Научная статья на тему 'ГЕНЕТИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ КАЗАХСКОЙ БЕЛОГОЛОВОЙ ПОРОДЫ КРУПНОГО РОГАТОГО СКОТА'

ГЕНЕТИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ КАЗАХСКОЙ БЕЛОГОЛОВОЙ ПОРОДЫ КРУПНОГО РОГАТОГО СКОТА Текст научной статьи по специальности «Животноводство и молочное дело»

CC BY
127
31
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Ключевые слова
МЯСНОЕ СКОТОВОДСТВО / КАЗАХСКАЯ БЕЛОГОЛОВАЯ ПОРОДА / ГЕНЕТИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ / ДОЛЯ ПРЕДКОВЫХ ГЕНОМНЫХ КОМПОНЕНТОВ

Аннотация научной статьи по животноводству и молочному делу, автор научной работы — Ковальчук Александр Михайлович

Представлены результаты молекулярно-генетических исследований крупного рогатого скота казахской белоголовой породы (KWh). Порода характеризуются относительно высоким уровнем генетического разнообразия среди изученных пород. Высокий уровень генетического разнообразия может быть связан с использованием естественного спаривания при разведении в отличие от искусственного осеменения. Установленный незначительный избыток гетерозигот можно рассматривать как показатель низкого уровня геномного инбридинга в популяции казахстанского белоголового скота (Fis = -0,007 [-0,007; -0,007]). Генетическая близость казахской белоголовой породы подтверждена минимальными значениями генетических дистанций между породами (Fst = 0,027) против 0,035 - 0,164 по сравнению с другими породами крупного рогатого скота, а также образованием единой ветви на филогенетических деревьях, построенных на основе значений Fst.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по животноводству и молочному делу , автор научной работы — Ковальчук Александр Михайлович

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

GENETIC DIVERSITY OF THE KAZAKH WHITE-HEADED CATTLE BREED

The article presents the results of molecular genetic studies of cattle of the Kazakh white-headed breed (kWh). The Kazakh white-headed breed is characterized by a relatively high level of genetic diversity among the studied breeds. A high level of genetic diversity may be associated with the use of natural mating in the breeding of the Kazakh white-headed breed, as opposed to artificial insemination. The established insignificant excess of heterozygotes can be considered as an indicator of a low level of genomic inbreeding in the studied population of Kazakh white-headed cattle (Fis = -0.007 [-0.007; -0.007]).The genetic proximity of the Kazakh white-headed breed is confirmed by the minimum values of genetic distances between breeds (Fst = 0.027) versus 0.035 - 0.164 compared to other breeds of cattle, as well as the formation of a single branch on phylogenetic trees based on Fst values.

Текст научной работы на тему «ГЕНЕТИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ КАЗАХСКОЙ БЕЛОГОЛОВОЙ ПОРОДЫ КРУПНОГО РОГАТОГО СКОТА»

sion of semen quality traits in a cattle population. Journal of Dairy Science. 2017; 100(6): 4721 - 4730.

12. Runs of homozygosity reveal signatures of positive selection for reproduction traits in breed and non-breed horses / Metzger J., Karwath M., Tonda R. et al. BMC Genomics. 2015; 16(1).

13. PLINK: A tool set for whole genome association and population-based linkage analyses / S.M. Purcell, B. Neale, K. Todd-Brown et al. American Journal of Human Genetics. 2007; 81(3): 559 - 575.

14. Влияние полиморфизма генов соматотропи-нового каскада на мясную продуктивность казахской белоголовой породы / И.С. Бейшова, Т.В. Поддудин-ская, Б.Б. Траисов [и др.] // Известия Оренбургского

государственного аграрного университета. 2018. № 2 (70). С. 194 - 199.

15. Бейшова И.С., Траисов Б.Б., Косилов В.И. Ассоциация snabi-полиморфизма гена инсулиноподобного фактора-1 (BIGF-1) с мясной продуктивностью крупного рогатого скота аулиекольской породы // Известия Оренбургского государственного аграрного университета. 2018. № 3 (71). С. 221 - 226.

