Научная статья на тему 'Участие лакказы гриба Stropharia rugosoannulata DSM в деградации ПАУ'

Участие лакказы гриба Stropharia rugosoannulata DSM в деградации ПАУ Текст научной статьи по специальности «Биологические науки»

CC BY
146
25
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Ключевые слова
лигнинолитические грибы / деградация / лакказа / полициклические ароматические углеводороды / ligninolytic fungi / degradation / laccase / polycyclic aromatic hydrocarbons

Аннотация научной статьи по биологическим наукам, автор научной работы — Баландина Светлана Андреевна, Позднякова Наталия Николаевна, Турковская Ольга Викторовна

Почвообитающие лигнинолитические базидиомицеты, такие как Stropharia rugosoannulata, играют важную роль в трансформации и деградации органического вещества почвы, в том числе поллютантов. Информации о механизмах деградации ксенобиотиков подобными грибами и роли их лигнинолитической ферментной системы все еще недостаточно. Нами выявлена способность S. rugosoannulata деградировать четырехкольцевые полициклические ароматические углеводороды (пирен, флуорантен). Флуорен и 2-карбоксибензальдегид идентифицированы как продукты деградации этих веществ. Очищена и охарактеризована лакказа S. rugosoannulata. По основным каталитическим свойствам этот фермент подобен большинству известных грибных лакказ. Лакказа S. rugosoannulata окисляла 2,7-диаминофлуорен, как модель ПАУ, что позволяет предположить ее участие в начальной атаке молекул ПАУ.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по биологическим наукам , автор научной работы — Баландина Светлана Андреевна, Позднякова Наталия Николаевна, Турковская Ольга Викторовна

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

The Involvement of Laccase of the Fungus Stropharia Rugosoannulata DSM 11372 in Pah Degradation

Soil-inhabiting ligninolytic basidiomycetes, such as Stropharia rugosoannulata, play an important role in the transformation of soil organic matter, including the degradation of pollutants. Information on the mechanisms of degradation of xenobiotics by these fungi and their ligninolytic enzymes is still limited. The degradative activity of the soil-inhabiting basidiomycete S. rugosoannulata towards four-rings PAHs was revealed. Fluorene and 2-carboxybenzaldehyde have been identified as products of degradation of fluoranthene and pyrene. The laccase of S. rugosoannulata was isolated and characterized; its main catalytic properties are is similar to that of well-known fungal laccases. The laccase catalyzed oxidation of 2,7-diaminofluorene as model of PAHs that propose the participation of this enzyme in the initial attack of molecules of PAHs.

Текст научной работы на тему «Участие лакказы гриба Stropharia rugosoannulata DSM в деградации ПАУ»

С. А. Баландина и др. Участие лакказы гриба Stropharia rugosoannulata DSM 11372

УДК 579.222.2

УЧАСТИЕ ЛАККАЗЫ ГРИБА STROPHARIA RUGOSOANNULATA DSM 11372 В ДЕГРАДАЦИИ ПАУ

С. А. Баландина, Н. Н. Позднякова, О. В. Турковская

Баландина Светлана Андреевна, магистрант кафедры биохимии и биофизики биологического факультета, Саратовский национальный исследовательский государственный университет имени Н. Г. Чернышевского; лаборант лаборатории экологической биотехнологии Института биохимии и физиологии растений и микроорганизмов РАН (Саратов). E-mail: sveta.balandinp@mail.ru

Позднякова Наталия Николаевна, ведущий научный сотрудник лаборатории экологической биотехнологии, Институт биохимии и физиологии растений и микроорганизмов РАН (Саратов), доктор биологических наук. E-mail: pozdnyakova_n@ibppm.ru

Турковская Ольга Викторовна, заведующая лабораторией экологической биотехнологии, Институт биохимии и физиологии растений и микроорганизмов РАН (Саратов), профессор, доктор биологических наук. E-mail: turkovskaya_o@ibppm.ru

