Научная статья на тему 'Видовое и генетическое разнообразие представителей семейства Anaplasmataceae, выявленное в зоне симпатрии клещей родов Ixodes, Dermacentor, Haemaphysalis'

Видовое и генетическое разнообразие представителей семейства Anaplasmataceae, выявленное в зоне симпатрии клещей родов Ixodes, Dermacentor, Haemaphysalis Текст научной статьи по специальности «Биологические науки»

CC BY
69
18
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Журнал
Acta Biomedica Scientifica
ВАК
Область наук
Ключевые слова
АНАПЛАЗМЫ / ЭРЛИХИИ / ИКСОДОВЫЕ КЛЕЩИ / РЕЗЕРВУАРНЫЕ ХОЗЯЕВА / ПОЛИМЕРАЗНАЯ ЦЕПНАЯ РЕАКЦИЯ / ANAPLASMA / EHRLICHIA / IXODIC TICKS / RESERVOIR HOSTS / POLYMERASE CHAIN REACTION

Аннотация научной статьи по биологическим наукам, автор научной работы — Дорощенко Е.К., Лисак О.В., Рар В.А., Сунцова О.В., Савинова Ю.С.

Обоснование. На территории Эхирит-Булагатского района Иркутской области выявлены зоны симпатрии иксодовых клещей четырёх видов. В связи с этим научный интерес представляет исследование видового и генетического разнообразия представителей семейства Anaplasmataceae в зоне симпатрии ареалов иксодовых клещей близкородственных видов в сравнении с очагами с монодоминантным типом населения клещей.Цель исследования: изучить видовое и генетическое разнообразие представителей семейства Anaplasmataceae в зонах симпатрии иксодовых клещей Ixodes persulcatus, Dermacentor silvarum, D. nuttalli и Haemaphysalis concinna, выявить основных переносчиков и потенциальных резервуарных хозяев эрлихий и анаплазм.Методы. В ходе исследования было проанализировано 1106 экз. имаго иксодовых клещей и 49 образцов печени мелких млекопитающих. ДНК анаплазм и эрлихий выявляли методом двухраундовой ПЦР в присутствии родои видоспецифичных праймеров из области гена 16S рРНК. У части образцов определены нуклеотидные последовательности гена 16S рРНК и фрагмента groESL оперона. Cеквенирование осуществляли по методу Сэнгера. Сравнительный анализ проводили с использованием программы BLASTN и метода ClustalW. Эпидемиологический анализ данных осуществляли с использованием параметрических методов статистической обработки материала.Результаты. ДНК Ehrlichia muris и Anaplasma рhagocytophilum была обнаружена во всех исследованных видах клещей, обитающих в зоне симпатрии их ареалов. Однако процент инфицированности таёжных клещей был достоверно выше, чем клещей H. сoncinna и Dermacentor spp. К потенциальным резервуарным хозяевам представителей семейства Anaplasmataceae могут быть отнесены Microtus oeconomus, M. gregalis, Myodes rutilus и Sorex spp. При анализе нуклеотидных последовательностей гена 16S рРНК выявлено три генетических варианта анаплазм. Нуклеотидные последовательности groESL оперона А. рhagocytophilum принадлежали к двум генетическим группам.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по биологическим наукам , автор научной работы — Дорощенко Е.К., Лисак О.В., Рар В.А., Сунцова О.В., Савинова Ю.С.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Species and Genetic Diversity of Representatives of the Anaplasmataceae Family Found in the Sympatry Zone of the Ixodes, Dermacentor and Haemaphysalis Genera Ticks

Introduction.On the territory of the Ekhirit-Bulagatsky district of the Irkutsk region zones of sympatry of four Ixodes ticks species are found, where the species and genetic diversity of infectious agents transmitted through tick bites may be more pronounced than in foci with a mono-dominant type of ticks' population. In this connection, the study of the species and genetic diversity of representatives of the Anaplasmataceae family in the sympatry zone of the Ixodes ticks of closely related species was of scientific interest.Objective: To study the species and genetic diversity of members of the Anaplasmataceae family in the zones of sympatry of Ixodes ticks Ixodes persulcatus, Dermacentor silvarum, D. nuttalli and Haemaphysalis concinna, to identify the main carriers and potential reservoir hosts of ehrlichia and anaplasma.Methods. In the course of the study, 1106 specimens of adult ticks and 49 samples of small mammalian livers from the Ekhirit-Bulagatsky area were analyzed. Anaplasma and ehrlichia DNA were detected by two-round PCR in the presence of genusand species-specific primers from the 16S rRNA gene region. The nucleotide sequences of the 16S rRNA gene and the fragment of the groESL operon were identified in some samples. Sequencing was carried out according to the Sanger method. Comparative analysis was performed using the BLASTN program and ClustalW method. Epidemiological data analysis was performed using parametric methods of statistical processing of the material.Results. The DNA of Ehrlichia muris and Anaplasma phagocytophilum were detected in all studied species of ticks in their sympatry area. However, the rate of infection of taiga ticks was significantly higher than that of H. concinna and Dermacentor spp. Potential reservoir hosts of the Anaplasmataceae family members can be classified as Microtus oeconomus, M. gregalis, Myodes rutilus and Sorex spp. When analyzing the nucleotide sequences of the 16S rRNA gene, three genetic variants of anaplasma were detected. The nucleotide sequences of the A. phagocytophilum groESL operon belonged to two genetic groups.

Текст научной работы на тему «Видовое и генетическое разнообразие представителей семейства Anaplasmataceae, выявленное в зоне симпатрии клещей родов Ixodes, Dermacentor, Haemaphysalis»

ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ EXPERIMENTAL RESEARCHES

DOI: 10.29413/ABS.2019-4.2.18

Видовое и генетическое разнообразие представителей семейства Anaplasmataceae, выявленное в зоне симпатрии клещей родов Ixodes,

Dermacentor, Haemaphysalis

Дорощенко Е.К. 1, Лисак О.В. 1, Рар В.А. 2, Сунцова О.В. 1, Савинова Ю.С. 1, Козлова И.В. 1

1 ФГБНУ «Научный центр проблем здоровья семьи и репродукции человека» (664003, г. Иркутск, ул. Тимирязева, 16, Россия); 2 ФГБУН «Институт химической биологии и фундаментальной медицины» СО РАН (630090, г. Новосибирск, пр. Академика

Лаврентьева, 8, Россия)

Автор, ответственный за переписку: Дорощенко Елена Константиновна, e-mail: doroshchenko-virus@mail.ru

Резюме

Обоснование. На территории Эхирит-Булагатского района Иркутской области выявлены зоны симпатрии иксодовых клещей четырёх видов. В связи с этим научный интерес представляет исследование видового и генетического разнообразия представителей семейства Anaplasmataceae в зоне симпатрии ареалов иксодовых клещей близкородственных видов в сравнении с очагами с монодоминантным типом населения клещей.

Цель исследования: изучить видовое и генетическое разнообразие представителей семейства Anaplasmataceae в зонах симпатрии иксодовых клещей Ixodes persulcatus, Dermacentor silvarum, D. nuttalli и Haemaphysalis concinna, выявить основных переносчиков и потенциальныхрезервуарныххозяев эрлихий и анаплазм.

