CC BY
21
Раздел 6. НАСЛЕДСТВЕННЫЕ ЗАБОЛЕВАНИЯ И ВРОЖДЕННЫЕ ПОРОКИ РАЗВИТИЯ
ТЕКСТОЛОГИЧЕСКИЕ КАРТЫ ПО ОРФАННЫМ ЗАБОЛЕВАНИЯМ ДЛЯ СОЗДАНИЯ ИНТЕЛЛЕКТУАЛЬНОЙ КОМПЬЮТЕРНОЙ СИСТЕМЫ
Благосклонов Н.А.1, Демикова Н.С.23, Кобринский Б.А.1 1ФИЦ Информатика и управление РАН, Москва 2РМАНПО Минздрава России, Москва 3НИКИ педиатрии им. акад. Ю.Е. Вельтищева РНИМУ им. Н.И. Пирогова Минздрава России, Москва
Введение. Сложность дифференциальной диагностики орфанных наследственных метаболических болезней определяется генетической гетерогенностью, клиническим полиморфизмом, прогрессированием заболеваний и, что создает особые трудности, отсутствием выраженных клинических признаков в раннем возрасте. В то время как своевременная и точная диагностика имеет решающее значение для раннего назначения патогенетической терапии.
Целью исследования являлось формирование текстологических карт для единообразного и полноценного описания заболеваний в разные возрастные периоды для последующей разработки интеллектуальной компьютерной системы поддержки принятия диагностических решений.
Материалы и методы. Извлечение знаний из отечественных и зарубежных литературных источников проводилось с помощью комплексного подхода, сочетающего в себе семантический, текстологический и лингвистический методы анализа текстов. Применение семантического анализа обусловлено необходимостью выявления признаков, возраста их проявления и изменений с течением времени, а также частоты встречаемости. Методы текстологического анализа применялись для сравнения различных литературных источников, в частности особенностей проявления болезней у различных этносов. С помощью лингвистического анализа изучалось соотнесение разноязычных терминов. Терминология на этапе разработки системы представлена на русском и английском языках.
Результаты. Разработано структурированное представление текстологических карт. Форма заполняется когнитологом и включает перечень признаков со степенью их выраженности и частотой встречаемости в разных возрастных группах. Используются специально разработанные шкалы: возрастная, ранговая (оценивает уровни проявления признаков), лингвистическая (для характеристики частоты встречаемости признаков).
Текстологические карты подготовлены по различным типам и клиническим формам мукополиса-харидозов. На следующем этапе построения интеллектуальной системы они используются экспертами в процессе формирования матрицы знаний «болезни — признаки».
Заключение. Текстологические карты, сформированные для каждой дифференцируемой нозоло-
гической формы заболеваний, позволяют в одном структурированном документе наглядно представить эксперту знания о клинических проявлениях болезни с их особенностями течения со ссылками на различные публикации. Сопоставляя их с собственным представлением, эксперт формирует интегрированное описание заболевания, необходимое для создания базы знаний интеллектуальной системы.
СЛУЧАЙ СЛОЖНОЙ АНОМАЛИИ ХРОМОСОМЫ 7 У РЕБЕНКА С ПРИЗНАКАМИ СИНДРОМА ЛЮДЖИНА-ФРИНСА.
