CC BY
7
ВЕСТНИК ГЕМАТОЛОГИИ, том XVII, № 3, 2021
государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской Федерации, г.Самара 7Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования «Казанский (Приволжский) федеральный университет», г.Казань
8Автономная некоммерческая организация «Приволжский регистр доноров костного мозга», г.Казань
Введение. Российская Федерация - многонациональное государство, на территории которого проживает более 146 млн человек, представляющие более 200 различных национальностей. Около 80% всего населения составляют русские, на втором месте по численности находятся татары (>3%). Этническая группа татары включает в себя два субэтноса: Казанские (Волжские татары] и Уральские татары (Татары-мишари]. Согласно данным переписи населения 2010 года татары составляют 4,1% жителей Самарской области, 5,4 % жителей Челябинской области, 53,2% жителей Татарстана, 2,7% жителей Кировской области и 25,4% жителей республики Башкортостан.
Цель. Целью настоящего исследования является изучение частот встречаемости аллелей HLA-A, -B, -DRB1 у татар Самарской, Челябинской, Кировской областей, республик Татарстан и Башкортостан.
Материалы и методы. В анализ были включены данные HLA-типирования по локусам HLA-A, B, DRB1 в низком разрешении 200 доноров ГСК регистра Челябинской областной станции переливания крови, 59 единиц пуповинной крови и 110 доноров ГСК Самарского регистра, 119 доноров Приволжского регистра доноров костного мозга, проживающих в Казани, 205 доноров из Кировской области и 374 донора из республики Башкортостан регистра КННИГиПК ФМБА России, самоопределившихся как татары и постоянно проживающих в указанных регионах. Частоты встречаемости HLA-аллелей были рассчитаны с использованием ПО Arlequin 3.5. Для оценки достоверности различий был использован метод оценки критерия Пирсона х2 (p<0.05) с поправкой Йейтса.
Результаты. В ходе исследования были выявлены достоверные отличия в частотах встречаемости некоторых аллелей. Частота встречаемости HLA-A*02 в популяциях татар Самарской области (21,2%), Татарстана (23,4%) и Башкортостана (24,7%) достоверно ниже, чем в популяциях Челябинской (29,6%) и Кировской областей (31,6%). Частота встречаемости HLA-A*23 (4,2%) Самарской
области достоверно выше, чем у татар Челябинска (1,3%), Башкортостана (2,3%] и Кировской области (1,2%).
Среди аллельных вариантов локуса В достоверные отличия в частотах встречаемости выявлены в отношении ША-В*27 между популяциями татар Татарстана и Кировской области (7,0% против 3,0%); в отношении ША-В*38 - между татарами Самарской области (1,5%) и татарами Татарстана и Башкортостана (4,3% и 4,5%, соответственно). Аллельный вариант ША-В*40 встречается чаще у татар Татарстана (7,0%), Башкортостана (6,1%) и Кировской области (6,0%), чем у татар Самарской области (3,0%), а ША-В*44 наоборот встречается чаще у татар Самарской области (14,0%), чем у татар Татарстана (8,3%), Челябинской (8,1%) и Кировской областей (7,1%). Достоверно частота встречаемости ША-В*58 выше у татар Самарской области (3,9%), чем у татар Кировской области (1,0%).
Среди аллельных вариантов локуса DRB1 достоверно значимые отличия в распределении частот встречаемости выявлены для ИLA-DRB1*04 - частота встречаемости у татар Башкортостана составляет 13,5%, в то время как у татар Кировской области - 9,2%; для ИLA-DRB1*07 - частота встречаемости у татар Кировской области составляет 22,5%, а у татар Башкортостана и Самарской области - 15,2% и 15,0%, соответственно. ИLA-DRB1*11 встречается достоверно чаще у татар Татарстана (16,5%), чему у татар Челябинской области (8,1%), Башкортостана (10,0%) и Кировской области (8,1%). ША^В1*14 встречается достоверно реже у татар Самарской области (0,6%), чем у татар Татарстана (3,4%), Челябинской области (3,0%), Башкортостана (2,2%) и Кировской области (4,2%).
Выводы. В ходе анализа татарских популяций Самарской, Челябинской, Кировской областей, республик Татарстан и Башкортостан выявлены достоверные отличия в частотах встречаемости аллельных групп ША-А*02, ША-А*23, ША-В*27, ША-В*38, ША-В*40, ША-В*44, ША-В*58, ИЬА-DRB1*04, ША^В1*07, тА^В1*11, ША^В1*14.
Кутявина С., Махова О.А., Смирнова Д.Н., Обухов И.П., Логинова М.А., Парамонов И.В.
ИДЕНТИФИКАЦИЯ ДВУХ НОВЫХ HLA-ДЛЛЕЛЕЙ - HLA-DRB1*14:223 И HLA-DQB1*03:01:49 У ОДНОГО ИНДИВИДУУМА
ФГБУН «Кировский научно-исследовательский институт гематологии и переливания крови ФМБА России»
Введение. Человеческие лейкоцитарные антигены являются наиболее полиморфными локусами в геноме человека. По данным международного Комитета по номенклатуре факторов ИЬА-системы ВОЗ, на декабрь 2020 года ИЬА-локусы представлены 28 938 аллелями. Что в последние несколько лет увеличение
количества известных аллелей ИЬА-локусов носит лавинообразный характер, что связано не только с увеличением числа изученных мировых популяций, но и с развитием методов ИЬА-типирования, позволяющих выявлять единичные нуклеотидные замены в различных структурных элементах ИЬА-генов.
МАТЕРИАЛЫ КОНФЕРЕНЦИИ
Цель. Идентификация двух новых HLA-аллелей, выявленных у бурята, рекрутированного в Иркутской области.