16. Бейшова И.С., Траисов Б.Б., Косилов В.И. Влияние парных сочетаний генов гормона роста и ин-сулиноподобного фактора роста-1 на признаки мясной продуктивности скота аулиекольской породы // Известия Оренбургского государственного аграрного университета. 2018. № 4 (72). С. 267 - 271.

Александр Михайлович Ковальчук, аспирант. НАО «Западно-Казахстанский аграрно-технический университет имени Жангир хана». Республика Казахстан, 090009, г. Уральск, ул. Жангир хана, 51, zapkazatu@wkau.kz

Алёна Валентиновна Белая, кандидат сельскохозяйственных наук. УО «Белорусский государственный педагогический университет имени Максима Танка». Республика Беларусь, 220050, г. Минск, ул. Советская, 18, estfac@bspu.by

Юсупжан Артыкович Юлдашбаев, доктор сельскохозяйственных наук, профессор, академик РАН. ФГБОУ ВО «Российский государственный аграрный университет - МСХА имени К.А. Тимирязева». Россия, 127550, г. Москва, ул. Тимирязевская, 49, zoo@rgau-msha.ru

Индира Салтановна Бейшова, доктор сельскохозяйственных наук. НАО «Западно-Казахстанский аграрно-технический университет». Республика Казахстан, 090009, г. Уральск, ул. Жангир хана, 51, indira_bei@mail.ru Владимир Иванович Косилов, доктор сельскохозяйственных наук, профессор. ФГБОУ ВО «Оренбургский государственный аграрный университет». Россия, 460014, г. Оренбург, ул. Челюскинцев, 18, kosilov_vi@bk.ru

Alexander M. Kovalchuk, postgraduate. West Kazakhstan Agrarian Technical University. 51, Zhangir khan St., Uralsk, 090009, Republic of Kazakhstan, zapkazatu@wkau.kz

Alena V. Belaya, Candidate of Agriculture. Belarusian State Pedagogical University. 18, Soviet St., Minsk, 220050, Republic of Belarus, estfac@bspu.by

Yusupzhan A. Yuldashbaev, Doctor of Agriculture Sciences, Professor, Academician of the Russian Academy of Sciences. Russian State Agrarian University - Moscow Timiryazev Agricultural Academy. 49, Timiryazevskaya St., Moscow, 127434, Russia, zoo@rgau-msha.ru

Indira S. Beishova, Doctor of Agriculture. West Kazakhstan Agrarian Technical University. 51, Zhangir khan St., Uralsk, 090009, Republic of Kazakhstan, indira_bei@mail.ru

Vladimir I. Kosilov, Doctor of Agriculture, Professor. Orenburg State Agrarian University. 18, Chelyuskintsev St., Orenburg, 460014, Russia, kosilov_vi@bk.ru

-Ф-

Научная статья УДК 636.082.33

doi: 10.37670/2073-0853-2021-92-6-283-289

Генетическое разнообразие казахской белоголовой породы крупного рогатого скота*

Александр Михайлович Ковальчук

Западно-Казахстанский аграрно-технический университет

Аннотация. Представлены результаты молекулярно-генетических исследований крупного рогатого скота казахской белоголовой породы (KWh). Порода характеризуются относительно высоким уровнем генетического разнообразия среди изученных пород. Высокий уровень генетического разнообразия может быть связан с использованием естественного спаривания при разведении в отличие от искусственного осеменения. Установленный незначительный избыток гетерозигот можно рассматривать как показатель низкого уровня геномного инбридинга в популяции казахстанского белоголового скота (Fis = -0,007 [-0,007; -0,007]). Генетическая близость казахской белоголовой породы подтверждена минимальными значениями генетических дистанций между породами (Fst = 0,027) против 0,035 - 0,164 по сравнению с

* Работа выполнена в рамках грантового финансирования фундаментальных и прикладных научных исследований молодых учёных по научным и (или) научно-техническим проектам Министерства образования и науки Республики Казахстан АР08052960 «Породоспецифичное QTL-маркирование мясной продуктивности крупного рогатого скота аулиекольской и казахской белоголовой породы на основе полногеномного $№-чипирования» (№ госрегистрации 0120КК00043).

