CC BY
44
Применение молекулярно-генетических методов для характеристики клинических изолятов бруцеллезного микроба
Л.И. Шакирова (delusion59@mail.ru), Л.В. Ляпустина (larisavl@mail.ru), С.И. Головнева (snipchi@mail.stv.ru), Н.М. Швецова (snipchi@mail.stv.ru)
ФКУЗ «Ставропольский противочумный институт» Роспотребнадзора
Резюме
Выполнено методом MLVA-14 типирование 24 изолятов бруцелл, выделенных от больных людей на территории Республики Дагестан и Республики Калмыкия в 2012 - 2013 годах. Произведена оценка корреляции полученных результатов c классической схемой идентификации и дифференциации бруцелл. Определено распределение генотипов бруцелл на данных территориях. Ключевые слова: возбудитель бруцеллеза, лабораторная диагностика, MLVA-типирование
Molecular and Genetic Methods Application for the Brucel^ Clinical Isolates Characteristic
L.I. Shakirova (delusion59@mail.ru), L.V. Lyapustina (larisavl@mail.ru), S.I. Golovneva (snipchi@mail.stv.ru), N.M. Shvetsova (snipchi@mail.stv.ru)
Federal Government Institution of Healthe «Stavropol Plague Control Research Institute» of Federal Service on Customers' Rights
Protection and Human Well-Being Surveillance
Abstract
Achieved typing of 24 isolates of Brucella by MLVA-14, isolated from human patients in the territories of the Republic of Dagestan and Kalmykia Republic in 2012 - 2013. The evaluation of the correlation of the results with classical scheme of identification and differentiation of Brucella. The distribution of genotypes of Brucella in these areas is defined. Key words: Brucella agent, laboratory diagnostics, MLVA-typing
Введение
Бруцеллез относится к зоонозным инфекционным болезням, при которых основной источник заражения людей - больные сельскохозяйственные животные [1].
Лабораторная диагностика бруцеллеза предусматривает индикацию бруцелл в объектах окружающей среды и в патологическом материале; выделение, идентификацию и типирование возбудителя; определение специфических антител и антигенов в сыворотке крови больных и лиц, подозрительных на заражение бруцеллезом [2, 3]. Несмотря на то что бактериологическое подтверждение при лабораторной диагностике бруцеллеза не является обязательным и окончательный диагноз может быть поставлен по совокупности клинико-эпидеми-ологических данных, результатов серологических исследований и аллергодиагностики, изоляция возбудителя из образцов клинического материала обеспечивает возможность расследования вспышек бруцеллезной инфекции.
Применяемая для типирования штаммов бруцелл традиционная схема оценки фенотипических признаков позволяет дифференцировать штам-мы-изоляты до уровня вида биовара и отличается трудоемкостью, длительностью, вероятностью неспецифических результатов [4 - 7]. Это определяет необходимость внедрения в систему лабораторной
диагностики более совершенных методов идентификации и характеристики клинических изолятов бруцелл.
В настоящее время в комплексе мер по лабораторной диагностике, расследованию вспышек инфекционных болезней, проведению противоэпидемических мероприятий возрастающее значение приобретают методы, позволяющие осуществлять молекулярно-генетическую характеристику выделяемых культур на уровне штаммов [8 - 12]. Одним из методов, который обеспечивает решение поставленной задачи, является VNTR (Variant Number Tandem Repeat)-типирование, с успехом используемое для характеристики микроорганизмов с высоким уровнем гомологии ДНК [(9, 13], к которым относится и бруцеллезный микроб [14].
Цель работы - проведение молекулярно-гене-тического типирования изолятов бруцелл, циркулирующих в южных регионах Российской Федерации, оценка корреляции полученных результатов генотипирования c классической схемой идентификации и дифференциации бруцелл, а также распределения и миграции генотипов бруцелл на рассматриваемых территориях.
