режиме реального времени. Анализ выживаемости проводился путем построения кривых дожития по методу Каплана — Майера.

ЗЛОКАЧЕСТВЕННЫЕ ОПУХОЛИ Российское общество клинической онкологии

том I vol. 12 № 3s1 • 2G22

MALIGNANT TUMOURS

Russian Society of Clinical Oncology

российский жж w» ш а онкологический Y Y \ж I конгресс-2022 /\/\ v i

Конкурс молодых ученых

Показано, что повышенная экспрессия ¡ЫОБ опухолевыми клетками может являться благоприятным прогностическим фактором, в то время как общая бактериальная нагрузка в опухоли не ассоциирована с прогнозом. Далее впервые проведен анализ выживаемости в зависимости от экспрессии исследуемых маркеров совместно с общей бактериальной нагрузкой. Показано, что высокая экспрессия ¡ЫОБ в совокупности с повышенной бактериальной нагрузкой является маркером хорошего прогноза по сравнению с группой пациентов с высокой бактериальной нагрузкой и низкой экспрессией ¡ЫОБ. Также показано, что высокая бактериальная нагрузка опухолей с иммуносупрессией (большим количеством РОХР3 + Т-кле-ток) является маркером плохого прогноза по сравнению с группой с высоким содержанием бактерий и низким содержанием РОХР3.

В результате проведенных исследований впервые показано, что высокая бактериальная нагрузка опухоли может являться как плохим, так и хорошим прогностическим фактором в зависимости от фенотипа опухолевой стромы и состояния местного противоопухолевого иммунитета.

ГЕТЕРОГЕННОСТЬ ТРАНСКРИПТОМНОГО ПРОФИЛЯ РАННЕГО ИНВАЗИВНОГО РАКА ШЕЙКИ МАТКИ В ОТНОШЕНИИ ИММУННОГО И СТРОМАЛЬНОГО МИКРООКРУЖЕНИЯ: ВОЗМОЖНОСТЬ МОЛЕКУЛЯРНОЙ КЛАССИФИКАЦИИ

О.В. Курмышкина

Место работы: ФГБОУ ВО «Петрозаводский государственный университет», Петрозаводск, Россия

Эл. почта: studioza@mail.ru

Вопросы молекулярной классификации, иммунной гетерогенности и возможности существования разных имму-нофенотипов вирус-ассоциированного рака шейки матки (РШМ) до сих пор являются недостаточно разработанными; в особенности это касается наиболее ранних его стадий и предраковых форм — интраэпителиальных нео-плазий (ЦИН).

Задачи: Выявить наличие транскриптомных профилей наиболее ранних этапов прогрессии инвазивного РШМ, существенно различающихся по характеристикам иммунного «портрета», спектру сигнальных путей и составу микроокружения, в сравнении с преинвазивными ЦИН. Материалы и методы: Профилирование транскрипто-ма было проведено методом РНК-секвенирования (RNA-Seq) на платформе Illumina. Панель образцов, полученных в рамках хирургической операции, включала ВПЧ (+) ЦИН 1-3 степени (в том числе, карциному in situ), РШМ IA1-IIB стадий и морфологически нормальный эпителий. RNA-Seq профили были проанализированы с помощью различных биоинформатических инструментов: GAGE-

алгоритм Gene Set Enrichment, WGCNA-анализ сигнальных путей, деконволюции клеточного состава xCELL и картирования транскриптомных различий к хромосомным регионам PREDA.

Результаты: Кластерный анализ транскриптомных профилей выявил неоднородность группы РШМ, а именно наличие двух кластеров образцов и 4 функциональных паттернов генов с согласованно изменяющейся экспрессией. С помощью WGCNA было идентифицировано 10 модулей ко-экспрессии с различным функциональным обогащением, указывающих на наиболее важные для формирования инвазивного фенотипа ранних стадий РШМ процессы. Между двумя кластерами образцов РШМ (А и В) и ЦИН (кластер С) были выявлены дифференциально экспрессированные гены и проведен GO/ GAGE-анализ обогащения сигнальными путями, показавший, что опухолевая прогрессия в кластерах А и В, поддерживается иммунологически различными механизмами. Xcell-анализ подтвердил гетерогенность изменений клеточного состава при сравнении трёх групп образцов, в частности кластер В, характеризовался подавленной иммунной активностью по целому ряду показателей иммунного инфильтрата и более высоким вкладом стромального микроокружения. PREDA-анализ показал ассоциацию транскриптомных различий с разными хромосомными локусами, их колокализацию с определенными генными семействами и «горячими точками». Выводы: Показана возможность выявления разных фенотипов инвазивного РШМ на начальных этапах его прогрессии, что может быть важно при применении таргет-ной и иммунотерапии. Работа выполнена при поддержке гранта РНФ №21-15-00208.

ПРЕДИКТОРЫ РЕЗИСТЕНТНОСТИ

К ИММУНОТЕРАПИИ

ПРИ РАСПРОСТРАНЕННОЙ МЕЛАНОМЕ

А.А. Мусаелян1,2, К.А. Оганян1, С. В. Одинцова1, М.А. Урте-нова1, С.В. Лапин1, С.В. Орлов1,2

Место работы: 1. ФГБОУ ВО «ПСПбГМУ им. И.П. Павлова» Минздрава России, Санкт-Петербург, Россия; 2. ФГБНУ «Научно-исследовательский институт медицинской приматологии», Сочи, Россия

Эл. почта: a.musaelyan8@gmail.com

Цель: Определение предиктивной ценности клинических параметров и базисных показателей периферической крови у пациентов с распространенной меланомой. Материалы и методы: Ретроспективное исследование включало 79 пациентов с меланомой кожи 111В-1V стадии, которые получали анти-РР-1 антитела (ниволумаб, пем-бролизумаб, пролголимаб) в монорежиме в 1 линии терапии. У всех пациентов, включенных в исследование, получены клинические, морфологические и лабораторные показатели до начала лечения и перед началом 2 цикла

ЗЛОКАЧЕСТВЕННЫЕ ОПУХОЛИ Российское общество клинической онкологии

том / vol. 12 № 3s1 • 2022

MALIGNANT TUMOURS

Russian Society of Clinical Oncology

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.