Научная статья на тему 'ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ИЗМЕНЧИВОСТЬ ПОПУЛЯЦИЙ КУР РАЗНОГО НАПРАВЛЕНИЯ ПРОДУКТИВНОСТИ ПО SNPS В ЛОКУСЕ, ВКЛЮЧАЮЩЕМ ГЕН МИОСТАТИН'

ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ИЗМЕНЧИВОСТЬ ПОПУЛЯЦИЙ КУР РАЗНОГО НАПРАВЛЕНИЯ ПРОДУКТИВНОСТИ ПО SNPS В ЛОКУСЕ, ВКЛЮЧАЮЩЕМ ГЕН МИОСТАТИН Текст научной статьи по специальности «Животноводство и молочное дело»

CC BY
185
25
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Ключевые слова
КУРИЦА / SNPS / МИОСТАТИН / ЖИВАЯ МАССА / ГЕНОТИП / CHICKEN / MYOSTATIN / LIVE WEIGHT / GENOTYPE

Аннотация научной статьи по животноводству и молочному делу, автор научной работы — Дементьева Наталия Викторовна, Митрофанова Ольга Викторовна, Ларкина Татьяна Александровна

Для ускорения селекционного прогресса в птицеводстве используются ДНК-маркёры, в том числе SNPs (Single nucleotide polymorphism), ассоциированные с показателями экстерьера курицы. Живая масса является одним из основных критериев при отборе птицы. Среди генов, ассоциированных с живой массой, мажорным является ген миостатин (MSTN), влияющий на рост и увеличение мышечной массы. Целью данного исследования являлся анализ частоты встречаемости генотипов по заменам rs14597164 и rs317925256, расположенных в локусе, включающем ген MSTN, у кур разного направления продуктивности. Различия между популяциями кур генофондных пород позволяют оценить генетическую значимость полиморфных вариантов при формировании живой массы и экстерьерных характеристик птицы в процессе отбора. В популяциях кур мясного направления продуктивности в полиморфном варианте rs14597164 преобладает генотип ТТ (> 0,6). Больше половины особей были носителями гетерозиготного генотипа TG у представителей мясо-яичных пород. У кур яичного и декоративного типа практически все особи (> 0,95) являлись носителями генотипа GG. По замене rs317925256 не выявлено значимых различий по встречаемости генотипов в популяциях кур биоресурсной коллекции, отличающихся направлением продуктивности. В результате исследования получены данные о возможном влиянии одиночного SNP rs14597164 в формировании признака «живая масса» у кур.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по животноводству и молочному делу , автор научной работы — Дементьева Наталия Викторовна, Митрофанова Ольга Викторовна, Ларкина Татьяна Александровна

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

GENETIC VARIABILITY OF CHICK POPULATIONS WITH DIFFERENT PRODUCTIVITY DIRECTIONS FOR SNPS IN THE LOCUS CONTAINING THE MYOSTATIN GENE

Live weight is one of the main criteria for the selection of birds. Among the genes associated with live weight, the myostatin (MSTN) gene, which affects the growth and increase of muscle mass, is major.The aim of this study was to analyze the frequency of occurrence of genotypes by substituting rs14597164 and rs317925256 located at a locus including the MSTN gene in chickens of different directions of productivity. Differences between the populations of hens of gene pool species allow us to assess the genetic significance of polymorphic variants in the formation of live weight and exterior characteristics of birds in the selection process. In the chicken populations of meat production direction in the polymorphic variant rs14597164, the TT genotype was predominant (>0.6). More than half of the individuals were carriers of the heterozygous TG genotype in representatives of meat and egg breeds. In chickens of the egg and decorative type, almost all individuals (>0.95) were carriers of the GG genotype. By replacing rs317925256, no significant differences were found in the occurrence of genotypes in chicken populations of the bioresource collection that differ in productivity direction. As a result of our study, data were obtained on the possible effect of a single SNP rs14597164 in the formation of the “live weight” trait in chickens.

