CC BY
9
ТЕЗИСЫ ПОСТЕРНЫХ ДОКЛАДОВ И ПРИНЯТЫЕ К ПУБЛИКАЦИИ
ХАРАКТЕРНЫЕ ОСОБЕННОСТИ ЗЛОКАЧЕСТВЕННЫХ ОПУХОЛЕЙ С МИКРОСАТЕЛЛИТНОЙ НЕСТАБИЛЬНОСТЬЮ
А.А. Мусаелян1,2, С.В. Лапин1, В.Д. Назаров1, С.Л. Воробьев3, А.А. Захаренко1, С.В. Орлов1,2
Место работы: 1. ФГБОУ ВО «ПСПбГМУ им. И. П. Павлова» Минздрава России, Санкт-Петербург, Россия; 2. ФГБНУ «Научно-исследовательский институт медицинской приматологии», Сочи, Россия; 3. Национальный центр клинической морфологической диагностики, Санкт-Петербург, Россия
Эл. почта: [email protected]
Цель: Исследование клинико-морфологических паттернов опухолей с микросателлитной нестабильностью (МСН). Материалы и методы: В исследование включено 613 образцов опухолей следующих локализаций: 400 — колорек-тальный рак (КРР), 80 — рак тела матки (РТМ), 75 — рак желудка (РЖ), 20 — рак яичников, 15 — рак поджелудочной железы, 10 — рак шейки матки, 8 — рак пищевода, 5 — опухоли без выявленной первичной локализации. Исследование МСН осуществлялось с помощью фраг-ментного анализа путем определения мононуклеотидных маркеров: BAT-25, BAT-26, NR-21, NR-24, NR-27. У 185 пациентов с КРР получены данные о предоперационном уровне РЭА и CA19-9.
Результаты: При колоректальном раке распространенность МСН оказалась равна 6,8 %, при раке тела матки — 27,5%, при раке желудка — 6,67%, при раке яичников — 5%. При других локализациях МСН не обнаружена. Характерными клинико-морфологическими особенностями МСН-положительного КРР являются более молодой возраст (p = 0,028), правосторонняя локализация опухоли (p <0,0001), наличие первично-множественных опухолей (p =0,0377), отсутствие отдаленных метастазов (p =0,0343), наличие карцином G3 (p = 0,0013), муцинозного компонента (p <0,0001), Крон-подобной реакции (p = 0,0009), и опухоль-инфильтрирующих лимфоцитов (p <0,0001). Также у пациентов с КРР с МСН уровень РЭА был ниже, чем у пациентов с МСН-отрицательными опухолями: медиана равна 2,0 нг /мл (интерквартильный размах (ИКР): 0,7-3,4; n =20) и 3,9 нг/мл (ИКР: 1,1-13,1; n =165), соответственно (p =0,0061). При этом, между группами КРР в зависимости от статуса МСН не показано различий в статусе курения, размере первичной опухоли и наличии сопутствующих заболеваний, связанных с увеличением РЭА. Для РТМ с МСН были следующие особенности: эндометриоидная адено-карцинома (p =0,025), низкая степень дифференцировки (p =0,0046), наличие крибриформного роста (p =0,0039) и опухоль-инфильтрирующих лимфоцитов (p = 0,0004), а также более высокий уровень митотической активности (p = 0,0035). РЖ с МСН чаще обнаруживался у женщин (p =0,0188), характеризовался более пожилым возрастом (p =0,0034), дистальной локализацией опухоли (p =0,0422), наличием карцином G3 (p =0,0083) и опухоль-инфильтри-рующих лимфоцитов (p =0,0028).
Онкогенетика
Заключение: Общей особенностью для КРР, РТМ и РЖ, имеющих МСН, является наличие низкой степени диффе-ренцировки и опухоль-инфильтрирующих лимфоцитов.
