CC BY
10Изучение циркуляции вируса гепатита А в г. Санкт-Петербурге в 1997-2003 гг.
С .Л. Мукомолов1, И. Давидкин2, Н.В. Железнова1, С. Йокинен2, М. Контио2
1Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии имени Пастера 2Институт национального здравоохранения Финляндии, Хельсинки
Краткий обзор Цель исследования: проведение молекулярно-эпидемиологических исследований штаммов вируса гепатита А (ГА) на территории Санкт-Петербурга и Карелии в 19972003 гг.
Результаты. Вирусную РНК выделяли из клинических образцов (фекалий или сыворотки крови), а также проб сточной воды. Полимеразную цепную реакцию с обратной транскрипцией (ОТ-ПЦР) воспроизводили с использованием различных праймеров из VP1/2A и VP1 вариабельных участков генома вируса ГА. После сиквенса продуктов ПЦР филогенетический анализ осуществляли путём сравнения 306 нуклеотидов из участка генома VP1/2A и 332 нуклеотидов из участка генома VP1. Полученные результаты показывают, что в изученный период превалировал субгенотип IA (>90 % изолятов вируса принадлежали к этому субгенотипу). Штаммы вируса ГА, выделенные от лиц, употреблявших наркотические препараты внутривенно, относились к субгенотипам 1А или IIIA. Только 1 из 82 секвенированных изолятов вируса принадлежал к субгенотипу 1В. Субгенотипы IB и IIIA были обнаружены только в период 2001-2003 гг., что свидетельствует о вовлечении новых штаммов вируса ГА в эпидемическую ситуацию.
Заключение. Полученные результаты подтверждают преимущество методов молекулярной эпидемиологии при мониторинге циркулирующих штаммов вируса ГА, а также при изучении путей распространения этого вируса. Ключевые слова: вирус гепатита А, филогенетический анализ
Abstract The study of Hepatitis A virus circulation in Saint Petersburg in 1997-2003
S.L. Mukomolov1,1. Davidkin2, N.V. Zheleznova1, S. Jokinen2, M. Kontio2
1Saint Petersburg Pasteur Institute, Russia;
2National Institute for health and welfare, Helsinki, Finland
Aim. The molecular epidemiology of hepatitis A virus (HAV) strains circulating in the St. Petersburg and Karelia regions was studied during 1997-2003.
Results. Hepatitis A virus RNA was isolated from both clinical samples (stools or sera) and environmental samples (sewage water). RT-PCR was carried out using different primer pairs from the VP1/2A and VP1 genomic regions, the variable parts of the HAV genome. Polymerase chain reaction (PCR) products were sequenced and 306 nucleotides from the VP1/2A and 332 nucleotides from the VP1 region were used for phylogenetic analysis. The results show that the IA subtype was the most common during the follow-up period: >90 % of the isolated HAV strains belonged to that subtype. The HAV strains found in intravenous drug users belonged to subtypes IA and IIIA. Only one out of a total of 82 sequenced strains was of the IB subtype. The subtypes IB and IIIA were found only in 2001-2003, which suggests that new strains were introduced into the endemic situation.
Conclusion. Our results indicate the usefulness of molecular epidemiological methods in studying changes in the circulating HAV strains and in tracing transmission routes. Key words: hepatitis A virus, phylogenetic analysis.
Введение
Гепатит А (ГА) остается эндемичным заболеванием в большинстве стран мира. Инфекционным агентом, вызывающим это заболевание, является вирус ГА (ВГА), относящийся к семейству Picornaviridae, род Нера^уиш. Передача вируса происходит преимущественно при тес-
ных контактах с ГА или через контаминиро-ванную возбудителем пищу и воду.
В середине 90-х годов появились публикации, свидетельствующие о распространении вируса ГА среди лиц, вводящих наркотические препараты внутривенно, при использовании ими общих игл для инъекций или в условиях тесного бытового контакта [1,2]. Вспышки ГА,
обусловленные употреблением морепродуктов (моллюски, креветки) и других пищевых продуктов, контаминированных ВГА, также имеют место в различных странах [3]. В настоящее время известны 3 генотипа ВГА, которые распространены среди людей (I, II, III I), однако существует только один серотип вируса [4,5]. Последнее делает возможным защитить человека от любого генотипа ВГА путём вакцинации.
