CC BY
0
РОССИЙСКИЙ Willi НШОШЕСКШ 11VII ШГРЕСС 2D23 АЛ I II
Онкоурология
АВТОМАТИЧЕСКАЯ СЕГМЕНТАЦИЯ НОВООБРАЗОВАНИЙ ПАРЕНХИМЫ ПОЧКИ ПО ДАННЫМ МУЛЬТИСПИРАЛЬНОЙ КОМПЬЮТЕРНОЙ ТОМОГРАФИИ С ПОМОЩЬЮ СВЕРТОЧНЫХ НЕЙРОННЫХ СЕТЕЙ (ПИЛОТНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ)
А.Д. Гуркина, Е.С. Сирота, П.В. Глыбочко, Д.В. Бутнару, Ю Г. Аляев, М.М. Черненький, И.М. Черненький, Д.Н. Фиев, А.В. Проскура, В.В. Козлов, А.Р. Аджиев, А.А. Измайлова, И.П. Саркисьян, М.Ю. Алексеева
Место работы: ФГАОУ ВО Первый МГМУ имени И.М. Сеченова Минздрава России (Сеченовский Университет), Москва, Россия Эл. почта: taniaandnastia@mail.ru
Цель: Оценить различия в автоматической сегментации опухоли с помощью модели искусственного интеллекта обученной на публичном датасете KiTS21 в наблюдениях различных морфологических видов новообразований паренхимы почки по данным мультиспиральной компьютерной томографии (МСКТ).
Материалы и методы: Ретроспективно использовали DICOM данные 4 фаз МСКТ с контрастированием 52 пациента от 22 до 86 лет находившихся на хирургическом лечении в Институте урологии и репродуктивного здоровья человека за период с 2011 по 2021 год. Все пациенты разделены на 4 группы в зависимости от морфологической принадлежности: светлоклеточный почечно-клеточ-ный рак (ПКР) — 13; папиллярный ПКР — 17; хромофобный ПКР — 3, онкоцитома — 19. Для каждой группы рассчитывались чувствительность, специфичность, положительный (PPV), метрика Дайса и доверительны е интервалы (ДИ). Результаты: Нами составлена статистика доступной ней-росетевой модели на сегодняшний день на предмет локализации почки. Проанализировав данные мультиспиральной компьютерной томографии с контрастированием 52 пациентов с возрастным диапазоном от 22 до 86 лет было обнаружено что, наивысшие усредненные результаты по специфичности и PPV были получены для свет-локлеточного почечно-клеточного рака (86,37% ± 2,63% и 8 7, 3 1 % ± 2,63 % соответственно). Наиболее высокие усредненные значения чувствительности были ухромо-фобного рака (79,03±1,41 %). Максимальное усре дненное значение индекса Дайса было достигнут среди случаев схромофобным раком (82,67% ± 0,53%). Наиболее низкие показатели мы наблюдали в случаях с папиллярным раком, где были наименьшие значения метрики Дайса и чувствительности (64,53% ± 7,92% и 65,85% ±8,65% соответственно). В случае хромофобного рака наблюдались наиболее низкие значения PPV = 73,67%±5,48%. Среди случаев онкоцитом минимальное значение чувствительности было 9,14%, а максимальное — 100%. Максимальное значение специфичности — 96,44%, минимальное — 52,17%. Максимальное значение метрики
Дайса — 0,94, а минимальное — 0,16. Наибольшее значение PPV = 0,99, а минимальное — 0,44. Среди случаев хромофобного рака минимальное значение чувствительности было 83,06%, максимальное — 93,23%. Максимальное значение специфичности — 89,59%, минимальное 75,60%. Максимальное значение метрики Дайса — 0,84, а минимальное — 0,80. Максимальное значение PPV = 0,98, а минимальное — 0,5. Среди случаев светло-клеточного рака минимальное значение чувствительности — 82,45%, максимальное — 99,95%. Максимальное значение специфичности — 96,21%, минимальное — 69,72%. Максимальное значение метрики Дайса — 0,93, а минимальное — 0,81. Наибольшее значение PPV = 0,97, а минимальное — 0,81. Среди случаев папиллярного рака минимальное значение чувствительности было 26,77%, максимальное — 98,18%. Максимальное значение специфичности — 1, минимальное — 57,26%. Максимальное значение метрики Дайса — 0,94, а минимальное — 0,16. Максимальное значение PPV = 0,99, а минимальное — 0,51.
