Научная статья на тему 'МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКОЕ СЕКВЕНИРОВАНИЕ НЕЙРОЭНДОКРИННЫХ ОПУХОЛЕЙ ЖЕЛУДОЧНО-КИШЕЧНОГО ТРАКТА'

МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКОЕ СЕКВЕНИРОВАНИЕ НЕЙРОЭНДОКРИННЫХ ОПУХОЛЕЙ ЖЕЛУДОЧНО-КИШЕЧНОГО ТРАКТА Текст научной статьи по специальности «Клиническая медицина»

CC BY
24
4
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по клинической медицине , автор научной работы — А.В. Андросова, Р.В. Орлова, М.Г. Гордиев, А.К. Иванова, Н.П. Беляк

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Текст научной работы на тему «МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКОЕ СЕКВЕНИРОВАНИЕ НЕЙРОЭНДОКРИННЫХ ОПУХОЛЕЙ ЖЕЛУДОЧНО-КИШЕЧНОГО ТРАКТА»

ТЕЗИСЫ ПОСТЕРНЫХ ДОКЛАДОВ И ПРИНЯТЫЕ К ПУБЛИКАЦИИ

Онкогенетика

ров оставалась неизменной. В III гр. остаточная популяция клеток ХЛЛ > 1% (33,5 ± 7,84%), профиль экспрессии всех маркеров, выявленных в дебюте заболевания оставался неизменным. После 6 курса ИХТ медиана и стандартное отклонение количественной характеристики МОБ составили в I гр. 0%; во II — 0,42 ± 0,09 %, в III — 33,2 ± 8,07 %. Профиль экспрессии всех иммунофенотипических маркеров во II и III группах оставался неизменным в сравнении с 3 курсом ИХТ. Отличия в экспрессии иммунофенотипических маркеров у больных разных групп на всех этапах были статистически значимы (р < 0,05). Заключение: В-лимфоциты больных ХЛЛ с МОБ-нега-тивным статусом характеризовались отсутствием экспрессии маркерных молекул CD38, ZAP-70, CD11c, CD25, FMC7. С неудовлетворительным ответом на лечение ассоциируется высокая экспрессия одновременно всех указанных маркеров.

■ ОНКОГЕНЕТИКА

КЛИНИЧЕСКОЕ ЗНАЧЕНИЕ ЭКСПРЕССИИ DNMT3A, ДНРНК LINC00847 И МИКРОРНК MIR-1301 У ПАЦИЕНТОВ С РАКОМ ЖЕЛУДКА

Е.А. Ветчинкина1, И.В. Буре1, Е.Б. Кузнецова12, А.И. Калин-кин2, А.Э. Киселева1, Е.А. Алексеева1, М.В. Немцова1,2 Место работы: 1. ФГАОУ ВО «Первый МГМУ им. И.М. Сеченова Минздрава России» (Сеченовскийуниверситет), Москва, Россия; 2. ФГБНУ «Медико-генетический научный центр», Москва, Россия

Эл. почта: katevetchinkina@ya.ru

Цель: Провести исследование экспрессии DNMT3A, днРНК LINC00847 и микроРНК miR-1301 в операционных образцах РЖ и оценить их потенциал в качестве прогностических факторов.

Материалы и методы: В исследование включены 62 парных образца операционного материала РЖ и прилежащих морфологически нормальных тканей, а также 5 секционных образцов здоровой ткани желудка. Выделение тотальной РНК проводили с использованием Trizol (Life Technologies), получение кДНК методом обратной транскрипции с использованием набора MiScript II RT Kit (Qiagen), оценку уровня экспрессии проводили с использованием ПЦР в реальном времени и набора MiScript SYBR Green PCR Kit (Qiagen). Статистический анализ был выполнен с использованием Statistica 13.1, компьютерного алгоритма mirDIP и критериев Манна-Уитни и Краскела-Уоллиса, t-крите-рия Стьюдента. Значения р < 0,05 считались статистически значимыми.

