Научная статья на тему 'Место молекулярно-генетических методов в мониторинге и диагностике оппортунистических инфекций, в том числе связанных с оказанием медицинской помощи, у пациентов неонатального и акушерско-гинекологического профиля'

Место молекулярно-генетических методов в мониторинге и диагностике оппортунистических инфекций, в том числе связанных с оказанием медицинской помощи, у пациентов неонатального и акушерско-гинекологического профиля Текст научной статьи по специальности «Фундаментальная медицина»

CC BY
224
77
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Ключевые слова
оппортунистические инфекции / гены резистентности / молекулярно-генетическая диагностика / ПЦР-исследование / перинатальная медицина / клиническая лабораторная диагностика / opportunistic infections / resistant gens / molecular genetic diagnosis / PCR / perinatal medicine / clinical laboratory diagnosis

Аннотация научной статьи по фундаментальной медицине, автор научной работы — Припутневич Татьяна Валерьевна, Любасовская Людмила Анатольевна, Трофимов Дмитрий Юрьевич, Донников Андрей Евгеньевич, Быстрицкий Андрей Александрович

Цель исследования – предложить технологию мониторинга и лечения бактериальных инфекций, вызванных полирезистентными условно-патогенными микроорганизмами, на основе молекулярно-генетических методов исследования в перинатальных центрах. Материал и методы. Проведен анализ мировой и отечественной литературы, изучены результаты мировых и отечественных многоцентровых исследований, выполнен анализ собственных данных видовой принадлежности основных оппортунистических патогенов в госпитальной среде, анализ данных о механизмах, составе и распространенности генов резистентности к антибиотикам с учетом особенностей контингента перинатальных центров. Создана коллекция полирезистентных штаммов с различными вариантами фенои генотипической резистентности, проведена валидация технологии in vitro на штаммах микроорганизмов и биологическом материале от новорожденных и женщин. Результаты. С учетом особенностей контингента перинатальных центров разработан перечень наиболее значимых молекулярно-генетических маркеров, необходимых для эффективного лечения госпитальных инфекций и профилактики распространения полирезистентных штаммов микроорганизмов. Технология позволяет выявлять ДНК условно-патогенных микроорганизмов и эпидемиологически значимые маркеры резистентности к β-лактамным антибиотикам и гликопептидам у женщин репродуктивного возраста и новорожденных методом количественной полимеразной цепной реакции в режиме реального времени. Сформирован алгоритм выбора оптимальной тактики ведения пациентов неонатального профиля. Заключение. Использование предложенной технологии позволит получить следующий результат: в короткие сроки (в течение 2 ч) выполнить идентификацию основных возбудителей госпитальных оппортунистических инфекций и выявить маркеры их резистентности к β-лактамным антибиотикам и гликопептидам у женщин репродуктивного возраста и новорожденных. На основе полученных данных можно оптимизировать антибактериальную терапию, проводить санитарные и противоэпидемические мероприятия, в том числе по изоляции и маршрутизации пациентов.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по фундаментальной медицине , автор научной работы — Припутневич Татьяна Валерьевна, Любасовская Людмила Анатольевна, Трофимов Дмитрий Юрьевич, Донников Андрей Евгеньевич, Быстрицкий Андрей Александрович

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Molecular genetic methods as a key-point of monitoring and diagnostics of opportunisctic infections including nosocomial among neonatal and ob-gyn patients

Research aim is to propose the technology of monitoring and treatment of bacterial infections caused by multiresistant opportunistic pathogens based on molecular genetic methods in perinatal centers. Material and methods. While preparing this research there was scientific foreign and russian literature review conducted, as well as overview of foreign and Russian multicenter studies. Results. We have developed the list of the most significant markers based on the specific features of perinatal patients. It might be used as a key-point in the treatment and profilaxis of nosocomial infections caused by multiresistant pathogens. This technology provides DNA-detection in opportunistic pathogens as well as identification of the most common β-lactams’ and glycopeptides’ resistance markers among newborns and women in real-time PCR. The medical algorithm devoted to the optimization of perinatal patients treatment was made. Conclusion. The developed technology is aimed to perform the express-identification (up to 2 hours) of the common nosocomial opportunistic pathogens and to detect the most common β-lactams’ and glycopeptides’ resistance markers among newborns and women. As a result, this technology is supposed to optimize the antibiotic therapy, hygienic measures in particular isolation and therapeutic route of patient.

