ДИАГНОСТИКА НАСЛЕДСТВЕННЫХ ОПУХОЛЕВЫХ СИНДРОМОВ МЕТОДОМ ВЫСОКОПРОИЗВОДИТЕЛЬНОГО СЕКВЕНИРОВАНИЯ. ОПЫТ СОЗДАНИЯ БАЗЫ ДАННЫХ Текст научной статьи по специальности «Клиническая медицина»

ГАТАТ кТ ■

ДИАГНОСТИКА НАСЛЕДСТВЕННЫХ ОПУХОЛЕВЫХ СИНДРОМОВ МЕТОДОМ ВЫСОКОПРОИЗВОДИТЕЛЬНОГО СЕКВЕНИРОВАНИЯ. ОПЫТ СОЗДАНИЯ БАЗЫ ДАННЫХ

И.С. Абрамов1, Т.С. Лисица1, А.М. Строганова2, О.О. Рябая2, А.М. Данишевич3, А.О. Хахина1, А.И. Закаморная1, А.Д. Мацвай1, Г.А. Шипулин1

1 Центр стратегического планирования и управления медико-биологическими рисками здоровью Федерального медико-биологического агентства, Москва, Российская Федерация

2 Национальный медицинский исследовательский центр онкологии имени Н.Н. Блохина, Москва, Российская Федерация

3 Московский клинический научно-практический центр имени А.С. Логинова Департамента здравоохранения Москвы, Москва, Российская Федерация

Обоснование. Ежегодно в Российской Федерации регистрируются более 500 тыс. новых случаев злокачественных новообразований, из них более 50 тыс. обусловлено наследственными формами. Своевременная диагностика данных форм позволит выявлять онкологические заболевания на ранних стадиях и своевременно проводить лечебно-профилактические мероприятия. Цель исследования — профилактика и ранняя диагностика наследственных форм онкологических заболеваний путем создания базы данных и разработки программного обеспечения для анализа данных таргетного высокопроизводительного секвенирования. Методы. В исследование вошли 636 образцов ДНК, полученных от пациентов, у которых установлено онкологическое заболевание с высокой вероятностью наследственной природы или отягощенное семейным анамнезом. ДНК выделяли из лимфоцитов периферической крови. Подготовку библиотек ДНК осуществляли с использованием панели зондов KAPA Hyper (Roche). Панель включала в себя зонды для таргетного обогащения кодирующей части 44 генов. Высокопроизводительное секвенирование проводили на платформе MiSeq (Illumina). Результаты. Выявлено 65 патогенных/вероятно патогенных вариантов нуклеотидной последовательности у 96 пациентов в генах ATM, BLM, BRCA1, BRCA2, CHEK2, EPCAM, MEN1, MLH1, MSH2, MSH3, MSH6, MUTYH, PALB2, TP53. Выявлено также 2858 вариантов нуклеотидной последовательности с неизвестным клиническим значением. Заключение. Создана локальная база данных генетических вариантов, содержащая клинико-анамнести-ческие данные. В настоящий момент в базу депонировано 4763 варианта нуклеотидной последовательности, из них 2522 — уникальные варианты, выявленные у 1 пациента.

Ключевые слова: наследственные опухолевые синдромы; NGS; таргетное секвенирование; база данных.

Для цитирования: Абрамов И.С., Лисица Т.С., Строганова А.М., Рябая О.О., Данишевич А.М., Хахина А.О., Закаморная А.И., Мацвай А.Д., Шипулин ГА. Диагностика наследственных опухолевых синдромов методом высокопроизводительного секвенирования. Опыт создания базы данных. Клиническая практика. 2021;12(3):36-42. doi: https://doi.org/10.17816/clinpract76383

Поступила 22.07.2021

Принята 26.08.2021

Опубликована 02.09.2021

ОБОСНОВАНИЕ

Среди всех случаев онкологических заболеваний 75% являются спорадическими, т.е. возникают случайным образом и связаны преимущественно с факторами внешней среды (солнечная радиация, загрязнение окружающей среды) и образом жизни (курение, злоупотребление вредными продуктами питания, ожирение, малоподвижный образ жизни). В 25% случаев диагностируют семейные формы злокачественных опухолей. Среди семейных форм

выделяют наследственные формы, при которых был диагностирован патогенный вариант в про-тоонкогенах, либо генах-протекторах онкологических заболеваний [1].

