Научная статья на тему 'Типичные и уникальные гаплотипы HLA: а-в-drb1 в популяции русских Челябинской области'

Типичные и уникальные гаплотипы HLA: а-в-drb1 в популяции русских Челябинской области Текст научной статьи по специальности «Фундаментальная медицина»

CC BY
328
59
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по фундаментальной медицине , автор научной работы — Суслова Т. А., Вавилов М. Н., Хромова Е. Б., Беляева С. В., Сташкевич Д. С.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Текст научной работы на тему «Типичные и уникальные гаплотипы HLA: а-в-drb1 в популяции русских Челябинской области»

2DS3-39 %, 2DS4-96 %, 2DS5-23 %, 3DS1-35 %. При сравнении с другими европейскими популяциями обнаружена более низкая частота встречаемости следующих KIR-генов, ассоциированных с В-гаплотипом: 2DL2, 2DS5 и 3DS1. Среди 33 доноров, имеющих АА-генотип, только один был гомозиготен по аллелям гена 2DS4, кодирующим экспрессируемый рецептор.

Проведенный анализ показывает, что потенциальные доноры Республиканского регистра имеют наибольшую частоту KIR-генотипов, оказывающих наиболее выраженный положительный терапевтический эффект при трансплантации ГСК больным острым миелоидным лейкозом (доноры группы «Best»), среди всех проанализированных нами популяций: Китая, Южной Кореи, Таиланда, Японии, США, Португалии, Италии, Франции, Англии и Чехии.

Выводы. Распределение КЖ-генов и КЖ-генотипов у потенциальных доноров ГСК Республиканского Регистра имеет выраженные черты сходства с другими кавказоидными популяциями. Особенностью обследованной нами группы доноров ГСК является более высокая по сравнению со всеми популяциями сравнения частота встречаемости КЖ-генотипов, оказывающих наиболее благоприятный клинический эффект при трансплантации ГСК при остром миелоид-ном лейкозе. Результаты данного исследования могут быть использованы для выбора наиболее предпочтительных доноров с целью улучшения терапевтического эффекта трансплантации ГСК, а также для оптимизации банка Республиканского Регистра неродственных доноров-добровольцев по количественному и популяционному составу.

Суслова Т. А., Вавилов М. Н., Хромова Е. Б., Беляева С. В., СташкевичД. С., Горелова А. К., Евдокимов А. В., Рудакова Г. А., Бурмистрова А. Л.

ФГБОУ ВПО «Челябинский государственный университет», Челябинск, Россия ГБУЗ «Челябинская областная станция переливания крови», Челябинск, Россия

ТИПИЧНЫЕ И УНИКАЛЬНЫЕ ГАПЛОТИПЫ HLA: А-В-DRB1 В ПОПУЛЯЦИИ РУССКИХ ЧЕЛЯБИНСКОЙ ОБЛАСТИ

Введение. Национальный состав жителей Челябинской области (ЧО) типичен для мегаполисов России с некоторыми отличиями, являющимися следствием географического положения региона. Согласно переписи населения 2010 года 80 % жителей являются русскими, 5 % — башкиры, 4,5 татары. Считается, что именно они являются основными этническими группами, проживающими в регионе. Сегодня далеко не каждому пациенту в России можно найти донора в отечественном Регистре. Возникает вопрос — это результат немногочисленности наших Российских Регистров, которые насчитывают около 30 000 типированных доноров в настоящее время, или следствие того факта, что генофонд русских несет уникальные гаплотипы, которые практически не встречаются в европейских миллионных Регистрах.

В случае неродственной трансплантации при совпадении донора и реципиента на гаплотипи-ческом уровне, с большей вероятностью совпадут другие локусы системы гистосовместимо-сти, чем при совпадении по отдельным аллелям. Таким образом, подбор донора, совпадающего по гаплотипам, повышает шансы на успешную

приживаемость донорских клеток.

Согласно официальным историческим данным, заселение русскими территории Челябинской области началось около 300 лет назад. Первыми поселенцами были жители Челябинской и Миасской крепостей, построенных по царскому указу Оренбургской экспедицией Кириллова. Впоследствии поселения расширялись за счет миграции русских из центральных и северных районов России согласно царскому указу «...к приращению государственной пользы заводить вновь разные заводы.». К началу 20 века заселение русскими территории современной Челябинской области было в основном завершено.

Цель исследования: оценка частот встречаемости трехлокусных гаплотипов HLA А, В, DR у русских Челябинской области в сравнении с распределением в популяциях поляков и финнов, как представителей типичных европейских популяций индоевропейской и финно-угорской языковых семей.

