CC BY
14
ТЕЗИСЫ ПОСТЕРНЫХ ДОКЛАДОВ И ПРИНЯТЫЕ К ПУБЛИКАЦИИ
Онкогенетика
логическом анализе материала опухоли выявлена мутация 19 экзона гена EGFR, с февраля 2020 года получал адъювантную терапию гефитинибом. По данным ПЭТ-КТ в марте 2021 года, отмечено прогрессирование заболевания, метастазы в медиастинальные и надключичные лимфоузлы, головной мозг. 08.04.2021 проведена биопсия надключичного лимфоузла слева, по данным пато-логоанатомического исследования выявлен метастаз аденокарциномы легкого. Параллельно в течение курса лечения 2020-2021 гг проводились исследования ДНК плазмы крови пациента. Анализировали циркулирующую ДНК плазмы крови в 4 временных точках после операции (1 мес., 7 мес, 10 мес., 14 мес.), а также опухолевый материал блоков в двух временных точках (операционный материал и материал биоптата лимфоузла, полученный во временной точке 14 мес) в качестве контроля. Для оценки мутационного статуса цДНК использовалось высокопроизводительное секвенирование в сочетании с молекулярным баркодированием. Была разработана панель для направленного секвенирования, включающая 8 участков гена EGFR, ассоциированных с чувствительностью или резистентностью к ингибиторам тирозинкиназы:кодоны 719, 768, 790, 797, 858 и 861, а также участки в экзонов 19 и 20. Выделение ДНК из плазмы крови осуществлялось при помощи наборов Qiagen, секвенирование проводилось на высокопроизводительном секвенаторе Illumina HiSeq. Количество ДНК, использованное для анализа мутационного статуса в 8 «горячих точках» составило 10 нг. Результаты: В результате проведённого исследования в образце ДНК из операционного материала, полученного 16.01.2020, было определено наличие делеции 15-ти нуклеотидов в экзоне 19 гена EGFR NG_007726.3 (EGFR_ v001):c. 2235_2249del с долей мутантных фрагментов 77,9 %. Через 1 месяц после операции в цДНК мутация определялась с частотой 0,3%. В контрольной точке через 7 месяцев после операции мутации ни в одном из исследуемых регионов EGFR в цДНК не были обнаружены. По прошествии 10 месяцев с момента операции, несмотря на продолжение таргетной терапии гефитинибом,деле-ция в экзоне 19 гена EGFR была выявлена вновь в 0,02 % фаргментов цДНК. В контрольной точке через 14 месяцев после операции по данным ПЭТ-КТ от 15.03.2021 отмечено прогрессирование заболевания, 08.04.2021 проведена биопсия надключичного лимфоузла слева. В материале, полученном из лимфоузла частота исследуемой делеции составила 25,1 %, а в материале цДНК 0,21 %. Таким образом, максимальная достигнутая чувствительность определения делеции в 19 экзоне гена EGFR составила 0,02 % мутантного аллеля. Опухоль-специфичная драйверная мутация была вновь обнаружена в цДНК крови через 10 месяцев после проведения операции и за 4 месяца до появления признаков прогрессии основного заболевания по результатам ПЭТ-КТ и подтверждающего исследования биопсийного материала. При этом мутации EGFR, ассоциированные с резистентностью к ИТК, не были обнаружены.
Заключение: Исследование циркулирующей ДНК крови методом высокопроизводительного секвенирования с использованием молекулярно баркодированных библиотек ДНК позволяет определять наличие соматических мутаций опухолевого происхождения с чувствительностью до 0,02 % мутантного аллеля. При этом возможно одновременно исследование мутационного статуса 8 регионов гена EGFR на материале, полученном из одной пробы крови. Финансирование: Работа выполнена в рамках государственного задания Минздрава России № 300060056.
