Научная статья на тему 'MALDI-TOF масс-спектрометрия клеточных экстрактов Leptospira spp. '

MALDI-TOF масс-спектрометрия клеточных экстрактов Leptospira spp. Текст научной статьи по специальности «Науки о здоровье»

CC BY
109
20
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Журнал
Инфекция и иммунитет
Scopus
ВАК
RSCI
ESCI
Область наук
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по наукам о здоровье , автор научной работы — И К. Литвинов, Е В. Зуева

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Текст научной работы на тему «MALDI-TOF масс-спектрометрия клеточных экстрактов Leptospira spp. »

2014, Т. 4, № 1

Материалы научно-практической конференции «От эпидемиологии к диагностике актуальных инфекций...»

В результате проведенного исследования доказано, что для подтверждения этиологической роли условно-патогенного микроорганизма в развитии инфекционного процесса необходимо руководствоваться данными о генетических и фенотипических маркерах вирулентности выделенного штамма.

АНАЛИЗ ЭТИОЛОГИЧЕСКОЙ СТРУКТУРЫ ОРВИ И ГРИППА У ДЕТСКОГО НАСЕЛЕНИЯ НОВОСИБИРСКОЙ ОБЛАСТИ ВО ВРЕМЯ ЭПИДЕМИЧЕСКОГО СЕЗОНА 2013-2014 гг.

О.Г. Курская12, И.А. Соболев12, М.В. Сивай12, О.С. Абрамова3, Е.В. Вакуленко3, А.М. Шестопалов1,2

1ФГБУ Научный центр клинической и экспериментальной медицины СО РАМН, г. Новосибирск 2Новосибирский национальный исследовательский государственный университет

3ГБОУ ВПО Новосибирский государственный медицинский университет МЗ РФ

Острые респираторные вирусные инфекции (ОРВИ) — самая частая патология, встречающаяся вне зависимости от возраста, места проживания и социального статуса человека. На долю ОРВИ в нашей стране приходится около 93% всей инфекционной патологии. При этом часто возникает необходимость проведения дифференциального диагноза с целью установления точного возбудителя ОРВИ, выбора тактики лечения, этиотропной терапии и предупреждения осложнений. Целью данной работы явилось изучение этиологической структуры острых респираторных вирусных инфекций (ОРВИ), в том числе гриппа, у детского населения Новосибирской области. Для этого во время эпидемического сезона в детских лечебно-профилактических учреждениях г. Новосибирска производился сбор клинического материала (мазки из носа и зева) у детей с симптомами ОРВИ. Исследование материала на наличие генетического материала вирусов, вызывающих острые респираторные заболевания (респираторно-синцитиальный вирус, риновирус, метапневмови-рус, вирус парагриппа, коронавирус, аденовирус, бокавирус), осуществляли с помощью полимеразной цепной реакции в режиме реального времени коммерческим набором «АмплиСенс ОРВИ-скрин-FL».

В ходе исследования были проанализированы мазки из носа и зева от детей разных возрастных групп: 36,5% образцов было получено от детей первого года жизни, 28,3% образцов — от детей раннего возраста (1—3 года) и 35,2% образцов — от детей старше 3 лет. Наличие генетического материала вирусов, вызывающих ОРВИ, было выявлено в 79,3% случаев, при этом наименьший уровень выявления вирусов наблюдался в возрастной группе 1—3 года. Наиболее распространенным этиологическим агентом, вызывающим ОРВИ у детей в наблюдаемый период, явился респираторно-синцитиальный вирус, составив 61,4% от всех проанализированных случаев, причем чаще всего данный патоген выявлялся у детей первого года жизни. Риновирус был выявлен в 14,5% случаев. На долю аденовируса, вируса парагриппа 3 типа и вируса парагриппа 1 типа пришлось 4,8, 4,1 и 2,8% случаев соответственно. В 10% случаев наблюдалась микст-инфекция, при этом чаще всего выявлялось сочетанное заражение респиратоно-синцитиальным вирусом и риновирусом.

Работа поддержана грантом Правительства Новосибирской области.