Материалы и методы. Для исследования были привлечены 958 доноров ГБУЗ «Челябинская областная станция переливания крови», идентифицирующих себя как русские в 3-м по-

«АКТУАЛЬНЫЕ ВОПРОСЫ ИММУНОГЕНЕТИКИ И ТКАНЕВОГО ТИПИРОВАНИЯ»

Санкт-Петербург 24-25 июня 2015 г.

колении. Группой сравнения служили популяции польского, немецкого Регистра доноров стволовой клетки и финской популяции. В качестве биологического материала для исследования использовалась венозная кровь, взятая в пробирки с 0,5 % раствором калиевой соли этилендиаминтетрауксусной кислоты (ЭДТА). Выделение ДНК проводили с использованием реагентов PROTRANS DNA Box 500. HLA-типирование проводилось полимеразной цепной реакцией с использованием аллель-специфических праймеров (SSP-PCR) методом, предложенным Downing J. Статистические методы:

Частоты трехлокусных гаплотипов HLA: в сравнении с популяцией т

расчет генных частот гаплотипов (HF) проводился методом максимизации ожидания в компьютерной программе Arlequin 3.1 (http://cmpg. unibe.ch/software/arlequin3/).

Результаты исследования. В ходе исследования установлены частоты встречаемости гаплотипов HLA: A-B-DRB1 в популяциях русских, проживающих в Челябинской области. Данные о 30 наиболее распространенных гапло-типах у представителей русских Челябинской области, популяции польских доноров и представлены таблице 1.

Таблица 1.

A-B-DRB1 у русских Челябинской области ляков (Schmidt A. H., 2011).

Русские (n = 958) Поляки(n = 20 653)

п.н.а HLA-A-B-DRB1 HF, % п.н. HLA-A-B-C-DRB1 HF.( %)

1 A*01-B*08-DRB1*03 4,292 1 A*01:01-B*08:01-C*07:01-DRB1*03:01 6,024

2 A*03-B*07-DRB1*15 3,462 2 A*03:01-B*07:02-C*07:02-DRB1*15:01 2,593

3 A*03-B*35-DRB1*01 3,186 6 A*03:01-B*35:01-C*04:01-DRB1*01:01 1,095

4 A*02-B*13-DRB1*07 2,436 3 A*02:01-B*13:02-C*06:02-DRB1*07:01 1,61

5 A*02-B*07-DRB1*15 1,952 4 A*02:01-B*07:02-C*07:02-DRB1*15:01 1,423

6 A*02-B*27-DRB1*01 1,552 15 A*02:01-B*27:05-C*02/01-DRB1*01:01 0,993

7 A*02-B*41-DRB1*13 1,507 28 A*02:01-B*41:02-C*17:01-DRB1*13:03 0,419

8 A*02-B*15-DRB1*04 1,495 12 A*02:01-B*15:01-C*03:04-DRB1*04:01 0,821

9 A*25-B*18-DRB1*15 1,422 5 A*25:01-B*18:01-C*12:03-DRB1*15:01 1,304

10 A*25-B*18-DRB1*04 1,326 18 A*25:01-B*18:01-C*12:03-DRB1*04:01 0,677

11 A*03-B*07-DRB1*01 1,062 37 A*03:01-B*07:02-C*07:02-DRB1*01:01 0,307

12 A*02-B*18-DRB1*11 1,038 20 A*02:01-B*18:01-C*07:01-DRB1*11:04 0,633

13 A*30-B*13-DRB1*07 0,983 9 A*30:01-B*13:02-C*06:02-DRB1*07:01 0,899

14 A*02-B*44-DRB1*04 0,981 14 A*02:01-B*44:02-C*05:01-DRB1*04:01 0,726

15 A*01-B*57-DRB1*07 0,978 16 A*01:01-B*57:01-C*06:02-DRB1*07:01 0,718

17 A*33-B*14-DRB1*01 0,879 31 A*33:01-B*14:02-C*08:02-DRB1*01:02 0,356

18 A*02-B*44-DRB1*16 0,857 22 A*02:01-B*44:02-C*07/02-DRB1*16:01 0,849

19 A*24-B*07-DRB1*15 0,849 19 A*24:02-B*07:02-C*07:02-DRB1*15:01 0,67

21 A*02-B*15-DRB1*13 0,772 25 A*02:01-B*15:01-C*03:03-DRB1*13:01 0,46

22 A*02-B*44-DRB1*13 0,751 35 A*02:01-B*44:02-C*05:01-DRB1*13:01 0,314

25 A*11-B*35-DRB1*01 0,685 13 A*11:01-B*35:01-C*04:01-DRB1*01:01 0,778

27 A*23-B*44-DRB1*07 0,643 7 A*23:01-B*44:03-C*04:01-DRB1*07:01 0,939

a П. н. — порядковый номер распространенности гаплотипа в популяции по частоте HF

В соответствии с таблицей 1, анцестральные гаплотипы АН8.1 и АН7.1 являются наиболее распространенными в популяциях русских и поляков. Частота гаплотипа АН8.1 — А*01-В*08-DRB1*03 у русских Челябинской области составляет 4,29 %, у поляков — 6,024 %. Гаплотип АН7.1 — A*03-B*07-DRB1*15 встречается с частотой 3,46 % у русских ЧО, у поляков — 2,593 %.

