CC BY
44
Вестник ДВО РАН. 2015. № 6
УДК 577.114.5:579.841.11:543.422.23
М.С. КОКОУЛИН, СВ. ТОМШИЧ, А.И. КАЛИНОВСКИЙ, НА. КОМАНДРОВА
О-антигены морских грамотрицательных
Представлены результаты структурных исследований О-специфических полисахаридов из липополисаха-ридов морских грамотрицательных бактерий, принадлежащих к родам Pseudoalteromonas, Cobetia, Idiomarina, Rheinheimera, Cellulophaga, Echinicola и Litorimonas. Отличительной особенностью этих полисахаридов является наличие необычных кислых и N-ациламиносахаров, а также заместителей неуглеводной природы.
Ключевые слова: липополисахарид, О-специфический полисахарид, морские бактерии.
O-antigens of marine gram-negative bacteria. M.S. KOKOULIN, S.V. TOMSHICH, A.I. KALINOVSKY, N.A. KOMANDROVA. (G.B. Elyakov Pacific Institute of Bioorganic Chemistry, FEB RAS, Vladivostok).
The results of structural studies of O-specific polysaccharides from lipopolysaccharides of marine gram-negative bacteria belonging to the genera Pseudoalteromonas, Cobetia, Idiomarina, Rheinheimera, Cellulophaga, Echinicola and Litorimonas are presented. The distinctive feature of these polysaccharides is the presence of unusual acidic and N-acyl amino sugars and non-carbohydrate substituents.
Key words: lipopolysaccharide, O-specific polysaccharide, marine bacteria.
Грамотрицательные бактерии - важнейший компонент морских экосистем. Ареалы их обитания весьма разнообразны, охватывают прибрежные и открытые акватории океанов, глубоководные и гидротермальные впадины, грунты; помимо свободно-живущих форм микроорганизмов некоторые виды бактерий способны колонизировать внешние оболочки и внутренние поверхности морских животных и растений. Отдельные группы микроорганизмов образуют высокоспецифические симбиотические взаимосвязи с организмом хозяина [5].
Основной интерес к исследованию морских бактерий обусловлен их способностью продуцировать биологически активные соединения, такие как антибиотики, токсины и эндотоксины (липополисахариды - ЛПС), антиопухолевые и антибактериальные вещества, имеющие фармакологический и биотехнологический потенциал. Кроме того, морские бактерии, имея особый путь метаболизма, обладают способностью биологической очистки окружающей среды от загрязнения.
Особое место среди биологически активных веществ морских грамотрицательных бактерий занимают ЛПС, которые, в отличие от ЛПС наземных бактерий, часто проявляют низкую токсичность и могут стать потенциально активными субстанциями при
* КОКОУЛИН Максим Сергеевич - кандидат химических наук, младший научный сотрудник, ТОМШИЧ Светлана Васильевна - кандидат химических наук, старший научный сотрудник, КАЛИНОВСКИЙ Анатолий Иванович - доктор химических наук, ведущий научный сотрудник, КОМАНДРОВА Надежда Алексеевна -кандидат химических наук, заведующая лабораторией (Тихоокеанский институт биоорганической химии им. Г.Б. Елякова ДВО РАН, Владивосток). *Е-таП: [email protected]
Работа выполнена при финансовой поддержке Программы фундаментальных исследований ДВО РАН «Дальний Восток» (проект № 15-1-5-001_о).
бактерий
разработке новых лекарственных средств и эффективных иммуномодуляторов. В связи с этим структурное исследование ЛПС морских грамотрицательных бактерий имеет большое значение.
ЛПС - один из основных компонентов внешней мембраны клеточной стенки грамотрицательных бактерий. Они известны как основные антигены бактериальной клетки; играют важную роль в определении специфичности каналов, ответственных за транспорт необходимых для роста клетки веществ; защищают ее от летального действия детергентов, ядов, некоторых антибиотиков; являются рецепторами для ряда специфических бактериофагов и бактериоцинов; играют ключевую роль в процессах межклеточного узнавания. Многие патофизиологические проявления грамотрицательных инфекций, в том числе эндотоксе-мия и бактериальный шок, ассоциированы с уникальными, эндотоксическими свойствами этих углеводсодержащих биополимеров.
