Научная статья на тему 'Эпигенетический метод определения подтипа лимфомы из клеток мантийной зоны'

Эпигенетический метод определения подтипа лимфомы из клеток мантийной зоны Текст научной статьи по специальности «Прочие медицинские науки»

CC BY
2
0
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Журнал
Вопросы онкологии
Scopus
ВАК
RSCI
Ключевые слова
лимфома из клеток мантии / эпигенетика / диагностика лимфом / метилирование ДНК / CpG
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по прочим медицинским наукам , автор научной работы — Бигильдеев Алексей Евгеньевич, Карпенко Дмитрий Владимирович, Королева Дарья Александровна, Звонков Евгений Евгеньевич

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Текст научной работы на тему «Эпигенетический метод определения подтипа лимфомы из клеток мантийной зоны»

и оптимизированный нами ранее [2]. Модель оценки скорости и направления движения ДК исследовали в системе наблюдения за живыми клетками Cell-IQ с программным обеспечением Cell-IQ Analyser (CM Technologies Oy, Finland).

Результаты

Изучение на модели кокультивирования с клетками МК in vitro миграционных свойств незрелых ДК под влиянием компонентов опухолевого микроокружения, блокирующих их подвижность, показало, что между количественным содержанием факторов TGFßl, VEGF-A, EGF, FGF, HGF, цитокина IL10, растворимой формы лиганда sFASL в супернатантах культур МК и средней скорости движения ДК, определяемой в аналитической системе Cell-IQ, существует обратная корреляция высокой силы (р&к;0,01). Направление траекторий ДК, определяемое по углу движения клеточной популяции, было связано с экспрессией клетками МК диф-ференцировочных антигенов Melan A, тирозиназы, раково-тестикулярных антигенов семейств MAGE, BAGE, NY-ESO1. Добавление в культуральную модельную систему высоких концентраций ILIO, TGFßl, VEGF приводило к статистически значимому уменьшению длины траектории и средней скорости прохождения траектории ДК (p<0,05).

Выводы

Опухоль формирует иммуносупрессивное микроокружение, которое способно воздействовать на скорость и направление миграции ДК.

Список литературы

1. Sakref C, Bendriss-Vermare N, Valladeau-Guilemond J . Phenotypes and Functions of Human Dendritic Cell Subsets in the

Tumor Microenvironment. Methods Mol Biol . 2023;2618:17-35 . DOI: 10 ,1007/978-1-0716-2938-3_2 . 2 . Нехаева Т. Л . Оптимизация аутологичных дендритно-клеточных вакцин для лечения больных злокачественными

новообразованиями / Т Л . Нехаева // Сибирский онкологический журнал . 2013 . Vol . 57 . № 3 . P 52-56 .

Эпигенетический метод определения подтипа лимфомы из клеток мантийной зоны

Авторы:

(1) Бигильдеев Алексей Евгеньевич, Bigildeev.ae@gmail.com, ФГБУ «НМИЦ гематологии» Минздрава России, Москва

(2) Карпенко Дмитрий Владимирович, D_@list.ru, ФГБУ «НМИЦ гематологии» Минздрава России, Москва

(3) Королева Дарья Александровна, koroleva_12-12@mail.ru, ФГБУ «НМИЦ гематологии» Минздрава России, Москва

(4) Звонков Евгений Евгеньевич, dr.zvonkov@gmail.com, ФГБУ «НМИЦ гематологии» Минздрава России, Москва

Ключевые слова

лимфома из клеток мантии, эпигенетика, диагностика лимфом, метилирование ДНК, CpG

Актуальность

Выделяют два основных подтипа лимфомы из клеток мантии (ЛКМ): классический (С1) и лейкеми-ческий ненодальный (С2) [1]. Для классического варианта характерно агрессивное течение заболевания, наличие симптомов опухолевой интоксикации (В-симптомы) и генерализованной лимфаденопатии. В случаях лейкемической ненодальной формы ЛКМ чаще наблюдается индолентное течение заболевания, поражение костного мозга, лейкемизация и спленомегалия, незначительное увеличение размеров лимфатических узлов. Для определения варианта ЛКМ используются клинико-лабораторные данные, имму-ногистохимические и молекулярно-генетические исследования. Недавно было установлено, что подтипы ЛКМ можно установить, измерив степень метилирования всего трех CpG [2], однако этот метод дорогой и трудоемкий, поскольку опирается на получение полногеномного профиля метилирования ДНК с помощью NGS-секвенирования.

