Научная статья на тему 'Особенности генетического полиморфизма антигенов гистосовместимости Уральского регионального регистра доноров гемопоэтических стволовых клеток'

Особенности генетического полиморфизма антигенов гистосовместимости Уральского регионального регистра доноров гемопоэтических стволовых клеток Текст научной статьи по специальности «Биология»

CC BY
11
2
Поделиться
Журнал
Иммунология
Scopus
ВАК
CAS
RSCI
Область наук
Ключевые слова
ЧАСТОТА СЕМЕЙСТВ АЛЛЕЛЕЙ СИСТЕМЫ HLA / HLA ALLELE FAMILIES FREQUENCY / ТРАНСПЛАНТАЦИЯ ГЕМОПОЭТИЧЕСКИХ СТВОЛОВЫХ КЛЕТОК / РЕГИСТР ДОНОРОВ ГЕМОПОЭТИЧЕСКИХ СТВОЛОВЫХ КЛЕТОК / HEMATOPOIETIC STEM CELLS TRANSPLANTATION / РУССКИЕ / RUSSIANS / БАШКИРЫ / BASHKIRS / ТАТАРЫ / TATARS / STEM CELLS DONORS REGISTRY

Аннотация научной статьи по биологии, автор научной работы — Рыбкина Валентина Львовна, Азизова Т.В., Адамова Г.В., Теплякова О.В., Румянцева А.В., Тепляков И.И.

Цель исследования оценка частот семейств аллелей системы HLA, встречающихся в Уральском региональном регистре доноров гемопоэтических стволовых клеток (УРРД ГСК) (г. Озерск Челябинской области). Основными этносами, представленными в УРРД ГСК, были русские, башкиры и татары. ДНК выделена из периферической крови детергентно-солевым методом с осаждением на мембранных колонках фирмы Protrans (Германия). HLA-типирование проведено с использованием методов сиквенс-специфических праймеров (SSP) с использованием реактивов фирмы Protrans (Германия) и сиквенс-специфических олигонуклеотидов (SSO) с использованием реактивов фирмы One Lambda (США). Для русских УРРД ГСК были характерны генетические черты кавказоидных популяций. Особенностью УРРД ГСК служит более низкая частота специфичности А*01, более высокая А*33, В*45, В*55 по сравнению с таковой у русских в Челябинской области. У татар имелись признаки кавказоидов, однако у татар УРРД ГСК частоты аллельных семейств А*01, В*44, ниже чем у русских УРРД ГСК и русских Челябинской области, что сближает их с представителями монголоидных популяций. Частота аллельного семейства А*03 статистически значимо выше, чем у татар Челябинской области. Более высокие частоты А*24, В*40 и DRB1*12, чем у русских УРРД ГСК, и ненулевые уровни А*33, В*46, В*48, В*58 и DRB1*09 роднят башкир УРРД ГСК в большей степени с монголоидными популяциями, чем с кавказоидными. У башкир УРРД ГСК отмечена статистически значимо более высокая частота аллельных семейств В*08, В*35 и DRB1*03 по сравнению с башкирами Челябинской области. Результаты исследования показали, что УРРД ГСК имеет свои особенности распределения частот семейств аллелей системы HLA и может способствовать обогащению международной сети регистров разнообразием местных генотипов.

Похожие темы научных работ по биологии , автор научной работы — Рыбкина Валентина Львовна, Азизова Т.В., Адамова Г.В., Теплякова О.В., Румянцева А.В., Тепляков И.И.,

GENETIC POLYMORPHISM OF HISTOCOMPATIBILITY ANTIGENS PECULIARITIES IN URALS REGIONAL REGISTRY OF HEMATOPOIETIC STEM CELLS DONORS

The aim of the investigation was the evaluation of HLA-system allele families frequencies in Urals regional registry of hematopoietic stem cells (URRD HSC) (Ozersk Chelyabinsk Region). The main ethnic groups in Urals regional registry of hematopoietic stem cells were Russians, Bashkirs and Tatars. DNA was obtained from EDTA-anticoagulated peripheral blood using membrane columns «Protrance» (Germany). HLA-A, B-, DRB1-typing was performed by PCR-SSP using reagents «Protrans» (Germany) and PCR-SSO using reagents «One Lambda» (USA). The distribution of HLA allele families in Russians of URRD HSC (Ozersk, Chelyabinsk region) is close to other Caucasoid populations. The peculiarity of URRD HSC is lower frequency of А*01 specificity, higher frequency of А*33, В*45, В*55 than in Russians of Chelyabinsk region. The Tatar population of URRD HSC demonstrates some Caucasoid HLA-features, but frequencies of А*01, В*44, allele families are lower than in Russians of URRD HSC and in Russians of Chelyabinsk Region and other Caucasoid populations, that makes them closer to Mongoloid populations. The frequency of allele family А*03 is statistically significantly higher than in Chelyabinsk Region Tatars population. The higher frequencies of allele families А*24, В*40 и DRB1*12, than in Russians URRD HSC and non-zero levels of А*33, В*46, В*48, В*58 and DRB1*09 suggest than Bashkirs are closer to Mongoloid populations than to Caucasoids. In URRD HSC Bashkir population were statistically significant higher frequencies of allele families В*08, В*35 и DRB1*03, than in Bashkirs of Chelyabinsk Region. URRD HSC due to its peculiarities may enrich the worldwide net of registries by the diversity of local HLA-genotypes.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