Текст научной работы на тему «Место молекулярно-генетических методов в мониторинге и диагностике оппортунистических инфекций, в том числе связанных с оказанием медицинской помощи, у пациентов неонатального и акушерско-гинекологического профиля»

В ПОМОЩЬ ПРАКТИКУЮЩЕМУ ВРАЧУ

Место молекулярно-генетических методов в мониторинге и диагностике оппортунистических инфекций, в том числе связанных с оказанием медицинской помощи, у пациентов неонатального и акушерско-гинекологического профиля

Припутневич Т.В., Любасовская Л.А., Трофимов Д.Ю., Донников А.Е., Быстрицкий А.А., Гордеев А.Б., Сердюкова Д.М., Шабанова Н.Е.

Федеральное автономное образовательное учреждение высшего образования Первый Московский государственный медицинский университет имени И.М. Сеченова Министерства здравоохранения Российской Федерации (Сеченовский Университет), 119991, г. Москва, Российская Федерация

Цель исследования - предложить технологию мониторинга и лечения бактериальных инфекций, вызванных полирезистентными условно-патогенными микроорганизмами, на основе молекулярно-генетиче-ских методов исследования в перинатальных центрах.

Материал и методы. Проведен анализ мировой и отечественной литературы, изучены результаты мировых и отечественных многоцентровых исследований, выполнен анализ собственных данных видовой принадлежности основных оппортунистических патогенов в госпитальной среде, анализ данных о механизмах, составе и распространенности генов резистентности к антибиотикам с учетом особенностей контингента перинатальных центров. Создана коллекция полирезистентных штаммов с различными вариантами фено-и генотипической резистентности, проведена валидация технологии in vitro на штаммах микроорганизмов и биологическом материале от новорожденных и женщин.

Результаты. С учетом особенностей контингента перинатальных центров разработан перечень наиболее значимых молекулярно-генетических маркеров, необходимых для эффективного лечения госпитальных инфекций и профилактики распространения полирезистентных штаммов микроорганизмов. Технология позволяет выявлять ДНК условно-патогенных микроорганизмов и эпидемиологически значимые маркеры резистентности к р-лактамным антибиотикам и гликопептидам у женщин репродуктивного возраста и новорожденных методом количественной полимеразной цепной реакции в режиме реального времени. Сформирован алгоритм выбора оптимальной тактики ведения пациентов неонатального профиля.

Заключение. Использование предложенной технологии позволит получить следующий результат: в короткие сроки (в течение 2 ч) выполнить идентификацию основных возбудителей госпитальных оппортунистических инфекций и выявить маркеры их резистентности к р-лактамным антибиотикам и гликопептидам у женщин репродуктивного возраста и новорожденных. На основе полученных данных можно оптимизировать антибактериальную терапию, проводить санитарные и противоэпидемические мероприятия, в том числе по изоляции и маршрутизации пациентов.

Ключевые слова:

оппортунистические инфекции, гены резистентности, молеку-лярно-генетиче-ская диагностика, ПЦР-исследование, перинатальная медицина, клиническая лабораторная диагностика

Конфликт интересов. Авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов.

Вклад авторов. Концепция и дизайн исследования - Припутневич Т.В., Трофимов Д.Ю. Сбор и обработка материала - Люба-совская Л.А., Гордеев А.Б., Донников А.Е. Статистическая обработка данных - Сердюкова Д.М., Быстрицкий А.А., Шабанова Н.Е. Написание текста - Сердюкова Д.М., Любасовская Л.А. Редактирование - Припутневич Т.В., Трофимов Д.Ю. Для цитирования: Припутневич Т. В.,Любасовская Л. А.,Трофимов Д.Ю.,Донников А. Е.,Быстрицкий А. А., Гордеев А. Б., Сердюкова Д.М., Шабанова Н.Е. Место молекулярно-генетических методов в мониторинге и диагностике оппортунистических инфекций, в том числе связанных с оказанием медицинской помощи, у пациентов неонатального и акушерско-гинекологического профиля // Акушерство и гинекология: новости, мнения, обучение. 2020. Т. 8, № 1. С. 53-60. 10.24411/2303-9698-2020-11007 Статья поступила в редакцию 15.12.2019. Принята в печать 05.02.2020.