Наиболее превалирующим в мире является генотип I, субгенотип А ВГА [6,7]. Субгенотип 1В также распространен повсеместно, однако в меньшей, чем субгенотип IA, степени [8,9]. Вспышки ГА среди наркоманов вызваны в большинстве случаев субгенотипом IIIA [1013]. ГА является эндемичным заболеванием на территории Северо-Запада Российской Федерации. В период 1997-2003 гг. заболеваемость ГА варьировала в пределах от 19,8 до 199,8 на 100 000 населения, и большая вспышка ГА была зарегистрирована в 2000-2001 гг. в Санкт-Петербурге [14]. По данным сероэпидемиоло-гических исследований, проведенных в 1999 г. в г. Санкт-Петербург, около 20% детей в возрасте 10 лет и более и 70% взрослых в возрасте 40 лет имели IgG антитела к ВГА [15]. В настоящее время имеются лишь немногочисленные дан-
Более 90% пациентов были госпитализированы, у всех была зарегистрирована желтуха. Средний возраст больных составил 28±6 лет (от 16 до 47 лет). Пробы были получены на 0-34 день болезни. До исследования образцы хранили при -20°С.
ные о штаммах ВГА, циркулирующих на территории России.
Целью настоящего исследования явилось изучение циркулирующих в Санкт-Петербурге и соседнем с ним регионе Северо-Запада России штаммов ВГА.
Образцы для исследований были получены от пациентов с ГА (фекалии, сыворотки крови) и из проб сточной воды. Формат исследований позволил проследить за возможными изменениями в штаммах вируса в изученный период, а также выявить возможные пути его распространения.
Образцы
Сыворотки крови и образцы стула были получены от больных с лабораторно подтвержденным ГА (позитивный тест на анти-ВГА IgM в ИФА) в г. Санкт-Петербург (спорадические случаи и материал от больных, взятый во время вспышки). Пробы сточной воды были взяты из городских канализационных коллекторов. Всего было изучено 24 образца стула и 117 сывороток от больных ГА, а также 15 проб сточной воды. Образцы стула были собраны в г. Санкт-Петербург в период 1997-2000 гг., сыворотки крови и пробы сточной воды — в 2000-2003 гг. (табл. 1).
Выделение РНК и постановка ОТ-ПЦР
РНК ВГА выделяли непосредственно из клинических образцов и проб сточной воды. Образец стула в объеме 100 мкл смешивали с 900 мкл фосфатного буфера, содержащего 0,15 М NaCl
Таблица 1. Характеристика материала и результаты ПЦР для определения РНК ВГА
Год Материал (число проб) ПЦР (+) абс. (%) Последовательн.* с праймерами из VP1/2A или VP1 Генотип вируса Территория
1997 Образец стула (4) 2 (50) 2 IA С.-Петербург
1998 Образец стула (7) 5 (71) 5 IA С.-Петербург
1999 Образец стула (2) Сыворотка (3) 1 (50) 2 (67) 1 2 IA Респ. Карелия С.-Петербург
2000 Образец стула(11) Сыворотка (15) 8 (73) 4 (27) 8 4 IA С.-Петербург С.-Петербург
2001 Сыворотка (49) Сыворотка (6) 33 (67) 3 (50) 29 2 1АД11А IA С.-Петербург Респ. Карелия
2002 Сыворотка (26) Сыворотка (7) Сточная вода (15) 17 (65) 3(43) 9(60) 20 1 2 IA IA IA С.-Петербург Респ. Карелия Лен. обл.
2003 Сыворотка (11) 10 (91) 12 1АДВ С.-Петербург
Всего 156 97 (62) 88
* — все последовательности не показаны на рис. 1 и рис. 2
(ФБР), интенсивно встряхивали, затем центрифугировали и 100 мкл супернатанта вносили в колонку из набора RNeasy Mini Kit (QIAgen GmbH, Hilden, Germany). Далее выделение РНК проводили согласно инструкции, прилагаемой к набору. При выделении РНК из сыворотки крови или образцов сточной воды пробу в объеме либо <200 мкл или 200-1000 мкл вносили в пробирку соответственно либо с 0,9 или 2 мл лизирующего буфера из набора NucliSens (bio-Meriéux bv, Boxtel, The Netherlands). Далее выделение РНК проводили с использованием реагентов из набора NucliSens (bioMeriéux bv, Box-tel) согласно прилагаемой инструкции производителя.