Текст научной работы на тему «Особенности генетического полиморфизма антигенов гистосовместимости Уральского регионального регистра доноров гемопоэтических стволовых клеток»

ОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИ

bacterial sensor NOD2 programs dendritic cells to promote interleukin-17 production in human memory T cells. Immunity. 2007; 27: 660—9.

8. Schwarz H., Posselt G., Wurm P., Ulbing M., Duschl A., Horejs-Hoeck J. TLR8 and NOD signaling synergistically induce the production of IL-ip and IL-23 in monocyte-derived DCs and enhance the expression of the feedback inhibitor SOCS2. Immunobiology. 2013; 218(4): 533—42.

9. Lebedeva E.S., Bagaev A.V., Chulkina M.M., Pichugin A.V., Ataullakhanov R.I. Synergistic enhancement of cytokines and interferon genes transcription during activation of macrophages and dendritic cells by a combination of the two agonists PRR. Immunologiya. 2017; 38(1): 64—71. (in Russian)

10. Whitmore M.M., DeVeer M.J., Edling A., Oates R.K., Simons B., Lindner D. et al. Synergistic activation of innate immunity by double-stranded RNA and CpG DNA promotes enhanced antitumor activity. Cancer Res. 2004; 64(16): 5850—60.

11. Nasirudeen A.M.A., Wong H.H., Thien P., Xu S., Lam K.P., Liu D.X. RIG-I, MDA5 and TLR3 synergistically play an important role in restriction of dengue virus infection. PLoS Negl. Trop. Dis. 2011; 5(1): e926.

12. Tukhvatulin A.I., Gitlin I.I., Shcheblyakov D.V., Artemicheva N.M., Burdelya L.G., Shmarov M.M. et al. Combined stimulation of Tolllike receptor 5 and NOD1 strongly potentiates activity of NF-kB, resulting in enhanced innate immune reactions and resistance to Salmonella enterica serovar Typhimurium infection. Infect. and Immun. 2013; 81(10): 3855—64.

13. Inaba K., Inaba M., Romani N., Aya H., Deguchi M., Ikehara S. et al. Generation of large numbers of dendritic cells from mouse bone marrow cultures supplemented with granulocyte/macrophage colony-stimulating factor. J. Exp. Med. 1992; 176(6): 1693—702.

14. Mann H.B., Whitney D.R. On a test of whether one of two random variables is stochastically larger than the other. Ann. Mathemat. Statist. 1947; 18: 50—60.

15. Peroval M.Y., Boyd A.C., Young J.R., Smith A.L. A critical role for MAPK signalling pathways in the transcriptional regulation of toll like receptors. PloS One. 2013; 8(2): e51243.

16. Makela S.M., Strengell M., Pietila T.E., Osterlund P., Julkunen I. Multiple signaling pathways contribute to synergistic TLR ligand-dependent cytokine gene expression in human monocyte-derived macrophages and dendritic cells. J. Leukoc. Biol. 2009; 85(4): 664—72.

17. Salmeron A., Janzen J., Soneji Y., Bump N., Kamens J., Allen H. et al. Direct phosphorylation of NF-kappaB1 p105 by the IkappaB kinase complex on serine 927 is essential for signal-induced p105 proteolysis. J. Biol. Chem. 2001; 276: 22215—22.

18. Yao J., Mackman N., Edgington T.S., Fan S.T. Lipopolysaccharide induction of the tumor necrosis factor-a promoter in human monocytic cells regulation by Egr-1, c-Jun, and NF-кЬ transcription factors. J. Biol. Chem. 1997; 272(28): 17795—801.

19. Zhu W., Downey J.S., Gu J., Di Padova F., Gram H., Han J. Regulation of TNF expression by multiple mitogen-activated protein kinase pathways. J. Immunol. 2000; 164(12): 6349—58.

20. Falvo J.V., Uglialoro A.M., Brinkman B.M., Merika M., Parekh B.S., Tsai E.Y. et al. Stimulus-specific assembly of enhancer complexes on the tumor necrosis factor alpha gene promoter. Mol. cell. Biol. 2000; 20(6): 2239—47.