Молекула ЛПС состоит из трех фрагментов, ковалентно связанных друг с другом: консервативной части - липида А (практически одинакового для большинства грамотрицательных бактерий); относительно консервативного олигосахаридного компонента («коровой» зоны) и высоковариабельной полисахаридной цепи (ОПС), имеющей уникальное строение у каждого вида микроорганизмов и определяющей их специфичность [6]. ОПС является антигенной детерминантой ЛПС, которая распознается антителами иммунной системы. Особые структурные изменения и перестановки, происходящие в ОПС в процессе биосинтеза, могут нарушить специфическое связывание полисахарида с антителами, маскируя бактериальную колонизацию и инфекцию [32].
Несмотря на значительный прогресс в области структурного анализа полисахаридов, антигены грамотрицательных бактерий исследованы крайне неравномерно. Наряду с довольно хорошо изученными полисахаридными антигенами патогенных и условно-патогенных бактерий существуют менее изученные и совсем не изученные роды микроорганизмов. К последним можно отнести практически все микроорганизмы морского происхождения, хотя по количеству и разнообразию они не уступают наземным формам бактерий.
Микробные ценозы океана, как древнейшие на земле, включают особые, иногда лишь им присущие таксоны микроорганизмов, которые формировались на протяжении длительного периода эволюции. Эти микроорганизмы, находящиеся в весьма специфических условиях обитания (низкая температура, высокое гидростатическое давление, соленость, циркуляция водных масс, низкие концентрации органических веществ и др.), отличаются от наземных форм рядом приспособительных особенностей. Прежде всего это относится к клеточной стенке бактерий, которая играет определяющую роль во взаимодействии микроорганизма с окружающей средой.
Имеющиеся на настоящий момент данные показывают, что клеточные стенки морских грамотрицательных бактерий различных родов и видов содержат антигены уникального строения. В состав этих биополимеров входят необычные кислые моносахариды, ^ациламино- и кетосахара, высшие моносахариды, а также различные заместители неуглеводной природы [1, 18, 25, 26].
Анионный характер О-специфических полисахаридов морских бактерий связан с процессом их адаптации к морской окружающей среде, поскольку наличие отрицательно заряженных участков в полисахаридной цепи способствует образованию ионного взаимодействия с катионами двухвалентных металлов. Эти ионные «мостики» усиливают общую упаковку мембраны, обеспечивая тем самым большую стабильность молекулы к внешним факторам, таким, например, как высокое давление.
Основные результаты структурных исследований по О-антигенам морских грам-отрицательных бактерий представлены в обзорах [1, 18, 25, 26]. Нами здесь описаны структуры ОПС из ЛПС морских бактерий, установленные в последние годы в лаборатории химии углеводов и липидов, в частности структуры ОПС бактерий, принадлежащих к родам Pseudoalteromonas, СоЬейа, Мютаппа, Rheinhemera, Ы^птопа&',
Cellulophaga, Echinicola. Изученные бактериальные штаммы взяты из коллекции морских микроорганизмов ТИБОХ.
Для установления химической структуры полисахаридов использованы методы моно-сахаридного анализа и метилирования, 'Н- и 13С-ЯМР спектроскопии, включая эксперименты двумерной спектроскопии ЯМР, такие как 'H, 'H-COSY, 'H, 'H-TOCSY, 'H, 13C-HSQC и 'H, 13C-HMBC, NOE спектроскопия ('H, 'H-NOESY и 'H, 'H-ROESY). В некоторых случаях применялось селективное химическое расщепление и масс-спектрометрический анализ.
Род Pseudoalteromonas семейства Pseudoalteromonadaceae образован в Í995 г. на основании ревизии гетерогенного рода Alteromonas и в настоящее время включает 43 вида (http://www.bacterio.net). Грамотрицательные бактерии рода Pseudoalteromonas представляют собой облигатные морские бактерии, широко распространенные в морской среде и выделяемые из различных морских источников. С точки зрения строения ОПС эти бактерии наиболее изучены среди морских микроорганизмов.
