10Научные междисциплинарные исследования
УДК 575.164
Искакова Гульназ Махамадьяновна Iskakova Gulnaz Mamadjanovna
Магистрант Undergraduate
Башкирский государственный педагогический университет им. М. Акмуллы Bashkir state pedagogical University named after M. Akmulla
Гилязова Ирина Ришатовна Gilyazova Irina Rishatovna
Кандидат биологических наук, научный сотрудник Candidate of biology, research fellow Институт биохимии и генетики Уфимского научного центра
Российской академии наук
Institute of biochemistry and genetics of the Ufa scientific center of the Russian Academy of
Sciences
АНАЛИЗ ПОЛИМОРФНОГО ВАРИАНТА RS1642742 ГЕНА VHL У ПАЦИЕНТОВ СО СВЕТЛОКЛЕТОЧНЫМ РАКОМ ПОЧКИ
ANALYSIS OF THE RS1642742 POLYMORPHIC VARIANT OF THE VHL GENE IN PATIENTS WITH LIGHT CELL KIDNEY CANCER
Аннотация: в данной статье рассматривается исследование почечно-клеточной карциномы (ПКК). Она является распространенной почечной неоплазией различных морфологических типов, среди которых светлоклеточная ПКК встречается наиболее часто. Порядка 70% спорадических случаев светлоклеточного рака почки сопровождается инактивацией гена фон Хиппеля-Линдау (VHL). Ген VHL является мишенью для нескольких микроРНК - малых некодирующих РНК, осуществляющих посттранскрипционную регуляцию генов.
Abstract: this article discusses the study of renal cell carcinoma (RCC). It is a common renal neoplasia of various morphological types, among which light-cell PKK is most common. About 70% of sporadic cases of light cell kidney cancer are accompanied by inactivation of the von Hippel-Lindau gene (VHL). The VHL gene is a target for several microRNAs - small non-coding RNAS that perform post-transcriptional regulation of genes.
Ключевые слова: светлоклеточный рак почки, миркоРНК, VHL, полиморфизм. Keywords: light cell kidney cancer, mircorna, VHL, polymorphism.
II Международная научно-практическая конференция Почечно-клеточная карцинома (ПКК) является распространенной
почечной неоплазией различных морфологических типов, среди которых
светлоклеточная ПКК встречается наиболее часто. МикроРНК - короткие
некодирующие РНК длиной 18-25 нуклеотидов, которые взаимодействуют по
комплементарному принципу с З'-нетранслируемыми областями мРНК-
мишеней. Было показано, что многочисленные гены, участвующие в
патогенезе ПКК, такие как VHL, PTEN, HIF1-a, mTOR, являются мишенями
микроРНК [1, с. 150]. Ряд исследований указывает на потенциальную связь
SNP в сайтах связывания микроРНК с развитием злокачественных
новообразований и их прогрессированием. Изменение характера
взаимодействия с сайтом связывания микроРНК в результате единственного
нуклеотидного замещения может способствовать изменению экспрессии
генов-мишеней, участвующих в возникновении и развитии опухолей. В связи
с этим, нами был проведен анализ полиморфного варианта, располагающегося
в сайте связывания микроРНК гена VHL rs1642742.
Материалом исследования послужили образцы ДНК, выделенные из
периферической венозной крови 50 пациентов со светлоклеточным раком
почки (скПКК) и 50 индивидов контрольной группы без онкологических
заболеваний. Выделение ДНК проводилось методом фенол-хлороформной
экстракции. Концентрация и чистота выделенных нуклеиновых кислот были
определены спектрофотометрически, путем измерения их оптической
плотности с использованием спектрофотометра NanoDrop ND-1000 (Thermo
Scientific). Генотипирование полиморфного варианта rs1642742
осуществлялось с помощью метода дискриминации аллелей TaqMan с
использованием прибора CFX96 Touch™ Real-Time PCR Detection System.