21. Medvedev A.E., Lentschat A., Wahl L.M., Golenbock D.T., Vogel S.N. Dysregulation of LPS-induced Toll-like receptor 4-MyD88 complex formation and IL-1 receptor-associated kinase 1 activation in endotoxin-tolerant cells. J. Immunol. 2002; 169: 5209—16.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

22. Li L., Cousart S., Hu J., McCall C.E. Characterization of interleukin-1 receptor-associated kinase in normal and endotoxin- tolerant cells. J. Biol. Chem. 2000; 275: 23340—5.

23. Tsai W.H., Huang D.Y., Yu Y.H., Chen C.Y., Lin W.W. Dual roles of NOD2 in TLR4-mediated signal transduction and induced inflammatory gene expression in macrophages. Cell. Microbiol. 2011; 13(5): 717—30.

24. Makela S.M., Osterlund P., Julkunen I. TLR ligands induce synergistic interferon-P and interferon-11 gene expression in human monocyte-derived dendritic cells. Mol. Immunol. 2011; 48(4): 505—15.

Поступила 30.09.16 Принята в печать 03.11.16

© КОЛЛЕКТИВ АВТОРОВ, 2017 УДК 612.6.02.017.1:575.174.015.3

Рыбкина В.Л., Азизова Т.В., Адамова Г.В., Теплякова О.В., Румянцева А.В., Тепляков И.И.

ОСОБЕННОСТИ ГЕНЕТИЧЕСКОГО ПОЛИМОРФИЗМА АНТИГЕНОВ ГИСТОСОВМЕСТИМОСТИ УРАЛЬСКОГО РЕГИОНАЛЬНОГО РЕГИСТРА ДОНОРОВ ГЕМОПОЭТИЧЕСКИХ СТВОЛОВЫХ КЛЕТОК

ФГУП «Южно-Уральский институт биофизики» ФМБА России 456780, г Озерск, Россия

Цель исследования — оценка частот семейств аллелей системы HLA, встречающихся в Уральском региональном регистре доноров гемопоэтических стволовых клеток (УРРД ГСК) (г. Озерск Челябинской области). Основными этносами, представленными в УРРД ГСК, были русские, башкиры и татары. ДНК выделена из периферической крови детергентно-солевым методом с осаждением на мембранных колонках фирмы Protrans (Германия). HLA-типирование проведено с использованием методов сиквенс-специфических праймеров (SSP) с использованием реактивов фирмы Protrans (Германия) и сиквенс-специфических олигонуклеотидов (SSO) с использованием реактивов фирмы One Lambda (США). Для русских УРРД ГСК были характерны генетические черты кавказоидных популяций. Особенностью УРРД ГСК служит более низкая частота специфичности А*01, более высокая А*33, В*45, В*55 по сравнению с таковой у русских в Челябинской области. У татар имелись признаки кавказоидов, однако у татар УРРД ГСК частоты аллельных семейств А*01, В*44, ниже чем у русских УРРД ГСК и русских Челябинской области, что сближает их с представителями монголоидных популяций. Частота аллельного семейства А*03 статистически значимо выше, чем у татар Челябинской области. Более высокие частоты А*24, В*40 и DRB1*12, чем у русских УРРД ГСК, и ненулевые уровни А*33, В*46, В*48, В*58 и DRB1*09 роднят башкир УРРД ГСК в большей степени с монголоидными популяциями, чем с кавказоидными. У башкир УРРД ГСК отмечена статистически значимо более высокая частота аллельных семейств В*08, В*35 и DRB1*03 по сравнению с башкирами Челябинской области. Результаты исследования показали, что УРРД ГСК имеет свои особенности распределения частот семейств аллелей системы HLA и может способствовать обогащению международной сети регистров разнообразием местных генотипов.

Ключевые слова: частота семейств аллелей системы HLA; трансплантация гемопоэтических стволовых клеток; регистр доноров гемопоэтических стволовых клеток; русские; башкиры; татары.

Для корреспонденции: Рыбкина Валентина Львовна, д-р мед. наук, старший научный сотрудник клинического отдела ФГУП «Южно-Уральский институт биофизики» ФМБА России, E-mail: clinic@subi.su

ORIGINAL ARTICLE

Для цитирования: Рыбкина В.Л., Азизова Т.В., Адамова Г.В., Теплякова О.В., Румянцева А.В., Тепляков И.И. Особенности генетического полиморфизма антигенов гистосовместимости уральского регионального регистра доноров гемопоэтических стволовых клеток. Иммунология. 2017; 38(2): 82-86. DOI: 10.18821/0206-4952-2017-38-2-82-86

Rybkina V.L., Azizova T. V., Adamova G.V., Teplyakova O.V., Rumyantseva A.V., Teplyakov I.I.