О-антигенный полисахарид типового штамма Р. agarivorans KMM 255T построен из разветвленных пентасахаридных повторяющихся звеньев, содержащих довольно распространенные в природе моносахариды [8, Í4]:
b-D-Glcp i
i 6
^4)-p-D-GlcpNAc-a ^-2)-a-D-Galp41 ^-P-D-Galp11-^
3 t 1
b-D-GlcA
Как и многие другие полисахариды из микроорганизмов морского происхождения, данный ОПС имеет кислый характер за счет присутствия остатка D-глюкуроновой кислоты (b-D-GlcA), а также содержит тризамещенный остаток D-галактозы (a-D-Galp1).
Отличительной особенностью другого штамма P. agarivorans КММ 232, изученного нами ранее, является образование в процессе культивирования на твердых средах шероховатых складчатых R-форм наряду со слизистыми S-колониями; кроме того, обе формы синтезируют полноценные ЛПС, ОПС которых имеют различную структуру [2, 3].
Род Cobetia относится к семейству Halomonadaceae, классу Gammaproteobacteria и включает в себя 5 видов (http://www.bacterio.net). Два штамма микроорганизма С. pacifica (KMM 3879T и КММ 3878) изолированы из образца донного песка, собранного в прибрежных водах Японского моря. Микроорганизм С. pacifica типового штамма KMM 3879T продуцирует сульфатированный ОПС, построенный из разветвленных трисахаридных повторяющихся звеньев, и имеет следующую структуру [!3]:
34
Í 1
P-D-Galp3SO3-
Микроорганизм С. pacifica штамма КММ 3878 также продуцирует сульфатированный ОПС, который представляет собой галактан, состоящий из линейных трисахаридных повторяющихся звеньев и содержащий остаток пировиноградной кислоты (Pyr) [17]:
^4)-p-D-Galp2,3SO3--(1^-6)-p-D-Galp3,4(S-Pyr)-(1^-6)-p-D-Galp-(1^-
Структуры О-антигенных полисахаридов двух штаммов морской бактерии C. pacifica являются необычными для грамотрицательных бактерий. Ранее был обнаружен только один сульфатированный ОПС из морской бактерии P. agarivorans KMM 232 (S-форма) [3]. Кроме того, некоторые грамотрицательные бактерии продуцируют сульфатированные эк-зополисахариды (ЭПС) [23, 33, 34, 38]. Наиболее близким по структуре к ОПС C. pacifica KMM 3879T является ЭПС морской бактерии Pseudomonas WAK-1, повторяющееся звено которого также содержит остатки D-глюкозы, D-галактозы и две сульфатные группы [23]. Интересно отметить, что ЭПС Pseudomonas WAK-1 проявляет цитотоксическую активность в отношении различных клеточных линий рака центральной нервной системы и легкого, а также индуцирует апоптоз моноцитарных лейкемических клеток линии U-937 [24]. Особенностью ОПС С. pacifica штамма КММ 3878 является наличие дисульфати-рованного моносахарида - 2,3-О-дисульфат-Э-галактозы (ß-D-Galp2,3SO3), обнаруженного среди бактериальных полисахаридов впервые. Пировиноградная кислота является частым компонентом бактериальных полисахаридов, но в то же время остаток 3,4-О-[^-карбоксиэтиледен)]-Э-галактозы (D-Galp3,4(S-Pyr)) идентифицирован лишь в составе ОПС Proteus mirabilis O24 PrK 47/57 [33] и капсульных полисахаридов (КПС) Klebsiella pneumoniae K13, K30, K33 [19, 20, 28].
