CC BY
31
ИННОВАЦИОННЫЕ ТЕХНОЛОГИИ В ПЕДИАТРИИ И ДЕТСКОЙ ХИРУРГИИ
влечением кластера генов цинковых пальцев и гена ССК. В других случаях были выявлены делеции генов SLC19A3, LYAR, СН1Т1; трипликации в генах RHBDD1и SHISA5; дупликации генов MXRЛ5, WWP2, ZNF264, ЛиЖС и SLC6Л14; делеции первого экзона гена NDE1 и 5-8 экзонов гена WT1; триплика-ция 13 экзонов гена LPЛ (АРОА). Настоящее исследование демонстрирует то, что вариомный анализ позволяет определять гены-кандидаты такого клинически и этиологически гетерогенного заболевания, как синдром Аспергера. Следовательно, дальнейшее изучение вариома (совокупности клинически значимых в расширенной когорте детей с высокофункциональным аутизмом является оправданным. Исследование выполнено за счет гранта Российского научного фонда (проект №14-35-00060).
МОЛЕКУЛЯРНО-ЦИТОГЕНЕТИЧЕСКАЯ ТЕХНОЛОГИЯ Ш SILICO ДЛЯ ДИАГНОСТИКИ ГЕНОМНОЙ ПАТОЛОГИИ
ЮровИ.Ю.123, Ворсанова С.Г.1-2-4, Васин КС.1-2-4, Юров Ю.Б.124
'ФГБНУ «Научный центр психического здоровья», г. Москва
Обособленное структурное подразделение ГБОУ ВПО РНИМУ им. Н.И. Пирогова «Научно-исследовательский клинический институт педиатрии» Минздрава России, г. Москва 3ГБОУ ДПО Российская медицинская академия последипломного образования Минздрава России, г. Москва
4ГБОУ ВПО «Московский городской психолого-педагогический университет», г. Москва
На современном этапе развития геномики человека использование биоинформатических методов является необходимым для интерпретации полученных данных, поиска генов-кандидатов, анализа геномных ассоциаций и определения молекулярных/клеточных механизмов заболеваний. К подобным технологиям можно отнести приоритезацию генов, которая позволяет оценивать патогенность геномных перестроек и ассоциировать вариабельность последовательностей ДНК с определёнными фенотипическими проявлениями. В настоящей работе предложена био-информатическая технология приоритезации геномных вариаций, основанная на анализе эпигеномных, протеомных и метаболомных баз данных. Межтканевая вариабельность экспрессии генов была выбрана определяющим критерием классификации патологических и приоритезации геномных состояний. Для тестирования предложенной технологии были исследованы 286 вариомов (совокупность изменений копийности последовательностей геномной ДНК) пациентов с умственной отсталостью, аутизмом и/или врождёнными пороками развития, полученных методом молекулярного кариотипирования. В результате исследования были выявлены 6 генов-кандидатов, изменения последовательности ДНК которых можно
рассматривать как ассоциированные с нарушениями психики: KALRN, TM2D3, CYP39A1, DIAPH3, ATP11B и STOX2. При анализе анеуплоидии (трисомии хромосомы 21 или синдрома Дауна) с помощью данной биоинформатической технологии были обнаружены гены-кандидаты патологии головного мозга при этом заболевании: CXADR, GABPA, APP, TIAM1, SYNJ1, SON, ATP50, TTC3, HMGN1, PDXK, SUMO3, S100B. Таким образом, можно сделать вывод о том, что применение данной технологии для приоритезации генов и процессов-кандидатов, позволяет определить генетические механизмы нарушения психики. Исследование выполнено за счёт гранта Российского научного фонда (проект №14-35-00060).
МОЛЕКУЛЯРНАЯ ДИАГНОСТИКА СУБТЕЛОМЕР-НОЙ ДЕЛЕЦИИ КОРОТКОГО ПЛЕЧА ХРОМОСОМЫ 6
Юров Ю.Б.1-2-3, Ворсанова С.Г.1-2-3, Зеленова М.А.1-2-3, Ратников А.М.1, Юров И.Ю.1-2-4 'ФГБНУ «Научный центр психического здоровья», г. Москва
Обособленное структурное подразделение ГБОУ ВПО РНИМУ им. Н.И. Пирогова «Научно-исследовательский клинический институт педиатрии» Минздрава России, г. Москва 3ГБОУ ВПО «Московский городской психолого-педагогический университет», г. Москва 4ГБОУ ДПО Российская медицинская академия последипломного образования Минздрава России, г. Москва
Субтеломерные делеции короткого плеча хромосомы 6 являются редкой хромосомной патологией, и обладают ярко выраженной клинической гетерогенностью, для которой характерны задержка психомоторного развития, умственная отсталость, нарушение развития речи, потеря слуха, микроаномалии развития, офтальмологические нарушения, патология сердца, почек и головного мозга. Разнообразие фе-нотипических проявлений делеций в участке 6p25 обуславливает необходимость описания новых случаев с использованием высокоразрешающих методов сканирования генома для определения корреляции генотип-фенотип. В настоящей работе представлен случай делеции 6p25.3p25.2, обнаруженной методом серийной сравнительной геномной гибридизации (array CGH) у девочки 7-ми лет с умственной отсталостью, фокальной (симптоматической) эпилепсией, врождённым пороком сердца, гипертелоризмом глазных щелей и частичной атрофией зрительного нерва. Данный метод позволил выявить аномалию размером более 3 млн пн. Перестройка затронула 35 генов, 15 из которых индексированы в OMIM. Среди последних необходимо отметить гены FOXC1 и FOXC2, которые относятся к транскрипционным факторам семейства forkhead и играют значительную роль в регуляции различных процессов в эмбриональных тканях, развития органов зрения и сердца, а также фунциони-
РОССИЙСКИЙ ВЕСТНИКПЕРИНАТОЛОГИИ И ПЕДИАТРИИ, 4, 2015