Методы. В ходе исследования было проанализировано 1106 экз. имаго иксодовых клещей и 49 образцов печени мелких млекопитающих. ДНК анаплазм и эрлихий выявляли методом двухраундовой ПЦР в присутствии родо- и видоспецифичных праймеров из области гена 16S рРНК. У части образцов определены нуклеотидные последовательности гена 16S рРНК и фрагмента groESL оперона. Cеквенирование осуществляли по методу Сэнгера. Сравнительный анализ проводили с использованием программы BLASTN и метода ClustalW. Эпидемиологический анализ данных осуществляли с использованием параметрических методов статистической обработки материала.

Результаты. ДНК Ehrlichia muris и Anaplasma рhagocytophilum была обнаружена во всех исследованных видах клещей, обитающих в зоне симпатрии их ареалов. Однако процент инфицированности таёжных клещей был достоверно выше, чем клещей H. mncinna и Dermacentor spp. К потенциальным резервуар-ным хозяевам представителей семейства Anaplasmataceae могут быть отнесены Microtus oeconomus, M. gregalis, Myodes rutilus и Sorex spp. При анализе нуклеотидных последовательностей гена 16S рРНК выявлено три генетических варианта анаплазм. Нуклеотидные последовательности groESL оперона А. рhagocytophilum принадлежали к двум генетическим группам.

Ключевые слова: анаплазмы, эрлихии, иксодовые клещи, резервуарные хозяева, полимеразная цепная реакция

Для цитирования: Дорощенко Е.К., Лисак О.В., Рар В.А., Сунцова О.В., Савинова Ю.С., Козлова И.В. Видовое и генетическое разнообразие представителей семейства Anaplasmataceae, выявленное в зоне симпатрии клещей родов Ixodes, Dermacentor, Haemaphysalis. Acta biomedica scientifica. 2019; 4(2): 129-137. doi: 10.29413/ABS.2019-4.2.18

Species and Genetic Diversity of Representatives of the Anaplasmataceae Family Found in the Sympatry Zone of the Ixodes, Dermacentor and Haemaphysalis

Genera Ticks

Doroshchenko E.K. 1, Lisak O.V. 1, Rar V.A. 2, Suntsova O.V. 1, Savinova Yu.S. 1, Kozlova I.V. 1

1 Scientific Centre for Family Health and Human Reproduction Problems (ul. Timiryazeva 16, Irkutsk 664003, Russian Federation); 2 Institute of Chemical Biology and Fundamental Medicine, Siberian Branch, Russian Academy of Sciences (pr. Academica Lavrentyeva 8, Novosibirsk 630090, Russian Federation)

Corresponding author: Elena K. Doroshchenko, e-mail: doroshchenko-virus@mail.ru

Abstract

Introduction. On the territory of the Ekhirit-Bulagatsky district of the Irkutsk region zones of sympatry of four Ixodes ticks species are found, where the species and genetic diversity of infectious agents transmitted through tick bites may be more pronounced than in foci with a mono-dominant type of ticks' population. In this connection, the study of the

species and genetic diversity of representatives of the Anaplasmataceae family in the sympatry zone of the Ixodes ticks of closely related species was of scientific interest.

Objective: To study the species and genetic diversity of members of the Anaplasmataceae family in the zones of sympatry of Ixodes ticks Ixodes persulcatus, Dermacentorsilvarum, D. nuttalli and Haemaphysalis concinna, to identify the main carriers and potential reservoir hosts of ehrlichia and anaplasma.

Methods. In the course of the study, 1106 specimens of adult ticks and 49 samples of small mammalian livers from the Ekhirit-Bulagatsky area were analyzed. Anaplasma and ehrlichia DNA were detected by two-round PCR in the presence of genus- and species-specific primers from the 16S rRNA gene region. The nucleotide sequences of the 16S rRNA gene and the fragment of the groESL operon were identified in some samples. Sequencing was carried out according to the Sanger method. Comparative analysis was performed using the BLASTN program and ClustalW method. Epidemiological data analysis was performed using parametric methods of statistical processing of the material. Results. The DNA of Ehrlichia muris and Anaplasma phagocytophilum were detected in all studied species of ticks in their sympatry area. However, the rate of infection of taiga ticks was significantly higher than that of H. concinna and Dermacentor spp. Potential reservoir hosts of the Anaplasmataceae family members can be classified as Microtus oeconomus, M. gregalis, Myodes rutilus and Sorex spp. When analyzing the nucleotide sequences of the 16S rRNA gene, three genetic variants of anaplasma were detected. The nucleotide sequences of the A. phagocytophilum groESL operon belonged to two genetic groups.

Key words: anaplasma, Ehrlichia, ixodic ticks, reservoir hosts, polymerase chain reaction

For citation: Doroshchenko E.K., Lisak O.V., Rar V.A., Suntsova O.V., Savinova Yu.S., Kozlova I.V. Species and Genetic Diversity of Representatives of the Anaplasmataceae Family Found in the Sympatry Zone of the Ixodes, Dermacentor and Haemaphysalis Genera Ticks. Acta biomedica scientifica. 2019; 4(2): 129-137. doi: 10.29413/ABS.2019-4.2.18

ВВЕДЕНИЕ

Иркутская область является территорией эндемичной по целому ряду инфекций, как вирусной, так и бактериальной этиологии, передающихся через укус клеща. Основным вектором для большинства клещевых патогенов является таёжный клещ Ixodes persulcatus. Однако в передаче возбудителей болезней человека и животных участвуют, в той или иной степени, и другие иксодовые клещи, ареалы которых пересекаются с ареалом таёжного клеща, формируя зоны симпатрии иксодовых клещей близкородственных видов.

Симпатрические отношения создают предпосылки для попеременного попадания вида (геновида, штамма) возбудителя в организм двух (или более) видов клещей, близкое родство которых даёт возможность возбудителю выживать и развиваться. При этом воздействие даже самой ограниченной степени контакта симпатрических видов-переносчиков на интенсивность обмена таксоном возбудителя может быть умножено в силу значительного диапазона вариантов горизонтальной и вертикальной циркуляций патогена на протяжении многих симпатрических поколений переносчиков [1]. Таким образом, в природных очагах одной и той же инфекции среда для возбудителя может быть неодинаковой в областях раздельного и совместного обитания близких видов-переносчиков.

Выбор Эхирит-Булагатского района в качестве модельной территории для изучения феномена симпатрии и его возможного влияния на видовое и генетическое разнообразие представителей семейства Anaplasmataceae не случаен. Он обусловлен наличием здесь всех основных типов ландшафтов (от таёжного до степного) и, в соответствии с этим, разнообразием обитающей здесь флоры и фауны. На территории Эхирит-Булагатского района встречаются клещи четырёх видов - Ixodes persulcatus (Schulze, 1930), Dermacentor nuttalli (Olenev, 1929), D. silvarum (Olenev, 1932) и Haemaphysalis concinna (Koch, 1844), а фауна, представлена наличием биоценотических группировок, свойственных таёжным, подтаёжным, лесостепным и степным ландшафтам.

В 2006 г. было доказано, что на территории этого района существуют природные очаги гранулоцитарного анаплазмоза человека (ГАЧ) и моноцитарного эрлихиоза

человека (МЭЧ) с циркуляцией в них Ehrlichia muris и Anaplasma рhagocytophilum [2, 3].