Еще один сульфатированный ОПС выделен и изучен нами из микроорганизма Idiomarina abyssalis КММ 227T. Род Idiomarina, семейства Idiomarinaceae образован в 1985 г. и в настоящее время насчитывает 21 вид (http://www.bacterio.net). Бактерии I. abys-salis КММ 227T выделены из образца воды, отобранной на глубине 4000 м в северо-западной части Тихого океана. Повторяющееся звено ОПС данного микроорганизма представляет собой разветвленный пентасахарид, построенный из остатков 2,4-диацетамидо-2,4,6-тридезокси-Э-глюкозы (D-QuiNAc4NAc), L-рамнозы (L-Rha), 3-(4-гидроксибутирамидо)-3,6-дидезокси-Э-глюкозы, сульфатированной по второму положению (ß-D-Quip2SO3-3N(4Hb)), и двух остатков 2-ацетамидо-2-дезокси-Э-глюкуроновых кислот (D-GlcpNAcA) [16]:
■3)-ß-D-QmpNAc4NAc-(1^3)-ß-D-GlcpNAcAn-(1^4)-ß-D-GlcpNAcA4^-
4
î 1
ß-D-Quip2SO3-3N(4Hb)-(1 ^2)-a-L-Rha
О-антигенный полисахарид I. abyssalis KMM 227T имеет уникальную структуру, он содержит три кислых компонента в пентасахаридном повторяющеемся звене. В его составе впервые в природе обнаружен остаток 3-(4-гидроксибутирамидо)-3,6-дидезокси-Э-глюкозы. Сульфатные группы, как уже отмечалось, также не являются частым компонентом ОПС грамотрицательных бактерий.
Род Rheinheimera семейства Chromatiaceae в настоящее время насчитывает 16 видов бактерий (http://www.bacterio.net). Микроорганизм Rheinheimera pacifica КММ 1406T выделен из образца морской воды, отобранной на глубине 5000 м в северо-западной части Тихого океана. О-антигенный полисахарид построен из линейных пентасахарид-ных повторяющихся звеньев, содержащих остатки 2,4-диацетамидо-2,4,6-тридезокси-Э-глюкозы (D-QuiNAc4NAc), 2-ацетамидо-2-дезокси-Э-галактозы (D-GalNAc), 4-амино-4,6-дидезокси-Э-глюкозы (D-Qui4N), N-ацетил-Э-аланина (D-AlaAc) и двух остатков 2-ацетамидо-2-дезокси-галактуроновых кислот (GalpNAcA) [15]:
■4)-a-D-GalpNAc-(1^4)-a-L-GalpNAcA-(1^-3)-ß-D-QuipNAc4NAc-(1^-2)-ß-D-Quip4ND AlaAc-(1 ■^4)-a-D-GalpNAcA-(1 ■
Интересно отметить, что все пять моносахаридных остатков в повторяющемся звене представлены аминосахарами. ОПС R. pacifica KMM 1406T является вторым бактериальным полисахаридом, содержащим одновременно D- и L-изомеры 2-ацетамидо-2-дезокси-галактозаминуроновой кислоты (GalNAcA). Ранее оба этих остатка были обнаружены в ОПС Р. haloplanktis ATCC 14393 [8]. Кроме этого, ОПС R. pacifica KMM 1406T имеет очень близкую структуру повторяющегося звена с ОПС Р. haloplanktis ATCC 14393 и КПС Alteromonas sp. KMM 155 [39].
Род Cellulophaga относится к семейству Flavobacteriaceae, типу Cytophaga-Flavobacterium-Bacteroides и включает в себя 7 видов (http://www.bacterio.net).
Ранее нами установлены структуры О-специфических полисахаридов из липополи-сахаридов C. baltica [4], C. fucicola [30] и C. pacifica [31]. Кислый характер изученных полисахаридов определяется присутствием в них уроновой (глюкуроновая в C. baltica), аминуроновой (2-ацетамидо-2-дезокси-Э-маннуроновая в C. pacifica) и нонулозоновой (5,7-диамино-3,5,7,9-тетрадезокси^-глицеро-Ь-манно-нон-2-улозоновая в C. fucicola) кислот.
Штамм ЕМ 41Т C. tyrosinoxydans выделен из образца морской воды, собранной у восточного побережья о-ва Чеджу (Южная Корея).
На основании данных моносахаридного анализа, 'Н и 13С ЯМР-спектроскопии высокого разрешения установлено, что ОПС C. tyrosinoxydans ЕМ 41Т построен из пентасахарид-ных повторяющихся звеньев и имеет следующее строение [36]:
^)-a-L-Fucp-(1^3)-ß-D-GlcpNAc-(1^3)-a-L-Rhap-(1^2)-a-L-Rhap-(1^-2
Í 1
ß-D-QuiNAc
Данный ОПС не содержит в своем составе кислых моносахаридных остатков, что является нетипичным как для исследованных на текущий момент полисахаридов бактерий рода Cellulophaga, так и для других морских бактерий. Интересно отметить, что идентичный трисахаридный фрагмент ^3)-ß-D-GlcpNAc-(1^3)-a-L-Rhap-(1^2)-a-L-Rhap-(1^ ранее обнаружен в составе ОПС некоторых патогенных микроорганизмов (http://csdb.gly-coscience.ru/bacterial). Род Echinicola относится к семейству Cyclobacteriaceae и включает в себя три вида (http://www.bacterio.net).