ПРОТОЧНАЯ ЦИТОМЕТРИЯ КАК МЕТОД ДИАГНОСТИКИ ИНФЕКЦИОННО-ВОСПАЛИТЕЛЬНОЙ СОСТАВЛЯЮЩЕЙ РЕПАРАТИВНОГО ОСТЕОГЕНЕЗА ПРИ ДЕНТАЛЬНОЙ ИМПЛАНТАЦИИ В.В. Лабис1, Э.А. Базикян1, И.Г. Козлов2

1 Московский государственный медико-стоматологический университет имени А.И. Евдокимова

2 Российский национальный исследовательский медицинский университет имени Н.И. Пирогова, Москва

Проточную цитометрию можно рассматривать в качестве нового клинического метода диагностики инфекционно-воспалительной составляющей тканевого костного матрикса в условиях реабилитации пациентов с первичной и вторичной адентией методом дентальной имплантации. Мы считаем, что забор крови, непосредственно из лунки удаленного зуба при проведении немедленной или отсроченной дентальной имплантации, в корреляции с теми же результатами клеточных и молекулярных параметров состава периферической венозной крови пациента, может служить диагностическим критерием к выбору хирургического протокола ведения пациента при использовании данного метода лечения. На основании изучения определенных кластеров дифференцировки: CD3, CD4, CD8, CD1a, CD14, CD16, CD19, CD25, CD62L, CD45Ra, CD45R0, CD45, CD127, CD56, CCR7, TGF-B — как местно, так и на периферии, мы сможем говорить о выраженности инфекционно-воспалительного процесса, происходящего непосредственно в костной ткани, что станет предпосылкой к обоснованию нового взгляда на механизм репаративного остеогенеза в целом. Данный метод исследования был выбран нами первым, в качестве доказательства значимости роли иммунной системы в регуляции регенераторной функции организма, происходящей в альвеолярных участках костной ткани челюстей при дентальной имплантации, в частности, для изучения механизма остеоинтеграции. Концепция нашего исследования подразумевает участие клеток иммунной системы в регуляции репаративного остеогенеза, а именно, в механизме остеоинтеграции дентальных имплантатов, что не может исключать важности инфекционно-воспалительной составляющей, наравне с другими антигенными детерминантами, влияющими на развитие иммунного ответа при проведении данного оперативного вмешательства.

MALDI-TOF МАСС-СПЕКТРОМЕТРИЯ КЛЕТОЧНЫХ ЭКСТРАКТОВ LEPTOSPIRA SPP.

И.К. Литвинов1, Е.В. Зуева2

1ФГБОУ ВПО Санкт-Петербургский государственный технологический институт (технический университет) 2 ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, Санкт-Петербург

Возбудителями лептоспироза, распространенного зоонозного заболевания, являются грамотрица-тельные бактерии рода Leptospira, насчитывающие 13 генетических видов патогенных лептоспир. В то же время серологическая классификация, основанная на различии липополисахаридных антигенов клеточной поверхности, разделяет патогенные леп-тоспиры более чем на 260 сероваров, объединенных по общим антигенам в серогруппы, не соответствующие таксономическим видам лептоспир.

Материалы научно-практической конференции «От эпидемиологии к диагностике актуальных инфекций...»

Инфекция и иммунитет

Матрично-активированная лазерная десорбция/ ионизация времяпролетная масс-спектрометрия (MALDI-TOF MS) показала себя надежным инструментом идентификации бактерий на видовом уровне. Метод основан на получении уникального набора белковых масс-спектров (MSP) исследуемого микроорганизма. Однако идентификация штаммов Leptospira с помощью MS затруднена отсутствием эталонных MSP в существующих международных таксономических базах.

Цель данного исследования — получение MSP патогенных штаммов Leptospira spp. из коллекции лаборатории зооантропонозных инфекций НИИЭМ им. Пастера.

Экстракты клеток 9-ти штаммов Leptospira, относящихся к 3-м геномовидам L. interrogans, L. borg-petersenii, L. kirschneri и 7-ми серогруппам получали этанольно-муравьинокислотным методом. Образцы экстрактов наносили 6-ти кратно по 1 мкл в лунки MALDI мишени. В качестве матрицы использовали раствор циано-коричной кислоты в 50% ацетонитри-ле и 2,5% трифторуксусной кислоте. Масс-спектры были получены на масс-спектрометре Microflex и преобразованы в MSP для каждого штамма с помощью программы MALDI Biotyper 3.0 (Bruker Daltonik, Германия). Как сравнительный контроль использовали эталонный MSP спирохеты Brachyspira murdochii из таксономической библиотеки Bruker. Сравнение MSP осуществляли визуализацией в виде построения дендрограмм.

Все штаммы Leptospira spp. дали специфические белковые профили, кластеризация которых на ден-дрограмме четко отличалась от MSP контроля сравнения. При этом не выявлена группировка MSP референсных штаммов на кластеры согласно таксономическим видам, но наблюдалась кластеризация MSP по серотипам Sejroe, Ballum, Icterohaemorrhagiae.

Полученные результаты свидетельствуют о возможности использования метода MALDI-TOF MS для серотипирования патогенных лептоспир.