Роль мелких млекопитающих в качестве резервуар-ных хозяев эрлихий и анаплазм в ареале таёжного клеща на территории России показана на примере Свердловской, Новосибирской областей и Хабаровского края [4, 5, 6]. ДНК A. phagocytophilum, E. muris и «Candidatus N. mikurensis» была обнаружена в образцах от мелких млекопитающих на территории данных регионов. Возбудители ГАЧ и МЭЧ выявлены в образцах от полёвок рода Myodes и Microtus, обыкновенных бурозубок (Sorex araneus), восточно-азиатских мышей (Apodemus peninsulae) и бурундуков (Tamias sibiricus) [4, 5, 6]. В Иркутской области исследования по выявлению бактерий семейства Anaplasmataceae в организме теплокровных животных до недавнего времени не проводились.

ЦЕЛЬ ДАННОЙ РАБОТЫ

Изучить видовое и генетическое разнообразие представителей семейства Anaplasmataceae в зонах симпатрии иксодовых клещей родов Ixodes, Dermacentor, Haemaphysalis, выявить основных переносчиков и потенциальных резервуарных хозяев эрлихий и анаплазм.

МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

В ходе исследования было проанализировано 1106 экз. имаго иксодовых клещей, отловленных с растительности на флаг в лесных, лесостепных и степных биотопах Эхирит-Булагатского района, из которых 522 экз. были представлены клещами I. рersulcatus, 408 - H. concinna и 176 - клещами рода Dermocentor spp. В качестве района сравнения был взят Иркутский район Иркутской области, характеризующийся абсолютным доминированием клещей I. рersulcatus. Проанализировано 1398 экз. имаго таёжных клещей, собранных с растительности на флаг на территории данного района.

Кроме того, были исследованы 49 образцов печени мелких млекопитающих, являющихся прокормителями иксодовых клещей на территории Эхирит-Булагатского района. Зверьки были пойманы с использованием стандартных зоологических методов.

Суммарные нуклеиновые кислоты экстрагировали из клещей и образцов тканей животных с помощью

Таблица 1

Праймеры, используемые при проведении двухраундовой ПЦР, для обнаружения и видовой идентификации эрлихий и анаплазм

Table 1

Primers used in the two-round PCR for the detection and species identification of Ehrlichia and Anaplasma

Ген Нуклеотидные последовательности праймеров (5' ^ 3') Температура отжига Ссылки на авторов

Ehrl (gaacgaacgctggcggcaagc) Ehr2(agta(t/c)cg(a/g)accagatagccgc) 57 °C [5]

Ген 16SpPHK Anaplasmataceae Ehr3 (tgcataggaatctacctagtag) Ehr4 (ctaggaattccgctatcctct) Ehr1 (gaacgaacgctggcggcaagc) Ehr6 (gacccaaccttaaatggctgc) 59 °C 63 °C [5] [5, 8]

Ehr7 (taacacatgcaagtcgaacg) Ehr8 (cttcgagttaagccaattcc) 60 °C [5, 8]

Ген 16S рРНК А. phagocytophilum HGE1 (cggattattctttatagcttgc) HGE2 (cttaccgaaccgcctacatg) 55 °C [5]

Ген 16S рРНК E. muris Em1 (cgaacggatagctacccatagc) Em2 (cgctccaaagttaagctttggt) 55 °C [5]

groESLonepoH Anaplasmataceae HS1-f (cgycagtgggctggtaatgaa) HS6-r (ccwccwggtacwacaccttc) HS6-f (atagtyatgaaggagagtgat) HSVR (tcaacagcagctctagtwg) 55 °C 50 °C [8, 9] [10]

комплекта реагентов «РИБО-преп» (ФБУН ЦНИИЭ Роспо-требнадзора, Москва) по инструкции производителя.

ДНК анаплазм и эрлихий выявляли методом двухраундовой полимеразной цепной реакции (ПЦР) в присутствии прямых и обратных родоспецифичных прайме-ров (табл. 1) из области гена 16S рРНК [5, 7], используя лабораторные наборы производства ЗАО «БИОСАН» (г. Новосибирск). При положительном результате длина ПЦР-продукта составляла 524 н.п.

Видовую принадлежность эрлихий и анаплазм устанавливали на втором этапе с использованием праймеров, специфичных для А. phagocytophilum и Е. muris (табл. 1) [5, 8].

В результате проведения второго раунда ПЦР получали специфические фрагменты длиной 494 н.п. для А. рhagocytophilum и 539 н.п. для Е. muris, которые выявляли с помощью электрофореза в 2%-ном агарозном геле в присутствии бромистого этидия с последующим облучением ультрафиолетом на трансиллюминаторе.

Для амплификации нуклеотидной последовательности гена 16S рРНК использованы праймеры Ehr1, Ehr6, Ehr7 и Ehr8 [5, 8], для амплификации фрагмента groESL-оперона - праймеры HS1-f, HS6-r, HS6-f и HSVR [8, 9, 10] (табл. 1).

Полученные ампликоны очищали с помощью GFX колонок («Amersham Biosciences», USA). Для идентификации возбудителей ГАЧ и МЭЧ проводили определение нуклеотидных последовательностей полиморфных участков их генома. Секвенирование осуществляли по методу Сэнгера на автоматическом секвенаторе «ABIPrism 3100 DNAAnaliser» («AppliedBiosystems», USA) в Центре секвенирования ДНК СО РАМН, г. Новосибирск. Сравнение расшифрованных нуклеотидных последовательностей с ранее опубликованными в GenBank проводили с использованием программы BLASTN (http://www.ncbi. nlm.nih.gov/BLAST), полученные последовательности анализировали методом ClustalW (http://www.ebi.ac.uk/ clustalw/index.html).

Эпидемиологический анализ данных осуществляли с использованием параметрических методов статистиче-

ской обработки материала с вычислением стандартной ошибки и критерия Стьюдента [11].

Соблюдение этических норм. Животные для исследования были отловлены с применением живоловок. Перед изъятием органов животные были подвергнуты эвтаназии с использованием хлороформа. Исследования выполнены в соответствии с законодательством РФ, положениями «Европейской конвенции о защите позвоночных животных, используемых для экспериментальных и других научных целей» (ETS № 123), в частности приложения А и статьи № 5 Конвенции, положениями Guide for the Care and Use of Laboratory Animals (Washington D.S., 2011) и другими нормами международного права, регламентирующими вопросы содержания и использования лабораторных (экспериментальных) животных.

РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ

В ходе исследования на наличие ДНК представителей семейства Anaplasmataceae было исследовано 1106 экз. иксодовых клещей, собранных на территории Эхирит-Булагатского района. Результаты исследования представлены в таблице 2. Из иксодовых клещей в общей сложности было выявлено 100 образцов ДНК бактерий семейства Anaplasmataceae: 48 изолятов ДНК E. muris, 30 - А. рhagocytophilum, в 19 образцах присутствовала одновременно ДНК E. muris и А. рhagocytophilum.

Инфицированность клещей I. persulcatus E. muris, A. phagocytophilum и одновременно двумя этими патогенами составила 7,1 %, 3,3 % и 2,7 % соответственно. Процент заражённости клещей H. concinna был значительно ниже. В клещах Dermacentor spp. ДНК E. muris детектирована в 2,0 % случаев, ДНК A. phagocytophilum - в 1,7 % случаев. Микст-инфицирование клещей этого вида одновременно двумя патогенами в ходе нашего исследования не выявлено.

