CC BY
15ЛИТЕРАТУРА
1. Арутюнов С.Д., Ибрагимов Т.И., Царев В.Н., Савкина Н.И., Трефилов А.Г. Микробиологическое обоснование выбора базисной пластмассы съемных зубных протезов . Стоматология. 2000, 3: 4-8.
2. Кучерова М.А., Трефилов А.Г. Индекс адгезии микроорганизмов к полимерным базисным материалам как индикатор оценки антимикробных средств. Стоматолог. 2008, 5: 38-44.
3. Мальков О.В., Литвиненко А.В. Измерение параметров шероховатости поверхности детали. М., Изд. МГТУ им. Баумана, 2012.
4. Миронов В.Л. Основы сканирующей зондовой микроскопии. Н. Новгород, 2004.
5. Царев В.Н., Давыдова М.М. Методы микробиологического исследования, применяемые в стоматологии. В: Микробиология, вирусология и иммунология. В.Н. Царев (ред.). М., Практическая медицина — ГЭОТАР-Медиа, 2009.
6. Царев В.Н., Ибрагимов Т.И., Трефилов А.Г. Применение методов микробиологического мониторинга в процессе ортопедического лечения пациентов с вторичной полной адентией. Стоматолог. 2008, 2: 45-51.
7. Binnig G., Quate C. F. Atomic force microscope. Physical Review Letters. 1986, 56 (9): 930933.
8. Donlan R.M., Costertone J.W. Biofilms: survival mechanisms clinically relevant microorganisms. Clin. Microbiol. Rev. 2002, 15 (2): 167-193.
9. Eick S., Glockmann E.. Adherence of Streptococcus mutans to various restorative materials in a continuous flow system. J. Oral. Rehabil. 2004, 31: 278-285.
10. Quirynen M., Bollen C.M. The influence of surface roughness and surface-free energy on supra- and subgingival plaque formation in man. J. Clin. Periodontol. 1995, 22: 1.
Поступила 27.02.14
Контактная информация: Царев В.Н., д.м.н., проф.,
127473, Москва, ул. Делегатская, 2., стр. 1
МОЛЕКУЛЯРНАЯ ЭПИДЕМИОЛОГИЯ
© КОЛЛЕКТИВ АВТОРОВ, 2014
С.Л.Мукомолов1,4, T.Tallo2,3, Е.В.Синайская1, П.Н.Кислый1, Г.Ф.Трифонова1, В.В.Герасимова1, H.Norder5
МОЛЕКУЛЯРНАЯ ЭПИДЕМИОЛОГИЯ ГЕПАТИТА С В ЦЕНТРАХ ГЕМОДИАЛИЗА В САНКТ-ПЕТЕРБУРГЕ
1НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера, Санкт-Петербург; 2Агенство
общественного здравоохранения Швеции, Стокгольм, Швеция; 3Национальный институт развития здоровья, Таллинн, Эстония; 4Санкт-Петербургский государственный университет; 5 Гетеборгский университет, Гетеборг, Швеция
Цель. Исследование молекулярной эпидемиологии гепатита С (ГС) в пяти отделениях гемодиализа (ОГД) в Санкт-Петербурге. Материалы и методы. В 2010 г. методом лимитированного сиквенирования NS5B региона генома вируса ГС были получены последовательности нуклеотидов у 93 выделенных изолятов, включая 67 изолятов от пациентов пяти ОГД и 26 изолятов от пациентов, у которых не было гемодиализа в анамнезе.
Филогенетический анализ выполняли с помощью пакета программ РНУЬЩ версия 3.69.
Эволюционные различия оценивали в программе DNADIST, используя алгоритм F84.
