Научная статья на тему 'Выделение, очистка и характеристика l,d-транспептидазы 2 Mycobacterium tuberculosis'

Выделение, очистка и характеристика l,d-транспептидазы 2 Mycobacterium tuberculosis Текст научной статьи по специальности «Фундаментальная медицина»

CC BY
309
77
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Журнал
Acta Naturae (русскоязычная версия)
WOS
Scopus
ВАК
RSCI
PubMed
Ключевые слова
L / D-TRANSPEPTIDASE / MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS / ENZYME PURIFICATION / RECOMBINANT ENZYME / ENZYME / REACTIVATION / L / D-ТРАНСПЕПТИДАЗА / ОЧИСТКА ФЕРМЕНТА / РЕКОМБИНАНТНЫЙ ФЕРМЕНТ / РЕАКТИВАЦИЯ ФЕРМЕНТА

Аннотация научной статьи по фундаментальной медицине, автор научной работы — Балдин С.М., Щербакова Т.А., Швядас В.К.

L,D-транспептидаза типа 2 Mycobacterium tuberculosis играет ключевую роль в формировании неклассических 3-3-поперечных сшивок пептидогликана в клеточной стенке патогена, обуславливая его устойчивость к широкому спектру антибиотиков пенициллинового ряда. Нами оптимизированы условия экспрессии, выделения и очистки рекомбинантной L,D-транспептидазы 2 из M. tuberculosis. Важным факто ром, вызывающим инактивацию фермента, является окисление SH-групп каталитического остатка цисте ина Cys354 как в процессе экспрессии, так и при хранении препарата. Определены биохимические свойства очищенной L,D-транспептидазы 2 как полной, так и без домена А, а также кинетические характеристики катализируемой ферментом реакции превращения нитроцефина.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по фундаментальной медицине , автор научной работы — Балдин С.М., Щербакова Т.А., Швядас В.К.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Isolation, Purification and Characterization of L,D-transpeptidase 2 from Mycobacterium tuberculosis

L,D-transpeptidase 2 from Mycobacterium tuberculosis plays a key role in the formation of nonclassical 3-3 peptidoglycan cross-links in a pathogen’s cell wall making it resistant to a broad range of penicillin antibiotics. The conditions of cultivation, isolation, and purification of recombinant L,D-transpeptidase 2 from M. tuberculosis have been optimized in this study. Oxidation of the free SH groups of catalytic cysteine Cys354 is an important factor causing the inactivation of the enzyme, which occurs during both the expression and storage of enzyme preparations. The biochemical characteristics of purified L,D-transpeptidase 2 and L,D-transpeptidase 2 lacking domain A were determined; the kinetic constants of enzyme-catalyzed nitrocefin transformation were evaluated.

Текст научной работы на тему «Выделение, очистка и характеристика l,d-транспептидазы 2 Mycobacterium tuberculosis»

УДК 577.152.232, 577.112.083, 577.151.042, 579.234, 579.873.21

Выделение, очистка и характеристика ¿,0-транспептидазы 2 Mycobacterium tuberculosis

С. М. Балдин1,2, Т. А. Щербакова1, В. К. Швядас1,2*

'Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова, НИИ физико-химической

биологии им. А.Н. Белозерского, 119991, Москва, Ленинские горы, 1, стр. 40

2Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова, химический факультет,

119991, Москва, Ленинские горы, 1, стр. 3

*E-mail: vytas@belozersky.msu.ru

Поступила в редакцию 21.11.2016

Принята в печать 13.12.2016

РЕФЕРАТ Ь,0-транспептидаза типа 2 Mycobacterium tuberculosis играет ключевую роль в формировании неклассических 3-3-поперечных сшивок пептидогликана в клеточной стенке патогена, обуславливая его устойчивость к широкому спектру антибиотиков пенициллинового ряда. Нами оптимизированы условия экспрессии, выделения и очистки рекомбинантной Ь,0-транспептидазы 2 из M. tuberculosis. Важным фактором, вызывающим инактивацию фермента, является окисление SH-групп каталитического остатка цисте-ина Cys354 как в процессе экспрессии, так и при хранении препарата. Определены биохимические свойства очищенной Ь,0-транспептидазы 2 - как полной, так и без домена А, а также кинетические характеристики катализируемой ферментом реакции превращения нитроцефина.

КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА Ь,0-транспептидаза, Mycobacterium tuberculosis, очистка фермента, рекомбинантный фермент, реактивация фермента.

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ Ac - ацетил; Ldt - Ь,0-транспептидаза; LdtMtl и LdtMt2 - Ь,0-транспептидазы Mycobacterium tuberculosis первого и второго типа; m-DAP - мезо-диаминопимелиновая кислота; IG -иммуноглобулин; Amp - ампициллин; IPTG - изопропил-Р-О-1-тиогалактопиранозид; LEW - Lysis/ Equilibration/Wash-буфер; ПААГ-электрофорез - электрофорез в полиакриламидном геле; DTT - дити-отреитол.

ВВЕДЕНИЕ

Туберкулез - опасное инфекционное заболевание, возбудителем которого является Mycobacterium tuberculosis. Число случаев туберкулеза с множественной и широкой лекарственной устойчивостью ежегодно возрастает [1]. Терапия туберкулеза заключается в комбинированном применении четырех основных препаратов первого эшелона, в который входят: рифампицин - ингибитор ДНК-зависимой РНК-полимеразы; изониазид и пиразинамид - бло-каторы синтеза миколовых кислот, необходимых для формирования клеточной стенки M. tuberculosis; этамбутол - ингибитор арабинозилтрансферазы, фермента, участвующего в синтезе арабиногалакта-на. Лечение больных в активной фазе может длиться более 6 месяцев. В некоторых случаях M. tuberculosis может сохраняться в легких в так называемой стационарной фазе, когда рост бактерий замедлен, не наблюдается иммунного ответа и проявляется устойчивость к различным антибиотикам [2]. В этой связи

большой интерес представляет поиск лекарственных средств, действующих на ранее не известные молекулярные мишени, связанные с особенностями жизнедеятельности и структурной организацией возбудителя туберкулеза. В последнее время понятными стали особенности формирования клеточной стенки ряда опасных патогенов, в том числе M. tuberculosis. В то время как у большинства бактерий главную роль в синтезе поперечных сшивок в пептидогли-кане играют пенициллинсвязывающие ферменты DD-транспептидазы, которые катализируют перенос 3-го остатка мезо-диаминопимелиновой кислоты (m-DAP) или L-Lys на 4-й остаток D-Ala (4-3-сшив-ки), образование большей части поперечных сшивок у M. tuberculosis осуществляют LD-транспептидазы, катализирующие перенос 3-го остатка m-DAP на аналогичный остаток другой цепи пептидоглика-на (3-3-сшивки) [3, 4], содержание которых в возбудителе туберкулеза достигает 80%. Первоначально LD-транспептидазы обнаружили у таких микро-

организмов, как Escherichia coli [5], Bacillus subtilis [6] и Enterococcus faecium [7], а о присутствии этих ферментов и их исключительной роли в формировании клеточной стенки у таких патогенов, как M. tuberculosis [8] и Helicobacter pylori [9], стало известно сравнительно недавно. Это открытие помогло понять причины низкой эффективности ß-лактамных антибиотиков при туберкулезе и ряде других инфекционных заболеваний: LD-транспептидазы, в отличие от DD-транспептидаз, не чувствительны к широко используемым пенициллинам и цефалоспоринам [10, 11]. Важность этих ферментов в функционировании микобактерий делает их одной из наиболее привлекательных мишеней для поиска ингибиторов с целью создания новых антибиотиков, обладающих противотуберкулезной активностью.