другими породами крупного рогатого скота, а также образованием единой ветви на филогенетических деревьях, построенных на основе значений Fst.

Ключевые слова: мясное скотоводство, казахская белоголовая порода, генетическое разнообразие, доля предковых геномных компонентов.

Для цитирования: Ковальчук А.М. Генетическое разнообразие казахской белоголовой породы крупного рогатого скота // Известия Оренбургского государственного аграрного университета. 2021. № 6 (92). С. 283 - 289. doi: 10.37670/2073-0853-2021-92-6-283-289.

Original article

Genetic diversity of the Kazakh white-headed cattle breed

Alexander M. Kovalchuk

West Kazakhstan Agrarian Technical University

Abstract. The article presents the results of molecular genetic studies of cattle of the Kazakh white-headed breed (kWh). The Kazakh white-headed breed is characterized by a relatively high level of genetic diversity among the studied breeds. A high level of genetic diversity may be associated with the use of natural mating in the breeding of the Kazakh white-headed breed, as opposed to artificial insemination. The established insignificant excess of heterozygotes can be considered as an indicator of a low level of genomic inbreeding in the studied population of Kazakh white-headed cattle (Fis = -0.007 [-0.007; -0.007]).The genetic proximity of the Kazakh white-headed breed is confirmed by the minimum values of genetic distances between breeds (Fst = 0.027) versus 0.035 - 0.164 compared to other breeds of cattle, as well as the formation of a single branch on phylogenetic trees based on Fst values.

Keywords: beef cattle breeding, Kazakh white-headed breed, genetic diversity, share of ancestral genomic components.

For citation: Kovalchuk A.M. Genetic diversity of the Kazakh white-headed cattle breed. Izvestia Orenburg State Agrarian University. 2021; 92(6): 283 - 289. (In Russ.). doi: 10.37670/2073-0853-2021-92-6-283-289.

В течение тысячи лет адаптация и миграция людей привели к приручению крупного рогатого скота, способного жить в различных средах, которые имеют уникальные генетические профили [1 - 7]. За последние несколько десятилетий во многих странах, включая Казахстан, были выведены коммерческие породы крупного рогатого скота с улучшенной продуктивностью при надлежащем содержании. Казахская белоголовая порода является одной из самых распространённых пород для производства мяса.

Генотипирование однонуклеотидного полиморфизма (SNP) является одним из наиболее продуктивных методов геномного прогнозирования и селекции животных [8, 9].

Казахской белоголовой породе принадлежит большая роль в становлении и развитии отрасли специализированного мясного скотоводства в Казахстане, животных этой породы успешно разводят во многих регионах страны. По данным Министерства сельского хозяйства Республики Казахстан, по состоянию на 1 января 2021 г. в 14 регионах Республики Казахстан насчитывалось более 393 тыс. гол. скота казахской белоголовой породы. Казахская белоголовая порода выведена путём скрещивания казахской и калмыцкой пород с использованием генофонда породы герефорд [10]. Животные этой породы сочетают в себе превосходные мясные качества и скороспелость, унаследованные от герефордов, а также адаптивные свойства, характерные для местного скота, что позволяет успешно разводить породу во всех регионах республики с обширными естественными пастбищами [11].