Филогенетические деревья конструировали с использованием методов ближайших соседей и UOGMA в компьютерном пакете программ PHYLIP. Результаты. Установлено, что субтип 1b доминировал во всех ОГД (69,2 — 92,9%) и те же самые изоляты вируса ГС были обнаружены в ОГД, которые были впервые выявлены в 1999 г. Сравнительно большая доля изолятов субгенотипа HCV 3a (26,7 — 30,8%) была обнаружена в двух ОГД из пяти в 2010 г. Такая же пропорция изолятов 3а была выявлена и в контрольной группе. Заключение. Тот факт, что изоляты вируса ГС 3а были обнаружены в ОГД в большой пропорции, является доказательством, что они успешно внедрились в циркуляцию среди диализных пациентов в последнее десятилетие.
Журн. икробиол., 2014, № 6, С. 27—34
Ключевые слова: вирус гепатита С, молекулярная эпидемиология, гемодиализ
S.L.Mukomolov14, T.Tallo2,3, E.V.Sinaiskaya1, P.N.Kisly1, G.F.Trifonova1, V.V.Gerasimova1, H.Norder5
MOLECULAR EPIDEMIOLOGY OF HEPATITIS C IN CENTERS OF HEMODIALYSIS IN ST. PETERSBURG
1Pasteur Research Institute of Epidemiology and Microbiology, St. Petersburg, Russia; 2Agency of Public Healthcare of Sweden, Stockholm, Sweden; 3National Institute of Health Development, Tallinn, Estonia; 4St. Petersburg State University, Russia; 5Gothenburg University, Gothenburg, Sweden
Aim. Study molecular epidemiology of hepatitis C (HC) in 5 departments of hemodialysis (DH) in St. Petersburg. Materials and methods. Sequences of nucleotides of 93 isolates including 67 isolates from patents of 5 DH and 26 isolates from patients, who never had hemodialysis in anamnesis, were obtained in 2010 by a method of limited sequencing of NS5B region of HC virus genome. Phyologenetic analysis was carried out by using PHYLIP version 3.69 program package. Evolution differences were evaluated in DNADIST program using F84 algorithm. Phylogenetic trees were constructed by using nearest neighbor and UOGMA methods in PHYLIP program package. Results. Subtype 1b was established to dominate in all the DH (69.2 — 92.9%) and the same isolates of HC virus were detected in DH, that were isolated for the first time in 1999. Comparatively higher proportion of isolates of HC subgenotype 3a (26.7 — 30.8%) was detected in 2 of 5 DH in 2010. The same proportion of 3a isolates was detected in the control group. Conclusion. The fact that HC 3a virus isolates were detected in DH in a higher proportion is proof that they have successfully integrated into circulation among dialysis patients over the last decade.
Zh. Mikrobiol. (Moscow), 2014, No. 6, P. 27—34
Key words: hepatitis C virus, molecular epidemiology, hemodialysis
ВВЕДЕНИЕ
Вирус гепатита С (НСУ), относящийся к семейству Flaviviridae, является одним из важнейших возбудителей гемоконтактных инфекций. С момента его открытия в 1989 г. [6] была установлена высокая степень изменчивости генома вируса [7]. Известно 6 главных генотипов НСУ, которые включают большое количество субтипов [19]. Высокий уровень гетерогенности популяции вируса предопределяет важность использования методов молекулярной эпидемиологии для определения источника инфекции и уточнения путей передачи возбудителя. Известно, что основные пути передачи НСУ тесно связаны с так называемыми «кровяными контактами», например, при трансфузиях контаминированной вирусом крови и продуктов крови, инъекционном применении психотропных препаратов, уколах иглами, использовании загрязненного медицинского оборудования и др. [2]. Множество публикаций описы-
вают распространение HCV внутри медицинских учреждений среди пациентов и персонала [9, 17, 21]. Гемодиализ является одним из важнейших факторов риска заражения HCV, а внутрибольничная передача вируса становится причиной формирования очагов гепатита С в отделениях гемодиализа [3, 8, 10, 13, 15]. Специальное исследование, выполненное Сотрудничающей группой по изучению HCV в начале 2000-х годов, установило значительное снижение уровня антител к вирусу (anti-HCV) у пациентов отделений гемодиализа в большинстве европейских стран, начиная с 1991 г. [12]. Авторы этого исследования сделали заключение, что это впоследствии будет способствовать снижению риска нозокомиальной передачи вируса среди пациентов и персонала отделений гемодиализа, что улучшит долгосрочный прогноз для пациентов гемодиализа и отделений пересадки почки. Заключение позднее было подтверждено отсутствием новых зарегистрированных случаев гепатита С среди пациентов отделений гемодиализа в некоторых странах [5, 18].
