CC BY
2
ТЕЗИСЫ ПОСТЕРНЫХ ДОКЛАДОВ И ПРИНЯТЫЕ К ПУБЛИКАЦИИ
Онкогенетика
сийского научного фонда № 22-75-10154, https://rscf.ru/ project/22-75-10154/
ВЛИЯНИЕ ВЫСОКИХ ДОЗ АПО-ЛАКТОФЕРРИНА НА ЭПИГЕНОМНЫЙ СТАТУС КЛЕТОК НЕЙРОБЛАСТОМЫ IMR-32
И.О. Сучкова, Н.И. Дергачева, Л.К. Сасина, Е.Л. Паткин
Место работы: ФГБНУ «Институт экспериментальной медицины», Санкт-Петербург, Россия Эл. почта: [email protected]
Цель: Исследовать влияние апо-формы рекомбинантного LF человека (apo-rhLF) на метилирование ДНК и компакти-зацию хроматина клеток нейробластомы IMR-32. Материалы и методы: IMR-32 культивировали 24 ч до достижения 25-30% конфлюэнтности. В опытные образцы добавляли apo-rhLF (конечные концентрации 1, 5, 10 мг/мл) и продолжали культивирование еще 72 ч. Количественную оценку полногеномного метилирования ДНК по CCGG сайтам проводили с помощью метил-чувствительной рестрикции с последующим анализом электрофореграмм в программе ImageJ. Степень компактизации хроматина определяли с использованием ДНКазы I и ImageJ анализа. Статистическую обработку проводили непараметрическими критериями Крускала-Уоллиса и Данна в GraphPad Prism v 8.0.1. Результаты: Дозы 1 и 5 мг/мл apo-rhLF повысили уровень полногеномного метилирования ДНК (63,4% и 56,2% vs 49,5% в контроле), тогда как доза 10 мг/мл, напротив, понизила метилирование до 42,3% (p < 0,001). При этом все три дозы apo-rhLF (1, 5 и 10 мг/мл) снизили степень компактизации хроматина в IMR-32 (47,2%, 67,2% и 75,1 % vs 88,4% в контроле) (p < 0,001).
Заключение: Apo-rhLF влияет на эпигеном IMR-32. Предполагается, что LF способен модулировать активность генов, изменяя паттерн метилирования ДНК и влияя на структуру хроматина, что может быть одним из молекулярных механизмов его противоопухолевого действия. Работа выполнена в рамках гос. задания № FGWG-2022-0012
СИСТЕМНЫЙ ОТВЕТ НА АДЪЮВАНТНУЮ ЛУЧЕВУЮ ТЕРАПИЮ У БОЛЬНЫХ РАКОМ МОЛОЧНОЙ ЖЕЛЕЗЫ НОСИТЕЛЕЙ ПОЛИМОРФИЗМА-ЗО8 (G/A) TNF
Т.Ф. Маливанова, Т.А. Астрелина, И.В. Кобзева, Ю.Б. Сучкова, В.А. Никитина, А.И. Головкова, Д.Ю. Усупжанова, В.А. Брунчуков, А.А. Расторгуева, Е.Е. Ломоносова, Е.О. Любаева, А.П. Кирильчев, М.Ю. Сухова, А.С. Самойлов
Место работы: ФГБУ «ГНЦ ФМБЦ имени А.И. Бурназяна» ФМБА
России, Москва, Россия
Эл. почта: [email protected]
Цель: Адъювантная лучевая терапия (АДЛТ), действуя не только местно, но и системно, приводит к сдвигу го-меостаза, что отражается в рутинных общеклинических тестах. Фактор некроза опухоли (TNF) это провоспали-тельный цитокин, на продукцию которого способен влиять полиморфизм-308 (G/A) TNF. Аллель -308A гена TNF может входить в наследуемый гаплотип AH8.1 комплекса генов HLA, при этом носительство аллеля-308А вне га-плотипа AH8.1 ассоциировано с плохим прогнозом у больных раком молочной железы (РМЖ). Цель исследования — оценка особенностей системного ответа на курс АДЛТ у носителей TNF-ассоциированных генотипов при РМЖ. Материалы и методы: Образцы венозной крови были получены от 147 больных РМЖ в начале и в конце курса АДЛТ (РОД 2 Гр до СОД 50 Гр). Методом аллель-специфической ПЦР определяли аллели -308 (G/A) TNF и маркерные аллели гаплотипа AH8.1 (HLA-A*01, HLA-B*08 и HLA-DRB1*03). Методом ИФА в 102 образцах плазмы крови была определена концентрация sTNF. Клинико-морфологические характеристики и данные общеклинического