В процессе улучшения породы соответствующим образом изменилось направление разведения. На начальном этапе основным наследственным признаком считалась живая масса. С начала 60-х гг. XX в. отбор производился по интенсивности роста путём двухэтапной оценки быков по собственной продуктивности и качеству потомства. Также проводилась племенная работа по совершенствованию генеалогической структуры породы [12]. Животные казахской белоголовой породы отличаются хорошими репродуктивными, кормовыми и откормочными качествами [13, 14]. К достоинствам породы можно отнести: неприхотливость и выносливость; хорошую адаптацию как к жарким степным условиям, так и к холодному северу; устойчивость к различным заболеваниям крупного рогатого скота; качественное мясо; хороший набор веса - в 18 мес. молодняк достигает 450 кг, что считается хорошим показателем скороспелости.

Цель исследования - определение генетического разнообразия и структуры крупного рогатого скота казахской белоголовой породы и её сравнение с другими породами крупного рогатого скота при помощи базы данных SNP DRYAD.

Материал и методы. Для проведения молекулярно-генетических исследований использовались волосяные луковицы, отобранные от 100 гол. крупного рогатого скота казахской белоголовой породы (KWh). Геномную ДНК экстрагировали и генотипировали в Neogen Agrigenomics, США, согласно протоколу производителя GeneSeek GGP Bovine 150K, который содержит ~150 тыс. SNP («Illumina Inc.», США).

Контроль качества и фильтрацию данных генотипирования для каждого SNP и каждого образца выполняли с использованием программного пакета PLINK 1.9 (http://zzz.bwh.harvard. edu/plink/), применяя следующие фильтры (в скобках даны соответствующие команды в программе PLINK):

- Call-rate по всем исследуемым SNP для индивидуального образца не ниже 90 % (--mind);

- Call-rate для каждого из исследованных SNP по всем генотипированным образцам не ниже 90 % (--geno);

- частота встречаемости минорных аллелей (MAF) более 0,01 или 0,05 (--maf 0,01);

- отклонение генотипов по SNP от распределения Харди - Вайнберга в совокупности тестируемых образцов с достоверностью значения p-9 < 10-6 (--hwe). Кроме того, было оценено неравновесие связей, изученных SNP (оценка LD) с r2 < 0,2 с шагом 50 кб (--indep-pairwais). Для анализа данных генотипирования маркеров SNP (популяционный генетический и филогенетический анализ) была сформирована база данных генотипов SNP всего генома с использованием генотипов высокой плотности 16 других мясных и комбинированных пород крупного рогатого скота.

Для анализа данных генотипирования SNP-маркеров (популяционно-генетический и филогенетический анализ) была сформирована база данных полногеномных SNP-генотипов c использованием генотипов 16 пород российской и евразийской селекции крупного рогатого скота из цифрового хранилища Dryad (табл. 1).

1. Породы крупного рогатого скота, использованные в проведении сравнительных популяционно-генетических и филогенетических исследований

Порода Обозначение породы

Алатау AT

Бестужевская BEST

Чёрно-пёстрая BlPi

Бурятская Bur

Херефорд Her

Калмыцкая R KalR

Калмыцкая Б KalS

Казахская белоголовая российская популяция KWh_Rus

Казахская белоголовая (изучаемая казахстанская популяция) KWh

Холмогорская Khol

Костромская Kost

Тагильская Tag

Украинская серая Ukr_Grey

Украинская белоголовая Ukr Wh

Якутская Yak

Ярославская Yar

Аулиекольская АК

На основании полученных SNP-генотипов в R пакете dive Rsity проводили расчёт следующих популяционно-генетических параметров: наблюдаемая (Ho) гетерозиготность, несмещённая ожидаемая гетерозиготность (uHe), аллельное разнообразие (Ar), коэффициент инбридинга Fis (c доверительным интервалом 95 %). Анализ главных компонент (principal component analysis, PCA) выполняли в программе PLINK 1.9 с последующим построением графика в R пакете ggplot2. Дифференциация популяции оценивалась с помощью программы Arlequin, и на основе значений Fst было построено филогенетическое дерево с помощью метода Neighbor-Joining, реализованного в программе MEGAX [12]. Эволюционная история также была получена с использованием метода Neighbor-Joining [13]. Дерево нарисовано в масштабе, с длиной ветвей в тех же единицах, что и эволюционные расстояния, используемые для построения филогенетического дерева. Эволюционный анализ проводился в MEGA11. Структура популяции изучаемых пород крупного рогатого скота была выполнена с помощью Admixture 1.3 с графическим использованием Genesis.