LD-транспептидазы относятся к классу амино-ацилтрансфераз [КФ 2.3.2]. Они принадлежат к суперсемейству белков с YkuD-доменами, название которому дала LD-транспептидаза (YkuD-фермент) B. subtilis - первый фермент с известной кристаллической структурой [6]. Геном M. tuberculosis кодирует пять белков, содержащих домен, обладающий L,D-транспептидазной активностью (участки Rv0116c, Rv0192, Rv0483, Rv1433 и Rv2518c) [11]. Наиболее активно экспрессируется LD-транспептидаза второго типа (LdtMt2) [8], с которой связывают высокое содержание «неклассических» 3-3-сши-вок в пептидогликане клеточной стенки патогена. Определены аминокислотные последовательности LD-транспептидаз возбудителя туберкулеза, однако структуры установлены лишь у ферментов первого и второго типа (LdtMt1 и LdtMt2). Предшественник LdtMt2 состоит из 408 аминокислотных остатков, образующих сигнальный пептид (Met1-Ala34) и цепь самого фермента (Cys35-Ala408), которую можно разделить на три домена: два некаталитических IG-подобных домена А и В (остатки Ala55-Ser147 и Pro148-Gly250 соответственно), а также каталитический домен С (остатки Asp251-Ala408), обладающий транспептидазной активностью. Ключевыми для катализа остатками LdtMt2 являются Cys354, His336 и Ser337, составляющие цепь переноса протона [8]. Активный центр LdtMt2 не экспонирован непосредственно в раствор, а расположен под так называемой «крышкой» Tyr298-Trp324 [12], формирующей три канала (A, B и C), по двум из которых (B и С) возможна доставка субстрата в активный центр.

Определена структура комплекса LdtMt2 с ди-пептидным фрагментом (N-Y-D-глутамил-т^АР) пептидогликана в активном центре фермента, PDB 3TUR [11], получены также структурные данные для ковалентных комплексов LdtMt2 с меропене-мом и LdtMt1 с имипенемом [12, 13]. С использова-

Канал С

Рис. 1. Объединенные кадры из молекулярно-дина-мических траекторий, в которых фрагменты пепти-догликана связаны с активным центром через разные каналы (В и С) [16]

нием методов предстационарной кинетики изучена инактивация LdtMtl различными Р-лактамными соединениями, такими, как меропенем, имипенем, дорипенем и эртапенем [14]. Показано [15], что эффективным ингибитором LdtMt могут быть не только карбапенемы, но и Р-лактамный антибиотик пене-мового ряда - фаропенем. Проведенное нами исследование взаимодействия фермента с тетрапептид-ным фрагментом пептидогликана клеточной стенки, а также с известными Р-лактамными ингибиторами при помощи методов молекулярного моделирования [16] позволило выявить особенности связывания N- и C-концевых фрагментов растущей цепи пептидогликана под действием LdtMt2 при образовании поперечных 3-3-сшивок и построить адекватную полноатомную модель LdtMt2 для скрининга и оптимизации структуры ингибиторов (рис. 1). Особенность действия Ь,0-транспептидаз заключается в том, что эти ферменты связывают в активном центре две молекулы субстрата - одну в качестве ацильного донора, которая в дальнейшем образует промежуточный ацилфермент, другую - в качестве нуклеофила, которая после связывания с ацилфер-ментом и переноса ацильной группы L-центра остатка m-DAP одной цепи пептидогликана на аминогруппу D-центра остатка m-DAP другой цепи формирует поперечную 3-3-сшивку пептидогликана клеточной стенки. Молекулярное моделирование показало, что связывание N-концевого фрагмента растущей цепи пептидогликана (ацильного донора), а также Р-лактамных соединений, способных инактивиро-вать фермент в результате образования стабильного ацилфермента, происходит в канале С, в то время как C-концевой (нуклеофильный) фрагмент растущей цепи связывается в канале В.

Задача данной работы состояла в выделении, очистке и характеристике LdtMt2 из M. tuberculosis с целью получения препаратов фермента для экспе-

риментального изучения ингибиторной способности соединений, отобранных в результате компьютерного скрининга.

ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ

Экспрессия LdtMt2 и LdtMt2_cut в E. coli, выделение и очистка

Наряду с препаратом «полноразмерной» LdtMt2 при выполнении работы был также получен препарат фермента, не содержащего в своей структуре домена А (мы назвали такой препарат LdtMt2_cut). Сравнительное изучение двух препаратов (LdtMt2 и LdtMt2_cut) могло помочь ответить на вопрос

0 влиянии домена А на каталитическую активность фермента. Для экспрессии фермента использовали плазмиду pET-19b, несущую либо ген Rv2518c (LdtMt2), не содержащий участка, кодирующего сигнальный пептид (остатки Phe54-Ala408), либо ген Rv2518c_cut (LdtMt2_cut), в котором отсутствовал не только участок, кодирующий сигнальный пептид, но и домен А (остатки Pro148-Ala408). В обоих случаях на N-концах белка располагался концевой пептид, состоящий из 24 аминокислотных остатков: MGHHHHHHHHHHSSGHIDDDDKHM с декагисти-диновым концевым фрагментом (His-tag). Колонии E. coli BL21(DE3) с трансформированной плазмидой pET-19b выращивали в среде LB в течение ночи. В дальнейшем переносили 100 мкл полученной культуры в колбу с отбойниками со средой LB, содержащей ампициллин (Amp) в концентрации 100 мкг/мл. Среду инкубировали при 37°С и 180 об/мин в течение 6-7 ч до достижения оптической плотности 0.6-0.8 при к = 600 нм.

Экспрессию фермента начинали, снижая температуру до 15°С и добавляя водный раствор CaCl2 до концентрации 2 мМ, изопропил-ß-D-l-тиогалактопиранозид (IPTG) до концентрации 0.5 мМ и глицерин до 2% (по объему), и продолжали в течение 4, 24 и 48 ч. Все операции по выделению фермента проводили во льду, образцы центрифугировали при 4°С. Выделение проводили по стандартной методике использования колонок Protino Ni-TED 1000 (MACHEREY-NAGEL GmbH & Co) для очистки белков, содержащих His-tag [17]. Клетки осаждали в центрифуге при 4000 об/мин и 4°С в течение 15 мин, сырую клеточную массу взвешивали, затем ресу-спендировали в 3 мл LEW-буфера (50 мM NaH2PO4 pH 8.0, 0.3 М NaCl), добавляли лизоцим до концентрации

1 мг/мл, инкубировали в течение 30 мин и разрушали под действием ультразвука в ледяной воде в течение 10 мин. Полученный лизат центрифугировали при 12000 об/мин в течение 30 мин при 4°С, суперна-тант фильтровали через 0.2-мкм фильтр и наносили

на колонку Ргойпо Ni-TED 1000, уравновешенную 2 мл LEW-буфера. Клеточные белки смывали двумя порциями (по 2 мл) LEW-буфера, LdtMt2 элюировали тремя порциями (по 1.5 мл) буфера для элюции (50 мМ ^Н2Р04, 0.3 М ШС1, 0.25 мМ имидазол, рН 8.0). Общую концентрацию белка и выход фермента контролировали на всех этапах очистки с использованием микробиуретового метода [18].

Определение концентрации SH-групп

Свободные SH-группы титровали, используя реактив Эллмана 5,5'-дитиобис-2-нитробензойную кислоту (DTNB) в концентрации 10 мМ (4 мг/мл) в денатурирующем буфере (0.1 М Трис-НС1, содержащем 6 М гуанидинхлорид, рН 8.0). В качестве модельного соединения для построения калибровочной прямой использовали ^ацетилцистеин (N-Ac-L-Cys). Готовили 0.2 мМ раствор N-Ac-L-Cys, в денатурирующий буфер добавляли 7 мкл реактива Эллмана в концентрации 10 мМ (4 мг/мл) и 5-55 мкл раствора N-Ac-L-Cys (2-22 мкМ), чтобы общий объем смеси составлял 500 мкл. Полученную смесь инкубировали в течение 5 мин и определяли поглощение при 412 нм. Концентрацию SH-групп рассчитывали, используя значение коэффициента экстинкции образующейся 2-нитро-5-тиобензойной кислоты при 412 нм и рН 8.0, равное 14150 М-1см-1 [19].

