Научная статья на тему 'Распространенность полиморфизмов генов, ассоциированных с социально-значимыми мультифакториальными заболеваниями, у населения г. Омска'

Распространенность полиморфизмов генов, ассоциированных с социально-значимыми мультифакториальными заболеваниями, у населения г. Омска Текст научной статьи по специальности «Науки о здоровье»

CC BY
328
117
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Журнал
Медицинский альманах
ВАК
Область наук
Ключевые слова
ОДНОНУКЛЕОТИДНЫЕ ПОЛИМОРФИЗМЫ ГЕНОВ / СЕРДЕЧНО-СОСУДИСТЫЕ ЗАБОЛЕВАНИЯ / ЛИПИДНЫЙ ОБМЕН / САХАРНЫЙ ДИАБЕТ / ОМСКАЯ ОБЛАСТЬ / SINGLE NUCLEOTIDE POLYMORPHISM CARDIOVASCULAR DISEASE / LIPID METABOLISM / DIABETES / OMSK REGION

Аннотация научной статьи по наукам о здоровье, автор научной работы — Вильмс Елена Анатольевна, Долгих Татьяна Ивановна, Турчанинов Денис Владимирович

Проведено исследование распространенности полиморфизмов генов, ассоциированных с сердечно-сосудистой патологией, нарушениями липидного обмена и сахарным диабетом, у здорового населения Омска методом единичных полиморфизмов. Выявлены возрастные и половые группы риска по ряду значимых полиморфизмов. Установлена высокая распространенность в женской популяции полиморфизмов генов, ассоциированных с развитием сердечно сосудистых заболеваний: AGT (174Met), AGTR А1166С, PON (-107C/T); среди мужчин нарушений липидного обмена LIPC-250(G>A).

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по наукам о здоровье , автор научной работы — Вильмс Елена Анатольевна, Долгих Татьяна Ивановна, Турчанинов Денис Владимирович

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

The prevalence of polymorphisms of genes, associated with socially significant multifactor diseases of Omsk population

The study of the prevalence of polymorphisms of genes associated with cardiovascular disease, lipid metabolism disorders and diabetes in a healthy population of Omsk by SNP (single nucleotide polymorphism). The age and sex groups at risk for a number of significant SNPs. The high prevalence in the female population of polymorphisms of genes associated with the development of cardiovascular disease: AGT (174Met), AGTR A1166C, PON (-107C / T); men dyslipidemia LIPC-250 (G> A).

Текст научной работы на тему «Распространенность полиморфизмов генов, ассоциированных с социально-значимыми мультифакториальными заболеваниями, у населения г. Омска»

УДК 591.151:613.6(470.51

РАСПРОСТРАНЕННОСТЬ ПОЛИМОРФИЗМОВ ГЕНОВ, АССОЦИИРОВАННЫХ С СОЦИАЛЬНО-ЗНАЧИМЫМИ МУЛЬТИФАКТОРИАЛЬНЫМИ ЗАБОЛЕВАНИЯМИ, У НАСЕЛЕНИЯ ОМСКА

Е.А. Вильмс, Т.И. Долгих, Д.В. Турчанинов,

ГБОУ ВПО «Омская государственная медицинская академия»

Вильмс Елена Анатольевна - e-mail: Wilms26@yandex.ru

Проведено исследование распространенности полиморфизмов генов, ассоциированных с сердечно-сосудистой патологией, нарушениями липидного обмена и сахарным диабетом, у здорового населения Омска методом единичных полиморфизмов. Выявлены возрастные и половые группы риска по ряду значимых полиморфизмов. Установлена высокая распространенность в женской популяции полиморфизмов генов, ассоциированных с развитием сердечно сосудистых заболеваний: AGT (174Met), AGTR А1166С, PON (-107C/T); среди мужчин - нарушений липидного обмена LIPC-250(G>A).

Ключевые слова: однонуклеотидные полиморфизмы генов, сердечно-сосудистые заболевания, липидный обмен, сахарный диабет, Омская область.

The study of the prevalence of polymorphisms of genes associated with cardiovascular disease, lipid metabolism disorders and diabetes in a healthy population of Omsk by SNP (single nucleotide polymorphism). The age and sex groups at risk for a number of significant SNPs. The high prevalence in the female population of polymorphisms of genes associated with the development of cardiovascular disease: AGT (174Met), AGTR A1166C, PON (-107C / T); men - dyslipidemia LIPC-250 (G> A).

