Научная статья на тему 'Межвидовая сравнительная молекулярно- генетическая характеристика бактерий рода Staphylococcus'

Межвидовая сравнительная молекулярно- генетическая характеристика бактерий рода Staphylococcus Текст научной статьи по специальности «Науки о здоровье»

CC BY
113
20
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Журнал
Инфекция и иммунитет
Scopus
ВАК
RSCI
ESCI
Область наук
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по наукам о здоровье , автор научной работы — А.Р. Мавзютов, Б.Н. Постригань, В.А. Гриценко, А.А. Давлетова, Г.А. Файзуллина

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Текст научной работы на тему «Межвидовая сравнительная молекулярно- генетическая характеристика бактерий рода Staphylococcus»

2012, Т. 2, № 1-2

Современное лабораторное обеспечение.

Целью нашего исследования явилось изучение и цитокинового и интерферонового статуса у женщин с ПВИ.

Мы провели изучение цитокинового профиля методом RT-PCR и показателей интерферонового статуса у 27 женщин с ПВИ (основная группа) и у 11 женщин с отсутствием клинических и лабораторных признаков ПВИ (контрольная группа).

В венозной крови выявлено наличие мРНК интерферона-а, интерлейкина-2, интерлейкина-4, интерлейкина-10, интерлейкина-18 и отсутствие мРНК интерферона-у, интерлейкина-lß, интерлей-кина-6, интерлекина-8, интерлейкина-12, фактора некроза опухолей-а.

При изучении показателей интерферонового статуса у женщин с ПВИполучено: у большинства пациенток (76%) снижена продукция интерферона-а (при норме от 128 до 640) до 40±0,3. У 54% женщин так же снижена продукция интерферона-у (при норме от 32 до 256) до 16±2,7 и снижена чувствительность к у-интерферону.

При изучении показателей интерферона у обследованных женщин, мы разделили всех пациенток на 2 подгруппы: в первую вошли жещины с ПВИ, во вторую — с сочетанной вирусно-бактериальной инфекцией (вирус папилломы человека (ВПЧ) + вирус простого герпеса (ВПГ), ВПЧ + уреаплазмоз и т.д.).

У женщин с ПВИ наиболее часто (75%) отмечено снижение продукции а-интерферона. У пациенток с сочетанной вирусно-бактериальной инфекцией — снижение продукции а- и у-интерферона (72,7%).

РАЗРАБОТКА КОМПЬЮТЕРНОЙ ПРОГРАММЫ МОДЕЛИРОВАНИЯ И ОЦЕНКИ ОПАСНОСТИ РАБОТ НА ОБЪЕКТАХ МЕДИКО-БИОЛОГИЧЕСКОГО ПРОФИЛЯ

М.Н. Ляпин, И.Н. Ежов, Е.В. Куклев, В.А. Сафронов, А.А. Лопатин, А.С. Раздорский, В.П. Топорков

ФКУЗ Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб» Роспотребнадзора, г. Саратов

Разработан опытный образец компьютерной программы моделирования и оценки опасности работ на объектах медико-биологического профиля, обеспечивающий повышение эффективности принятия управленческих решений в части мониторинга и контроля состояния биологической безопасности в субъекте РФ, предупреждению чрезвычайных ситуаций на потенциально опасных объектах.

Входной информацией для системы моделирования и оценки биологической опасности является информация, вводимая в систему с помощью веб-форм: сведения о видах и характеристиках микроорганизмов, с которыми проводятся манипуляции на объектах медико-биологического профиля;сведения о характеристиках рабочей зоны; сведения о характеристиках технологического процесса, исполнителя, манипуляций, методов;экспертные оценки (индексы) опасности микроорганизма в зависимости от его вида и количества, характеристик рабочего места, потенциальной опасности манипуляций и процессов.

В состав информационного обеспечения системы входит база данных системы поддержки принятия управленческих решений, разработанная в ФКУЗ РосНИПЧИ «Микроб», доработанная для работоспособности настоящей компьютерной программы.

Выходная информация представлена в следующих формах:результатов расчета интегративного показателя биологической опасности и степень потенциальной опасности, соотнесенная с вероятностными величинами риска возникновения инцидента (аварии) и уровнем достоверности и правдоподобия; тематических карт, отображающих значения интегративного показателя биологической опасности для каждого объекта медико-биологического профиля.

Разработанная компьютерная программапоз-воляет осуществлять взаимодействие с внешними информационными системами (система поддержки принятия управленческих решений, информационные системы по оценке и прогнозированию уровней риска возникновения чрезвычайных ситуаций) с целью получения исходных данных для расчетов с использованием модели оценки рисков и прогнозирования биологических опасностей и осуществлять визуализацию результатов моделирования и оценки опасности работ на объектах медико-биологического профиля, на территории субъектов РФ и муниципальных образований.

