ГЕТЕРОГЕННОСТЬ ТРАНСКРИПТОМНОГО ПРОФИЛЯ РАННЕГО ИНВАЗИВНОГО РАКА ШЕЙКИ МАТКИ В ОТНОШЕНИИ ИММУННОГО И СТРОМАЛЬНОГО МИКРООКРУЖЕНИЯ: ВОЗМОЖНОСТЬ МОЛЕКУЛЯРНОЙ КЛАССИФИКАЦИИ Текст научной статьи по специальности «Фундаментальная медицина»

российский жж w» ш а онкологический Y Y \ж I конгресс-2022 /\/\ v i

Конкурс молодых ученых

Показано, что повышенная экспрессия ¡ЫОБ опухолевыми клетками может являться благоприятным прогностическим фактором, в то время как общая бактериальная нагрузка в опухоли не ассоциирована с прогнозом. Далее впервые проведен анализ выживаемости в зависимости от экспрессии исследуемых маркеров совместно с общей бактериальной нагрузкой. Показано, что высокая экспрессия ¡ЫОБ в совокупности с повышенной бактериальной нагрузкой является маркером хорошего прогноза по сравнению с группой пациентов с высокой бактериальной нагрузкой и низкой экспрессией ¡ЫОБ. Также показано, что высокая бактериальная нагрузка опухолей с иммуносупрессией (большим количеством РОХР3 + Т-кле-ток) является маркером плохого прогноза по сравнению с группой с высоким содержанием бактерий и низким содержанием РОХР3.

В результате проведенных исследований впервые показано, что высокая бактериальная нагрузка опухоли может являться как плохим, так и хорошим прогностическим фактором в зависимости от фенотипа опухолевой стромы и состояния местного противоопухолевого иммунитета.

ГЕТЕРОГЕННОСТЬ ТРАНСКРИПТОМНОГО ПРОФИЛЯ РАННЕГО ИНВАЗИВНОГО РАКА ШЕЙКИ МАТКИ В ОТНОШЕНИИ ИММУННОГО И СТРОМАЛЬНОГО МИКРООКРУЖЕНИЯ: ВОЗМОЖНОСТЬ МОЛЕКУЛЯРНОЙ КЛАССИФИКАЦИИ

О.В. Курмышкина

Место работы: ФГБОУ ВО «Петрозаводский государственный университет», Петрозаводск, Россия

Эл. почта: studioza@mail.ru

Вопросы молекулярной классификации, иммунной гетерогенности и возможности существования разных имму-нофенотипов вирус-ассоциированного рака шейки матки (РШМ) до сих пор являются недостаточно разработанными; в особенности это касается наиболее ранних его стадий и предраковых форм — интраэпителиальных нео-плазий (ЦИН).

Задачи: Выявить наличие транскриптомных профилей наиболее ранних этапов прогрессии инвазивного РШМ, существенно различающихся по характеристикам иммунного «портрета», спектру сигнальных путей и составу микроокружения, в сравнении с преинвазивными ЦИН. Материалы и методы: Профилирование транскрипто-ма было проведено методом РНК-секвенирования (RNA-Seq) на платформе Illumina. Панель образцов, полученных в рамках хирургической операции, включала ВПЧ (+) ЦИН 1-3 степени (в том числе, карциному in situ), РШМ IA1-IIB стадий и морфологически нормальный эпителий. RNA-Seq профили были проанализированы с помощью различных биоинформатических инструментов: GAGE-

алгоритм Gene Set Enrichment, WGCNA-анализ сигнальных путей, деконволюции клеточного состава xCELL и картирования транскриптомных различий к хромосомным регионам PREDA.

Результаты: Кластерный анализ транскриптомных профилей выявил неоднородность группы РШМ, а именно наличие двух кластеров образцов и 4 функциональных паттернов генов с согласованно изменяющейся экспрессией. С помощью WGCNA было идентифицировано 10 модулей ко-экспрессии с различным функциональным обогащением, указывающих на наиболее важные для формирования инвазивного фенотипа ранних стадий РШМ процессы. Между двумя кластерами образцов РШМ (А и В) и ЦИН (кластер С) были выявлены дифференциально экспрессированные гены и проведен GO/ GAGE-анализ обогащения сигнальными путями, показавший, что опухолевая прогрессия в кластерах А и В, поддерживается иммунологически различными механизмами. Xcell-анализ подтвердил гетерогенность изменений клеточного состава при сравнении трёх групп образцов, в частности кластер В, характеризовался подавленной иммунной активностью по целому ряду показателей иммунного инфильтрата и более высоким вкладом стромального микроокружения. PREDA-анализ показал ассоциацию транскриптомных различий с разными хромосомными локусами, их колокализацию с определенными генными семействами и «горячими точками». Выводы: Показана возможность выявления разных фенотипов инвазивного РШМ на начальных этапах его прогрессии, что может быть важно при применении таргет-ной и иммунотерапии. Работа выполнена при поддержке гранта РНФ №21-15-00208.

ПРЕДИКТОРЫ РЕЗИСТЕНТНОСТИ

К ИММУНОТЕРАПИИ

ПРИ РАСПРОСТРАНЕННОЙ МЕЛАНОМЕ

А.А. Мусаелян1,2, К.А. Оганян1, С. В. Одинцова1, М.А. Урте-нова1, С.В. Лапин1, С.В. Орлов1,2

Место работы: 1. ФГБОУ ВО «ПСПбГМУ им. И.П. Павлова» Минздрава России, Санкт-Петербург, Россия; 2. ФГБНУ «Научно-исследовательский институт медицинской приматологии», Сочи, Россия

Эл. почта: a.musaelyan8@gmail.com

Цель: Определение предиктивной ценности клинических параметров и базисных показателей периферической крови у пациентов с распространенной меланомой. Материалы и методы: Ретроспективное исследование включало 79 пациентов с меланомой кожи 111В-1V стадии, которые получали анти-РР-1 антитела (ниволумаб, пем-бролизумаб, пролголимаб) в монорежиме в 1 линии терапии. У всех пациентов, включенных в исследование, получены клинические, морфологические и лабораторные показатели до начала лечения и перед началом 2 цикла

ЗЛОКАЧЕСТВЕННЫЕ ОПУХОЛИ Российское общество клинической онкологии

том / vol. 12 № 3s1 • 2022

MALIGNANT TUMOURS

Russian Society of Clinical Oncology