Текст научной работы на тему «ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ИЗМЕНЧИВОСТЬ ПОПУЛЯЦИЙ КУР РАЗНОГО НАПРАВЛЕНИЯ ПРОДУКТИВНОСТИ ПО SNPS В ЛОКУСЕ, ВКЛЮЧАЮЩЕМ ГЕН МИОСТАТИН»

Столбова Ольга Александровна, кандидат ветеринарных наук, доцент Скосырских Людмила Николаевна, кандидат ветеринарных наук, доцент ФГБОУ ВО «Государственный аграрный университет Северного Зауралья» Россия, 625003, г. Тюмень, ул. Республики, 7 E-mail: rus72-78@mail.ru

Treatment and preventive measures against yolk peritonitis in hens

Stolbova Olga Aleksandrovna, Candidate of Veterinary Sciences, Associate Professor Skosyrskih Lyudmila Nikolaevna, Candidate of Veterinary Sciences, Associate professor State Agrarian University of the Northern Trans-Urals 7, Republic St., Tyumen, 625003, Russia E-mail: rus72-78@mail.ru

In recent years, the share of non-communicable diseases that cause mass culling, mortality and forced slaughter of sick poultry has noticeably increased in many farms. One of such diseases in laying hens is vitelline peritonitis. In poultry farms in Europe and the Russian Federation, the death of laying hens from yolk peritonitis under certain conditions can reach 20 - 40 % of all causes of death of a bird. Given the damage caused by yolk peritonitis to industrial poultry farming, the aim of the research was to study the occurrence of this pathology in the Tyumen region and to analyze treatment and preventive measures. The work was carried out in the period from 2016 to 2019. on the basis of PJSC "Borovskaya Poultry Farm" of the Tyumen region of the Tyumen region. 589 626 chickens of Cross-Line High Brown of various ages were examined. The diagnosis was established taking into account anamnestic data, general research methods (examination, palpation, thermometry), laboratory blood tests and postmortem autopsy. It was established that respiratory diseases (23.42 %), colibacteriosis (19.71 %), hepatitis (18.65 %), egg formation diseases (14.36 %) occupy a leading position, and vitelline peritonitis is only in fifth place (13.42 %). Of the three proposed treatment regimens, the third one with oral administration per head was the most effective: ascorbic acid 15 mg, calcium chloride 0.1 g, potassium iodide 3 mg and lexoflon® OR at a dose of 1 ml per 20 kg of body weight.

Key words: poultry farming, laying hens, non-communicable diseases, vitelline peritonitis, therapy, prevention.

DOI 10.37670/2073-0853-2020-84-4-228-231

-♦-

УДК 636.52:575.174.015.3

Генетическая изменчивость популяций кур разного направления продуктивности по SNPs в локусе, включающем ген миостатин*

Н.В. Дементьева, канд. биол. наук; О.В. Митрофанова, канд. биол. наук;

Т.А. Ларкина, канд. биол. наук

ВНИИГРЖ

Для ускорения селекционного прогресса в птицеводстве используются ДНК-маркёры, в том числе SNPs (Single nucleotide polymorphism), ассоциированные с показателями экстерьера курицы. Живая масса является одним из основных критериев при отборе птицы. Среди генов, ассоциированных с живой массой, мажорным является ген миостатин (MSTN), влияющий на рост и увеличение мышечной массы. Целью данного исследования являлся анализ частоты встречаемости генотипов по заменам rs14597164 и rs317925256, расположенных в локусе, включающем ген MSTN, у кур разного направления продуктивности. Различия между популяциями кур генофондных пород позволяют оценить генетическую значимость полиморфных вариантов при формировании живой массы и экстерьерных характеристик птицы в процессе отбора. В популяциях кур мясного направления продуктивности в полиморфном варианте rs14597164 преобладает генотип ТТ (> 0,6). Больше половины особей были носителями гетерозиготного генотипа TG у представителей мясо-яичных пород. У кур яичного и декоративного типа практически все особи (> 0,95) являлись носителями генотипа GG. По замене rs317925256 не выявлено значимых различий по встречаемости генотипов в популяциях кур биоресурсной коллекции, отличающихся направлением продуктивности. В результате исследования получены данные о возможном влиянии одиночного SNP rs14597164 в формировании признака «живая масса» у кур.

