Научная статья на тему 'Молекулярно-генетические методы в эпидемиологическом надзоре за острыми респираторными вирусными инфекциями'

Молекулярно-генетические методы в эпидемиологическом надзоре за острыми респираторными вирусными инфекциями Текст научной статьи по специальности «Науки о здоровье»

CC BY
135
28
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Журнал
Инфекция и иммунитет
Scopus
ВАК
RSCI
ESCI
Область наук
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по наукам о здоровье , автор научной работы — С.Б. Яцышина, А.Н. Миненко, М.Н. Прадед, А.В. Горелов, Г.А. Шипулин

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Текст научной работы на тему «Молекулярно-генетические методы в эпидемиологическом надзоре за острыми респираторными вирусными инфекциями»

Материалы X съезда ВНПОЭМП, Москва, 12-13 апреля 2012 г.

Инфекция и иммунитет

Из 116 детей ооцисты криптоспоридий были обнаружены у 16 человек (14%), причем наиболее часто — у детей от 1 года до 3 лет (30%).

Микробиологические исследования основывались на определении качественного и количественного состава микрофлоры кишечника, дисбактериоз I—IV степени был выявлен у 98% — 114 человек.

Наиболее часто выделялись микробы энтеробак-тер (16%), на втором месте по частоте обнаружения — протеи (14%). Бактерии рода цитробактер, серрация и клебсиелла — в небольшом проценте случаев (4%).

У детей, выделяющих криптоспоридии также часто обнаруживалось преобладание лактозанегатив-ных эшерихий (44%) 8 человек, у 20% (4 чел) преобладание эшерихий со смешанной ферментативной активностью.

В 18% случаев (3 чел) отмечали значительное снижение эшерихий по сравнению с нормой. Гемолитические варианты кишечной палочки встречались в 11% случаев (2 чел).

Таким образом, проведенные исследования позволили выявить значительные изменения микрофлоры кишечника у детей с дисфункцией ЖКТ, с выделением у них УПБ и наличием криптоспоридий (14%).

БАКТЕРИОЛОГИЧЕСКИЕ АСПЕКТЫ РАССЛЕДОВАНИЯ ВСПЫШКИ ПИЩЕВОЙ ТОКСИКОИНФЕКЦИИ СТАФИЛОКОККОВОЙ ПРИРОДЫ

Е.С. Ясная1, Т.А. Христенко1, Н.В. Зубчонок13, В.А. Бондарев13, И.А. Щукина23, И.В. Ярковская23, Н.М. Фатина2, С.Н. Бабанин23

'ФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Липецкой области, г. Липецк; 2Управление Роспотребнадзора по Липецкой области, г. Липецк; 3ГБОУ ВПО Северо-Западный государственный медицинский университет им. И.И. Мечникова, Санкт-Петербург

В январе 2011 г. на территории области была зарегистрирована вспышка, охватившая 57 детей в возрасте от 5 месяцев до 5-ти лет с клиникой пищевой токсикоинфекции (ПТИ) и острого гастроэнтеро-колита. В ходе эпидемиологического расследования установлено, что заболевание было связано с употреблением в пищу продукции («Наринэ», творог), изготовленной по рецептуре в детской молочной кухне (ДМК).

В ходе расследования вспышки были проведены отбор клинического материала от больных, персонал ДМК, смывов с оборудования, продукции и заквасок. Для выявления приоритетных патогенов использовались как экспресс-методы (ПЦР с применением тест-систем «АмплиСенс Shigella spp., и EIEC/Salmonella spp./Campylobacter spp.; «АмплиСенс Rotavirus/Norovirus/Astrovirus-FL»), так и классические (бактериологический, химический). В результате бактериологической диагностики из клинического материала (рвотные массы, промывные воды желудка, фекалии), персонала ДМК (мазки из полости носа) и образцов продукции ДМК был выделен S. aureus. Идентификацию микроорганизмов проводили общепринятыми методами. Все штаммы золотистого стафилококка обладали типичными для данного вида биологическими и биохимическими свойствами. Количество микроорганизмов варьировало от 4 х 104 до 5,9 х 105 КОЕ/мл

у больных и 1 х 102 до 5 х 102 КОЕ/мл у сотрудников ДМК. Изучение антибиотикорезистентности проводили на 27 штаммах S. aureus. В 37% случаев выявлена устойчивость к оксациллину и 7,4% — к эритромицину. Внутривидовую дифференциацию и эпидемиологическое маркирование проводили на штаммах, выделенные из клинического материала детей, сотрудников ДМК и продукта «Наринэ». Результат фа-готипирования показал, что большинство штаммов S. aureus, обнаруженных в продуктах детского питания, биологическом материале сотрудников ДМК и клиническом материале больных детей относились к фаготипам 29, 52, 52А, I литической группы.

Проведенные исследования показали, что применение комплекса методов типирования штаммов, определение продукции энтеротоксинов позволяет сделать диагностику ПТИ стафилококковой природы более целенаправленной и достоверной, а также собрать необходимую доказательную базу для удовлетворения исков о возмещении морального и материального вреда при регистрации групповой и вспышечной заболеваемости.

МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЕ МЕТОДЫ В ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКОМ НАДЗОРЕ ЗА ОСТРЫМИ РЕСПИРАТОРНЫМИ ВИРУСНЫМИ ИНФЕКЦИЯМИ

С.Б. Яцышина, А.Н. Миненко, М.Н. Прадед, А.В. Горелов, Г.А. Шипулин

ФБУН«Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии Роспотребнадзора», Москва

В структуре инфекционной патологии острые респираторные вирусные инфекции (ОРВИ) занимают до 90%, что обусловливает актуальность эпидемиологического надзора. Причиной ОРВИ может быть инфицирование представителями 6-ти основных семейств вирусов (Orthomyxoviridae, Paramyxoviridae, Picornaviridae, Adenoviridae, Coronaviridae, Parvoviri-dae). Регистрация заболеваемости гриппом, острыми инфекциями верхних дыхательных путей, вне-больничными пневмониями в России проводится на основании клинического диагноза, без учета данных лабораторной диагностики по идентификации инфекционного агента. Причем, клиническая картина лабораторно-подтвержденного гриппа зачастую не имеет характерных симптомов гриппа, и наоборот, ряд возбудителей ОРВИ (например, респираторно-синцитиальный вирус, метапневмо-вирус, коронавирусы, аденовирусы) могут вызывать гриппоподобныезаболевания.Сцельюоптимизации лабораторной диагностики ОРВИ в ФБУН ЦНИИЭ Роспотребнадзора разработан и поставлен на производство комплекс наборов реагентов «АмплиСенс Influenza virus A/B-FL», «АмплиСенс Influenza virus А-тип-FL», «АмплиСенс Influenza virus A/H1-swine-FL», «АмплиСенс ОРВИ-скрин-FL», предназначенный для выявления и дифференциации НК возбудителей гриппа и 13ти видов вирусных возбудителей ОРЗ (респираторно-синцитиальный вирус (RSv), метапневмовирус (Mpv), вирусы парагриппа тип 1—4 (Piv), коронавирусы 229E, OC43, HKUI, NL63 (Cov), риновирусы (Rv), бокавирус (Bov), аденовирусы В, С, Е (Adv) методом полимеразной цепной реакции с гибридизационно-флуоресцентной детекцией. Наборы реагентов зарегистрированы и разрешены для использования в РФ в целях диагностики и эпи-

2012, Т. 2, № 1-2

Современное лабораторное обеспечение.

демиологического надзора. Данный комплекс наборов реагентов хорошо зарекомендовал себя в работе референс-центра по мониторингу за возбудителями заболеваний верхних и нижних дыхательных путей на базе ФБУН ЦНИИЭ Роспотребнадзора на протяжение 2008—2011 гг.; их использование позволило идентифицировать возбудители ОРВИ при исследовании случаев спорадической и групповой заболеваемости с эффективностью от 60 до 80%. При расследовании случаев групповых заболеваний были обнаружены следующие этиологические агенты: Аёу тип В, серотип 7, вызвавший заболевания внебольничными пневмониями в январе 2011 г.у призывников срочной службы; вирус гриппа А/НШ1рёш2009 послужил причиной группового заболевания в Доме ребенка в феврале 2011г; К8у — заболевание дыхательных путей у 50 детей до 3х лет с одним летальным случаем от пневмонии в Доме малютки в ноябре 2011 г. Результаты многолетнего этиологического мониторинга возбудителей гриппа и ОРВИ с определением возрастной структуры и сезонности показали, что рассматриваемые вирусы могут вызывать заболевание у детей всех возрастных групп и взрослых, однако их доля в этиологической структуре в зависимости от возраста,

сезона и изучаемой нозологической формы варьируется. С увеличением возраста отмечается тенденция к снижению доли в этиологической структуре Соу и К8у, и увеличение доли Ку и вирусов гриппа, а также снижение частоты случаев сочетанного инфицирования двумя и более вирусными агентами (с 25 до 10%). Частота обнаружения Воу наиболее высока в возрастной группе от 1 до 3-х лет; при изучении спорадических случаев ОРЗ у взрослых Воу не обнаруживался. Частота обнаружения вирусов Р1у не претерпевала значительных колебаний в зависимости от возраста в пределах исследованной нами группы детей (от 1 месяца до 5 лет). Все вирусные агенты могут обнаруживаться при заболевании нижних дыхательных путей, и наиболее часто для детей всех возрастных групп — К8у. В этиологической структуре крупов высока доля Р1у и Соу. Заболеваемость, вызванная вирусами гриппа и К8у характеризуется выраженной сезонностью с одним пиком подъема, причем, для последнего отмечается чередование эпидемической активности с годичным интервалом, с начальным предиком весной и выраженным подъемом в осенне-зимний период. Для Ку ежегодно отмечаются два пика увеличения частоты их обнаружения — осенью и весной.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.