СОВРЕМЕННЫЕ ФАКТОРЫ ПЕРЕДАЧИ ВОЗБУДИТЕЛЕЙ ОСТРЫХ КИШЕЧНЫХ ИНФЕКЦИЙ

И.В. Лихачев, Л.А. Кафтырева

ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, Санкт -Петербург

Острые кишечные инфекции (ОКИ) имеют глобальное распространение, регистрируются среди детского и взрослого населения и имеют широкий спектр этиологии. Такая тенденция отмечается практически во всех странах.

Цель исследования: оценить значимость продуктов, ранее не рассматриваемых как факторы передачи ОКИ (так называемые «нетрадиционные»).

Задачи: анализ вспышек ОКИ, зарегистрированных в последнее десятилетие в ряде стран, выявление ведущих факторов передачи пищевых вспышек и оценка эпидемиологической значимости различных пищевых продуктов в структуре ОКИ.

Материалы и методы: отечественная и зарубежная статистика регистрации вспышек ОКИ, вызванных нетрадиционными с точки зрения эпидемиологии пищевыми продуктами.

Результаты. Bacillus cereus был причиной 46% пищевых вспышек, обусловленных зерновыми, бобовыми и растительными продуктами и не более 25% — мясомолочными. Причиной вспышек, вызванных

энтерогеморрагическими (E. coli О157) и энтеротокси-генными эшерихиями, продуцирующими экзотоксины (шигатоксины и энтеротоксины соответственно) в 30% были продукты растительного происхождения, в 15% зерновые и бобовые, в 35% — мясные. Доля молочных вспышек не превышала 6%. Микроаэрофильные микроорганизмы, такие как Campylobacter spp. чаще выделялись из мясо-молочных продуктов (58,5%), поскольку вакуумная упаковка способствовала их длительному сохранению. Факторами передачи вирусных кишечных патогенов, таких как Norovirus, Rotavirus, Sapovirus, чаще являлись контаминиро-ванные растительные продукты — от 50% (Sapovirus) до 31% (Norovirus), реже — мясные продукты (16%), и с одинаковой частотой (8—10%) — молочные и яичные, зерновые и бобовые продукты (9—16%), масла и сахара (9—10%). Следует отметить, что такой фактор передачи, как спиртные напитки (вина) нередко были контаминированы различными микроорганизмами (B. cereus — в 6% случаев, Campylobacter — в 7% случаев, Clostridium botulinym — 11% случаев, Clostidium perfringens — 8% случаев, E. coli — от 7 до 11 %, различных сероваров Salmonella — от 2 до 13%, вирусов (Norovirus, Rotairus, Sapovirus) — до 10%).

Таким образом, настоящее время особенностью факторов передачи ОКИ является активная роль продуктов растительного происхождения, зерновых и бобовых продуктов, употребляемых без термической обработки, а также спиртосодержащих напитков. Профилактика ОКИ в настоящее время должна включать лабораторный контроль широкого спектра возбудителей.

ЛОКАЛЬНЫЙ ГУМОРАЛЬНЫЙ ИММУННЫЙ ОТВЕТ К СЕЗОННЫМ, ПАНДЕМИЧЕСКИМ И ПОТЕНЦИАЛЬНО ПАНДЕМИЧЕСКИМ ЖИВЫМ ГРИППОЗНЫМ ВАКЦИНАМ

И.В. Лосев, Г.Д. Петухова, С.А. Донина, С.А. Кузнецова, А.Н. Найхин

ФГБУ НИИ экспериментальной медицины СЗО РАМН, Санкт-Петербург

Локальный иммунитет верхних дыхательных путей — один из важнейших факторов защиты от гриппа. Живые аттенуированные гриппозные вакцины (ЖГВ) вызывают выраженный локальный иммунный ответ. Ранее нами было показано существо -вание прямой зависимости между защитой людей от гриппозной инфекции и уровнем секреторных IgA антител в слюне и носовых секретах. Целью настоящей работы является сравнение формирования локального иммунного ответа на сезонную пандемическую ЖГВ А (H1N1)pdm2009 и потенциально пандемические ЖГВ, приготовленные из птичьих вирусов А (H5N2) и А (H7N3).

Материалы и методы. Здоровые волонтеры 18—20 лет прививались однократно тривалентны-ми сезонными ЖГВ или двукратно моновалентными ЖГВ А/17/Калифорния/2009/38 (H1N1), А/17/ Утка/Потсдам/86/92 (H5N2) и A/17/Дикая утка/ Нидерланды/00/95 (H7N3). Образцы носовых секретов, слюны и сывороток крови собирали до вакцинации, на 28 день после вакцинации и на 28 день после ревакцинации. Титры сывороточных антител измеряли в РТГА. Уровни локальных IgA в носовых секретах и слюне определяли с помощью ИФА. Для изучения авидности антител применялся тест с мочевиной.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.