Научная статья на тему 'Вклад в генофонд HLA регистра доноров стволовой клетки различных национальностей, проживающих в Челябинской области'

Вклад в генофонд HLA регистра доноров стволовой клетки различных национальностей, проживающих в Челябинской области Текст научной статьи по специальности «Биологические науки»

CC BY
204
46
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Ключевые слова
ПОПУЛЯЦИОННАЯ ИММУНОГЕНЕТИКА / MHC / HLA / ТАТАРЫ / БАШКИРЫ / РУССКИЕ / РЕГИСТР ДОНОРОВ СТВОЛОВЫХ КЛЕТОК КРОВИ / POPULATIONAL IMMUNOGENETICS / TATARS / BASHKIR / RUSSIAN / REGISTER DONOR BLOOD STEM CELLS

Аннотация научной статьи по биологическим наукам, автор научной работы — Суслова Татьяна Александровна, Рудакова Галина Аркадьевна, Хромова Елена Борисовна, Вавилов Михаил Николаевич, Беляева Светлана Валерьевна

Представлены частоты генов и гаплотипов HLA у доноров различной национальности Челябинского регистра доноров стволовой клетки. Типирование HLA по трём локусам проведено методом ПЦР. Результаты свидетельствуют о том, что нацеленное включение в регистр доноров различных национальностей увеличивает число редких аллелей и обеспечивает разнообразие гаплотипов HLA.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по биологическим наукам , автор научной работы — Суслова Татьяна Александровна, Рудакова Галина Аркадьевна, Хромова Елена Борисовна, Вавилов Михаил Николаевич, Беляева Светлана Валерьевна

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

The Contribution to the Gene Pool of HLA Donor Register of Stem Cells of Different Nationalities Living in the Chelyabinsk Region

The article presents the frequency of genes and haplotypes HLA donors of different nationalities Chelyabinsk register stem cell donors. HLA typing for 3 loci was curried out by PCR-SSP. The results show that the aimed inclusion in the register of donors of different nationalities increases the number of rare alleles and provides a variety of HLA haplotypes.

Текст научной работы на тему «Вклад в генофонд HLA регистра доноров стволовой клетки различных национальностей, проживающих в Челябинской области»

Вестник Челябинского государственного университета. 2015. № 21 (376). Биология. Вып. 3. С. 28-35.

УДК 575

ББК 28.704-28.707.4-52.54

ВКЛАД В ГЕНОФОНД ^Л РЕГИСТРА ДОНОРОВ СТВОЛОВОЙ КЛЕТКИ

РАЗЛИЧНЫХ НАЦИОНАЛЬНОСТЕЙ, ПРОЖИВАЮЩИХ В ЧЕЛЯБИНСКОЙ ОБЛАСТИ

Исследование выполнено при финансовой поддержке РФФИ в рамках научного проекта № 15-04-05176

Т. А. Суслова1'2, Г. А. Рудакова2, Е. Б. Хромова1'2, М. Н. Вавилов, С. В. Беляева1'2

ФГБОУ ВПО «Челябинский государственный университет», Челябинск, Россия 2ГБУЗ «Челябинская областная станция переливания крови», Челябинск, Россия

Представлены частоты генов и гаплотипов HLA у доноров различной национальности Челябинского регистра доноров стволовой клетки. Типирование HLA по трём локусам проведено методом ПЦР. Результаты свидетельствуют о том, что нацеленное включение в регистр доноров различных национальностей увеличивает число редких аллелей и обеспечивает разнообразие гаплотипов НЬА.

Ключевые слова: популяционная иммуногенетика, МНС, HLA, татары, башкиры, русские, регистр доноров стволовых клеток крови.

Национальный состав жителей Челябинской области типичен для мегаполисов России с некоторыми отличиями, являющимися следствием географического положения региона. Согласно переписи населения 2010 г. 80 % жителей являются русскими, 5 % — башкиры, 4,5 % — татары [1], именно они являются основными этническими группами, проживающими в регионе. Однако миграции последних столетий в той или иной степени влияли на генофонд в каждом из этих этносов. И среди 80 % русских немалая доля тех, кто считает себя русским, имея бабушек и дедушек иных этнических родов и являясь по сути потомками смешанных браков. Регистр доноров стволовой клетки, создаваемый на Челябинской областной станции переливания крови, отражает все сложившиеся национальные взаимоотношения как модель общества.