МЕЖВИДОВАЯ СРАВНИТЕЛЬНАЯ МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА БАКТЕРИЙ РОДА STAPHYLOCOCCUS

А.Р. Мавзютов1, Б.Н. Постригань2, В.А. Гриценко3, А.А. Давлетова1, Г.А. Файзуллина1

1ГБОУ ВПО БГМУ Минздравсоцразвития России, г. Уфа; 2Институт биохимии и генетики УНЦРАН, г. Уфа; 3Институт клеточного и внутриклеточного симбиоза УрО РАН, г. Оренбург

Вопрос о патогенности условно-патогенных бактерий (УПБ) до настоящего времени остается наиболее проблематичным, что во-многом обусловлено фенотипической изменчивостью микроорганизмов. Указанное безусловно снижает информативность диагностики вызываемых ими заболеваний и эффективность противоэпидемических мероприятий. В этой связи представляется перспективным более широкое использование молекулярно-генетических методов, которые наряду с указанным могут кардинально изменить некоторые наши представления о роли УПБ в этиологии заболеваний человека.

В соответствии с этим нами были подобраны праймеры, специфичные генетическим детерминантам ряда факторов, ассоциируемых с патоген-ностью Staphylococcus spp., позволяющие выявлять в ходе полимеразной цепной реакции специфические фрагменты генов mecA (метициллинрези-стентность), sec3 (продукция стафилококкового энтеротоксина С), lukF-PV и lukS-PV (лейкоцидин Panton-Valentine (PVL)), tst (развитие синдрома токсического шока), agr (регулятор синтеза токсинов), а также к родоспецифическим фрагментам 16S rRNA Staphylococcus spp. Указанные праймеры были испытаны на 19 штаммах S. aureus, 9 шт. S. epidermidis, 9 — S. hominis и 13 — S. haemolyticus (коллекция культур НИИКВС УрО РАН, г. Оренбург), фенотипически характеризовавшихся способностью к синтезу пигмента стафилоксантина, а также лецитиназы и коа-гулазы.

В 100% случаев при использовании родоспе-цифических праймеров к 16S rRNA были получены положительные результаты ПЦР. Фрагменты mecA были выявлены у 47,37% S. ат^ш, у 32,07%

Материалы X съезда ВНПОЭМП, Москва, 12-13 апреля 2012 г.

Инфекция и иммунитет

S. hominis и в 13,89%. — у S. haemolyticus; lukS-PV — у 100% S. aureus, у 88,89% S. epidermidis, у 84,61% S. hominis и у 69,44% S. haemolyticus; lukF-PV — у 84,21% S. aureus, у 44,44% S. epidermidis, у 61,53% S. hominis и у 50% S. haemolyticus; sec3 — у 100% штаммов S. aureus, 55,55% S. epidermidis, у 84,61% S. hominis и 75% S. haemolyticus. Частота обнаружения фрагментов гена agr составила для S. аш^^ — 100%, S. epidermidis — 88,89%, S. hominis — 100% и среди штаммов S. haemolyticus — 66,67%. Полученные данные свидетельствуют о генетической детерминированности различий в степени патогенности Staphylococcus spp.

Работа выполнена в соответствии с ФЦП «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России» на 2009—2013 гг., в рамках реализации мероприятия № 1.2.1. ГК№ П385 от 30.07.2009.

ХАРАКТЕРИСТИКА ШТАММОВ CORYNEBACTERIUM DIPHTHERIAE, ЦИРКУЛИРУЮЩИХ В РОССИИ В РАЗНЫЕ ПЕРИОДЫ ЭПИДЕМИЧЕСКОГО ПРОЦЕССА ДИФТЕРИЙНОЙ ИНФЕКЦИИ

И.К. Мазурова, О.Ю. Борисова, С.Ю. Комбарова, И.А. Рудакова, Н.Т. Гадуа, Г.А. Ивашинникова, А.С. Пименова