Было показано, что различия в уровне инфициро-ванности разных видов иксодовых клещей в Эхирит-Бу-лагатском районе статистически значимы. Для выборок клещей I. рersulcatus и H. rancinna критерий Стьюдента

составил t = 4,6, при сравнении инфицированности клещей I. persulcatus и Dermacentor spp. t = 3,7 (при К > 500: t = 1,96 при p < 0,05; t = 2,58 при p < 0,01). В то время

крит. 1 ' крит 1 ' 1

как между клещами H. сопстпа и Dermacentor spp. статистически значимой разницы в уровне инфицированности эрлихиями и анаплазмами не обнаружено t = 1,0 (К > 500, p < 0,05, t = 1,96).

крит.

Параллельно с исследованиями в Эхирит-Булагатском районе нами проведено изучение инфицированности клещей бактериями семейства Anaplasmataceae в Иркутском районе Иркутской области (табл. 3). Это район характеризуется монодоминантным типом населения иксодовых клещей, с абсолютным преобладанием клеща I. persulcatus.

Сравнительный анализ инфицированности таёжных клещей из Эхирит-Булагатского и Иркутского районов Иркутской области показал, что доля клещей, инфицированных эрлихиями и анаплазмами, почти вдвое выше в зоне симпатрии иксодовых клещей, чем в зоне с монодоминантным обитанием этого вида клещей.

Нами отмечено, что инфицированность представителями семейства Anaplasmataceae является более высокой

у I. persulcatus, чем других иксодид. По всей видимости, именно этот вид клещей является основным переносчиком эрлихий и анаплазм, как в зоне симпатрии иксодовых клещей, так и на территории с монодоминантным типом населения клещей.

Для выявления ДНК бактерий семейства Anaplasmataceae в организме теплокровных животных, являющихся прокормителями иксодовых клещей и, следовательно, потенциальными резервуарными хозяевами возбудителей МЭЧ и ГАЧ в природных очагах, нами было проанализировано 49 образцов печени мелких млекопитающих, отловленных в лесостепных и степных биотопах Эхирит-Булагатского района.

Видовой состав животных и результаты исследования приведены в таблице 4. Полученные нами результаты согласуются с данными, полученными ранее при исследовании мелких млекопитающих в других регионах [5, 6].

С учётом данных, в том числе по микстинфицирован-ным животным, к числу потенциальных резервуарных хозяев моноцитарных эрлихий на территории Эхирит-Булагатского района, могут быть отнесены: полёвка-эко-

Результаты исследования методом ПЦР иксодовых клещей, собранных в Эхирит-Булагатском районе The results of a PCR study of Ixodic ticks collected in the Ekhirit-Bulagatsky district

Таблица 2 Table 2

Исследовано клещей Всего Обнаруженные виды бактерий

Вид клеща положительных образцов E. muris A. phagocytophilum E. muris/ A. phagocytophilum

I. persulcatus 522 71* (13,6 ± 1,5 %) 37 (7,1 ± 1,1 %) 17 (3,3 ± 0,8 %) 14 (2,7 ± 0,7 %)

Dermacentor spp. 176 9 (5,1 ± 1,7 %) 3 (1,7 ± 1,0 %) 6 (3,4 ± 1,4 %) -

H. concinna 408 20 (4,9 ± 1,1 %) 8 (2,0 ± 0,7 %) 7 (1,7 ± 0,6 %) 5 (1,2 ± 0,5 %)

Всего 1106 100 (9 ± 0,9 %) 48 (4,3 ± 0,6 %) 30 (2,7 ± 0,5 %) 19 (1,7 ± 0,4 %)

Примечание. * - в 3 образцах бактерии семейства Anaplasmataceae не определены до вида.

Таблица 3

Результаты исследования методом ПЦР клещей I. persulcatus, собранных в Иркутском районе Иркутской области

Table 3

The results of the PCR study of I. persulcatus ticks collected in the Irkutsk region of the Irkutsk Oblast

Исследовано клещей Всего Обнаруженные виды бактерий

Вид клеща положительных образцов E. muris A. phagocytophilum E. muris/ A. phagocytophilum

I. persulcatus 1398 104 (7,4 ± 0,7 %) 49 (3,5 ± 0,5 %) 42 (3,0 ± 0,5 %) 13 (0,9 ± 0,3 %)

Таблица 4

Результаты исследования грызунов, отловленных на территории Эхирит-Булагатского района, на присутствие ДНК E. muris и

А. рЬадосуХорЬИит

Table 4

The results of a study of rodents caught in the territory of the Ekhirit-Bulagatsky district for the presence of E. muris and A. phagocytophilum DNA

Количество Число образцов, в которых обнаружена ДНК

№ Вид животного исследованных особей _ . . , . ., E. muris + E. muris А. phagocytophilum . . А. phagocytophilum

1 Полёвка-экономка (Microtus oeconomus) 17 2* 2

2 Узкочерепная полёвка (Microtus gregalis) 4 1 - -

3 Бурозубка (Sorex spp.) 21 2

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

4 Красная полёвка (Myodes rutilus) 5 - 2* 1

5 Красно-серая полёвка (Myodes rufocanus) 1 - -

6 Серая крыса (Rattus norvegicus) 1 - -

Всего (абс./%) 49 3 (6,1%) 4 (8,2%) 3 (6,1%)

Примечание. * - в одном из образцов одновременно обнаружена РНК вируса клещевого энцефалита.

номка (М. овсопотиз), узкочерепная полёвка (М. дгвдаНз), красная полёвка (М. ги^йиз) и бурозубки (Богвх Брр.). Возможными резервуарными хозяевами А. рЬадосу^рЬНит являются М. овсопотиз и М. ги^!из.

ДНК «СапсИс1а^з N. ггнкигепБ^» при исследовании клещей и грызунов в Эхирит-Булагатском районе не обнаружена, что вероятнее всего обусловлено небольшим объёмом выборки, так как, как правило, инфицированность иксодовых клещей этой бактерией не превышает 1 % [8]. На территории Иркутского района ДНК «СапсИс1а^з N. тнкигегыБ» была выявлена в клещах I. рвгзи!са^з.

Ранее были определены нуклеотидные последовательности фрагмента гена 16Б рРНК Е. тиг1з длиной 1299 н.о. для образцов от клещей и мелких млекопитающих, отловленных на территории различных областей России [9, 12, 13]. Все они были идентичны друг другу и нуклеотидной последовательности Е. тиг1з (бепВапк АВ196302), выявленной у грызунов в Японии [14, 15], и отличались двумя нуклеотидными заменами от последовательности Е. тиг1з (бепВапк АВ013009), которая была впервые генотипирована в Японии в 1999 г. в клещах и грызунах [15]. Типичным образцом Е. тиг1з на территории азиатской части России является образец N0^-^ 205, нуклеотидные последовательности которого занесены в базу данных бепВапк под номерами 611358686 (дгоЕБ1 оперон) и 611358691 (ген 16Б рРНК). Было установлено, что последовательности фрагмента гена 16Б рРНК Е. тиг1з являются высоко консервативными.

У образца 1гк-Нс313, полученного от клеща Н. сопсппа из Эхирит-Булагатского района, была определена нукле-отидная последовательность дгоЕБ1 оперона длиной

1315 н.о. Она оказалась идентичной последовательностям дгоЕБ1 оперона образцов Е. типз, выявленных ранее в клещах I. рвгзи!са^з в Новосибирской области (611358686), Хабаровском крае (611358689) и Иркутской области (I гк-1 р615,1 гк-1 р635), и отличалась двумя заменами от последовательности дгоЕБ1 оперона из клещей в Японии (ДР210459) [16, 17].