Таким же образом титровали свободные SH-группы в препаратах LdtMt2 и LdtMt2_cut. Образец объемом 62-125 мкл с известной концентрацией фермента добавляли в денатурирующий буфер с 7 мкл реактива Эллмана, чтобы конечный объем смеси составлял 500 мкл, инкубировали в течение 5 мин и определяли поглощение при 412 нм. Концентрацию SH-групп в ферменте рассчитывали аналогично N-Ac-L-Cys.

Определение активности LdtMt2 и LdtMt2_cut с использованием нитроцефина

В настоящее время низкомолекулярные аналоги фрагмента клеточной стенки, которые могли быть удобными субстратами для определения активности фермента, не известны, поэтому активность LdtMt2 и его кинетику принято изучать с использованием хромогенного субстрата нитроцефина (рис. 2) [11].

Рис. 2. Структурная формула нитроцефина - субстрата ^,0-транспептидазы

Таблица 1. Результаты культивирования, выделения и очистки препаратов LdtMt2 и LdtMt2_cut

Препарат Время экспрессии, ч Масса клеток после центрифугирования, г Концентрация белка в клеточных экстрактах, мг/мл Масса очищенного фермента, мг

LdtMt2 4 - - 1.2

24 0.62 3.7 2.4

48 0.86 4.1 2.4

LdtMt2_cut 4 - - 0.8

24 0.71 3.1 1.9

48 0.95 3.8 1.9

Активность ферментных препаратов по отношению к нитроцефину определяли по величине абсорбции продукта гидролиза ß-лактамного кольца при 486 нм в 0.02 M буфере HEPES рН 7.5 в присутствии 0.1 M KCl. Значение коэффициента экстинкции продукта принимали равным 20500 М-1см-1 [11].

Культивирование в восстанавливающих условиях для предотвращения инактивации фермента

Проведенные нами опыты по выделению и очистке LdtMt2 показали, что для получения активных препаратов фермента необходимо использовать восстанавливающие условия, которые препятствуют окислению каталитического остатка цистеина. С этой целью при культивировании продуцента за 3 ч до окончания экспрессии в среду добавляли дити-отреитол (DTT) до концентрации 6 мМ. Выделение фермента также проводили в присутствии DTT.

РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ

В процессе получения препаратов LdtMt2 и LdtMt2_ cut для выявления оптимальных условий по выходу целевого фермента проводили экспрессию в течение различных промежутков времени: 4, 24 и 48 ч. В табл. 1 представлены результаты выделения и очистки препаратов LdtMt2 и LdtMt2_ cut. Оптимальным для препаративного выделения и очистки препаратов было культивирование в течение 24 ч: при сравнении с культивированием в течение 48 ч имеется не только выигрыш во времени, но и более высокий выход очищенного фермента по белку.

С помощью ПААГ-электрофореза показано, что посторонние белки не связываются на Ni-TED-колонках, а полученные препараты по молекулярной массе соответствуют LdtMt2 40.9 кДа (Ala55-Ala408 + His-tag) и LdtMt2_cut 31.3 кДа (Pro148-Ala408 + His-tag) и обладают высокой степенью чистоты (рис. 3). В то же время активность препарата LdtMt2, выделенного без добавления восстанавливающих агентов, по отношению к нитроцефину была существенно ниже ожидаемой.

Mw, кДа

LdtMt2 LdtMt2 LdtMt2 ...... xLdtMt2 cut LdtMt2 cut

97 LdtMt2 cut — —

несвяз. экстракт 97 — экстракт несвяз.

66

40.9 кДа 45

31.3 кДа

Рис. 3. ПААГ-электрофорез в денатурирующих условиях препаратов LdtMt2 40.9 кДа (Ala55-Ala408 + His-tag) и LdtMt2_cut 31.3 кДа (Pro148-Ala408 + His-tag), очищенных на Protino Ni-TED 1000, а также клеточных экстрактов и фракций, не связавшихся со смолой