Ключевые слова: курица, SNPs, миостатин, живая масса, генотип.

* Исследование выполнено в рамках государственного задания АААА-А18-118021590138-1 с использованием популяций кур из биоресурсной коллекции ЦКП «Генетическая коллекция редких и исчезающих пород кур» (ВНИИГРЖ, Санкт-Петербург, Пушкин).

известия оренбургского государственного аграрного университета

2020 • № 4 (84)

Важным источником увеличения производства продуктов питания является повышение мясной продуктивности птицы. Целенаправленная селекционная работа позволила исследователям за последние два десятилетия получить породы, линии и кроссы птиц с высокими продуктивными и воспроизводительными качествами как в России, так и за рубежом.

Влияющие на изменчивость живой массы полиморфизмы в генах являются важным селекционным инструментом для совершенствования пород [1, 2]. В течение последних десятилетий в геноме курицы (Gallus Gallus) было обнаружено множество QTL (Quantitative Trait Loci), ассоциированных с живой массой (https://www. animalgenome .org/cgi-bin/QTLdb/index). Исследования показали, что значимые SNP регистрируются не только в генах, но и в межгенных участках [3]. Одним из генов, участвующих в формировании живой массы кур, является миостатин (MSTN). Тканеспецифичный белок миостатин адетектируется только в поперечнополосатой мышечной ткани скелетных мышц и не экспрессируется в гладкой мускулатуре внутренних органов [4]. Генетическая структура миостатина Gallus Gallus представлена тремя экзонами и двумя интронами, а кодирующая часть состоит из 2314 пар оснований [4]. SNPs, расположенные в локусе, включающем ген MSTN, могут быть эффективны в качестве генетических маркёров в селекции кур различного направления продуктивности [5]. В опытной популяции пушкинской породы кур биоресурсной коллекции ВНИИГРЖ на протяжении пяти поколений велась маркёрная селекция по гену MSTN на увеличение живой массы, которая достоверно (P < 0,001) изменила экстерьерный профиль взрослой птицы (330 дней) [6]. Селекция по одиночным маркёрам необходима и важна при разведении малочисленных и генофондных популяций кур.

Целью нашей работы было выявление генетической изменчивости в опытных популяциях кур различного направления продуктивности по двум SNPs, расположенным вблизи гена MSTN.

Материал и методы исследования. Исследование проводили на базе лаборатории молекулярной генетики ВНИИГРЖ. Объектом эксперимента служили популяции 12 пород и кроссов кур разного направления продуктивности (табл. 1) биоресурсной коллекции ВНИИГРЖ «Генетическая коллекция редких и исчезающих пород кур» (г. Пушкин, Санкт-Петербург).

Материалом для нашего исследования служила ДНК, выделенная из лейкоцитов цельной крови фенольным методом.

Район между изучаемыми SNP rs14597164 и rs317925256 имеет длину 37 kb и включает в себя ген MSTN. Для проведения генотипиро-вания нами были разработаны методы, основанные на ПЦР - ПДРФ (полимеразная цепная реакция и полиморфизм длины рестрикционных фрагментов). Подбор праймеров осуществляли в соответствии с первичной структурой ДНК GallusGallus в базе данных NCBI (https://www. ncbi.nlm.nih.gov). Условия ПЦР - ПДРФ приведены в таблице 2. Тест-система по каждому SNP содержала внутренний контроль полноты расщепления фрагмента рестриктазой. Для электрофореза использовали 1,5%-ные агарозные гели, содержащие флуоресцентный краситель бромистый этидий. Электрофорез проводили в течение 1 часа при рабочем напряжении 150 В.

Сигнал флуоресценции фотографировали в системе гель-документации фирмы Kоdаk.

Биометрическая обработка данных выполнена с помощью программы Microsoft Excel.