Участок генома вируса ГА VP1/2A и часть гена VP1 амплифицировали в ОТ-ПЦР. Синтез кДНК и ПЦР проводили с использованием обратной транскриптазы AMV (Finnzymes Oy, Finland) и Taq ДНК-полимеразы (Promega, USA), соответственно, в период исследований до конца 1999 г. Начиная с 2000 г. для этих целей использовали обратную транскриптазу M-MLV (Invitrogen, Life Technologies, USA) и ДНК-поли -меразу HotStarTaq (OIAgen), соответственно. Праймеры из участка генома VP1/2A, +2799, +2891, -3265 и -3375 [7] давали продукты ПЦР, состоящие из 600 нуклеотидов и 394 нуклеоти-дов, соответственно, для 1-й и «гнездной» ПЦР. Праймеры VP1 (НА2112, HA1369S и HA1865AS) [13] давали ПЦР продукты длиной в 571 нуклео-тид и 518 нуклеотидов для 1-й и «гнездной» ПЦР соответственно. «Гнездную» ПЦР использовали в случае получения негативных результатов в 1-ой ПЦР.
Секвенирование
Продукты амплификации, которые получали в ОТ-ПЦР, очищали с использованием либо QI-Aquick PCR Purification Kit, либо QIAquick Gel Extraction Kit (QIAgen GmbH, Hilden, Germany). Прямое определение последовательности нуклеотидов осуществляли на автоматическом ДНК секвенаторе ABI 377 (РЕ Applied BioSystems, Foster City, CA) с реагентами ABI Prism Big Dye Terminator Cycle Sequencing Ready Reaction Kit. Субгенотип вируса и взаимосвязь полученных изолятов определяли методом филогенетического анализа 316 нуклеотидов из участка генома VP1/2A и 332 нуклеотидов из VP1 с применением алгоритма «объединения ближайших соседей» по двухпараметровой модели Кимура в компьютерной программе Clustal W.
Полученные изоляты вируса ГА были направлены в ОепеВапк и зарегистрированы под входящими номерами ЕР382366-ЕР382410.
Результаты
Выделение РНК и постановка ОТ-ПЦР
Для выявления РНК вируса ГА было изучено 24 образца стула, собранные в период 1997-2000 гг., сыворотки от 117 больных и 15 проб сточной воды, в основном полученные в период 2001-2003 гг. Постановку ОТ-ПЦР проводили с различными праймерами из участка УР1/2А или УР1 генома вируса. В результате 97 из 156 (62%) образцов оказались положительными в ПЦР. РНК ВГА была обнаружена в 16 (67%), 74 (66%) и 9 (60%) пробах стула, сыворотках и пробах сточной воды, соответственно. Всего для последующего филогенетического анализа было получено 88 последовательностей нуклеотидов в амплифицированных участках генома. Из этих последовательностей 16 были получены из проб стула, 70 — из сывороток крови и 2 из проб сточной воды. Всего же 49 последовательностей были из участка генома вируса УР1/2А и 39 из УР1. Последовательности нуклеотидов из обоих участков генома были получены для 12 образцов.
Филогенетический анализ и молекулярная эпидемиология
С использованием филогенетического анализа было показано, что в период 1997-2003 гг. в Санкт-Петербурге превалирующим был генотип I ВГА, субгенотип А. Два филогенетических древа (рис. 1; рис. 2) построены на основе последовательностей из различных участков генома вируса.
На рисунке 1 представлена дендрограмма 46 штаммов ВГА , построенная на основе сравнения 306 нуклеотидов из участка генома вируса УР1/2А.
Все изоляты из образцов стула в 1997-2000 гг. принадлежали к субгенотипу 1А, так же как изоляты из проб сточной воды, в то время как все изоляты вируса из сывороток, собранные после 2000 г., относились к субгенотипам 1А, 1В или ША (рис. 2). Все 4 изолята ВГА, которые были получены из образцов стула (1) и сывороток крови (3) на территории Карелии в 1999 г., 2001 г. и 2002 г. принадлежали к субгенотипу 1А.
Все штаммы ВГА, которые были выделены из проб, собранных во время вспышек ГА или от спорадических случаев ГА на территории Ленинградской обл. (Гатчина), относились к
субгенотипу 1А. И только один изолят вируса принадлежал к субгенотипу 1В. Он был импортирован из-за рубежа, что было подтверждено документально историей болезни больного ГА, от которого был выделен этот штамм. Два штамма ВГА, которые были выделены из проб
сточной воды, собранной на территории Ленинградской обл., принадлежали к субгенотипу 1А и практически не отличались от изолятов, полученных в это же время от больных на этой же территории. Различия среди изолятов вируса субгенотипа 1А были незначительны (<5%).