Материалы и методы
В работе использовали 24 клинических изолята возбудителя бруцеллеза, выделенные на террито-
рии Республики Калмыкия и Республики Дагестан в 2012 - 2013 годах (табл. 1), а также пять референтных штаммов бруцелл видов B. melitensis и B. abortus из коллекции Ставропольского противочумного института.
Фенотипические свойства изолятов изучали традиционными методами [15].
Выделение ДНК проводили по методике R. Boom и соавт. [8] с использованием сорбентного набора на основе диоксида кремния.
Праймеры [5], используемые в работе (табл. 2), -собственного изготовления (прибор ДНК ASM-800 «БИОССЕТ», Россия).
Амплификацию проводили отдельно для каждого локуса. Реакционная смесь (общий объем - 25 мкл) содержала: ^PCR-буфер, 1,76 мМ каждого из dNTPs, 1,0 ед. Taq-полимеразы,
Таблица 1.
Характеристика штаммов бруцеллезного микроба
по 10 pmol каждого праймера и 5 - 30 нг ДНК каждого штамма.
Для амплификации использовали термо-циклер Veriti 96-well Thermal Cycler (Applied Biosystems, США). В качестве положительных контролей применяли по 10 нг ДНК референтных штаммов бруцелл.
Визуализацию продуктов реакции осуществляли методом электрофореза в 3% агарозном геле с добавлением этидиума бромида. Размеры ампли-конов сравнивали с ДНК-маркером 100 bp Ladder DNA marker (Axygen, США), ампликонами контрольных референтных штаммов с известными длинами, а также ампликонами образцов, длины которых предварительно были измерены с помощью станции автоматического гель-электрофореза Experion Automated Electrophoresis Station (BioRad, США).
номер изолята Год выделения регион выделения
республика Дагестан
C-533 Тарумовский р-н, с. Кочубей
C-534 Бабаюртовский р-н, кутан М. Горького
C-535 Ногайский р-н, с. Кара-су
C-536 Цумадинский р-н, с. Н. Гаквари
С-538 Шамильский р-н, с. Ассаб
С-539 Шамильский р-н, с. Ассаб
C-540 Акушинский р-н, с. Усиша
С-541 Карабудахкентский р-н, пос. Манас
С-542 2012 Гергебельский р-н, с. Гергебель
С-543 Левашинский р-н, с. Арада-Чугли
С-544 Левашинский р-н, с. Арада-Чугли
С-545 г Каспийск
С-546 г Каспийск
С-547 Карабудахкентский р-н, с. Карабудахкент
C-554 Тарумовский р-н, с. Новодмитревка
C-555 Шамильский р-н, с. Мочох
C-556 Хунзахский р-н, с. Ората
C-557 Хунзахский р-н, с. Ората
C-558 2013 Лакский р-н, с. Камахал
C-559 Левашинский р-н, с. Уллуая
республика Калмыкия
С-550 Целинный р-н, пос. Аршан
С-551 2012 Ики-Бурульский р-н, пос. Оргакин
С-552 Малодербетовский р-н, пос. Малые Дербеты
C-553 Черноземельский р-н, пос. Комсомольский
Таблица 2.