анализа крови получали из историй болезни. При статистической обработке данных использовали критерий xi2, ANOVA с поправкой по Тьюки и корреляционный анализ. Для всех к ритериев различия считали достоверными при p < 0,05. Результаты: На основе генотипирования были выделены три TNF-ассоциированные группы: 114 (77,6%) носителей -308GG гена TNF независимо от гаплотипа AH8.1; 23 (15,6%) носителя -308A (AH8.1pos) имели хотя бы один маркерный аллель AH8.1; 10 (6,8%) носителей -308A (AH8.1neg) не имели ни одного маркерного аллеля AH8.1. Группы сравнения не имели достоверных отличий по стадии, степени злокачественности, гистологическому типу, молекулярному подтипу РМЖ и числу пациентов, получавших полихимиотерапию до проведения курса АДЛТ. Средняя концентрация sTNF в группе носителей прогностически неблагоприятного генотипа -308A (AH8.1neg) была достоверно выше в начале и в конце АДЛТ (13,6 и 17,8 пкг/мл, соответственно), по сравнению с носителями -308GG (4,9 пкг/мл в начале и 2,9 пкг/мл в конце АДЛТ) и -308A (AH8.1pos) (6,7 пкг/мл в начале и 1,9 пкг/мл в конце АДЛТ). При проведении курса АДЛТ было отмечено достоверное снижение абсолютных показателей лимфоцитов во всех группах сравнения, тромбоцитов и sTNF — у носителей -308GG и -308A (AH8.1pos). В прогностически неблагоприятной группе -308A (AH8.1neg) выявлены сильные положительные корреляционные связи между sTNF и нейтрофилами (r = 0,70; p = 0,027), sTNF и тромбоцитами (r = 0,67; p = 0,039) только в конце АДЛТ, тогда как в начале АДЛТ корреляционные связи между sTNF и составляющими формулы крови были слабыми (r<0,3) и статистически недостоверными.
Заключение: АДЛТ оказывала угнетающее действие на уровень маркера воспаления sTNF и абсолютные показатели лимфоцитов и тромбоцитов у больных РМЖ носителей двух TNF-ассоциированных генотипов -308GG и -308A (AH8.1pos). Однако у носителей прогностически
ЗЛОКАЧЕСТВЕННЫЕ ОПУХОЛИ Российское общество клинической онкологии
том/vol. 13 #3s1 • 2023
MALIGNANT TUMOURS
Russian Society of Clinical Oncology
РОССИЙСКИЙ Willi НШОШЕСКШ 11VII ШГРЕСС 2D23 АЛ I II
Онкогенетика
неблагоприятного генотипа -308A (AH8.1neg) в конце курса АДЛТ сохранялся высокий уровень sTNF, а выявленная коррреляция sTNF с нейтрофилами и тромбоцитами говорит о возможности активации механизмов опухоль-ассо-циированного тромбоза и метастазирования, что требует дальнейшего изучения. Выявленные особенности могут рассматриваться как основа для индивидуализированной терапии.
ДЛИННЫЕ НЕКОДИРУЮШИЕ РНК КАК МАРКЕРЫ ЧУВСТВИТЕЛЬНОСТИ ОПУХОЛЕВЫХ КЛЕТОК ШЕЙКИ МАТКИ К ЛУЧЕВОЙ ТЕРАПИИ
Д.С. Кутилин, Н.Н. Цаплина, Н.В. Порханова
Место работы: ФГБУ «НМИЦ онкологии» Минздрава России,
Ростов-на-Дону, Россия
Эл. почта: [email protected]
Цель: Рак шейки матки (РШМ) по заболеваемости в мире занимает 4 место среди онкогинекологических заболеваний. Местнораспространенные формы РШМ лечат только ЛТ, но полный клинический ответ достигается лишь у определенной когорты больных, что обусловлено формированием радиорезистентности опухолевых клеток. В настоящее время в клинической практике отсутствует перечень маркеров для предсказания чувствительности опухолевых клеток к ЛТ. Поэтому целью исследования стало изучение показателя копийности генов длинных некодируюших РНК у больных РШМ, чувствительных и резистентных к ЛТ.