IA
IB
RUS 21 01 — RUS 85 01 RUS 1 00 RUS 62 01 RUS 25 02 RUS 9 00 RUS 2 01 RUS 23 02 RUS 17 03 RUS 50 02 RUS 60 01 I— RUS 30 01 RUS 74 01 ■ RUS_9 98 . RUS 8 98 V- RUS 13 98 RUS 1 99
- RÜS 4 97
- RUS 7 98 RUS ' 10 99 RUS 15 00 RUS 15 01 RUS 16 01 j RUS 2 00 1 RUS 6 01
rt
-L
- RUS 4 00 RUS 5 97 RUS 10 98 - RÜS 16 03
St. Petersburg IVDU (2) St. Petersburg St. Petersburg (2) St. Petersburg Ghatchina outbreak (4) St. Petersburg (2) St. Petersburg Ghatchina outbreak Ghatchina sporadic Ghatchina sewage water St. Petersburg St. Petersburg IVDU Karelia St. Petersburg St. Petersburg St. Petersburg Karelia St. Petersburg St. Petersburg St. Petersburg (2) St. Petersburg (3) St. Petersburg (6) St. Petersburg St. Petersburg St. Petersburg IVDU St. Petersburg (3) St. Petersburg St. Petersburg Ghatchina sporadic - RUS 83 01 St. Petersburg IVDU
IIIA
.10
Рис. 1. Генетические взаимоотношения 44 Российских изолятов ВГА, выделенных в 1997-2003 гг. Сравнение выполнено на основании 306 нуклеотидов из региона VP1/2A. Происхождение изолята указано для каждого из них, а в скобках указано число идентичных изолятов.
Однако на рисунке 1 можно выделить несколько кластеров среди изолятов вируса этого субгенотипа, связанных с годом сбора материала или периодом локальных вспышек заболевания. Вместе с тем несколько идентичных штаммов были выявлены в случае образцов, собранных в разные годы и на разных территориях.
Четыре штамма ВГА, выделенные из сывороток инъекционных наркоманов в 2001 г., образовали кластер в пределах субгенотипа ША, в то время как другие 4 изолята, выделенные от больных из этой группы риска, принадлежали к субгенотипу 1А. В то же время один изолят ВГА, который был получен из сыворотки больного, не принадлежащего к группе инъекционных наркоманов, также относился к субгенотипу ША.
На рисунке 2 представлено филогенетическое древо для некоторых штаммов ВГА из Рос-
сии и отдельных штаммов из других стран, которое построено на основе 332 нуклеотидов из участка VP1 генома вируса. Видно, что большинство штаммов ВГА, относящихся к субгенотипу ША, были выделены от инъекционных наркоманов.
При сравнении штаммов ВГА из России со штаммами из Эстонии, Норвегии, Германии и Финляндии было установлено, что 4 штамма из России и 4 штамма из Эстонии, выделенные от инъекционных наркоманов, явно образуют отдельные кластеры. Штамм из Норвегии несколько отличается от штаммов из Эстонии. Однако один штамм из Эстонии (выделен от ребШка в 1995 г.) и один штамм из Германии (2003 г.) расположены на дереве ближе к кластеру штаммов из России. И один штамм из России локализован отдельно от других штаммов ВГА субгенотипа IIIA, ближе к штамму вируса из Панамы.
IA
IB
RUS 17 03
--FIN 20 03
- FIN 106 03 L RUS 23 02 L RUS 2 01 - AB020569
- AY221836
L RUS 63 01 AY221883
— RUS 76 01
— AB020564
— HPA RUS 16 03
IMA
Russia Vp1 332nt 24.8.2006
- RUS 32 01 IVDU SHVVP1CP I RUS 83 01 IVDU 1 RUS 31 01 RUS 89 01 L RUS 92 01 IVDU — AY644337 AY221873 AY221874 AY221880 AY221876 HEA299464
.10
Рис. 2. Генетические взаимоотношения Российских и на основе 332 нуклеотидов из VP1 региона генома.
Дискуссия
Методы молекулярной эпидемиологии позволяют дать лучшее представление о генотипах вируса, циркулирующих на конкретной территории, а также о путях распространения этой инфекции. В результате многочисленных исследований изолятов ВГА было показано, что наиболее широко распространен в мире субгенотип IA. Он является превалирующим в Северной Америке, Китае, Японии, в странах бывшего СССР и Тайланде [4]. В середине 80-х гг. прошлого столетия была замечена только одна публикация, в которой изучение генотипов ВГА было проведено в бывшем СССР [16]. Выделенный там штамм вируса принадлежал к субгенотипу IA. Однако в 2006 г. появилась новая публикация по результатам филогенетического анализа штаммов ВГА, выделенных в регионе Сибири (Россия) [17]. И также было показано, что все изоляты относились к субгенотипу вируса IA.
