CC BY
0
| ГЕМАТОЛОГИЯ И ТРАНСФУЗИОЛОГИЯ | RUSSIAN JOURNAL OF HEMATOLOGY AND TRANSFUSIOLOGY (GEMATOLOGIYA I TRANSFUSIOLOGIYA) | 2022; ТОМ 67; №2 |
с помощью компьютерной программы Arlequin 3.5, как и стандартизованное значение неравновесного сцепления генов (D').
Результаты и обсуждение. Определено 565 различных га-плотипов HLA-A-C, 765 гаплотипов HLA-A-B, 345 гаплотипов HLA-B-C, 744 гаплотипа HLA-B-DRB1, 99 гаплотипов HLA-DRB1-DOB1. Разнообразие HLA-гаплотипов связано со значительным числом гаплотипов с низкой частотой встречаемости, однако ^большая часть доноров являлась носителями относительно небольшого числа распространенных гаплотипов (см. рис.). Кумулятивная частота наиболее распространенных (с частотой >1%) гаплотипов HLA-A-B составила 36%; наиболее распространенных гаплотипов HLA-A-C — 45%; гаплотипов HLA-B-C — 62%; гаплотипов HLA-B-DRB1 - 35%; DRB1-DOB1 - 87%. Самый распространенный среди гаплотипов HLA-A-B — гапло-тип А®01:01:01:01-В®08:01:01:01(5,4%) с высоким неравновесным сцеплением генов (Dv=0,81); среди гаплотипов HLA-A-C — га-плотип А®01:01:01:01-С®07:01:01:01/16 с незначительным сцеплением генов (D^=0,43); среди гаплотипов HLA-B-C — гаплотип В®07:02:01:01-С®07:02:01:03 (D^=0,92); среди гаплотипов HLA-B-DRB1 - B®07:02:01:01-DRB1®15:01:01 (D"= 0,51); среди гаплотипов DRB1-DOB1 - DRB1®15:01:01-DQB1®06:02:01 (D^=0,98). Конкретные пары аллелей, составляющие HLA-гаплотипы, значительно различались между собой по силе сцепления. Сцепление генов было наиболее сильно выражено для гаплотипов, входящих в основные блоки HLA-гаплотипов — HLA-DRB1-DOB1 (гены блока дельта) и HLA-B-C (гены блока бета). Хотя гены в гапло-типе HLA-A-C находятся ближе друг к другу по расположению на хромосоме, чем в гаплотипе HLA-A-B, однако неравновесное сцепление в последней паре генов было более выражено.
Заключение. Распределение двухлокусных HLA-гаплотипов соответствует распределению с «длинным хвостом» (heavy-tail distribution), при котором за компактной группой распространенных гаплотипов, носителями которых является значительная часть доноров, тянется «длинный хвост» из редких гаплотипов. Присутствие редких гаплотипов в популяции создает проблему с подбором полностью HLA-совместимого донора для их носителей, если им показана алло-ТГСК от неродственного донора.
Хрульнова С. А., Клясова Г. А., Фёдорова А. В., Фролова И. Н., Ликольд Е. Б.
ГЕНОТИПИРОВАНИЕ PSEUDOMONAS AERUGINOSA С ПРОДУКЦИЕЙ МЕТАЛЛО- ß-Л АКТАМ A3, ВЫДЕЛЕННЫХ ИЗ ГЕМОКУЛЬТУРЫ БОЛЬНЫХ ЗАБОЛЕВАНИЯМИ СИСТЕМЫ КРОВИ, МЕТОДОМ МУЛЬТИЛОКУСНОГО СЕКВЕНИРОВАНИЯ-ТИПИРОВАНИЯ
ФГБУ «НМИЦ гематологии» Минздрава России
Введение. Р^еидотопал аегидспо^а — один из наиболее значимых внутрибольничных патогенов, вызывающих инфекции кровотока с высокой летальностью. В настоящее время наибольшее клиническое и эпидемиологическое значение имеет способность Р. аегидто^а продуцировать приобретенные металло-Р-лактама-зы (МБЛ). Также среди Р. аегид'ьпоёа выделяют клоны «высокого риска», такие как 8Т235, 8Т111, 8Т175, 8Т654 и другие. Штаммы, принадлежащие к клонам «высокого риска», чаще характеризуются фенотипом множественной и экстремальной устойчивости вследствие приобретения разнообразных генов антибиотикорези-стентности, в том числе генов МБЛ.
Цель работы. Изучить генетическое разнообразие МБЛ-продуцирующих Р. аегидтом, выделенных из крови больных заболеваниями системы крови.
Материалы и методы. Материалом исследования были изо-ляты Р. ае-гидтом, выделенные из гемокультуры больных, находившихся на стационарном лечении в 11 лечебных учреждениях России (2003—2020 гг.). Чувствительность изолятов Р. аегидтола к карбапенемам оценивали согласно критериям СБ81 (2021). Наличие генов МБЛ класса В (групп Ь1а1МР, Ь1аУ1М и Ыа^М) определяли методом ПЦР в режиме реального времени с использованием коммерческих наборов. Для характеристики клональ-ной структуры популяции был использован метод мультилокус-ного секвенирования-типирования (МЛСТ) (https://pubmlst.org/ organisms/pseudomonas-aeruginosa/).
Результаты и обсуждение. Всего было исследовано 394 изо-лята Р. аегидто^а, из которых 166 (42,1%) были нечувствительными к меропенему и/или имипенему. Гены приобретенных МБЛ были обнаружены у 41,6% (69 из 166) карбапенем-нечуствитель-ных изолятов. Гены группы Ь1аУ1М были доминирующими, их доля составила 98,6% (68 из 69). В геноме одного изолята были обнаружены гены группы Ь1а1МР (1,7%). Гены группы blaNDM не были выявлены. При генотипировании 69 карбапенемазопро-дуцирующих Р. аегидто^а было выявлено 9 сиквенс-типов (8Т).
Подавляющее большинство исследуемых штаммов (89,9%) принадлежало к трем сиквенс-типам — 8Т235 (п=44;63,8%), 8Т654 (п=10;14,5%) и 8Т234 (п=8; 11,6%) (рис.). В первый период исследования (2003—2011 гг.) было выделено 33 МБЛ-продуцирующих Р. аггид 'игоёа, во второй (2012—2020 гг.) — 36 штаммов. Р. аегидмом 8Т235 были доминирующими в течение обоих периодов исследования, и их доля осталась неизменной (63,6 и 63,9% соответственно), в то время как доля других сиквенс-типов претерпевала изменения. Так, Р. ае-гидтом 8Т234 не были выявлены в 2012—2020 гг. (р=0,0017), в то время как доля 8Т645 значительно увеличилась до 27,8% (10/36)(р=0,001).
Заключение. Почти половина (42,1%) всех Р. аегидмом, выделенных из гемокультуры, были карбапенем-нечувствительными, среди которых гены приобретенных МБЛ были выявленыу 41,6%. Большинство МБЛ-продуцирующих Р. а£гид'иго,ш. (63,8%) относились к международному клону «высокого риска» 8Т235. В ходе исследования клональный состав Р. аегид'ьпоёа с продукцией кар-бапенемаз претерпел изменения, но клон «высокого риска» 8Т235 был наиболее распространенным в течение всего периода исследования, и его можно рассматривать как эндемичный для гематологических отделений России.