В ходе выполнения исследования нами определены нуклеотидные последовательности гена 165 рРНК и дгоЕБ1 оперона А. рЬадосу^рЬИит у 5 образцов от клещей I. рвгзи!са^з, собранных в Эхирит-Булагатском районе (табл. 5).

Нуклеотидные последовательности дгоЕ51. оперона и гена 165 рРНК образцов I гк-1р2, 1гк-1р2620, 1гк-1р137 были идентичны последовательностям образца из Новосибирска Nov-Ip456. Нуклеотидная последовательность гена 165 рРНК образца 1гк-1р645 была идентична последовательности Iгк-1 р820 из Иркутского района (табл. 5).

Нуклеотидные последовательности гена 165 рРНК и дгоЕБ1 оперона образца !гк-!р662 зарегистрированы в базе данных бепВапк под номерами НМ366572 (дгоЕБ1 оперон) и НМ366584 (165 рРНК). Генетические варианты последовательностей этого образца обнаружены только Эхирит-Булагатском районе Иркутской области, в других регионах Сибири и Дальнего Востока подобные нуклеотидные последовательности А. рЬадосу^рЬИит не обнаружены.

По результатам секвенирования гена 165 рРНК образцов из Эхирит-Булагатского района выявлено три генетических варианта А. рЬадосу^рЬНит - 1, 4, 5 (табл. 5).

Генетический вариант 1 (образцы кЫр-2, I г к-!р2620). Нуклеотидная последовательность гена 165 рРНК

Таблица 5

Генетические варианты A. phagocytophilum, выявленные на территории Эхирит-Булагатского и Иркутского районов

Table 5

Detection of various variants of A. phagocytophilum in the territory of Ekhirit-Bulagatsky and Irkutsk districts

дгоЕ5Ьэперон 16S рРНК

Образец Генетический Идентичная последовательность Генетический вариант в базе данных ОвпБапк вариант Идентичная последовательность в базе данных GenBank

Эхирит-Булагатский район

Irk-Ip2 I НМ366570 1 HM366582

Irk-Ip2620 I НМ366570 1 HM366582

Irk-Ip137 I НМ366570 -* -

Irk-Ip645 -* - 4 HM366586

Irk-Ip662 III-h HM366572 5 HM366584

Иркутский район

Irk-Ip853 I НМ366570 1 HM366582

Irk-Ip687 I НМ366570 1 HM366582

Irk-Ip625 I НМ366571 2 HM366583

Irk-Ip706 I НМ366571 2 HM366583

Irk-Ip10 III-a НМ366575 4 HM366587

Irk-Ip776 III-b НМ366573 4 HM366585

Irk-Ip50 III-b НМ366573 4 HM366585

Irk-Ip820 III-c НМ366574 4 HM366586

Irk-Ip398 III-c НМ366574 -* -

Irk-Ip434 III-c НМ366574 -* -

Примечание. * - нуклеотидная последовательность не определена.

соответствует последовательности, доступной в базе данных СепБапк (ДР093788), ранее выявленной в крови больных людей [18].

Генетический вариант 4 (Iгк-1 р-645) отличается одной нуклеотидной заменой в консервативной области гена 165 рРНК от последовательности редкого генетического варианта А. рИадосу^рИНит (СепБапк 00342324), выявленного ранее только на территории Китая в I. рвгзи!с^из и мелких млекопитающих [19, 20], и тремя нуклеотидными заменами в вариабельной области гена 165 рРНК от соответствующей последовательности генетического варианта 1.

Генетический вариант 5 (1гк-1р662) отличается от варианта 4 одной нуклеотидной заменой в консервативной области гена.

Генетические варианты 2, 3 и 6, ранее описанные в других регионах России [7, 12], в Эхирит-Булагатском районе не обнаружены. В Иркутском районе, кроме выявленных в Эхирит-Булагатском районе вариантов гена 165 рРНК,встречаетсятакжегенетический вариант2 А. рИадосу^рИНит, но в то же время отсутствует вариант 5 (табл.5).

Последовательности дгоЕБ1 оперона А. рИадосуО рИНит отлиарютса Чклеевя1сояимеазтообразиемпо сравнению с последовательностями гена 165 рРНК. В России былкеыявленодесиеь ва^астиринследоеатрль-

ностей groESL оперона, которые могут быть отнесены к трём различным группам (I, II, III) и отличаются по тропизму к позвоночным хозяевам [21, 22].

Гомология нуклеотидных последовательностей groESL оперона между разными группами составляет 94,8-94,9 %, внутри групп варьирует от 99,7 до 100 % [8, 21, 22]. Было показано, что на филогенетическом древе нуклеотидные последовательности групп I и II - образцы из России вместе с аналогичными последовательностями образца, выделенного от полёвки из Швейцарии (AF192796), - формируют отдельный достаточно гомогенный кластер. В то время как генетическая группа III была крайне гетерогенна и содержала восемь вариантов нуклеотидных последовательностей, обозначенных IIIa-IIIh (рис. 1). Все они вошли в кластер, сформированный нуклеотидными последовательностями образцов А. рЬадосу^рЬНит от клещей и бурундуков. Эти последовательности различаются между собой 1-4 нуклеотидными заменами [21, 22].

Обрезцы ДНК А. рЬадрсдАоиОНит изЭхидит-Була-гатского района по результатам анализа нуклеотидных последовательностей дroESL орероноИыдиотнесены к I и III группам (табл. 5). К этим же группам отнесены все обнарикенАынзоасАоящоьу времмнив Иркдгскос области образцы нуклеотидных последовательностей groESL ыперзна А.еАмосузорЛ//ит.Адоаро срекзргеАмтич еских

65

99

79 L

69 Irk-Ip776-IIIb (HM366573) I. persulcatus Irk-Ip820-IIIc (HM366574) I. persulcatus Kh-Ip7 (HM366575) I. persulcatus Irk-Ip10-IIIa I. persulcatus Irk-Ip662-IIIh (HM366572) I. persulcatus I бурундук, Новосибирск (HQ630618) 72^ I. persulcatus, Новосибирск (HM366569) косуля, Австрия (AY220469) I. ricinus, Германия (AY281820)

-косуля, Швейцария (AF383225)

-косуля, Швейцария (AF383227)

> I

67

53

человек, США (AF172163) LI. pacificus, США (AF173989) I. ricinus, Германия (AY281828)

I-овца, Норвегия (AF548386)

94 | олень, Словения (AF478563)

100 I—1

I—п

100

полевка, Свердловск (HQ630616) полевка, Швейцария (AF192796) Nov-Ip456 (HM366570) I. persulcatus Irk-Ip853 I. persulcatus Irk-Ip625 (HM366571) I. persulcatus

■c у

■с у

0.005

Рис. 1. Дендрограмма сходства нуклеотидных последовательностей фрагмента groESL оперона A. phagocytophilum (1245 н.о.), построенная с использованием метода NJ. Шкала представляет 0,5 % дивергенции. Красным цветом выделены последовательности из Иркутской области.