Наследственные онкологические синдромы в странах Европы и Северной Америки изучаются достаточно давно. Существует большое количество работ, посвященных поиску герминальных нарушений при наследственном раке толстой кишки (синдром Линча, полипозы). Описано более 50

Лицензия CC BY-NC-ND 4 / The article can be used under the CC BY-NC-ND 4 license

кл П

?ПР1 2021

Том 12 №3

DIAGNOSTICS OF HEREDITARY CANCER SYNDROMES BY NGS. A DATABASE CREATION EXPERIENCE

I.S. Abramov1, T.S. Lisitsa1, A.M. Stroganova2, O.O. Ryabaya2, A.M. Danishevich3, A.O. Khakhina1, A.I. Zakamornaya1, A.D. Matsvay1, G.A. Shipulin1

1 Centre for Strategic Planning and Management of Biomedical Health Risks of the Federal Medical Biological Agency, Moscow, Russian Federation

2 N.N. Blokhin National Medical Research Center of Oncology, Moscow, Russian Federation

3 Moscow Clinical Scientific Center, Moscow, Russian Federation

Background: More than 500 thousand new cases of malignant neoplasms are registered annually in the Russian Federation, of which more than 50 thousand new cases are due to hereditary forms. Improving the diagnosis of these diseases will make it possible to detect tumors at the early stages and take timely preventive and therapeutic measures. Aims: Creation of a database and development of a software for the NGS data analysis for the prevention and early diagnosis of hereditary forms of oncological diseases. Methods: The present study used 636 DNA samples obtained from cancer patients with a high hereditary risk or a burdened family history. DNA was isolated from blood lymphocytes. DNA libraries were prepared with a KAPA Target Enrichment Panel (Roche). The panel included probes for targeted enrichment of the coding region of 44 genes. NGS was performed on the MiSeq platform (Illumina). Results: We identified 65 pathogenic/ probably pathogenic nucleotide sequence variants in 96 patients in the ATM, BLM, BRCA1, BRCA2, CHEK2, EPCAM, MEN1, MLH1, MSH2, MSH3, MSH6, MUTYH, PALB2, TP53 genes. We also identified 2858 nucleotide sequence variants of unknown clinical significance. Conclusions: We have created a local database that contains both genetic variants and clinical and anamnestic data. The database contains 4763 nucleotide sequence variants at the moment, among which 2522 are unique variants identified in a single patient.

Keywords: neoplastic syndromes; hereditary; high-throughput nucleotide sequencing; databases; genetic.

For citation: Abramov IS, Lisitsa TS, Stroganova AM, Ryabaya OO, Danishevich AM, Khakhina AO, Zakamornaya AI, Matsvay AD, Shipulin GA. Diagnostics of Hereditary Cancer Syndromes by NGS. A Database Creation Experience. Journal of Clinical Practice. 2021;12(3):36-42. doi: https://doi.org/10.17816/clinpract76383

Submitted 22.07.2021 Revised 26.08.2021 Published 02.09.2021

патогенных мутаций в исландских, французских, канадских, африканских, американских, польских и латиноамериканских популяционных группах [2, 3]. Выявлены драйверные мутации при раке молочной железы (РМЖ) и раке яичников в крупных исследованиях популяций евреев-ашкенази, скандинавских народов (норвежцы, финны). Менее масштабные исследования проводили в Бразилии [4]. В странах Азиатского региона (Бангладеш, материковый Китай, Гонконг, Индонезия, Япония, Корея, Малайзия, Филиппины, Сингапур, Таиланд, Вьетнам и этнические азиаты Канады и США) выявляется 7-10% РМЖ в составе наследственных синдромов [5]. Группа ученых из США провела масштабное исследование мутаций, ответственных за развитие наследственных РМЖ, рака яичников, синдрома Линча. Проанализировано 25 генов с изучением семейных историй, включающих диа-

гноз на момент исследования и анамнез заболеваний в прошлом. У 6,8% (17 000) обследованных лиц из 252 223 включенных в исследование была обнаружена по меньшей мере одна патогенная мутация [6]. В России также проводятся исследования по-пуляционной частоты клинически значимых вариантов при онкологических заболеваниях [7]. Такая работа наглядно демонстрирует необходимость применения комплексного метода диагностики генетических нарушений, основанного не только на общепризнанных данных о популяционной частоте и устоявшихся описаниях наследственных синдромов, но и на анализе более широкой выборки генов у лиц группы риска с целью определения собственной популяционной частоты и создания национального реестра мутаций.

