Научная статья на тему 'Изучение биохимических и молекулярно-генетических особенностей межвидовых гибридов сахарной свёклы'

Изучение биохимических и молекулярно-генетических особенностей межвидовых гибридов сахарной свёклы Текст научной статьи по специальности «Агробиотехнологии»

CC BY
98
25
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Журнал
Сахар
ВАК
Область наук
Ключевые слова
сахарная свёкла / межвидовые гибриды / биохимическая оценка / ПЦР-анализ / suger beet / interspecific hybrids / biochemical assessment / PCR analysis

Аннотация научной статьи по агробиотехнологии, автор научной работы — Е. Н. Васильченко, Т. П. Жужжалова, О. А. Землянухина, Е. О. Колесникова

В статье приведена физиолого-биохимическая и молекулярногенетическая оценка межвидовых форм сахарной свёклы в культуре in vitro. Показано, что диплоидные (2n = 18), триплоидные (3n = 27) и миксоплоидные (2n = 27; 18) растения, полученные от скрещивания B. vulgaris L. × B. corolliflora Z., различались по общей активности пероксидазы и глюкозо-6-Р-дегидрогеназы. В результате проведённого молекулярного анализа методом ПЦР у части растений, полученных от скрещивания, был выявлен чужеродный генетический материал, присущий дикому виду.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

The article presents a physiological-biochemical and molecular-genetic assessment of interspecific forms of sugar beet in in vitro culture. It was shown that diploid (2n = 18), triploid (3n = 27) and mixoploid (2n = 27; 18) plants obtained from crossing B. vulgaris L. × B. corolliflora Z. differed in the total activity of peroxidase and glucose-6-P-dehydrogenase. As a result of the conducted molecular analysis by PCR in some plants obtained from crossing, foreign genetic material inherent in the wild species was identified.

Текст научной работы на тему «Изучение биохимических и молекулярно-генетических особенностей межвидовых гибридов сахарной свёклы»

технология высоких урожаев

УДК 633.63:581.143.6 doi.org/10.24411/2413-5518-2020-10705

Изучение биохимических и молекулярно-генетических особенностей межвидовых гибридов сахарной свёклы

е.н. Васильченко, ст. научн. сотрудник

Т.П. ЖУЖЖАЛОВА, гл. научн. сотрудник, д-р биолог. наук, профессор О.А. ЗЕМЛЯНУХИНА, научн. сотрудник, канд. биолог. наук е.о. Колесникова, ст. научн. сотрудник

ФГБНУ «Всероссийский научно-исследовательский институт сахарной свёклы и сахара имени А.Л. Мазлумова» (e-mail: biotechnologiya@mail.ru)

Введение

В современных условиях развития сельскохозяйственного производства приоритетным направлением в селекции сахарной свёклы является создание высокопродуктивных гибридов на линейной основе. В повышении продуктивности сахарной свёклы и производства сахара из этой культуры важная роль принадлежит созданию принципиально новых исходных материалов и на их основе сортов и гибридов, пригодных для возделывания по интенсивной технологии. Большая экономическая значимость сахарной свёклы в России требует в настоящее время внедрения в селекционный процесс нетрадиционных биотехнологических методов на основе культуры изолированных органов и тканей, позволяющих целенаправленно получать генетически улучшенный исходный материал для создания перспективных гибридов нового поколения. Данные технологии могут быть реализованы лишь с учётом специфики морфогенетических потенций развития органов растений, обеспечивающих в условиях in vitro активные процессы морфогенеза, регенерации и размножения [1].

Важнейшим методом обогащения культурных растений явля-

ется межвидовая гибридизация, посредством которой совершается передача ценных признаков от диких видов к культурным. Это позволяет расширить спектр генетической изменчивости сахарной свёклы, а также получить адаптивные генотипы с хозяйственно ценными признаками [2]. По литературным данным известно, что отдалённая и межвидовая гибридизация являются мощным стрессовым фактором, способным вызывать структурные изменения гибридизуемого генома в процессе его стабилизации [3].