Fig. 1. Dendrogram of nucleotide sequence similarity of the groESL operon fragment of A. phagocytophilum (1245 nb), constructed using the NJ method. The scale represents 0.5 % divergence. Sequences from the Irkutsk Region are highlighted in red.

94

99

98

76

100

вариантов нуклеотидных последовательностей, отнесённых к III группе, в Иркутском районе Иркутской области отличался от варианта в зоне симпатрии клещей родов Ixodes, Dermacentor и Haemaphysalis в Эхирит-Булагатском районе.

Сравнение генетических вариантов A. phagocytophilum, циркулирующих в областях симпатрии I. persulca-tus/I. trianguliceps на территории Западной Сибири и I. ricinus/I. trianguliceps на территории Европы, позволило выявить генетическую линию анаплазм, характерную только для I. trianguliceps [22, 23].

В нашем исследовании выявить генетический вариант, ассоциированный с каким-либо определённым видом клещей, не удалось, т.к. изучалась только генетическая вариабельность образцов А. рhagocytophilum от клещей I. persulcatus в областях раздельного и совместного обитания близких видов-переносчиков. Исследования в этом направлении будут продолжены.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

Установлено широкое распространение на территории Эхирит-Булагатского района Иркутской области очагов МЭЧ и ГАЧ с циркуляцией в них E. muris и A. рhagocytophilum.ДНК этих возбудителей была обнаружена как в иксодовых клещах, так и в образцах печени от мелких млекопитающих.

Основным переносчиком бактерий семейства Anaplasmataceae в зоне симпатрии иксодовых клещей на территории Эхирит-Булагатского района является таёжный клещ I. регБи1са1:иБ. Клещи H. concinna и Dermocentor spp. выполняют роль дополнительных переносчиков. Установлено, что к числу потенциальных резервуарных хозяев представителей семейства Anaplasmataceae на территории Эхирит-Булагатско-го района, могут быть отнесены: полёвка-экономка (M. oeconomus), узкочерепная полёвка (M. gregalis), красная полёвка (M. rutilus) и бурозубки (Sorex spp.).

Показано, что нуклеотидная последовательность groESL оперона от клеща H. concinna из Эхирит-Булагат-ского района идентична последовательностям groESL оперона образцов E. muris, выявленных ранее в клещах I. persulcatus в Новосибирской области, Хабаровском крае и Иркутской области (Irk-Ip 615, Irk-Ip 635) и отличается только двумя заменами от последовательности groESL оперона из клещей в Японии. Учитывая полученные ранее результаты и данные литературы, можно заключить, что нуклеотидные последовательности E. muris являются высоко консервативными и не зависят от вида клеща.

Проведён сравнительный анализ генетической вариабельности A. рhagocytophilum в зоне симпатрии клещей родов Ixodes, Dermacentor и Haemaphysalis и в районе с монодоминантным типом населения иксодовых клещей. Показано, что по результатам секвенирования гена 16S рРНК образцов из Эхирит-Булагатского района выявлено три генетических варианта А. рhagocytophilum - 1, 4, 5, а в Иркутском районе - 1, 2 и 4.

В ходе сравнительного анализа нуклеотидных последовательностей groESL оперона на территории двух районов было установлено, что образцы из обоих районов относятся к генетическим группам I и III. Однако спектр генетических вариантов, отнесённых к группе III по groESL оперону, в Эхирит-Булагатском районе в зоне симпатрии клещей родов Ixodes, Dermacentor и Haemaphysalis и в Иркутском районе Иркутской области отличался.

Финансирование

Данное исследование выполнено при финансовой поддержке гранта РФФИ № 16-04-01336_а.

Конфликт интересов

Авторы данной статьи сообщают об отсутствии конфликта интересов.

ЛИТЕРАТУРА

1. Филиппова Н.А. Симпатрия близкородственных видов иксодовых клещей и её возможная роль в паразитарных системах природных очагов трансмиссивных болезней. Паразитология. 1999; 33(3): 223-241.

2. Козлова И.В., Злобин В.И., Верхозина М.М., Рар В.А., Ли-сак О.В., Дорощенко Е.К., и др. Результаты рекогносцировочных исследований по моноцитарному эрлихиозу и гранулоцитар-ному анаплазмозу человека в Прибайкалье. Acta biomedica scientifica. 2007; 3(55): 112-116.

3. Козлова И.В., Верхозина М.М., Дёмина Т.В., Джиоев Ю.П., Дорощенко Е.К., Лисак О.В., и др. Сочетанные очаги трансмиссивных клещевых инфекций на территории Прибайкалья. Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2010; 4(53): 40-46.

4. Ливанова Н.Н., Рар В.А., Ливанов С.Г., Иголкина Я.П. Разнообразие паразитарных систем с участием мелких млекопитающих и Ixodes persulcatus Shculze на Северном Урале. Сибирский экологический журнал. 2005; (6): 1079-1084.

5. Рар В.А., Пуховская Н.М., Высочина Н.П., Зайнулина З.У., Гуляко Л.Ф., Иванов Л.И. Распространение и генетическое разнообразие эрлихий и анаплазм в таежных клещах и мелких млекопитающих на территории Хабаровского края. Acta biomedica scientifica. 2007; 3 (Приложение): 156-159.

6. Rar VA, Livanova NN, Panov VV, Kozlova IV, Pukhovska-ya NM, Vysochina NP, et al. Prevalence of Anaplasma and Ehrlichia species in Ixodes persulcatus ticks and small mammals from different regions of Asian part of Russia. Int JMed Microbiol. 2008; 298(1): 222-230. doi: 10.1016/j.ijmm.2008.01.001

7. Rar VA, Fomenko NV, Dobrotvorsky AK, Livanova NN, Ruda-kova SA, Fedorov EG, et al. Tick-borne pathogen detection, Western Sibiria, Russia. Emerg Infect Dis. 2005; 11: 1708-1715.

8. Rar VA, Epikhina TI, Livanova NN, Panov VV, Doroshchen-ko EK, Pukhovskaya NM, et al. The study of heterogeneity of 16S rRNA gene and groESL operone in DNA samples of Anaplasma phagocytophilum, Ehrlichia muris, and "Candidatus Neoehrlichia mikurensis" determined in Ixodes persulcatus ticks on the territory of Ural, Siberia and Far East of Russia. Mol Gen Microbiol Virol. 2011; 26(2): 66-73. doi: 10.3103/S0891416811020091

9. Sumner JW, Nicholson WL, Massung RF. PCR amplification and comparison of nucleotide sequences from the groESL heat shock operon of Ehrlichia species. J Clin Microbiol. 1997; 35(8): 2087-2092.

10. Liz JS, Anderes L, Sumner JW, Massung RF, Gern L, Rutti B, et al. PCR detection of granulocytic ehrlichia in Ixodes ricinus ticks and wild small mammals in western Switzerland. J Clin Microbiol. 2000; 38(3): 1002-1007.

11. Савилов Е.Д., Астафьев В.А., Жданова С.Н., Заруд-нев Е.А. Эпидемиологический анализ: Методы статистической обработки материала. Новосибирск: Наука-Центр; 2011.