Цель исследования — профилактика и ранняя диагностика наследственных форм онкологи-

«ШТАТ ГАТАТ

ческих заболеваний путем создания базы данных и разработки программного обеспечения для анализа данных таргетного высокопроизводительного секвенирования.

МЕТОДЫ

Клинико-анамнестическая характеристика образцов

В данное исследование были включены 636 образцов цельной крови от пациентов с диагнозом РМЖ, в том числе двусторонний, рак яичников, толстой кишки, желудка, тела матки, меланомы, рак почки, поджелудочной железы, опухоли головного мозга, лимфома Ходжкина, десмоид, опухоли желчных протоков, первично-множественные злокачественные новообразования и др. Средний возраст пациентов на момент манифестации заболевания составил 42,8±9,3 года.

Дизайн панели зондов

для таргетного секвенирования

кодирующих участков генов

Для создания таргетной панели нами были отобраны 44 гена (APC, ATM, AXIN2, BARD1, ELM, BMPR1A, BRCA1, BRCA2, BRIP1, CDH1, CDKN2A, CHEK2, DICER1, EPCAM, GALNT12, GREM1, MEN1, MLH1, MLH3, MSH2, MSH3, MSH6, MUTYH, NBN, NF1, NTHL1, PALB2, PMS2, POLD1, POLE, PTCH1, PTCH2, PTEN, RAD51C, RAD51D, RET, SMAD4, STK11, SUFU, TP53, TSC1, TSC2, VHL, WT1), ассоциированных с развитием основных опухолевых синдромов. Далее с помощью онлайн-сервиса HyperDesign от компании Roche (США) был проведен биоинформа-тический дизайн панели ДНК-зондов, включающий кодирующие участки данных генов, сайты сплайсинга, 5'-UTR области.

Подготовка ДНК-библиотек и высокопроизводительное секвенирование

Выделение ДНК из лимфоцитов проводили с помощью набора QIAamp DNA Blood Mini Kit (Qiagen, Германия). Пробоподготовку библиотек осуществляли с помощью набора KAPA HyperPrep Kit (Roche) по стандартному протоколу. Гибридизацию с таргетной панелью проводили также по стандартному протоколу Hyper (Roche). В качестве секвени-рующей платформы была использована система MiSeq (Illumina, США), версия химии MiSeq Reagent Kit v2 500-cycles, позволяющая анализировать за один запуск до 96 библиотек.

Биоинформатическая обработка

данных секвенирования

Генерация FastQ-файлов выполнялась с использованием программного обеспечения Illumina v2.4. Дальнейшая обработка данных проведена с использованием алгоритма, включающего выравнивание прочтений на референсную последовательность генома человека GRCh38 с помощью программного пакета BWA (burrows-wheeler-alignment), сортировку по координате, дедупликацию и повторное выравнивание с помощью сервиса Picard-tools, выявление вариантов нуклеотидной последовательности и фильтрацию вариантов по качеству с помощью GATK v4.1.8.1. Аннотацию выявленных вариантов по всем транскриптам для каждого гена из базы RefSeq, оценку популяционных частот с использованием выборки проектов Genome aggregation database (gnomAD), Exome Aggregation Consortium (ExAC), оценку влияния с применением ряда методов предсказания патогенности замен (SIFT, PolyPhen2-HDIV, PolyPhen2-HVAR), а также методов расчета эволюционной консервативности позиции (PhyloP, PhastCons) проводили при помощи программы OpenCravat. Классификация вариантов нуклео-тидной последовательности проводилась на основании рекомендаций по интерпретации результатов высокопроизводительного секвенирования (NGS) American College of Medical Genetics and Genomics (ACMG) и сервиса Varsome.

Этическая экспертиза

Письменное информированное согласие было получено от всех пробандов, участвующих в исследовании. Все образцы были обезличены до получения исследовательской группой. В данном исследовании не используются идентифицируемые биологические образцы и не приводятся какие-либо конфиденциальные данные. Следовательно, согласно правилам этического комитета и национальным нормам, этот проект не требует этического одобрения.