Как показано ранее [11], каталитический остаток цистеина Cys354 способен подвергаться окислению, что может приводить к необратимой инактивации LdtMt2. Когда для предотвращения окисления каталитического остатка цистеина культивирование клеток E. coli, а также выделение фермента проводили в восстанавливающих условиях с добавлением в среду дитиотреитола (DTT), выход белка существенно не изменился и составил 1.8 ± 0.2 мг с 50 мл культу-ральной среды, однако каталитическая активность фермента оказалась существенно выше. Степень окисления SH-групп в препаратах LdtMt2 и LdtMt2_ cut, полученных при культивировании и выделении фермента в невосстанавливающих и восстанавливающих условиях, оценивали с использованием титрования SH-групп по методу Эллмана. Полученные результаты представлены в табл. 2. Добавление DTT в культуральную среду и выделение фермента в восстанавливающих условиях позволило предотвратить окисление каталитического Cys354 и получить препарат LdtMt2 с почти в 2 раза более высокой удельной активностью.

[Нитроцефин], мкМ

Рис. 4. Зависимость начальных скоростей катализируемой LdtMt2 реакции раскрытия Р-лактамного кольца нитроцефина от концентрации нитроцефина. Точками представлены экспериментальные данные. При построении кривой использованы значения кинетических параметров, приведенные в тексте

Таблица 2. Доля свободных SH-групп в препаратах LdtMt2, полученных без добавления и с добавлением 6 мМ DTT в среду во время культивирования

DTT, мМ Доля свободных SH-групп [SH]/[LdtMt2], %

0 42 ± 2

6 72 ± 7

Таблица 3. Удельная активность препаратов LdtMt2 и LdtMt2_cut в реакции превращения нитроцефина в расчете на содержание белка в ферментном препарате и на содержание активных центров, учитывающее присутствие свободных SH-групп

Препарат Удельная активность

на мг белка, мкмоль/(мин х мг) на мкмоль SH-групп, мкмоль/(мин х мкмоль)

LdtMt2 (Ala55-Ala408) 0.65 30.6

LdtMt2 cut (Pro148-Ala408) 0.03 2.6

Стоит также отметить, что очищенные препараты фермента были достаточно стабильными при хранении (4°С, pH 7.5, 20 мМ HEPES, 0.1 М KCl) и практически не теряли активности в течение месяца. Этот факт в значительной степени способствует использованию полученных ферментных препаратов для изучения их каталитических свойств и тестирования потенциальных ингибиторов.

Важной частью работы было получение ответа на вопрос о влиянии домена А на каталитическую активность фермента. Сравнение активностей LdtMt2 и LdtMt2_cut показало, что после удаления домена А удельная активность препарата полноразмерного фермента снижается более чем на порядок (см. табл. 3). Значения KM и V реакции гидролиза нитроцефина, катализируемого LdtMt2 и LdtMt2_cut, определяли при анализе зависимости начальных скоростей от концентраций субстрата в интервале 5-160 мкМ (рис. 4). При определении значений каталитических констант ферментативной реакции и расчете концентрации активных центров фермента в препаратах LdtMt2 и LdtMt2_cut учитывали концентрацию свободных SH-групп. Падение активности полноразмерного фермента при удалении домена А в основном обусловлено снижением каталитической константы, которая при переходе от LdtMt2 к LdtMt2_cut в реакции превращения нитроцефина снижается от 0.98 ± 0.05 с-1 до 0.08 ± 0.03 с-1, в то время как значение константы Михаэлиса ухудшается незначительно - от 85 ± 7 до 102 ± 10 мкМ соответственно.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

Проведенная оптимизация условий экспрессии и очистки LdtMt2 показала, что наиболее продуктивным путем получения активных ферментных препаратов является культивирование клеток E. coli в течение 24 ч в среде LB в присутствии 0.2 мМ IPTG, 2 мМ CaCl2 и своевременное добавление восстанавливающих агентов (DTT) для предотвращения окисления каталитического Cys354. Получен высокоочищенный препарат LdtMt2 M. tuberculosis, не теряющий активности как минимум в течение месяца при хранении в буферном растворе 20 мМ HEPES, pH 7.5 при 4°С, который можно использовать для экспериментального изучения потенциальных ингибиторов фермента, отобранных в результате компьютерного скрининга. Охарактеризованы биохимические и кинетические свойства препаратов полноразмерной LdtMt2 и LdtMt2_cut без домена А. Показано, что при удалении домена А, непосредственно не связанного с каталитическим доменом С, активность полноразмерного фермента существенно снижается (более чем на порядок), в основном из-за снижения каталитической константы превращения нитроцефина. Взаимодействие между доменами и их роль в проявлении функциональных свойств полноразмерного фермента требует дальнейшего изучения.