12. Rar VA, Livanova NN, Panov VV, Doroshchenko EK, Pukhovskaya NM, Vysochina NP, et al. Genetic diversity of Anaplasma and Ehrlichia in Asian part of Russia. Ticks Tick-Borne Dis. 2010; 1(1): 57-65. doi: 10.1016/j.ttbdis.2010.01.002

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

13. Rar VA, Epikhina TI, Livanova NN, Panov VV, Doroschen-ko EK, Pukhovskaya NM, et al. Genetic variability of Anaplasma phagocytophilum in Ixodes persulcatus ticks and small mammals in the Asian part of Russia. Vector-Borne Zoonot Dis. 2011; 11(8): 1013-1021. doi: 10.1089/vbz.2010.0266

14. Kawahara M, Suto C, Rikihisa Y, Yamamoto S, Tsuboi Y. Characterization of ehrlichial organisms isolated from a wild mouse. J Clin Microbiol. 1993; (31): 89-96.

15. Wen B, Rikihisa Y, Mott J, Fuerst PA, Kawahara M, Suto C. Ehrlichia muris sp. nov., identified on the basis of 16S rRNA

base sequences and serological, morphological and biological characteristics. Int J Syst Bacteriol. 1995: (45): 250-254. doi: 10.1099/00207713-45-2-250

16. Kawahara M, Ito T, Suto C, Shibata S, Rikihisa Y, Hata K, et al. Comparison of Ehrlichia muris strains isolated from wild mice and ticks and serologic evidence of humans and animals with E. muris as antigen. J Clin Microbiol. 1999: 37(4): 1123-1129.

17. Sumner JW, Storch GA, Buller RS, Liddell AM, Stockham SL, Rikihisa Y, et al. PCR amplification and phylogenetic analysis of groESL operon sequences from Ehrlichia ewingii and Ehrlichia muris. J Clin Microbiol. 2000; 38(7): 2746-2749.

18. Von Loewenich FD, Stumpf G, Baumgarten BU, Roll-inghoff M, Dumler JS, Bogdan C. A case of equine granulocytic ehrlichiosis provides molecular evidence for the presence of pathogenic Anaplasma phagocytophilum (HGE agent) in Germany. Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 2003; 22(5): 303-305. doi: 10.1007/ s10096-003-0935-1

19. Cao WC, Zhan L, He J, Foley J, De Vlas SJ, Wu XM, Yang H, Richardus JH, Habbema JD. Natural Anaplasma phagocytophilum infection of ticks and rodents from a forest area of Jilin Province, China. Am J Trop Med Hyg. 2006; 75(4): 664-668.

20. Cao WC, Zhao QM, Zhang PH, Dumler JS, Zhang XT, Fang LQ, et al. Granulocytic ehrlichia in Ixodes persulcatus ticks from an area in China where Lyme disease is endemic. J Clin Microbiol. 2000; 38(11): 4208-4210.

21. Rar VA, Golovljova I. Anaplasma, Ehrlichia, and "Can-didatus Neoehrlichia" bacteria: pathogenicity, biodiversity, and molecular genetic characteristics, a review. Infect GenetEvol. 2011; 11(8): 1842-1861. doi: 10.1016/j.meegid.2011.09.019

22. Rar VA, Epikhina TI, Tikunova NV, Yakimenko VV, Malko-va MG, Tancev AK, et al. Genetic variability of Anaplasma phagocytophilum in ticks and voles from Ixodes persulcatus/Ixodes triangu-liceps sympatric areas from Western Siberia, Russia. Ticks Tick-Borne Dis. 2014; 5(6): 854-863. doi: 10.1016/j.ttbdis.2014.07.008

23. Blanarova L, Stanko M, Carpi G, Miklisova D, Vfchova B, Mosansky L, et al. Distinct Anaplasma phagocytophilum genotypes associated with Ixodes trianguliceps ticks and rodents in Central Europe. Ticks Tick-Borne Dis. 2014; 5(6): 928-38. doi: 10.1016/j. ttbdis.2014.07.012.

REFERENCES

1. Filippova NA. Sympathy of closely related species of ixodic ticks and its possible role in the parasitic systems of natural foci of vector-borne diseases. Parazitologiya. 1999; 33(3): 223-241. (In Russ.)

2. Kozlova IV, Zlobin VI, Verkhozina MM, Rar VA, Lisak OV, Doroshchenko EK, et al. The results of reconnaissance studies on monocytic ehrlichiosis and human granulocytic anaplasmosis in the Baikal region. Acta biomedica scientifica. 2007; 3(55): 112-116. (In Russ.)

3. Kozlova IV, Verkhozina MM, Dyomina TV, Dzhioev YuP, Doroshchenko EK, Lisak OV, et al. Combined foci of transmissible tick-borne infections in the Baikal region. Epidemiologiya i vaktsin-oprofilaktika. 2010; 4(53): 40-46. (In Russ.)

4. Livanova NN, Rar VA, Livanov SG, Igolkina YaP. Diversity of parasitic systems involving small mammals and Ixodes persulcatus Schulze in the Northern Urals. Sibirskiy ehkologicheskiy zhurnal. 2005; (6): 1079-1084 (In Russ.)

5. Rar VA, Pukhovskaya NM, Vysochina NP, Zaynulina ZU, Gulyako LF, Ivanov LI. Distribution and genetic diversity of Ehrlichia and Anaplasma in taiga ticks and small mammals on the territory of the Khabarovsk Territory. Acta biomedica scientifica. 2007; 3 (Supplement): 156-159 (In Russ.)

6. Rar VA, Livanova NN, Panov VV, Kozlova IV, Pukhovskaya NM, Vysochina NP, et al. Prevalence of Anaplasma and Ehrlichia species in Ixodes persulcatus ticks and small mammals from different regions of Asian part of Russia. Int J Med Microbiol. 2008; 298(1): 222-230. doi: 10.1016/j.ijmm.2008.01.001

7. Rar VA, Fomenko NV, Dobrotvorsky AK, Livanova NN, Ruda-kova SA, Fedorov EG, et al. Tick-borne pathogen detection, Western Sibiria, Russia. Emerg Infect Dis. 2005; 11: 1708-1715.

8. Rar VA, Epikhina TI, Livanova NN, Panov VV, Doroshchenko EK, Pukhovskaya NM, et al. The study of heterogeneity of 16S rRNA gene and groESL operone in DNA samples of Anaplasma phagocytophilum, Ehrlichia muris, and "Candidatus Neoehrlichia mikurensis"determined in Ixodes persulcatus ticks on the territory of Ural, Siberia and Far East of Russia. Mol Gen Microbiol Virol. 2011; 26(2): 66-73. doi: 10.3103/S0891416811020091

9. Sumner JW, Nicholson WL, Massung RF. PCR amplification and comparison of nucleotide sequences from the groESL heat shock operon of Ehrlichia species. J Clin Microbiol. 1997; 35(8): 2087-2092.

10. Liz JS, Anderes L, Sumner JW, Massung RF, Gern L, Rutti B, et al. PCR detection of granulocytic ehrlichia in Ixodes ricinus ticks and wild small mammals in western Switzerland. J Clin Microbiol. 2000; 38(3): 1002-1007.