Результаты исследования. По результатам проведённого контроля качества для популяционно-генетического и филогенетического анализа было отобрано 112 723 SNP и 99 гол. крупного рогатого скота. После применения LD-фильтра для популяционно-генетических исследований было отобрано 112 723 SNP.

Результаты оценки генетического разнообразия казахской белоголовой породы крупного рогатого скота в сравнении с другими породами крупного рогатого скота приведены в таблице 2.

По представленным в таблицах 2 и 3 данным, казахская белоголовая порода характеризуется относительно высоким уровнем генетического разнообразия среди изученных пород. Высокий уровень генетического разнообразия может быть связан с использованием естественного спаривания при разведении скота казахской белоголовой породы, в отличие от искусственного осеменения. Установленный незначительный избыток гетерозигот можно рассматривать как показатель низкого уровня геномного инбридинга в исследованной популяции казахстанского белоголового скота (Fis = -0,007 [-0,007; -0,007]).

Как отображено на рисунках 1 и 2, изучаемые нами породы крупного рогатого скота разделены на пять групп. Первый кластер составляют герефордская и казахская белоголовая породы крупного рогатого скота. Вторую группу составляют аулиекольская порода казахского скота. Формирование консолидированного изолированного кластера казахской белоголовой породы, несмотря на активное использование скрещивания с гере-фордами, можно рассматривать как показатель сохранения оригинальных геномных компонентов,

2. Параметры генетического разнообразия казахской белоголовой породы КРС*

Порода n Ho Ar uHe uFis [95 CI]

Kazakh WH 99 0,36 ± 0 1,91 ± 0,001 0,36 ± 0 -0,0076 [-0,0124; -0,0031]

Примечание: * Но - наблюдаемая гетерозиготность; Аг - аллельное разнообразие; иНе - объективная (неискажённая) ожидаемая гетерозиготность; uFis - несмещённый коэффициент инбридинга, рассчитанный на основе значений иНе; С1 - доверительный интервал.

отличающих казахскую белоголовую от крупного рогатого скота герефордской породы. Третья, четвертая и пятая группы являются наиболее многочисленными, представлены породами крупного рогатого скота России и Евразии.

Генетическая близость казахской белоголовой породы подтверждена минимальными значениями генетических дистанций между породами (Fst = 0,027) против 0,035 - 0,164 по сравнению

с другими породами крупного рогатого скота (табл. 3), а также образованием единой ветви на филогенетических деревьях, построенных на основе значений Fst (рис. 3).

Анализ генетической структуры изучаемых пород крупного рогатого скота показывает, что при К = 2 герефордская и якутская породы образуют свои кластеры, а другие породы демонстрируют разную степень адмиксии. Казахская

тч 2

В,КЧ I OS щ м> «.m V

щ Ж r-i 9t- V,

к *

оди • * ^ s t!, •*• ' Vv' с • * -ч J- u s.

* .tflti. ■ P.I $

* ■ Q.I' 1

• * a* *

-5 ЛЬ 0.01* \ Mft м4 ил t

1 ПК В At • №11 v EIFI ■ Bur v Наг

« Kift

О Х«|Э * KWh.nuB

* unal

* «ill ■> Km

A T4

4 Ufcr.crti A UhrWh a Yak D **

РСА1

Рис. 1 - Анализ основных компонентов (РСА1 и РСА2) изучаемой породы крупного рогатого скота

• MH fttti ал* «• uii

•••• С

♦ *

* ■ .* •

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

* *

f « • « •

• HV^i

*

ч -адй В DTI -J di * .