Праймеры, используемые для амплификации VNTR-локусов
№ VNTR* Название локуса Последовательность праймеров
1 BRU1543_8bp_152bp_2u Bruce04 ctgacgaagggaaggcaataag
cgatctggagattatcgggaag
2 BRU1322_134bp_408bp_3u Bruce06 atgggatgtggtagggtaatcg
gcgtgacaatcgactttttgtc
3 BRU1250_8bp_158bp_5u Bruce07 gctgacggggaagaacatctat
accctttttcagtcaaggcaaa
4 BRU1134_18bp_348bp_4u Bruce08 attattcgcaggctcgtgattc
acagaaggttttccagctcgtc
5 BRU588_8bp_156bp_7u Bruce09 gcggattcgttcttcagttatc
gggagtatgttttggttgtacatag
6 BRU211_63bp_257bp_2u Bruce11 ctgttgatctgaccttgcaacc
ccagacaacaacctacgtcctg
7 BRU73_15bp_392bp_13u Bruce12 cggtaaatcaattgtcccatga
gcccaagttcaacaggagtttc
8 BRU548_8bp_152bp_3u Bruce16 acgggagtttttgttgctcaat
ggccatgtttccgttgatttat
9 BRU339_8bp_146bp_5u Bruce18 tatgttagggcaatagggcagt
gatggttgagagcattgtgaag
10 BRU329_8bp_148bp_6u Bruce21 ctcatgcgcaaccaaaaca
gatctcgtggtcgataatctcatt
11 BRU424_125bp_539bp_4u Bruce42 catcgcctcaactataccgtca
accgcaaaatttacgcatcg
12 BRU379_12bp_182bp_2u Bruce43 tctcaagcccgatatggagaat
tattttccgcctgcccataaac
13 BRU233_18bp_151bp_3u Bruce45 atccttgcctctccctaccag
cgggtaaatatcaatggcttgg
14 BRU2066_40bp_273bp_3u Bruce55 tcaggctgtttcgtcatgtctt
aatctggcgttcgagttgttct
Примечание: *Наименование, включающее размер повторяющегося элемента, длину продукта ПЦР и число копий повторов в штамме B. melitensis 16M.
На основании данных о длинах ампликонов была построена матрица расстояний в евклидовом пространстве, которая легла в основу данных кластерного анализа по методу «ближайшего соседа». Вычисления проводили при помощи языка статистической обработки R. Визуализацию результатов в виде филогенетического дерева получили в среде Rstudio.
Результаты и обсуждение
Изначально все анализируемые клинические изоляты бруцелл были охарактеризованы в соответствии с традиционной схемой типирования
[3 - 4]. Культуры имели типичные тинкториаль-ные, морфологические и культуральные свойства и при проведении межвидовой и внутривидовой дифференциации были отнесены к двум видам
- B. melitensis и B. abortus. Так, из 18 штаммов бруцеллезного микроба, выделенных в 2012 году в Республике Дагестан, три штамма были отнесены к I биовару вида B. melitensis, 15 штаммов
- к III биовару вида B. melitensis, два штамма, выделенные на территории Республики Калмыкия в 2012 году, - к III биовару вида B. abortus, два -к III биовару вида B. melitensis.
Рисунок 1.
Филогенетический анализ штаммов B. melitensis и B. abortus, выделенных на территории Республики Дагестан и Республики Калмыкия по четырнадцати VNTR-локусам
Респ. Дагестан Респ. Дагестан Респ. Дагестан Респ. Д агестан
Респ. Дагестан Респ. Д агестан Респ. Дагестан
Респ. Дагестан Респ. Д агестан Респ. Д агестан Респ. Д агестан Респ. Дагестан Респ. Дагестан Респ. Д.аг ее тан Респ. Д агестан Респ. Д агестан Респ. Д агестан Респ. Д агестан Респ. Калмыкия Респ. Калмыкия Респ. Дагестан Респ. Дагестан
Респ. Калмыкия РеСП. K-äJETiTbllS-LI
с Ората„ Хунзахскнй район c^nse с Opata„ Хунзаяский район e«? с Каыахал, Лакский район сие •С. Уснша, Акушннсклй район с-Ф-ю 1С м
с. Уллуая, Левавзн некий район с^м с. Мочоя. Шамнлъский район С-5М с. НоЕодмитрсека, Тарумовский район с-ам
с Аесаб. Ш&ыильскнй район с. Ассаб. Шаынльскнй район с. Н. Гамеарй. Цу мадннекий район е.. Кара-су. Ногайский район с. Гсргеблпь, ГергебеяьекиЙ район г. Каспийск
пос. Мамае. Карабудаякентскнй район г Каспийск
с. Карабудажент, Карабудашентскнй район с. Арада-Чуглн, Л^вашн некий район с Арддз-Чуглн, Леваши некий район пос.Малые Дгрбеты* Малодербетовский район пос. Комсомольский, Черноземельскнй район е. Кочубйй, Таруыовскнн район кутан М Горького, Бабаюртовпгмн район
п:. Аршан. Целинный район Оргакик/Жки-Бурульский район
i ГНЁП
C-i» иа t.SM (SM
с«
C.Ü4B Ь«1
ЩШ
С SJ7
С.МЗ C«
(-яг
СИЗ CMS (-5М
5Л4 tulya (JSC С-591
н
>1 ft
h
В 2013 году в Референс-центр поступили две культуры возбудителя бруцеллеза, выделенные на территории Республики Дагестан, которые при проведении межвидовой дифференциации отнесены к III биовару вида B. melitensis.