ЧАСТОТА ТЕРМИНАЛЬНЫХ МУТАЦИЙ В ГЕНАХ ПРЕДРАСПОЛОЖЕННОСТИ К РАЗВИТИЮ ЗЛОКАЧЕСТВЕННЫХ НОВООБРАЗОВАНИЙ СРЕДИ ПАЦИЕНТОВ С РАКОМ МОЛОЧНОЙ ЖЕЛЕЗЫ, РАКОМ ЯИЧНИКОВ И С ПЕРВИЧНО-МНОЖЕСТВЕННЫМИ ЗЛОКАЧЕСТВЕННЫМИ ОПУХОЛЯМИ
Н.И. Поспехова 1, Д.А. Головина 1, М.Г. Филиппова 1, С.М. Дранко 1, И.С. Абрамов 2, Т.С. Лисица 2, А.М. Строганова 1
Место работы: 1. ФГБУ «НМИЦ онкологии имени Н.Н. Блохи-на» Минздрава России, Москва, Россия; 2. ФГБУ «ЦСП» ФМБА России, Москва, Россия
Эл. почта: [email protected]
Цель: ДНК-диагностика терминальных мутаций в генах BRCA1/2 в настоящее время является стандартом для отбора пациентов с раком молочной железы (РМЖ) и раком яичников (РЯ) при определении тактики лечения. Массовое параллельное секвенирование (NGS) позволяет тестировать мутации в дополнительных генах предрасположенности к РМЖ, РЯ и другим злокачественными новообразованиями. Целью этого исследования было изучить распространенность и природу мутаций в 44 генах наследственной предрасположенности к развитию рака, включая BRCA1/2, в группе пациентов с РМЖ, РЯ и первично-множественными злокачественными новообразованиями (ПМЗН).
Материалы и методы: В исследование были включены 454 пациента, их них: 373 пациента с диагнозом РМЖ, 18 — с двухсторонним РМЖ (ДРМЖ), 19 — с РЯ, 44 — с ПМЗН, которые наблюдались в НМИЦ онкологии им. Н.Н. Блохина в период с 2018 по 2020 год. Геномную ДНК выделяли из образцов периферической крови. Подготовку библиотек ДНК осуществляли с использованием кастомной панели зондов KAPA Hyper (Roche). Панель включала в себя зонды для таргетного обогащения кодирующей части 44 генов: APC, ATM, AXIN2, BARD1, BLM, BMPR1A, BRCA1, BRCA2, BRIP1, CDH1, CDKN2A, CHEK2, DICER1, EPCAM, GALNT12, GREM1, MEN1, MLH1, MLH3, MSH2, MSH3, MSH6, MUTYH, NBN, NF1, NTHL1, PALB2, PMS2, POLD1, POLE, PTCH1, PTCH2, PTEN, RAD51C, RAD51D, RET, SMAD4, STK11, SUFU, TP53, TSC1, TSC2, VHL, WT1. Целевое парноконцевое высокопроиз-
ЗЛОКАЧЕСТВЕННЫЕ ОПУХОЛИ Российское общество клинической онкологии
том / vol. 11 №3s1 • 2021
MALIGNANT TUMOURS
Russian Society of Clinical Oncology
Российский онкологический ArnÁm Т конгресс
Саркомы
водительное секвенирование проводилось на приборе Illumina MiSeq.
Результаты: Было выявлено 53 терминальные патогенные мутации у 50 больных (11,01%). В гене BRCA1 выявлено 10 мутаций (18,90%), в гене BRCA2-19 (35,80%). В других исследованных генах обнаружено 24 патогенных варианта (45,3%) в 10 генах, из них: в гене PALB2-2, ATM — 3, TP53-3, CHEK2-3, EPCAM — 1, BLM — 2, MEN1-1, MUTYH — 7, MLH1-1, MSH6-1. Среди пациентов с РМЖ частота мутаций составила 8,04% (30/373), при ДРМЖ — 24,80% (4/18), в группе РЯ — 15,80% (3/19), в группе ПМЗН — 29,50% (13/44). Мутации в генах BRCA1/2 встречались во всех группах больных. В других генах выявлены следующие варианты: в гене ATM — 3 мутации (p. Ser151Ter, p. Glu1978Ter, p. Val2716Ala); в гене BLM — 2 мутации (p. Gln548Ter, p. Gln645Ter); в гене CHEK2-3 мутации (c. 1368dup, p. Arg145Trp, c. 444 1G >A); в гене EPCAM — 1 мутация (p. Trp143Ter), в гене MEN1-1 мутация (p. Trp143Ter); в гене MLH1-1 мутация (p. Lys618del); в гене MSH6-1 мутация (c. 1421_1422dup); в гене MUTYH — 7 мутаций (6 случаев p. Gly368Asp, Gln159Ter); в гене PALB2-2 мутации (c. 509_510del, c. 172_175del) и в гене TP53-3 мутации (p. Arg267Trp, p. Arg248Gln, p. Tyr163Cys). Отметим, что у трех из 50 больных с мутацией были обнаружены одновременно 2 патогенные мутации в разных генах (6,0%): у пациентки с РМЖ — в генах BRCA1 (c. 321del) и BLM (p. Gln645Ter); у пациентки с ПМЗН (Рак тела матки РМЖ) — в генах BRCA2 (p. Ile2627Phe) и MSH6 (c. 1421_1422dup); у пациентки с ПМЗН (Рак щитовидной железы РМЖ рак маточной трубы) — в генах BRCA1 (p. Arg1835Ter) и PALB2 (c. 172_175del). Заключение: В исследованной группе больных РМЖ, РЯ и ПМЗН анализ 44 генов позволил идентифицировать 29 мутаций в генах BRCA1/2, а также 24 патогенных варианта в 10 генах высокого, умеренного или низкого риска, что позволяет принимать персонализированные решения в тактике ведения пациентов. Полученные данные демонстрируют клиническую значимость использования мульти-генной панели при диагностике наследственной предрасположенности к онкологическим заболеваниям.