ПОЛИМОРФИЗМ ГЕНА BIRC5 (СУРВИВИНА) КАК МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЙ ПРЕДИКТОР ТЕЧЕНИЯ ЗАБОЛЕВАНИЯ У ПАЦИЕНТОВ С НМИРМП
Д.В. Черняев1,2, Р.А. Зуков12, Е.В. Слепов2, Л.А. Франк3
Место работы: 1. ФГБОУ ВО «Красноярский государственный медицинский университет им. проф. В. Ф. Войно-Ясенецкого» Минздрава России, Красноярск, Россия; 2. КГБУЗ «Красноярский краевой онкологический диспансер им. А.И. Крыжановского», Красноярск, Россия; 3. Институт биофизики СО РАН, ФИЦ КНЦ СО РАН, Красноярск, Россия Эл. почта: denisonco@mail.ru
Цель: Разработка новых подходов к ранней диагностике, а также прогнозированию безрецидивной выживаемости у больных немышечно-инвазивным раком мочевого пузыря на основе данных молекулярно-генетического анализа полиморфизма гена BIRC5 (сурвивина). Материалы и методы: Были исследованы 298 образцов венозной крови пациентов сдиагнозом рак мочевого пузыря. Из них 214 (72%) пациентов мужского пола и 84 (28%) — женского, средний возраст составил 64±10,8 лет (Ме: 65 лет; С25-С75: 58-71,5), при этом 217 больных имели немышечно-инвазивную форму РМП (Tis, Ta, T1), а 81 — мышечно-инвазивный РМП (T2-T3). Гистологические типы опухолей распределись в следующем количественном порядке: классический переходно-клеточный рак был выявлен в 277 случаях, рак с плоскоклеточной метаплазией — 15 случаев, с железистой метаплазией — 4 случая, смешанная форма плоскоклеточной с железистой метаплазией — 2 случая. По степени дифференцировки клеток разделение произошло следующим образом: 30 опухолей отнесены к высокодифференцированным (G1), 210 — куме-
ЗЛОКАЧЕСТВЕННЫЕ ОПУХОЛИ Российское общество клинической онкологии
том/vol. 13 #3s1 • 2023
MALIGNANT TUMOURS
Russian Society of Clinical Oncology
ТЕЗИСЫ ПОСТЕРНЫХ ДОКЛАДОВ И ПРИНЯТЫЕ К ПУБЛИКАЦИИ
Онкоурология
ренно дифференцированным (G2), 49 — к низко дифференцированным, у 9 опухолей дифференцировка не определена (Gx). Сопоставимую по полу и возрасту контрольную группу составили 183 здоровых донора, 143 (78%) мужчины и 40 (12%) женщин, средний возраст 63,2 ± 6,4 лет (Ме: 63 года; С25-С75: 59-68).
Выделение ДНК игенотипирование образцов проводили спомощью ПЦР на основе реакции удлинения специфичных праймеров с последующим твердофазным биолюминесцентным анализом продуктов. Образец ДНК с генотипом GC, дополнительно подтвержденным секвенированием по Сэнгеру (ЦКП «Геномика» СО РАН, Новосибирск, Россия) использовали как внутренний контроль. Обработку данных проводили с использованием Microsoft Excel для Windows 10, статистического программного обеспечения STATISTICA 12 (Statsoft, Россия). U-тест Манна-Уит-ни применяли для сравнения количественных данных. Исследуемая выборка для случаев и контролей находилась в равновесии Харди-Вайнберга (p > 0,05). Критерий X2 Пирсона использовали для сравнения частот вариантов гена среди случаев с РМП и контрольных образцов. Ассоциация между вариантами rs9904341 и РМП оценивали по отношению шансов (ОШ) с 95%-ным доверительным интервалом (ДИ), значения p < 0,05 считали значимыми. Результаты: Результаты анализа вариаций генотипа про-моторного участка ДНК сурвивина (rs9904341 (G/C)) показали, что у пациентов при наличии генотипа GC и CC рецидив заболевания чаще имеет множественный характер образований в мочевом пузыре, в то время какупациен-тов с генотипом GG рецидив носит единичный характер опухоли, однако данное утверждение имеет характер стойкой тенденции (р = 0,088). Также было установлено, что у больных НМИРМП с генотипом GC или CC рецидив опухоли в 3,4 раза чаще носит характер мультицентрич-ного роста (p = 0,049), а рецидив наблю дается преимущественно в течение первых 12 мес., в то время как у больных с генотипом GG чаще регистрируются отдаленные рецидивы на втором/третьем году и после пятилетнего периода наблюдения от радикального лечения (р = 0,035). Кроме того, был выявлен условно «защитный эффект» генотипа CC, который преобладал в группе здоровых людей (контрольная группа) (p = 0,000).