Таким образом, по полученным данным следует отметить, что на территории указанных республик продолжают циркулировать штаммы бруцеллезного микроба, которые в основном представлены видом B. melitensis (I и III биовары), и впервые за долгие годы изоляции культур выделены штаммы вида B. abortus. В последний раз культуры данного вида выделялись на указанной территории в 2002 году. Для более детальной характеристики изучаемых штаммов было проведено MLVA (Multiple Loci VNTR Analysis)-типирование. Выбранная нами схема включала анализ 14 VNTR-локусов штаммов бруцелл, содержащих тандемные повторы от 8 до 134 п. н. [5, 11]. Для оценки воспроизводимости результатов и доказательства соответствия схемы типирования MLVA-14 фенотипическим методам идентификации в работе использовали данные MLVA-профилей референтных штаммов бруцелл с известными генотипами: B. melitensis 16M (биовар I), B. melitensis 63/9 (био-вар II), B. melitensis Ether 706 (биовар III), B. abortus 544 (биовар I), B. abortus Tulya (биовар III).
Анализ полученной дендрограммы (рис. 1) показал, что 24 изолята бруцелл формировали 14 генотипов.
Штаммы, которые были отнесены к III биовару вида B. melitensis (18 штаммов), группировались в общий кластер, которому по генетическому родству соответствовал референтный штамм указанного биовара B. melitensis Ether 706.
Штаммы I биовара вида B. melitensis (четыре штамма) образовали один кластер совместно с референтным штаммом B. melitensis 16M (I биовар).
Штаммы III биовара вида B. abortus (два штамма) формировали общий, но удаленный от других кластер совместно с референтным штаммом B. abortus Tulya (III биовар).
В результате проведенного анализа было показано, что идентичными по MLVA-генотипу являются изоляты общего географического происхождения. Так, штаммы B. melitensis С-552 и С-553, изолированные в Республике Калмыкия в 2012 году, сформировали отдельную подгруппу в пределах общего кластера, образованного штаммами III биовара вида B. melitensis.
Штаммы, выделенные в Республике Дагестан в 2012 году и отнесенные к III биовару вида B. melitensis, были объединены внутри общего кластера в подгруппы, которые включали культуры, изолированные в одних географических точках: штаммы B. melitensis С-556 и С-557 - в Хунзахском районе (с. Орота), B. melitensis С-543 и С-544 - в Левашинском районе (с. Арада-Чугли), B. melitensis
С-545 и С-546 - в г. Каспийске, В. melitensis С-538 и С-539 - в Шамильском районе (с. Ассаб).
Штаммы В. melitensis С-545 и С-546, изолированные в г. Каспийске Республики Дагестан, также объединены в одну подгруппу внутри кластера, однако в эту же подгруппу вошел штамм В. melitensis С-541, выделенный в пос. Манас Карабудахкент-ского района Республики Дагестан, что может говорить в пользу вероятного единого источника заражения.
Регион Северного Кавказа на протяжении последних 50 лет неблагополучен по бруцеллезной инфекции, формируя основной уровень заболеваемости в Российской Федерации по данной нозологической форме [15, 16]. В связи с этим немаловажным в обеспечении эффективного санитарно-эпидемиологического надзора за бруцеллезом является мониторинг «миграции» бруцеллезного микроба на территории Северо-Кавказского федерального округа, а также граничащих с ним регионов.