Особое значение при разработке биотехнологических схем культивирования приобретает использование биохимических маркерных признаков, ускоряющих и облегчающих процессы создания и отбора форм растений с новыми свойствами в условиях in vitro. Физиолого-биохимический анализ на начальных стадиях развития созданных форм может помочь выделить наиболее интересные экземпляры с точки зрения устойчивости к разного рода стрессам, включая получение гибридных растений. Это связано с тем, что сами по себе условия in vitro являются стрессовыми, меняют программу работы генов, другими словами — изменяют эпигенетическую программу [4].

Для более эффективного применения в селекции полученных интрогрессивных форм, несущих новые гены устойчивости, представляет интерес исследование особенностей интрогрессии элементов донора.

Детекцию интрогрессии чужеродного генетического материала в геноме сахарной свёклы проводят с помощью ДНК-маркеров. В настоящее время широко используются методы исследования полиморфизма на уровне ДНК — установление нуклеотидной последовательности, метод полимеразной цепной реакции, метод рестрикционного анализа и др.

Метод полимеразной цепной реакции (ПЦР), или специфичной амплификации ДНК, — наиболее простой и не требует больших материальных затрат, с его помощью изучают структуру генома, определяют степень гибридности, идентифицируют сорта, гибриды и линии. На данный момент разработаны различные модификации ПЦР и оценена их возможность для решения прикладных задач.

В связи с вышеизложенным целью настоящих исследований явилось выявление физиолого-биохимических и молекулярно-генетических особенностей у растений-регенерантов сахарной свёклы, полученных при межвидовой

34 САХАР № 7 • 2020

ТЕХНОЛОГИЯ ВЫСОКИХ УРОЖАЕВ

гибридизации, культивируемых в условиях in vitro.

Материалы и методы

В работе были использованы материалы Рамонской селекции ФГБНУ ВНИИСС им. А.Л. Маз-лумова.

Для получения межвидовых гибридов использовали мужскостерильную (МС) односемянную форму B. vulgaris L. (2n = 18) и фертильную многосемянную дикую форму B. corolliflora Z. (4n = 36). В целях получения межвидовых гибридов проводили принудительное опыление пыльцой дикого вида. Асептические незрелые зародыши от межвидовой гибридизации B. vulgaris х B corolliflora вводили в культуру in vitro на агаризованные питательные среды. Отбор полученных в результате скрещивания межвидовых форм с разным набором хромосом (2n = 18; 3n = 27; 2n = 27; 18) и их родительских компонентов осуществляли с помощью проточной цитофотометрии на анализаторе плоидности Partec PA.

Активность пероксидазы (ПО; КФ 1.11.1.7) определяли в гомогенатах тканей растений в реакции окисления бензидина. Активность

глюкозо-6-фосфатдегидрогеназы (Г6ФД; КФ 1.1.1.49), определяли по методике А.А. Землянухина [5].

Детекцию интрогрессии чужеродного генетического материала в геном сахарной свёклы проводили методом ПЦР-амплификации с использованием видоспецифических праймеров [6].

Результаты исследований

В результате исследований выявлено, что диплоидные (2n = 18), триплоидные (3n=27) и миксопло-идные (2n = 27; 18) гибридные растения, полученные от скрещивания B. vulgaris L. х B. corolliflora Z., различались по общей активности фермента пероксидазы (ПО). Так, у диплоидных растений она оказалась примерно равной активности ПО у материнской формы и составила 9 ФЕ/мл; эта активность примерно на 4 ФЕ/мл выше, чем у отцовского компонента — дикой свёклы (рис. 1).

Следует отметить, что активность пероксидазы миксоплоид-ных растений-регенерантов была значительно (почти в 3 раза) ниже, чем у материнской формы, и её показатель соответствовал 3,5 ФЕ/мл. Триплоидные растения характеризовались понижен-

ной активностью данного фермента по сравнению с культурной свёклой в 3 раза (3,8—3,9 ФЕ/мл) и в 1,5 раза в сравнении с дикими видом B. corolliflora.

