Научная статья на тему 'ВЫЯВЛЕНИЕ ГЕНЕТИЧЕСКОЙ СТРУКТУРЫ ПОПУЛЯЦИЙ ВОЗБУДИТЕЛЕЙ БОЛЕЗНЕЙ ИНДЕЕК'

ВЫЯВЛЕНИЕ ГЕНЕТИЧЕСКОЙ СТРУКТУРЫ ПОПУЛЯЦИЙ ВОЗБУДИТЕЛЕЙ БОЛЕЗНЕЙ ИНДЕЕК Текст научной статьи по специальности «Биологические науки»

CC BY
64
11
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Ключевые слова
ГЕНОМНАЯ ДНК / ЭНДОНУКЛЕАЗЫ РЕСТРИКЦИИ / ИНДЕЙКИ / ГЕНОТИПИРОВАНИЕ / ИДЕНТИФИКАЦИЯ / ПАТОГЕННЫЕ МИКРООРГАНИЗМЫ / ПЦР / ШТАММ

Аннотация научной статьи по биологическим наукам, автор научной работы — Шепляков А.В., Шинкаренко Л.А., Терлецкий В.П., Тыщенко В.И., Новикова О.Б.

В СГЦ «Северо-Кавказской ЗОСП» запланировано проведение научно-исследовательской работы, направленной на профилактику и борьбу с инфекционными заболеваниями птиц, наносящими огромный экономический ущерб отрасли. Создание отечественных конкурентоспособных линий и кроссов птиц предполагает надежную систему защиты поголовья, которая может быть основана на применении современных молекулярно-генетических методов, включающих генотипирование и ПЦР-тесты на антибиотикорезистентность патогенных микроорганизмов. Исследования базируются на использовании метода генотипирования патогенных микроорганизмов, применяющего эндонуклеазы рестрикции с одновременным мечением отдельных фрагментов ДНК, которые затем визуализируются на нейлоновом фильтре. При проведении исследований получены культуры бактериальных изолятов в элективной, селективной и дифференциально-диагностической средах в отделе микробиологии ВНИВИП после отбора проб и биоматериалов у индеек разных возрастных групп СГЦ «СКЗОСП». Также определена видовая принадлежность бактерий с помощью культуральных и молекулярно-генетических методов (стандартная ПЦР с праймерами к 16S ДНК бактерий); проведены сопоставление данных генотипирования двумя различными методами; in-silico поиск эндонуклеаз рестрикции для генотипирования методом ДРИМ; генотипирование бактерий E.coli с использованием комбинаций эндонуклеаз рестрикции Xho I/ Bsu RI и Xba I/ Pst I и выявлением бактериальных генотипов.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по биологическим наукам , автор научной работы — Шепляков А.В., Шинкаренко Л.А., Терлецкий В.П., Тыщенко В.И., Новикова О.Б.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

IDENTIFICATION OF THE POPULATION GENETIC STRUCTURE OF PATHOGENIC ORGANISMS OF TURKEY DISEASES

It is planned to carry out a research work in the Genetic Selection Centre “North Caucasus Zonal Experimental Station of Poultry” which is aimed at the prevention and control of infectious diseases of birds, causing huge economic damage to the industry. The creation of domestic competitive lines and crosses of birds requires a reliable system of livestock protection, which can be based on the use of modern molecular genetics techniques, including genotyping and PCR tests of antibiotic resistance of pathogenic microorganisms. The research is based on the use of the method of genotyping of pathogenic microorganisms, which uses restriction endonucleases with simultaneous labeling of individual DNA fragments, which are then visualized on a nylon filter. During the research, cultures of bacterial isolates were obtained in elective, selective and differential diagnostic media in the Department of Microbiology of All-Russian Research Veterinary Institute of Poultry Science after sampling and biomaterials from turkeys of different age groups in the Genetic Selection Centre “North Caucasus Zonal Experimental Station of Poultry”. The species of bacteria were also determined with the help of cultural and molecular genetics techniques (standard PCR with primers to 16S DNA of bacteria); the comparison of genotyping data by two different methods was carried out; an in silico search of restriction endonucleases for genotyping by the DREAM technique was carried out; E. coli bacteria were genotyped using combinations of restriction endonucleases XhoI / BsuRI and XbaI / PstI, with the identification of bacterial genotypes.