Выводы
1. Результаты проведенного анализа показали,
что использование классической схемы идентификации и дифференциации бруцелл позво-
ляет оценивать свойства штаммов-изолятов до уровня вида и биовара, что недостаточно для проведения ретроспективного эпидемиологического расследования. В то же время апробированная схема MLVA-типирования на основе анализа 14 VNTR-локусов в геноме бруцеллезного микроба продемонстрировала высокие дискриминационные возможности, позволяющие не только проводить определение видов и биоваров изучаемых штаммов, но и выделять соответствующие генотипы.
2. Показано, что совокупность значений длин 14 локусов у бруцелл является индивидуальным показателем для отдельного штамма или группы штаммов, поэтому с высокой точностью можно определить происхождение штамма и источник заражения.
3. Использование схемы MLVA-14 для генотипиро-вания бруцелл с высокой степенью достоверности продемонстрировало возможность характеристики возбудителя бруцеллеза на штаммовом уровне, что делает целесообразным ее практическое применение как метод типирования штаммов изолятов бруцелл в качестве дополнения традиционной схемы эпидемиологического анализа. ш
Литература
1. Вершилова П.А. Бруцеллез. Москва: Медицина; 1972.
2. Порядок организации и проведения лабораторной диагностики бруцеллеза для лабораторий территориального, регионального и федерального уровней: Методические указания МУ 4.2.3010-12. Москва; 2011.
3. Профилактика и лабораторная диагностика бруцеллеза людей: Методические указания МУ 3.1.7.1189-03. Москва; 2003: 59.
4. Alton G.G., Jones L.M., Angus R.D., Verger J.M. Techniques for the brucellosis laboratory. Paris; 1988: 54 - 58.
5. Le F^che P., Jacques I., Grayon M., Al-Dahouk A., Bouchon P, Denoeud F. et al. Evaluation and selection of tandem repeat loci for a Brucella MLVA typing assay. BMC Microbiol. 2006; 6: 9.
6. Whatmore A.M. Current understanding of the genetic diversity of Brucella, an expanding genus of zoonotic pathogens. Infect. Genet. Evolut. 2009; 9 (9): 1168 -1184.
7. Whatmore A.M., Shankster S., Perrett L.L., Murphy T.J., Brew S.D., Thirlwall R.E. et al. Identification and сharacterization of variable-number tandem-repeat markers for typing of Brucella spp. J. Clin. Microbiol. 2006; 44 (6): 1982 - 1993.
8. Boom R., Sol C.J.A., Salimans M.M.M., Jansen C.L., Wertheim van Dillen P.M.E. Rapid and simple method for purification of nucleic acids. J. Clin. Microbiol.
1990; 28 (3): 495 - 503.
9. Farlow J., Smith K.L., Wong J., Abrams M., Lytle M., Keim P. Francisella tularensis strain typing using multiple-locus, variable-number tandem repeat analysis. J. Clin. Microbiol. 2001; 39 (9): 3186 - 3192.
10. Hoffmaster A.R., Fitzgerald C.C., Ribot E. еще 3 автора et al. Molecular subtyping of Bacillus anthracis and the 2001 bioterrorism-associated anthrax outbreak, United States. A. Emerg. Infect. Dis. 2002; 8 (10): 1111 - 1116.
11. Lindstedt B.A. Multiple-locus variable number tandem repeats analysis for genetic fingerprinting of pathogenic bacteria. Electrophoresis. 2005; 26 (13): 2567 - 2582.
12. Vergnaud G., Pourcel С. Multiple Locus VNTR (Variable Number of Tandem Repeat) Analysis (MLVA). In: Molecular identification, systematics and population structure of prokaryotes. Е. Stackebrandt, еd. Berlin: Springer-Verlag; 2006: 83 - 104.
