CC BY
2
РОССИЙСКИЙ Willi НШОШЕСКШ 11VII ШГРЕСС 2D23 АЛ I II
Онкогенетика
неблагоприятного генотипа -308A (AH8.1neg) в конце курса АДЛТ сохранялся высокий уровень sTNF, а выявленная коррреляция sTNF с нейтрофилами и тромбоцитами говорит о возможности активации механизмов опухоль-ассо-циированного тромбоза и метастазирования, что требует дальнейшего изучения. Выявленные особенности могут рассматриваться как основа для индивидуализированной терапии.
ДЛИННЫЕ НЕКОДИРУЮШИЕ РНК КАК МАРКЕРЫ ЧУВСТВИТЕЛЬНОСТИ ОПУХОЛЕВЫХ КЛЕТОК ШЕЙКИ МАТКИ К ЛУЧЕВОЙ ТЕРАПИИ
Д.С. Кутилин, Н.Н. Цаплина, Н.В. Порханова
Место работы: ФГБУ «НМИЦ онкологии» Минздрава России,
Ростов-на-Дону, Россия
Эл. почта: [email protected]
Цель: Рак шейки матки (РШМ) по заболеваемости в мире занимает 4 место среди онкогинекологических заболеваний. Местнораспространенные формы РШМ лечат только ЛТ, но полный клинический ответ достигается лишь у определенной когорты больных, что обусловлено формированием радиорезистентности опухолевых клеток. В настоящее время в клинической практике отсутствует перечень маркеров для предсказания чувствительности опухолевых клеток к ЛТ. Поэтому целью исследования стало изучение показателя копийности генов длинных некодируюших РНК у больных РШМ, чувствительных и резистентных к ЛТ.
Материалы и методы: Дистанционная ЛТ 500 больных РШМ (IB1-2, IIA1) выполнялась на линейном ускорителе Varian TrueBeam в режиме VMAT/IMRT (СОД 50 Гр). Поиск потенциальных маркеров осуществляли с помощью базы данных The Cancer Genome Atlas, используя пакет TCGABiolinks языка R. Для идентификации областей генома, размер которых значительно изменялся в ряде образцов опухолей, применяли алгоритм GISTIC. Для исследования использовали срезы тканей из FFPE-блоков 500 больных РШМ. Опухолевые и нормальные клетки из тканей шейки матки выделяли с помощью лазерной микродиссекции с бесконтактным захватом Palm MicroBeam. Выявленные на биоинформационном этапе маркёры валидировали методом ПЦР-РВ в образцах ДНК, выделенной из опухолевых и нормальных клеток модифицированным методом фенол-хлороформной экстракции. Для оценки различий показателя копийности генов применяли критерий Ман-на-Уитни с поправкой Бонферрони. Результаты: По результатам ЛТ пациентки были разделены на 2 группы — чувствительные к ЛТ (n = 280, группа 1) и резистентные (n = 220, группа 2). На этапе биоинформационного анализа был выделен ряд генов длинных некодируюших РНК, изменяющих копийность и ассоциирован-
ных с чувствительностью к ЛТ — LINC00167, LINC00558, LINC00400. Показатель копийности этих генов был проанализирован в ДНК опухолевых и нормальных клеток шейки матки. У пациенток группы 1 обнаружено снижение в 12 раз (р < 0,001) числа копий гена LINC00400. У пациенток группы 2 показатель копийности генов длинных некодируюших РНК в опухолевых клетках относительно этих показателей в нормальных клетках статистически значимо не отличался. Копийность гена LINC00400 в 15 раз (р < 0,0001) была ниже в опухолевых клетках 1 группы больных РШМ относительно 2 группы. Заключение: Показатель копийности гена LINC00400 имеет определенный потенциал в качестве маркера для прогнозирования чувствительности к ЛТ у больных РШМ.
РЕЗУЛЬТАТЫ РУТИННОГО ТЕСТИРОВАНИЯ МУТАЦИЙ ГЕНОВ HRD: КАКИМИ ДОЛЖНЫ БЫТЬ СЛЕДУЮЩИЕ ШАГИ?