Современное представление о циркулирующих на территории Северо-Запада России генотипов ВГА было неизвестно до настоящего момента.
В результате проведенных исследований было показано, что 3 субгенотипа ВГА — IA, IB and IIIA — циркулировали в 1997-2003 гг. на территории Санкт-Петербурга и его региона, включая пригород (г. Гатчина), а также Респуб-
других изолятов субгенотипа ША. Сравнение выполнено
лику Карелия. Методом филогенетического анализа более 60 штаммов ВГА, которые были выделены в этой работе, было установлено, что субгенотип 1А является доминирующим на этой территории России. И более того, явно наиболее превалирующим по сравнению с другими субгенотипами в указанный период наблюдений.
Фекально-оральный механизм передачи этого вируса может реализовываться при использования контаминированных воды или пищи, а также при тесном контакте с больными ГА. В случае передачи вируса через пищу или при тесных контактах с больными ГА обнаруживают обычно только незначительное количество различных изолятов вируса [18]. Однако в случае контаминации ВГА воды и при реализации этого пути распространения вируса циркулирующие штаммы вируса могут быть выделены с большей частотой. Даже в случае водной вспышки ГА несколько штаммов вируса одного субгенотипа могут циркулировать в течение длительного периода без каких-либо значительных изменений в их нуклеотидных последовательностях. Например, по данным Агаиг-Яшг е! а1., 2001 [19] 4 основных штамма вируса субгенотипа 1А циркулировали в Коста-Рика в течение 40 лет.
По нашим данным, несколько штаммов ВГА субгенотипа 1А циркулировали в регионе Санкт-Петербурга, что видно на филогенетиче-
ском древе, и они группировались отдельно. Это подтверждает основную идею о том, что питьевая вода, контаминированная ВГА, является основным фактором передачи этого вируса в регионе Санкт-Петербурга. Еще одним свидетельством в пользу этой идеи является тот факт, что выделенные нами из проб сточной воды штаммы вируса субгенотипа IA были родственны изолятам, полученным от больных ГА.
Следует отметить, что выделенные в 1997— 1998 гг. в Санкт-Петербурге штаммы ВГА (годы с низкой заболеваемостью ГА) не группируются вместе со штаммами, выделенными в 20002001 г. (годы с высокой заболеваемостью ГА). Учитывая утверждение некоторых авторов о высокой консервативности изолятов ВГА субгенотипа IA [12,19] можно предположить, что вспышка ГА в нашем регионе (городе) в 20002001 гг. была обусловлена появлением нового более «агрессивного» штамма субгенотипа IA (рис. 1). С другой стороны, в 2001 г. от нескольких больных ГА в Санкт-Петербурге был впервые выделен штамм субгенотипа IIIA. В публикации Robertson et al.,1992 г. [7] было уже замечено, что субгенотип IIIA ВГА является эндемичным для стран Юго-Западной и Центральной Азии (Индия, Шри-Ланка, Непал и др. страны). Это нашло свое подтверждение и в появившихся недавно публикациях по молекулярной эпидемиологии ВГА в Индии [20,21].
Согласно мнению ученых из Норвегии [12] HAV субгенотип IIIA вновь появился в Европе в последние несколько лет, и это было частично связано со вспышками ГА среди инъекционных наркоманов. Первая официально зарегистрированная в 1980-х гг. вспышка ГА среди инъекционных наркоманов, вызванная субгенотипом IIIA, имела место в Швеции [7]. Начиная с этого времени несколько вспышек ГА, связанных с субгенотипом IIIA, были описаны среди инъекционных наркоманов в Норвегии [11], Великобритании [10,22], Эстонии [13] и Италии [23].
В наших исследованиях случаи ГА субгенотипа IIIA были впервые выявлены только в 2001 г. Этот год, как и предыдущий 2000 г. были годами наибольшей официально зарегистрированной Санкт-Петербургским ЦГСЭН заболеваемости ГА за период 1997-2003 гг. (рис. 3)
Ранее нами были опубликованы данные об эпидемическом распространении парентерально передающихся гепатитах В и С в связи с инъекционным употреблением наркотиков в
Санкт-Петербурге в конце 1990-х г. и начале 2000-х г. [24,25].