п Jff

■ в*н

О №1

■ ВЩГ • МП

* Ка1Я

С клл

I ЯМкш

* клш

* К«[

* кип

Л Тан

О

А. IJkr_V.li » Vak □ ¥lf

Рис. 2 - Анализ основных компонентов (РСА1 и РСА3) изучаемой породы крупного рогатого скота

3. Парные генетические дистанции (РэО между животными разных пород крупного рогатого скота

< Ala Tau Bestuzhev Black Pied Buryat Hereford KalmykR Kalmyks Kazakh Whiteheaded (Russian) Kliolmogory Kostroma KWh Tagil Ukrainian Grey Ukrainian Whiteheaded Yakut Yaroslavl

AK 0,0000

Ala_Tau 0,04871 0,0000

Bestuzhev 0,05200 0,05952 0,0000

Black_Pied 0,05978 0,06785 0,04651 0,0000

Buryat 0,06613 0,06571 0,07477 0,08657 0,0000

Hereford 0,08490 0,11436 0,11327 0,11797 0,13487 0,0000

KalmykR 0,05451 0,05990 0,06356 0,07293 0,04240 0,12359 0,0000

Kalmyks 0,04164 0,04577 0,04952 0,06004 0,02915 0,10999 0,01322 0,0000

Kazakh_White headed (Russian) 0,05958 0,08040 0,08241 0,08911 0,09755 0,03942 0,08735 0,07324 0,0000

Kliolmogory 0,06169 0,07047 0,05983 0,05858 0,08482 0,12123 0,07368 0,05950 0,09341 0,0000

Kostroma 0,07877 0,03617 0,09331 0,10190 0,10088 0,14804 0,09352 0,08123 0,11279 0,10249 0,0000

KWh 0,04838 0,06944 0,07137 0,07877 0,08425 0,03565 0,07410 0,06093 0,02768 0,07964 0,09910 0,0000

Tagil 0,04952 0,05447 0,04543 0,03736 0,06990 0,10946 0,05777 0,04465 0,0893 0,05066 0,08972 0,06736 0,0000

Ukrainian_Grey 0,08436 0,08705 0,09556 0,10427 0,08494 0,15553 0,08253 0,07050 0,11895 0,10381 0,11913 0,10484 0,09100 0,0000

Ukrainian Whiteheaded 0,04881 0,05101 0,05281 0,05660 0,06652 0,11361 0,05616 0,04096 0,08010 0,06142 0,08742 0,06702 0,04804 0,08863 0,0000

Yakut 0,14651 0,16508 0,16684 0,17475 0,11589 0,23544 0,13575 0,12911 0,19018 0,17118 0,19599 0,16405 0,16176 0,15701 0,17105 0,0000

Yaroslavl 0,06863 0,07286 0,06512 0,06543 0,08498 0,13019 0,07525 0,06080 0,09825 0,07052 0,10503 0,08566 0,05898 0,10887 0,06827 0,17449 0,0000

Рис. 3 - Филогенетическое древо различных пород крупного рогатого скота, построенное методом Neighbour joining

белоголовая порода демонстрирует большую долю наследственных геномных компонентов герефордской породы по сравнению с якутской. Доля предковых геномных компонентов в структуре казахской белоголовой породы сохраняется и при более высоких значениях K от 3 до 9. При К = 10 казахская белоголовая порода демонстрирует собственную генетическую структуру, отличную от герефордского скота, при этом следы герефордского скота сохраняются. Выявленная генетическая структура казахской белоголовой породы сохраняется даже при увеличении количества кластеров К с 14 до 20.