Третьим по распространенности у русских Челябинской области является гаплотип А* 03-B*35-DRB1*01 с частотой 3,186 %, в отличие

от популяции поляков, частота встречаемости данного гаплотипа у которых составила 1,095 %. Этот гаплотип чаще встречается (2-7 %) в таких популяциях как финны, саамы Швеции, саамы европейского севера России, чуваши — то есть, евразийских народов, имеющих в своем этногенезе финно-угорскую составляющую. Сравнительная характеристика частот трехлокусных гаплотипов в популяциях русских и финнов представлена в таблице 2.

Таблица 2.

Частоты трехлокусных гаплотипов ИЬА: А-Б-ВЯЫ у русских Челябинской области

и финнов (Ц'еппегяМт А.,2013).

Гаплотипы Русские (п = 958) Финны (п = 150)

НЬА-А-В-РРВ1 П.н.а НР, % П.н. НР, %

Д*01-В*08-йКВ1*03:01 1 4,29 2 4

Д*03-В*07-йКВ1*15:01 2 3,46 16 1,1

Д*03-В*35^В1*01:01 3 3,19 1 7,1

Д*02-В*13-йКВ1*07:01 4 2,44 10 1,6

Д*02-В*07-йКВ1*15:01 5 1,95 3 3,5

Д*02-В*15-йКВ1*04:01 8 1,50 7 1,9

Д*03-В*07-йКВ1*01:01 11 1,06 12 1,4

Д*02-В*44-йКВ1*04:01 14 0,98 14 1,2

Д*02-В*15-йКВ1*13:01 21 0,77 5 2,3

Д*03-В*07-йКВ1*13:01 24 0,69 15 1,2

Д*02-В*15-йКВ1*08:01 94 0,15 8 1,9

Д*02-В*27-йКВ1*08:01 112 0,23 4 2,7

Д*02-В*40-йКВ1*13:02 136 0,16 17 1,1

Д*03-В*08-йКВ1*03:01 190 0,07 6 2,1

Д*03-В*15-йКВ1*08:01 194 0,06 9 1,7

Д*11-В*07-0КВ1*15:01 253 0,48 11 1,5

Д*02-В*15-йКВ1*15:01 - - 13 1,3

с' П.н. — порядковый номер распространенности гаплотипа в популяции по частоте HF

Наличие высокой частоты встречаемости ан-цестрального гаплотипа А*03-В*35-ЭКВ1*01 у русских ЧО говорит о том, что в этногенезе русских велика финно-угорская составляющая. Это предположение также подтверждается фактом наличия у русских и финнов гаплотипа А*03-В*07-ЭКВ1*01, типичного североевропейского, в котором в гене II класса произошла замена DRB1*15 на превалирующий в финно-угорских популяциях DRB1*01, а также появление гаплотипов с DRB1*08 (А*02 В*27 DRB1*08:01).

Данные гаплотипы, свидетели финно-угорского вклада в этногенез популяции, прослеживаются, хотя и в меньшей степени, в центральных европейских популяциях поляков (частота А*03-В*35^К£1*01 у поляков составляет 1-2 %, данный гаплотип занимает 6-е место по распространенности).

Четвертое место по частоте встречаемости у русских ЧО занимает гаплотип А*02-В*13-DRB1*07 с частотой 2,4 %. Этот гаплотип превалирует во многих популяциях Евразии, предки которых были степными народами и занимались преимущественно скотоводством (башкиры, татары, чуваши России, казахи, уйгуры). Например, частота этого гаплотипа в популяции башкир достигает 6,7 %. По-видимому, данный гаплотип придавал эволюционное преимуще-

ство его обладателям, ведущим кочевой образ жизни, что позволило признаку закрепиться в популяциях степных народов. У русских данный гаплотип не превалирует над остальными. Но его частота у русских Челябинской области выше, чем у типичных европейских популяций, в которых его распространенность редко достигает 1 %.

Родственный ему гаплотип А*30^*13-DRB1*07, широко распространенный в азиатских популяциях, у русских встречается значительно реже, с частотой 0,98 %. Эти цифры сопоставимы с данными в популяции поляков, в которой частота этого гаплотипа выше, чем у русских (9-е место по частоте встречаемости, результаты представлены в таблице 1).