genetic polymorphism of histocompatibility antigens peculiarities in urals regional registry of hematopoietic stem cells donors

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

FSUE Southern Urals Biophysics Institute of FMBA, 456780, Ozersk, Chelyabinsk Region, Russian Federation

The aim of the investigation was the evaluation of HLA-system allele families frequencies in Urals regional registry of hematopoietic stem cells (URRD HSC) (Ozersk Chelyabinsk Region). The main ethnic groups in Urals regional registry of hematopoietic stem cells were Russians, Bashkirs and Tatars. DNA was obtained from EDTA-anticoagulated peripheral blood using membrane columns «Protrance» (Germany). HLA-A, B-, DRB1-typing was performed by PCR-SSP using reagents «Protrans» (Germany) and PCR-SSO using reagents «One Lambda» (USA). The distribution of HLA allele families in Russians of URRD HSC (Ozersk, Chelyabinsk region) is close to other Caucasoid populations. The peculiarity of URRD HSC is lower frequency of А*01 specificity, higher frequency of А*33, В*45, В*55 than in Russians of Chelyabinsk region. The Tatar population of URRD HSC demonstrates some Caucasoid HLA-features, but frequencies of А*01, В*44, allele families are lower than in Russians of URRD HSC and in Russians of Chelyabinsk Region and other Caucasoid populations, that makes them closer to Mongoloid populations. The frequency of allele family А*03 is statistically significantly higher than in Chelyabinsk Region Tatars population. The higher frequencies of allele families А*24, В*40 и DRB1*12, than in Russians URRD HSC and non-zero levels of А*33, В*46, В*48, В*58 and DRB1*09 suggest than Bashkirs are closer to Mongoloid populations than to Caucasoids. In URRD HSC Bashkir population were statistically significant higher frequencies of allele families В*08, В*35 и DRB1*03, than in Bashkirs of Chelyabinsk Region. URRD HSC due to its peculiarities may enrich the worldwide net of registries by the diversity of local HLA-genotypes.

Keywords: HLA allele families frequency; hematopoietic stem cells transplantation; stem cells donors registry, Russians, Bashkirs, Tatars.

For citation: Rybkina V.L., Azizova T. V., Adamova G.V., Teplyakova O.V., Rumyantseva A.V., Teplyakov I.I. Genetic polymorphism of histocompatibility antigens peculiarities in urals regional registry of hematopoietic stem cells donors. Immunologiya. 2017; 38(2): 82-86. DOI: 10.18821/0206-4952-2017-38-2-82-86

For correspondence: Valentina L. Rybkina, Dr. Sci. Med. Senior researcher of the clinical department of FSUE Southern Urals Biophysics Institute of FMBA of Russia.

conflict of interest. The authors declare no conflict of interest.

Acknowledgments. The study had no sponsorship.

Received 28.09.16 Accepted 03.11.16

введение

Лейкоцитарные антигены человека (НЬА) — это главный комплекс тканевой совместимости у людей. Частота аллелей НЬА системы различных популяций очень значима при подборе доноров для аллогенных пересадок гемопоэтических стволовых клеток (ГСК). Успех трансплантации ГСК во многом определяет эффективность подбора донора для реципиента. При высокой степени полиморфизма генов системы НЬА такой подбор оказывается сложной задачей. Для ее решения во всем мире создают регистры доноров ГСК. В Южно-Уральском институте биофизики с 2007 г. при одобрении Наблюдательного совета института для защиты прав граждан, привлекаемых в качестве субъекта исследования в научно-исследовательских программах, создают регистр доноров ГСК — Уральский региональный регистр доноров гемопоэтических стволовых клеток (УРРД ГСК) [1, 2].

Каждому этносу свойственны свои особые генетические черты и, следовательно, особенности распространения тех или иных НЬА-генотипов. Цель настоящего исследования — оценка частот аллельных семейств локусов А, В, DRB1 системы НЬА потенциальных доноров УРРД ГСК.

Материал и методы

Все исследованные субъекты были потенциальными донорами УРРД ГСК, проживавшими в закрытом территориальном образовании (ЗАТО) г. Озерск Челябинской области; в возрасте от 18 до 55 лет. Этническое происхождение устанавливали путем опроса регистрантов. Из 302 потенциальных доноров ГСК, которым проведено НЬА-типирование, 257 доноров были идентифицированы как русские (157 мужчин, 100 женщин), 33 донора — башкиры (20 мужчин 13 женщин), 12 — татары (7 мужчин, 5 женщин). ДНК выделена

из периферической крови с использованием ЭДТА в качестве антикоагулянта детергентно-солевым методом с осаждением на мембранных колонках фирмы Protrans (Германия). HLA-типирование проведено методом сиквенс-специфических праймеров (SSP) с использованием реактивов фирмы Protrans (Германия) и сиквенс-специфических олигонуклеотидов (SSO) с применением реактивов фирмы One Lambda (США) согласно инструкциям производителей.