Цель исследования:

1. Оценить количество потомков смешанных браков среди выборки доноров регистра стволовой клетки Челябинской областной станции пере -ливания крови.

2. Рассчитать частоты генов и наиболее распространённых гаплотипов НЬА в следующих группах, организованных посредством сбора генеалогического анамнеза: русские в третьем поколении, русские по паспортным данным, потомки смешанных браков русских и татар, русских и украинцев, татар и башкир.

3. Оценить вклад гаплотипов HLA, принадле-

жащих различным национальностям, в общий генотип Банка стволовых клеток Челябинской областной станции переливания крови.

4. Представить гаплотипы HLA, наиболее распространённые среди доноров Челябинского регистра.

Методы. Принадлежность к той или иной национальности выявляли методом опроса доноров и составлением анкеты. Если человек идентифицировал себя с русским и утверждал, что его родители, а также дедушки и бабушки являлись русскими, то он относился к группе «русские в третьем поколении»; другая часть исследуемых, чётко идентифицирующих своих родителей к различным национальностям, относилась к группе смешанного населения «русский-украинец», «русский-татарин», «русский-белорус», «башкир-татарин» и др. Исследуемые, считающие себя русскими (татарами, башкирами), но точно не определяющие национальность родителей или дедушек-бабушек, считались русскими (татарами, башкирами) по паспортным данным. Таким образом, для исследования были привлечены 2 957 чел.: русские в третьем поколении, русские по паспортным данным, потомки смешанных браков русских-украинцев, русских-белорусов, русских-татар, русских-башкир.

В последующем 1 908 чел. были подвергнуты иммуногенетическому исследованию по трём локусам НЬА с последующим расчётом стандартных иммуногенетических показателей.

Материалы и методы. HLA-типирование проводилось полимеразной цепной реакцией (ПЦР) с использованием аллель-специфических прай-меров (SSP-PCR) методом, предложенным J. Downing [4].

Методы статистических иммуногенетиче-ских расчётов. Статистические методы: расчёт генных частот (GF), частот гаплотипов (HF) проводились методом максимизации ожидания в компьютерной программе Arlequin 3.1 [http:// cmpg.unibe.ch/software/arlequin3] и DoctorStat

[http://doctorstat.narod.ru/index.html]. Определение соответствия наблюдаемого распределения аллелей равновесию Харди — Вайнберга проверялось для каждого локуса по той же программе. Достоверность различий в частоте встречаемости генов и гаплотипов в популяциях определяли согласно критерию Пирсона. При абсолютных значениях <5 использовали точный двухсторонний критерий Фишера.

Результаты и обсуждение. Результаты представлены в табл. 1-3. Данные табл. 1 свидетель-

Таблица 1

Распределение доноров Челябинского регистра доноров по национальностям

Национальность Всего человек Доля от общего числа, % Доля от числа русских, % Доля от числа татар, % Доля от числа башкир, %

Русский в третьем поколении 1 220 41,26 56,64

Русский (паспортные данные) 520 17,59 24,14

Руский-украинец 157 5,31 7,29

Русский-белорус 87 2,94 4,04

Русский-татарин 88 2,98 4,09

Русский-башкир 21 0,71 0,97

Русский-немец 34 1,15 1,58

Русский-поляк 17 0,57 0,79

Русский-чуваш 9 0,30 0,42

Русский-мари 1 0,03 0,05

Всего русские 2 154 72,84 100,00

Татары в третьем поколении 180 6,09 49,45

Татары (паспортные данные) 35 1,18 9,62

Татарин-русский 88 2,98 24,18

Башкир-татарин 61 2,06 16,76

Всего татар 364 12,31 100,00

Нагайбаки 112 3,79

Башкир в третьем поколении 266 9,00 68,91

Башкир (паспортные данные) 34 1,15 8,81

Башкир-татарин 61 2,06 15,80

Башкир-казах 2 0,07 0,52

Башкир-мари 2 0,07 0,52

Башкир-русский 21 0,71 5,44

Всего башкир 386 13,05 100,00

Остальные национальности1 111 3,75

ВСЕГО 2 957

1 Белорусы (7), украинцы (19), мордва (12), чуваши (11), мари (1), казахи (25), немцы (24), латыши (3), поляки (2), литовцы (2), армяне (2), венгр (1), гречанка (1), осетин (1).