Текст научной работы на тему «ВЫЯВЛЕНИЕ ГЕНЕТИЧЕСКОЙ СТРУКТУРЫ ПОПУЛЯЦИЙ ВОЗБУДИТЕЛЕЙ БОЛЕЗНЕЙ ИНДЕЕК»

«Северо-Кавказский федеральный научный аграрный центр», г. Ставрополь, dorohin.2012@inbox.ru

Krivoruchko Aleksandr Yurevich - Doctor of Biological Sciences, Chief Researcher of the Laboratory of Genomic Selection and Reproductive Cryobiology in Animal Breeding, FSBSI "North Caucasus FARC", Stavropol, email rcvm@yandex.ru

Saprikina Tatyana Yurevna, Junior Researcher of the Laboratory of Genomic Selection and Reproductive Cryobiology in Animal Breeding, FSBSI "North Caucasus FARC", Stavropol, saprikina.tanya@mail.ru

Yatsyk Olesya Andreevna - Candidate of Biological Sciences, Researcher of the Laboratory of Genomic Selection and Reproductive Cryobiology in Animal Breeding, FSBSI "North Caucasus FARC", Stavropol, email malteze@mail.ru

Kanibolotskaya Anastasia Aleksandrovna - Candidate of Biological Sciences, Researcher of the Laboratory of Genomic Selection and Reproductive Cryobiology in Animal Breeding, FSBSI "North Caucasus FARC", Stavropol, email dorohin.2012@inbox.ru

ВЕТЕРИНАРИЯ

DOI 10.25930/2687-1254/011.1.14.2021 УДК 636.592:619

ВЫЯВЛЕНИЕ ГЕНЕТИЧЕСКОЙ СТРУКТУРЫ ПОПУЛЯЦИЙ ВОЗБУДИТЕЛЕЙ БОЛЕЗНЕЙ ИНДЕЕК

А.В. Шепляков, Л.А. Шинкаренко, В.П. Терлецкий, В.И. Тыщенко, О.Б. Новикова, И.Н. Буравцова, Ю.В. Титов

В СГЦ «Северо-Кавказской ЗОСП» запланировано проведение научно-исследовательской работы, направленной на профилактику и борьбу с инфекционными заболеваниями птиц, наносящими огромный экономический ущерб отрасли. Создание отечественных конкурентоспособных линий и кроссов птиц предполагает надежную систему защиты поголовья, которая может быть основана на применении современных молекулярно-генетических методов, включающих генотипирование и ПЦР-тесты на антибиотикорезистентность патогенных микроорганизмов. Исследования базируются на использовании метода генотипирования патогенных микроорганизмов, применяющего эндонуклеазы рестрикции с одновременным мечением отдельных фрагментов ДНК, которые затем визуализируются на нейлоновом фильтре. При проведении исследований получены культуры бактериальных изолятов в элективной, селективной и дифференциально-диагностической средах в отделе микробиологии ВНИВИП после отбора проб и биоматериалов у индеек разных возрастных групп СГЦ «СКЗОСП». Также определена видовая принадлежность бактерий с помощью культуральных и молекулярно-генетических методов (стандартная ПЦР с праймерами к 16S ДНК бактерий); проведены сопоставление данных генотипирования двумя различными методами; in-silico поиск эндонуклеаз рестрикции для генотипирования методом ДРИМ; генотипирование бактерий E.coli с использованием комбинаций эндонуклеаз рестрикции XhoI/BsuRI и XbaI/PstI и выявлением бактериальных генотипов.

Ключевые слова: геномная ДНК, эндонуклеазы рестрикции, индейки, генотипирование, идентификация, патогенные микроорганизмы, ПЦР, штамм.