Для оценки различий частоты семейств аллелей использовали критерий х2 и х2 с поправкой Йейтса, при множественных сравнениях использовали поправку Бонферрони. Статистически значимыми считали различия при p < 0,05.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

результаты

Результаты исследования показали, что у русских УРРД ГСК аллели семейств А*01, А*02, А*03, А*24, В*07, В*35, DRB1*01, DRB1*03, DRB1*04, DRB1*07, DRB1*11, DRB1*13 и DRB1*15 встречались с высокой частотой (>0,075); аллели семейств А*23, А*34, А*66, А*74, А*80, В*26, В*42, В*47 и В*49, В*54, В*56, В*58, В*67, В*73, В*78, DRB1*10 встречались редко (<0,01). Аллели А*36, А*43, А*69, В*48, В*59, В*81, В*82 не встречались вообще (табл. 1).

У русских УРРД по сравнению с татарами и башкирами УРРД частоты семейств аллелей А* и DRB1* были примерно одинаковыми (см. табл. 1—3). Частота семейства аллелей В*35 у русских была статистически значимо ниже, чем у татар. Семейство аллелей В*48 у русских УРРД ГСК не выявлено, небольшая частота зарегистрирована у башкир и татар, разница была статистически значимой. Частота семейства аллелей В*13 у русских была ниже, чем у башкир и татар, однако только с башкирами различие было статистически значимым. Частота семейства аллелей В*44 у русских УРРД была небольшой, в то время как у башкир не встречалось (p =

Иммунология. 2017; 38(2)

DOI: http://dx.doi.org/10.18821/0206-4952-2017-38-2-82-86 ОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИ

Таблица 1

Частота аллелей HLA-A, -DRB1 в Уральском региональном регистре доноров ГсК у русских (п = 257)

Семейства аллелей Частота семейств аллелей Семейства аллелей Частота семейств аллелей Семейства аллелей Частота семейств аллелей

УРРД ГСК Русские Челябинской области УРРД ГСК Русские Челябинской области УРРД ГСК Русские Челябинской области

А*01 0,096 0,181 В*14 0,035 0,017 В*54 0,006 0

А*02 0,304 0,297 В*15 0,049 0,082 В*55 0,019 0,005

А*03 0,183 0,159 В*18 0,058 0,056 В*56 0,012 0,010

А*11 0,041 0,046 В*26 0,002 0 В*57 0,037 0,031

А*23 0,008 0,022 В*27 0,062 0,053 В*58 0,007 0,007

А*24 0,126 0,089 В*35 0,119 0,097 В*67 0,006 0

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

А*25 0,047 0,043 В*37 0,012 0,012 В*73 0,002 0

А*26 0,043 0,039 В*38 0,019 0,039 В*78 0,002 0

А*29 0,019 0,010 В*39 0,029 0,024 DRB1*01 0,128 0,157

А*30 0,023 0,014 В*40 0,045 0,048 DRB1*03 0,086 0,094

А*31 0,030 0,019 В*41 0,021 0,031 DRB1*04 0,109 0,109

А*32 0,022 0,034 В*42 0,004 0 DRB1*07 0,134 0,135

А*33 0,025 0,005 В*44 0,084 0,116 DRB1*08 0,053 0,043

А*34 0,002 0 В*45 0,018 0 DRB1*09 0,019 0,014

А*66 0,004 0,007 В*46 0,010 0 DRB1*10 0,006 0,017

А*68 0,021 0,034 В*47 0,004 0,002 DRB1*11 0,101 0,097

А*74 0,002 0 В*48 0 0,005 DRB1*12 0,018 0,010

А*80 0,004 0 В*49 0,008 0,002 DRB1*13 0,150 0,126

В*07 0,126 0,147 В*50 0,012 0,012 DRB1*14 0,029 0,017

В*08 0,054 0,077 В*51 0,054 0,043 DRB1*15 0,126 0,147

В*13 0,051 0,053 В*52 0,023 0,027 DRB1*16 0,041 0,034

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

В*53 0,010 0,002

Примечание. Здесь и в табл. 2, 3 — значения частот аллельных семейств УРРД статистически значимо отличающиеся от таковых Челябинской области (а < 0,05), выделены жирным шрифтом, данные частот аллельных семейств представителей разных национальностей Челябинской области заимствованы из статьи [3].