ствуют о том, что 72,84 % доноров самоопределились как русские, из них только 56,64 % являются русскими в третьем поколении, ещё чуть более 10 % — являются потомками смешанных браков русских с украинцами или белорусами и 24,14 % — русские по паспортным данным. Около 12,31 % доноров относят себя к татарам, причём почти 50 % из них представляют татар в третьем поколении, остальные являются потомками смешанных браков, четверть — потомки смешанных браков татар с русскими. Башкиры в регистре доноров составляют 13,05 %, из них 68 % считают себя башкирами в третьем поколении, остальные являются потомками от смешанных браков. Наибольшее число потомков отмечено от смешанных браков башкир и татар. Их больше, чем потомков башкир с русскими.

3 % составляют нагайбаки, остальные национальности среди доноров ЧОСПК представлены в количестве менее 1 % (см. табл. 1).

Следующим этапом нашей работы было изучить распределение частот генов НЬА в группах различных национальностей доноров Челябинского регистра доноров. Результаты представлены в табл. 2. Для сравнения частот встречаемости генов НЬА нами были выбраны следующие исследуемые группы: русские в третьем поколении, русские по паспортным данным, потомки смешанных браков русских-украинцев, русских-белорусов, русских-татар, татар-башкир, русских и татар по паспортным данным, татар и башкир в третьем поколении.

Нашими предыдущими работами было показано, что по распределению генов НЬА популяция русских является типичной европеоидной популяцией с набором генов и гаплотипов, распространённых в Европе [2; 3; 5; 6]. Некоторые отличия, в основном в частоте встречаемости редких «азиатских» генов НЬА, отмечены у татар Челябинской области и максимальные отличия в распределении НЬА отмечены у башкир.

Нам хотелось ответить на вопрос: как много редких и уникальных генов могут привнести в генофонд регистра доноров СК потомки смешанных браков, которые составляют 25 % — среду русской популяции. И из каких популяций могли прийти эти гены? Какие уникальные гены и гаплотипы НЬА можно найти у русских? Ведь считается, что на протяжении нескольких веков войн и миграций населения на территории современной России, и в том числе Южного Урала,

происходило масштабное смешение рас и народностей. Ответы на эти вопросы мы попробовали найти при статистическом сравнении частот генов НЬА в группах доноров стволовых клеток с различным генеалогическим анамнезом.

При сравнении группы русских в третьем поколении и русских по паспортным данным обнаружено небольшое увеличение в частоте встречаемости В*35 в группе русских по паспортным данным (статистически достоверно). Следует отметить, что данный ген широко распространён у татар, русских, финно-угорских народов (чуваши), проживающих на территории России, а также у финнов и в меньшей степени у башкир, проживающих в Челябинской области.

Следующим этапом было сравнение группы русских в третьем поколении и потомков смешанных браков русских с украинцами и белорусами. Русские и украинцы, являясь представителями восточных славян, также являются типичными европеоидными популяциями по антропологическим и лингвистическим признакам. Распределение частот генов в сравниваемых группах — русские в третьем поколении, потомки смешанных браков русских и украинцев — было практически идентичным, достоверное различие отмечалось только в частоте гена В*49, максимальная частота которого отмечается в популяциях татар, армян, турок. При сравнительном анализе популяции русских в третьем поколении и группы потомков смешанных браков русских и белорусов обнаружено несколько больше отличий, а именно: некоторое снижение частоты гена В*07 и повышение частоты В*40 и DRB1*11. Интересно отметить, что ОЯВ1*11 максимально распространён в популяциях, издавна проживающих на побережье Средиземноморья, а также Армении, Турции, Пакистана.