Информация о гепатите С в отделениях гемодиализа и особенно о молекулярной эпидемиологии этого возбудителя в Российской Федерации достаточно ограничена [1, 14]. В указанных публикациях отмечена высокая превалентность anti-HCV у пациентов отделений гемодиализа и доминирование штаммов вируса субтипа HCV 1b в изученных отделениях гемодиализа в Москве и Санкт-Петербурге. Во время этих исследований чрезвычайно интенсивная циркуляция HCV была документирована и среди населения России в целом [2], в основном за счет субгенотипа вируса HCV 3a. Эта эпидемическая ситуация в настоящее время проявляется высокими показателями хронической ГС инфекции [4]. Последнее означает, что вместе с существующим распространением штаммов HCV 1b новые генетические варианты HCV, в частности, относящиеся в субтипу 3a, могут начать циркулировать в гемодиализных центрах. Эта гипотеза нуждается в подтверждении в специальном исследовании.
Целью настоящей работы явилось исследование молекулярной эпидемиологии гепатита С (ГС) в пяти отделениях гемодиализа (ОГД) в Санкт-Петербурге.
МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
Пять отделений гемодиализа из различных стационаров, включенные в настоящее исследование, проведенное в 2009 — 2010 гг., были поименованы как 1 (ОГД-1), 2 (ОГД-2), 3 (ОГД-3), 4 (ОГД-4), 5 (ОГД-5). Отделения 1, 2 и 3 были включены в предыдущее подобное исследование, проведенное в 1998 — 1999 гг. [14].
Образцы сыворотки крови были получены от 454 пациентов (223 мужчины и 231 женщина), проходивших лечение во всех пяти ОГД. Возраст пациентов варьировал у мужчин от 52 до 56 лет, а у женщин — от 53 до 58 лет. Кроме пациентов в ОГД-1 образцы сыворотки крови были также получены от 18 человек медицинского персонала (2 мужчин, 16 женщин); средний возраст мужчин составил 27 лет, а женщин — 38 лет. Все 472 образца первоначально исследованы на антитела к вирусу ГС (anti-HCV) с использованием коммерческой тест-системы производства Вектор Бест (п. Кольцово, Новосибирская область). Все положительные в этом тесте пробы были повторно исследованы в тест-системе ImmunoComb HCV (Orgenics, Israel). Для сравнения изо-лятов HCV, выделенных в отделениях гемодиализа, с циркулирующими в городе штаммами были получены образцы сыворотки крови от 37 anti-HCV позитивных пациентов ( 22 мужчины, средний возраст 39 лет; 15 женщин, средний возраст 37 лет), наблюдаемых в поликлиническом отделении Санкт-Петербургского НИИЭМ им. Пастера. Эта группа служила в качестве контрольной группы. Никто из пациентов контрольной группы не подвергался лечению гемодиализом. Однако 25% из них указывали на различные медицинские манипуляции в медицинских учреждениях, а 19% в анамнезе имели инъекционное использование психотропных препаратов. У остальных пациентов контрольной группы факторы риска идентифицировать не удалось. Все образцы хранились при -80°C до исследования.
Пять пациентов из отделений ОГД-1 и ОГД-2 были вовлечены в предыдущее по-
добное исследование, выполненное в 1998 — 1999 гг. [14]. Последовательности ну-клеотидов изолятов HCV, выделенных от них, были доступны в базе данных GeneBank (AF388490, AF388481, AF388482, AF388518, AF388497) и были использованы для сравнения последовательностей нуклеотидов.