РЕЗУЛЬТАТЫ

В результате анализа выявлено 65 патогенных вариантов нуклеотидной последовательности у 96 пациентов в генах ATM, BLM, BRCA1, BRCA2, CHEK2, EPCAM, MEN1, MLH1, MSH2, MSH3, MSH6, MUTYH, PALB2, TP53 (табл. 1). Выявлено также 2858 вариантов нуклеотидной последовательности с неизвестным клиническим значением.

кл П

?ПР1 2021

Том 12 №3

ОБСУЖДЕНИЕ

Наиболее часто встречались патогенные варианты в генах ВЯСЛ1 и ВЯСЛ2 — у 37 и 27 пациентов соответственно. Самый распространенный вариант с.5266с1ир, р.01п1756Рго{эТег в гене ВЯСА1, также известный как 53821пэС, был выявлен у 17 пациентов

с РМЖ, двусторонним РМЖ, раком яичников, что соответствует данным, полученным ранее другими исследовательскими группами [7]. В гене ВЯСА2 мажорных мутаций на основании полученных данных выделить не удается. Из всех выявленных патогенных вариантов в генах ВЯСА1 и ВЯСА2 лишь

Таблица 1 / Table 1

Патогенные варианты нуклеотидной последовательности / Pathogenic variants

Ген Координата кДНК Белок Кол-во

ATM chr11:108312424G>T c.5932G>T p.Glu1978Ter 2

ATM chr11:108235784delTTCT c.450_453del p.Ser151Ter 1

ATM chr11:108335105T>C c.8147T>C p.Val2716Ala 1

BLM chr15:90761015C>T c.1642C>T p.Gln548Ter 2

BLM chr15:90763016C>T c.1933C>T p.Gln645Ter 1

BRCA1 chr17:43057063insG c.5266dup p.Gln1756ProfsTer74 17

BRCA1 chr17:43091496delT c.4035del p.Glu1346LysfsTer20 3

BRCA1 chr17:43071225G>C c.4689C>G p.Tyr1563Ter 2

BRCA1 chr17:43106487A>C c.181T>G p.Cys61Gly 2

BRCA1 chr17:43045767G>A c.5503C>T p.Arg1835Ter 1

BRCA1 chr17:43057078G>A c.5251C>T p.Arg1751Ter 1

BRCA1 chr17:43067608C>G c.5074G>C p.Asp1692His 1

BRCA1 chr17:43091772delAGAC c.3756_3759del p.Ser1253ArgfsTer10 1

BRCA1 chr17:43091827delTTTAC c.3700_3704del p.Val1234GlnfsTer8 1

BRCA1 chr17:43092280delAGCAT c.3247_3251del p.Met1083Ter 1

BRCA1 chr17:43093570insT c.1961dup p.Tyr655ValfsTer18 1

BRCA1 chr17:43094021delG c.1510del p.Arg504ValfsTer28 1

BRCA1 chr17:43094023delTTTAA c.1504_1508del p.Leu502AlafsTer2 1

BRCA1 chr17:43094731 G>C c.800C>G p.Ser267Ter 1

BRCA1 chr17:43104242delA c.321del p.Phe107LeufsTer12 1

BRCA1 chr17:43115780C>G c.81-1G>C - 1

BRCA1 chr17:43124028delCT c.68_69del p.Glu23ValfsTer17 1

BRCA2 chr13:32337161 delAAAC c.2808_2811del p.Ala938ProfsTer21 2

BRCA2 chr13:32340757delTAACT c.6405_6409del p.Asn2135LysfsTer3 2

BRCA2 chr13:32362596A>T c.7879A>T p.Ile2627Phe 2

BRCA2 chr13:32380136delA c.9253del p.Thr3085GlnfsTer19 2

BRCA2 chr13:32316528G>A c.67+1G>A - 1

BRCA2 chr13:32326104delT c.429del p.Val144LeufsTer8 1

BRCA2 chr13:32326143insT c.468dup p.Lys157Ter 1

BRCA2 chr13:32330933delT c.700del p.Ser234ProfsTer7 1

BRCA2 chr13:32332779delAAAG c.1310_1313del p.Lys437IlefsTer22 1

«ШТАТ ГАТАТ кТ

Таблица 1 Окончание / End of Table 1

Ген Координата кДНК Белок Кол-во

BRCA2 chr13:32336624delA c.2272del p.Ser758ValfsTer14 1