Васин КС.1-2, Юров И.Ю.123, Куринная О.С.12, Булатникова М.А.4, Ворсанова С.Г.1-2 1ФГБНУ Научный центр психического здоровья, Москва 2НИКИ педиатрии им. акад. Ю.Е. Вельтищева РНИМУ им. Н.И. Пирогова Минздрава России, Москва 3ФГБОУ ДПО Российская медицинская академия непрерывного профессионального образования Минздрава РФ, Москва
4Медицинский центр Покровский ООО Покровский банк, Санкт-Петербург
В ходе обследования ребенка с признаками синдрома Люджина-Фринса анализировали гены, ассоциированные с данным синдромом (MED12, UPF3B, ZDHHC9). Нарушений обнаружено не было. При молекулярно-цитогенетическом исследовании у ребенка была обнаружена одновременно субтеломерная делеция короткого плеча 7p22.3p22.1(43,360-4,705,196)x1 и дупликация длинного плеча 7q36.1q36.3(m,696,397-159,119,707)x3. Данные области не соответствуют синдрому. В ходе биоинформатического анализа корреляции генотип/фенотип генов, имеющих прямую корреляцию с данным фенотипом, обнаружено не было. В базе данных DECIPHER мы обнаружили описание пациента с подобными геномными перестройками: 7p22.3p22.1(93,136-3,683,371)*1, 7q36. 1q36.3(151,927,331-158,933,231)x3, у которого также имелись признаки синдрома Люджина-Фринса. На основании этого был проведен расширенный био-информатический анализ, направленный на прио-ритизацию генов и процессов-кандидатов, а также анализ межбелковых взаимодействий между генами, ассоциированными с синдромом Люджина-Фринса и другими генами в измененных участках. Межбелковые взаимодействия были смоделированы с использованием STRING-DB.
Продукты гена PAXIP1, локализованного в дупли-цированном участке 7q36.1q36.3, и гена PRKAR1B, локализованного в делетированном участке 7p22.3p22.1, имеют вторичные межбелковые взаимодействия с белком гена MED12, который ассоциирован с синдромом Люджина-Фринса. Продукты генов FTSJ2 и EIF3B, локализованных в делетированном участке 7p22.3p22.1,
РОССИЙСКИЙ ВЕСТНИК ПЕРИНАТОЛОГИИ И ПЕДИАТРИИ, 2018; 63:(4) ROSSIYSKIY VESTNIK PERINATOLOGY IPEDIATRII, 2018; 63:(4)
DOI: 10.21508/1027-4065-congress-2018
ИННОВАЦИОННЫЕ ТЕХНОЛОГИИ В ПЕДИАТРИИ И ДЕТСКОЙ ХИРУРГИИ
и гена NOM1 в дуплицированном участке (7q36.1q36.3) имеют вторичное межбелковое взаимодействие с белком гена UPF3B, который также является геном-кандидатом синдрома Люджина-Фринса. Все эти гены также затрагиваются перестройками у пациента, данные которого приводятся в базе данных DECIPHER. На основании этого мы считаем, что дупликация генов PAXIP1, NOM1 и делеция генов PRKAR1B, FTSJ2, EIF3B связанны с функциями генов, ассоциированных с синдромом Люджина-Фринса, или с процессами, в которых они задействованы, и за счет которых, вероятно, формируется подобный фенотип.
Данный случай показывает необходимость использования тщательного биоинформатического анализа, направленного на поиск генов и процессов-кандидатов у пациентов с хромосомными микроаномалиями при определенном фенотипе.
РОЛЬ НЕОНАТАЛЬНОГО СКРИНИНГА В ДИАГНОСТИКЕ МУКОВИСЦИДОЗА У ДЕТЕЙ СТАВРОПОЛЬСКОГО КРАЯ
Водовозова Э.В., Леденева Л.Н., Оганесян И.С., Пономарева Т.А.
ФГБОУ ВО Ставропольский государственный медицинский университет МЗ РФ, Ставрополь
Введение. В 2006 году в Ставропольском крае (СК) введен неонатальный скрининг муковисцидоза (МВ), который позволяет осуществить раннюю его диагностику.
Цель исследования — оценить роль неонатального скрининга в диагностике муковисцидоза у детей Ставропольского края.
