Научная статья на тему 'Таргетное секвенирование нового поколения (NGS) в диагностике первичных иммунодефицитов'

Таргетное секвенирование нового поколения (NGS) в диагностике первичных иммунодефицитов Текст научной статьи по специальности «Фундаментальная медицина»

CC BY
1057
113
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по фундаментальной медицине , автор научной работы — Суспицын Е.Н., Гусева М.Н., Соколенко А.П., Бизин И.В., Имянитов Е.Н.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Текст научной работы на тему «Таргетное секвенирование нового поколения (NGS) в диагностике первичных иммунодефицитов»

«Дни иммунологии в СПб 2017» Immunology Days in St. Petersburg 2017

Медицинская Иммунология Medical Immunology (Russia)/Meditsinskaya Immunologiya

ных больных характерным является снижение количества циркулирующих CD16+ лимфоцитов (6,3±2,1%, в контроле 12,1±1,2%), также как и угнетение их цитолитического потенциала в сравнении с данными практически здоровых (CD16+GrB+ 4,30±2,3; в контроле 10,21±1,10%). Однако функциональная активность CD16+ натуральных киллеров (НК), оцениваемая по процентному содержанию Гранзим-содержащих НК от их общего числа, у не болеющих выше (20,1±3,7%) по сравнению с пациентами с клиническими признаками иммунной недостаточности на фоне терапии ВВИГ (7,2±2,9%). Кроме того, у больных без клинических проявлений ОВИН в условиях заместительной терапии более высокий антигенпрезентирующий потенциал макро-фагальных клеток: CD14+HLA-DR+ — 73±8% (в контроле 85±5%), тогда как у болеющих отитами, конъюнктивитами, бронхитами количество CD14+HLA-DR+ составило лишь 52±3%. Также выявлены отличия функционирования фагоцитирующих нейтрофилов, которые наиболее показательны при сопоставлении значения К ст. НСТ-теста. У болеющих на фоне ВВИГ-терапии регистрируется существенное снижение адаптационного потенциала нейтро-фильного фагоцитоза (К ст. 1,4±0,2 у.е.) в сравнении с аналогичным показателем не болеющих пациентов (1,8±0,3).

Таким образом, у больных с врожденным дефектом гуморальной составляющей адаптивной иммунной защиты клеточные факторы врожденного иммунитета играют существенную роль в поддержании целостного функционального потенциала иммунной системы, что следует учитывать при иммунокоррекции в случае неполной эффективности заместительной терапии.

ТАРГЕТНОЕ СЕКВЕНИРОВАНИЕ НОВОГО ПОКОЛЕНИЯ (NGS) В ДИАГНОСТИКЕ ПЕРВИЧНЫХ ИММУНОДЕФИЦИТОВ

Суспицын Е.Н.1, 2, Гусева М.Н.3, 4, Соколенко А.П.1, 2, Бизин И.В.5, Имянитов Е.Н.1' 2

1ФГБОУ «Санкт-Петербургский государственный педиатрический медицинский университет», Санкт-Петербург, Россия

2 ФГБУ«Научно-исследовательский институт онкологии им. Н.Н. Петрова» Министерства здравоохранения РФ, Санкт-Петербург, Россия

3 Консультативно-диагностический центр Санкт-Петербургского государственного педиатрического медицинского университета, Санкт-Петербург, Россия

4 ФГБОУ ВО «Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет им. И.П. Павлова», Санкт-Петербург, Россия

5 Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого, Санкт-Петербург, Россия

Первичные иммунодефициты (ПИД) — заболевания, связанные с наличием наследственного дефекта како-

го-либо звена иммунной защиты. Диагностика ПИД затрудняется существованием большого числа нозологических форм (более 300), которое регулярно увеличивается. Клинико-лабораторные признаки часто недостаточно специфичны, что не всегда позволяет с уверенностью поставить диагноз, а высокая генетическая гетерогенность ограничивает ценность ДНК-анализа. Эффективность диагностики может быть повышена за счет применения методов секвенирования нового поколения (NGS), которые дают возможность одномоментного тестирования множества генов.

Цель и задачи. Установление генетической причины заболевания у детей с клиническими признаками возможного первичного иммунодефицита.

Материалы и методы. Для проведения ДНК-анализа были отобраны 34 пациента с подозрением на наличие ПИД; отбор осуществлялся на основании наличия клинических признаков ПИД, предложенных Jeffrey Modell Foundation. Клинические и иммунологические признаки позволяли заподозрить конкретные нозологические формы ПИД лишь в трети случаев (12/34, 35%). Поиск мутаций проводился посредством высокопроизводительного таргетного секвенирования на платформе Illumina. При этом целевому обогащению c помощью наборов зондов SeqCapEZMedExome (Roche) подвергались кодирующие последовательности 302 известных генов первичных им-мунодефицитов. При отборе потенциально патогенных вариантов учитывались тип мутации, популяционная частота, наличие сведений о патогенности, а также данные предиктивных программ.

Результаты. Однозначный результат генетического исследования, т.е. выявление патогенной мутации, соответствующей клинической картине и типу наследования заболевания, был получен в 13/34 (38%) случаев. Выявлен широкий спектр нозологических форм ПИД, включаята-кие заболевания как аутоиммунный полиэндокринный синдром 1 типа, синдром IPEX, агаммаглобулинемия Брутона, хроническая грануломатозная болезнь, атак-сия-телеангиэктазия, синдром Нетертона, аутовоспали-тельные синдромы и др. В 6 из 13 случаев результат ДНК-анализа соответствовал диагнозу, предполагаемому ранее на основании клинических и лабораторных данных.

Заключение. Мультигенное таргетноесеквенирова-ние является ценным методом диагностики первичных иммунодефицитных состояний, особенно в ситуациях, когда клинико-лабораторные данные не дают оснований к проведению «прицельного» тестирования отдельных генов. Эффективность выявления генетических причин ПИД в проведенном исследовании соответствует данным зарубежных работ, выполненных с использованием аналогичных подходов.

Работа поддержана за счет средств гранта РНФ 15-15-00079.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.