Третьей группой сравнения с русскими в третьем поколении была группа потомков от смешанных браков русских и татар. Напомним, что при сравнении частот НЬА у русских и татар в третьем поколении, проживающих в Челябинской области, выявлены некоторые различия в частотах генов. Генные семейства, более характерные для азиатских популяций, а именно: А*11, В*46, 48, 49, 50, 58; DRB1*07, 09, 14, у татар встречаются достоверно чаще, чем у русских. Среди потомков смешанных браков русских и татар отмечается отличие по частоте генов от русских в третьем поколении только по генам А*29, В*57, В*58, В*37, которых у микстов больше.

Наиболее резкие различия в частотах генов HLA определены ранее у русских с башкирами — по 4 генам в локусе А, 17 генам в локусе В и 7 генам в локусе DR, и именно гены потомков этих смешанных браков русских и башкир могли бы внести наибольшее число редких, азиатских генов HLA, однако в силу исторических и социальных традиций в нашей выборке таких людей было слишком мало — всего 19, что не по -зволило нам провести полноценное статистиче-

ское исследование.

В табл. 2 представлены частоты генов HLA всех доноров, включённых в Челябинский регистр доноров стволовых клеток. При сопоставлении этих частот с русскими в третьем поколении можно сделать вывод, что в этой группе повышено число лиц, несущих редкие азиатские гены ИЬЛ (В*13, 46, 48, 49, 50, 58; ЭЯВ1* 07, 09, 14). Это может увеличить шансы пациентов с редкими «неевропейскими» генами HLA на поиск

Таблица 2

Частоты генов HLA в группах с различным генеалогическим анамнезом

Ген Все доноры регистра Потомки смешанных браков татар и башкир Потомки смешанных браков русских и татар Русские в третьем поколении Русские по паспортным данным Потомки смешанных браковрус-ских и белорусов Потомки смешанных браков русских и украинцев

1 908 49 74 958 138 63 126

Л*01 11,28 12,24 10,81 13,05 8,70 9,52 11,11

Л*02 30,26 26,53 32,43 30,58 35,87 34,13 26,19

Л*03 14,86 16,33 10,81 15,81 17,39 15,08 16,27

Л*11 6,08 6,12 4,73 5,74 6,52 6,35 4,37

Л*23 1,53 - 2,70 1,51 1,45 - 2,38

Л*24 10,51 12,24 9,46 9,71 9,06 11,90 10,71

Л*25 4,67 2,04 4,05 5,53 6,88 3,97 5,95

Л*26 4,07 2,04 7,43 3,86 2,54 3,17 5,56

Л*29 0,92 1,02 2,70 0,78 0,72 0,79 1,19

Л*30 2,07 3,06 2,03 1,88 1,81 0,79 1,59

Л*31 2,98 3,06 3,38 2,30 2,90 2,38 2,78

Л*32 2,63 2,04 2,03 2,92 1,09 3,97 2,38

Л*33 2,49 4,08 4,05 2,19 2,90 1,59 2,78

Л*34 0,03 - - 0,05 - - -

Л*66 0,34 - 0,68 0,42 - - 0,40

Л*68 4,07 9,18 2,70 3,50 2,17 5,56 6,35

Л*69 0,00 - - 0,10 - 0,79 -

Л*74 0,03 - - 0,05 - - -

В*07 12,76 15,31 11,49 14,09 14,13 6,351 12,30

В*08 5,47 5,10 4,73 6,37 5,80 3,97 5,56

В*13 7,80 13,27 5,41 6,21 6,52 7,14 4,76

В*14 2,17 - 3,38 2,56 3,99 - 3,97

В*15 5,94 1,02 4,05 6,89 8,70 7,14 5,16

В*18 6,78 4,08 7,43 7,52 7,25 8,73 7,14

1 Статистически достоверные отличия частот по сравнению с популяцией русских в третьем поколении P < 0,05.