Molecular genetic methods as a key-point of monitoring and diagnostics of opportunistic infections including nosocomial among neonatal and ob-gyn patients

Priputnevich T. V., Lyubasovskaya L.A., I.M. Sechenov First Moscow State Medical University (Sechenov Trofimov D.Yu., Donnikov A.E., University), 119991, Moscow, Russian Federation

Bystritsky A.A., Gordeev A.B., Serdyukova D.M., Shabanova N.E.

Research aim is to propose the technology of monitoring and treatment of bacterial infections caused by multiresistant opportunistic pathogens based on molecular genetic methods in perinatal centers.

Material and methods. While preparing this research there was scientific foreign and russian literature review conducted, as well as overview of foreign and Russian multicenter studies.

Results. We have developed the list of the most significant markers based on the specific features of perinatal patients. It might be used as a key-point in the treatment and profilaxis of nosocomial infections caused by multiresistant pathogens. This technology provides DNA-detection in opportunistic pathogens as well as identification of the most common p-lactams' and glycopeptides' resistance markers among newborns and women in real-time PCR. The medical algorithm devoted to the optimization of perinatal patients treatment was made.

Conclusion. The developed technology is aimed to perform the express-identification (up to 2 hours) of the common nosocomial opportunistic pathogens and to detect the most common p-lactams' and glycopeptides' resistance markers among newborns and women. As a result, this technology is supposed to optimize the antibiotic therapy, hygienic measures in particular isolation and therapeutic route of patient.

Conflict of interests. The authors declare no conflict of interests.

Contribution. The concept and design of the study - Priputnevich T.V., Trofimov D.Yu. Collection and processing of material - Lyubasovskaya L.A., Gordeev A.B., Donnikov A.E. Statistical data processing - Serdyukova D.M., Bystritsky A.A., Shabanova N.E. Writing a text - Serdyukova D.M., Lyubasovskaya L.A. Editing - Priputnevich T.V., Trofimov D.Yu.

For citation: Priputnevich T.V., Lyubasovskaya L.A., Trofimov D.Yu., Donnikov A.E., Bystritsky A.A., Gordeev A.B., Serdyukova D.M., Shabanova N.E. Molecular genetic methods as a key-point of monitoring and diagnostics of opportunisctic infections including nosocomial among neonatal and ob-gyn patients. Akusherstvo i ginekologiya: novosti, mneniya, obuchenie [Obstetrics and Gynecology: News, Opinions, Training]. 2020; 8 (1): 53-60. doi: 10.24411/2303-9698-2020-11007 (in Russian) Received 15.12.2019. Accepted 05.02.2020.

Keywords:

opportunistic infections, resistant gens, molecular genetic diagnosis, PCR, perinatal medicine, clinical laboratory diagnosis

Эффективное лечение многих инфекционных заболеваний невозможно без данных о резистентности возбудителя к антимикробным препаратам (АМП). Наиболее широко применяемый метод - фено-типическое определение чувствительности на основе измерения уровня минимальной подавляющей концентрации (МПК), а также его упрощенная модификация -диско-диффузионный метод. С помощью данных методов можно оценить подавляющую способность АМП в отношении конкретного штамма микроорганизма независимо от механизма действия и генов, его кодирующих. В то же время к недостаткам данной методики можно отнести увеличение длительности микробиологического исследования минимум на 1 сут, а также отсутствие возможности эпидемиологического маркирования штаммов по генам резистентности, чтобы можно было отслеживать пути их

циркуляции в стационаре. Наряду с этим нередко при резистентности у микроорганизма к антибиотику in vitro не удается получить клинический эффект от применения препарата. Это может быть связано как со свойствами данного микроорганизма, например с формированием биопленок [1, 2], так и с присутствием в ассоциации микроорганизмов, несущих гены резистентности в столь незначительном количестве, что при фенотипическом определении чувствительности они не выявляются, но в случае назначения антимикробной терапии под действием селективного пресса антибиотика чувствительные варианты бактериальных клеток одного вида погибают, а резистентные, получив конкурентное преимущество, могут дать новый вираж инфекции, вызванной возбудителем с новыми свойствами. Таким образом, невозможность быстрого выявления устойчивых штаммов

условно-патогенных бактерий приводит к применению неадекватных схем противомикробной терапии и несет в себе риск распространения резистентных штаммов.