Результаты исследования. В результате ге-нотипирования выявили разнообразие генотипов по замене rs14597164 T > G среди опытных популяций генофондных пород. Результаты встречаемости генотипов у анализируемых популяций

1. Породы и кроссы кур, принимающие участие в исследовании

Направление продуктивно сти № популяции n Порода/кросс

1 20 брама светлая

Мясное 2 14 корниш х суссекс х амрок,

3 14 корниш х брама светлая х суссекс

4 25 суссекс

Мясо-яичное 5 19 нью-гемпшир

6 20 первомайская

7 20 аврора голубая

Яичное 8 20 павловская

9 17 панцыревская чёрная

10 20 гамбургская

Декоративные 11 19 китайская шёлковая

12 20 бентамка ситцевая

2. Условия проведения ПЦР - ПДРФ при генотипировании ге14597164 и ге317925256

/ ГО, позиция Аллель Праймер T °С отжига Размер ампликона Эндонуклеаза рестрикции Длина продуктов рестрикции и генотип

Ы4597164 / 250502 Т/О F: СТССТТАСААСАААСТОСТСТ RV: СТАООСТТОТОСТОСТАОТТ 60 212 Fae I ТТ-212 ТG-212/158/54 GG-158/54

ге317925256 / 213016 Т/С F: ТСТООТСААТТСТООАОСААТ RV: СТСАООАСТТССТСАССАОС 60 337 Pst I ТТ-337, ТС-337/244/93 СС-244/93

кур биоресурсной коллекции представлены на рисунке 1.

Анализ полиморфизма ге14597164 Т > G показал, что большая часть популяции кур брама светлая (мясного направления продуктивности) является носителем генотипа ТТ (0,6), генотип GT встречается с частотой 0,3, а генотип GG является редким и определён только у 10 % выборки кур. В кроссах корниш х суссекс х амрок и корниш х брама светлая х суссекс наблюдается равномерное распределение генотипов за счёт межпородного скрещивания.

У пород кур мясо-яичного направления продуктивности, таких, как суссекс, нью-гемпшир, первомайская, наблюдалось значительное преобладание гомозиготного генотипа GG (0,56; 0,53; 0,63), а генотип ТТ определён как редкий, и его частота составила (0,08; 0,1; 0,07) соответственно.

У кур яичного направления продуктивности (павловская и аврора голубая) отмечено значительное преобладание генотипа GG (0,95 и 0,95) и аллеля G (0,95). Хотя у кур породы панцыревская чёрная более половины выборки были носителями генотипа GT (0,53), однако также наблюдалось значительное преобладание аллеля G (0,94).

Куры декоративных популяций пород гамбургская, китайская шёлковая, бентамка были мономорфны по аллелю G.

Анализируя данные по SNP ге317925256, можно отметить, что во всех группах птиц были выявлены все три генотипа, при этом не отмечалось какого-либо сдвига в сторону одного из аллелей (рис. 2). Исключение составила декоративная порода китайская шёлковая, в которой наблюдали преобладание генотипа ТТ, что может быть связано с особенностями выборки.

В популяциях кур нью-гемпшир (%2 = 4,16), первомайская (%2 = 5,57) и китайская шелковая (х2 = 3,94) наблюдалось смещение генетического равновесия в связи с сильным селекционным давлением. В других анализируемых популяциях биоресурсной коллекции ВНИИГРЖ, независимо от породной принадлежности, значения %2 не превышали критического значения (3,84). Таким образом, не наблюдалось достоверной разницы между показателями наблюдаемой и ожидаемой гетерозиготности (табл. 3).

