CC BY
170ХАРАКТЕРИСТИКА СЕРИНОВОЙ
тельно редкого возбудителя мукормикоза — Syncephalas-
.
чении различными методами, в том числе — с помощью
enzymes from relatively rare pathogen of mucoromycosis — sis of mycoses, serine protease, structural proteomics, Syn-
наиболее тяжелые инвазивные оппортунистические руют около 5000 случаев мукормикозов, но реальная
яет множество факторов: фоновое заболевание и его
паратов, эффективных в отношении возбудителей ние новых противогрибковых агентов не эвристиче-информатики, а также «молекулярного докинга»,
* Контактное лицо: Рябинин Игорь Андреевич, e-mail: Igor.Ryabinin@szgmu.ru
ураты, аналоги тиохроман-4-она, соединения класса
инвазивных микозов особое место занимают
протеаз достоверно доказана в патогенезе инвазивного кандидоза, аспергиллеза,
терапии инвазивных микозов, служащих в качестве
рентгеноструктурный анализ. Однако современные
следовательности по комплексу структурных и физико-химических признаков.
нов и фрагментов, общих для семейств и суперсе-
мента, его физико-химические свойства, включая поведение ферментативного перевара при MALDI-
исследуемого белка протеолизу при использовании различных ферментов установили благодаря on-line
ных третичной и четвертичной структуры белков -
гомологов среди мукоромицетов. Сериновая проте-
соавторами в 2016 г. (прямое депонирование без
comyces blakesleeanus, Mucor circinelloides, M. am-
глутамата, 36 - глицина, 14 - гистидина, 26 - изо-
вила р!=6,53; коэффициент молярной экстинкции,
- 61600 М-1*см-1, при формировании дисульфидных связей - 61854 М-1*см-1.
- как электрофил, гистидин - как органическое ос-
нование. В этом семействе присутствуют Ca+2-
Staphylococcus aureus, Streptomyces griseus и Bacillus 24 сайта). Слабая активность характерна для проте-
ными агентами, при обработке сериновой протеазы
Особенности поведения протеолитического
ментов от протеолиза, участвующих в формирова-
действии химотрипсина - до 323, при действии стафилококковой протеазы V8 - до 564.
Реконструкция третичной структуры фер-
сталлографических моделей они оказываются почти по последовательностям при выравнивании пере-
ровании получили хорошие показатели качества построения, например, при наложении на структуру
вероятном сходстве «геометрии» молекулы анализи-
нием. Вторичная структура включает 5 Р-листов, 1 (8-10), участков межспирального взаимодействия (4-
лы фермента в различных проекциях при вращении
доступен только для белков-«шаблонов». В-
24 (5)], объем глобулы составляет 18609 А3, в ферменте 8 полостей объемами от 123 А3 до 855 А3, а также 8 «пустот» объемами от 61 А3 до 208 А3.
каналов, все они связаны, преимущественно, с
внутренняя поверхность из аминокислотных остатков сравнительно слабо ионизируемая, умеренно гидрофильна (средний индекс
противоположной стороне глобулы находится наиболее протяженный (14,8 А) туннель, его внутренний просвет преимущественно
предполагаемым активным центром фермента, но второй из описанных своим внешним устьем расположен довольно близко к сайту связывания
ставляет 182 А2; взаимодействие происходит следу-
связан с выполнением особой функции в клетке или
Определение возможных лигандов сериновой делях протеиназы К (с использованием данных
типа аланил-аланил-пролил-валин и пролил-аланил-
нии белки имеют по 1 центру, удерживающему ион Ca+2, положение которого у разных ферментов несвязывания ионов Са+2 протеазы V. psalliotae). Также выявили сайты связывания фенилметансульфоновой
взаимодействие с такими лигандами имеет, вероят-ставлена подробная характеристика сериновой про-
тивных позиций.
принадлежит протеаза & racemosum, определяет ее исхождения, что указывает на необходимость тща-
третичной структуры сериновые протеазы микро-
лярной геометрии структурно сходных белков у се-заны с его активным центром, вероятно, они служат
собность к нестойкой димеризации, что, гипотетически, связано с участием в деградации крупных тяжи-
особенности патогенных мукоромицетов - возбу-
.
2. Khedr M. Stepwise design, synthesis, and in vitro antifungal screening of (Z)-substituted-propenoic acid derivatives with potent broad-spectrum antifungal activity. Drug Des. Devel. Ther. 2015; 9: 4501-4513. doi: 10.2147/DDDT.S84178
5. Zhong Y., Han X., Li S., et al. Design, synthesis, antifungal activity and molecular docking of thiochroman-4-one 05049-2.
8. Hassan M.I.A., Voigt K. Pathogenicity patterns of mucormycosis: epidemiology, interaction with immune cells and idoj.IDOJ_155_18