Как и ранее, условно-патогенные микроорганизмы (УПМ) являются основными возбудителями послеродовых инфекционных осложнений и раннего неонатального сепсиса, но теперь УПМ становятся возбудителями и госпитальных оппортунистических инфекций с присущими им современными новыми свойствами - множественной лекарственной устойчивостью. К приоритетным направлениям в диагностике инфекций, в частности среди особого контингента пациентов -беременных, родильниц и новорожденных, можно отнести быстроту выявления возбудителя и определение его свойств.

Как правило, на рынке представлены диагностические продукты для выявления отдельных возбудителей нозо-комиальных и оппортунистических инфекций и генов, ассоциированных с резистентностью к антимикробным препаратам. При этом праймеры к генам резистентности чаще всего входят в состав отдельных тестов, и каждый из них позволяет определить резистентность к отдельным группам препаратов. Например, для идентификации генов металло-р-лактамаз, принадлежащих к наиболее распространенным группам - VIM, IMP и основных подгрупп карбапенемаз OXA-типа, разработан ряд методов с использованием поли-меразной цепной реакции (ПЦР) [3].

Кроме того, существуют комплексные способы выявления маркеров резистентности микроорганизмов к антимикробным препаратам. К примеру, существует метод мультиплексной ПЦР в режиме реального времени c последующим анализом кривых плавления полученных ампликонов для идентификации генов 5 групп металло-р-лактамаз [4]. Но, как правило, метод мультиплексной ПЦР не позволяет одновременно детектировать большое количество генов [5]. Другая группа способов идентификации генов, обусловливающих резистентность микроорганизмов к АМП, основана на методе гибридизационного анализа на ДНК-микрочипах [5]. Существенную долю российского рынка диагностических продуктов для выявления с помощью ПЦР генов, ассоциированных с резистентностью к антимикробным препаратам, занимают продукты 3 компаний: ООО «Интерлабсервис» (Россия), НПФ «Литех» (Россия) и компании Cepheid (США). ООО «Интерлабсервис» предлагает отдельные наборы для ПЦР-идентификации генов резистентности к метициллину и генов ряда карбапенемаз (VIM, IMP, NDM, KPC, OXA-48). НПФ «Литех» предлагает наборы для определения генов р-лактамаз классов TEM, CTX-M, SHV-5, SHV-12, VIM, NDM, OXA-48, а также генов резистентности к метициллину (mecA) и ванкомицину (vanA, vanB). Компания Cepheid предлагает детектирующие амплификаторы серии Gene Expert, которые работают с тест-наборами разных типов. Тест-наборы позволяют идентифицировать гены резистентности, относящиеся к следующим группам: р-лактамазы (классов IMP-1, NDM, OXA-48, VIM, KPC), гены резистентности к метициллину (mecA) и ванкомицину (vanA, vanB).

Существующие методы молекулярно-биологической диагностики позиционируются как тесты для усредненного пациента, т.е. они не учитывают специфику выявления подобных заболеваний у женщин репродуктивного возраста,

беременных и родильниц. Поэтому представляется целесообразной и практически актуальной для использования в клинической практике разработка набора маркеров резистентности возбудителей нозокомиальных и оппортунистических инфекций у пациентов неонатального и акушерско-гинекологического профиля.

Цель исследования - предложить технологию мониторинга и лечения бактериальных инфекций, вызванных полирезистентными УПМ, на основе молекулярно-генетических методов исследования в перинатальных центрах.

