Научная статья на тему 'Влияние нормального компонентного состава рубцовой жидкости на уровень свечения биосенсора'

Влияние нормального компонентного состава рубцовой жидкости на уровень свечения биосенсора Текст научной статьи по специальности «Промышленные биотехнологии»

CC BY
200
37
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Ключевые слова
БИОСЕНСОР / БИОТОКСИЧНОСТЬ / РУБЦОВАЯ ЖИДКОСТЬ / РЕКОМБИНАНТНЫЙ ШТАММ E. COLI К12 TG1 / СУБСТРАТ / A RECOMBINANT STRAIN OF E. COLI K12 TG1 / BIOSENSOR / BIOTOXICITY / RUMEN FLUID / SUBSTRATE

Аннотация научной статьи по промышленным биотехнологиям, автор научной работы — Дроздова Елена Александровна, Каримов Ильшат Файзелгаянович

Рассмотрено влияние реальной (нативная) рубцовой жидкости и модельной смеси на уровень свечения люминесцентного штамма E.coli. Выявлены сходные токсические эффекты изучаемых биологических жидкостей, развивающиеся в первые минуты контакта. Проанализировано влияние отдельных компонентов рубцовой жидкости на свечение бактерий, а также вклад отдельных компонентов трофического субстрата.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по промышленным биотехнологиям , автор научной работы — Дроздова Елена Александровна, Каримов Ильшат Файзелгаянович

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

RUMEN FLUID NORMAL COMPONENTS EFFECTS ON LUMINESCENCE LEVEL OF BIOSENSOR

The effect of real (native) and rumen fluid mixture model on the emission level of luminescent strain E.coli was considered. Revealed similar toxic effects studied biological fluids, developing in the first minutes of contact. Analyzed the impact of individual components on rumen fluid bacteria glow, as well as the contribution of individual components of the trophic substrate.

Текст научной работы на тему «Влияние нормального компонентного состава рубцовой жидкости на уровень свечения биосенсора»

Дроздова Е.А., Каримов И.Ф.

Оренбургский государственный университет E-mail: [email protected]

ВЛИЯНИЕ НОРМАЛЬНОГО КОМПОНЕНТНОГО СОСТАВА РУБЦОВОЙ ЖИДКОСТИ НА УРОВЕНЬ СВЕЧЕНИЯ БИОСЕНСОРА

Рассмотрено влияние реальной (нативная) рубцовой жидкости и модельной смеси на уровень свечения люминесцентного штамма E.coli. Выявлены сходные токсические эффекты изучаемых биологических жидкостей, развивающиеся в первые минуты контакта. Проанализировано влияние отдельных компонентов рубцовой жидкости на свечение бактерий, а также вклад отдельных компонентов трофического субстрата.

Ключевые слова: биосенсор, биотоксичность, рубцовая жидкость, рекомбинантный штамм E. coli К12 TG1, субстрат

Биолюминесценция - это ферментативный процесс, сопровождающийся потреблением кислорода и выделением света [1]. У микроорганизмов центральным звеном подобной реакции является люцифераза - флавинзависимая моноок-сигеназа, катализирующая окисление восстановленного флавинмононуклеотида и длинноцепочечного альдегида в присутствии кислорода до флавинмононуклеотида, воды и соответствующей жирной кислоты с испусканием кванта света в видимой сине-зеленой области спектра [2].

Высокая степень сопряженности биолюминесценции с основными энергетическими потоками в бактериальной клетке [3] явилась условием для использования светящихся микроорганизмов при тестировании различных природных сред, биотоксичность которых может быть интегрально оценена через изменение интенсивности биолюминесценции [4], [5]. Исходя из этих предпосылок на основе лиофилизированных светящихся бактерий и выделенной из них люциферазной ферментной системы предложен ряд методов экспрессного биолюминесцентного анализа.

В настоящее время для решения проблем анализа токсичности сред сложного состава привлекается метод под названием биотестирование. Данный метод состоит в определении токсичности среды непосредственно при действии ее на живой организм [6].

В качестве материала для исследования выбрана рубцовая жидкость мясного крупного рогатого скота казахской белоголовой породы; модельная рубцовая жидкость, полученная на основе фосфатного буфера, пропионовой, молочной, масляной, уксусной кислот, глюкозы и 10-% раствора аммиака; трофические субстра-

ты на основе пшеничных отрубей, экструдированных с добавлением Ca2+, Cr2+, Fe2+, Cu2+ или обработанные сверхвысокочастотными волнами (СВЧ) и ультразвуком (УЗ) [7]. Следует отметить, что рубцовую жидкость получали путем фильтрации цельного рубцового содержимого через четыре слоя марли, затем в отфильтрованную рубцовую жидкость добавляли несколько капель 20% раствора формалина для фиксации. Для проведения опыта in vitro за основу нами была взята методика исследования переваримости сухого вещества оцениваемых кормов in vitro В. В. Попова и Е. Т. Рыбиной в модификации Г. И. Левахина и А. Г. Мещерякова. При этом в каждый из контейнеров «искусственного рубца» вносили по 128 мл рубцовой жидкости и 500 мг трофического субстрата и инкубировали в течение 24 часов при 37 °С, при этом временной интервал отбора проб составлял 3, 6, 12 и 24 часа.