IDENTIFICATION OF THE POPULATION GENETIC STRUCTURE OF PATHOGENIC ORGANISMS OF TURKEY DISEASES

A.V. Sheplyakov, L.A. Shinkarenko, V.P. Terletsky, V.I. Tyschenko, O.B. Novikova,

I.N. Buravtsova, Yu.V. Titov

It is planned to carry out a research work in the Genetic Selection Centre "North Caucasus Zonal Experimental Station of Poultry" which is aimed at the prevention and control of infectious diseases of birds, causing huge economic damage to the industry. The creation of domestic competitive lines and crosses of birds requires a reliable system of livestock protection, which can be based on the use of modern molecular genetics techniques, including genotyping and PCR tests of antibiotic resistance of pathogenic microorganisms. The research is based on the use of the method of genotyping of pathogenic microorganisms, which uses restriction endonucleases with simultaneous labeling of individual DNA fragments, which are then visualized on a nylon filter. During the research, cultures of bacterial isolates were obtained in elective, selective and differential diagnostic media in the Department of Microbiology of All-Russian Research Veterinary Institute of Poultry Science after sampling and biomaterials from turkeys of different age groups in the Genetic Selection Centre "North Caucasus Zonal Experimental Station of Poultry". The species of bacteria were also determined with the help of cultural and molecular genetics techniques (standard PCR with primers to 16S DNA of bacteria); the comparison of genotyping data by two different methods was carried out; an in silico search of restriction endonucleases for genotyping by the DREAM technique was

carried out; E. coli bacteria were genotyped using combinations of restriction endonucleases XhoI / &mRI and Xbal / PstI, with the identification of bacterial genotypes.

Key words: genomic DNA, restriction endonucleases, turkeys, genotyping, identification, pathogenic microorganisms, PCR, strain.

Введение. Циркулирование патогенных и условно-патогенных микроорганизмов во внешней среде и у животных давно привлекает внимание ученых. Актуальность темы исследования подчеркивается медико-социальным аспектом проблемы, связанной с циркулированием ряда возбудителей не только у птиц, но и у людей (антропозоонозы). Остро стоит вопрос инфекционных заболеваний бактериальной природы, вызываемых кишечной палочкой (колибактериозы), при все большем распространении резистентных к антибиотикам штаммов. При планировании профилактических мероприятий, направленных на снижение заболеваемости, важно точно найти источник инфекции и определить пути перезаражения. Метод двойного расщепления и избирательного мечения (ДРИМ) может использоваться при проверке эффективности лечебных мероприятий (сравниваются штаммы до и после лечения) и вакцинации (сравнивается вакцинный и патогенный штаммы), выявлении путей распространения инфекции. Цель заключалась в генотипировании группы изолятов Escherichia coli и обсуждении потенциала метода ДРИМ в молекулярной эпидемиологии в условиях птицеводческих предприятий, занимающихся выращиванием индеек. В рамках поставленной цели решали задачи по выращиванию изолятов, Escherichia coli выделению геномной ДНК бактерий, проведению генотипирования.

Генотипирование полевых изолятов дает возможность проследить пути распространения и найти источник инфекции [1, 2]. Если генетические профили сравниваемых изолятов совпадают, это свидетельствует о передаче инфекции (перезаражении особей). В этой связи быстрые методы определения бактериальных штаммов приобрели особое значение. Сравнение генетических профилей бактерий позволяет отличить эпидемические штаммы (все изоляты бактерий будут идентичными) от спорадических проявлений инфекции (изоляты отличаются). Так можно выявить пути передачи возбудителя, идентифицировать источник инфекции, что при проведении ветеринарно-санитарных мероприятий позволяет прервать эпизоотическую цепь и не допустить распространения заболевания.

Таким образом, генотипирование является современным инструментом молекулярной эпизоотологии. В настоящее время используется целая группа методов генотипирования (пульс-гель электрофорез, AFLP, риботипирование, мультилокусное секвенирование (MLST), секвенирование отдельных генов, ПЦР-генотипирование [3]. Всем этим методам присущи как достоинства, так и недостатки [4, 5]. В предыдущие годы нами был разработан и валидирован на большой выборке изолятов новый метод генотипирования, основанный на двойном расщеплении и избирательном мечении фрагментов геномной ДНК - ДРИМ [6, 7]. В настоящее время метод может быть адаптирован к использованию на актуальных патогенах индеек, что является одной из целей исследования. Результаты исследований опубликованы для широкой аудитории специалистов-птицеводов [8, 9, 10].