Материал и методы

В качестве технологической основы для мониторинга и диагностики инфекций у пациентов акушерско-гинеко-логического профиля и новорожденных был выбран метод количественной ПЦР с детекцией результатов в режиме реального времени, обладающий высокой специфичностью и чувствительностью. ПЦР выполняется на приборах, обеспечивающих техническую возможность постановки реакции ПЦР в режиме реального времени. Для обследования у женщин используют соскобы эпителиальных клеток из влагалища (заднебоковые своды), цервикального канала, биоптат эндометрия, метроаспират, содержимое абсцесса, экссудат брюшной полости, кровь, мочу; у новорожденного -кал, зев, кровь, моча, отделяемое глаз, содержимое везикулы, отделяемое пупочной ранки, содержимое венозного

Таблица 1. Перечень показателей, выявляемых предлагаемым способом

Показатель Возможность

идентификации

Геномная ДНК человека +

Общая бактериальная масса +

ДНК условно-патогенных микроорганизов +

Enterobacteriaceae spp. +

Pseudomonas aeruginosa +

Acinetobacter spp. +

Burkholderia cepacia complex +

Stenotrophomonas maltophilia +

Staphylococcus spp. +

Staphylococcus aureus +

Enterococcus spp. +

Гены резистентности +

mecA +

vanA +

vanB +

blaSHV +

blaTEM +

blaCTX-M +

blaOXA-23-like +

blaOXA-40-like +

blaOXA-48-like +

blaOXA-51-like +

blaOXA-58-like +

blaKPC +

blaNDM +

blaVIM +

blaIMP +

Таблица 2. Алгоритм выбора оптимальной тактики лечения пациента

Ъ

CD

С §

CD С со

Enterobacteriaceae spp., Pseudomonas aeruginosa, Acinetobacter spp.

Не определяется

blaSHV + + Патоген+ ПЕН - R, ЦЕФ - S/R, КАРБ - S, ПЕН/ИНГ - S

- + Патоген+ ПЕН - S, ЦЕФ - S, КАРБ - S, ПЕН/ИНГ - S

1 + + Патоген+ ПЕН - R, ЦЕФ - S/R, КАРБ - S, ПЕН/ИНГ - S

CO 3 - + Патоген+ ПЕН - S, ЦЕФ - S, КАРБ - S, ПЕН/ИНГ - S

s £ + + Патоген+ ПЕН - R, ЦЕФ - R, КАРБ - S, ПЕН/ИНГ - S

Ü CO 3 - + Патоген+ ПЕН - S, ЦЕФ - S, КАРБ - S, ПЕН/ИНГ - S

Burkholderia cepacia Staphylococcus complex, Stenotroph- spp.+Staphylococcus omonas maltophilia aureus -

Staphylococcus spp.+Staphylococcus

Enterococcus spp.

ro

-e-

o s

s

CL [=

О Ф

Патоген CoNS + ПЕН - R ЦЕФ - R КАРБ - R

Патоген CoNS + ПЕН - S/R ЦЕФ - S КАРБ - S

Патоген S. aureus + ПЕН - R ЦЕФ - R КАРБ - R ЦЕФ IV - S Патоген S. aureus + ПЕН - S/R ЦЕФ - S КАРБ-S

Не определяется Не определяется

Не определяется

Патоген + ВАН -Патоген + ВАН - Э Патоген + ВАН -Патоген + ВАН - Э

Не определяется

3 Ö

" 8

8 s %

Й Ь а

■S ü ®

.F га а

3 ° о

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

и С +2

•S й га

Зо Е

KMtiBisdudsiHH

1Л1LIA ЭИИИУВН

BH9J ЭИЬИУВН

KMtiBisdudsiHH

1Л1LIA эиииувн

BH9J ЭИЬИУВН

KMtiBisdudsiHH

1ЛШЛ ЭИИИУВН

BH3J эиьиувн

KMtiBisdudsiHH

S S

<0 I

vg S о

sc

и I

S

£

LU

з-

Отделение реанимации и интенсивной терапии новорожденных

Тактика обследования, лечения и ведения новорожденных в отделении на основе результатов исследования методом полиме-разной цепной реакции

* - полимеразная цепная реакция (ПЦР) на другие патогены, имеющие другую вирусную или бактериальную природу (в том числе микоплазмы, уреаплазмы, хламидии), проводится только при расширенном диагностическом поиске, в случае исключения патогенов, включенных в стандартное исследование; ** - при отсутствии признаков инфекции в первые 72 ч жизни микробиологическое исследование не показано; *** - к стандартной панели «Резистентность»дополнительно ставится ген ОЕЯ, связанный с устойчивостью к линезолиду.