Материалы и методы: Дистанционная ЛТ 500 больных РШМ (IB1-2, IIA1) выполнялась на линейном ускорителе Varian TrueBeam в режиме VMAT/IMRT (СОД 50 Гр). Поиск потенциальных маркеров осуществляли с помощью базы данных The Cancer Genome Atlas, используя пакет TCGABiolinks языка R. Для идентификации областей генома, размер которых значительно изменялся в ряде образцов опухолей, применяли алгоритм GISTIC. Для исследования использовали срезы тканей из FFPE-блоков 500 больных РШМ. Опухолевые и нормальные клетки из тканей шейки матки выделяли с помощью лазерной микродиссекции с бесконтактным захватом Palm MicroBeam. Выявленные на биоинформационном этапе маркёры валидировали методом ПЦР-РВ в образцах ДНК, выделенной из опухолевых и нормальных клеток модифицированным методом фенол-хлороформной экстракции. Для оценки различий показателя копийности генов применяли критерий Ман-на-Уитни с поправкой Бонферрони. Результаты: По результатам ЛТ пациентки были разделены на 2 группы — чувствительные к ЛТ (n = 280, группа 1) и резистентные (n = 220, группа 2). На этапе биоинформационного анализа был выделен ряд генов длинных некодируюших РНК, изменяющих копийность и ассоциирован-
ных с чувствительностью к ЛТ — LINC00167, LINC00558, LINC00400. Показатель копийности этих генов был проанализирован в ДНК опухолевых и нормальных клеток шейки матки. У пациенток группы 1 обнаружено снижение в 12 раз (р < 0,001) числа копий гена LINC00400. У пациенток группы 2 показатель копийности генов длинных некодируюших РНК в опухолевых клетках относительно этих показателей в нормальных клетках статистически значимо не отличался. Копийность гена LINC00400 в 15 раз (р < 0,0001) была ниже в опухолевых клетках 1 группы больных РШМ относительно 2 группы. Заключение: Показатель копийности гена LINC00400 имеет определенный потенциал в качестве маркера для прогнозирования чувствительности к ЛТ у больных РШМ.
РЕЗУЛЬТАТЫ РУТИННОГО ТЕСТИРОВАНИЯ МУТАЦИЙ ГЕНОВ HRD: КАКИМИ ДОЛЖНЫ БЫТЬ СЛЕДУЮЩИЕ ШАГИ?
А. Лебедева1, Е. Веселовский1'2, А. Кавун1, Е. Белова13, Т. Григорьева1,4, П. Орлов5, А. Субботинская5, М. Шипунов5, О. Машков6, Ф. Билалов6, Ж. Дюжев7, О. Мигяев7, Н. Выт-нова7, П. Шаталов8, А. Каприн8, П. Шегай8, В. Милейко1, М. Иванов1,9
Место работы: 1. ООО «Онкодиагностика Атлас», Москва, Россия; 2. Институт биологии развития им. Н.К. Кольцова РАН, Лаборатория эволюционной генетики, Москва, Россия; 3. ФГБОУ ВО «МГУ им. М.В. Ломоносова» Москва, Россия; 4. Институт биоорганической химии. им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН, Москва, Россия; 5. Федеральный исследовательский центр фундаментальной и трансляционной медицины, Новосибирск, Россия; 6. ГБУЗ Республиканский медико-генетический центр, Уфа, Россия; 7. ООО «Лаборатория Гемотест», Москва, Россия; 8. ФГБУ «НМИЦ радиологии» Минздрава России, Москва, Россия; 9. МФТИ (Национальный исследовательский университет), Долгопрудный, Россия Эл. почта: [email protected]
Цель: Накопленные данные позволяют предположить широкое применение ингибиторов PARP, втом числе за рамками текущих показаний. Для некоторых типов рака тестирование на мутации генов HRR стало рутинной клинической практикой. Тестирование на мутации в генах HRR позволяет выявить здоровых носителей и своевременно провести процедуры по снижению риска. Тем не менее, единого мнения относительно стратегий тестирования не существует. Здесь мы представляем реальные данные рутинного тестирования генов HRR в России. Материалы и методы: Мы проанализировали клинико-морфологические характеристики и результаты секвениро-вания, полученные для пациентов, которым было проведено тестирование на наличие мутаций генов HRR (по крови или по образцу опухолевой ткани) в одной из 4 лабораторий в России.Тестирование было проведено методом
ЗЛОКАЧЕСТВЕННЫЕ ОПУХОЛИ Российское общество клинической онкологии
том/vol. 13 #3s1 • 2023
MALIGNANT TUMOURS
Russian Society of Clinical Oncology