Изучение общей активности глюкозо-6-фосфатдегидрогеназы (глюкозо-6-Ф-ДГ) выявило значительное её повышение по сравнению с родительскими формами, которая у 27-хромосомных растений была выше в 2 раза (0,12 ФЕ/мл), а у 18-хромосомных растений — в 3,5 раза (0,18 ФЕ/мл). У миксоплоидных форм этот показатель составил 0,06 ФЕ/мл и практически не отличался от родительских компонентов (рис. 2).

Изменения ферментативной активности вызваны, по-видимому, стрессовым состоянием метаболизма гибридных растений при интрогрессии генома дикой свёклы в геном сахарной, а также изменением плоидности клеток.

В результате молекулярного анализа методом ПЦР у части растений, полученных от скрещивания B. vulgaris L. х В. corolliflora Z., был выявлен чужеродный генетический материал, присущий дикому виду. ПЦР-анализ позволил выявить у диплоидных и миксопло-

ФЕ/мл

12

ФЕ/мл 0,2 _

\о~ И

*5

\§-н

<2^

Рис. 1. Общая активность пероксидазы у родительских форм и межвидовых гибридов

Рис. 2. Общая активность глюкозо-6-Ф-ДГ родительских форм и гибридных растений

№ 7 • 2020 САХАР 35

технология высоких урожаев

идных гибридных потомств са-теллитные участки ДНК (размер амплифицированного фрагмента составил 161 п. н.), видоспецифичные для В. corolliflora Z. (рис. 3). У материнских МС-растений и 27-хромосомных растений данный фрагмент отсутствовал.

Выявленный продукт полимеразной цепной реакции (161 п. н.) является результатом специфического связывания праймера с матрицей, что подтверждает наличие сателлитной последовательности Нае III, которая представляет собой видоспецифический признак дикого вида свёклы В. comUiflom в геноме исследуемых растений. Результаты экспериментов указывают на то, что в составе генетического аппарата растений, полученных от скрещивания B. vulgaris х В. corolliflora, присутствуют некоторые элементы дикой свёклы. Это позволило нам предположить, что 18-хро-мосомные растения, несущие фенотип культурной свёклы, являются гибридными, имеющими отдельные элементы генома дикого вида; поэтому их можно использовать при отборе исходных форм для селекционной работы [7]. Кроме того, для выявления межвидовых гибридов свёклы ис-

пользуют также праймеры к са-теллитной ДНК, видоспецифичной для B. vulgaris.

Амплификация ДНК родительских форм и растений от межвидового скрещивания B. vulgaris х х B. corolliflora показала наличие элементов генома культурной свёклы в гибридных формах (рис. 4).

В результате амплификации геномных ДНК растений, полученных от скрещивания B. Vulgaris х х B. corolliflora, со специфическими праймерами, было установлено, что искомая сателлитная ДНК присутствует в диплоидной, миксоплоидной и триплоидной формах гибридов в разной степени выраженности. В миксопло-идной форме чётко выражены 4 тандемных повтора, в то время как в диплоидных и триплоидных растениях сателлитная последовательность повторяется большее число раз, о чём свидетельствует наличие минорных продуктов амплификации. Результаты указывают на то, что в составе генетического аппарата как диплоидных, триплоидных, так и мик-соплоидных растений, полученных от скрещивания B. vulgaris х х B. corolliflora, присутствуют элементы ДНК культурной свёклы. Анализ полученных электрофоре-грамм свидетельствует, что в гено-

6

ме B. vulgaris наблюдается наличие двух тандемов сателлитной ДНК. В геноме B. corolliflora таких повторов обнаружено не было.

Выводы

Представленные результаты показывают физиолого-биохимические особенности у растений свёклы в условиях in vitro, позволяющие проследить изменения активности фермента окислительного стресса - пероксидазы и некоторых ключевых ферментов основных метаболических циклов клетки.

В результате молекулярного анализа у диплоидных гибридов (2n = 18) и миксоплоидов (2n = 27; 18), полученных от скрещивания B. vulgaris L. х В. corolliflora Z., были выявлены сателлитные участки ДНК, видоспецифичные для дикого вида В. corolliflora Z.

