Роль унаследованных вариантов генов ферментов репарации ДНК, биотрансформации ксенобиотиков, системы антиоксидантной защиты, контроля клеточного цикла и апоптоза, трансмембранного рецептора семейства рецепторных тирозинкиназ ЕrbВ в формировании риска рака легкого у рабочих угольных шахт Кузбасса Текст научной статьи по специальности «Фундаментальная медицина»

Материалы и методы

В исследование включено 260 больных серозным РЯ высокой степени злокачественности и РМЖ: 68 чеченок, 55 осетинок, 12 тувинок, 20 ингушек, 25 лезгинок. Информация об этнической принадлежности предоставлялась пациентками. Образцы ДНК были выделены из крови или гистологических препаратов. Был выполнен анализ полной кодирующей последовательности генов BRCA1 и BRCA2 методом секвенирования нового поколения [next-generation sequencing (NGS)].

Результаты

Частота мутаций в генах BRCA1/2 составила 22,2% (40/180). У чеченок частота мутаций составила 22% (15/68), 60% (9/15) пришлось на повторяющуюся в этой популяции мутацию BRCA1 c.3629_3630delAG [rs80357589]. У 18% (10/55) осетинок обнаружили BRCA-мутации, 60% (6/10) мутаций пришлось на повторяющуюся в этой популяции мутацию BRCA2 c.6339_6339delC (no rs). У тувинок обнаружена повторяющаяся в 33% (4/12) случаев мутация BRCA2 c.8208_8209insAG [rs483353122]. У 30% (6/20) ингушек обнаружены BRCA-мутации, более 60% пришлось на две повторяющиеся мутации в гене BRCA2: L1686X c.5057T>A [rs886038115] (n=2) и c.5351dupA [rs80359507, c.5344_5345insA] (n=2). BRCA1 c.5266dupC обнаружена у 1 ингушки. У лезгинок частота мутаций составила 20% (5/25), 60% (3/5) пришлось на мутацию BRCA1 c.66dupA [rs80357783].

Выводы

Полученные результаты подчеркивают необходимость исследования полной кодирующей последовательности генов BRCA1/2 и создания современных генетических тест-систем, учитывающих этноспецифические различия в спектре и частоте мутаций. Широко распространенная ДНК-диагностическая панель, включающая в себя 8 повторяющихся мутаций, не отражает истинного спектра патогенных изменений в высокопенетрант-ных генах BRCA1 и BRCA2 среди неславянского населения России. Так, среди пациенток из нашей выборки, BRCA1 c.5266dupC обнаружена у 1пациентки ингушской национальности. Таким образом, вероятность обнаружения повторяющейся «славянской» мутации у представителей неславянских популяций относится к случайному событию.

Работа поддержана грантом РНФ № 21-75-30015 «Наследственный рак молочной железы и яичника: 1) спектр вовлеченных генов и мутаций у различных народов России; 2) новые аспекты молекулярного патогенеза».

Использованная литература

1. Sokolenko AP, Sokolova TN, Ni VI, et al . Frequency and spectrum of founder and non-founder BRCA1 and BRCA2 mutations

in a large series of Russian breast cancer and ovarian cancer patients . Breast Cancer Res Treat . 2020;184(1):229-235 .

https://doi . org/10 . 1007/s10549-020-05827-8

Роль унаследованных вариантов генов ферментов репарации ДНК, биотрансформации ксенобиотиков, системы антиоксидантной защиты, контроля клеточного цикла и апоптоза, трансмембранного рецептора

семейства рецепторных тирозинкиназ ЕгЬВ в формировании риска рака легкого у рабочих угольных шахт Кузбасса

Авторы:

(1) Баканова Марина Леонидовна, mari-bakano@ya.ru, ФГБНУ «Федеральный исследовательский центр угля и углехимии СО РАН», ФГБОУ ВО «Кемеровский государственный университет», ФГБОУ ВО «Кемеровский государственный медицинский университет» Минздрава России, Кемерово

(2) Савченко Яна Александровна, mari-bakano@ya.ru, ФГБНУ «Федеральный исследовательский центр угля и углехимии СО РАН», ФГБОУ ВО «Кемеровский государственный университет», Кемерово

(3) Минина Варвара Ивановна, mari-bakano@ya.ru, ФГБНУ «Федеральный исследовательский центр угля и углехимии СО РАН», ФГБОУ ВО «Кемеровский государственный университет», Кемерово

Ключевые слова

шахтеры, генетический полиморфизм, рак легкого

Актуальность

Добыча угля остается крупной отраслью, в которой работают миллионы людей по всему миру. У подвергшихся воздействию пыли угольных шахт рабочих могут развиться различные легочные заболевания, в том числе такие, как злокачественные новообразования легких (Taeger, 2015). Варианты генов, осуществляющих контроль биотрансформации ксенобиотиков, репарации ДНК, контроля клеточного цикла и апоптоза, системы антиоксидантной защиты, трансмембранного рецептора семейства рецепторных тирозинкиназ ЕгЬВС нередко ассоциируют не только с формированием рака легкого (РЛ) , но и с эффектом воздействия производственной среды на организм человека (Ada, 2013; Liu, 2017).