11. Savilov ED, Astafyev VA, Zhdanova SN, Zarudnev EA. Epidemiological analysis: Methods of the statistical processing of materials. Novosibirsk: Nauka-Tsentr; 2011. (In Russian)

12. Rar VA, Livanova NN, Panov VV, Doroshchenko EK, Pukhovskaya NM, Vysochina NP, et al. Genetic diversity of Anaplasma and Ehrlichia in Asian part of Russia. Ticks Tick-Borne Dis. 2010; 1(1): 57-65. doi: 10.1016/j.ttbdis.2010.01.002

13. Rar VA, Epikhina TI, Livanova NN, Panov VV, Doroschen-ko EK, Pukhovskaya NM, et al. Genetic variability of Anaplasma phagocytophilum in Ixodes persulcatus ticks and small mammals in the Asian part of Russia. Vector-BorneZoonot Dis. 2011; 11(8): 1013-1021. doi: 10.1089/vbz.2010.0266

14. Kawahara M, Suto C, Rikihisa Y, Yamamoto S, Tsuboi Y. Characterization of ehrlichial organisms isolated from a wild mouse. J Clin Microbiol. 1993; (31): 89-96.

15. Wen B, Rikihisa Y, Mott J, Fuerst PA, Kawahara M, Suto C. Ehrlichia muris sp. nov., identified on the basis of 16S rRNA base sequences and serological, morphological and biological characteristics. Int J Syst Bacteriol. 1995: (45): 250-254. doi: 10.1099/00207713-45-2-250

16. Kawahara M, Ito T, Suto C, Shibata S, Rikihisa Y, Hata K, et al. Comparison of Ehrlichia muris strains isolated from wild mice and ticks and serologic evidence of humans and animals with E. muris as antigen. J Clin Microbiol. 1999: 37(4): 1123-1129.

17. Sumner JW, Storch GA, Buller RS, Liddell AM, Stockham SL, Rikihisa Y, et al. PCR amplification and phylogenetic analysis of groESL operon sequences from Ehrlichia ewingii and Ehrlichia muris. J Clin Microbiol. 2000; 38(7): 2746-2749.

18. Von Loewenich FD, Stumpf G, Baumgarten BU, Roll-inghoff M, Dumler JS, Bogdan C. A case of equine granulocytic ehrlichiosis provides molecular evidence for the presence of pathogenic Anaplasma phagocytophilum (HGE agent) in Germany. Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 2003; 22(5): 303-305. doi: 10.1007/ s10096-003-0935-1

19. Cao WC, Zhan L, He J, Foley J, De Vlas SJ, Wu XM, Yang H, Richardus JH, Habbema JD. Natural Anaplasma phagocytophilum infection of ticks and rodents from a forest area of Jilin Province, China. Am J Trop Med Hyg. 2006; 75(4): 664-668.

20. Cao WC, Zhao QM, Zhang PH, Dumler JS, Zhang XT, Fang LQ, et al. Granulocytic ehrlichia in Ixodes persulcatus ticks from an area in China where Lyme disease is endemic. J Clin Microbiol. 2000; 38(11): 4208-4210.

21. Rar VA, Golovljova I. Anaplasma, Ehrlichia, and "Can-didatus Neoehrlichia" bacteria: pathogenicity, biodiversity, and molecular genetic characteristics, a review. Infect Genet Evol. 2011; 11(8): 1842-1861. doi: 10.1016/j.meegid.2011.09.019

22. Rar VA, Epikhina TI, Tikunova NV, Yakimenko VV, Malko-va MG, Tancev AK, et al. Genetic variability of Anaplasma phagocytophilum in ticks and voles from Ixodes persulcatus/Ixodes trianguliceps sympatric areas from Western Siberia, Russia. Ticks Tick-Borne Dis. 2014; 5(6): 854-863. doi: 10.1016/j.ttbdis.2014.07.008

23. Blanarova L, Stanko M, Carpi G, Miklisova D, Vfchova B, Mosansky L, et al. Distinct Anaplasma phagocytophilum genotypes associated with Ixodes trianguliceps ticks and rodents in Central Europe. Ticks Tick-Borne Dis. 2014; 5(6): 928-38. doi: 10.1016/j. ttbdis.2014.07.012.

Сведения об авторах

Дорощенко Елена Константиновна - кандидат биологических наук, научный сотрудник лаборатории молекулярной эпидемиологии и генетической диагностики, ФГБНУ «Научный центр проблем здоровья семьи и репродукции человека», e-mail: doroshchenko-virus@mail.ru, http://orcid.org/0000-0002-8209-616 Лисак Оксана Васильевна - младший научный сотрудник лаборатории молекулярной эпидемиологии и генетической диагностики, ФГБНУ «Научный центр проблем здоровья семьи и репродукции человека», e-mail: lisak.liza@rambler.ru, http://orcid.org/0000-0003-3909-7551

Рар Вера Александровна - кандидат биологических наук, научный сотрудник лаборатории молекулярной микробиологии, ФГБУН Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, e-mail: rarv@niboch.nsc.ru

Сунцова Ольга Владимировна - кандидат биологических наук, научный сотрудник лаборатории молекулярной эпидемиологии и генетической диагностики, ФГБНУ «Научный центр проблем здоровья семьи и репродукции человека», e-mail: olga_syntsova@list.ru, http://orcid.org/0000-0003-4057-2890

Савинова Юлия Сергеевна - младший научный сотрудник лаборатории молекулярной эпидемиологии и генетической диагностики, ФГБНУ «Научный центр проблем здоровья семьи и репродукции человека», e-mail: vippersona2389@rambler.ru, http://orcid.org/0000-0001-8183-1233

Козлова Ирина Валерьевна - доктор медицинских наук, руководитель лаборатории молекулярной эпидемиологии и генетической диагностики, ФГБНУ «Научный центр проблем здоровья семьи и репродукции человека»; e-mail: diwerhoz@rambler.ru, http://orcid.org/0000-0002-6324-8746.

Information about the authors

Elena K. Doroshchenko - Cand. Sc. (Biol.), Research Officer at the Laboratory of Molecular Epidemiology and Genetic Diagnostics, Scientific Centre for Family Health and Human Reproduction Problems, e-mail: doroshchenko-virus@mail.ru, http://orcid.org/0000-0002-8209-616

Oksana V. Lisak - Junior Research Officer at the Laboratory of Molecular Epidemiology and Genetic Diagnostics, Scientific Centre for Family Health and Human Reproduction Problems, e-mail: lisak.liza@rambler.ru, http://orcid.org/0000-0003-3909-7551

Vera A. Rar - Cand. Sc. (Biol.), Research Officer at the Laboratory of Molecular Microbiology, Institute of Chemical Biology and Fundamental Medicine SB RAS, e-mail: rarv@niboch.nsc.ru Olga V. Suntsova - Cand. Sc. (Biol.), Research Officer at the Laboratory of Molecular Epidemiology and Genetic Diagnostics, Scientific Centre for Family Health and Human Reproduction Problems, e-mail: olga_syntsova@list.ru, http://orcid.org/0000-0003-4057-2890

Julia S. Savinova - Junior Research Officer of the Laboratory of Molecular Epidemiology and Genetic Diagnostics, Scientific Centre for Family Health and Human Reproduction Problems, e-mail: vippersona2389@rambler.ru, http://orcid.org/0000-0001-8183-1233

Irina V. Kozlova - Dr. Sc. (Med.), Head of the Laboratory of Molecular Epidemiology and Genetic Diagnostics, Scientific Centre for Family Health and Human Reproduction Problems, e-mail: diwerhoz@rambler.ru, http://orcid.org/0000-0002-6324-8746

^атья получена: 14.01.2019. йатья принята: 04.03.2019. йатья опубликована: 26.04.2019.

Received: 14.01.2019. Accepted: 04.03.2019. Published: 26.04.2019.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.