Результаты: Анализ с использованием компьютерного алгоритма т№1Р предсказал, что днРНК иЫС00847 и микроРНК т1к-1301 являются возможными регуляторами РЫИТЗА. При сравнении экспрессии РЫИТЗА в секционных здоровых образцах желудка с опухолевой и морфологически нормальной тканью пациентов с РЖ обнаружены статистически достоверные различия (р = 0,003) и (р < 0,001) соответственно. Для ИЫС00847 и т1к-1301 результаты оказались статистически не значимы. Для поиска клинически значимых маркеров РЖ мы провели анализ ассоциаций экспрессии РЫМТЗА, ИЫС00847 и т1к-1301 в опухоли и морфологически нормальной ткани с клиническими характеристиками пациентов. Выявлено, что экспрессия гена РЫМТ3А достоверно повышена в опухоли (р = 0,018) и прилежащей морфологически нормальной ткани пациентов (р = 0,005) при недифференцированном типе РЖ. Экспрессия т1к-1301 достоверно снижается в зависимости от распространенности первичной опухоли, при Т4 экспрессия достоверно ниже, чем в Т1-3 (р = 0,045). Статистически значимых различий экспрессии ИЫС00847 у пациентов с различными клиническими характеристиками не выявлено. При сравнении других показателей (пола, общей выживаемости, 5-летней выживаемости, клинической стадии, наличия или отсутствия перстневидных клеток и отдаленных метастазов) установить статистически значимых различий не удалось. Заключение: Полученные данные дифференциальной экспрессии в здоровых тканях и тканях РЖ для РЫМТ3А и т1к-1301 позволяют предположить их потенциальную прогностическую значимость при РЖ. Работа выполнена при финансовой поддержке Российского научного фонда (грант № 20-75-10117).

МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКОЕ СЕКВЕНИРОВАНИЕ НЕЙРОЭНДОКРИННЫХ ОПУХОЛЕЙ ЖЕЛУДОЧНО-КИШЕЧНОГО ТРАКТА

А.В. Андросова1,2, Р.В. Орлова1,2, М.Г. Гордиев4, А.К. Иванова2 Н.П. Беляк12, С.И. Кутукова23

Место работы: 1. ФГБОУ ВО «Санкт-Петербургский государственный университет» Санкт-Петербург, Россия; 2. СПбГБУЗ «Городской клинический онкологический диспансер», Санкт-Петербург, Россия; 3. ФГБОУВО «Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет им. академика И.П. Павлова», Санкт-Петербург, Россия; 4. «Лечебно-диагностический центр Международного института биологических систем имени Сергея Березина», Санкт-Петербург, Россия Эл. почта: alexa.androsova.1711@mail.ru

Цель: Оценить молекулярно-генетические особенности нейроэндокринных опухолей ЖКТ

Материалы и методы: Всего протестировано 30 опухолевых блоков пациентов с НЭО ЖКТ методом секвени-

ЗЛОКАЧЕСТВЕННЫЕ ОПУХОЛИ Российское общество клинической онкологии

том / vol. 12 № 3s1 • 2022

MALIGNANT TUMOURS

Russian Society of Clinical Oncology

российский жж w» ш а онкологический Y Y \ж I конгресс-2022 /\/\ v i

Онкогенетика

рования нового поколения (NGS). Были проанализированы следующие гены: ATM, ATR, BARD1, BRCA1, BRCA2, BRIP1, CDH1, CDK12, CHEK1, CHEK2, EPCAM, FANCL, MLH1, MSH2, NBN, NF1, PALB2, PMS2, RAD51B, RAD51C, RAD51D, RAD54L, STK11, TP53, POLE, KRAS, NRAS, BRAF, EGFR, ERBB2, PIK3CA, MET ex14, BAT25, BAT26, NR21, NR24, MONO27, KIT, PDGFRA, Pi3Ca.