Следует особо подчеркнуть, что 4 из 5 случаев изолятов вируса субгенотипа ША в Санкт-Петербурге в 2001 г. были связаны с инъекционными наркоманами. Таким образом, появление субгенотипа ША ВГА среди циркулирующих штаммов вируса, наряду с высокой заболеваемостью ГА в Санкт-Петербурге в эти годы, может свидетельствовать о том, что в 2001 г. в Санкт-Петербурге имело место скрытая вспышка ГА субгенотипа ША среди инъекционных наркоманов. Эта гипотеза подтверждается данными, что наиболее высокая заболеваемость в 2001 г. была зарегистрирована в возрастных группах 15-19 и 20-29 лет и составляла 346 и 303,9 на 1 000 000 населения соответственно (по данным Санкт-Петербургского ЦСЭН). Среди больных ГА в этих возрастных группах 23-28% были ко-инфицированы вирусами гепатитов В, С, ВИЧ.
Годы
Рис. 3. Заболеваемость гепатитом А и выявленные генотипы ВГА в Санкт-Петербурге в 1997-2003 гг.
По данным Tallo Т. et al., 2001 г. [13], вспышка ГА субгенотипа IIIA была зарегистрирована в Эстонии в 1998-1999 гг., т.е. за 2 года до появления вспышки ГА в Санкт-Петербурге.
Из этого можно сделать вывод о том, что появление субгенотипа ША в Санкт-Петербурге напрямую связано с его экспортом из соседней Эстонии вследствие возможного тесного контакта между инъекционными наркоманами в этих двух странах. Однако филогенетический анализ пяти штаммов вируса субгенотипа ША, выделенных в 2001 г. в Санкт-Петербурге, показывает, что ни один из них не группируется вместе с изолятами субгенотипа ША от наркоманов из Эстонии. Четыре изолята субгенотипа IIIA от наркоманов из Санкт-Петербурга образуют четкий отдельный кластер (рис. 2). Для подтверждения факта, что эти изоляты от инъекционных наркоманов из Санкт-Петербурга действительно уникальны, необходимы дополнительные исследования.
Остается очень важным вопрос о том, действительно ли субгенотип IIIA существует (выживает) как биологический вид в Европе. Трудно предположить, что этот вирус распространяется только парентеральным путем. В странах, эндемичных по субгенотипу IIIA, например в Индии, этот тип ВГА вызывал большие водные вспышки заболевания [19]. Мы обнаружили только один случай выделения субгенотипа IIIA в 2001 г. В Санкт-Петербурге, который не был связан с инъекционными наркоманами. Этот изолят не группировался с кластером штаммов от инъекционных наркоманов и был ближе к вирусу, выделенному в Панаме в 1980 г. Таким образом, по крайней мере, 2 штамма вируса субгенотипа IIIA циркулировали в Санкт-Петербурге в 2001 г.
Среди инъекционных наркоманов с клиническими признаками ГА циркулировали как субгенотип IIIA, так и доминирующий субгенотип вирусаIA.
В отличие от изолятов субгенотипа IIIA, выделенных от инъекционных наркоманов, штаммы субгенотипа IA на филогенетическом дереве были перемешены со штаммами, выделенными от других больных ГА. Объяснением этому может служить предположение о том, что некоторые больные ГА в группе инъекционных наркоманов были заражены традиционными способами передачи вируса.
Таким образом, молекулярно-эпидемиоло-гические исследования ГА в Санкт-Петербурге в период 1997-2003 гг. позволяют предположить , что большая вспышка ГА в 2000-2001 гг. могла быть вызвана появлением нового штамма ВГА субгенотипа IA, наряду с вовлечением в циркуляцию новых ВГА, принадлежащих к субгенотипу IIIA, что повлекло за собой вспышку ГА среди инъекционных наркоманов. Постоянный мониторинг циркулирующих в регионе штаммов вируса ГА весьма полезен для выявления изменений в распространении вируса и проведения своевременных противоэпидемических мероприятий.
Литература
[1] Grinde В., Stene-Johansen К., Sharma В., Hoel T., Jensenius M., Skaug К. Characterisation of an epidemic of hepatitis A virus involving intravenous drug abusers-infection by needle sharing?//J. Med. Virol. - 1997. - Vol. 53. - P. 69-75.
[2] Leino T., Leinikki P., Hyypia T., Ristola M., Suni J., Sutinen J., Holopainen A., Haikala O., Valle M., Rostila T. Hepatitis A outbreak amongst intravenous amphetamine abusers in Finland // Scand. J. Infect. Dis. - 1997. - Vol. 29. - P. 213216.
[3] Fiore A.E. Hepatitis A transmitted by food // Clin. Infect. Dis.
- 2004. - Vol. 38. - P. 705-715.