Материалы и методы. В исследование включено 956 образцов цельной крови, полученных от взрослых индивидуумов, идентифицирующих себя бурятами, рекрутированных на территории Иркутской области.
Препараты ДНК выделены из замороженных образцов цельной крови (антикоагулянт - K3EDTA в концентрации 2 мг/мл] методом колоночной фильтрации с применением наборов QIAamp DNA Blood Mini Kit («QIAgen GmbH», Германия]. Концентрацию ДНК измеряли на амплификаторе нуклеиновых кислот QuantStudio 5 («Life Technologies», Сингапур], затем образцы нормализовали деионизированной водой до концентрации 10 нг/мкл.
HLA-типирование по локусам HLA-A, HLA-B, HLA-C, HLA-DRB1, HLA-DQB1 проводили в разрешении 2-field по технологии NGS с использованием набора реагентов VariFind™ HLA Solution IL-v2 (ООО «ПАРСЕК ЛАБ», Россия], массовое параллельное секвенирование проводили на приборе MiSeq™ System («Illumina Inc.», США]. Анализ полученных данных осуществляли с использованием программного обеспечения PARallele™ HLA Software v.1 (ООО «ПАРСЕК ЛАБ», Россия] в автоматическом режиме.
Подтверждение выявленных новых аллелей выполнено по технологии SBT с использованием наборов реагентов HLAssure SE SBT Kit (TBG Diagnostics Limited, Тайвань]. Экзоны 1-3 локуса HLA-DRB1 и эк-зоны 2-3 локуса HLA-DQB1 амплифицировали с помощью полимеразной цепной реакции и секвенировали на генетическом анализаторе 3730 (Thermo Fisher Scientific, США]. Полученные последовательности анализировали в программном обеспечении AccuType TM (Texas Bio GeneInc, США].
Результаты. В результате проведенного исследования 956 образцов геномной ДНК, полученных от бурят, рекрутированных на территории Иркутской об-
ласти, в образце № 54107 выявлены сразу два аллеля по локусам HLA-DRB1 и -DQB1, ранее не зарегистрированных международным Комитетом по номенклатуре факторов HLA-системы ВОЗ.
Нуклеотидная последовательность аллеля HLA-DRB1*14:223 отличается от аллеля DRB1*14:03:01 одной нуклетидной заменой в позиции 508 экзона 3, что приводит к несинонимичной замене кодона 141 с глицина (GGG] на триптофан (TGG]. Последовательность аллеля HLA-DQB1*03:01:49 отличается от HLA-DQB1*03:01:01:01 одной однонуклеотидной заменой ^ ^ А] в экзоне 2 в положении 315.
Полный HLA-генотип индивидуума 54107 с двумя новыми аллелями следующий: HLA-A*02:01, 03:01; -С*03:04, 12:02; -В*40:02, 52:01; ^В1*14:223, 15:02/15:140/15:149; ^В1*03:01:49, 06:01. Номера данным аллелям присвоены в мае 2020 года международным Комитетом по номенклатуре факторов HLA-системы ВОЗ.
Для установления принадлежности обоих аллелей одному гаплотипу проведено HLA-типирование двух сиблингов индивидуума № 54107, один № 64225 из которых имел генотип, полностью совпадающий с генотипом донора № 54107, второй № 64531 - был гаплоидентичен. Полный HLA-генотип индивидуума № 64531: НЬА-А*03:01, 68:01; -С*07:68, 12:02; -В*44:02, 52:01; ^В1*11:01, 15:02/15:140/15:149; -DQB1*03:01, 06:01. Это позволило отнести оба новых аллеля одному гаплотипу.
Выводы. Выявление двух новых аллелей в относительно не большой выборке образцов, подтверждает необходимость использования современных молеку-лярно-генетических методов анализа при проведении HLA-типирования популяций потенциальных доноров ГСК. Подтверждение наследования выявленных новых аллелей свидетельствует о целесообразности расширения пула доноров из данного региона Российской Федерации.
Леонов Е.А., Хамаганова Е.Г., Абдрахимова А.Р., Хижинский С.П., Гапонова Т.В.
^Л-ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ДИСТАНЦИИ МЕЖДУ РОССИЙСКИМИ ДОНОРАМИ ГЕМОПОЭТИЧЕСКИХ СТВОЛОВЫХ КЛЕТОК РАЗЛИЧНОГО ЭТНИЧЕСКОГО ПРОИСХОЖДЕНИЯ, ТИПИРОВАННЫМИ С ВЫСОКИМ РАЗРЕШЕНИЕМ
Федеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный медицинский исследовательский центр гематологии» Министерства здравоохранения Российской Федерации
Введение. Высокий полиморфизм генов системы HLA затрудняет подбор совместимого донора для пациентов с заболеваниями системы крови, которым показана трансплантация гемопоэтических стволовых клеток (ГСК]. Информация о вариантах HLA-генов в популяциях разных географических регионов, о HLA-генетических дистанциях между популяциями способствует более успешному подбору донора для трансплантации ГСК.
Цель. Провести анализ генетических дистанций по генам HLA между донорами ГСК базы данных ФГБУ «НМИЦ Гематологии» Минздрава России, само-
определившимися как русские, донорами-татарами, донорами-башкирами, а также некоторыми другими российскими и зарубежными популяциями, о которых имеются сведения в открытой печати.
Материалы и методы. В исследование включено 1510 потенциальных доноров ГСК регистра ФГБУ «НМИЦ гематологии» Минздрава России, самоопределившиеся как русские, 192 доноров-татар, 120 доноров-башкир. Выделение геномной ДНК из образца периферической крови донора производили с помощью наборов QIAamp DNA Blood Mini Kit и автоматизированной системы выделения ДНК QIAcube (Qiagen,