Окончание табл. 2

Ген Все доноры регистра Потомки смешанных браков татар и башкир Потомки смешанных браков русских и татар Русские в третьем поколении Русские по паспортным данным Потомки смешанных браков русских и белорусов Потомки смешанных браков русских и украинцев

1 908 49 74 958 138 63 126

В*27 4,92 6,12 3,38 5,69 3,99 9,52 3,17

В*35 11,48 17,35 9,46 11,12 15,58х 13,49 11,90

В*37 1,11 2,04 3,38х 0,89 1,09 1,59 1,59

В*38 2,95 2,04 0,68 2,87 3,26 0,79 2,78

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

В*39 2,68 - 2,70 2,87 3,26 2,38 1,59

В*40 6,05 3,06 4,05 5,32 6,16 11,90х 5,16

В*41 2,33 1,02 2,70 3,13 1,45 2,38 1,98

В*44 8,14 3,06 12,16 8,92 7,25 6,35 11,11

В*45 0,18 - - 0,21 - 0,79 0,40

В*46 0,34х - - - - 0,79 -

В*47 0,26 - - 0,42 - 0,79 0,40

В*48 1,35х 4,08 1,35 0,52 0,36 - -

В*49 1,58 1,02 2,03 1,15 0,72 1,59 3,17х

В*50 1,61 4,08 2,03 0,94 0,72 0,79 0,40

В*51 5,41 7,14 6,76 4,85 4,35 3,17 5,16

В*52 1,82 2,04 2,03 1,83 1,45 1,59 2,78

В*53 0,18 - - 0,10 - 0,79 0,79

В*54 0,18 1,02 - 0,05 - - 0,40

В*55 0,97 - 0,68 0,84 1,45 - 1,19

В*56 1,08 2,04 0,68 1,10 0,36 2,38 2,38

В*57 2,63 2,04 6,08х 2,66 1,45 3,17 3,17

В*58 1,48 3,06 3,38х 0,84 0,72 1,59 1,59

В*73 0,21 - - 0,05 - 0,79 -

DRB1*01 14,04 12,24 11,49 16,13 17,03 13,49 14,29

DRB1*03 6,98 8,16 5,41 7,93 6,16 5,56 7,14

DRB1*04 10,48 11,22 9,46 11,27 7,61 9,52 8,73

DRB1*07 14,95х 16,33 17,57 12,79 12,32 11,11 14,29

DRB1*08 3,77 2,04 2,70 4,18 3,62 6,35 3,17

DRB1*09 1,99х 3,06 1,35 1,10 1,81 1,59 1,19

DRB1*10 1,08 - 2,03 1,04 0,72 - 0,79

DRB1*11 9,64 7,14 9,46 10,54 10,14 17,46х 11,51

DRB1*12 2,76х 4,08 3,38 1,57 2,54 0,79 1,59

DRB1*13 13,61 14,29 10,14 13,57 13,41 14,29 14,68

DRB1*14 2,44 3,06 2,70 1,93 1,81 0,79 1,59

DRB1*15 14,49 16,33 17,57 14,46 17,39 11,90 17,06

DRB1*16 3,74 2,04 6,76 3,50 5,43 7,14х 3,97

Таблица 3

Частоты 20 наиболее распространённых трёхлокусных гаплотипов A-B-DRB1

в регистре ЧОСПК

№ п/п Гаплотип A-B-DRB1 Частота гаплотипа, % Популяции максимального распространения

1 A*01-B*08-DRB1*03 3,58 Европа

2 A*03-B*35-DRB1*01 3,17 Финны Европы, России

3 A*03-B*07-DRB1*15 2,94 Север Европы

4 A*02-B*13-DRB1*07 2,78 Кочевники от Азии до Европы

5 A*02-B*07-DRB1*15 1,64 Европа

6 A*25-B*18-DRB1*15 1,26 Балканы

7 A*02-B*15-DRB1*04 1,11 Западная Европа

8 A*02-B*41-DRB1*13 1,01 Европа

9 A*02-B*44-DRB1*04 0,95 Запад Европы (кельты)

10 A*02-B*27-DRB1*01 0,94 Русские. Саамы Швеции

11 A*24-B*07-DRB1*15 0,93 Евразия

12 A*02-B*15-DRB1*13 0,92 Евразия

13 A*25-B*18-DRB1*04 0,90 Средиземноморье, Балканы

14 A*30-B*13-DRB1*07 0,89 Центральная Азия

15 A*02-B*18-DRB1*11 0,89 Средиземноморье, Балканы

16 A*02-B*44-DRB1*16 0,83 Балканы

17 A*02-B*50-DRB1*07 0,77 Центральная Азия

18 A*03-B*07-DRB1*13 0,73 Евразия

19 A*02-B*44-DRB1*11 0,68 Европа

20 A*03-B*07-DRB1*01 0,67

донора стволовых клеток для трансплантации костного мозга.