BRCA2 chr13:32337006delCAGA c.2653_2656del p.Asp885MetfsTer9 1

BRCA2 chr13:32337522delAAAA c.3167_3170del p.Gln1056ArgfsTer3 1

BRCA2 chr13:32339548delTC c.5197_5198del p.Ser1733ArgfsTer9 1

BRCA2 chr13:32339593insT c.5238dup p.Asn1747Ter 1

BRCA2 chr13:32339641delT c.5286T>G p.Tyr1762Ter 1

BRCA2 chr13:32340073delCT c.5722_5723del p.Leu1908ArgfsTer2 1

BRCA2 chr13:32340301delT c.5946del p.Ser1982ArgfsTer22 1

BRCA2 chr13:32340824C>T c.6469C>T p.Gln2157Ter 1

BRCA2 chr13:32340848delT c.6494del p.Leu2165TrpfsTer3 1

BRCA2 chr13:32357845G>A c.7721G>A p.Trp2574Ter 1

BRCA2 chr13:32370955G>A c.8488-1G>A - 1

BRCA2 chr13:32371044delAA c.8578_8579del p.Lys2860GlufsTer8 1

BRCA2 chr13:32380147T>C c.9256+2T>C - 1

CHEK2 chr22:28725242C>T c.444+1G>A - 2

CHEK2 chr22:28725254G>A c.433C>T p.Arg145Trp 2

CHEK2 chr22:28695134insT c.1368dup p.Glu457ArgfsTer33 1

EPCAM chr2:47375237G>A c.429G>A p.Trp143Ter 1

MEN1 chr11:64810109T>C c.1A>G p. Met1Val 1

MLH1 chr3:37047632delGAA c.1852_1854del p.Lys618del

MLH1 chr3:37042331 G>A c.1731G>A p.Ser577Ser 1

MSH2 chr2:47414411delT c.939del p.Gln314ArgfsTer17 1

MSH3 chr5:80813614G>T c.2686G>T p.Gly896Ter 1

MSH6 chr2:47799403insGT c.1421_1422dup p.Gln475CysfsTer7 1

MUTYH chr1:45331556C>T c.1103G>A p.Gly368Asp

MUTYH chr1:45332310C>T c.705G>A p.Trp235Ter 1

MUTYH chr1:45332780G>A c.475C>T p.Gln159Ter 1

PALB2 chr16:23637886delACAA c.172_175del p.Gln60ArgfsTer7

PALB2 chr16:23636036delTC c.509_510del p.Arg170IlefsTer14 1

TP53 chr17:7674220C>T c.743G>A p.Arg248Gln 1

TP53 chr17:7674872T>C c.659A>G p.Tyr220Cys 1

TP53 chr17:7675124T>C c.488A>G p.Tyr163Cys 1

TP53 chr17:7675139C>T c.473G>A p.Arg158His 1

TP53 chr17:7673821 G>A c.799C>T p.Arg267Trp 1

кл П

ОП21

Том 12 »3

4 входят в стандартные панели распространенных тест-систем в России.

У нескольких пациентов выявлено также сочетание двух патогенных вариантов: у пациентки с РМЖ выявлены мутации с.321Се1, р.РИе1071_е^эТег в гене ВЯСА1 и с.1933С>Т, р.О!п645Тег в гене BLM; у пациентки с диагнозом первично-множественных злокачественных новообразований (рак щитовидной железы, РМЖ, рак маточной трубы) выявлены мутации с.5503С>Т, р.Агд1835Тег в гене ВЯСА1 и с.172_175Се!, р.01п60А^эТег в гене PALB2; у пациентки с диагнозом первично-множественных злокачественных новообразований (рак эндометрия, РМЖ) выявлены мутации с.1421_1422Сир, p.Gln475CysfsTer в гене МБН6 и с.7879А>Т, р.!!е2627РИе в гене ВЯСА2. У 9 пациентов выявлено сочетание мутации в генах ВЯСА1, ВЯСА2, MLH1, МБН3, ЕРСАМ с вариантом с.470Т>С, р.!!е157ТИг в гене СНЕК2. У пациентов с диагнозом РМЖ и РМЖ в сочетании с лейомиосаркомой были выявлены патогенные варианты в гене ТР53. Все вышеперечисленное подчеркивает актуальность исследования кодирующей последовательности данных генов, в том числе при проведении предварительной ПЦР-диа-гностики.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

