Научная статья на тему 'АНАЛИЗ ИЗМЕНЕНИЙ КЛЕТОЧНОГО ПОПУЛЯЦИОННОГО СОСТАВА, АССОЦИИРОВАННЫХ С РАЗВИТИЕМ РАННИХ СТАДИЙ ИНВАЗИВНОЙ КАРЦИНОМЫ ШЕЙКИ МАТКИ, НА ОСНОВЕ RNA-SEQ ДАННЫХ'

АНАЛИЗ ИЗМЕНЕНИЙ КЛЕТОЧНОГО ПОПУЛЯЦИОННОГО СОСТАВА, АССОЦИИРОВАННЫХ С РАЗВИТИЕМ РАННИХ СТАДИЙ ИНВАЗИВНОЙ КАРЦИНОМЫ ШЕЙКИ МАТКИ, НА ОСНОВЕ RNA-SEQ ДАННЫХ Текст научной статьи по специальности «Фундаментальная медицина»

CC BY
15
3
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по фундаментальной медицине , автор научной работы — О.В. Курмышкина, П.И. Ковчур, Т.О. Волкова

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Текст научной работы на тему «АНАЛИЗ ИЗМЕНЕНИЙ КЛЕТОЧНОГО ПОПУЛЯЦИОННОГО СОСТАВА, АССОЦИИРОВАННЫХ С РАЗВИТИЕМ РАННИХ СТАДИЙ ИНВАЗИВНОЙ КАРЦИНОМЫ ШЕЙКИ МАТКИ, НА ОСНОВЕ RNA-SEQ ДАННЫХ»

российский жж w» ш а онкологический Y Y \ж I конгресс-2022 /\/\ v i

Экспериментальная онкология

Заключение: Впервые проведено комплексное исследование резидентного микробиома и описание фенотипа воспалительного инфильтрата клеток стромы опухолей почки различных гистологических типов. В дальнейшем анализ микробиома, ассоциированного со злокачественными опухолями почек различных гистологических типов, позволит выявить микроорганизмы, присутствие которых специфично для определенного типа опухолей, а проведение комплексного анализа опухолевой стромы и микробиома поможет выявить новые эффективные прогностические критерии.

Исследование выполнено за счет гранта Российского научного фонда № 22-25-00082, https://rscf.ru/project/22-25-00082/

АНАЛИЗ ИЗМЕНЕНИЙ КЛЕТОЧНОГО ПОПУЛЯЦИОННОГО СОСТАВА, АССОЦИИРОВАННЫХ С РАЗВИТИЕМ РАННИХ СТАДИЙ ИНВАЗИВНОЙ КАРЦИНОМЫ ШЕЙКИ МАТКИ, НА ОСНОВЕ RNA-SEQ ДАННЫХ

О.В. Курмышкина, П.И. Ковчур, Т.О. Волкова

Место работы: ФГБОУ ВО «Петрозаводский государственный университет», Петрозаводск, Россия

Эл. почта: studioza@mail.ru

Цель: Ранее нами было выявлено наличие существенных различий в транскриптоме и профиле сигнальных путей между ранними стадиями прогрессии рака шейки матки (РШМ) и интраэпителиальными неоплазиями (ЦИН), указывающих на активацию процессов ремоделирования иммунного и стромального микроокружения при переходе к инвазивному этапу развития. Цель данного исследования состояла в том, чтобы проанализировать связь данных транскриптомных различий с количественными изменениями субпопуляционного клеточного состава ткани. Материалы и методы: Биопсийный материал был получен в ходе хирургической операции для последующего выделения суммарной РНК, приготовления библиотек и проведения РНК-секвенирования (RNA-Seq) на платформе Illumina. Используемая панель образцов включала ВПЧ (+) ЦИН 1-3 степени (включая карциному in situ, n = 5), РШМ IA1-IIB стадий (n = 9, в том числе 4 случая микроинвазив-ной карциномы) и морфологически нормальный эпителий (n = 2). Полученные RNA-Seq профили после биоинформа-тической обработки были проанализированы с помощью алгоритма деконволюции Xcell по 64 типам клеток. Результаты: Образцы РШМ характеризовались значительно более высоким уровнем инфильтрации наивными CD4 Т-клетками и выраженной тенденцией к увеличению содержания Th1 и Th2, CD4 клеток памяти и общей популяции CD4 лимфоцитов. Однако, несмотря на повышенное рекрутирование CD4 Т-клеток, результаты ука-

зывают на нарушение «in situ' активации эффекторных механизмов Т-клеточного ответа. Аналогичные закономерности обнаружены для субпопуляций CD8 T-лимфоцитов и В-клеток. В отношении антиген-презентирующих клеток (АПК), в группе РШМ наблюдалось значимое увеличение количества активированных дендритных клеток (ДК) и М1-макрофагов по сравнению с ЦИН. Различия в структуре стромального микроокружения между преинвазив-ными ЦИН и ранним инвазивным РШМ были обусловлены увеличением количества ангиогенез-ассоциированных популяций ( (лимфо-) эндотелиальных клеток, перицитов, гладких миоцитов) на фоне широкого варьирования количества фибробластов. Содержание дифференцированных эпителиальных клеток закономерно снижалось от нормы к РШМ.

Суммарные ХсеИ-индексы указывали на снижение показателя гомогенности клеточного состава и увеличение роли иммунного (в том числе про-воспалительно-го) и стромального микроокружения по мере прогрессии неоплазии. В то же время, с помощью GSA-анализа среди образцов ЦИН /РШМ выявлен кластер, характеризующийся подавленной иммунной активностью (отклонениями в Th1 / 2-дифференцировке и формировании CD4 Т-кле-точной памяти, снижением уровня CD8-инфильтрата, преобладанием незрелых ДК и М2-макрофагов), более выраженным про-ангиогенным профилем и в целом менее дифференцированным фенотипом.

Заключение: Таким образом, переход от предрака к инва-зивной форме РШМ связан с ростом доли лимфоцитарного инфильтрата и активированных АПК, что может быть следствием хронически протекающего локального воспаления и в свою очередь может являться необходимым условием для ускользания опухолевых клеток от иммунного ответа и начала инвазии в результате нарушения эффекторных механизмов и иммунного истощения. Показана гетерогенность изменений клеточного состава и возможность выявления разных иммунофенотипов раннего инвазивно-го РШМ, что может быть важно для стратификации больных при назначении таргетной и иммунотерапии. Работа выполнена при поддержке гранта РНФ № 21-15-00208.

ЗЛОКАЧЕСТВЕННЫЕ ОПУХОЛИ Российское общество клинической онкологии

том / vol. 12 № 3s1 • 2022

MALIGNANT TUMOURS

Russian Society of Clinical Oncology

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.