Key words: single nucleotide polymorphism cardiovascular disease,

lipid metabolism, diabetes, Omsk region

Актуальной задачей современной профилактической медицины является использование современных достижений молекулярной биологии и генетики для оценки риска развития и предупреждения массовых социально-значимых заболеваний. К числу таких мультифакториальных болезней относятся, в частности, сердечно-сосудистая патология, нарушения липидного обмена, сахарный диабет.

Данная патология у населения Омской области и г. Омска носит массовый характер и не имеет тенденции к снижению в динамике [1]. Население различных половозрастных групп экспонировано комплексом интенсивно действующих факторов риска [2].

Генетические факторы могут играть значительную роль в развитии заболеваний с алиментарными факторами риска,

РАЗДЕЛ VI

РАЗДЕЛ VI

IVK

МЕДИЦИНСКИЙ

АЛЬМАНАХ

в частности - сердечно-сосудистых, сахарного диабета, ожирения, поэтому в мировой практике современных научных исследований по фундаментальной медицине большое внимание уделяют молекулярно-генетическим методам анализа с идентификацией полиморфных участков (однонуклеотидных полиморфизмов генов, SNP - Single nucleotide polymorphism, с заменой одного нуклеотида на другой), повышающих риск развития заболеваний [3]. Любой отдельный полиморфизм гена объясняет 1-8% от общего риска заболевания в популяции, что может показаться незначительным, но аддитивный эффект нескольких таких факторов риска может составлять до 20-70% общего риска, обусловленного генетическими факторами [4].

Исследование генетических полиморфизмов позволяет получить важнейшую информацию о геноме каждого человека и учесть это при разработке индивидуальных рекомендаций (персонализированная профилактика). Данные о распространенности различных вариантов генов-кандидатов, ассоциированных с повышенным риском развития той или иной патологии, необходимы также и для реализации популяционной стратегии профилактики хронических неинфекционных заболеваний современного человека.

Цель работы: исследование распространенности полиморфизмов генов, ассоциированных с сердечно-сосудистой патологией, нарушениями липидного обмена и сахарным диабетом у населения Омска.

Материалы и методы

Полиморфизмы генов исследованы методом SNP (single nucleotide polymorphism - однонуклеотидные полиморфизмы) на тест-системах «SNP-экспресс» (НПФ «Литех»). ДНК выделена из лейкоцитов стабилизированной ЭДТА цельной крови реагентом «ДНК-экспресс-кровь» (НПФ «Литех») с последующей амплификацией на программируемом термостате с использованием комплекта реагентов «SNP-экспресс». Результаты электрофореза визуализированы при УФ-облучении с длиной волны 310 нм в трансиллюминаторе с помощью программы Vision Capt.

Контингент обследованных лиц включал 139 неродственных здоровых доноров (51 мужчина и 88 женщин), подобранных эмпирически в возрасте от 17 до 75 лет (в том числе 17-29 лет - 49 человек, 30-49 лет- 58 человек, 50-75 лет- 32 человека). Средний возраст обследуемых составил 38,3+1,24 лет, все они проживали в Омске или пригородном районе.

Определялись 8 генетических полиморфизмов, ассоциированных с риском развития мультифакторных заболеваний: сердечно-сосудистая патология - AGT (174Met), AGT (Met235Thr), AGTR А1166С, PON (-107C/T); нарушения липидного обмена - LPL (S44), LIPC 514T, LIPC-250(G>A); болезни обмена веществ (сахарный диабет) - PPARGC1A (G482S).

Средние значения качественных бинарных признаков приведены в тексте в виде M+m, где M - экстенсивный показатель (в %), m - стандартная ошибка показателя. Для оценки значимости расхождения частот аллелей, генотипов пробандов использован точный критерий Фишера. Во всех процедурах статистического анализа критический уровень значимости р принимался равным 0,05.

Результаты и их обсуждение

У обследованных лиц, проживающих на территории Омска, выявлена высокая частота полиморфизмов, ассоции-

рованных с сердечно-сосудистыми заболеваниями (ССЗ), нарушениями липидного обмена, сахарным диабетом II типа (таблица 1).

ТАБЛИЦА 1.