Штамм E. vietnamensis KMM 6221T изолирован из образца воды, отобранной на ферме по выращиванию мидий во Вьетнаме [27]. Установлено, что повторяющееся звено ОПС E. vietnamensis КММ 6221Т представляет собой тетрасахарид и имеет следующую структуру [37]:
a-Colp
1
1
2
^4)-ß-D-GlcpNAcA-(1^4)-ß-D-GlcpA-(1^3)-ß-D-GalpNAc-(1^
Данный полисахарид содержит редкий среди бактериальных полисахаридов моносахарид - 3,6-дидезокси^-ксило-гексозу (колитоза, Col).
Штамм G5T, выделенный из образца пляжного песка бухты Taean (Южная Корея), описан как новый род и вид семейства Hyphomonadaceae класса Alphaproteobacteria - Lito-rimonas taeanensis на основании филогенетических, фенотипических, хемотаксономиче-ских и молекулярных свойств. На данный момент род Litorimonas включает 2 вида (http:// www.bacterio.net).
Сведений по структурам О-антигенов морских грамотрицательных альфапротеобак-терий в литературе практически нет, за исключением двух представителей: Sulfitobacter brevis KMM 6006 [7] и Loktanella rosea KMM 6003T [9].
ОПС L. taeanensis G5T построен из трисахаридных повторяющихся звеньев, содержащих остатки 2-ацетамидо-2-дезокси^-галактуроновой кислоты (D-GalNAcA), 2-ацетамидо-
4-(^^)-3,5-дигидроксигексанамидо)-2,4,6-тридезокси^-глюкозы (D-QuiNAc4NR) и 2-ацетамидо-2,6-дидезокси^-ксило-гексоз-4-улозы (L-Sug) и имеет следующую структуру [12]:
^4)-a-D-GalpNAcA-(1^3)-a-D-Quip2Nac4NR-(1^-3)-a-L-Sug-(1^, где R - это ^^)-3,5-дигидроксигексановая кислота.
Для определения хиральных центров в 3,5-дигидроксибутановой кислоте при установлении этой структуры применен метод получения эфиров Мошера с использованием R-,
5-а-метокси-а-трифторметил-а-фенилацетилхлорида (MTPA). MTPA-эфиры для определения абсолютной конфигурации хиральных центров неуглеводных заместителей в углеводной химии использованы нами впервые.
Отличительной особенностью данного полисахарида является одновременное присутствие в его составе двух редко встречающихся в природе сахаров: кетосахара-2-ацетамидо-2,6-дидезокси^-ксило-гексоз-4-улозы и 2-ацетамидо-4-((3S,5S)-3,5-дигидро-ксигексанамидо)-2,4,6-тридезокси-Э-глюкозы.
Такой же кетосахар, только с абсолютной D-конфигурацией, обнаружен в составе ОПС Flavobacterium columnare ATCC 43622 [21], P. rubra ATCC 29570 [11] и капсульных полисахаридов Vibrio ordalii O:2 [35], Streptococcus pneumoniae type 5 [10] и Staphylococcus saprophyticus ATCC 15305 [29]. Другой редкий моносахарид, 2-ацетамидо-4-((3S,5S)-3,5-дигидроксигексамидо)-2,4,6-тридезокси-Э-глюкоза, идентифицирован ранее в ОПС F. psychrophilum (259-93) [22].
Таким образом, проведенные нами в последние годы исследования показывают, что химические структуры полисахаридов различных штаммов морских бактерий отличаются большим разнообразием при отсутствии заметного структурного сходства. Данные полисахариды являются источником редких и необычных моносахаридов, которые вносят существенный вклад в иммуноспецифичность бактерий, что важно для создания их серологических классификационных схем и понимания механизмов биологического действия гликополимеров поверхности микробной клетки.