катетера. Биоматериал, взятый одноразовым стерильным зондом, помещают в одноразовую пластиковую пробирку с транспортной средой для реакции ПЦР. Из взятого биоматериала стандартными процедурами выделяют суммарные нуклеиновые кислоты.

Для проведения ПЦР используют детектирующие ам-плификаторы. После прохождения амплификации по показателю индикаторного цикла программное обеспечение прибора отмечает наличие общей бактериальной массы и присутствие в анализируемом образце ДНК избранных генов резистентности. Реакция выполняется с наборами реагентов, обеспечивающими возможность исследования конкретных микроорганизмов: 1) реагенты для определения наличия общей массы бактериальной ДНК; 2) реагенты для определения бактерий, относящихся к 8 таксонам (семейство: Enterobacteriaceae, роды: Staphylococcus, Enterococcus, Acinetobacter, комплекс видов: Burkholderia cepacia, виды: Staphylococcus aureus, Pseudomonas aeruginosa, Stenotrophomonas maltophilia); 3) реагенты для определения генов резистентности; 4) реагенты для определения геномной ДНК человека (ген рецептора гормона роста).

Результаты

Предлагаемая технология предназначена для выявления ДНК УПМ и избранных маркеров резистентности

к ß-лактамным антибиотикам и гликопептидам у женщин репродуктивного возраста и новорожденных методом количественной ПЦР в режиме реального времени. Предлагается идентифицировать следующие показатели в биоматериале (табл. 1): определение геномной ДНК человека (гена рецептора гормона роста) для контроля забора материала, общей бактериальной массы, специфической ДНК микроорганизмов, относящихся к 8 таксонам (семейство: Enterobacteriaceae, роды: Staphylococcus, Enterococcus, Acinetobacter, комплекс видов: Burkholderia cepacia, виды: Staphylococcus aureus, Pseudomonas aeruginosa, Stenotrophomonas maltophilia) и 15 маркерных локусов, позволяющих выявлять гены резистентности УПМ к ß-лактамным антибиотикам и гликопептидам.

В результате сопоставления полученных данных с предлагаемыми критериями (табл. 2) можно определить чувствительность микроорганизмов к ß-лактамным антибиотикам и гликопептидам и выбрать оптимальную тактику лечения для конкретного пациента.

Полученные при исследовании биологического материала данные позволяют не только эмпирически назначить адекватную антимикробную терапию, но и проводить маркирование пациентов в отделении и ранжировать их по степени биологической опасности для планирования маршрутизации пациентов. Современная эпидемиология должна основываться на молекулярно-генетических методах,

т.е. стать молекулярной эпидемиологией. Выбор тактики ведения пациента на примере отделения реанимации и интенсивной терапии новорожденных (ОРИТН) представлен на рисунке.

Так, при поступлении новорожденного в ОРИТ из родильного зала обследования методом ПЦР на госпитальные патогены не требуется, при наличии признаков врожденной инфекции необходима диагностика вирусных и внутриутробных бактериальных инфекций и стартовая схема антимикробной терапии для внутриутробных инфекций, включающая ампициллин (или защищенный аминопенициллин) в комбинации с аминогликозидом (гентамицин, нетил-мицин). Изоляция не требуется.

При манифестации признаков инфекции у ребенка после 72 ч пребывания в ОРИТН или новый вираж инфекции, а также при переводе ребенка в отделение из другого стационара требуется обязательное обследование на госпитальные патогены и гены резистентности. При получении положительного результата необходима немедленная изоляция пациента для исключения колонизации полирезистентными УПМ окружающих новорожденных. Если признаков инфекции нет, необходимо ограничиться изоляцией, если признаки инфекции присутствуют, проводить коррекцию антимикробной терапии в соответствии с табл. 2.

Обсуждение

Многофакторность взаимодействия микроорганизмов с организмом человека и интенсивное развитие новых методических возможностей для микробиологических исследований диктует необходимость разработки инновационных комплексных диагностических инструментов, позволяющих оценить генетические свойства отдельно взятых клинически значимых штаммов УПМ, в частности выявлять гены резистентности возбудителей нозокомиальных оппортунистических инфекций к антимикробным препаратам. Получение данных о резистентности возбудителей нозокомиальных оппортунистических инфекций существенно повышает эффективность лечения подобных заболеваний. В эпоху нарастания лекарственной устойчивости ответственность за использование антибиотиков приобретает первостепенное значение.