Распределение полиморфизмов генов, ассоциированных с развитием мультифакторных заболеваний у населения Омска (%)

Аллели Генотипы

Полиморфизм Вариант Распро- страненность, % Вариант Распро- страненность, %

AGT Thr 174 Met 174 Thr 174 Met 75,9+2,6 24,1+2,6 174 ТТ 174 ТМ 174 М/М 59,3+4,2 33,3+4,0 7,4+2,2

AGT Met235Thr 235 Met 235 Thr 69,6 +2,8 30,4+2,8 235 ММ 235 МТ 235 ТТ 48,6+4,2 42,1+4,2 9,3+2,5

AGTR А1166С 1166 А 1166 С 68,1+2,8 31,9+2,8 АА АС СС 54,0+4,2 28,3+3,8 17,7+3,2

LPL S447X C G 86,1+2,1 13,9+2,1 CC CG GG 76,2+3,6 19,8+3,4 4,0+1,7

LIPC-250 G>A G А 79,5+2,4 20,5+2,4 GG GA AA 68,3+5,9 23,8+5,4 7,9+3,4

LIPC C-514T 514 С 514 Т 80,2+2,4 19,8+2,4 CC CT TT 68,5+3,9 22,5+3,5 9,0+2,4

PPARG C1A Gly482Ser 482 Gly 482 Ser(A) 51,2+3,0 48,8+3,0 GG GS SS 29,3+3,9 43,9+4,2 26,8+3,8

PON (-107C/T) 107С 107 Т 80,7+2,4 19,3+2,4 CC CT TT 74,8+3,7 11,8+2,7 13,4+2,9

Полиморфизмы генов, связанных с синтезом ангио-тензиногена, часто используются в качестве генетических маркеров сердечно-сосудистых заболеваний. Наличие одного или двух Т аллелей ДОТ(235) приводит к существенному повышению ангиотензина II (АТ II), поэтому М235Т полиморфизм ассоциирован с артериальной гипертензией [5, 6]. Риск развития гипертонии у людей с генотипом Т/Т увеличивается в 1,3 раза. Заболевание встречается в 1,6 раза чаще у пациенток, имеющих генотип Т/Т и проходящих заместительную гормонотерапию (Дания). Показано также, что вариант 235Т является независимым фактором риска развития инфаркта миокарда и ишемической болезни сердца (ИБС) у европейцев, тогда как у японцев было показано отсутствие ассоциации данного полиморфизма с ИБС. Частота встречаемости в европейских популяциях генотипа 235Т - 15-20% [7].

У обследованных лиц выявлена высокая частота 235ТЬг полиморфизма гена ангиотензиногена ДОТ (30,4+2,8%) (таблица 1). Частоты аллелей М235/235Т в группах мужчин (64,0 и 36,0%) и женщин (73,4 и 26,6%), проживающих в Омске, статистически не различаются (рис.). Полученные результаты согласуются с литературными данными по распределению 235ТЬг полиморфизма ДОТ в популяциях европейцев Франции, Великобритании, США, Норвегии, Германии [6]. Высокая распространенность 235Т1пг полиморфизма гена ДОТ, ассоциированного с ССЗ, может обусловливать (в числе прочих причин) высокие показатели заболеваемости (34 случая на 100 обследованных по данным углубленных популяционных обследований) и смертности (760,6 на 100 тыс.) населения Омской области, а также негативную динамику этих показателей за последние 20 лет [1].

Полиморфизм Т174М гена ДСТ также является маркером АГ и повышенного риска развития инфаркта миокарда. Показана связь гипертонии с аллелью М и генотипом ТМ при полиморфизме Т174М. Частота встречаемости в европейских популяциях генотипа 174М - 10-15%. В общей выборке обследованных мутантная 174Met аллель ДСТ была обнаружена в 24,1 ±2,6% случаев, в группе женщин мутантная 174М аллель ДСТ 174 выявлялась статистически значимо чаще (26,6±5,0%; р=0,029). Это соответствует данным

Т.А. Барановой, [8], согласно которым распространенность артериальной гипертензии (АГ) среди женского населения Омской области в 1,6 раза выше, чем среди мужчин (р<0,005). Статистически значимых различий в распределении ТТ, ТМ, ММ генотипов ДвТ 174 в возрастных группах не выявлено.

АйШ А1166С 1.1РС250 ОА НРС 514Т АвТ МеСЗбТИг АСТ ТИг174Ме( 1-Р1- Э447Х РРАРвСИА С482Э РОМ (-107С/Г)

0,0 10,0 20,0 30,0 40,0 50,0 60,0 70,0

□ женщины

□ мужчины

РИС.

Распространенность «мутантных» аллелей исследованных генов у мужского и женского населения Омска

(на 100 обследованных).

Полиморфизм A1166C рецептора !-го типа ангиотензина-2. Замена нуклеотида аденина (А) на цитозин (С) в локусе 1166 (А1166С) сказывается на функциональной активности рецептора и реализации эффектов ангиотензина II. Вариант С полиморфизма Д1166С является кардиоваскулярным маркером [9].