При проведении исследований использован рекомбинантный штамм E.coli K12 TG1 с клонированными luxCDABE генами Photobacterium leiognathi 54D10, выпускаемый в виде лиофилизированного препарата под коммерческим названием «Эколюм-10». В соответствии с инструкцией во вскрытый флакон с ли-офилизированными бактериями добавляли 10 мл дистиллированной воды. Полученную суспензию бактерий несколько раз встряхивали до однородного раствора. Данную суспензию выдерживали в холодильной установке при температуре от плюс 2°С до плюс 4°С в течение 30 мин, доводили температуру суспензий бактерий от плюс 22°С до плюс 24°С, держа при этом флакон в защищенном от солнца месте.

Перед экспериментом суспензию бактерий во флаконе встряхивали.

Измерение люминесценции сенсорного штамма E.coli осуществляли с помощью био-люминометра LM-01T, при этом в лунки планшета вносили 225 мкл испытуемого агента и 25 мкл бактерий, после чего измеряли кинетику свечения в течение 30 минут. Ключевым моментом является внесение во все пробы одинаковых количеств суспензии бактериального биосенсора и их быстрое смешивание, исключающее лимитирование люминесцентной реакции по кислороду.

Окончательную обработку результатов измерений токсичности выполняли путем расчета среднеарифметического значения величины биолюминесцентного индекса (БЛИ) по формуле:

т опыт т контр

БЛИ = -п—-0------

I опыт I контр ?

0 n

где Гплыт - уровень люминесценции опытной пробы на n-минуте;

ITш - уровень люминесценции опытной пробы на 0-минуте;

рттр - уровень люминесценции контрольной пробы на n-минуте;

рошп-р - уровень люминесценции контрольной пробы на 0-минуте.

По окончании исследований полученные результаты были нами обработаны методами статистического анализа с определением средней арифметической величины, ошибки средней арифметической и стандартного отклонения.

В соответствии с поставленной целью, в ходе первого эксперимента оценивалось формирование возможной биотоксичности нативной рубцовой жидкости, при этом в качестве контроля была взята суспензия рекомбинантного люминесцирующего штамма E. coli в физиологическом растворе(рисунок 1).

В начале эксперимента по изучению влияния нативной рубцовой жидкости на биолюминесценцию репортёрного штамма Е. coli, наблюдалось индукция бактериальной биолюминесценции, начинающаяся с середины опыта. Однако подобная ситуация нивелировалась к концу эксперимента.

Исходя из предварительных результатов эксперимента нативная рубцовая жидкость оказала выраженное ингибирующее действие на

рекомбинантный штамм E.coli, характеризующееся резким тушением свечения уже в первые минуты контакта. Вероятной причиной такого явления может быть влияние на бактериальную биолюминесценцию какого-либо одного или нескольких компонентов, входящих в состав рубцовой жидкости, а именно наличием высокой концентрации ионов водорода в среде, воздействующих на мембраны бактериальных клеток и вызывающих протонирование молекул фосфолипидов и белков, что нарушает транспорт веществ и активность дыхательных ферментов.

Чтобы подтвердить или опровергнуть данное предположение, на следующем этапе работы нами использована модельная смесь (модельная рубцовая жидкость). Анализируя данные о влиянии отдельных компонентов модельной рубцовой жидкости на рекомбинантный штамм Е. coli, можно сделать предварительный вывод, что меньшая степень токсичности в отношении бактериальных клеток связана, по всей видимости, с отсутствием в ее составе полного спектра веществ, включая ферменты и антимикробные пептиды.

С целью идентификации компонентов, оказывающих ингибирующее воздействие на уровень свечения рекомбинантного штамма E.coli нами были изучены эффекты пропионовой, молочной, масляной, уксусной кислот, глюкозы и 10-% раствора аммиака. При этом зарегистрировано, что раствор аммиака и уксусная кислота проявляли выраженное прогрессирующее подавление интенсивности свечения штамма биосенсора. С другой стороны, пропионовая, масляная и молочная кислоты проявляли менее выраженное токсическое действие, что обусловлено наличием более длинного углеводородного хвоста, ослабляющего кислотные свойства данных молекул.

Иной характер имела глюкоза, проявляющая стимуляцию свечения, что вероятно, связано с тем, что глюкоза является трофическим субстратом для бактериальных клеток, вследствие чего регистрируется развивающееся во времени увеличение интенсивности свечения.

Полученные результаты явились отправной точкой для серии экспериментов, целью которых стало изучение влияния отдельных компонентов трофического субстрата на динамику формирования биотоксичности в условиях «искусственного рубца».

