CC BY
13
ВЕСТНИК ГЕМАТОЛОГИИ, том XVII, № 2, 2021
реляция между степенью тяжести и летальности пациентов COVID-19 и биохимическими маркерами (уровнем СРБ, ИЛ-6 и др.). Проведен анализ не только мутаций, которые могут влиять на вирулентность и тяжесть заболевания путем изменения структуры белка короновируса, но и на общее количество несинонимичных SNP в ключевых генах короновируса (S-белка, РНК-полимеразы, геликазы). Обнаружено, что среднее (11-12) количество SNP в геноме COVlD-19 положительно коррелирует с одышкой (p=0,016), сахарным диабетом (p=0,016), показателем тяжести заболевания по шкале компьютерной томографии (КТ 1-4, p=0,01) и уровнем Д-димера (p=0,o01). Среднее количество мутаций в S-белке коррелирует с уровнем ферритина (p=0,01). В результате проведенных полногеномного поиска ассоциаций (GWAS) и анализа ассоциаций редких вариантов (RVAS) с использованием библиотеки Hail для Python и скриптов собственной разработки были обнаружены сигналы ассоциации с уровнями Д-димера и ферритина и уровнем ИЛ-6. В случае
ИЛ-6 ассоциированные локусы могут иметь связь с компонентами внеклеточного матрикса и метаболическим путем через рецептор ангиотензин-превращающего фермента (АСЕ2). При анализе суммарной частоты встречаемости редких вариантов на уровне целых генов была обнаружена ассоциация миссенс-вариантов в гене бифункциональной 3'-фосфоаденозин-5'-фосфосульфатсинтетазы-2 (PAPSS2) с низким уровнем лимфоцитов. Также был обнаружен сигнал ассоциации гена интегрина аМ (ITGAM) с тяжестью течения, количеством СРБ и «цитокиновым штормом».
Выводы. Полученные результаты позволяют предположить наличие генетических факторов риска в геноме человека, определяющих тяжесть течения и исход заболевания. Эти данные, наряду с информацией о структуре генома вируса и лабораторными исследованиями будут способствовать дифференциальной диагностике пациентов по степени тяжести, прогнозу и персонализации терапии, что позволит проводить более эффективное лечение пациентов с COVID-19.
Т.Ю. Грачева, М.В. Латыпова, А.А. Хабибуллина, И.А. Петрова, Д.С. Ильясова, Е.С. Рябикова, Т.Л. Гиндина
ДОПОЛНИТЕЛЬНЫЙ АНАЛИЗ СЛОЖНЫХ ХРОМОСОМНЫХ АБЕРРАЦИЙ У БОЛЬНЫХ ОМЛ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ МЕТОДА FISH
«Научно-исследовательский институт детской онкологии, гематологии и трансплантологии им. Р.М. Горбачевой»
Федерального Государственного Бюджетного Образовательного Учреждения высшего профессионального образования «Первый Санкт-Петербургский Государственный Медицинский Университет имени академика И.П. Павлова» Министерства здравоохранения Российской Федерации, Санкт-Петербург
Введение. Диагностика хромосомных аномалий с использованием стандартного кариотипирования, в частности, GTG-окрашивания, часто не позволяет идентифицировать скрытые транслокации, несбалансированные обмены, маркерные хромосомы, а также хромосомный состав при сложных хромосомных аберрациях (СХА) с тремя и более перестройками. В настоящее время в арсенале цитогенетиков имеется многоцветная флуоресцентная in situ гибридизация (M-FISH), молекулярно-цитогенетическая техника, позволяющая обойти ограничения стандартного кариотипирования благодаря индивидуальному окрашиванию флуорохромами каждой пары хромосом.
Цель. Используя стандартное кариотипирование и M-FISH, изучить структуру хромосомных аберраций в сложных кариотипах (СК) у больных острым миелоидным лейкозом (ОМЛ).
Материалы и методы. В исследование включены 22 пациента с ОМЛ, находящимися под наблюдением в клинике НИИ ДОГиТ им Р.М. Горбачевой с 2010 по 2019 год, у которых с помощью кариотипирования костного мозга выявлены СХА. Среди пациентов было 14 (64 %) мужчин и 8 (36 %) женщин с медианой возраста 43 года (диапазон 3 месяца - 71 год), 17 (73 %) пациентов - с первичным ОМЛ, 5 (23 %) - со вторичным оМл (из МДС). У 6 (27 %) пациентов СК наблюдался в дебюте заболевания, у 16 (73 %) - в рецидивах ОМЛ. Всем пациентам проведена M-FISH, при необходимости до-
полненная интерфазной FISH с локус-специфичными ДНК-зондами к генам ТР53, KMT2A, c-MYC и локусам делеций 5q.
Результаты. Комбинация стандартного кариотипирова-ния и M-FISH позволила точно идентифицировать все комплексные хромосомные обмены, при этом во всех наблюдениях результаты кариотипирования были исправлены и дополнены данными FISH анализа. В СХА участвовали все пары хромосом, а наиболее часто участниками были хромосомы 8 (n=15, 68 %), 5 (n=13, 59 %), 7 (n=12, 54 %), 3 (n=11, 50 %), 11 (n=11, 50 %), 17 (n=10, 45 %). Несбалансированные транслокации были наиболее частой находкой и наблюдались у 20 (91%) пациентов. Реципрокные транслокации встречались реже и были зарегистрированы у 7 (32%) пациентов. В 9 (41 %) наблюдениях были выявлены маркерные хромосомы, определенные с помощью М-FISH как производные, состоящие от 3 до 5 сегментов разных хромосом. В таких производных чаще определялись хромосомы 5, 7, 13, 17, 21, маскирующиеся под «псевдомоносомии». Амплификации генов KMT2A и c-MYC были выявлены каждая у одного пациента.
Выводы. Исследование обнаружило цитогенетическую гетерогенность СХА у пациентов с ОМЛ, где несбалансированные обмены хромосом играют центральную роль. Комбинация стандартного кариотипирования и FISH позволяет точно определить хромосомные аберрации для определения прогноза и молекулярные мишени для последующего определения минимальной остаточной болезни при ОМЛ.
М.А. Гурьянова, О.А. Шухов, Н.М. Капранов, Ю.О. Давыдова, К.А. Никифорова, А.О. Абдуллаев, А.Б. Судариков, Е.Ю. Челышева, А.В. Быкова, А.Н. Петрова, И.С. Немченко, И.В. Гальцева, А.Г. Туркина
ОПРЕДЕЛЕНИЕ КОНЦЕНТРАЦИИ CD26+ ЛЕЙКОЗНЫХ СТВОЛОВЫХ КЛЕТОК У ПАЦИЕНТОВ С ХРОНИЧЕСКИМ МИЕЛОИДНЫМ ЛЕЙКОЗОМ
Федеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный медицинский исследовательский центр гематологии» Минздрава Российской Федерации, г.Москва
Введение. Лейкозные стволовые клетки (ЛСК) при хроническом миелолейкозе (ХМЛ) находятся в CD34+CD38-фракции лейкозного клона. Н.Неггтапп и соавт. (2014 г.)
было обнаружено что у 100% пациентов с ХМЛ на ЛСК в периферической крови (ПК) и в костном мозге (КМ) отмечалась экспрессия CD26, которая не выявлялась на нормаль-
