CC BY
9
| ГЕМАТОЛОГИЯ И ТРАНСФУЗИОЛОГИЯ | RUSSIAN JOURNAL OF HEMATOLOGY AND TRANSFUSIOLOGY (GEMATOLOGIYA I TRANSFUSIOLOGIYA) | 2022; ТОМ 67; №2 |
мный Легкий -*- Средна
тяжести — Тяжелый
Рис. 1.
е диагностики COVID-19
Рис.2.
Месяцы после диагностики COVID-19
Михалева М. А.1, Мартынкевич И. С.1, Мотыко Е. В.1, Булдаков И. А.1, Петров С. В.1, Кувшинов А. Ю.1, Волошин С. В.2 СЕКВЕНИРОВАНИЕ НОВОГО ПОКОЛЕНИЯ В ИЗУЧЕНИИ ХРОНИЧЕСКОГО ЛИМФОЛЕЙКОЗА
'ФГБУ «Российский научно-исследовательский институт гематологии и трансфузиологии ФМБА России», 2ФГБВОУ ВО «Военно-медицинская академия имени С.М. Кирова» Минобороны России, ФГБОУ ВО «Северо-Западный государственный медицинский университет
имени И.И. Мечникова» Минздрава России
Введение. Применение цитогенетических и молекулярных методов в диагностике хронического лимфолейкоза (ХЛЛ) позволило получить информацию о биологии опухолевого клона, ставшей фундаментальной. Активное использование технологии секвенирования нового поколения (Next-generation sequencing, NGS) создало условия для определения мутационного статуса ХЛЛ — генетической и эпигенетической изменчивости — основы гетерогенного течения заболевания. Выявление драйверных мутаций предоставляет возможность как стратифицировать пациентов на прогностические группы и подбирать оптимальную тактику ле-чения, так и вести направленный поиск новых мишеней для создания препаратов с большей эффективностью у больных ХЛЛ.
Цель работы. Исследовать мутационный статус у больных ХЛЛ с использованием «Лимфоидной таргетной NGS-панели генов».
Материалы и методы. В исследование было включено 86 пациентов с ХЛЛ: нелеченые (п=62) и рецидивирующие/рефрактерные (п=24). Диагноз ХЛЛ был верифицирован в соответствии с критериями iwCLL (iwCLL, Hallek et al., 2018). Стратификация осуществлялась по результатам молекулярно-генетических исследований (стандартное кариотипирование, FISH-исследование, определение мутационного статуса IGHV). Все пациенты имели показания к началу лечения. Схемы терапии: иммунохимиотерапия с анти-С020-моноклональными антителами (п=48); монотерапия ингибиторами ВТК (п=18) или Вс1-2 (п=3); комбинации таргетных препаратов (п=17). Секвенирование проводилось на платформе MiSeq (Illumma,
USA) с применением разработанной «Лимфоидной таргетной NGS панели генов» (комплексная панель 117 генов). Образцы ДНК были выделены из B-лимфоцитов крови при помощи стандартного фенол-хлороформного метода. Средняя глубина прочтения — lOOOx. Порог частоты встречаемости аллеля (VAF) — 2%. Клиническая значимость выявленных мутаций оценивалась с помощью открытых баз данных с применением in ¿LLico анализа.
Результаты и обсуждение. Проведено секвенирование 21 образца ДНК пациентов, в которых обнаружены генетические аберрации — 839 вариантов в 89/117 генах. Наиболее частые мутации: FAT1 (12,7%), обуславливающий рефрактерность к терапии; КМТ2С (12,5%) и его паралог KMT2D (3,34%), ускоряющие процесс опухолевой пролиферации. В группе с неблагоприятным прогнозом течения заболевания у 14/24 пациентов были выявлены известные патогенные варианты мутаций (SF3B1 К700Е, SF3B1 G742D, SF3B1 К666Е, ТР53 Lysl20Glu, ТР53 H179R, NOTCH1 P2514fs*4, NOTCH1 02404е, NOTCH1 02503е, BRAF D594G, BRAF K601N, PTEN (с.1321-2А> T), BIRC3 Q547fsX21, MGA R1246X, MGA F907fsX25, JAK3 V722L, IDH2 T352P, IKZF3 L162R) и у 2/24 — мутации вероятно патогенного характера (ATM Y2080, CNF1 M2217V, XPOl Е571К).
Заключение. Промежуточные данные исследования мутационного статуса с использованием NGS-технологии свидетельствуют о возможности ее применения в клинической практике. Для оценки корреляции с клинико-лабораторными характеристиками заболевания исследование продолжается.