РНК HCV выделяли из сыворотки крови фенол-изопропаноловым методом. Синтез кДНК выполнялся с использованием 100 Ед обратной транскриптазы (Superscript III; Invitrogen, Life technologies, USA) и 0,1 Ед рандомных гексамерных праймеров (Roche Diagnostics Scandinavia AB, Sweden) при 42oC в течение 2 часов; кДНК амплифицировали в ПЦР с 1Ед Taq ДНК полимеразы (Invitrogen, USA) с прай-мерами hep-101M, hep-120 и гнездовой ПЦР с праймерами hep-101 and hep-105 [14, 15].
Все ПЦР продукты очищали с использованием реагентов E.N.Z.A. Cycle-Pure Kit (Omega Bio-Tek, Inc., USA). Очищенные ПЦР продукты использовались в качестве матрицы сиквенирующей реакции по методике [20].
Полученные сиквенсы обрабатывали с использованием программы SeqMan из пакета LASERGENE 7 (DNA STAR Inc., Madison, WI) и программы BioEdit и сравнивали их с 50 соответствующими сиквенсами HCV из базы данных GeneBank, включая штаммы HCV, изолированные в ОГД в Санкт-Петербурге в 1999 г. [14].
Филогенетический анализ выполняли с помощью пакета программ PHYLIP, версия 3.69 (http://evolution.genetics.washington.edu/phylip/getme.html). Эволюционные различия оценивали в программе DNADIST, используя алгоритм F84. Филогенетические деревья конструировали с использованием методов ближайших соседей и UPGMA в компьютерном пакете программ PHYLIP. Бустрэпинговый анализ выполнялся с использованием 500 повторов с помощью программ SEQBOOT и CONSENSE.
РЕЗУЛ ЬТАТЫ
Образцы сыворотки крови от 108 пациентов из 454 (23,8%) оказались позитивными в двух различных ИФА тест-системах и были признаны содержащими апй-НСУ У двух медицинских сестер из 18 человек персонала ОГД-1 также обнаружили апй-НСУ (11,1%). В целом образцы крови 110 человек из 472 содержали апй-НСУ — 23,3% (табл.).
Самая высокая частота апй-НСУ имела место в отделении 3 (30,1%), а самая низкая — в ОГД-1 (18,7%) и ОГД-4 (18,6%).
НСУ РНК была выявлена в 69 образцах из 110 апй-НСУ-позитивных проб, полученных от пациентов отделений гемодиализа и персонала ОГД-1 (62,7%), а также в 31 образце из 37 апй-НСУ — позитивных образцов (83,8%) от пациентов контрольной группы (табл.).
Участок №5В региона генома НСУ размером 250 нуклеотидов удалось амплифи-цировать в 66 (97,1%) образцах, полученных от 68 пациентов гемодиализа, в 1 образце от медицинского персонала и в 26 образцах (83,8%) пациентов контрольной группы. Таким образом, сиквенированы 93 НСУ РНК позитивных образцов из 100 — 93% (табл.).
Субтипы НСУ определяли по результатам сиквенирования ограниченного участка NS5B региона и последующего фило-генетичсекого анализа изолятов.