■ Саркомы
КЛИНИЧЕСКАЯ ЗНАЧИМОСТЬ РАСТВОРИМОЙ ФОРМЫ КОНТРОЛЬНОЙ ТОЧКИ ИММУНИТЕТА VISTA У БОЛЬНЫХ ПЕРВИЧНЫМИ ОПУХОЛЯМИ КОСТЕЙ
Н.Е. Кушлинский, О.В. Ковалева, Ю.Б. Кузьмин, Е.А. Корот-кова, И.В. Булычева, Е.В. Козлова, Д.А. Кудлай, А.Н. Грачев, И.Н. Кузнецов, Е.А. Сушенцов
Место работы: ФГБУ «НМИЦ онкологии имени Н. Н. Блохина» Минздрава России, Москва, Россия Эл. почта: [email protected]
Цель: Целью данной работы является сравнительная оценка содержания растворимой формы контрольной точки иммунитета sVISTA в сыворотке крови практически здоровых доноров, больных пограничными и злокачественными опухолями костей различных гистологических типов, а также анализ взаимосвязи уровня данного маркера с основными клиническими и морфологическими особенностями опухолей костей и прогнозом заболевания. Материалы и методы: В исследование включено 79 больных злокачественными новообразованиями костей (ЗНО), 14 больных пограничными опухолями костей (ПОК) и 30 практически здоровых доноров, составивших группу контроля. Группу злокачественных новообразований костей составили три гистологических типа: остеосаркома (34 наблюдения), хондросаркома (31), хордома (14). Концентрацию sVISTA определяли в сыворотке крови с помощью набора реактивов для прямого иммуноферментного анализа (Human VISTA / B7-H5 / PD-1H ELISA Kit; RayBiotech, США). Полученные данные обрабатывали с помощью программы GraphPad Prizm 9.0. При сравнении показателей и анализе их взаимосвязей использовали непараметрические критерии Манна-Уитни и Краскела-Уоллиса. Анализ выживаемости проводили с помощью построения кривых дожития по методу Каплана- Майера. Сравнение статистической значимости различий выполняли при использовании логарифмического рангового критерия. Различия и корреляции считали статистически значимыми при p <0,05.
Результаты: В общей группе больных злокачественными новообразованиями костей медиана содержания sVISTA в сыворотке крови статистически значимо ниже по сравнению с контролем (p = 0,040). У больных опухолями костей и здоровых доноров старше 18 лет отмечено снижение с возрастом уровней sVISTA в сыворотке крови. Не выявлено значимых различий концентрации sVISTA между больными остеосаркомой, хондросаркомой и здоровыми донорами. Только у больных хордомой кости уровни sVISTA были статистически значимо ниже, чем в контроле (р = 0,013). В группах больных хондросаркомой и остеосаркомой кости не отмечено значимых ассоциаций между содержанием sVISTA в сыворотке крови и основными клинико-морфо-
ЗЛОКАЧЕСТВЕННЫЕ ОПУХОЛИ Российское общество клинической онкологии
том I vol. 11 № 3s1 • 2G21
MALIGNANT TUMOURS
Russian Society of Clinical Oncology