ЛИТЕРАТУРА
1. Командрова Н.А., Назаренко Е.Л., Томшич С.В., Горшкова Р.П. Строение О-антигенных полисахаридов морских протеобактерий родов Pseudoalteromonas и Shewanella // Вестн. ДВО РАН. 2004. № 3. С. 54-65.
2. Командрова Н.А., Исаков В.В., Томшич С.В., Романенко Л.А., Перепелов А.В., Шашков А.С. Структура кислого О-специфического полисахарида R-формы морской бактерии Pseudoalteromonas agarivorans КММ 232 // Биохимия. 2010. Т. 75, № 5. С. 727-734.
3. Командрова Н.А., Томшич С.В., Исаков В.В., Романенко Л.А. Структура сульфатированного О-специфического полисахарида морской бактерии Pseudoalteromonas marinoglutinosa KMM 232 // Биохимия. 1998. Т. 63, № 10. С. 98-103.
4. Томшич С.В., Командрова Н.А., Недашковская О.И., Перепелов А.В., Видмальм Г., Шашков А.С. Структура кислого О-специфического полисахарида Cellulophaga baltica // Биоорган. химия. 2007. Т. 33, № 1. С. 91-95.
5. Balows A., Truper H.G., Dworkin M., Harber H., Schleifer K.H. The Prokaryotes / Second ed. Berlin: Springer Verlag, 1992. Vol. 2/3. P. 2111-3130.
6. Caroff M., Karibian D. Structure of bacterial lipopolysaccharides // Carbohydr. Res. 2003. Vol. 338, N 23. P. 2431-2447.
7. Gorshkova R.P., Isakov V.V., Shevchenko L.S., Ivanova E.P., Denisenko V.A., Nazarenko E.L. Structure of teichoic acid from marine proteobacterium of Sulfitobacter brevis // Chem. of Nat. Comp. 2007. Vol. 43. P. 643-647.
8. Hanniffy O., Shashkov A.S., Senchenkova S.N., Tomshich S.V., Komandrova N.A., Romanenko L.A., Knirel Y.A., Savage A.V. Structure of an acidic O-specific polysaccharide of Pseudoalteromonas haloplanktis type strain ATCC14393 containing 2-acetamido-2-deoxy-D- and -L-galacturonic acids and 3-(N-acetyl-D-alanyl)amino-3,6-dideoxy-D-glucose // Carbohydr. Res. 1999. Vol. 321, N 1/2. P. 132-138.
9. Ierano T., Silipo A., Nazarenko E.L., Gorshkova R.P., Ivanova E.P., Garozzo D., Sturiale L., Lanzetta R., Par-rilli M., Molinaro A. Against the rules: a marine bacterium, Loktanella rosea, possesses a unique lipopolysaccharide // Glycobiology. 2010. Vol. 20, N 5. P. 586-593.
10. Jansson P.-E., Lindberg B., Lindquist U. Structural studies of the capsular polysaccharide from Streptococcus pneumoniae type 5 // Carbohydr. Res. 1985. Vol. 140, N 1. P. 101-110.
11. Kilcoyne M., Shashkov A.S., Knirel Y.A., Gorshkova R.P., Nazarenko E.L., Ivanova E.P., Gorshkova N.M., Senchenkova S.N., Savage A.V. The structure of the O-polysaccharide of the Pseudoalteromonas rubra ATCC 29570T lipopolysaccharide containing a keto sugar // Carbohydr. Res. 2005. Vol. 15. P. 2369-2375.
12. Kokoulin M.S., Komandrova N.A., Kalinovskiy A., Tomshich S.V., Romanenko L.A., Vaskovsky V.E. Structure of the O-specific polysaccharide from the deep-sea marine bacterium Idiomarina abyssalis KMM 2271 containing a 2-O-sulfate-3-N-(4-hydroxybutanoyl)-3,6-dideoxy-D-glucose // Carbohydr. Res. 2015. Vol. 413. P. 100-106.