А. Лебедева1, Е. Веселовский1'2, А. Кавун1, Е. Белова13, Т. Григорьева1,4, П. Орлов5, А. Субботинская5, М. Шипунов5, О. Машков6, Ф. Билалов6, Ж. Дюжев7, О. Мигяев7, Н. Выт-нова7, П. Шаталов8, А. Каприн8, П. Шегай8, В. Милейко1, М. Иванов1,9
Место работы: 1. ООО «Онкодиагностика Атлас», Москва, Россия; 2. Институт биологии развития им. Н.К. Кольцова РАН, Лаборатория эволюционной генетики, Москва, Россия; 3. ФГБОУ ВО «МГУ им. М.В. Ломоносова» Москва, Россия; 4. Институт биоорганической химии. им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН, Москва, Россия; 5. Федеральный исследовательский центр фундаментальной и трансляционной медицины, Новосибирск, Россия; 6. ГБУЗ Республиканский медико-генетический центр, Уфа, Россия; 7. ООО «Лаборатория Гемотест», Москва, Россия; 8. ФГБУ «НМИЦ радиологии» Минздрава России, Москва, Россия; 9. МФТИ (Национальный исследовательский университет), Долгопрудный, Россия Эл. почта: [email protected]
Цель: Накопленные данные позволяют предположить широкое применение ингибиторов PARP, втом числе за рамками текущих показаний. Для некоторых типов рака тестирование на мутации генов HRR стало рутинной клинической практикой. Тестирование на мутации в генах HRR позволяет выявить здоровых носителей и своевременно провести процедуры по снижению риска. Тем не менее, единого мнения относительно стратегий тестирования не существует. Здесь мы представляем реальные данные рутинного тестирования генов HRR в России. Материалы и методы: Мы проанализировали клинико-морфологические характеристики и результаты секвениро-вания, полученные для пациентов, которым было проведено тестирование на наличие мутаций генов HRR (по крови или по образцу опухолевой ткани) в одной из 4 лабораторий в России.Тестирование было проведено методом
ЗЛОКАЧЕСТВЕННЫЕ ОПУХОЛИ Российское общество клинической онкологии
том/vol. 13 #3s1 • 2023
MALIGNANT TUMOURS
Russian Society of Clinical Oncology
ТЕЗИСЫ ПОСТЕРНЫХ ДОКЛАДОВ И ПРИНЯТЫЕ К ПУБЛИКАЦИИ
Саркомы
NGS с использованием одной из двух панелей: Соло-тест ABC (гены BRCA1, BRCA2, ATM, CHEK2) или Соло-тест ABC HRR (15 генов HRR).
Результаты: Данные секвенирования были получены для 2032 пациентов, проходивших тестирования с 02.2021 по 02.2023. У большинства пациентов был рак молочной железы (n = 715, 35,2%), рак яичников (n =259, 12,7%), рак поджелудочной железы (n = 85, 4,2%) или рак предстательной железы (n = 58, 2,9%). Среди 487 пациентов, у 17,6% пациентов были выявлены делетирующие варианты (ДВ) в генах HRD (17,1 % среди пациентов с РМЖ; 23,8% — РЯ; 8% — РПжЖ; 6% — РПЖ); варианты неопределенного значения (VUS) были обнаружены у дополнительных 31,4% пациентов, у которых не было выявлено ДВ. Среди 51 обнаруженных ДВ в 242 образцах FFPE дополнительное тестирование для определения природы варианта (соматический/наследственный) потребовалось только в одном случае (0,4%), так как для остальных 50 вариантов были получены прогнозы с высокой степенью достоверности относительно природы варианта при тестировании только опухолевого материала. Большая часть обнаруженных наследственных вариантов в генах BRCA1/2 были ДВ (121 ДВ, 26 VUS), в то время как для не-BRCA1/2 генов наблюдалась обратная тенденция (53 ДВ, 132 VUS). Среди вариантов в не-BRCA^ генах 22 варианта обнаруживались более, чем в одном образце, причем 68,2% из них были VUS. In silico оценка потенциального эффекта вариантов дала основание предположить, что для дополнительно 4,9% пациентов был потенциально упущен HRD ДВ-положительный результат при использовании 15-генной панели и 1,2% — при использовании панели на 4 гена в связи с потенциально делетирующим эффектом обнаруженных нарушений. В то же время, вна-стоящий момент эти нарушения могут быть классифицированы только как VUS.