Таблица 2

Частоты аллелей HLA A, B, DRB1 в Уральском региональном регистре доноров ГсК у татар (п = 12)

Семейства аллелей Частота семейств аллелей Семейства аллелей Частота семейств аллелей Семейства аллелей Частота семейств аллелей

УРРД ГСК Челябинская область УРРД ГСК Челябинская область УРРД ГСК Челябинская область

А*01 0,083 0,118 В*13 0,125 0,107 В*55 0 0,007

А*02 0,333 0,274 В*14 0 0,004 В56* 0 0,015

А*03 0,333 0,159 В*15 0 0,019 В*57 0,083 0,019

А*11 0,042 0,074 В*18 0 0,074 В*58 0,042 0,019

А*23 0 0,019 В*27 0,083 0,048 DRB1*01 0,208 0,111

А*24 0,083 0,107 В*35 0,292 0,122 DRB1*03 0,208 0,063

А*25 0 0,030 В*37 0 0,011 DRB1*04 0,042 0,089

А*26 0,042 0,126 В*38 0 0,044 DRB1*07 0,168 0,196

А*29 0 0,007 В*39 0 0,041 DRB1*08 0 0,030

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

А*30 0,042 0,030 В*40 0 0,056 DRB1*09 0,083 0,030

А*31 0 0,022 В*41 0 0,030 DRB1*10 0 0,015

А*32 0 0,022 В*44 0,042 0,067 DRB1*11 0,083 0,104

А*33 0,042 0,022 В*46 0 0,011 DRB1*12 0 0,022

А*66 0 0,007 В*48 0,083 0,011 DRB1*13 0,083 0,144

А*68 0 0,044 В*49 0 0,033 DRB1*14 0 0,033

В*07 0,208 0,107 В*50 0,042 0,033 DRB1*15 0,125 0,111

В*08 0 0,037 В*51 0 0,059 DRB1*16 0 0,052

В*52 0 0,026

ORIGINAL ARTICLE

Таблица 3

Частота аллелей HLA A, B, DRB1 в Уральском региональном регистре доноров ГсК у башкир (п = 33)

Семейства аллелей Частота семейств аллелей Семейства аллелей Частота семейств аллелей Семейства аллелей Частота семейств аллелей

УРРД ГСК Челябинская область УРРД ГСК Челябинская область УРРД ГСК Челябинская область

А*01 0,091 0,089 В*14 0 0,010 В*55 0,015 0,010

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

А*02 0,303 0,336 В*15 0,030 0,027 В*56 0 0,003

А*03 0,167 0,086 В*18 0,030 0,034 В*57 0,015 0,014

А*11 0,030 0,058 В*27 0,030 0,055 В*58 0,030 0,024

А*23 0,015 0,017 В*35 0,167 0,075 В*73 0,015 0,007

А*24 0,167 0,144 В*37 0,030 0,007 В*78 0,030 0

А*25 0 0,010 В*38 0,045 0,021 ЭКБ1*01 0,045 0,075

А*26 0,061 0,048 В*39 0 0,014 ЭКБ1*03 0,152 0,051

А*30 0,030 0,014 В*40 0,061 0,082 DRБ1*04 0,061 0,116

А*31 0 0,044 В*41 0,015 0,010 DRБ1*07 0,212 0,216

А*32 0,030 0,034 В*44 0 0,038 DRБ1*08 0,030 0, 027

А*33 0,030 0,031 В*46 0,015 0,024 DRБ1*09 0,015 0,048

А*66 0 0,003 В*47 0,015 0 DRБ1*10 0,015 0,007

А*68 0,045 0,086 В*48 0,030 0,075 DRБ1*11 0,061 0,062

А*69 0,015 0 В*49 0,015 0,024 DRB1*12 0,030 0,082

А*74 0,015 0 В*50 0,030 0,038 DRБ1*13 0,212 0,154

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

В*07 0,045 0,082 В*51 0,076 0,106 DRБ1*14 0,076 0,045

В*08 0,106 0,034 В*52 0,015 0,017 DRБ1*15 0,061 0,092

В*13 0,136 0,161 В*54 0 0,007 DRБ1*16 0,030 0,024

0,03). Семейство аллелей В*78 у русских выявляли с низкой частотой, у башкир — чаще (/> = 0,03).

При сравнении частот аллелей у русских УРРД и русских Челябинской области установлено, что статистически значимых различий в частотах аллельных семейств локуса DRB1 в УРРД и доноров Челябинской области у русских не обнаружено. В УРРД отмечена статистически значимо более низкая частота специфичности А*01, более высокая частота аллельных семейств А*33, В*45, В*55 по сравнению с таковой у русских доноров в Челябинской области [3]. Кроме того, у русских УРРД ГСК с небольшой частотой встречались семейства аллелей, которых не было у доноров Челябинской области: А*34, А*74, А*80, В*42, В*45, В*67, В*78.

