CC BY
34
ИННОВАЦИОННЫЕ ТЕХНОЛОГИИ В ПЕДИАТРИИ И ДЕТСКОЙ ХИРУРГИИ
влечением кластера генов цинковых пальцев и гена ССК. В других случаях были выявлены делеции генов SLC19A3, LYAR, СН1Т1; трипликации в генах RHBDD1и SHISA5; дупликации генов MXRЛ5, WWP2, ZNF264, ЛиЖС и SLC6Л14; делеции первого экзона гена NDE1 и 5-8 экзонов гена WT1; триплика-ция 13 экзонов гена LPЛ (АРОА). Настоящее исследование демонстрирует то, что вариомный анализ позволяет определять гены-кандидаты такого клинически и этиологически гетерогенного заболевания, как синдром Аспергера. Следовательно, дальнейшее изучение вариома (совокупности клинически значимых в расширенной когорте детей с высокофункциональным аутизмом является оправданным. Исследование выполнено за счет гранта Российского научного фонда (проект №14-35-00060).
МОЛЕКУЛЯРНО-ЦИТОГЕНЕТИЧЕСКАЯ ТЕХНОЛОГИЯ Ш SILICO ДЛЯ ДИАГНОСТИКИ ГЕНОМНОЙ ПАТОЛОГИИ
ЮровИ.Ю.123, Ворсанова С.Г.1-2-4, Васин КС.1-2-4, Юров Ю.Б.124
'ФГБНУ «Научный центр психического здоровья», г. Москва
Обособленное структурное подразделение ГБОУ ВПО РНИМУ им. Н.И. Пирогова «Научно-исследовательский клинический институт педиатрии» Минздрава России, г. Москва 3ГБОУ ДПО Российская медицинская академия последипломного образования Минздрава России, г. Москва
4ГБОУ ВПО «Московский городской психолого-педагогический университет», г. Москва
На современном этапе развития геномики человека использование биоинформатических методов является необходимым для интерпретации полученных данных, поиска генов-кандидатов, анализа геномных ассоциаций и определения молекулярных/клеточных механизмов заболеваний. К подобным технологиям можно отнести приоритезацию генов, которая позволяет оценивать патогенность геномных перестроек и ассоциировать вариабельность последовательностей ДНК с определёнными фенотипическими проявлениями. В настоящей работе предложена био-информатическая технология приоритезации геномных вариаций, основанная на анализе эпигеномных, протеомных и метаболомных баз данных. Межтканевая вариабельность экспрессии генов была выбрана определяющим критерием классификации патологических и приоритезации геномных состояний. Для тестирования предложенной технологии были исследованы 286 вариомов (совокупность изменений копийности последовательностей геномной ДНК) пациентов с умственной отсталостью, аутизмом и/или врождёнными пороками развития, полученных методом молекулярного кариотипирования. В результате исследования были выявлены 6 генов-кандидатов, изменения последовательности ДНК которых можно
рассматривать как ассоциированные с нарушениями психики: KALRN, TM2D3, CYP39A1, DIAPH3, ATP11B и STOX2. При анализе анеуплоидии (трисомии хромосомы 21 или синдрома Дауна) с помощью данной биоинформатической технологии были обнаружены гены-кандидаты патологии головного мозга при этом заболевании: CXADR, GABPA, APP, TIAM1, SYNJ1, SON, ATP50, TTC3, HMGN1, PDXK, SUMO3, S100B. Таким образом, можно сделать вывод о том, что применение данной технологии для приоритезации генов и процессов-кандидатов, позволяет определить генетические механизмы нарушения психики. Исследование выполнено за счёт гранта Российского научного фонда (проект №14-35-00060).