Создана локальная база данных генетических вариантов, и соответствующих им клинико-анамне-стических данных. По мере дополнения базы данных новыми данными секвенирования будет проводиться дальнейшая статистическая и клиническая характеристика выявленных генетических вариантов. В перспективе накопленные данные могут быть использованы как для анализа эпидемиологии онкологических заболеваний, так и разработки тест-систем, актуальных для российской популяции.

ДОПОЛНИТЕЛЬНАЯ ИНФОРМАЦИЯ

Вклад авторов. Строганова А.М., Рябая О.О., Данишевич А.М. — сбор образцов и клинико-ана-мнестическая характеристика; Хахина А.О., Закаморная А.И. — экспериментальная часть работы; Абрамов И.С., Лисица Т.С., Мацвай А.Д., Шипулин Г.А. — планирование и контроль экспериментов, обработка данных, написание и рецензирование статьи. Авторы подтверждают соответствие своего авторства международным критериям !С1ШЕ (все авторы внесли существенный вклад в разработку концепции, проведение исследования

и подготовку статьи, прочли и одобрили финальную версию перед публикацией).

Author contribution. Stroganova A.M., Rya-baya O.O., Danishevich A.M. — collection of samples and anamnestic characteristics; Khakhina A.O., Zaka-mornaya A.I. — the experimental part; Abramov I.S., Lisitsa T.S., Matsvai A.D., Shipulin G.A. — planning and control of experiments, data processing, writing and reviewing the article. The authors made a substantial contribution to the conception of the work, acquisition, analysis, interpretation of data for the work, drafting and revising the work, final approval of the version to be published and agreeing to be accountable for all aspects of the work.

Источник финансирования. Исследование выполнено в рамках государственного задания № 388-00102-20-01/388-00154-21 -00.

Funding source.

The study was done with a support of the state assignment № 388-00102-20-01/ 388-00154-21-00

Конфликт интересов. Авторы данной статьи подтвердили отсутствие конфликта интересов, о котором необходимо сообщить.

Competing interests. The authors declare that they have no competing interests.

ЛИТЕРАТУРА / REFERENCES

1. Имянитов Е.Н. Общие представления о наследственных опухолевых синдромах // Практическая онкология. 2014. Т. 15, № 3. С. 101-106. [Imyanitov EN. General ideas about hereditary tumor syndromes. Practical Oncology. 2014;15(3): 101 -106. (In Russ).]

2. Biller LH, Syngal S, Yurgelun MB. Recent advances in Lynch syndrome. Fam Cancer. 2019;18(2):211-219. doi: 10.1007/s10689-018-00117-1

3. Haraldsdottir S, Rafnar F, Frankel WL, et al. Comprehensive population-wide analysis of Lynch syndrome in Iceland reveals founder mutations in MSH6 and PMS2. Nat Commun. 2017;8(1):14755. doi: 10.1038/ncomms14755

4. Felix GE, Abe-Sandes C, Machado-Lopes TM, et al. Germline mutations in BRCA1, BRCA2, CHEK2 and TP53 in patients at high-risk for HBOC: characterizing a Northeast Brazilian Population. Hum Genome Var. 2014;1:14012. doi: 10.1038/hgv.2014.12

5. Kwong A, Shin VY, Ho JC, et al. Comprehensive spectrum of BRCA1 and BRCA2 deleterious mutations in breast cancer in Asian countries. J Med Genet. 2016;53(1):15-23. doi: 10.1136/jmedgenet-2015-103132

6. Rosenthal ET, Bernhisel R, Brown K, et al. Clinical testing with a panel of 25 genes associated with increased cancer risk results in a significant increase in clinically significant findings across a broad range of cancer histories. Cancer Genet. 2017; 218-219:5868. doi: 10.1016/j.cancergen.2017.09.003