Заключение: Наше исследование является одним из первых по оценке встречаемости ДВ и VUS в генах HRR, обнаруженных с использованием NGS, в крупной когорте российских пациентов. Была продемонстрирована высокая эффективность стратегии тестирования опухоли для определения наследственных вариантов. Дальнейшие исследования должны быть направлены на изучение эффекта и интерпретацию часто обнаруживаемых VUS вариантов в не-BRCA^ генах.
■ САРКОМЫ
ПОИСК ПОТЕНЦИАЛЬНЫХ И ЭФФЕКТИВНЫХ ИНГИБИТОРОВ КАРБОАНГИДРАЗЫ ДЛЯ ТЕРАПИИ САРКОМЫ ЮИНГА
Д.Р. Файзуллина1, С.И. Якушов1, К.Р. Канцерова1, Е.Д. Беляева1, Д.А. Анискин1, С.В. Цибульников1, А.А. Недорубов2, С. Калинин3, О.М. Романцова4, П.С. Тимашев5, И.В. Уласов1
Место работы: 1. ФГАОУ ВО «Первый МГМУ им. И.М. Сеченова Минздрава России (Сеченовский Университет)», Москва, Россия; 2. Институт трансляционной медицины, ФГАОУ ВО «Первый МГМУ им. И.М. Сеченова» Минздрава России, Москва, Россия; 3. ФГБОУ ВО «Санкт-Петербургский государственный университет», Санкт-Петербург, Россия; 4. ФГБУ «НМИЦ онкологии им Н.Н. Блохина» Минздрава России, Москва, Россия; 5. Центр мирового уровня «Цифровой биодизайн и персонализированное здравоохранение», ФГАОУ ВО «Первый МГМУ им. И.М. Сеченова» Минздрава России, Москва, Россия Эл. почта: [email protected]
Цель: Оценить эффективность ингибиторов карбоангид-раз для терапии сарком Юинга.
Материалы и методы: В нашей работе мы использовали: перевиваемую клеточную модель саркомы Юинга (А673), культуры опухолевых клеток, выделенных из первичных тканей сарком Юинга, а также эмбриональные фибро-бласты. Активность ингибиторов карбоангидраз человека (Inh1-Inh10) были исследованы на предмет ингиби-рования пролиферации опухолевых клеток, исследованы в реакциях токсичности и индукции клеточной смерти. Результаты: Мы выявили, что терапия ингибиторами кар-бонгидраз ограничивала рост опухолевых клеток в доз-зависимой манере, опухолевых клеток в доз-зависимой манере, демонстрируя низкую токсичность для нормальных фибробластов человека. При этом Inh4 (OX-71) и Inh9 (Py-23) были токсичны для первичных культур сарком Юинга, но не вызывали явную активацию апоптоза (окраска Annexin V), усиливая аутофагию. В то же время использование модуляторов аутофагии 3-метиладени-на (3Ма) и рапамицина (Rap) оказало влияние на пролиферацию опухолевых клеток в присутствии ингибиторов 4 или 9, а добавление RLS3, активатора ферроптоза, повышало чувствительность опухолевых клеток к терапии ингибиторами карбоангидраз человека. Также мы заметили, что высокая экспрессия катепсина B связана с активностью ингибиторов карбоангидраз человека. В дальнейшем воздействие Inh4 и Inh9 на рост подкожных А673 ксенографтов мышей будет исследовано in vivo при пероральном применении ингибиторов 4 или 9. Ранее, в доклинических исследованиях на мышах линии c57/Black 6, мы уже оценили ЛД50 для каждого из ингибиторов и показали отсутствие какого-либо цитотокси-ческого эффекта in vivo.
ЗЛОКАЧЕСТВЕННЫЕ ОПУХОЛИ Российское общество клинической онкологии
том/vol. 13 #3s1 • 2023
MALIGNANT TUMOURS
Russian Society of Clinical Oncology