1,6 -| 1,4 -

1,2 ■

1

0,8 ■ 0,6 0,4 -

0,2 0

Рч Щ

Ї

Ї

<

Рисунок 1. Оценка интегральной биотоксичности рубцовой жидкости и ее отдельных компонентов с

использованием сенсорного штамма E.coli

я

S

-S+Ca•

-S+Cr -

- S+Fe

-S+Cu

-S+СВЧ •

-S+УЗ

Рисунок 2. Влияние рубцовой жидкости в комплексе с кормовым субстратом и времени экспозиции на свечение

сенсорного штамма E.coli

Анализируя вклад отдельных компонентов трофического субстрата в формирование биотоксичности рубцовой жидкости в условиях «искусственного рубца» с использованием рекомбинантного штамма E. coli можно отметить, что уже через 3 ч инкубации рубцовой жидкости формируется повышение уровня токсичности образцов, обработанных УЗ или СВЧ, при этом данный эффект сохраняется на протяжении всего времени (рисунок 2).

Наибольшее усиление биотоксичности рубцовой жидкости с кормовыми добавками оказывали ионы железа (II), максимальное ингибирующее воздействие которых зарегистрировано на 12 часах инкубации смеси и составляло 59,4% тушения свечения бактериального биосенсора. Подобный эффект связан со способностью металлов переменной валентности осуществлять процессы перекисного окисления липидов, что ведет к нарушению структуры мембраны клетки, а также образованию веществ, блокирующих активный центр люциферазы. С другой стороны, хром проявлял токсический эффект лишь после суток инкубации в системе, что свидетельствует о достаточной низкой токсичности данного металла в ионной форме, в

отличие от соединений с кислородом. В свою очередь медь (II) не оказывала сходного действия в связи с тем, что данный металл находится в максимальной окисленной форме и в существующей системе не способен отдать электрон. Противоположный эффект был зарегистрирован при действии на бактериальные биосенсоры рубцовой жидкости, инкубированной с ионами кальция, при этом наблюдалось зависимый от времени инкубации усиление свечения люминесцирующего штамма, что обусловлено не только принадлежностью данного металла к группе макроэлементам, но его способностью увеличивать степень перевариваемос-ти кормов, подвергнутых экструзионной обработке.

Таким образом, были зарегистрированы сходные эффекты воздействия на бактериальную биолюминесценцию реальной и модельной рубцовой жидкости, при этом обе смеси проявляли токсическое действие. Полученные данные подтверждают возможность использования созданной нами модельной смеси для установления влияния отдельных компонентов рубцовой жидкости на биолюминесценцию рекомбинантного штамма E. coli.

28.03.2014

Список литературы:

1. Кратасюк, В.А. Использование светящихся бактерий в биолюминесцентном анализе [Текст] / В.А. Кратасюк, И.И. Гительзон // Успехи микробиологии. - 1987. - Т. 21. - С. 3.

2. Findley, S.D. Activity based metagenomic screening and biochemical characterisation of bovine protozoan glycoside hydrolases [Текст] /S.D. Findley, M.R. Mormile, A. Sommer-Hurley, X.C. Zhang, P. Tipton, K. Arnett, J.H. Porter, M. Kerley, G. Stacey // Appl. Environ. Microbiol. - 2011. - V 77. - P. 8106-8113.

3. Griffith, G.W. Anaerobic fungi: Neocallimastigomycota [Текст] / G.W. Griffith, S. Baker, K. Fliegerova, A. Liggenstoffer, M. van der Giezen, K. Voigt & G. Beakes // IMA Fungus 1. - 2010. - P 181-185.

4. Huang, H. Diversity, abundance and characterisation of ruminal cysteine phytases suggest their important role in phytate degradation [Текст] / H. Huang, R. Zhang, D. Fu, J. Luo, Z. Li, H. Luo, P. Shi, P Yang, Q. Diao, B. Yao // Environ. Microbiol. 13. - 2010. - P. 747-757.

5. Zoetendal, E.G. High-throughput diversity and functionality analysis of the gastrointestinal tract microbiota [Текст] / E.G. Zoetendal, M. Rajilic-Stojanovic & W.M. de Vos // Gut 11. - 2008. - P. 1605-1615.

6. McSweeney, C. Micro-organisms and ruminant digestion: state of knoledge, trends and future prospects [Текст] / C. McSweeney, R. Mackie // Comission on genetics resources for food and agriculture — FAO. - September 2012. - Background study paper NO. P. 61-62.

7. Дроздова, Е.А. Влияние трофических субстратов на интегральную и дифференциальную биотоксичность рубцовой жидкости / Е.А. Дроздова, И.Ф. Каримов, К.Г. Логачев // Вестник Российской академии сельскохозяйственных наук. -2013. - №2. - С. 58-61.

Сведения об авторах:

Дроздова Елена Александровна, доцент кафедры микробиологии химико-биологического факультета Оренбургского государственного университета, кандидат биологических наук

e-mail: [email protected]

Каримов Ильшат Файзелгаянович, доцент кафедры микробиологии химико-биологического факультета Оренбургского государственного университета, кандидат биологических наук 460018, Оренбург, пр. Победы, д. 13, корп. 16, ауд. 306, e-mail: [email protected]

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.