Результаты лабораторного тестирования 509 человек, участвующих в исследовании
Число
Отделения (кол-во образцов ) Анти-ВГС + (%) HCVРНК + (%) изолятов, сиквенирован-
ных в регионе NS5b (%)
ОГД-1 (пациенты) (п=91) 17 (18,7) 13 (76,5) 13(100)
ОГД-1 (персонал) (п=18) 2 (11,1) 1 (50,0) 1 (100)
ОГД-2 (п=93) 25 (26,9) 15 (60,0) 14 (93,3)
ОГД-3 (п=83) 25 (30,1) 14 (56,0) 13 (92,9)
ОГД-4 (п=97) 18 (18,6) 11 (61,1) 11 (100)
ОГД-5 (п=90) 23 (25,6) 15 (65,2) 15(100)
Итого (п=472) 110(23,3) 69 (62,7) 67 (97,1)
Контрольная группа (п=37) 37(100) 31 (83,8) 26 (83,8)
Рис. 1. Часть дендрограммы, полученной в программе UPGMA на основе 184 сиквенсов длиной 250 нуклеотидов области NS5B генома вируса ГС изолятов вируса субтипа 1Ь.
Происхождение каждого штамма указано рядом с ветвью дендрограммы, соответствующей данному изоляту. Стрелками показаны участки дендограммы, представленные сходными изолятами из разных ОГД.
В целом принадлежность выделенных изолятов к субтипу 1Ь была установлена в 86,3% случаев. Доля изолятов 1Ь варьировала от 69,2% в ОГД-3 до 92,9% в ОГД-1 и ОГД-2. Одиннадцать изолятов HCV (16,4%) были классифицированы как принадлежащие к субтипу 3a. Доля изолятов 3a варьировала от 7,1% в ОГД-1 до 26,7% и 30,8% в ОГД-5 и ОГД-3 соответственно. Медицинская сестра из ОГД-1 была инфицирована вирусом ГС субтипа 1Ь. В контрольной группе изоляты HCV относились к 4 субтипам со следующим долевым распределением: 1Ь — 61,5%; 2a — 3,8%; 2c — 3,8%; 3a — 30,9%.
Субтип HCV 1Ь был определен у 33 из 56 пациентов старше 50 лет (58,9%). Похожая ситуация была установлена и при анализе изолятов субтипа HCV 3a, который также выявлен у 72,7% пациентов старше 50 лет.
Филогенетический анализ последовательностей нуклеотидов изолятов HCV 1Ь, выделенных от пациентов отделений гемодиализа, выявил, что 8 изолятов из 13 (61,5%) формировали 2 субклада в ОГД-1, и 9 изолятов из 13 также формировали 2 субклада в ОГД-2, что свидетельствует, по крайней мере, о двух цепочках передачи вируса в каждом из отделений (рис.1). Изолят 2070_2010, относящийся к одному из субкладов в ОГД-1, был получен от медицинской сестры, которая была anti-HCV негативной в 1998 г. Шесть изолятов из 10 (60%), выделенных от пациентов ОГД-4, формировали отдельный субклад, который также включал 4 изолята из ОГД-3. Детальный анализ историй гемодиализа этих пациентов установил, что все пациенты ОГД-3 ранее получали процедуры гемодиализа в ОГД-4 и позднее были переведены в ОГД-3. Таким образом, этот субкластер следует рассматривать как сформированный изолятами из ОГД-4. Похожая ситуация такого передвижения пациентов из одного отделения в другое хорошо видна на филогенетическом дереве в нескольких точках. Так, изолят 2073_2010 из ОГД-1 был идентичен изоляту 2037_2010 из ОГД-5; изолят 2069_2010 из
ОГД-1 оказался близкородственным изо-ляту 1983_2010 из ОГД-2; изолят 0392_2010 из ОГД-5 был сходен с изолятом 0385_2011 из ОГД-3 (рис. 1). Дополнительно еще несколько пар идентичных сиквенсов были обнаружены в ОГД-3, ОГД-4 и ОГД-5, что свидетельствует о возникновении разных цепочек передачи вируса в отделениях (рис. 1). Изоляты, выделенные ранее в ОГД-1 и ОГД-2 и описанные в публикации 2001 г. [14], были похожи на выделенные изоляты от пациентов из этих же отделений в 2010 г.