13. Adair D.M., Worsham PL., Hill K.K., Klevytska A.M., Jackson P.J., Friedlander A.M., Keim P. Diversity in a variable-number tandem repeat from Yersinia pestis. J. Clin. Microbiol. 2000; 38: 1516 - 1519.
14. Verger J.M., Grimont F., Grimont P.A.D., Grayon M. Brucella, a monospecific genus as shown by deoxyribonucleic acid hybridization. Int. J. Syst. Bacteriol. 1985; 35 (3): 292 - 295.
15. Лямкин Г.И. Бруцеллез в регионе Северного Кавказа (Эпидемиология, природная очаговость, лабораторная диагностика): Автореф. дис. ... д-ра. мед. наук. Ставрополь; 1995.
16. Цирельсон Л.Е., Желудков М.М., Кулаков Ю.К., Хадарцев О.С., Скляров О.Д. Эпидемические проявления бруцеллеза в различных эпизоотических очагах. Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. 2012; 4: 18 - 22.
References
1. Vershilova RA. Brucellosis. Moscow: Medicine; 1972 (in Russian).
2. The organization and conduct of laboratory diagnosis of brucellosis laboratory territorial, regional and federal levels: guidelines 4.2.3010-12 MOU. Moscow; 2011 (in Russian).
3. Prevention and laboratory diagnosis of brucellosis people: guidelines 3.1.7.1189-03 MOU. Moscow; 2003: 59 (in Russian).
4. Alton G.G., Jones L.M., Angus R.D., Verger J.M. Techniques for the brucellosis laboratory. Paris; 1988: 54 - 58.
5. Le Fleche R., Jacques I., Grayon M., Al-Dahouk A., Bouchon R, Denoeud F. et al. Evaluation and selection of tandem repeat loci for a Brucella MLVA typing assay. BMC Microbiol. 2006; 6: 9.
6. Whatmore A.M. Current understanding of the genetic diversity of Brucella, an expanding genus of zoonotic pathogens. Infect. Genet. Evolut. 2009; 9 (9): 1168 -1184.
7. Whatmore A.M., Shankster S., Rerrett L.L., Murphy T.J., Brew S.D., Thirlwall R.E. et al. Identification and characterization of variable-number tandem-repeat markers for typing of Brucella spp. J. Clin. Microbiol. 2006; 44 (6): 1982 - 1993.
8. Boom R., Sol C.J.A., Salimans M.M.M., Jansen C.L., Wertheim van Dillen P.M.E. Rapid and simple method for purification of nucleic acids. J. Clin. Microbiol.
1990; 28 (3): 495 - 503.
9. Farlow J., Smith K.L., Wong J., Abrams M., Lytle M., Keim R. Francisella tularensis strain typing using multiple-locus, variable-number tandem repeat analysis. J. Clin. Microbiol. 2001; 39 (9): 3186 - 3192.
10. Hoffmaster A.R., Fitzgerald C.C., Ribot E. et al. Molecular subtyping of Bacillus anthracis and the 2001 bioterrorism-associated anthrax outbreak, United States. A. Emerg. Infect. Dis. 2002; 8 (10): 1111 - 1116.
11. Lindstedt, B. A. Multiple-locus variable number tandem repeats analysis for genetic fingerprinting of pathogenic bacteria. Electrophoresis. 2005; 26 (13): 2567 - 2582.
12. Vergnaud G., Rourcel C. Multiple Locus VNTR (Variable Number of Tandem Repeat) Analysis (MLVA). In. Molecular Identification, Systematics and Ropulation Structure of Rrokaryotes, E. Stackebrandt, ed. Springer-Verlag; 2006: 83 - 104.
13. Adair D.M., Worsham RL., Hill K.K., Klevytska A.M., Jackson RJ., Friedlander A.M., Keim R. Diversity in a variable-number tandem repeat from Yersinia pestis. J. Clin. Microbiol. 2000; 38: 1516 - 1519.