Полиморфизмы ДСТМ могут служить маркерами хронически повышенного кровяного давления и других кардиоваскулярных осложнений. При наличии сахарного диабета вариант 1166С соответствует значительному повышению среднестатистического риска [10].

По данным некоторых авторов полиморфизм AGTR А1166С встречается у 30-40% представителей европейских популяций [7]. В нашем исследовании данный полиморфизм имел схожую распространенность у населения Омска - 31,9±2,8%. У женщин распространенность мутантной аллели 1166С была значимо выше, чем у мужчин (38,2±5,5% и 22,2±6,2% соответственно; р=0,008) (рис.). В возрастной «группе риска» (30-49 лет) более половины обследованных лиц имели генотип СС или АС (таблица 2).

Полиморфизм параоксоназы PON1. Мутации в гене Р01\11(-107С->Т) приводят к его низкой продуктивности (экспрессии) и используются как маркеры риска сердечнососудистых заболеваний и атеросклеротических поражений. Частота обнаружения вариантов -107С->Т в европейских популяциях составляет 40-45% [7]. «Нормальная» 107С

аллель гена Р0\1 у жителей Омска выявлялась в 4 раза чаще полиморфной 107Т (80,7±2,4% и 19,3±2,4% соответственно). Выявлены также гендерные различия в распределении С107/107Т аллелей: вариант 107Т в женской популяции встречался статистически значимо чаще, чем у мужчин (25,0±4,9% и 10,6±4,6% соответственно; р=0,004).

ТАБЛИЦА 2.

Частота встречаемости мутантных аллелей исследуемых генов у населения Омской области на 100 обследованных

17-29 лет 30-49 лет 50 лет и старше

Р,% ±т Р,% ±т Р,% ±т

РОЫ (-107С/Т) 14,3 5,3 25 6,03 14,3 7,9

РРАРСС1А С482Б 59,4 7,4 41,7 6,9 40 11,1

1_Р1. Б447Х 10,8 4,7 23,7 5,92 3,8 4,3

АСТ Т1|г174Ме1 21,4 6,2 32,5 6,52 15,4 8,2

АСТ Ме1235Т1|Г 25,6 6,6 40 6,82 23,1 9,5

НРС 514Т 22,1 6,3 18,2 5,37 20,8 9,2

ЦРС250 С>А 21,9 6,3 21,1 5,68 16,7 8,4

АСТРА1166С 27,9 6,8 41,7 6,87 18,2 8,7

Липопротеиновая липаза (LPL) - многофункциональный белок, вовлеченный в различные аспекты метаболизма липопротеинов и липидов. Фермент располагается на люмене васкулярного эндотелия и катализирует гидролиз фосфолипидов и триглицеридов хиломикронов и ЛПОНП. Липопротеиновая липаза играет важную роль в формировании ЛПВП. В дополнение к гидролизу триглицеридов плазмы до диглицеридов 1_Р1_ также участвует во взаимодействии липопротеинов с клеточными рецепторами. Вариант полиморфизма Б447Х (преждевременный стоп-кодон) ассоциирован с благоприятными изменениями липидного спектра: пониженным уровнем триглицеридов и повышенным уровнем холестерина ЛПВП. Распространенность варианта составляет 5-10% [7].

Данная мутация признана «протективной», среди населения Омска была распространена в меньшей степени (13,9±2,1%). Различий между мужчинами и женщинами не было выявлено.

Мутации печеночной липазы (НРС С-514Т, НРС-250 G> Д) связывают с развитием инсулинорезистентности, повышенными уровнями инсулина, липопротеидов низкой и очень низкой плотности. Полиморфизм -250 G> Д влияет на уровень триглицеридов и холестерина крови.

Полиморфизм НРС-250 G>A характеризовался значительным преобладанием генотипов GA и АА среди лиц мужского пола, аллель -250А встречалась у них с частотой 31,4±4,6% (р=0,0027). В целом распространенность варианта -250Д была близка к средней в популяции 19,8±3,6% (по данным литературы - 20-25%).

Полиморфизм 1_1РС С-514Т чаще был представлен генотипом СС (68,5±3,9%). Варианты СТ и ТТ встречались реже (22,5±3,5% и 9,0±2,4% соответственно).