В табл. 3 представлены 20 наиболее распростра -нённых гаплотипов HLA среди потенциальных доноров стволовых клеток Челябинской областной станции переливания крови. Большинство из них представляют собой типичные европейские гаплотипы HLA, что следует ожидать, так как 70 % доноров, из которых состоит регистр,— русские. В первой десятке также есть гаплоти-пы A*01-B*08-DRB1*03 и Л*02-В*07^В1*15, характерные для финно-угорского населения

Европы, обнаружено несколько гаплотипов Л*02-В*13^ЯВ1*07, Л*02-В*50^ЯВ1*07, характерных для народов юга Евразии: башкир, татар, казахов, а также гаплотипы, появившихся, по-видимому, кроссинговером и представляющих собой усечённый анцестральный гаплотип с изменённым третьим членом.

Выводы. Нацеленное включение в регистр до -норов стволовой клетки Челябинской областной станции переливания крови приводит к увеличению частоты встречаемости в регистре азиатских генов и разнообразию гаплотипов ИЬЛ.

Список литературы

1. Всероссийская перепись населения [Электронный ресурс]. - URL: http://www.perepis2002.ru

2. Суслова, Т. А. Частоты генов HLA-A, B, DR в популяции татар Челябинской области в сравнении с другими этносами региона / Т. А. Суслова, А. Л. Бурмистрова, Е. Б Хромова, М. Н. Вавилов, С. В. Беляева, М. С. Чернова, А. K. Горелова // Вестн. Челяб. гос. ун-та. - 2013. - № 7 (298). Биология. Вып. 2. -С. 14-17.

3. Суслова, Т. А. Распределение генов, гаплотипов HLA в популяции башкир, проживающих в Челябинской области / Т. А. Суслова, А. Л. Бурмистрова, М. С. Чернова, М. Н. Вавилов, Е. Б. Хромова // Иммунология. - 2011. - № 2. - С. 65-68.

4. Downing, J. Five-Locus HLA Typing of Hematopoietic Stem Cell Donor Volunteers Using PCR Sequence Specific Primers / J. Downing, M. G. Guttridge, J. Thompson, C. Darke // Genetic Testing. - 2004. - Vol. 8, № 3. - P. 301-312.

5. Suslova, T. A. HLA gene and haplotype frequencies in bashkirs, russians and tatars, living in the Chelyabinsk region (Russian South Urals) [Электронный ресурс] / T. A. Suslova, A. L. Burmistrova, M. S. Chernova, E. B. Khromova, I. V. Devald, S. V. Timofeeva, M.N. Vavilov, E. I. Lupar, C. Darke // International Journal of Immunogenetics. - 2012. - Vol. 39, iss. 5. - P. 394-408. - Doi: 10.1111/j.1744-313X.2012.01117.x

6. Wennerstrom, A. Diversity of Extended HLA-DRB1 Haplotypes in the Finnish Population [Электронный ресурс] / A. Wennerstrom, E. Vlachopoulou, L. E. Lahtela, R. Paakkanen, K. T. Eronen, M. Seppanen, M.-L. Lokki // PLoS One. - 2013. - № 8 (11). - URL: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3836878

Сведения об авторах

Суслова Татьяна Александровна — кандидат медицинских наук, заведующая отделом молекулярно-био-логической диагностики Челябинской областной станции переливания крови, доцент кафедры микробиологии, иммунологии и общей биологии Челябинского государственного университета, Челябинск, Россия. hla_chel@mail.ru

Рудакова Галина Аркадьевна — главный врач Челябинской областной станции переливания крови, Челябинск, Россия. chel@ospk.ru

Хромова Елена Борисовна — кандидат биологических наук, биолог отдела молекулярно-биологической диагностики Челябинской областной станции переливания крови, доцент кафедры микробиологии, иммунологии и общей биологии Челябинского государственного университета, Челябинск, Россия. eb_sh@mail.ru

Вавилов Михаил Николаевич — биолог отдела молекулярно-биологической диагностики Челябинской областной станции переливания крови, Челябинск, Россия. vavlakhim@mail.ru

Беляева Светлана Валерьевна — кандидат биологических наук, биолог отдела молекулярно-биоло-гической диагностики Челябинской областной станции переливания крови, доцент кафедры микробиологии, иммунологии и общей биологии Челябинского государственного университета, Челябинск, Россия. shshvetlana@gmail.com

Bulletin of Chelyabinsk State University. 2015. No. 21 (376). Biology. Issue 3. Pp. 28-35.