Цель

Провести пилотное исследование по определению подтипа ЛКМ с помощью избирательного анализа степени метилирования CpG с помощью секвенирования по Сэнгеру.

Материалы и методы

В дебюте заболевания у пациентов с ЛКМ (n=18) были получены клетки периферической крови (ПК) (n=11), костного мозга (n=6) или биоптат лимфоузла (n=1). В качестве контроля были использованы клетки ПК пациентов с неопухолевыми заболеваниями системы крови (n=3). Из клеток выделяли ДНК и проводили бисульфитную конверсию. Амплифицировали CpG cg03425785, cg07769421 и cg23892310 c помощью подобранных условий реакции и праймеров, фланкирующих локусы интереса в традиционной ПЦР. Очищали продукт ПЦР и секвенировали его по Сэнгеру. Степень метилирования CpG определяли по ранее разработанной методике [3].

Результаты

В 5 образцах ПК был обнаружен лимфоцитоз. Разработанный метод позволил верно определить подтип ЛКМ в 80% (4/5) из них: по 2 случая С1- и С2-подтипов. В образцах костного мозга метод позволил верно определить подтип только в 50% случаев (3/6). Стоит отметить, что в норме доля лимфоцитов в костном мозге ниже, чем в ПК, и искажение клеточного состава костного мозга вследствие его лейкемизации обычно менее выражено, чем искажение формулы крови. Вероятно, с этим связана меньшая точность метода в костном мозге. В единственном образце, где в качестве источника ДНК была биопсия лимфоузла, подтип ЛКМ был определен верно (С1).

Выводы

Эпигенетический метод определения подтипа ЛКМ показал свою перспективность, но нуждается в доработке. Для повышения точности метода представляется целесообразным выделять ДНК не из суммарной клеточной популяции ПК или костного мозга, а из мононуклеарных клеток или из фракции В-лимфоцитов. Это позволит увеличить долю опухолевых клеток в образце и повысит точность метода.

Список литературы

1. Queirös, A. C . et al . Cancer Cell 30, 806-821 (2016) . DOI: 10 ,1016/j . ccell . 2016 . 09 . 014.

2 . Duran-Ferrer, M . et al . Nat . cancer 1, 1066-1081 (2020) . DOI: 10 ,1038/s43018-020-00131-2 .

3 . Karpenko, D . et al . DNA Cell Biol . 39, 790-800 (2020) . DOI: 10 ,1089/dna . 2019 . 5310 .

Исследование эффективности нового соматоклеточного противоопухолевого препарата «Мукоплазмин-ovа» для CAR-T терапии СА125-позитивных опухолей

Авторы:

(1) Боженко Владимир Константинович, vbojenko@mail.ru, ФГБУ «Российский научный центр рентгено-радиологии» Минздрава России, Москва

(2) Киселева Яна Юрьевна, yana.kiseleva@gmail.com, ФГБУ «Российский научный центр рентгенорадио-логии» Минздрава России, Москва

(3) Шишкин Александр Михайлович, schy@mail.ru, ФГБУ «Российский научный центр рентгенорадиоло-гии» Минздрава России, Москва

(4) Кулинич Татьяна Михайловна, sobral@mail.ru, ФГБУ «Российский научный центр рентгенорадиологии» Минздрава России, Москва

(5) Большакова Оксана Борисовна, oksana.bolshakova.rncr@mail.ru, ФГБУ «Российский научный центр рентгенорадиологии» Минздрава России, Москва

(6) Кудинова Елена Александровна, dockudinova@mail.ru, ФГБУ «Российский научный центр рентгенорадиологии» Минздрава России, Москва

(7) Солодкий Владимир Алексеевич, mailbox@rncrr.ru, ФГБУ «Российский научный центр рентгенорадио-логии» Минздрава России, Москва

Ключевые слова

иммунотерапия, рак яичников, соматоклеточный лекарственный препарат, CAR-T терапия

Актуальность

Опухоль-специфичный антиген рака яичников СА125 считается привлекательной терапевтической антигенной мишенью для таргетной терапии [2]. В работе приведены результаты исследования противоопухолевой

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.