Выводы. В нашем исследовании выявлена генетическая изменчивость по SNP ге14597164 Т > G в популяциях пород и кроссов различного направления продуктивности. В популя-

Корниш х брама светлая х суссекс Корниш х суссекс х амрок

Брама светлая •жыж///////////////////л.-Первомайская Нью -гемпшир Суссекс Панцыревская чёрная Павловская Аврора голубая Бентамка ситцевая Китайская шёлковая Гамбургская

0

0,2

0,4 SGG

0,6

ШGT ИТТ

0,8

Рис. 1 - Частота встречаемости генотипов по замене ге14597164 Т > О среди популяций кур биоресурсной коллекции ВНИИГРЖ

известия оренбургского государственного аграрного университета 2020 • № 4 (84)

Панцыревская чёрная ШШШШШШШШШШШШШ^^

Аврора голубая ШШШШШШШШШЖ^^

Китайская шёлкевая ШтШ^^ШШШШШШШШШШШШ^ Гамбургская ............................

0 0,2 0,4 0,6 0,8 1

^СС ИСТ ЕЭТТ

Рис. 2 - Частота встречаемости генотипов по замене ге317925256 Т > С среди популяций кур биоресурсной коллекции ВНИИГРЖ

3. Значения %2 для популяций кур биоресурсной коллекции ВНИИГРЖ по rs14597164 и rs317925256

Направление продуктивно сти Порода / кросс Значения х2 rs14597164 Значения х2 rs317925256

Мясное брама светлая 0,80 0,03

корниш х суссекс х амрок 0,29 0,29

корниш х брама светлая х суссекс 0,39 0,88

Мясо-яичное суссекс 0,10 1,67

нью-гемпшир 0,21 4,16

первомайская 0,55 5,57

Яичное аврора голубая 1,90 0,01

павловская 0,01 1,38

панцыревская чёрная 0,75 3,19

Декоративные гамбургская - 0,002

китайская шёлковая - 3,94

бентамка ситцевая - 0,90

циях кур мясного направления продуктивности преобладающим был генотип ТТ (> 2340,6). У мясо-яичных пород кур преобладали особи с гетерозиготным генотипом TG. Популяции кур яичного и декоративного типа характеризовались высокой частотой встречаемости генотипа GG. По замене rs317925256, не выявлено значимых отличий по частоте встречаемости генотипов среди популяций кур биоресурсной коллекции различного направления продуктивности. Результаты нашего исследования позволяют предположить, что SNP rs14597164 можно рассматривать в качестве ДНК-маркера признака «живая масса» кур.

Литература

1. Эффективность использования SNP-маркеров в гене MSTN в селекции кур пушкинской породы / Н.В. Дементьева,

A.Б. Вахрамеев, Т.А. Ларкина [и др.] // Вавиловский журнал генетики и селекции. 2019. Т. 23. № 8. С. 993 - 998.

2. Le Bihan-Duval, E., Berri, C. Genetics and Genomics for Improving Poultry Meat Quality // Poultry Quality Evaluation. 2017. P. 199 - 220.

3. Kudinov, A. A., Dementieva, N. V., Mitrofanova, O. V., Stan-ishevskaya, O. I., Fedorova, E. S., Larkina, T. A., Romanov, M. N. Genome-wide association studies targeting the yield of extraembryonic fluid and production traits in Russian White chickens// BMC genomics. 2019. V. 20. No. 1. P. 270.

4. Thomas M., Langley B., Berry C., Sharma M., Kirk S, Bass J., Kambadur R. Myostatin, a negative regulator of muscle growth, functions by inhibiting myoblast proliferation // J. Biol. Chem. 2000. V. 275. No. 51. P. 40235 - 40243.

5. Baron A.A., Wenceslau L.E., Alvares K., Nones D.C., Ruy G.S., Schmidt E.L., Zanella L.L., Coutinh M.C., Ledur E.E. High level of polymorphism in the myostatin chicken gene // Proc. 7th World Congr. Genet. Appl. Livest. Prod. Montpellier. 2002. P. 19 - 23.

6. Связь генотипов по однонуклеотидным заменам в гене миостатина с показателями живой массы у кур Юрловской голосистой породы / О.В. Митрофанова, Н.В. Дементьева,

B.И. Тыщенко [и др.] // Генетика и разведение животных. 2015. № 1. С. 39 - 42.