У татар выявлены высокие частоты аллельных семейств А*01, А*02, А*24, В*07, В*13, В*27, В*35, В*48, В*57, DRB1*01, DRB1*03, DRB1*07, DRB1*09, DRB1*11, DRB1*13, DRB1*15 (см. табл. 2). Кроме того, среди татар в УРРД ГСК отсутствовали носители аллелей семейств А*23, А*25, А*29, А*31, А*32, А*66, А*68, В*08, В*14, В*15, В*18. Частоты семейств аллелей локуса А были примерно одинаковыми у татар у башкир. У татар статистически значимо чаще регистрировались семейства аллелей В*07 и DRB*01 по сравнению с башкирами. Частота аллельного семейства А*03 была статистически значимо выше у татар УРРД ГСК, по сравнению с татарами Челябинской области [3].

У башкир в УРРД ГСК выявлены высокие частоты следующих аллелей А*01, А*02, А*03, А*24, В*08, В*13, В*35, В*51, DRB1*03, DRB1*07, DRB1*13, DRB1*14 и низкая частота DRB1*10 (см. табл. 3). Отсутствовали носители аллелей А*25, А*31, А*66, В*14, В*39, В*44, В*54, В*56, В*78. Установлено, что у башкир УРРД ГСК была более высокая частота аллельных семейств В*08, В*35 и DRB1*03 по сравнению с башкирами-донорами крови Челябинской области (р < 0,05) [3].

В табл. 4 представлены статистически значимые различия в частотах аллельных семейств у представителей наиболее распространенных этносов УРРД ГСК. Установлено, что статистически значимых различий в частотах аллельных семейств системы НЬА между русскими и башкирами больше, чем между русскими и татарами. Статистически значимых различий в частотах аллельных семейств между башкирами и татарами не найдено.

Обсуждение

Результаты настоящего исследования показали, что распределение частот семейств аллелей системы НЬА среди русских УРРД ГСК близко к другим кавказоидным популяциям [4]. Например, аллели семейств А*01, 02, А*03, 24, В*07, В*35, DRB1*03, DRB1*04, DRB1*07, DRB1*11, DRB1* 13 и DRB1*15 встречались с высокой частотой. Аллели семейств А*23, А*34, А*66, А*74, А*80, В*26, В*42, В*47 и В*49, В*54, В*56 В*58 В*67 В*73, В*78 DRB1*10 встречались редко. Так же, как и у русских доноров крови Челябинской области, у русских УРРД ГСК отмечена более

Таблица 4

наличие статистически значимых различий в частотах аллельных семейств наиболее многочисленных этносов УррД ГсК

Русские по сравнению с Русские по сравнению с Татары по сравне-

Аллели татарами башкирами нию с башкирами

русские | татары русские | башкиры татары | башкиры

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

Локус А нет различий

В*07

В*13 1 !

В*35

В*44

В*48 нет различий нет различий

В*78 4 Т

DRB1*01

Примечание. Т — частота выше 4 — частота ниже.

- 85 -

ОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИ

высокая частота семейства аллелей В*13 по сравнению с другими европейскими популяциями, за исключением поляков и чехов [3—5]. В отличие от русских Челябинской области отмечена более низкая частота специфичности А*01 по сравнению с таковой у русских доноров крови в Челябинской области [3]. Она более близка к частоте этого семейства аллелей у башкир и татар в нашем исследовании и исследовании доноров Челябинской области [3]. Высокая частота аллельных семейств А*33 свидетельствует о близости их с монголоидными популяциями, в частности с башкирами, что подтверждают наши данные и данные литературы [3]. Более высокая частота аллельных семейств В*45 и В*55, наблюдаемая у русских в УРРД ГСК по сравнению с русскими донорами Челябинской области, объясняется, вероятно, большой долей русских, приехавших из Москвы, и возможной примеси немецких генотипов [4, 6]. Частоты аллельных семейств DRB1*01 и DRB1*03 были несколько ниже (хотя и статистически незначимо), чем у русских Челябинской области, и более близки к частотам аллелей у русских Архангельской области [3, 7]. Частоты семейств аллелей DRB1*04 и DRB1*07, DRB1*09, DRB1*11 были практически идентичны частотам аллелей у русских Челябинской области, DRB1*08 и DRB1*13 были близки к частотам аналогичных семейств аллелей русских Вологодской области [3, 7]. Частоты семейств аллелей DRB1*03, DRB1*04, DRB1*10, DRB1*14, DRB1*16 были близки к частотам аллельных семейств Смоленской области. Частоты семейств аллелей DRB1*12 были близки частоте этого семейства аллелей у русских Костромской области [7]. Эти факты объясняются приездом в ЗАТО в момент строительства комбината и города русских из различных городов России [8]. У потенциальных доноров УРРД ГСК, которые считали себя русскими, с небольшой частотой встречались семейства аллелей, не наблюдающихся у доноров Челябинской области: А*34, А*74, А*80, В*42, В*45, В*67, В*78. Поскольку эти семейства аллелей не встречались в исследованных популяциях русских, можно предположить, что в иммуногенотипе этих людей имелись примеси аллелей представителей популяций, у которых эти семейства аллелей встречаются: А*34, В*42 и В*45 — немецкой, А*74 и В*67 — армянской и немецкой, А*80 и В*78 — евреев Израиля [4].