МОЛЕКУЛЯРНАЯ ДИАГНОСТИКА СУБТЕЛОМЕР-НОЙ ДЕЛЕЦИИ КОРОТКОГО ПЛЕЧА ХРОМОСОМЫ 6
Юров Ю.Б.1-2-3, Ворсанова С.Г.1-2-3, Зеленова М.А.1-2-3, Ратников А.М.1, Юров И.Ю.1-2-4 'ФГБНУ «Научный центр психического здоровья», г. Москва
Обособленное структурное подразделение ГБОУ ВПО РНИМУ им. Н.И. Пирогова «Научно-исследовательский клинический институт педиатрии» Минздрава России, г. Москва 3ГБОУ ВПО «Московский городской психолого-педагогический университет», г. Москва 4ГБОУ ДПО Российская медицинская академия последипломного образования Минздрава России, г. Москва
Субтеломерные делеции короткого плеча хромосомы 6 являются редкой хромосомной патологией, и обладают ярко выраженной клинической гетерогенностью, для которой характерны задержка психомоторного развития, умственная отсталость, нарушение развития речи, потеря слуха, микроаномалии развития, офтальмологические нарушения, патология сердца, почек и головного мозга. Разнообразие фе-нотипических проявлений делеций в участке 6p25 обуславливает необходимость описания новых случаев с использованием высокоразрешающих методов сканирования генома для определения корреляции генотип-фенотип. В настоящей работе представлен случай делеции 6p25.3p25.2, обнаруженной методом серийной сравнительной геномной гибридизации (array CGH) у девочки 7-ми лет с умственной отсталостью, фокальной (симптоматической) эпилепсией, врождённым пороком сердца, гипертелоризмом глазных щелей и частичной атрофией зрительного нерва. Данный метод позволил выявить аномалию размером более 3 млн пн. Перестройка затронула 35 генов, 15 из которых индексированы в OMIM. Среди последних необходимо отметить гены FOXC1 и FOXC2, которые относятся к транскрипционным факторам семейства forkhead и играют значительную роль в регуляции различных процессов в эмбриональных тканях, развития органов зрения и сердца, а также фунциони-
РОССИЙСКИЙ ВЕСТНИКПЕРИНАТОЛОГИИ И ПЕДИАТРИИ, 4, 2015
Раздел 2 Педиатрия
рования головного мозга. Мутации в генах TUBB2A и TUBB2B, затронутых данной перестройкой, также ассоциированы с патологией головного мозга. Следует отметить, что в делетированном участке находится ген SERPINB6, ранее ассоциированный с нейросен-сорной тугоухостью. Данное нарушение является типичным для делеций короткого плеча хромосомы 6, однако соответствующих фенотипических признаков у описываемого пациента не наблюдается. Помимо этого, необходимо отметить, что у девочки обнаружена фокальная эпилепсия, что не было ранее описано при подобных геномных аномалиях. Таким образом, можно сделать вывод о том, что участок 6p25.2p25.3 является критическим для микроделеционного синдрома, причиной которого является субтеломерная делеция 6p25, наблюдаемая у данного пациента. Исследование осуществлено при финансовой поддержке Российского научного фонда (грант №14-15-00411).