Филогенетический анализ изолятов вируса субтипа 3a выявил, что 3 из 4 изолятов (75%), выделенных в ОГД-3, формировали один субклад, что свидетельствует о наличии эпидемической цепи (рис. 2). Остальные изоляты субтипа 3а из других ОГД и контрольной группы оказались разбросанными по филогенетическому дереву и не формировали субкластеров (рис. 2).
В настоящую работу были включены 5 HCV — РНК позитивных пациентов, которые также участвовали в предыдущем исследовании 1998 — 1999 гг. [14], и данные о последовательностях нуклеотидов в NS5B регионе были доступными в базе данных. Сравнительный анализ последовательностей нуклеотидов в NS5B регионе, полученных от тех же самых пациентов более, чем через 10 лет, показал, что только несколько незначимых замен аминокислот были обнаружены у 4 пациентов и у одного пациента вообще не обнаружено замен. В каждой из четырех сравниваемых пар данных о последовательностях было обнаружено по 2 замены, в основном, A/G или G/A и T/C. Эти замены не могли привести к значительным мутациям в NS5B регионе, использованном для филогенетического анализа.
ОБСУЖДЕНИЕ
Первая публикация о генотипах HCV, циркулирующих в отделениях гемодиализа в Санкт-Петербурге, была подготовлена группой специалистов Санкт-Петербургского НИИЭМ им. Пастера и Шведского Института по контролю за инфекционными заболеваниями в 2001 г. [14]. В это исследование было вовлечено три ОГД, в которых от пациентов были выделены изоляты, относящиеся к трем субтипам — 1b, 2c и 3a с доминированием субтипа 1b (89%). В то же время, доминирующим субтипом вируса у населения Санкт-Петербурга в целом был HCV 3a. Было установлено, что нозокоми-альная передача вируса имела место в двух отделениях из трех.
Настоящее исследование, проведенное спустя 10 лет в тех же трех отделениях гемодиализа и двух новых, позволило обнаружить несколько важных находок. Во-первых, было установлено, что частота anti-HCV во всех отделениях в 2010 г. (23,3%) значительно уменьшилась по сравнению с 1998 — 1999 гг. (41,7%). Это, несомненно, отражает усилия по повышению эффективности инфекционного контроля в отделениях гемодиализа. Тем не менее, существующий показатель anti-HCV может считаться весьма высоким, поскольку он более, чем в 50 раз, выше такового у доноров крови в Санкт-Петербурге — 0,4% (официальная статистика Управления Роспотребнадзора). Вторая находка, выявленная при филогенетическом анализе NS5B региона, позволяет судить о циркуляции двух генетических вариантов HCV — субгенотипы 1b и 3a. Более того, субгенотип 3a был обнаружен во всех вовлеченных в исследование ОГД,
Рис. 2. Дендрограмма, полученная в программе UPGMA на основе 184 сиквенсов длиной 250 нуклеотидов области NS5B генома вируса ГС изолятов вируса субтипа 3a.
Происхождение каждого штамма указано рядом с ветвью дендрограммы, соответствующей данному изоляту. Стрелками показаны участки дендограммы, представленные сходными изо-лятами.
а в двух из них доля изолятов 3а оказалась достаточно большой и достигала 26,7 — 30,8%. В предыдущем исследовании 1998 — 1999 гг. изоляты HCV, принадлежащие к субтипу 3a, были документированы только в одном ОГД, и их доля составляла лишь 6% [14]. Такая ситуация с циркуляцией изолятов HCV 3a в гемодиализных отделениях не является обычной. В большинстве публикаций сообщается о находках изолятов вируса, относящихся к первому или второму генотипам HCV 1b, 1a, 2a/2c [8, 10]. Только в Иране было установлено доминирование HCV 3a в отделениях гемодиализа [11]. Ранее Kalinina О. et al. [14] обсуждали в своей работе изменения доминирующих субтипов вируса ГС в Санкт-Петербурга с 1b на 3a. Это объяснялось, в первую очередь, увеличением количества лиц, использующих инъекционные психотропные препараты. Позднее приведенная гипотеза была подтверждена результатами специального исследования Paintsil Е. et al. [16]. Таким образом, увеличение интенсивности циркуляции HCV 3a среди населения Санкт-Петербурга могло способствовать и проникновению этого субтипа вируса в отделения гемодиализа и началу эффективной передачи среди пациентов, получающих сеансы гемодиализа.