Почвообитающие лигнинолитические базидиомицеты, такие как Stropharia rugosoannulata, играют важную роль в трансформации и деградации органического вещества почвы, в том числе пол-лютантов. Информации о механизмах деградации ксенобиотиков подобными грибами и роли их лигнинолитической ферментной системы все еще недостаточно. Нами выявлена способность S. rugosoannulata деградировать четырехкольцевые полициклические ароматические углеводороды (пирен, флуорантен). Флуорен и 2-карбоксибензальдегид идентифицированы как продукты деградации этих веществ. Очищена и охарактеризована лакказа S. rugosoannulata. По основным каталитическим свойствам этот фермент подобен большинству известных грибных лакказ. Лакказа S. rugosoannulata окисляла 2,7-диаминофлуорен, как модель ПАУ, что позволяет предположить ее участие в начальной атаке молекул ПАУ. Ключевые слова: лигнинолитические грибы, деградация, лак-каза, полициклические ароматические углеводороды.

DOI: 10.18500/1816-9775-2017-17-3-331-332 Введение

Грибы, разрушающие в природе лигниновый компонент древесины, способны метаболизиро-вать и минерализовать широкий спектр устойчивых ароматических соединений, включая полициклические ароматические углеводороды (ПАУ). Это уникальное свойство связано с продукцией грибами внеклеточной, неспецифической, окислительной ферментной системы, включающей лакказу и Mn-пероксидазу. Почвообитающие ба-зидиомицеты, такие как Stropharia rugosoannulata, играют важную роль в трансформации органического вещества почвы, в том числе в разрушении поллютантов. Сведений о механизмах деградации этими грибами ксенобиотиков и участии их лиг-

нинолитических ферментов все еще недостаточно.

Целью представленной работы было изучение каталитических свойств и участия лакказы в деградации ПАУ грибом Stropharia rugosoannulata DSM 11372. Для достижения поставленной цели решались следующие задачи: изучение дегра-дативной активности гриба по отношению к ПАУ; подбор условий его культивирования для получения максимальной продукции лакказы; разработка схемы очистки и получение лакказы; характеристика лакказы и выявление ее активности по отношению к ПАУ.

Материалы и методы

Изучение деградативной активности гриба проводили в условиях погруженного культивирования по описанной нами ранее методике (Позднякова и др., 2016). Оценку убыли ПАУ и выявление метаболитов при их деградации проводили методом ГЖХ в Центре коллективного пользования «Симбиоз» ИБФРМ РАН. Для получения лакказы гриб культивировали на среде Bioclean с 2 мМ феруловой кислотой и 50 мМ CuSO4 в качестве индукторов. Схема очистки фермента включала фракционирование сульфатом аммония, гель-фильтрацию на Sephacryl S200, ионообменную хроматографию на DEAE-Toyopearl. Чистоту фермента контролировали электрофорезом в денатурирующих условиях. Активность ферментов и каталитические свойства лакказы определяли спектрофотометрическими методами (Leonowicz and Crzywnowicz, 1981; Niku-Paavola et al., 1988; Martinez et al, 1996; Criquet et al., 2000).

Результаты и их обсуждение

Убыль пирена и флуорантена из среды культивирования гриба S. rugosoannulata составила 86 и 87% соответственно. В качестве мажорного метаболита был выявлен 2-карбоксибензальдегид, что указывает на расщепление ароматических колец в молекулах ПАУ. Также был выявлен метаболит деградации флуорантена, сохраняющий трехкольцевую структуру флуорена. Деградация обоих исследованных ПАУ сопровождалась продукцией лакказы и Mn-пероксидазы, которая начиналась почти одновременно, достигая 16 и 2,4 Ед./мл на 10-12-е сутки.

© Баландина С. А., Позднякова Н. Н., Турковская О. В., 2017

Изв. Сарат. ун-та. Нов. сер. Сер. Химия. Биология. Экология. 2017. Т. 17, вып. 3

Известно, что лигнинолитические ферменты могут катализировать ключевые этапы деградации ароматических веществ. Активность Мп-пероксидазы была невысокой, поэтому нами выделена и частично охарактеризована по основным молекулярным и каталитическим свойствам только внеклеточная лакказа гриба 5". rugosoannulata. Для получения грубого ферментного препарата гриб культивировали до достижения максимума продукции лакказы. Разработанная нами схема позволила получить лакказу высокой степени очистки, которую далее использовали в экспериментах. Это мономерный белок с молекулярной массой 72 кДа. Лакказа была термостабильной и сохраняла до 24% при 60°С в течение суток. Это может быть результатом гликозилирования белка. Определены опти-мумы рН и каталитические константы окисления основных субстратов. Наибольшим сродством фермент обладал к сирингалдазину, который считают тестовым для подобных ферментов. Максимальная скорость реакции лакказы была обнаружена с АБТС, для этого же субстрата показано наибольшее число оборотов. Исследована активность лакказы по отношению к модельному соединению ПАУ - 2,7-диаминофлуорену. Показано высокое сродство фермента к этому субстрату, о чем свидетельствует низкая величина Км. находящаяся в одном ряду с таковой тестового субстрата лакказы.