Классическим методом («золотым стандартом») выявления резистентных штаммов УПМ является культуральное исследование с определением видовой принадлежности микроорганизма и индикацией маркеров резистентности. Однако этот метод предполагает обязательное выделение чистой культуры и дополнительное тестирование антибиотикорезистентности по фенотипическим признакам, что пролонгирует получение конечного результата до 2-3 сут в зависимости особенностей возбудителей и их состава.

Помимо культурального исследования существуют способы выявления резистентных штаммов с применением технологий молекулярной диагностики. В основе таких способов лежит метод ПЦР, суть которого состоит в том, что в исследуемый образец, предположительно содержащий тот или иной микроорганизм или ген, вносятся искусственно синте-

зированные нуклеотидные последовательности (праймеры), специфически комплементарные генетическому материалу искомого микроорганизма или гена. В процессе ПЦР при наличии искомого микроорганизма/гена нарастание концентрации специфических молекул ДНК происходит в геометрической прогрессии, и после 30-40 циклов она достигает значений, при которых возможна визуальная регистрация результатов реакции.

Предлагаемая технология представляет собой способ выявления маркеров резистентности к ß-лактамным антибиотикам и гликопептидам у женщин репродуктивного возраста и новорожденных путем анализа ДНК микроорганизмов, а также для выявления ДНК УПМ и избранных маркеров резистентности к ß-лактамным антибиотикам и гликопептидам. Она позволяет в течение короткого времени (несколько часов) идентифицировать любые микроорганизмы: аэробные и анаэробные; условно-патогенные и облигатно патогенные. Так, например, в соответствии с данными Европейских стандартов диагностики и лечения заболеваний, передаваемых половым путем (2004), чувствительность ПЦР в диагностике хламидийной инфекции составляет 70-95%, специфичность 97-99%. К достоинствам метода следует отнести возможность тестирования большого количества любых клинических образцов. Диагностическая ценность признана во всем мире и метод широко используется в лабораторной практике.

Представленная технология относится к области медицины: к акушерству, гинекологии, неонатологии, микробиологии, молекулярной генетике, клинической лабораторной диагностике, - и может быть использована для выявления основных возбудителей нозокомиальных оппортунистических инфекций и маркеров их резистентности к ß-лактамным антибиотикам и гликопептидам для выбора оптимальной стратегии лечения пациентов в медицинских учреждениях акушерского, гинекологического и неонатологического профиля.

Заключение

Представленная технология может быть востребована сетью акушерских и гинекологических стационаров, перинатальными центрами, женскими консультациями, а также коммерческими медицинскими центрами и лабораториями. Кроме того, изобретение можно использовать в научно-исследовательской практике. Данная методика отличается тем, что предлагает комплексное решение, учитывающее специфику выявления инфекционных заболеваний, вызванных УПМ у женщин репродуктивного возраста и новорожденных. Технологи предполагает идентификацию как основных УПМ - возбудителей нозокомиальных оппортунистических инфекций, так и наиболее распространенных генов, обусловливающих резистентность УПМ к ß-лактамным антибиотикам и гликопептидам. Кроме того, технология отличается уникальным набором предоставляемых показателей и включает аналитический компонент - алгоритм, позволяющий на основе результатов выбрать оптимальную стратегию лечения для каждого отдельно взятого пациента.

СВЕДЕНИЯ ОБ АВТОРАХ

ФГБУ «НМИЦ АГП им. В.И. Кулакова» Минздрава России, Москва, Российская Федерация:

Припутневич Татьяна Валерьевна (Tatiana V. Priputnevich) - доктор медицинских наук, заведующая отделом микробиологии и клинической фармакологии E-mail: priput1@gmail.com https://orcid.org/0000-0002-4126-9730

Любасовская Людмила Анатольевна (Lyudmila A. Lyubasovskaya) - кандидат медицинских наук, заведующая отделением клинической фармакологии отдела микробиологии и клинической фармакологии E-mail: labmik@yandex.ru https://orcid.org/ 0000-0002-7456-9940

