CC BY
32
2012, Т. 2, № 1-2
Современное лабораторное обеспечение.
тивогрибковым препаратам. Цель работы: идентификация и количественное определение грибов рода Candida, определение их чувствительности к анти-микотикам при обследовании амбулаторных пациентов. За 2010—2011 гг. исследовано 2073 пробы биологического материала от поликлинических больных г. Иркутска. Выделение грибов проводилось на среде Сабуро с последующей идентификацией на бактериологическом анализаторе «AutoScan4 System» (Siemens, USA). Определение чувствительности выделенных штаммов грибков к нистатину, амфотери-цину В, клотримазолу, кетоконазолу, интраконазо-лу, флюконазолу проводилось диско-диффузионным методом. В результате было выделено 172 (8,3% всех исследованных проб) культуры грибов рода Candida. Из общего числа культур 59,9% выделены из органов мочеполовой системы, 27,2% — из верхних дыхательных путей, 11,7% — из органов желудочно-кишечного тракта; культуры прочей локализации составили 1,2%. Среди выделенных культур, удельный вес C. albicans составил 86,1%, на долю C. non-albicans приходилось 13,9%, которые были представлены видами C. krusei, C. glabrata, C. tropicalis. Учитывали культуры грибов с концентрацией 104 колониеобра-зующих единиц (КОЕ) и выше в 1 мл исследуемого материала. Микст-инфицирование (грибы и бактериальная микрофлора) наблюдалось в 51,2% случаев. Выделенные штаммы C. albicans показали наибольшую чувствительность к нистатину (от 87,5 до 100%) вне зависимости от места выделения, наименьшую — интраконазолу (от 32,1 до 64,4%). Чувствительность к остальным антимикотическим препаратам колебалась от 38,4% (кетоконазол) до 84,6% (клотримозол). Таким образом, у амбулаторных пациентов наиболее часто обнаруживали C. albicans. Культуры этого микроорганизма, выделенные в г. Иркутске, характеризовались наибольшей чувствительности к анти-микотику полиенового ряда — нистатину, на фоне более низкой чувствительности к антимикотикам системного действия.
ПЕРСПЕКТИВЫ МОНИТОРИНГА БАКТЕРОИДОВ В ПЦР АНАЛИЗЕ ДЛЯ ОЦЕНКИ ФЕКАЛЬНОГО ЗАГРЯЗНЕНИЯ ПИТЬЕВОЙ ВОДЫ
А.Н. Карташева, Л.В. Черкасова, Г.А. Петрушанская, Р.А. Бурханов
Филиал ФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в городе Москве» в САО города Москвы, Москва
Актуальность мониторинга фекального загрязнения воды обусловлена тем, что результаты бактериологического исследования санитарно-показательной и патогенной флоры в ряде случаев не совпадают (Ahmed W. с соавт., 2008). Описаны случаи вспышек кишечных инфекций на фоне отрицательных результатов санитарно-показательной флоры. По мнению экспертов ВОЗ, назрела необходимость в пересмотре критериев микробиологической безопасности воды и поиске более надежных лабораторных показателей (Nusca A соавт., 2008). С помощью ПЦР анализа в воде открытых водоемов и в водопроводной воде определяются токсоплазмы, хели-кобактер пилори, вирус гепатита А, энтеробактерии и энтеровирусы, риккетсии и легионеллы,многие из которых,по-видимому, нежизнеспособны и не представляют опасности. Вместе с тем, присутствие санитарно-показательных бактерий в воде в любой
форме свидетельствует о фекальном загрязнении воды и о потенциальной опасности контаминации воды патогенными микробами.Одним из перспективных тестов рассматривается индикация бактероидов, которые детектируются в воде открытых водоемов и в питьевой воде чаще других микроорганизмов (Ahmed W. с соавт. ,2008, Bower P. с соавт., 2005). Цель настоящего исследования заключалась в индикации ДНК бактероидов в водопроводной воде, в том числе горячей, бакпосевы которой, как правило, отрицательны.
В исследовании использованы ПЦР тест-системы производства НПФ «Литех» для определения ДНК бактероидов в режиме реального времени на амплификаторе Rotor 0епе-6000.Для пробообра-ботки использован ДНК-экспресс той же фирмы. Пробы водопроводной воды объемом 0,5Л предварительно концентрировали пропуская на вакуумной установке через фильтры с диаметром пор 0,45 мкм, после чего материал экстрагировали с поверхности фильтров и растворяли лизирующим буфером и далее следовали инструкции фирмы производителя для получения пробы ДНК. Все пробы воды параллельно исследовались на санитарно-показательную флору. В результате проведенных исследований из 36 проб воды в 4 обнаружена ДНК бактероидов (11%), при этом в 3 (из 30) в горячей и в 1 (из 6) в холодной воде. В бактериологическом исследовании все пробы были отрицательными. Дальнейшие исследования в этом направлении с применением количественного варианта ПЦР анализа позволят детально изучить информативность индикации бактероидов в воде для оценки ее безопасности.
ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА ШТАММОВ ВОЗБУДИТЕЛЯ БРЮШНОГО ТИФА
Л.А. Кафтырева, С.А. Егорова, А.В. Семенов, Ю.В. Останкова, Ю.А. Артамонова
ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, Санкт-Петербург
В настоящее время одним из методов генотипи-рования возбудителей инфекционных заболеваний, основанном на секвенировании, является MLVA (multiple-locus variable-number tandem-repeats analysis), который субтипирует штаммы, используя различия в числе тандемных нуклеотидных повторов в определенных локусах хромосомной ДНК. Метод обладает высокой дифференцирующей способностью и эпидемиологической конкордантностью.
С 2010 г. в референс-центре по мониторингу за возбудителем брюшного тифа проведено генотипирова-ние методом MLVA 65 штаммов S. Typhi, выделенных в 2005—2010 гг. на различных административных территориях РФ. Завозные случаи заболевания отмечались из Азербайджана (2006 г.), Таджикистана (2006, 2008, 2010 гг.), Абхазии (2008 г.), Кыргызстана (2010 г.), Узбекистана (2010 г.), Индии (2008, 2010 гг.), Бангладеш (2008 г.), Камбоджи (2008 г.), Египта (2008, 2010 гг.), ОАЭ (2008 г.), Пакистана (2008 г.), Непала (2010 г.) и др.
Популяция российских штаммов S. Typhi характеризовалась различными фенотипами резистентности к антимикробным препаратам и генетической неоднородностью. По результатам MLVA-генотипирования выявлено 8 кластеров (генотипов), характеризующихся репрезентативны-