Материал и методы исследований. Исследования проводились в 2020 году в производственных условиях СГЦ «СКЗОСП» Ставропольского края, отделе микробиологии ВНИВИП - филиале ФНЦ «ВНИТИП» РАН, ПЦР-лаборатории. Было произведено взятие проб биоматериала яиц индеек, эмбрионов из инкубатория, молодняка индеек, внутренних органов взрослых индеек с убойного цеха, проб спермы индюков с разбавителем, помета от клинически здоровых индеек. Выращивание микроорганизмов в элективной, селективной и дифференциально-диагностической средах проходило во ВНИВИП. Параллельно определялась видовая принадлежность возбудителей молекулярно-генетическим методом - ПЦР с праймерами к 16S6ДНК.

Целью научно-исследовательской работы явилась валидация и практическое применение ранее разработанного метода генотипирования изолятов кишечной палочки для использования в решении эпизоотологических вопросов в промышленном индейководстве. Несмотря на обилие методов генотипирования микроорганизмов, не существует унифицированного подхода, применимого к разным видам патогенов. Была поставлена цель разработать метод генотипирования, позволяющий идентифицировать штаммы Escherichia coli. Метод основан на ранее выдвинутой идее двойного расщепления и избирательного мечения рестрикционных фрагментов ДНК (ДРИМ). Результатом генотипирования методом ДРИМ является группа фрагментов ДНК в виде полос на фильтре, распределение которых специфично для каждого штамма. Точность идентификации штаммов, рассчитываемая по индексу дискриминации, превышает точность текущего «золотого стандарта» генотипирования. Полученные фрагменты ДНК разделяли по размеру электрофорезом в обычном 0,8% агарозном геле в трисацетатном буфере. Сразу же после электрофореза ДНК переносили на нейлоновый фильтр. Процесс проводился в дистиллированной воде на приборе вакуумного переноса VacuGene XL Vacuum Blotting System (Amersham Biosciences™). После этого фрагменты ДНК на фильтре визуализировали в цветной реакции с применением конъюгата стрептавидин-щелочной фосфатазы (Streptavidin-AP, Bio-Rad™). После проявления фрагментов ДНК фильтр отмывали несколько раз в дистиллированной воде для удаления неспецифически связанных красителей. Заключительным этапом стала работа по изучению фрагментов ДНК для выявления идентичных близкородственных и генетически далеких бактериальных генотипов-штаммов.

Одновременно сделана попытка ПЦР-генотипирования кишечной палочки с универсальными праймерами ERIC, используемыми для многих видов патогенов:

- Прямой ERIC1 ATG TAA GCT CCT GGG GAT TCAC;

- Обратный ERIC2 AAG TAA GTG ACT GGG GTG AGCG.

Условия ПЦР для ERIC праймеров: 94 °С - 3 мин., затем 35 циклов: 94 °С - 30 сек.,

40 °С - 30 сек., 72 °С - 30 сек., в конце 72 °С - 5 мин. Данные о различии/идентичности генетического профиля между сравниваемыми бактериальными изолятами позволяют определить пути передачи и найти источник инфекции в пределах птицеводческого предприятия. Анализ генетических профилей позволяет сравнить по индексу дискриминации методы генотипирования ДРИМ и ПЦР с праймерами ERIC.

Работа проведена в соответствии с правилами надлежащей лабораторной практики. Ущерб здоровью и благополучию животных при выполнении исследований нанесен не был.

Результаты исследования и их обсуждение. Поиск т^Шсо позволил подобрать большое число ферментов, теоретически пригодных для генотипирования методом ДРИМ кишечной палочки (таблицы 1, 2, 3). Предварительные опыты показали преимущество комбинации ферментов XhoI/BsuRI или XbaI/PstI при генотипировании изолятов кишечной палочки. Первый фермент расщеплял геномную ДНК возбудителя в 20-50 сайтах, что давало ограниченное число меченых фрагментов ДНК, которые было удобно визуализировать и учитывать в анализе. Пары ферментов проявляли высокую активность в одном буфере. Эти комбинации оказались удобными для генотипирования кишечной палочки. Таким образом, в отношении Е.соН подходит пара эндонуклеаз рестрикции ХЬа1РуД. Проведено генотипирование изолятов Е.соН, изолированных от больных и павших индеек, с использованием комбинаций XbaI/PstI и XhoУBsuKÍ (рис. 1). Выявлен заметно отличающийся от остальных генотип, (рис. 1, дорожка 3 слева), который имели большое число фрагментов ДНК в других положениях на фильтре, по сравнению с положением фрагментов у остальных изолятов.