Мутация коактиватора 1а Gly482Ser гена

PPARGC1. Распространенность аллели Б, ассоциированной с повышенным риском развития СД, АГ, избыточной массы тела в популяциях европейского типа (Франция, Австрия), составляет 12-20%, в китайской - 43%, в японской - 42%, у кавказских народов - 38% [11] .

У населения Омска распространенность аллели Б оказалась достаточно высокой - 53,3±4,9%. При сравнении

РАЗДЕЛ VI

РАЗДЕЛ VI

IVK

МЕДИЦИНСКИЙ

АЛЬМАНАХ

частот выявления 482Gly и 482Ser аллелей гена PPARGC1 у мужчин и женщин различий не наблюдалось. Однако проведенный анализ по возрастным группам показал, что частоты аллелей 482Gly и 482Ser в возрастной группе 17-29 лет

(40,6 и 59,4+5,0% соответственно) были наиболее высокими в сравнении со старшими возрастными группами: 30-49 лет (p=0,036) и 50 и старше (p=0,042). Установленные различия требуют пристального внимания к идентификации факторов риска, действующих в группе лиц молодого возраста.

Выводы

1. Впервые проведено исследование распространенности полиморфизмов генов у населения Омского региона, показавшее высокую частоту обнаружения их вариантов ассоциированных с повышенным риском развития сердечно-сосудистых заболеваний, нарушений липидного обмена, сахарного диабета, что вносит вклад в формирование высокой заболеваемости населения указанными патологиями в Омске.

2. Обнаружена более высокая распространенность в женской популяции полиморфизмов генов, ассоциированных с развитием сердечно-сосудистых заболеваний: AGT (174Met), AGTR А1166С, PON (-107C/T); среди мужчин - нарушений липидного обмена LIPC-250(G>A).

3. Выявлены возрастные группы риска по ряду значимых полиморфизмов: PPARGC1A (G482S) - 17-29 лет, AGT (Met235Thr), AGTR А1166С - 30-49 лет.

4. Полученная в исследовании информация о распростра-

ненности полиморфизмов генов, ассоциированных с развитием массовых социально-значимых заболеваний, у населения Омска необходимо учитывать при разработке комплекса адекватных профилактических мероприятий. [И

ЛИТЕРАТУРА

1. Турчанинов Д.В. Питание и здоровье сельского населения Сибири в современных социально-экономических условиях. Автореферат дисс. ... докт. мед. наук. Омск. 2009. 48 с.

2. Шупина М.И., Турчанинов Д.В. Распространенность артериальной гипертензии и сердечно-сосудистых факторов риска у лиц молодого возраста. Сибирский медицинский журнал. Томск. 2011. Т. 26. № 3. Вып. 2. С. 152-156.

3. Тугуз А.Р., Агаджанян Н.А., Лысенков С.П. и др. Частоты Met235thr, Thr174met полиморфизмов гена ангитензиногена (Agt) и A1166c аллели рецептора I типа гена ангитензиногена-2 (agt2r1) в этнических группах населения г. Майкопа (Республика Адыгея). Современные проблемы науки и образования. 2011. № 3. URL: www.science-education.ru/97-4693 (дата обращения: 14.05.2012).

4. HuGE Navigator [Электронный ресурс]. URL: http://www.hugenavigator. net/HuGENavigator/ geneProspectorStartPage.do (дата обращения: 5.10.10).

5. Kanat О. et al. Asian Cardiovasc. Thorac. Ann. 2005. № 13. P. 153-156.

6. Sethi A.A. et al. Angiotensinogen single nucleotide polymorphisms, elevated blood pressure, and risk of cardiovascular disease. Hypertension. 2003. № 6. P. 102-111.

7. Руководство по применению «SNP- экспресс». М.: Литех, 2010. 38 с.

8. Баранова Т.А. Гигиеническое и эпидемиологическое обоснование системы профилактики селенодефицитных состояний у населения Омской области Автореф. дисс. . канд. мед. наук. Омск. 2008. 22 с.

9. Пузырев В.П., Степанов В.А., Макеева О.А. Синтропные гены болезней сердечно-сосудистого континуума. Медицинская генетика. 2009. № 3. С. 31-48.

10. Weir M.R. Opportunities for cardiovascular risk reduction with angiotensin II receptor blockers. Current Hypertension Reports. 2002. № 4. P. 333-335.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

11. Chen S. et al. Peroxisome proliferator-activated receptor-gamma coactivator-1alpha polymorphism is not associated with essential hypertension and type 2 diabetes mellitus in Chinese population. Hypertens Res. 2004. № 27 (11). Р. 813-20.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.