ПРИМЕНЕНИЯ ТРАНСКРИПТОМНОГО И БИОИНФОРМАТИЧЕСКОГО АНАЛИЗА В ТРАНСЛЯЦИОННОЙ ОНКОЛОГИИ
А.А. Моисеев1, М.И. Сорокин2, А.А. Буздин1 Место работы: 1. Первый Московский государственный медицинский университет имени И.М. Сеченова, Москва, Россия; 2. Московский физико-технический институт (национальный исследовательский университет), Москва, Россия Эл. почта: [email protected]
Цель: Мутации, связанные с чувствительностью опухоли ктаргетным и иммунотерапевтическим препаратам, выявляются в среднем в 10-20% всех случаев солидных опухолей. Цель данного исследования — исследовать преимущества комбинирования транскриптомного и мутационного генетического анализа для персонализации лечения онкобольных.
Материалы и методы: Разработана платформа второго мнения Oncobox для клинических онкологов. Платформа основана на анализе профиля экспрессии генов в опухолевом образце по сравнению с нормальной тканью для персонализации лечения онкобольных. На основе данных генной экспрессии рассчитываются уровни активации молекулярных путей, а также уровни экспрессии генов-мишеней таргетных и иммунотерапевтических препаратов. Эти параметры используются в качестве предикторов ответа индивидуальной опухоли на противораковые препараты. Валидация эффективности работы платформы была проведена ретроспективно для рака желудка, коло-ректального рака, глиобластомы и рака почки. Для отдельного случая пациентки с рецидивирующим раком желудка было проведено исследования четырьмя независимыми генетическими платформами: Oncobox, FoundationOne, Dana Farber Oncopanel и OncoDNA для сравнения производительности вышеуказанных платформ. Результаты: Предсказания платформы Oncobox, основанные на глубоком анализе транскриптома опухоли, были успешно валидированы для рака почки (n =15), рака желудка (n =13), колоректального рака (n =30) и глиобластомы (n = 16) в ходе ретроспективных исследований. Во всех группах пациентов предсказанная эффективность препаратов, которые применялись для лечения пациентов, с высокой достоверностью (площадь под ROC кривой >0,7) соответствовала наблюдаемым клиническим ответам, что указывает на валидность применения подходов, основанных на методах транскриптомики, для персонализации лечения в онкологии.
Для отдельного случая пациентки с рецидивирующим раком желудка (T3N1M0, 80 лет) были проведены исследования независимыми генетическими платформами:
ЗЛОКАЧЕСТВЕННЫЕ ОПУХОЛИ Российское общество клинической онкологии
том / vol. 11 №3s1 • 2021
MALIGNANT TUMOURS
Russian Society of Clinical Oncology
Российский Ж ж* онкологический Ami« ▼ конгресс
Онкогенетика
Oncobox, FoundationOne, Dana Farber Oncopanel и OncoDNA. Все четыре платформы согласованно не вывили мутаций, которые могли бы повлиять на выбор тактики лечения. Однако платформа Oncobox выявила гиперактивацию сигнального пути PD-1 / PD-L1 в образце опухолевой ткани пациентки, что, совместно с повышенным уровнем экспрессии PD-L1, стало основанием для решения назначить пембролизумаб в адъювантном режиме. Выбранная тактика лечения привела к более чем 3-х летней выживаемости без прогрессирования.
Заключение: Комбинирование транскриптомного и мутационного анализа для персонализации назначения терапии при солидных онкозаболеваниях в ряде случаев демонстрирует преимущество перед исключительно мутационным анализом и повышает вероятность благоприятного клинического исхода.
КЛИНИЧЕСКОЕ ИСПОЛЬЗОВАНИЕ СЕКВЕНИРОВАНИЯ РНК И АНАЛИТИЧЕСКОЙ ПЛАТФОРМЫ ONCOBOX ДЛЯ ПЕРСОНАЛИЗИРОВАННОГО ПРОГНОЗИРОВАНИЯ ЭФФЕКТИВНОСТИ ТАРГЕТНЫХ ПРЕПАРАТОВ
С.А. Румянцев1, М.И. Сорокин2, М.А. Золотовская 12, А.А. Буз-дин3
Место работы: 1. Российский национальный исследовательский медицинский университет имени Н.И. Пирогова, Москва, Россия; 2. Московский физико-технический институт (национальный исследовательский университет), Москва, Россия; 3. Первый Московский государственный медицинский университет имени И.М. Сеченова, Москва, Россия;
Эл. почта: [email protected]
Цель: Анализ мутационных профилей онкологических больных не позволяет выбрать тактику лечения в большинстве случаев солидных опухолей (Marquart et al., 2018). Данное исследование было проведено с целью оценки клинического эффекта от применения широкомасштабного анализа генной экспрессии для персонализации лечения онкопациентов.