13. Kokoulin M.S., Kalinovskiy A.I., Komandrova N.A., Tomshich S.V., Romanenko L.A., Vaskovsky V.E. The new sulfated O-specific polysaccharide from marine bacterium Cobetiapacifica KMM 3878, containing 3,4-O-[(S)-1-carboxyethylidene]-d-galactose and 2,3-O-disulfate-D-galactose // Carbohydr. Res. 2014. Vol. 397, N 1. P. 46-51.
14. Kokoulin M.S., Kalinovskiy A.L., Komandrova N.A., Tovarchi V.E., Tomshich S.V., Nedashkovskaya O.I., Vaskovsky V.E. The structure of the O-specific polysaccharide from marine bacterium Litorimonas taeanensis G5T containing 2-acetamido-4-((3S,5S)-3,5-dihydroxyhexanamido)-2,4-dideoxy-D-quinovose and 2-acetamido-2,6-dide-oxy-L-xylo-hexos-4-ulose // Carbohydr. Res. 2013. Vol. 375. P. 105-111.
15. Kokoulin M.S., Kalinovsky A.I., Komandrova N.A., Tomshich S.V., Romanenko L.A., Vaskovsky V.E. The sulfated O-specific polysaccharide from the marine bacterium Cobetia pacifica KMM 3879T // Carbohydr. Res. 2014. Vol. 387, N 1. P. 4-9.
16. Komandrova N.A., Kokoulin M.S., Kalinovskiy A.I., Tomshich S.V., Romanenko L.A., Vaskovsky V.E. The O-specific polysaccharide from the marine bacterium Pseudoalteromonas agarivorans KMM 255T // Carbohydr. Res. 2015. Vol. 414. P. 60-64.
17. Komandrova N.A., Kokoulin M.S., Kalinovsky A.I., Tomshich S.V., Romanenko L.A., Vaskovsky V.E. The O-specific polysaccharide of the marine bacterium Rheinheimera pacifica KMM 1406T containing D- and L-2-acetami-do-2-deoxy-galacturonic acids // Carbohydr. Res. 2014. Vol. 394. P. 1-6.
18. Leone S., Silipo A., Nazarenko E.L., Lanzetta R., Parrilli M., Molinaro A. Molecular structure of endotoxins from Gram-negative marine bacteria: an update. (Review) // Mar. Drugs. 2007. Vol. 5, N 3. P. 85-112.
19. Lindberg B., Lindh F., Lonngren J., Sutherland I.W. Structural studies of the capsular polysaccharide of Klebsiella type 30 // Carbohydr. Res. 1979. Vol. 76, N 1. P. 281-284.
20. Lindberg B., Lindh F., Lonngren J., Nimmich W. Structural studies of the capsular polysaccharide of Klebsiella type 33 // Carbohydr. Res. 1979. Vol. 70, N 1. P. 135-144.
21. MacLean L.L., Perry M.B., Crump E.M., Kay W.W. Structural characterization of the lipopolysaccharide O-polysaccharide antigen produced by Flavobacterium columnare ATCC 43622 // Eur. J. Biochem. 2003. Vol. 270. P. 3440-3446.
22. MacLean L.L., Vinogradov E.V., Crump E.M., Perry M.B., Kay W.W. The structure of the lipopolysaccharide O-antigen produced by Flavobacterium psychrophilum (259-93) // Eur. J. Biochem. 2001. Vol. 268. P. 2710-2716.
23. Matsuda M., Hasui M., Okutani K. Structural Analysis of a Sulfated Polysaccharide from a Marine Pseudomonas // Nippon Suisan Gakkaishi. 1993. Vol. 59, N 3. P. 535-538.
24. Matsuda M., Yamori T., Naitoh M., Okutani K. Structural revision of sulfated polysaccharide B-1 isolated from a marine Pseudomonas species and its cytotoxic activity against human cancer cell lines // Mar. Biotechnol. 2003. Vol. 5. P. 13-19.
25. Nazarenko E.L., Komandrova N.A., Gorshkova R.P., Tomshich S.V., Zubkov V.A., Kilcoyne M., Savage A.V. Structures of polysaccharides and oligosaccharides of some Gram-negative marine Proteobacteria // Carbohydr. Res. 2003. Vol. 338. P. 2449-2457.