14. Verger J.M., Grimont F., Grimont R.A.D., Grayon M. Brucella, a monospecific genus as shown by deoxyribonucleic acid hybridization. Int. J. Syst. Bacteriol. 1985; 35 (3): 292 - 295.
15. Lyamkin G.I. Brucellosis in the North Caucasus (Epidemiology, natural foci, laboratory diagnostics): RhD of med. sci. dis. Sciences. Stavropol; 1995 (in Russian).
16. Tsirel'son L.E., Zheludkov M.M., Kulakov Yu.K., Khadartsev O.S., Sklyarov O.D. Epidemic manifestations of brucellosis in different epizootic outbreaks. Epidemiology and Vaccine. 2012; 4: 18 - 22 (in Russian).
Эпидемиологические особенности внебольничной пневмонии в Свердловской области
В.В. Романенко (Romanenko_VV@66.rospotrebnadzor.ru), А.В. Сомова
ФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Свердловской области», г. Екатеринбург
Резюме
Внебольничные пневмонии остаются одной из ведущих причин госпитализации и смертности, становясь проблемой здравоохранения. В ходе работы изучены эпидемиологические особенности распространения внебольничной пневмонии среди населения Свердловской области в 2002 - 2012 годах. Выявлены основные возрастные и социальные группы риска по заболеваемости, характер течения эпидемического процесса, внутригодовое распределение, структура заболеваемости по степени тяжести. Полученные результаты этиологической расшифровки и анализ международного опыта могут послужить основой для принятия решения о целесообразности внедрения противопневмококковой вакцинации как одного из вариантов профилактики и снижения заболеваемости внебольничными пневмониями.
Ключевые слова: внебольничные пневмонии, эпидемиологические особенности, вакцинопрофилактика
Epidemiologic Characteristics of Community-Acquired Pneumonia in Sverdlovsk Region
V.V. Romanenko (Romanenko_VV@66.rospotrebnadzor.ru), A.V. Somova
Federal Budget-funded Institution of Public Health Center of Epidemiology and Hygiene of Sverdlovsk region, Yekaterinburg Abstract
Community-acquired pneumonia (CAP) is one of the major causes of hospitalization and mortality and thus public health burden. Epidemiological characteristics of CAP, including incidence, prevalence, causality and outcomes, in 2002 - 2012 in Sverdlovsk region have been investigated. Leading social, age and medical risk groups for CAP have been determined along with description of epidemiology process peculiarities, seasonality and disease severity. Obtained results of CAP etiology investigation and international data analysis have formed the rational for the decision on implementation of anti-pneumococcal vaccination as a preventive measure for community-acquired pneumonia to decrease morbidity and mortality. Key words: community-acquired pneumonia, epidemiology, vaccination
Введение
Внебольничная пневмония - острое, сопровождающееся симптомами инфекции нижних отделов дыхательных путей и рентгенологическими признаками «свежих» очагово-инфильтративных изменений в легких при отсутствии очевидной диагностической альтернативы заболевание, возникшее во внебольничных условиях (т. е. вне стационара), или диагностированное в первые 48 часов от момента госпитализации, или развившееся у пациента, не находившегося в доме для престарелых, отделении длительного медицинского наблюдения 14 и более суток [1].
Внебольничные пневмонии остаются одной из ведущих причин госпитализации и смертности, явля-
ясь постоянной проблемой здравоохранения как в индустриально развитых, так и в развивающихся странах. По данным ВОЗ, во всем мире ежегодно регистрируется около 155 млн случаев внебольнич-ной пневмонии и примерно 1,4 млн смертельных исходов у детей в возрасте до пяти лет - 18% всех случаев смерти детей этого возраста [2].
Внебольничные пневмонии - актуальная проблем и для здравоохранения Свердловской области. Их доля в структуре инфекционных заболеваний без гриппа и ОРВИ достигает 17%. Летальность при пневмониях составляет в среднем 5%, а среди лиц пожилого возраста - 15 - 20%. Пневмония занимает 4-е место в структуре причин смертности [3].