[4] Costa-Mattioli M., Di Napoli A., Ferre V., Billaudel S., Perez-Bercoff R., Cristina J. Genetic variability of hepatitis A virus // J. Gen. Virol. - 2003. - Vol. 84. - P. 3191-3201.
[5] Lemon S.M., Jansen R.W., Brown E.A. Genetic, antigenic and biological differences between strains of hepatitis A virus // Vaccine. - 1992. - Vol. 10. - P. 40-44.
[6] Bruisten S.M., van Steenbergen J.E., Pijl A.S., Niesters H.G., van Doornum GJ., Coutinho R.A. Molecular epidemiology of hepatitis A virus in Amsterdam, the Netherlands // J. Med. Virol. - 2001. - Vol. 63. - P. 88-95.
[7] Robertson B.H., Jansen R.W., Khanna B., Totsuka A., Nainan O.V., Siegl G., Widell A., Margolis H.S., Isomura S., Ito K. Genetic relatedness of hepatitis A virus strains recovered from different geographical regions//J. Gen. Virol. - 1992. - Vol. 73. - P. 1365-1377.
[8] Chironna M., Grottola A., Lanave C., Villa E., Barbuti S., Quarto M. Genetic analysis of HAV strains recovered from patients with acute hepatitis from Southern Italy // J. Med. Virol. -2003. - Vol. 70. - P. 343-349.
[9] de Paula V.S., Baptista M.L., Lampe E., Niel C., Gaspar A.M. Characterization of hepatitis A virus isolates from subgeno-types IA and IB in Rio de Janeiro, Brazil // J. Med. Virol. -2002. - Vol. 66. - P. 22-27.
[10] O'Donovan D., Cooke R.P., Joce R., Eastbury A., Waite J., Stene-Johansen K. An outbreak of hepatitis A amongst injecting drug users // Epidemiol. Infect. - 2001. - Vol. 127. - P. 469-473.
[11] Stene-Johansen K., Skaug K, Blystad H., Grinde B. A unique hepatitis A virus strain caused an epidemic in Norway associated with intravenous drug abuse. The Hepatitis A Study Group//Scand. J. Infect. Dis. - 1998. - Vol. 30. - P. 35-38.
[12] Stene-Johansen K., Jonassen T.O., Skaug K. Characterization and genetic variability of Hepatitis A virus genotype IIIA//J. Gen. Virol. - 2005. - Vol. 86. - P. 2739-2745.
[13] Tallo T., Norder H., Tefanova V., Ott K., Ustina V., Prukk T., Solomonova O., Schmidt J., Zilmer K., Priimagi L., Krispin T., Magnius L.O. - Sequential changes in hepatitis A virus genotype distribution in Estonia during 1994 to 2001 // J. Med. Virol. - 2003. - Vol. 70. - P. 187-193.
[14] Mukomolov S., Shliakhtenko L., Shargorodskaya E., Suliagina L. Viral Hepatitis in Russian Federation / An analytical overview (in Russian). - 2003, St.Petersburg: St.Petersburg Pasteur Institute. - 200 p.
[15] Mukomolov S.L., Shliakhtenko .LI., Valle M., Plotnikova V.A., Davidkin I., Levakova I.A., Samokhina E.V., Andreeva I.A., Dmitrieva T.G. Characteristics of the manifest and latent components of the hepatitis A epidemic process in cities of Russia // Zh Mikrobiol Epidemiol Immunobiol. - 2001. -Vol. 3. - P. 35-39.
[16] Ovchinnikov J., Sverdlov E., Tsarev S., Arsenian S., Rokhlina T. Sequence of 3372 RNA nucleotide links in the hepatitis A virus coding for capsid VP4-VP1 and nonstructural proteins // Docl. Acad. Nauk USSR. - 1985. - Vol. 285. - P. 10141108.
[17] Ternovoi V.A., Chausov E.V., Bondarenko T., Kochneva G.V., Sivolobova G.F., Grazhdantseva A.A., Netesov S.V. Genetic diversity of hepatitis A virus in Siberia // Vopr. Virusol. - 2006.
- Vol. 51. - P. 23-27.
[18] Chironna M., Lopalco P., Prato R., Germinario C., Barbuti S., Quarto M. Outbreak of infection with hepatitis A virus (HAV) associated with a foodhandler and confirmed by sequence analysis reveals a new HAV genotype IB variant //J. Clin. Microbiol. - 2004. - Vol. 42. - P. 2825-2828.