Третья находка связана с одной из главных задач исследования, которая была призвана ответить на вопрос: продолжается ли циркуляция штаммов вируса субтипа 1b, выявленных в ОГД в 1998 — 1999 гг. и предположительно относящихся к внутриболь-ничным. Филогенетический анализ сиквенсов, полученных в предыдущем и настоящем исследовании, подтверждает, что в ОГД-1 и ОГД-2 передача штаммов вируса HCV 1b продолжается с 1998 г. Образование кластеров вирусных изолятов, выделенных в разное время, на филогенетическом дереве подтверждает это заключение.
Четвертый важный результат настоящего исследования связан с полезностью сиквенирования ограниченных участков NS5B региона HCV для изучения передачи вируса. Этот регион не считается объектом высокого уровня иммунного пресса, что может результироваться в увеличении уровня мутаций, как это имеет место в гипервариабельном регионе E1/E2 участке генома. Сравнение сиквенсов участка NS5B региона, полученных от тех же самых пациентов с интервалом в 10 лет, не выявило каких-либо значительных изменений в последовательностях нуклеотидов и аминокислот. Указанное подтверждает идею о том, что NS5B регион является наилучшим участком генома для фингерпринтинга выделенных штаммов и реконструкции передачи вируса в медицинских учреждениях. В заключение должно быть обращено внимание на большое значение сиквенирования ограниченных участков NS5B региона вируса ГС и последующего филогенетического анализа выделенных изолятов как полезного инструмента молекулярной эпидемиологии для мониторирования эпидемической ситуации в отделениях гемодиализа и подтверждения передачи возбудителя для проведения своевременных адекватных противоэпидемических мероприятий.
Исследование было частично поддержано грантом программы New Visby Шведского Института №№. 01348/2007 и 00874/2009.
ЛИТЕРАТУРА
1. Зубкин М.Л., Селиванов Н.А., Стаханова В.М., Новоженов В.Г., Селькова Е.П., Кучерова Т.Е., Баранова Ф.С., Кожокарь Ю.В., Киркман В.В., Касапова Е.Н., Стенина И.И., Львов Д.К. Распространенность и особенности вирусных гепатитов В и С в условиях лечения гемодиализом. Вопр. вирусол. 2000, 1: 10-14.
2. Мукомолов С.Л., Шляхтенко Л.И., Левакова И.А., Калинина О.В. В: Вирусные гепатиты в Российской Федерации. СПб, НИИЭМ им. Пастера, 2000.
3. Мукомолов С.Л., Левакова И.А., Синайская Е.В., Сулягина Л.В., Кислый П.Н., Тимаховская Г.Ю., Иванова Н.В., Старосельский К.Г., Ряснянский В.Ю. Эпидемиологическая характеристика вирусных гепатитов В и С в отделениях гемодиализа в Санкт-Петербурге в современный период. Регистрация гемоконтактных вирусных гепатитов и серологические маркеры вирусных гепатитов В и С у пациентов отделений гемодиализа. Инфекция и иммунитет. 2011, 1 (2): 143-150.
3. ЖМЭИ 6 № 34
33
4. Мукомолов С.Л., Левакова И.А. Эпидемиологическая характеристика хронических вирусных гепатитов в Российской Федерации. Инфекция и иммунитет. 2011, 1 (3): 255262.
5. Amroth G., Ekermo B., Akerlind B. et al. Monitoring hepatitis C infection in a major Swedish nephrology unit and molecular resolution of a new case of nosocomial transmission. J. Med. Virol. 2010, 82 (2): 249-256.