Сельскохозяйственный

журнал №1(14), 2021

Рис 1. Генотипирование методом ДРИМ изолятов кишечной палочки, выделенных от индеек с использованием пары ферментов XhoI/BsuRI (слева) и XbaI/PstI (справа). М - маркер молекулярных масс фрагментов ДНК

В целом, патогенные штаммы кишечной палочки у индеек не отличались генетическим разнообразием, что говорит о циркулировании в помещении нескольких штаммов и о передаче инфекции между отдельными индейками. Нужно отметить, что эти же штаммы были выявлены в более ранней работе на курах, что свидетельствует об отсутствии видовой избирательности патогена.

Таблица 1 - Ферменты рестрикции для уменьшения размера фрагментов ДНК ферментативной реакции ДРИМ с возбудителем колибактериоза (рестрикционные буфера производства Thermo Fisher Scientific™)

Фермент Число сайтов в геноме E.coli Оптимальный буфер Эффективность в буфере O (%) Эффективность лигирования (%)

Eco32I 2440 R 50-100 95

Eco47III 902 R 50-100 95

DraI 2017 Tango™ 20-50 95

PvuI 1463 R 50-100 90

PvuII 2087 G 20-50 90

Mph110I 1073 R 20-50 95

PstI 1349 O 100 95

BsurI 1300 R 100 95

Эти ферменты отбирались in-silico с учетом частоты расщепления геномной ДНК E.coli с минимизацией в 800-2500 раз.

Таблица 2 - Результаты генотипирования изолятов E.coli, выделенных из различных органов индеек с использованием пары ферментов XbaI/PstI

Номера Номера Номера генетически

генотипов идентичных изолятов близких изолятов

1 1 я -

2 2 сл -

3 3 д -

4 4 ж -

5 5 с, 6 п -

6 7 с, 8 ж -

7 - 9 д (близок 7 с, 8 ж)

8 10 т -

9 11 сл, 12 д -

10 14 сп, 15 сп -

11 16 сп -

12 17 сп -

13 18 сп -

14 19 сп -

15 20 сп -

16 21 пом -

17 22 пом -

Обозначения: с - сердце, п - печень, ж - желчь, д - двенадцатиперстная кишка, сл - слепой отросток, сп - сперма индюков, т - тощая кишка, пом - помет, я - яйца индеек.

В таблице 2 представлены данные по генотипированию 21 патогенных изолятов кишечной палочки, выделенных из органов свежепавших и при санитарном убое индеек, в котором использовали пару ферментов - XbaI/PstI. Генотипирование позволило выявить 17 бактериальных генотипов, различавшихся между собой всего на 2-3 фрагмента ДНК. Во всех случаях близкородственные генотипы выделены от одной и той же особи из разных органов. Отмечено появление приспособительных мутаций у микроорганизма, позволяющих ему существовать в условиях разных органов, тканей. Изоляты, выделенные из разных особей, как правило, имели совершенно различные генетические профили, отличия составляли от 10 до 20 фрагментов ДНК, что подтверждает природное генетическое разнообразие бактерий Escherichia coli и перемещение большого количества патогенных штаммов. Близкие результаты генотипирования получены на этих же изолятах бактерий с применением пары ферментов XhoI/BsuRI (таблица 3).

Таблица 3 - Результаты ДРИМ-генотипирования изолятов E.coli, выделенных из различных органов индеек с использованием пары ферментов XhoI/BsuRI

Номера генотипов Номера идентичных изолятов Номера генетически близких изолятов

1 1 я -

2 2 сл -

3 3 д -

4 3 д -

5 4 ж -

6 7 с, 8 ж, 9 д -

7 10 т -

8 11 сл, 12 д -

9 14 сп, 15 сп -

10 16 сп -

11 17 сп -

12 18 сп -

13 19 сп -

14 20 сп -

15 21 пом -

16 22 пом -

Обозначения: с - сердце, п - печень, ж - желчь, д - двенадцатиперстная кишка, сл - слепой отросток, сп - сперма индюков, т - тощая кишка, пом - помет, я - яйца индеек.