26. Nazarenko E.L., Crawford R.J., Ivanova E.P. The structural diversity of carbohydrate antigens of selected gramnegative marine bacteria // Marine Drugs. 2011. Vol. 9, N 10. P. 1914-1954.
27. Nedashkovskaya O.I., Kim S.B., Hoste B., Shin D.S., Beleneva I.A., Vancanneyt M., Mikhailov V.V. Echinicola vietnamensis sp. nov., a member of the phylum Bacteroidetes isolated from seawater // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2007. Vol. 57, N 4. P. 761-763.
28. Niemann H., Frank N., Stirm S. Klebsiella serotype-13 capsular polysaccharide primary structure and depolymerization by a bacteriophage-borne glycanase // Carbohydr. Res. 1977. Vol. 59, N 1. P. 165-177.
29. Park S., Kelley K.A., Vinogradov E., Solinga R., Weidenmaier C., Misawa Y., Lee J.C. Characterization of the structure and biological functions of a capsular polysaccharide produced by Staphylococcus saprophyticus // J. Bacteriol. 2010. Vol. 192, N 18. P. 4618-4626.
30. Perepelov A.V., Shashkov A.S., Tomshich S.V., Komandrova N.A., Nedashkovskaya O.I. Pseudoaminic acid containing O-specific polysaccharide from a marine bacterium Cellulophaga fucicola // Carbohydr. Res. 2007. Vol. 342. P. 1378-1381.
31. Perepelov A.V., Shashkov A.S., Tomshich S.V., Komandrova N.A., Nedashkovskaya O.I. Structure of the O-specific polysaccharide from a marine bacterium Cellulophaga pacifica containing rarely occurred sugars, Fuc4NAc and ManNAcA // Carbohydr. Res. 2013. Vol. 372. P. 69-72.
32. Rietschel E.T., Kirikae N., Shade U.F., Ulmer A.J., Holst O., Brade H., Schmidt G., Mamat U., Grimmecke H.D., Kusumoto S., Zahringer U. The chemical structure of bacterial endotoxin in relation to bioactivity // Immunobiology. 1993. Vol. 187. P. 169-190.
33. Rogera O., Kervarecb N., Ratiskola J., Colliec-Jouaulta S., Chevolot L. Structural studies of the main exo-polysaccharide produced by the deep-sea bacterium Alteromonas infernus // Carbohydr. Res. 2004. Vol. 339, N 14. P. 2371-2380.
34. Rougeaux H., Guezennec J., Carlson R.W., Kervarec N., Pichon R., Talaga P. Structural determination of the exopolysaccharide of Pseudoalteromonas strain HYD 721 isolated from a deep-sea hydrothermal vent // Carbohydr. Res. 1999. Vol. 28, N 3/4. P. 273-285.
35. Sadovskaya I., Brisson J.-R., Altman E., Mutharia L.M. Structural characterization of the lipopolysaccharide O-antigen and capsular polysaccharide of Vibrio ordalii serotype O:2 // Eur. J. Biochem. 1998. Vol. 253, N 1. P. 319-327.
36. Tomshich S.V., Kokoulin M.S., Kalinovsky A.I., Nedashkovskaya O.I., Komandrova N.A. Structure of the O-specific polysaccharide from a marine bacterium Cellulophaga tyrosinoxydans // Carbohydr. Res. 2015. Vol. 413. P. 1-4.
37. Tomshich S.V., Kokoulin M.S., Kalinovsky A.I., Komandrova N.A., Nedashkovskaya O.I. Structure of the O-specific polysaccharide from a marine bacterium Echinicola vietnamensis KMM 6221T // Carbohydr. Res. 2015. Vol. 402. P. 1-5.
38. Worawattanamateekul W., Matsuda M., Okutani K. Structural Analysis of a Rhamnose-Containing Sulfated Polysaccharide from a Marine Pseudomonas // Nippon Suisan Gakkaishi. 1993. Vol. 59, N 5. P. 875-878.
39. Zubkov V.V., Nazarenko E.L., Gorshkova R.P., Ivanova E.P., Shashkov A.S., Knirel Y.A., Paramonov N.A., Ovodov Y.S. Structure of the capsular polysaccharide from Alteromonas sp. CMM 155 // Carbohydr. Res. 1995. Vol. 275, N 1. P. 147-154.