НЕСТАБИЛЬНОСТЬ ГЕНОМА В КЛЕТКАХ ГОЛОВНОГО МОЗГА ПРИ АУТИЗМЕ
Юров Ю.БР-3, Ворсанова С.ГМ3, Юров И.Ю124 'ФГБНУ «Научный центр психического здоровья», г. Москва
Обособленное структурное подразделение ГБОУ ВПО РНИМУ им. Н.И. Пирогова «Научно-исследовательский клинический институт педиатрии» Минздрава России, г. Москва 3ГБОУ ВПО «Московский городской психолого-педагогический университет», г. Москва 4ГБОУ ДПО Российская медицинская академия последипломного образования Минздрава России, г. Москва
Молекулярно-цитогенетические исследования свидетельствуют о широкой межиндивидуальной и межклеточной вариабельности генома нервных клеток, связанной с хромосомными (геномными) мутациями и нестабильностью. Примечательно, что геномная нестабильность в клетках головного мозга является одним из механизмов нервно-психических заболеваний (Yurov et al., 2001; Iourov et al., 2006; Vorsanova et al., 2010). В ходе данного исследования были изучены межклеточные геномные вариации в клетках 12 пост-мортальных образцов детей с аутизмом и контроля из банка тканей Мэрилэндского Университета (NICHD Brain and Tissue Bank for Developmental Disorders at the University of Maryland, Baltimore, USA). Анализ хромосомных аномалий с использованием многоцветовой FISH, иммунно-FISH и оригинальной методики интерфазного хромоосомоспецифичного окрашивания хромосом в 50000 клетках головного мозга показал статистически значимое трехкратное увеличение уровня хромосомной (геномной) нестабильности в виде анеуплоидии хромосомы X в префронтальной коре головного мозга детей с аутизмом по сравнению с мозжечком и контрольными образцами. Помимо этого, были также выявлены дополнительные перестроенные хромосомы 15. Далее, образцы были ис-
следованы с помощью высокоразрешающего молекулярного кариотипирования (разрешение: 1 тыс. пн и более). Сканирование генома с помощью данной технологии подтвердило наличие мозаичных форм анеуплоидии хромосомы Х и перестроенной хромосомы 15. В 3 образцах был выявлен ранее неописанный вид геномной нестабильности, представляющий собой значительное увеличение количества CNV (вариаций числа копий последовательности ДНК) в геноме. При среднестатистическом числе CNV в геноме, варьирующем от 150 до 1000, в этих образцах количество CNV составляло около 10000 в двух образцах, а в третьем — около 60000. Важно отметить, что в другой области головного мозга этих пациентов подобной формы нестабильности обнаружено не было. Полученные данные позволили сделать вывод о том, что нестабильность генома в нейронах головного мозга при аутизме за счет нарушения функционирования нейронных сетей может играть значительную роль в патогенезе этого нервно-психического заболевания. Исследование выполнено за счет гранта Российского научного фонда (проект №14-35-00060).
ОСОБЕННОСТИ КЛИНИКО-ЛАБОРАТОРНОЙ ДИАГНОСТИКИ И ЛЕЧЕНИЯ ДЕТЕЙ С СИНДРОМОМ ЛЕША-НИХАНА
Яблонская М.И.1, Новиков П.В.1, Папиж С.В.1, Агапов Е.Г.1, Комарова О.Н.1, Харабадзе М.Н.1, Захарова ЕЮ.2
'НИКИ педиатрии ГБОУ ВПО РНИМУ им. Н.И.Пирогова Минздрава России, г. Москва 2 ФГБУ «Медико-генетический научный центр» РАМН г. Москва
Синдром Леша-Нихана — редкое наследственное заболевание из группы нарушений обмена пуринов, обусловленное недостаточностью фермента гипок-сантин-гуанинфосфорибозилтрансферазы (ГФРТ) вследствие мутаций в гене HPRT1. Частота синдрома Леша-Нихана 1: 235 000 — 1: 380 000 живорожденных. Тип наследования Х-сцепленный. Клинически заболевание характеризуется двигательными нарушениями, напоминающими церебральный паралич, в сочетании с когнитивными и поведенческими расстройствами (аутоагрессией) и гиперпродукцией мочевой кислоты с развитием уратной нефропатии, а у взрослых больных — подагрического артрита. У отдельных детей формируется хроническая почечная недостаточность.
Под нашим наблюдением находились два не родственных друг другу мальчика с синдромом Леша-Нихана, диагноз которым был установлен в возрасте 8 лет и 1 года 4 месяцев и подтвержден выявлением мутаций c.23-25delCTG a610C>G, соответственно, в гене HPRT1 в гемизиготном состоянии. Обе мутации были описаны ранее в базе данных HGMD. Заболевание манифестировало на первом году жизни — у более старшего ребенка с 6 месяцев, у младшего — с 4 месяцев в виде беспокойного поведения, запрокидывания
РОССИЙСКИЙ ВЕСТНИКПЕРИНАТОЛОГИИ И ПЕДИАТРИИ, 4, 2015