Выявлено всего16 генотипов (на один меньше, чем в паре ферментов XbaI/PstI). В этом случае не удалось дифференцировать пару идентичных изолятов с идентичными генотипами 7 с, 8 ж от изолята 9 д. В остальных случаях отмечалось полное соответствие результатов генотипирования, проведенного раздельно парами ферментов XbaI/PstI и XhoI/BsuRI. Тем не менее пара ферментов XhoI/BsuRI также отличается высокой

дискриминационной способностью, и большинство изолятов удалось генетически различить. Генотипирование этих же изолятов кишечной палочки и сальмонелл с помощью ПЦР с праймерами ERIC показало гораздо худшую дискриминационную способность в сравнении с методом ДРИМ. Большинство изолятов имели одинаковый рисунок и генетически дифференцировать штаммы не представлялось возможным. Этот метод можно применять в качестве предварительного, когда стоит задача дифференцировать генетически удаленные штаммы бактерий. Близкородственные штаммы разделить не получится, в этом случае необходимо использование более высокоразрешающих методов, например, ДРИМ, ПГЭ или MLST.

Индекс дискриминации, показывающий способность метода разделять штаммы, не применяли, так как он может использоваться исключительно на эпидемиологически не родственных изолятах. В данном случае индейки содержались в условиях одного хозяйства, отбор проб проводился в одно время, поэтому нельзя исключить возможность перезаражения птицы. Ранее индекс дискриминации нами рассчитывался для групп эпидемиологически не родственных изолятов другого вида бактерий (псевдомонады), выделенных от клинически больных особей в разные периоды времени. Эта работа проводилась для доказательства эффективности метода ДРИМ, было показано, что метод не уступает по индексу дискриминации широко используемому методу пульс-гель электрофореза и мультилокусного секвенирования (MLST).

Заключение. На данном этапе исследования проведены работы согласно поставленным целям и задачам. В частности, проведен in-silico поиск эндонуклеаз рестрикции для генотипирования методом ДРИМ изолятов кишечной палочки. Были отобраны для дальнейшей работы по генотипированию кишечной палочки ферменты XhoI и XbaI (первый фермент в паре) и группа Eco32I, Eco47III, DraI, PvuI, PvuII, Mph110I, PstI, и BsuRI (в качестве второго фермента в паре). Дальнейшая работа показала преимущество пар XbaI/PstI и XhoI/BsuRI.

В дальнейшем эти ферменты использовали для генотипирования изолятов кишечной палочки, выделенных от больных и павших индеек. Показано некоторое преимущество использования пары ферментов XbaI/PstI, которая выявила на один генотип больше, чем пара XhoI/BsuRI.

Таким образом, генотипирование Escherichia coli позволяет оценить разнообразие патогена, циркулирующего у индеек, определить возможности передачи инфекции, доказать появление мутаций у бактерий, колонизирующих разные органы одной особи.

В дальнейшем планируется изучение генетической структуры популяции кишечной палочки у индеек, изучение эффекта метилирования ДНК в сайтах узнавания эндонуклеаз рестрикции на результаты генотипирования, выявление генетических различий между изолятами, выделенными от одной особи, но из разных органов.

Литература

1. Терлецкий В. П., Тыщенко В. И., Новикова И. И., Бойкова И. В., Тюлебаев С.Д., Шахтамиров И. Я. Эффективный метод генетической паспортизации штаммов Bacillus

subtilis - перспективных продуцентов биопрепаратов // Микробиология. 2016. Т. 85. №

1. С.50-55. DOI: 10.7868/S002636561601013.

2. Терлецкий В.П., Тыщенко В.И., Новикова О.Б., Борисенкова А.Н., Белаш Д.Э., Яковлев А.Ф. Эффективный молекулярно-генетический метод идентификации штаммов сальмонелл и протея // Доклады РАСХН. 2013. № 5. С. 60-63.

3. Mitani N., A. Koizumi, R. Sano, T. Masutani, K. Murakawa, K. Mikasa, Y. Okamoto. Molecular typing of methicillin-resistant Staphylococcus aureus by PCR-RFLP and its usefulness in an epidemiological study of an outbreak // Jpn. J. Infect. Dis. 2005. V. 58. № 4. P. 250-252.