Материал и методы. Исследование проводилось в период с 2006 по 2016 годы на базе отделений нео-натологии в родовспомогательных учреждениях СК и пульмонологического отделения ГБУЗ СК «Краевая детская клиническая больница». На 3- 4 сутки жизни у доношенных и на 7-8 сутки у недоношенных новорожденных определялся иммунореактивный трипсин (ИРТ) в капле высушенной крови. При положительном результате (более 70 нг/мл) на 21-28 день жизни проводился повторный тест на ИРТ. В случаях положительного результата (более 40 нг/мл) выполнялась потовая проба с помощью анализатора «Нанодакт». Подготовку к обработке первичных данных и последующий статистический анализ производили с использованием интегрированного пакета статистических программ STATISTICA 6.0 (StatSoftInc., США) и пакета программных приложений MicrosoftExcel ХР (MicrosoftCorp., США).
Результаты. В период с 2006 по 2016 годы в г. Ставрополе и СК проживал 61 ребенок, страдающий МВ. Заболеваемость в 2016 году составила 0,89 на 10000 детского населения. По неонатальному скринингу выявлен 31 ребенок, с данной патологией, что со-
ставляет 50,8% от общего числа пациентов с МВ.
Заключение. Таким образом, при внедрении нео-натального скрининга, диагноз МВ более чем в половине случаев верифицируется на самых ранних сроках, что значительно повышает возможность улучшения качества жизни пациента.
МОЛЕКУЛЯРНО-ЦИТОГЕНЕТИЧЕСКОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ ГЕНОМНОЙ ПАТОЛОГИИ У ДЕТЕЙ С АУТИЗМОМ _
Ворсанова С.Г.1-2, Куринная О.С.12, Юров Ю.Б.12, Демидова И.А.12, Кравец В.С.12, Юров И.Ю.123
1НИКИ педиатрии им. акад. Ю.Е. Вельтищева РНИМУ им. Н.И. Пирогова Минздрава России, Москва 2ФГБНУ Научный центр психического здоровья, Москва 3ФГБОУ ДПО Российская медицинская академия непрерывного профессионального образования Минздрава РФ, Москва
Детский аутизм — заболевание, ассоциированное с симптомокомплексом, основным компонентом которого является отстраненность пациента от внешнего мира и, как правило, резкое неприятие им любых «вмешательств» этого мира в его внутренний мир. У большинства больных (70-90%) наблюдается умственная отсталость. Показано, что геномные нарушения у детей с аутизмом выявляются в более чем 25% случаев. С помощью цитогенетических и мо-лекулярно-цитогенетических методов можно предположить биологические механизмы аутистических расстройств, а также выявить и исследовать гены-кандидаты, ассоциированные с аутизмом.
При исследовании клеток крови группы из 115 детей с аутизмом, умственной отсталостью и микроаномалиями развития в возрасте от 1 года 11 месяцев до 16 лет, средний возраст пациентов: 5 лет 4 месяца (78 мальчиков, 37 девочек; соотношение полов: 2,1мальчики : 1девочки) с помощью молекулярного кариотипирования с последующим биоинформати-ческим анализом геномные вариации были выявлены у 107 (93,1%). Несбалансированные хромосомные и геномные перестройки обнаружены у 31 ребенка (27,0%), геномная нестабильность — у 1 (0,9%), вариации числа копий последовательностей ДНК (С№\&) — у 63 детей (54,8%), интрагенные вариации числа копий последовательности ДНК — у 8 (6,9%), сегментные потери гетерозиготности (унипаренталь-ные дисомии) — у 4 (3,5%). Как видно из представленных данных, в случаях сочетания аутизма с умственной отсталостью и МАР частота геномных аномалий резко возрастает. Несбалансированные хромосомные и геномные аномалии затрагивали хромосомы X, Y, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 12, 13, 14, 15, 18, 21, 22; вариации числа копий последовательностей ДНК (С№\&) обнаружены во всех хромосомах; интрагенные вариации числа копий последовательностей ДНК — во всех
РОССИЙСКИЙ ВЕСТНИК ПЕРИНАТОЛОГИИ И ПЕДИАТРИИ, 2018; 63:(4) ROSSIYSKIY VESTNIK PERINATOLOGY IPEDIATRII, 2018; 63:(4)
DOI: 10.21508/1027-4065-congress-2018