ФБУН МНИИЭМим. Г.Н. Габричевского Роспотребнадзора, Москва

В 1990-е годы прошлого века в России имел место эпидемический подъем заболеваемости дифтерией. В результате принятых мер и, в первую очередь, предусматривающих увеличение охвата населения профилактическими прививками, произошло снижение заболеваемости дифтерией. Однако, эпидемический процесс и судьба возбудителя дифтерийной инфекции по-прежнему остаются предметом внимания многих специалистов, так как в период спорадической заболеваемости сохраняются условия поддержания эпидемического процесса и формирования популяции возбудителя дифтерии. Анализ данных по наблюдению за фено- и генотипическими свойствами и особенностями распространения ток-сигенных и нетоксигенных штаммов C. diphtheriae, выделенных на территории России в различные периоды эпидемического процесса дифтерийной инфекции, показал существование филогенетических связей между токсигенными и нетоксигенными C. diphtheriae, обусловленных наличием некоторых генетических детерминант (ген tox, ген dtxR, гены rPHK) или общих нуклеотидных последовательностей (например, сайты прикрепления профага attB) с экспрессией или «молчащей» структурно -функциональной организацией этих генетических детерминант. Изучая особенности распространения токсигенных и нетоксигенных C. diphtheriae в различные периоды эпидпроцесса (подъем и пик заболеваемости 1990-х годов, снижение и спорадическая заболеваемость 2000-е годов) установлено, что динамика распространения токсигенных штаммов соответствовала динамике показателей заболеваемости дифтерией. Нетоксигенные штаммы имеют постоянное распространение, которое сохраняется даже в отсутствии заболеваемости дифтерией. В период спорадической заболеваемости показателями выделяемости нетоксигенных штаммов остаются примерно на одном уровне и значительно превышают выделение токсигенных штаммов. Возможность «скрытого» распространения токсигенных C. diph-

theriae, их взаимодействия с нетоксигенными C. diphtheriae, имеющими широкое распространение и генетический материал для эволюционных преобразований, указывает на то, что эрадикация возбудителя дифтерийной инфекции не произойдет, даже если предположить, что будут найдены эффективные средства борьбы с токсигенным бактерионосительством.

ДИАГНОСТИКА ПНЕВМОНИЙ У ДЕТЕЙ С ОСТРЫМИ РЕСПИРАТОРНЫМИ ЗАБОЛЕВАНИЯМИ

А.В. Макарова1, С.П. Кокорева1, А.В. Доценко1, Г.С. Болышева2, Т.Н. Разинкина2

'ГБОУ ВПО «ВГМА им. Н.Н. Бурденко» Минздравсоцразития РФ; 2ГБУЗ ОДКБ№ 2, г. Воронеж

Острые респираторные заболевания неуклонно занимают лидирующее положение в структуре инфекционной патологии у детей, часто имеют негладкое течение, среди осложнений особую тревогу у педиатров вызывают пневмонии.

С целью изучения особенностей этиологической структуры пневмоний у детей при острых респираторных заболеваниях обследовано 70 пациентов в возрасте от 3 месяцев до 16 лет, поступавших в ОДКБ № 2 в 2010-2011 гг.

Наиболее часто с острыми пневмониями госпитализировались дети в возрасте от 3 месяцев до 6 лет (52 человека) — 74%. Большинство (63%) пациентов поступали в стационар в первые 3-4 дня от начала заболевания и только треть больных (27%) — в конце первой недели заболевания. Диагноз пневмонии подтверждался у всех детей рентгенологическим исследованием легких. Сегментарная пневмония отмечалась у 41 ребенка (58,5%), очаговая — 22 (31,4%) и долевая — 7 (10,1%). У большинства детей (89%) воспалительный процесс в легких был односторонним, чаще правосторонним и только у 11% — двусторонним. По тяжести: преобладали нетяжелые пневмонии (96%), тяжелые отмечались только у 4% детей.

Всем детям для расшифровки этиологии пневмо-нийпроводились: микроскопическое, бактериологическое исследование мокроты; микробиологическое исследование мазков из зева, носа на патогенную флору; посевы крови на стерильность; иммуно-ферментный анализ (ИФА) на антитела к респираторному микоплазмозу, хламидиозу; экспресс-диагностика на антигены респираторной группы. У большинства детей (69%) уточнить этиологию пневмоний не удалось, вероятно, в связи с поздними сроками забора материала (после начала антибактериальной терапии, проводимой на догоспитальном этапе) и техническими трудностями сбора мокроты у маленьких пациентов, при этом неуточненные вирусные пневмонии составили — 47%, неуточненные бактериальные пневмонии — 23%. Среди остальных (31%) уточненных возбудителей выявлялись: ß-гемолитический стрептококк — у 14%, гемофиль-ная палочка — у 5%, «атипичные» возбудители — у 4% (респираторный хламидиоз и респираторный микоплазмоз по 2%), аденовирусы — 4% и вирусы парагриппа и РС-инфекции по 2%.

Таким образом, расшифровать этиологию пневмоний удалось только у 1/3 детей, что связано с поздними сроками забора материала и техническими трудностями при сборе мокроты у маленьких паци-

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.