Дементьева Наталия Викторовна, кандидат биологических наук, ведущий научный сотрудник, заведующая лабораторией

Митрофанова Ольга Викторовна, кандидат биологических наук

Ларкина Татьяна Александровна, кандидат биологических наук, младший научный сотрудник лаборатории

Всероссийский научно-исследовательский институт генетики и разведения сельскохозяйственных животных - филиал ФГБНУ «Федеральный научный центр животноводства - ВИЖ им. академика Л.К. Эрнста»

Россия, 196601, г. Санкт-Петербург, г. Пушкин, Московское шоссе, 55а E-mail: dementevan@mail.ru; mo1969@mail.ru; tanya.larkina2015@yandex.ru

Genetic variability of chick populations with different productivity directions for SNPs in the locus containing the myostatin gene

Dementyeva Natalia Viktorovna, Candidate of Зю^ду, Leading Researcher, Head of the Laboratory Mitrofanova Olga Viktorovna, Candidate of Biologу

Larkina Tatyana Aleksandrovna, Candidate of Biologу, Junior Researcher of the Laboratory

All-Russian Scientific Research Institute of Genetics and Breeding of Agricultural Animals - branch of the

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

«Federal Research Center for Livestock - VIZ named after Academician L.K. Ernst»

55A, Moscow highway, Pushkin, St. Petersburg, 196601, Russia

E-mail: dementevan@mail.ru; mo1969@mail.ru; tanya.larkina2015@yandex.ru

Live weight is one of the main criteria for the selection of birds. Among the genes associated with live weight, the myostatin (MSTN) gene, which affects the growth and increase of muscle mass, is major.The aim of this study was to analyze the frequency of occurrence of genotypes by substituting rs14597164 and rs317925256 located at a locus including the MSTN gene in chickens of different directions of productivity. Differences between the populations of hens of gene pool species allow us to assess the genetic significance of polymorphic variants in the formation of live weight and exterior characteristics of birds in the selection process. In the chicken populations of meat production direction in the polymorphic variant rs14597164, the TT genotype was predominant (>0.6). More than half of the individuals were carriers of the heterozygous TG genotype in representatives of meat and egg breeds. In chickens of the egg and decorative type, almost all individuals (>0.95) were carriers of the GG genotype. By replacing rs317925256, no significant differences were found in the occurrence of genotypes in chicken populations of the bioresource collection that differ in productivity direction. As a result of our study, data were obtained on the possible effect of a single SNP rs14597164 in the formation of the "live weight" trait in chickens.

Key words: chicken, SNPs, myostatin, live weight, genotype.

DOI 10.37670/2073-0853-2020-84-4-231-235

-♦-

УДК 619:614.31:637.5'64:[636.4:615.2/.3]

Ветеринарно-санитарная характеристика свинины при применении перед убоем животных антистрессовых препаратов Стрессмикс и Стреснил

В.А. Крыгин, канд. ветеринар. наук; О.В. Швагер, канд. с.-х. наук;

И.Н. Минашина, канд. ветеринар. наук

ФГБОУ ВО Южно-Уральский ГАУ

С целью снижения негативного действия предубойного стресса на организм свиней, их мясную продуктивность, показатели качества и безопасности мяса перед убоем животных применяются различные антистрессовые препараты. При проведении опыта были определены ветеринарно-санитарные характеристики свинины от животных, получавших перед убоем антистрессовые препараты Стрессмикс и Стреснил. При органолептическом исследовании свинины установлено, что сенсорные характеристики мяса от свиней, получавших антистрессовые препараты, соответствовали свежему, доброкачественному продукту. Биохимические показатели свинины от животных, получавших антистрессовые препараты, соответствовали требованиям нормативной документации. Мышечная ткань свинины с признаками порока Р8Е имела пониженные значения рН и коэффициента кислотность/окисляемость и повышенное содержание амино-аммиачного азота, что связано с нарушением обмена веществ в организме стрессчувствительных свиней на фоне предубойного стресса и накоплением в мышцах промежуточных продуктов белкового метаболизма. Бактериальная обсеменённость свинины с органолептическим пороком Р8Е была соответственно в 2,3 и

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.