4. Fakhr, M.K., L.K. Nolan, C.M. Logue. Multilocus sequence typing lacks the discriminatory ability of pulsed-field gel electrophoresis for typing Salmonella enterica serovar Typhimurium // J. Clin. Microbiol. 2005. V. 43. № 5. P. 2215-2219.

5. Hosoi T. Strain typing of Bacillus subtilis (natto) using a modified randomly amplified polymorphic DNA method // Bull. Tokyo Metropol. Agr. For. Res. Cent. 2010. V. 5. № 2. P. 45-48.

6. Terletskiy V., Tyshchenko V., Martinez-Ballesteros I., Garaizar J., Bikandi J. Validation of Double Digest Selective Label database for sequenced prokaryotic genomes // Bioinformatics. 2010. V.26. P.417-418.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

7. Eltai N.O., Abdfarag E.A., Al-Romaihi H., Wehedy E., Mahmoud M.H., Alawad O.K., Al-Hajri M.M., Al Thani A.A., Yassine H.M. Antibiotic Resistance Profile of Commensal Escherichia coli Isolated from Broiler Chickens in Qatar. J Food Prot. 2018 V.81(2):302-307. doi: 10.4315/0362-028X.JFP-17-191.

8. In-silico selection of enzymes for strain genotyping of bacteria belonging to campylobacter genus isolated from birds. Terletskiy V.P., Novikova O.B., Tyshchenko V.I., Shinkarenko L.A. Journal of Agriculture and Environment. 2019. № 3 (11). С. 11-15.

9. Терлецкий В.П., Новикова О.Б., Тыщенко В.И., Шинкаренко Л.А. In-silico подбор ферментов для генотипирования изолятов бактерий рода campylobacter, выделенных у птиц // Известия Нижневолжского агроуниверситетского комплекса: Наука и высшее профессиональное образование. 2019. № 3 (55). С. 245-252.

10. Терлецкий В.П., Тыщенко В.И., Новикова О.Б., Шинкаренко Л.А. Генотипирование патогенных бактерий - инструмент контроля эпизоотической ситуации // Аграрная Россия. 2020. № 8. С. 3-8.

Шепляков Алексей Витальевич, директор СГЦ «СКЗОСП» - филиала ФГБНУ ФНЦ «ВНИТИП» РАН, 357812, Россия, Ставропольский край, Георгиевский городской округ, с. Обильное, ул. Продольная, д. 30, тел.: 8-918-792-01-97, E-mail: skzosp@yandex.ru

Шинкаренко Лидия Александровна, кандидат сельскохозяйственных наук, заместитель директора по научной работе СГЦ «СКЗОСП» - филиала ФГБНУ ФНЦ «ВНИТИП» РАН, 357812, Россия, Ставропольский край, Георгиевский городской округ, с. Обильное, ул. Продольная, д. 30, тел.: 8-928-343-97-71, E-mail: skzospzooteh@yandex.ru

Терлецкий Валерий Павлович, доктор биологических наук, исполнитель темы по ветеринарии СГЦ «СКЗОСП» - филиала ФГБНУ ФНЦ «ВНИТИП» РАН, 357812,

Россия, Ставропольский край, Георгиевский городской округ, с. Обильное, ул. Продольная, д. 30, тел.:8-921-558-79-57, E-mail: skzosp@yandex.ru

Тыщенко Валентина Ивановна, кандидат биологических наук, исполнитель темы по ветеринарии СГЦ «СКЗОСП» - филиала ФГБНУ ФНЦ «ВНИТИП» РАН, 357812, Россия, Ставропольский край, Георгиевский городской округ, с. Обильное, ул. Продольная, д. 30, тел.:8-921-558-79-57, E-mail: skzosp@yandex.ru

Новикова Оксана Борисовна, кандидат ветеринарных наук, исполнитель темы по ветеринарии СГЦ «СКЗОСП» - филиала ФГБНУ ФНЦ «ВНИТИП» РАН, 357812, Россия, Ставропольский край, Георгиевский городской округ, с. Обильное, ул. Продольная, д. 30, тел.:8-952-399-42-65, E-mail: skzosp@yandex.ru