Цель

Анализ вариантов генов репарации ДНК (APEX1 rs1130409, hOGGl rs1052133, NBS1 rs1805794, XPD rs13181) , системы антиоксидантной защиты (MnSOD rs4880, GPxl rs1050450, CAT rs1001179), контроля клеточного цикл и апоптоза (TP53 rs1042522), ферментов биотрансформации ксенобиотиков (CYP1A2 rs762551, GSTP1 rs1695, EPHX1 rs1051740), трансмембранного рецептора семейства рецепторных тирозинкиназ ЕгЬВ (EGFR rs2227984) в связи с риском формирования рака легкого у рабочих угольных шахт Кузбасса.

Материалы и методы

Обследованы 214 больных РЛ рабочих угольных шахт Кузбасса и 300 здоровых рабочих угольных шахт Кузбасса, которые составили группу сравнения. Испытуемые были подобраны с учетом пола, возраста и статуса курения, и у каждого было взято согласие на исследование. Варианты генов hOGGl (rs1052133), APEX1 (rs1130409), XPD (rs13181), NBS1 (rs1805794), CAT (rs1001179), EPHX1 (rs1051740), EGFR (rs2227984) изучали методом аллель-специфической ПЦР (НПФ «Литех», Москва), а варианты генов CYP1A2(rs762551), TP53(rs1042522), GSTP1 (rs1695), MnSOD(rs4880), GPx1(rs1050450) — Real-time PCR (ООО «СибДНК», Нoвосибирск). Статистическая обработка материала проводилась с помощью SNPstats (http://bioinfo.iconcolo-gia.net/SNPstats), «Statistica 10.0» (StatSoft, Inc., USA).

Результаты

Выявлены ассоциации риска развития РЛ c генотипом АА гена EGFR (OR= 1,85; 95% CI=1,28-2,68; p=0,001 для сверхдоминантной модели), с генотипом ТС+СС гена EPHX1 (OR=0,45; 95% CI=0,32-0,64; p=0,0001 для доминантной модели), с генотипом GG гена XPD (OR=2,60; 95% CI=1,57-4,31; p=0,0004 для кодоминантной модели), с генотипом GG гена APEX1 (OR=1,64; 95% CI=1,07-2,52; p=0,02 для рецессивной модели). В обследованных группах частоты генотипов и аллелей исследованных генов соответствовали равновесию Харди-Вайнберга.

Выводы

Полученные данные указывают на возможную роль вариантов генов EPHX1 rs 1051740, EGFR rs2227984, APEX1 rs1130409, XPD rs13181 в формировании риска РЛ у шахтеров Кузбасса.

Исследование выполнено при поддержке гранта в форме субсидий на создание научных лабораторий под руководством молодых ученых (постановление Правительства от 19.09.22 № 632).

Список литературы

1. Taeger, D . Lung cancer among coal miners, ore miners and quarrymen: smoking-adjusted risk estimates from the synergy pooled analysis of case-control studies I D .Taeger, B . Pesch, B . Kendzia, et al . II Scand J Work Environ Health . 2015;41(5):467-477. D0l:10 . 5271Isjweh . 3513 .

2 Ada, A O Cytogenetic damage in Turkish coke oven workers exposed to polycyclic aromatic hydrocarbons: Association with CYP1A1, CYP1B1, EPHX1, GSTM1, GSTT1, and GSTP1 gene polymorphisms I Ada, A. O . C . Demiroglu, M . Yilmazer, et al . II Arh Hig Rada Toksikol . 2013;64(3):359-369. D0l:10. 2478I10004-1254-64-2013-2328 .

3 Liu, C Genetic polymorphisms and lung cancer risk: Evidence from metaanalyses and genome-wide association studies I C . Liu, H . Cui, D . Gu et al . II Lung Cancer. 2017 . V. 113 . P. 18-29 .

Спектр генетических перестроек в расширенной выборке воспалительных миофибробластических опухолей у детей

Авторы:

(1) Венина Айгуль Рифовна, garifullina.aigul@gmail.com, ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Петрова» Минздрава России, Санкт-Петербург

(2) Преображенская Елена Васильевна, chekmarevaev@mail.ru, ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Петрова» Минздрава России, Санкт-Петербург