[19] Arauz-Ruiz P., Sundqvist L., Garcia Z., Taylor L., Visona K., Norder H., Magnius L.O. Presumed common source outbreaks of hepatitis A in an endemic area confirmed by limited se-
quencing within the VP1 region //J. Med. Virol. - 2001. -Vol.65. - P. 449-456.
[20] Arankalle VA, Sarada Devi KL, Lole KS, Shenoy KT, Verma V, Haneephabi M. Molecular characterization of hepatitis A virus from a large outbreak from Kerala, India // Indian J. Med. Res. - 2006. - Vol. 123. - P. 760-769.
[21] Hussain Z., Das B.C., Husain S.A., Asim M., Chattopadhyay S., Malik A., Poovorawan Y, Theamboonlers A., Kar P. Hepatitis A viral genotypes and clinical relevance: Clinical and molecular characterization of hepatitis A virus isolates from northern India // Hepatol. Res. - 2005. - Vol. 32. - P. 16-24.
[22] Sundkvist T., Smith A., Mahgoub H., Kirkby A., Kent R., Wreghitt T., Davidkin I. Outbreak of hepatitis A infection among intravenous drug users in Suffolk and suspected risk factors // Commun. Dis. Public Health - 2003. - Vol. 6. - P. 101-105.
Контактная информация Corresponding author
Мукомолов Сергей Леонидович, д.м.н., профессор
Заведующий лабораторией вирусных гепатитов Санкт-Петербургского научно-исследовательского института эпидемиологии и микробиологии им. Пастера 197101, Санкт-Петербург ул. Мира д.14 эл. почта: s.mukomolov(5)mail.ru
Давидкин Ирья, PhD
Ведущий научный сотрудник отдела вирусологии Национального института общественного здравоохранения и благополучия 166, Mannerheimminte, Helsinki, Finland эл. почта: Iria.davidkin@thl.fi
Железнова Нина Всеволодовна, к.б.н.
Ведущий научный сотрудник лаборатории вирусных гепатитов Санкт-Петербургского научно-исследовательского института эпидемиологии и микробиологии им. Пастера 197101, Санкт-Петербург ул. Мира д.14 эл. почта: nzhel@mail.ru
Йокинен Сари
Научный сотрудник
Национального института общественного здравоохранения и благополучия 166, Mannerheimminte, Helsinki, Finland эл. почта: sari.iokinen@thl.fi
Контико Миа
Научный сотрудник
Национального института общественного здравоохранения и благополучия 166, Mannerheimminte, Helsinki, Finland эл. почта: mia.kontio@thl.fi
[23] Spada E., Genovese D., Tosti M.E., Mariano A., Cuccuini M., Proietti L., GiuLi C.D., Lavagna A., Crapa G.E., Morace G., Taf-fon S., Mele A., Rezza G., Rapicetta M. An outbreak of hepatitis A virus infection with a high case-fatality rate among injecting drug users // J. Hepatol. - 2005. - Vol. 43. - P. 958-964.
[24] Beutels P., Shkedy Z., Mukomolov S., Aerts M., Shargo-rodskaya E., Plotnikova V., Molenberghs G., Van Damme P. Hepatitis B in St Petersburg, Russia (1994-1999): incidence, prevalence and force of infection //J. Viral. Hepat. - 2003. - Vol. 10. - P. 141-149.
[25] Kalinina 0., Norder H., Vetrov T., Zhdanov K., Barzunova M., Plotnikova V., Mukomolov S., Magnius L.O. Shift in predominating subtype of HCV from lb to 3a in St. Petersburg mediated by increase in injecting drug use // J. Med. Virol. -2001. - Vol. 65. - P. 517-524.
Prof. Mukomolov Sergey Leonidoich, MD, PhD, DSc
Head of Viral Hepatitis Laboratory Saint-Petersburg Pasteur Institute 197101, Saint-Petersburg, Mira str 14. e-mail: s.mukomolov@mail.ru
Davidkin Irja, PhD
Leader researcher Department of virology
National institute for public health and welfare 166, Mannerheimminte, Helsinki, Finland e-mail: Iria.davidkin@thl.fi
Zheleznova Nina Vsevolodovna, PhD
Leader researcher of Viral Hepatitis Laboratory Saint-Petersburg Pasteur Institute 197101, Saint-Petersburg, Mira str 14. e-mail: nzhel@mail.ru
Jokinen Sari
Researcher
National institute for public health and welfare 166, Mannerheimminte, Helsinki, Finland e-mail: sari.iokinen@thl.fi
Kontio Mia
Researcher
National institute for public health and welfare 166, Mannerheimminte, Helsinki, Finland e-mail: mia.kontio@thl.fi