Проведённый ПЦР-анализ родительских и гибридных форм с использованием праймеров к видоспецифической сател-литной ДНК B. vulgaris является точным методом идентификации

1 2 3 4 5 М

Рис. 4. Амплификация геномной ДНК родительских форм свёклы и гибридных растений со специфическими праймерами к сателлитной ДНК B. vulgaris: 1 — B. vulgaris; 2 — B. т-rolliflora; 3 — диплоидные растения (2n = 18); 4 — миксоплоидныерастения (2n = 27; 18); 5 — триплоидные растения (3n = 27); М — маркеры молекулярной массы ДНК

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10

Рис. 3. ПЦР-продуктыродительских форм и межвидовых гибридов: 1 — маркер молекулярной массы; 2, 6 — материнская МС-форма; 3, 8 — растения (3n = 27); 4, 9 — растения-миксоплоиды (2n = 27; 18); 5 — растение (2n = 18);

7 — B. corolliflora; 10 — отрицательный контроль (вода)

36 САХАР № 7 • 2020

чужеродного материала в геноме гибридных растений. В частности, метод амплификации геномной ДНК со специфическими праймерами к данной сателлит-ной ДНК можно использовать для оценки генетического родства гибридных и родительских форм свёклы.

В результате экспериментов выделены и отобраны межвидовые гибриды сахарной свёклы с морфологическими и функциональными изменениями генома, которые можно использовать в качестве исходных форм в процессе селекционной работы.

Список литературы

1. Бутенко, Р.Г. Биология клеток высших растений in vitro и биотехнологии на их основе. — Р.Г. Бутенко. — М., 1999. - 160 с.

2. Бунин, М.С. Межвидовая гибридизация в роде Capsicum L. и её использование в селекции. Методика / М.С. Бунин [и др.]. — М., 2008 — 82 с.

3. Тютерев, С.Л. Экологически безопасные индукторы устойчивости растений к болезням и физиологическим

стрессам / С.Л. Тютерев // Вестник защиты растений. — 2015. — Т. 1. — № 83. — С. 3—13.

4. Ванюшин, Б.Ф. Эпигенетика сегодня и завтра // Вавиловский журнал селекции и генетики. — 2013. — Т. 17. — № 4—2. — С. 805—832.

5. Землянухин, А.А. Большой практикум по физиологии и биохимии растений / А.А. Землянухин, Л.А. Землянухин. — Воронеж : ВГУ, 1996. — 188 с.

6. Буренин, В.И. Генетические ресурсы рода Beta (свёкла) / В.И. Буренин. — СПб., 2007. — 274 с.

7. Федулова, Т.П. Использование ПЦР-анализа для идентификации межвидовых гибридов Beta vulgaris х х Beta corolliflora zoss / Т.П. Федулова [и др.] // Биотехнология: состояние и перспективы развития. Пятый московский международный конгресс. Ч. 1. — М., 2009. — Стр. 312—313.

Аннотация. В статье приведена физиолого-биохимическая и молекулярногенетическая оценка межвидовых форм сахарной свёклы в культуре in vitro. Показано, что диплоидные (2n = 18), триплоидные (3n = 27) и миксоплоидные (2n = 27; 18) растения, полученные от скрещивания B. vulgaris L. х B. corolliflora Z., различались по общей активности пероксидазы и глюкозо-6-Р-дегидрогеназы.

В результате проведённого молекулярного анализа методом ПЦР у части растений, полученных от скрещивания, был выявлен чужеродный генетический материал, присущий дикому виду.

Ключевые слова: сахарная свёкла, межвидовые гибриды, биохимическая оценка, ПЦР-анализ.

Summary. The article presents a physiological-biochemical and molecular-genetic assessment of interspecific forms of sugar beet in in vitro culture. It was shown that diploid (2n = 18), triploid (3n = 27) and mixoploid (2n = 27; 18) plants obtained from crossing B. vulgaris L. х B. corolliflora Z. differed in the total activity of peroxidase and glucose-6-P-dehydrogenase. As a result of the conducted molecular analysis by PCR in some plants obtained from crossing, foreign genetic material inherent in the wild species was identified.

Keywords: suger beet, interspecific hybrids, biochemical assessment, PCR analysis

№ 7 • 2020 САХАР 37

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.