6. Choo Q.-L., Kuo G., Weiner A.J. et al. Isolation of a cDNA clone derived from a blood-borne non-A, non-B viral hepatitis genome. Science. 1989, 244 (4902): 359-362.
7. Choo Q.-L., Richman K., Han J.H. et al. Genetic organization and diversity of the Hepatitis C virus. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1991, 88: 2451-2455.
8. Furusyo N., Kubo N., Nakashima H. et al. Confirmation of nosocomial hepatitis C virus infection in a hemodialysis unit. Infect. Control. Hosp. Epidemiol. 2004, 25: 584-590.
9. Gutelius B., Perz J.F., Parker M.M. et al. Multiple clusters of hepatitis virus infections associated with anesthesia for outpatient endoscopy procedures. Gastroenterology. 2010, 139: 163170.
10. Hmaied F., Ben Mamou M., Dubois M. et al. Determining the source of nosocomial transmission in hemodialysis units in Tunisia by sequencing NS5b and E2 sequences of HCV. J. Med. Virol. 2007,79: 1089-1094.
11. Hosseini-Moghaddam S.M., Keyvani H., Kasiri H. et al. Distribution of Hepatitis C virus genotypes among hemodialysis patients in Tehran — a multicenter study. J. Med. Virol. 2006,78: 569-573.
12. Jadoul M., Poignet J.L., Geddes C. et al. The changing epidemiology of Hepatitis C virus infection in hemodialysis: European multicentre study. Nephrol. Dial. Transplant. 2004, 19: 904-909.
13. Johnson D.W., Dent H., Yao Q. et al. Frequencies of Hepatitis B and C infection among hemodialysis and peritoneal dialysis patients in Asia-Pacific countries: analysis of registry data. Nephrol. Dial. Transplant. 2009, 24: 1598-1603.
14. Kalinina O., Norder H., Vetrov T., Zhdanov K., Barzunova M., Plotnikova V., Mukomolov S., Magnius L.O. Shift in predominating subtype of HCV from 1b to 3a in St.Petersburg mediated by increase in injecting drug use. J. Med. Virol. 2001, 65: 517-524.
15. Norder H., Bergstrom A., Uhnoo I. et al. Confirmation of nosocomial transmission of hepatitis C virus by phylogenetic analysis of the NS5B region. J. Clin. Microbiol. 1998, 36: 30663069.
16. Paintsil E., Verovochkin S., Dukhovlinova E. et al. Hepatitis C virus infection among drug injectors in St.petersburg, Russia: social and molecular epidemiology of an endemic infection. Addiction. 2009, 104: 1881-1890.
17. Panella H., Rius C., Cayla J.A. Transmission of hepatitis C virus during computed tomography scanning with contrast. Emerg. Infect. Dis. 2008,14: 333-335
18. Ross R.S., Viazov S., Clauberg R. et al. Lack of de novo hepatitis C virus infections and absence of nosocomial transmission of GB virus C in a large cohort of German haemodialysis patients. J. Viral. Hepat. 2009, 16 (4): 230-238.
19. Simmonds P., Bukh J., Combet C. et al. Consensus proposals for a unified system of nomenclature of hepatitis C virus genotypes. Hepatology. 2005, 42: 962-973.
20. Tallo T., Norder H., Tefanova V. et al. Genetic characterization of hepatitis C virus strains in Estonia: fluctuations in the predominating subtype with time. J. Med. Virol. 2007, 79 (4): 374382.
21. Thompson N.D., Hellinger WC., Kay R.S. et al. Healthcare-associated hepatitis C virus transmission among patients in an abdominal organ transplant center. Transpl. Infect. Dis. 2009, 11: 324-329.
Поступила 27.02.14
Контактная информация: Мукомолов Сергей Леонидович, д.м.н., проф.,
197101, Санкт-Петербург, ул. Мира, 14, р.т. (812)232-90-69