Материалы и методы: В исследование были включены 239 взрослых онкобольных с солидными опухолями на продвинутых стадиях. Генная экспрессия была профилирована с помощью РНК-секвенирования нового поколения для всех парафинзированных образцов опухолевой ткани всех пациентов, включенных в исследование. Полученные молекулярные профили анализировали с помощью био-информатической платформы Oncobox для построения персонализированного рейтинга таргетных препаратов согласно прогнозируемой эффективности. Сводные отчеты по исследованию в каждом из случаев были предоставлены лечащим врачам-онкологам, которые принимали решение о назначении терапии.
Результаты: По состоянию на июль 2021 года обратная связь получена для 224 пациентов; из них 34 пациента умерли до назначения терапии, 53 пациента получили лечение, отличное от таргетной терапии (химиотерапия, хирургия, лучевая или паллиативная помощь), 74 пациента получили по крайней мере один таргетный препарат (в режиме монотерапии или в комбинации), который был предсказан как эффективный но основе анализа Oncobox («Группа РНКсек»); 63 пациента получали химиотерапию или другую медикаментозную терапию, потенциально неэффективную на основании анализа Oncobox («контрольная группа»). Ответ на лечение получен для 66 пациентов с биопсиями, собранными не более чем за 6 месяцев до анализа, (38 в группе РНКсек и 28 в контрольной группе). У 76 % пациентов группы РНКсек был диагностирован частичный ответ или стабилизация заболевания, по сравнению с 50% в контрольной группе (р-значение теста Фишера 0,037). Более того, в группе РНКсек пациенты показали вдвое большее время до прогрессирования заболевания по сравнению с контрольной группой.
Заключение: Полученные данные дают указывают на то, что профилирование генной экспрессии и дальнейший биинфор-матический анализ являются перспективным инструментом выбора оптимальной тактики лечения и повышения эффективности лекарственной терапии онкологических больных.
ВЫСОКОТОЧНЫЙ КОЛИЧЕСТВЕННЫЙ МОНИТОРИНГ МУТАЦИОННОГО СТАТУСА EGFR В ПЛАЗМЕ КРОВИ ПАЦИЕНТА С НМРЛ
А.П. Коваль1, М.Д. Чанышев1, И.М. Гагарин 2, И.З. Мамедов1, Д.С. Щербо1
Место работы: 1. Институт трансляционной медицины ФГАОУ ВО РНИМУ им. Н.И. Пирогова Минздрава России, Москва, Россия; 2. ГБУЗ «Московская городская онкологическая больница № 62 Департамента здравоохранения города Москвы», Москва, Россия
Эл. почта: [email protected]
Цель: Неинвазивное исследование мутационного статуса онкогенов по циркулирующей ДНК крови в последние годы входит в практику ведения пациентов с рядом онкологических заболеваний. Наличие активирующих соматических мутаций в «горячих точках» гена EGFR служит предиктивным маркером при назначении таргетной терапии немелкоклеточного рака легких (НМРЛ) ингибиторами тирозинкиназы. Целью исследования была оценка возможности одновременного высокоточного мониторинга мутационного статуса в 8 клинически значимых регионах гена EGFR в условиях ограниченной доступности циркулирующей ДНК крови (цДНК).
Материалы и методы: Пациент X., 44 года, диагноз периферическая аденокарцинома верхней доли левого легкого с метастазами в лимфоузлах средостения ША стадия. 16.01.2020 была выполнена расширенная верхняя лоб-эктомия слева с лимфодиссекцией. При молекулярно-био-
ЗЛОКАЧЕСТВЕННЫЕ ОПУХОЛИ Российское общество клинической онкологии
том / vol. 11 № 3s1 • 2021
MALIGNANT TUMOURS
Russian Society of Clinical Oncology