Частота гаплотипов А*29-В*44-DRB1*16 и А*23-В*44^К£1*07 у русских значительно ниже, чем в польской популяции. Гаплотипы А*02-В* 18-DRB 1*11, А*33-Б*14- DRB1*01 и А*02-В*41-DRB1*13 у русских встречаются чаще, чем у поляков.

Гаплотип А*02-В*18-DRB1*11, занимающий 12-е место по распространенности, встречается с частотой 1,038 % у русских Челябинской области. Этот гаплотип широко распространен у татар России и южных славян, жителей балканских стран: болгар, албанцев, македонцев.

«АКТУАЛЬНЫЕ ВОПРОСЫ ИММУНОГЕНЕТИКИ И ТКАНЕВОГО ТИПИРОВАНИЯ»

Санкт-Петербург 24-25 июня 2015 г.

Частота гаплотипа A*33-B*14-DRB1*01 у русских ЧО составляет 0,88 % (17-е место по распространенности), у поляков данный гапло-тип встречается с частотой в два раза меньше 0,35 %, занимая 31-е место. Согласно данным различных исследователей, этот гаплотип распространен в популяциях индоиранских народов: парси, популяции Туниса, Армении.

Остальные гаплотипы из 30 наиболее распространенных в русской популяции с близкой частотой встречаются у поляков, демонстрируя

генетическую близость этих двух славянских популяций. Кроме того, у русских не обнаружено гаплотипов, которые не встречались бы в польской популяции.

В тоже время в популяции русских встречаются редкие гаплотипы, характерные для азиатской части континента: А*01-В*37-ЭКВ1*10, А*33-В*58-ОЯВ1*03, А*02-В*50-ЭЯВ1*07, А*02-В*48-ОЯВ1* 12-0,07 % (данные представлены в таблице 3).

Таблица 3.

Частота некоторых типичных азиатских гаплотипов у русских Челябинской области.

Редкие гаплотипы Русские n = (958)

HLA-A-B-DRB1 Кол-во Частота, %

A*01-B*37-DRB1*10 2 0,052

A*02-B*48-DRB1*12 2 0,077

A*02-B*50-DRB1*07 2 0,104

A*03-B*50-DRB1*07 3 0,157

A*11-B*48-DRB1*12 5 0,250

A*02-B*52-DRB1*15 7 0,319

A*29-B*44-DRB1*07 5 0,344

A*33-B*58-DRB1*03 7 0,356

A*01-B*52-DRB1*15 7 0,386

Частота этих гаплотипов столь мала, что не позволяет считать их типичными для русской популяции.

Заключение. Распределение трехлокусных гаплотипов у русских Челябинской области соответствует таковому в европейский популяциях. Русские жители Челябинской области имеют в генофонде вклад гаплотипов, характерных для финно-угорских народов (А*03-В*35-ЭКВ1*01, А*02-В*27-0ЯВ1*08:01). Русские жители Челя-

бинской области имеют в генофонде вклад гаплотипов тюркских народов (А*02-В*13-ЭКВ1*07). Русские жители Челябинской области не имеют существенного вклада генов, характерных для типичных монголоидных популяций.

Распределение частот генов HLA: А*, В*, DRB1* в группе практически здоровых лиц русской популяции Челябинской области было установлено в исследовании, поддержанном грантом РФФИ (№ 15-04-05176).

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

Хамаганова Е. Г., Паровичникова Е. Н., Кузьмина Л. А., Куликов С. М., Кузьминова Е. П.,

Юшкова А. А., Савченко В. Г.

Федеральное государственное бюджетное учреждение Гематологический научный центр Министерства здравоохранения России, Москва

ВЛИЯНИЕ KIR-ГЕНОВ ДОНОРА НА БЕЗРЕЦИДИВНУЮ ВЫЖИВАЕМОСТЬ ПОСЛЕ ТРАНСПЛАНТАЦИИ АЛЛОГЕННЫХ ГЕМОПОЭТИЧЕСКИХ СТВОЛОВЫХ КЛЕТОК У БОЛЬНЫХ ОСТРЫМИ МИЕЛОИДНЫМИ ЛЕЙКОЗАМИ

Введение. Острые миелоидные лейкозы (ОМЛ) — основное показание к выполнению трансплантации аллогенных гемопоэтических стволовых клеток (алло-ТГСК). Рецидивы заболевания являются одной из основных причин смертности пациентов после ТГСК. Алло-ТГСК

ассоциирована с самым низким риском рецидива, что связано с развитием реакции трансплантат против лейкоза [Савченко В. Г. и соавт. 2007, 2014]. Натуральные киллерные (^К) клетки распознают клетки-мишени со сниженной экспрессией HLA-молекул класса 1, подобных

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.