При сравнительном анализе частот генотипов и аллелей полиморфного
локуса rs1642742 гена VHL было показано, что генотип rs1642742*AA
(p=0,0165; OR= 0,5978; 95% CI (0,3915-0,9213)) встречался у пациентов скПКК
в возрасте 55 лет и старше значительно реже, чем в контрольной группе той
же возрастной категории, тогда как генотип rs1642742*GG чаще встречался у
Научные междисциплинарные исследования пациентов скПКК (p=0,0381; OR= 1,8412; 95% CI (1,0314-3,3122)), являясь
маркером повышенного риска развития заболевания. Moore L.E. с соавт.
показали, что полиморфный вариант rs1642742 гена VHL был связан с риском
гиперметилирования VHL-промотора. Случаи скПКК с конкретными
полиморфизмами зародышевой линии VHL с большей вероятностью имели
инактивацию VHL посредством гиперметилирования промотора, чем путем
изменения последовательности ДНК опухолевой ткани. Таким образом,
можно предположить, что присутствие этих SNP может представлять собой
пример облегченной эпигенетической вариации (унаследованной склонности
к эпигенетической вариации) в ткани почки [2, c. e1002312]. В настоящем
исследовании у индивидов, которые имеют G аллель rs1642742 был обнаружен
повышенный риск развития скПКК в возрасте 55 лет и старше. Схожие
результаты были представлены в исследовании Wen-Chung Wang et al., где
частота аллеля G в rs1642742 была намного выше при поздних стадиях
карциномы почек у пациентов из Тайваня [3, c. 638]. Недавнее исследование
выявило ассоциацию генотипа GG rs1642742 со снижением общей
выживаемости, а также тенденцию к снижению выживаемости без признаков
прогрессирования заболевания при метастатическом светлоклеточном раке
почки у пациентов, получавших терапию ингибиторами тирозинкиназы
VEGF-рецептора. Кроме того, отмечалась более высокая частота
саркоматоидной дифференцировки у носителей генотипа GG по сравнению с
AG/AA [4, c. 266]. Предполагается, что вариант rs1642742*G нарушает
связывание нескольких микроРНК, регулирующих экспрессию VHL, среди
которых есть члены семейства Let-7, подавляющего развитие опухоли.
Известно, что повышенный уровень Let-7a позволяет дифференцировать
подгруппу скПКК с более высокой 5-летней выживаемостью (Cancer Genome
Atlas Research Network, 2013).
Важной задачей молекулярно-генетических исследований в области онкологии является совершенствование методов профилактики и своевременного лечения онкологических заболеваний и, как следствие,
II Международная научно-практическая конференция снижение уровня заболеваемости и смертности. Полиморфные варианты
могут служить маркерами для оценки риска развития и прогнозирования
течения различных заболеваний, в том числе рака почки. Полученные в
данном исследовании результаты вносят вклад в формирование панели
молекулярных маркеров, тем не менее, требуются дальнейшие крупные
исследования в данной области.
Библиографический список:
1. Chow TF, Youssef YM, Lianidou E et al. Differential expression profiling of microRNAs and their potential involvement in renal cell carcinoma pathogenesis. Clin Biochem. 2010. - V.43. - № (1-2). - Р.150-8. doi: 10.1016/j.clinbiochem.2009.07.020.
2. Moore, L.E. Von Hippel-Lindau (VHL) inactivation in sporadic clear cell renal cancer: associations with germline VHL polymorphisms and etiologic risk factors./ L.E. Moore, M.L. Nickerson, P. Brennan, et al. // PLoS Genet. - 2011. - V. 7. - № 10. - P. e1002312.
3. Wang, W.-C. Two single nucleotide polymorphisms in the von Hippel-Lindau tumor suppressor gene in Taiwanese with renal cell carcinoma/ W.-C. Wang, M.-H. Tsou, H.-J. Chen, et al. // BMC Res. Notes. - 2014. - V. 7. - № 1. - P. 638.
4. Verbiest, A. Polymorphisms in the Von Hippel-Lindau Gene Are Associated With Overall Survival in Metastatic Clear-Cell Renal-Cell Carcinoma Patients Treated With VEGFR Tyrosine Kinase Inhibitors/ A. Verbiest, D. Lambrechts, T. Van Brussel, et al. // Clin. Genitourin. Cancer. - 2018. - V. 16. - № 4. - P. 266-273.
© Г.М. Искакова, И.Р. Гилязова, 2020