Заключение: В ходе исследования показано, что определение полиморфизма -31G > C (rs9904341), находящегося в промоторной области гена BIRC5 может быть использовано для прогнозирования времени возникновения рецидива НМИРМП (ранний или поздний), а также характера роста рецидивирующей опухоли. Представляет интерес определение носительства генотипа СС у пациентов с подозрением на РМП, как предиктора отсутствия злокачественного новообразования.
ПОЛИМОРФНЫЕ ЛОКУСЫГЕНОВ TP53, AKT1, PTEN КАК ПРЕДПОЛАГАЕМЫЕ МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ПРЕДИКТОРЫ РАЗВИТИЯ РАКА ПРОСТАТЫ
В.Н. Павлов1, М.В. Логинова1, И.Р. Гилязова2
Место работы: 1. ФГБОУ ВО «Башкирский государственный медицинский университет» Минздрава России, Уфа, Республика Башкортостан; 2. Институт биохимии и генетики Уфимского Федерального исследовательского центра РАН, Уфа, Республика Башкортостан Эл. почта: mariialoginova25@gmail.com
Цель: Поиск и исследование роли полиморфных локусов rs17878362 гена TP53, rs2994750 гена AKT1, rs2735343 гена PTEN среди пациентов с раком простаты в качестве возможных молекулярно-генетических предикторов развития заболевания.
Материалы и методы: Нами сформированы контрольная и основная группа пациентов. В основную группу набраны 457 пациентов с РП, проходящих лечение на базе Клиники БГМУ г. Уфы. Контрольная группа включала здоровых индивидов из Республики Башкортостан, которая по возрасту, территории проживания и численности соответствовала группе больных. Выделение ДНК пациентов выполнялось методом фенольно-хлороформной экстракции. Исследование коррелировало с клиническими характеристиками пациентов и гистопатологическими параметрами опухоли простаты. При анализе распределения частот генотипов и аллелей нами учитывалась стадия заболевания согласно классификации TNM, уровень ПСА, гистологическая градация по шкале Глисона, группы риска и гисто-патологические характеристики. Определение генотипов исследуемых полиморфных локусов генов проводилось при помощи метода аллельной дискриминации и технологии TaqMan.
Результаты: Сравнительный анализ основной и контрольной групп показал, что у пациентов с раком простаты III и IV стадии, проходящих лечение в Клинике БГМУ, статистически значимо чаще встречался генотип rs2735343*CG гена PTEN по сравнению с контрольной выборкой, и этот генотип может расцениваться как рисковый в отношении развития рака простаты тяжелого течения (p = 0,003, OR = 2,06, 52% CI = 1,31-3,24), в то же время генотип rs2735343*GG будет считаться протективным в отношении развития заболевания тяжелого течения (p = 0,004, 0R = 0,51, 53% CI = 0,32-0,86). Сравнительный анализ распределен ия генотипов полиморфных локусов rs2494750 гена АКТ1 и rs17878362 гена TP53 в выборках больных с раком простаты и индивидов контрольной группы не выявил статистически значимых различий. Заключение: Исследование проводилось для изучения роли полиморфных вариантов генов TP53, AKT1, PTEN в качестве молекулярно-генетических предикторов риска раз-
ЗЛОКАЧЕСТВЕННЫЕ ОПУХОЛИ Российское общество клинической онкологии
том/vol. 13 #3s1 • 2023
MALIGNANT TUMOURS
Russian Society of Clinical Oncology