Работа выполнена при финансовой поддержке Российского научного фонда (грант № 15-14-00069).

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1. Global tuberculosis report 2016. // World Health Organization. 2016.

2. Betts J.C., Lukey P.T., Robb L.C., McAdam R.A., Duncan K. // Mol. Microbiol. 2002. V. 43. № 3. P. 717-731.

3. Fisher J.F., Meroueh S.O., Mobashery S. // Chem. Rev. 2005. V. 105. № 2. P. 395-424.

4. Jankute M., Cox J.A.G., Harrison J., Besra G.S. // Annu. Rev. Microbiol. 2015. V. 69. № 1. P. 405-423.

5. Magnet S., Dubost L., Marie A., Arthur M., Gutmann L. // J. Bacteriol. 2008. V. 190. № 13. P. 4782-4785.

6. Bielnicki J., Devedjiev Y., Derewenda U., Dauter Z., Joachim-iak A., Derewenda Z.S. // Proteins Struct. Funct. Genet. 2006. V. 62. № 1. P. 144-151.

7. Biarrotte-Sorin S., Hugonnet J.E., Delfosse V., Mainardi J.L., Gutmann L., Arthur M., Mayer C. // J. Mol. Biol. 2006. V. 359. № 3. P. 533-538.

8. Böth D., Steiner E.M., Stadler D., Lindqvist Y., Schnell R., Schneider G. // Acta Crystallogr. Sect. D Biol. Crystallogr. 2013. V. 69. № 3. P. 432-441.

9. Kim H.S., Im H.N., An D.R., Yoon J.Y., Jang J.Y., Mobashery S., Hesek D., Lee M., Yoo J., Cui M., et al. // J. Biol. Chem. 2015. V. 290. № 41. P. 25103-25117.

10. Gupta R., Lavollay M., Mainardi J.L., Arthur M., Bishai

W.R., Lamichhane G. // Nat. Med. 2010. V. 16. № 4. P. 466-469.

11. Erdemli S.B., Gupta R., Bishai W.R., Lamichhane G., Amzel L.M., Bianchet M.A. // Structure. 2012. V. 20. № 12. P. 21032115.

12. Kim H.S., Kim J., Im H.N., Yoon J.Y., An D.R., Yoon H.J., Kim J.Y., Min H.K., Kim S.J., Lee J.Y., et al. // Acta Crystallogr. Sect. D Biol. Crystallogr. 2013. V. 69. № 3. P. 420-431.

13. Correale S., Ruggiero A., Capparelli R., Pedone E., Berisio R. // Acta Crystallogr. Sect. D Biol. Crystallogr. 2013. V. 69. № 9. P. 1697-1706.

14. Dubee V., Triboulet S., Mainardi J.L., Etheve-Quelquejeu M., Gutmann L., Marie A., Dubost L., Hugonnet J.E., Arthur M. // Antimicrob. Agents Chemother. 2012. V. 56. № 8. P. 4189-4195.

15. Dhar N., Dubee V., Ballell L., Cuinet G., Hugonnet J.E., Signorino-Gelo F., Barros D., Arthur M., McKinney J.D. // Antimicrob. Agents Chemother. 2015. V. 59. № 2. P. 1308-1319.

16. Ba^flMH C.M., MMcropa H.M., mBHflac B.K. // Acta Naturae. 2017. V. 9. № 1. P. 47-54.

17. Purification of His-tag proteins. // MACHEREY-NAGEL. 2014. V. Rev.06.

18. Itzhaki R.F., Gill D.M. // Anal. Biochem. 1964. V. 9. № 4. P. 401-410.

19. Ellman G.L. // Arch. Biochem. Biophys. 1959. V. 82. № 1. P. 70-77.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.