Трофимов Дмитрий Юрьевич (Dmitry Yu. Trofimov) - доктор биологических наук, профессор РАН, директор института репродуктивной генетики E-mail: molgen@bk.ru https://orcid.org/0000-0002-1569-8486

Донников Андрей Евгеньевич (Andrey E. Donnikov) - кандидат медицинских наук, заведующий лабораторией молекулярно-

генетических методов

E-mail: a_donnikov@oparina4.ru

https://orcid.org/0000-0003-3504-2406

Быстрицкий Андрей Александрович (Andrey A. Bystritsky) - кандидат биологических наук, ведущий научный сотрудник лабораторией молекулярно-генетических методов E-mail: andrey.bystritskiy@yandex.ru https://orcid.org/0000-0002-0436-9951

Гордеев Алексей Борисович (Alexey B. Gordeev) - кандидат биологических наук, старший научный сотрудник лаборатории микробиологии

E-mail: gordeew@vega.protres.ru https://orcid.org/0000-0002-9171-5276

Сердюкова Дарья Михайловна (Darya M. Serdyukova) - старший научный сотрудник, врач клинический фармаколог, кандидат медицинских наук, отделение клинической фармакологии отдела микробиологии, клинической фармакологии и эпидемиологии

E-mail: d_serdyukova@oparina4.ru https://orcid.org/0000-0002-4660-9052

Шабанова Наталья Евгеньевна (Natalia E. Shabanova) - научный сотрудник, врач клинический фармаколог, кандидат медицинских наук, отделение клинической фармакологии отдела микробиологии, клинической фармакологии и эпидемиологии E-mail: n_shabanova@oparina4.ru https://orcid.org/0000-0001-6838-3616

ЛИТЕРАТУРА

1. Руднов В.А., Бельский Д.В., Дехнич А.В. Инфекции в ОРИТ России: результаты национального многоцентрового исследования // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2011. Т. 13, № 4. С. 294-303.

2. Zhao G., Usui M.L. Biofilms and Inflammation in Chronic Wounds // Adv. Wound Care (New Rochelle). 2013. Vol. 2. Р. 389-399.

3. Ионов О.В., Никитина И.В., Бурменская О.В., Непша О.С., Трофимов Д.Ю., Донников А.Е.. Роль метода ПЦР в диагностике врожденных

и нозокомиальных инфекций у новорожденных // Акушерство и гинекология. 2013. № 11. С. 59-64.

4. Pfeifer Y., Cullik A., Witte W. Resistance to cephalosporins and carbapenems in Gram-negative bacterial pathogens // Int. J. Med. Microbiol. 2010. Vol. 300. Р. 371-379.

5. Уляшова М.М., Халилова Ю.И., Рубцова М.Ю. и др. Олигонукле-отидный микрочип для идентификации генов карбапенемаз молекулярных классов A и D // Acta Naturae. 2010. № 2. С. 116-125.

REFERENCES

1. Rudnov V.A., Belsky D.V., Dehnich A.V. I Infections in Russian ICUs: Results of the Nationwide Multicenter Study Klinicheskaya mikrobiologiya i antimikrobnaya himioterapiya [Clinical Microbiology and Antimicrobial Chemotherapy]. 2011; 13 (4): 294-303. (in Russian)

2. Zhao G., Usui M.L. Biofilms and Inflammation in Chronic Wounds. Adv Wound Care (New Rochelle). 2013; 2: 389-99.

3. Ionov O.V., Nikitina I.V., Burmenskaya O.V., Nepsha O.S., Trofimov D.Yu., Donnikov A.E. The role of the PCR method in the diagnosis

of congenital and nosocomial infections in newborns. Akusherstvo i ginekologiya [Obstetrics and Gynecology]. 2013; 11: 59-64. (in Russian)

4. Pfeifer Y., Cullik A., Witte W. Resistance to cephalosporins and carbapenems in Gram-negative bacterial pathogens. Int J Med Microbiol. 2010; 300: 371-9.

5. Ulyashova M.M., Khalilova Yu.I., Rubtsova M.Yu., et al. Oligonucleotide microchip for identification of carbapenemase genes of molecular classes A and D.Acta Naturae. 2010; 2: 116-25. (in Russian)

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.