Подготовка библиотек для секвенирования осуществлялось с помощью NimblGen SepCapEZ Choice. Секвениро-вание проводилось на приборе Illumina MiSeq. Результаты: В исследуемой когорте больных, чьи опухолевые блоки были направлены на исследование методом NGS, женщин было больше — 19 (63,3 %) чем мужчин — 11 (36,7%). При анализе возраста пациентов, следует отметить, что среди всех возрастных групп преобладали пациенты пожилого (60-74 года по классификации ВОЗ, 2016) — 12 (40%). У большинства пациентов — 10 (33,3%) — первичный опухолевый очаг локализовался в поджелудочной железе, у 6 (20 %) пациентов первично был поражен желудок, у 7 (23,3 %) — тонкая кишка. Другие отделы ЖКТ поражались значительно реже: толстая кишка — у 1 (3,3%) пациентов. Согласно разделению по степени дифферен-цировки НЭО ЖКТ- 10 опухолей имели степень дифферен-цировки G1 (33,3%), 16-G3 (54,3%), 4- G3 (13,3 %). В опухолевом образце пациента с НЭО желудка G1 (Ki 67 = 2 %) были обнаружены мутации POLE: c. 2276G > A, p. R759H и CHEK2: c. 470T > C, p. I157T. Также в опухолевом образце другого пациента с НЭО желудка G2 (Ki 67 = 7 %) обнаружены мутации MLH1: c. 199G > A, p. G67R BRCA1: c. 1881 _1884del, p. V627fs. В опухолевом материале пациента с НЭО поджелудочной железы G2 (Ki 67 = 3%) была выявлена мутация мутации POLE: c. 2276G > A, p. R759H. Стоит отметить, что все три пациента в чьем опухолевом материале были обнаружены вышеперечисленные мутации были женского пола и относились к группе — молодой возраст (согласно ВОЗ, 2016 г.). Заключение: Для улучшения показателей выживаемости пациентов стоит уделять особенное внимание молеку-лярно-генетическому исследованию НЭО ЖКТ. Именно молекулярно-генетическое профилирование может стать опорой для выстраивания более индивидуализированных алгоритмов лечения пациентов. Результаты данного исследования позволяют рассчитывать на то, что при проведении исследования на большей когорте пациентов с НЭО ЖКТ можно получить результаты, которые расширят наши знания о данной нозологии и позволят дополнить уже имеющуюся информацию о факторах прогноза и предикторах ответа на лечение.

ЗЛОКАЧЕСТВЕННЫЕ ОПУХОЛИ Российское общество клинической онкологии

ЧАСТОТА И СПЕКТР МУТАЦИЙ В ГЕНАХ BRCA У ПАЦИЕНТОК С РАЗЛИЧНЫМИ МОРФОЛОГИЧЕСКИМИ ПОДТИПАМИ КАРЦИНОМЫ ЯИЧНИКОВ МЕТОДОМ NGS НА ПРИМЕРЕ РЕСПУБЛИКИ БАШКОРТОСТАН

А.А. Фатихова, К.В. Меньшиков, А.В. Султанбаев, Н.А. Тарасов, Р. Т. Аюпов

Место работы: ГАУЗ «РКОД» Министерства здравоохранения Республики Башкортостан, Уфа, Респ. Башкортостан

Эл. почта: a.fatikhova@inbox.ru

Цель: Выявление частоты и спектра мутаций в генах BRCA у пациенток с различными морфологическими подтипами карциномы яичников методом NGS в многонациональном регионе Российской Федерации (на примере Республики Башкортостан).

Материалы и методы: В период с 2021 по 2022 гг. на BRCA тестирование были направлены 76 образцов биоматериала пациенток с диагнозом рак яичников. Материалом для исследования служил биоптат опухоли пациента. Учитывая региональные особенности населения Республики Башкортостан, для определения мутаций в генах BRCA был выбран метод NGS (next-generation sequencing method). Из направленных биоптатов 54 включали в себя наиболее часто встречающиеся морфологические подтипы (серозная карцинома высокой степени злокачественности — high grade), 22 образца включали в себя более редкие подтипы: серозный рак низкой степени злокачественности, светло-клеточный рак, железистый рак, недифференцированный рак яичников.

Результаты: При исследовании методом NGS из 76 исследуемых образцов выявлено 28 случаев мутаций в генах BRCA 1 и 2. В подгруппе серозных карцином high grade выявлено 27 случаев мутаций в генах BRCA 1 и 2, частота выявления мутаций в этой подгруппе составила 50 %. Из представленных мутаций в гене BRCA119 случаев (70,4%), в гене BRCA2 8 случаев (29,6%). В подгруппе редких гистотипов карциномы яичников выявлена 1 случай мутации в гене BRCA2 у пациентки со светлоклеточной карциномой яичника, частота выявления мутаций в этой подгруппе составила 4,6 %.

Заключение: С учетом национальных особенностей населения Республики Башкортостан онкогенетическое тестирование предпочтительнее проводить методом секвенирования нового поколения, что позволяет значительно повысить эффективность выявления клинически значимых патогенных мутаций у больных раком яичников. Необходим более широкий охват тестирования методом NGS пациенток с диагнозом рак яичников, особенно у пациенток с наиболее часто встречающимися морфологическими подтипами (серозная карцинома высокой степени злокачественности), с целью определения прогностических факторов и оптимизации терапии, а также в перспективе скрининга здоровых носителей мутаций.

MALIGNANT TUMOURS

Russian Society of Clinical Oncology

том / vol. 12 № 3s1 • 2022

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.