Выводы. Было установлено, что казахская белоголовая порода характеризуется относительно высоким уровнем генетического разнообразия, сопоставимым с такими породами как в России, так и Евразии, что может быть следствием использования естественного скрещивания при разведении казахской белоголовой породы. Установлено незначительное превышение гетерозигот (0,7 %), что можно рассматривать как показатель низкого уровня инбридинга в исследованной популяции казахского белоголового скота. Результаты анализа основных компонентов, расчёта генетических дистанций и оценок генетической структуры популяции показали сохранение оригинальных геномных компонентов у крупного

рогатого скота казахской белоголовой породы, что отличает его от родственных пород герефорд и других пород крупного рогатого скота мясного и комбинированного направлений Европы и Азии. Строение древа было получено в сравнении с другими породами, которые показывают, что казахская белоголовая - это отдельная порода. Даже по сравнению с казахской белоголовой породой казахстанского типа русская популяция имеет несколько иную генетическую структуру. Также для полноценной работы с казахстанскими породами крупного рогатого скота необходимы полногеномные исследования, включая митохон-дриальные и Y-хромосомные маркеры.

Литература

1. Бейшова И.С., Траисов Б.Б., Косилов В.И. Влияние парных сочетаний генов гормона роста и ин-сулиноподобного фактора роста-1 на признаки мясной продуктивности скота аулиекольской породы // Известия Оренбургского государственного аграрного университета.

2018. № 4 (72). С. 267 - 271.

2. Весовой рост тёлок казахской белоголовой породы и её помесей с герефордами / В.И. Косилов, Р.Г. Каля-кина, Е.А. Никонова [и др.] // Известия Оренбургского государственного аграрного университета. 2019. № 2 (76). С. 196 - 199.

3. Показатели линейного роста бычков-кастратов казахской белоголовой породы и её помесей с герефордской породой / В.И. Косилов, Е.А. Никонова, М.А. Нуржанова [и др.] // Известия Оренбургского государственного аграрного университета. 2019. № 2 (76). С. 205 -208

4. Никонова Е.А., Харламов А.В., Тюлебаев С.Д. Весовой рост бычков-кастратов казахской белоголовой породы и её помесей с герефордами // Известия Оренбургского государственного аграрного университета.

2019. № 4 (78). С. 202 - 205.

5. Бейшова И.С., Траисов Б.Б., Косилов В.И. Ассоциация snabi-полиморфизма гена инсулиноподобного фактора-1 (BIGF-1) с мясной продуктивностью крупного рогатого скота аулиекольской породы // Известия Оренбургского государственного аграрного университета. 2018. № 3 (71). С. 221 - 226.

6. Исупова Ю.В., Ачкасова Е.В. Перспективы использования оценки геномной племенной ценности в селекции молочного скота в условиях Удмуртской Республики// Известия Оренбургского государственного аграрного университета. 2021. № 4 (90). С. 307 - 312.

7. Каюмов Ф.Г., Третьякова Р.Ф., Третьякова Н.А. Создание генетической структуры нового мясного типа. Комолость стада // Известия Оренбургского государственного аграрного университета. 2021. № 4 (90). С. 255 - 258.

8. Boichard D. and Brochard M., New phenotypes for new breeding goals in dairy cattle. Animal, 2012. 6(4):544 - 550

9. Sermyagin A., Dotsev A., Elena A. Gladyr E., Tra-spov A., Deniskova T., Kostyunina O., Reyer H., Wimmers K., Barbato M., Paronyan I., Plemyashov K., Solkner J., Popov R., Brem G., and Zinovieva N.; Whole-genome SNP analysis elucidates the genetic structure of Russian cattle and its relationship with Eurasian taurine breeds. Genetic Selection Evolution, 2018. 50:37

10. Ministry of Agriculture of the Republic of Kazakhstan. The number of breeding cattle for meat production by breed in all categories of farms in the Republic of Kazakhstan as of 01.01.2021.

11. Омбаев А.М. Современные тенденции развития аграрной науки Казахстана в области животноводства // Известия Национальной академии наук Республики Казахстан. Алматы, 2013. № 6. С. 3 - 18.

12. Wickham, H. (2009) Ggplot2: Elegant Graphics for Data Analysis. 2nd Edition, Springer, New York.

13. Excoffier, L. and H.E.L. Lischer; Arlequin suite ver 3.5: A new series of programs to perform population genet-

ics analyses under Linux and Windows, 2010. Molecular Ecology Resources. 10: 564 - 567.