Заключение

Таким образом, исследована деградативная активность почвообитающего базидиомицета 5. rugosoannulata по отношению к четырехцикли-ческим ПАУ. Впервые выявлены, как продукты деградации флуорантена и пирена, 2-карбок-сибензальдегид и метаболит с трехкольцевой структурой флуорена. Выделенная и охарактеризованная нами лакказа 5. rugosoannulata по основным каталитическим свойствам подобна известным грибным лакказам (БЫ^^а et а1., 2011). На примере 2,7-диаминофлуорена показана принципиальная возможность лакказы окислять ПАУ.

Работа выполнена при финансовой поддержке Российского фонда фундаментальных исследований (проект № 16-04-00351).

Авторы благодарят д-ра Д. Шлоссера (Центр исследований окружающей среды, Лейпциг, Германия) за предоставление штамма, а также кандидата биологических наук М. П. Чернышову за проведение газожидкостной хроматографии.

The Involvement of Laccase

of the Fungus Stropharia Rugosoannulata DSM 11372

in Pah Degradation

S. A. Balandina, N. N. Pozdnyakova, O. V. Turkovskaya

Svetlana A. Balandina, Saratov State University, 83, Astrakhanskaya Str., Saratov, 410012, Russia, sveta.balandinp@mail.ru

Nataliya N. Pozdnyakova, Institute of Biochemistry and Physiology of Plants and Microorganisms, Russian Academy of Sciences, 13, Prospekt Entuziastov, Saratov, 410049, Russia, pozdnyakova_n@ ibppm.ru

Olga V. Turkovskaya, Institute of Biochemistry and Physiology of Plants and Microorganisms, Russian Academy of Sciences, 13, Prospekt Entuziastov, Saratov, 410049, Russia, turkovskaya_o@ ibppm.ru

Soil-inhabiting ligninolytic basidiomycetes, such as Stropharia rugosoannulata, play an important role in the transformation of soil organic matter, including the degradation of pollutants. Information on the mechanisms of degradation of xenobiotics by these fungi and their ligninolytic enzymes is still limited. The degradative activity of the soil-inhabiting basidiomycete S. rugosoannulata towards four-rings PAHs was revealed. Fluorene and 2-carboxybenzaldehyde have been identified as products of degradation of fluoranthene and pyrene. The laccase of S. rugosoannulata was isolated and characterized; its main catalytic properties are is similar to that of well-known fungal laccases. The laccase catalyzed oxidation of 2,7-diaminofluorene as model of PAHs that propose the participation of this enzyme in the initial attack of molecules of PAHs.

Key words: ligninolytic fungi, degradation, laccase, polycyclic aromatic hydrocarbons.

Acknowledgements: This work was supported by the Russian Foundation for Basic Research (project no. 16-04-00351).

Образец для цитирования:

Баландина С. А., Позднякова Н. Н., Турковская О. В. Участие лакказы гриба Stropharia rugosoannulata DSM 11372 в деградации ПАУ // Изв. Сарат. ун-та. Нов. сер. Сер. Химия. Биология. Экология. 2017. Т. 17, вып. 3. С. 331-332. DOI: 10.18500/1816-9775-2017-17-3-331-332.

Cite this article as:

Balandina S. A., Pozdnyakova N. N., Turkovskaya O. V. The Involvement of Laccase of the Fungus Stropharia Rugosoannulata DSM 11372 in Pah Degradation. Izv. Saratov Univ. (N.S.), Ser. Chemistry. Biology. Ecology, 2017, vol. 17, iss. 3, pp. 331-332 (in Russian). DOI: 10.18500/1816-9775-2017-17-3-331-332.

332

Научный отдел

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.