THE CONTRIBUTION TO THE GENE POOL OF HLA DONOR REGISTER OF STEM CELLS OF DIFFERENT NATIONALITIES LIVING IN THE CHELYABINSK REGION

T. A. Suslova

Chelyabinsk regional hemotransfusion station, Chelyabinsk State University, Chelyabinsk, Russia. hla_chel@mail.ru

G. A. Rudakova

Chelyabinsk regional hemotransfusion station, Chelyabinsk, Russia. chel@ospk.ru

E. B. Khromova

Chelyabinsk regional hemotransfusion station, Chelyabinsk State University, Chelyabinsk, Russia. eb_sh@mail.ru

M.N. Vavilov

Chelyabinsk regional hemotransfusion station, Chelyabinsk, Russia. vavlakhim@mail.ru

S. V. Belyaeva

Chelyabinsk regional hemotransfusion station, Chelyabinsk State University, Chelyabinsk, Russia. shshvetlana@gmail.com

The article presents the frequency of genes and haplotypes HLA donors of different nationalities Chelyabinsk register stem cell donors. HLA typing for 3 loci was curried out by PCR-SSP. The results show that the aimed inclusion in the register of donors of different nationalities increases the number of rare alleles and provides a variety of HLA haplotypes.

Keywords: populational immunogenetics, MHC, HLA, Tatars, Bashkir, Russian, Register donor blood stem cells.

References

1. Vserossiyskayaperepis' naseleniya [National Population Census]. Available at: http://www.perepis2002. ru, accessed 17.10.2015. (In Russ.).

2. Suslova T.A., Burmistrova A.L., Khromova E.B., Vavilov M.N., Belyaeva S.V., Chernova M.S., Gorelo-va A.K. Chastoty genov HLA-A, B, DR v populyacii tatar Chelyabinskoj oblasti v sravnenii s drugimi etnosami regiona [The frequencies of genes HLA-A, B, DR Tatars in the population of the Chelyabinsk region in comparison to other ethnic groups in the region]. Vestnik Chelyabinskogo gosudarstvennogo universiteta [Bulletin of Chelyabinsk State University], 2013, no. 7 (298), pp. 14-17. (In Russ.)

3. Suslova T.A., Burmistrova A.L., Chernova M.S., Vavilov M.N., Khromova E. B. Raspredeleniye genov, gaplotipov HLA v populyacii bashkir, prozhivajushhikh v Chelyabinskoy oblasti [The distribution of genes, HLA haplotypes in a population of Bashkirs living in the Chelyabinsk Region]. Immunologiya [Immunology], 2011, no. 2, pp. 65-68 (In Russ.)

4. Downing J., Guttridge M.G., Thompson J., Darke C. Five-Locus HLA Typing of Hematopoietic Stem Cell Donor Volunteers Using PCR Sequence Specific Primers. Genetic Testing, 2004, vol. 8, iss. 3, pp. 301-312.

5. Suslova T.A., Burmistrova A.L., Chernova M.S., Khromova E.B., Devald I. V., Timofeeva S.V., Vavi-lov M.N., Lupar E.I., Darke C. HLA gene and haplotype frequencies in Bashkirs, Russians and Tatars, living in the Chelyabinsk region (Russian South Urals). International Journal of Immunogenetics, 2012, vol. 39, iss. 5, pp. 394-408. Doi: 10.1111/j.1744-313X.2012.01117.x

6. Wennerstrom A., Vlachopoulou E., Lahtela L.E., Paakkanen R., Eronen K.T., Seppanen M., Lok-ki M.-L. Diversity of Extended HLA-DRB1 Haplotypes in the Finnish Population. PLoS One, 2013, vol. 8, iss. 11. Available at: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3836878/, accessed 17.10.2015.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.