14. Влияние полиморфизма генов соматотропи-нового каскада на мясную продуктивность казахской белоголовой породы / И.С. Бейшова, Т.В. Поддудин-ская, Б.Б. Траисов [и др.] // Известия Оренбургского государственного аграрного университета. 2018. № 2 (70). С. 194 - 199.

Александр Михайлович Ковальчук, аспирант. НАО «Западно-Казахстанский аграрно-технический университет имени Жангир хана». Республика Казахстан, 090009, г. Уральск, ул. Жангир хана, 51, zapkazatu@wkau.kz

Alexander M. Kovalchuk, postgraduate. West Kazakhstan Agrarian Technical University. 51, Zhangir khan St.,

Uralsk, 090009, Republic of Kazakhstan, zapkazatu@wkau.kz

-♦-

Научная статья

УДК 636.082.

doi: 10.37670/2073-0853-2021-92-6-289-294

Селекционно-генетические параметры хозяйственно полезных признаков генотипированного молодняка абердин-ангусского скота по генам CАPN1 CAST и bGH*

Вячеслав Михайлович Габидулин, Светлана Анатольевна Алимова

Федеральный научный центр биологических систем и агротехнологий РАН

Аннотация. Представлены результаты исследования по выявлению селекционно-генетических параметров у генотипированного молодняка стада абердин-ангусской породы по генам CAPN1, CAST и bGH, ассоциированных с показателями продуктивности хозяйственно полезных признаков. По итогам исследования установлено, что гомозиготные желательные генотипы по генам CAPN1, bGH и CAST обоих полов молодняка абердин-ангусского стада достоверно имеют наименьший показатель коэффициента изменчивости, они более однородны по живой массе и высотному параметру. Установлено, что наибольшую положительную детерминацию с показателями продуктивности и промерами тела животных имеет гомозиготный желательный генотип гена bGH.

Ключевые слова: абердин-ангусская порода, молодняк, генотипы, селекционно-генетические параметры, гены, аллели, полиморфизм.

Для цитирования: Габидулин В.М., Алимова С.А. Селекционно-генетические параметры хозяйственно полезных признаков генотипированного молодняка абердин-ангусского скота по генам CAPN1 CAST и bGH // Известия Оренбургского государственного аграрного университета. 2021. № 6 (92). С. 289 -294. doi: 10.37670/2073-0853-2021-92-6-289-294.

Original article

Selection and genetic parameters of economically useful traits genotyped young Aberdeen-Angus cattle by genes CАPN1 CAST and bGH

Vyacheslav M. Gabidulin, Svetlana A. Alimova

Federal Research Centre of Biological Systems and Agrotechnologies

of the Russian Academy of Sciences

Abstract. The paper presents the results of a study to identify breeding and genetic parameters in genotyped young stock of the Aberdeen-Angus herd by genes CAPN1, CAST and bGH, associated with indicators of productivity of economically useful traits. According to the results of the study, it was found that homozygous desired genotypes for the CAPN1, bGH and CAST genes of both sexes of the young Aberdeen Angus herd reliably have the lowest coefficient of variability, they are more uniform in live weight and height parameter. It has been established that the homozygous desired genotype of the bGH gene has the greatest positive determination with the performance indicators and body measurements of animals.

Keywords: Aberdeen-Angus breed, young animals, genotypes, breeding and genetic parameters, genes, al-leles, polymorphism.

For citation: Gabidulin V.M., Alimova S.A. Selection and genetic parameters of economically useful traits genotyped young Aberdeen-Angus cattle by genes CAPN1 CAST and bGH. Izvestia Orenburg State Agrarian University. 2021; 92(6): 289 - 294. (In Russ.). doi: 10.37670/2073-0853-2021-92-6-289-294.

* Исследования выполнены в соответствии с планом НИР ФГБНУ ФНЦ БСТ РАН (№ 0526-2021-0001).

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.