Буравцова Ирина Николаевна, старший научный сотрудник зооветеринарной лаборатории СГЦ «СКЗОСП» - филиала ФГБНУ ФНЦ «ВНИТИП» РАН, 357812, Россия, Ставропольский край, Георгиевский городской округ, с. Обильное, ул. Продольная, д. 30, тел.:8-636-62-81, E-mail: skzosplab@yandex.ru

Титов Юрий Васильевич, научный сотрудник отдела ветеринарии СГЦ «СКЗОСП» - филиала ФГБНУ ФНЦ «ВНИТИП» РАН, 357812, Россия, Ставропольский край, Георгиевский городской округ, с. Обильное, ул. Продольная, д. 30, тел.:8-928-310-28-99, E-mail: skzosplab@yandex.ru

Sheplyakov Aleksey Vitalievich, Director of the Genetic Selection Centre "North Caucasus Zonal Experimental Station of Poultry" - branch of the Federal State Budgetary Scientific Institution FSC "VNITIP" RAS 357812, Russia, Stavropol Territory, Georgievsky District, Obilnoye v., Prodolnaya St., 30, tel .: 8-918-792-01-97, E-mail: skzosp@yandex.ru.

Shinkarenko Lidiya Aleksandrovna, Candidate of Agricultural Sciences, Deputy Director for Research, the Genetic Selection Centre "North Caucasus Zonal Experimental Station of Poultry" - branch of the Federal State Budgetary Scientific Institution FSC "VNITIP" RAS 357812, Russia, Stavropol Territory, Georgievsky District, Obilnoye v., Prodolnaya St., 30, tel .: 8-928-343-97-71, E-mail: skzospzooteh@yandex.ru.

TerletskiyValeriy Pavlovich, Doctor of Biological Sciences, executive of the topic in veterinary science, the Genetic Selection Centre "North Caucasus Zonal Experimental Station of Poultry" - branch of the Federal State Budgetary Scientific Institution FSC "VNITIP" RAS 357812, Russia, Stavropol Territory, Georgievsky District, Obilnoye v., Prodolnaya St., 30, tel.: 8-921-558-79-57, E-mail: skzosp@yandex.ru.

Tyschenko Valentina Ivanovna, Candidate of Biological Sciences, executive of the topic in veterinary science, the Genetic Selection Centre "North Caucasus Zonal Experimental Station of Poultry" - branch of the Federal State Budgetary Scientific Institution FSC "VNITIP" RAS 357812, Russia, Stavropol Territory, Georgievsky District, Obilnoye v., Prodolnaya St., 30, tel.: 8-921-558-79-57, E-mail: skzosp@yandex.ru.

Novikova Oksana Borisovna, Candidate of Veterinary Sciences, executive of the topic in veterinary science, the Genetic Selection Centre "North Caucasus Zonal Experimental Station of Poultry" - branch of the Federal State Budgetary Scientific Institution FSC "VNITIP" RAS 357812, Russia, Stavropol Territory, Georgievsky District, Obilnoye v., Prodolnaya St., 30, tel.: 8-952-399-42-65, E-mail: skzosp@yandex.ru.

Buravtsova Irina Nikolaevna, Senior Researcher of the Veterinarian Laboratory of the Genetic Selection Centre "North Caucasus Zonal Experimental Station of Poultry" - branch of the Federal State Budgetary Scientific Institution FSC "VNITIP" RAS 357812, Russia, Stavropol Territory, Georgievsky District, Obilnoye v., Prodolnaya St., 30, tel.: 8-636-62-81, E -mail: skzosplab@yandex.ru.

Titov Yuri Vasilievich, Researcher of the Veterinary Department, the Genetic Selection Centre "North Caucasus Zonal Experimental Station of Poultry" - branch of the Federal State Budgetary Scientific Institution FSC "VNITIP" RAS 357812, Russia, Stavropol Territory, Georgievsky District, Obilnoye v., Prodolnaya St., 30, tel.: 8-928-310-28-99, E-mail: skzosplab@yandex.ru.

РЕДАКЦИОННАЯ ПОЛИТИКА Тематика журнала «Сельскохозяйственный журнал».

Научно-теоретический журнал имеет своей целью донесение до научной общественности и практических работников результатов оригинальных научно-исследовательских работ в различных областях аграрной науки, оказание помощи

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.