7. Никитин А.Г., Бровкина О.И., Ходырев Д.С., и др. Опыт создания публичной базы данных мутаций oncoBRCA: биоинформационные проблемы и решения // Клиническая практика. 2020. Т. 11, № 1. С. 21-29. [Nikitin AG, Brovkina OI, Khodyrev DS, et al. The experience of creating a public database of oncoBRCA mutations: bioinformatic problems and solutions. Journal of Clinical Practice. 2020;11(1):21-29. (In Russ).] doi: 10.17816/clinpract25860

«ШТАТ ГАТАТ

ОБ АВТОРАХ

Автор, ответственный за переписку: Абрамов Иван Сергеевич; адрес: 119121, Российская Федерация, Москва, ул. Погодинская, д. 10, с. 1; e-mail: IAbramov@cspmz.ru; eLibrary SPIN: 1436-3601; ORCID: https://orcid.org/0000-0002-6954-1564

Соавторы:

Лисица Татьяна Сергеевна;

e-mail: Tlisitsa@cspmz.ru; eLibrary SPIN: 2289-4331; ORCID: https//orcid.org/0000-0002-6212-7627

Строганова Анна Михайловна, к.м.н.;

e-mail: stroganova_am@mail.ru; eLibrary SPIN: 5295-3338;

ORCID: http://orcid.org/0000-0002-7297-5240

Рябая Оксана Олеговна, к.б.н.;

e-mail: oxa2601@yandex.ru; eLibrary SPIN: 4865-5850;

ORCID: https//orcid.org/0000-0001-6295-3497

Данишевич Анастасия Михайловна;

e-mail: danisham7@gmail.com; eLibrary SPIN: 3195-1760; ORCID: https//orcid.org/0000-0002-3573-8342

Хахина Анастасия Олеговна;

e-mail: AKhakhina@cspmz.ru; eLibrary SPIN: 2922-9674; ORCID: https//orcid.org/0000-0002-0723-9765

Закаморная Анастасия Ивановна;

e-mail: AZakamornaya@cspmz.ru; eLibrary SPIN: 6263-9686; ORCID: https//orcid.org/0000-0001-5151-0236

Мацвай Алина Дмитриевна;

e-mail: AMatsvay@cspmz.ru; eLibrary SPIN: 2679-3183; ORCID: https//orcid.org/0000-0002-6301 -9169

Шипулин Герман Александрович;

e-mail: shipulin@cspmz.ru; eLibrary SPIN: 1908-9098; ORCID: https//orcid.org/0000-0002-3668-6601

AUTHORS INFO

The author responsible for the correspondence: Ivan S. Abramov; address: 10 bild. 1, Pogodinskaya street, 119121, Moscow, Russia; e-mail: IAbramov@cspmz.ru; eLibrary SPIN: 1436-3601; ORCID: https://orcid.org/0000-0002-6954-1564

Co-authors:

Tatyana S. Lisitsa; e-mail: Tlisitsa@cspmz.ru;

eLibrary SPIN: 2289-4331;

ORCID: https//orcid.org/0000-0002-6212-7627

Anna M. Stroganova, MD, Cand. Sci. (Med.);

e-mail: stroganova_am@mail.ru; eLibrary SPIN: 5295-3338;

ORCID: http://orcid.org/0000-0002-7297-5240

Oxana O. Ryabaya, Cand. Sci. (Biol.);

e-mail: oxa2601@yandex.ru; eLibrary SPIN: 4865-5850;

ORCID: https//orcid.org/0000-0001-6295-3497

Anastasiya M. Danishevich;

e-mail: danisham7@gmail.com; eLibrary SPIN: 3195-1760; ORCID: https//orcid.org/0000-0002-3573-8342

Anastasia O. Khakhina;

e-mail: AKhakhina@cspmz.ru; eLibrary SPIN: 2922-9674; ORCID: https//orcid.org/0000-0002-0723-9765

Anastasiya I. Zakamornaya;

e-mail: AZakamornaya@cspmz.ru; eLibrary SPIN: 6263-9686; ORCID: https//orcid.org/0000-0001-5151-0236

Alina D. Matsvay;

e-mail: AMatsvay@cspmz.ru; eLibrary SPIN: 2679-3183; ORCID: https//orcid.org/0000-0002-6301 -9169

German A. Shipulin;

e-mail: shipulin@cspmz.ru; eLibrary SPIN: 1908-9098; ORCID: https//orcid.org/0000-0002-3668-6601