Как показали результаты исследования, для татар УРРД ГСК в большей степени были характерны черты кавказоидных популяций [3, 4] — высокие частоты семейств аллелей А*01, А*02, А*24, В*07, В*13, В*27, В*35, В*48, В*57, DRB1*01, DRB1*03, DRB1*07, DRB1*09, DRB1*11, DRB1*13, DRB1*15. Кроме того, у представителей этого этноса в УРРД ГСК отсутствовали носители аллелей А*23, А*25, А*29, А*31, А*32, А*66, А*68, В*08, В*14, В*15, В*18. У татар УРРД ГСК частоты аллельных семейств А*01, В*44 были ниже, чем у русских УРРД ГСК и русских Челябинской области, что также сближает их с представителями монголоидных популяций [3, 4, 9]. У татар УРРД ГСК так же, как и у татар-доноров Челябинской области, наблюдалась высокая частота аллельного семейства В*50, которая встречается у чувашей [3, 10].

Более высокие частоты А*24, В*40 и DRB1*12, чем у русских УРРД ГСК, и ненулевые уровни А*33, В*46, В*48, В*58 и DRB1*09 роднят башкир в большей степени с монголоидными популяциями, чем с кавказоидными [3, 9]. Семейство аллелей DRB1*07 встречалось с высокой частотой как у башкир УРРД ГСК, так и у башкир-доноров Челябинской области. Это семейство аллелей встречается с высокой частотой у татар, по нашим данным, а также по данным других исследователей [3], и, кроме того, у удмуртов, бурят и манси [9]. Статистически значимых различий в частотах аллельных семейств между башкирами и татарами не найдено, вероятно, из-за недостаточной статистической мощности исследования.

Проведенные исследования свидетельствуют о том, что УРРД ГСК имеет свои особенности распределения частот аллелей системы HLA и может способствовать обогащению международной сети регистров разнообразием местных генотипов. Это особенно важно для подбора доноров при трансплантации ГСК.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

Финансирование. Исследование не имело спонсорской поддержки.

Конфликт интересов. Авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов.

литература

1. Азизова Т.В., Рыбкина В.Л., Козловская Л.И., Карпова В.Н., Адамова Г.В., Теплякова О.В. Уральский региональный регистр доноров кроветворных стволовых клеток. Медицина экстремальных ситуаций. 2011; 36(2): 117—23.

2. Азизова Т.В., Рыбкина В.Л., Карпова В.Н., Адамова Г.В, Теплякова О.В., Румянцева А.В. Уральский региональный регистр доноров гемопоэтических стволовых клеток: структура и характеристика. Гематология и трансфузиология. 2013; 3: 19—23.

6. Бубнова Л.Н., Зайцева Г.А., Ерохина Л.В., Беркос А.С., Реутова Н.В. Беляева Н.В. и др. Сравнительное исследование распределения HLA-A и HLA-B антигенов и антигенов и гаплотипов среди доноров гемопоэтических стволовых клеток из регионов Германии и России Клеточная терапия и трансплантация. 2008;1: 28—32.

7. Болдырева М.Н., Алексеев Л.П., Хаитов Р.М., Гуськова И.А., Богатова О.В. и др. HLA-генетическое разнообразие населения России и СНГ. I Русские. Иммунология. 2005; 5: 260—3.

8. Черников В.Г. Особое поколение. Т. 1. Челябинск: Челябинский дом печати; 2003.

referencies

1. Azizova T.V., Rybkina V.L., Kozlovskaya L.I., Karpova V.N., Adamova G.V., Teplyakova O.V. Urals regional registry of hematopoietic stem cells donors. Medicina jekstremal'nyh situacij. 2011; 36 (2): 117—23. (in Russian)

2. Azizova T.V., Rybkina V.L., Karpova V.N., Adamova G.V., Teplyakova O.V., Rumyantseva A.V. Urals regional registry of hematopoietic stem cells donors: structure and characteristics. Gematologija i transfuziologija. 2013; 3: 19—23. (in Russian)

3. Suslova T.A., Burmistrova F.L. Chernova M.B., Khromova E.B., Lupar E.I., Timofeeva S.V. et al. HLA gene and haplotype frequencies in Russians, Bashkirs and Tatars, living in Chelyabinsk region (Russian south Urals). Int. J. Immunogenet. 2012; 39(5): 394—408.

4. The allele frequencies Net database (2015). Available at: /http: www. allelefrequencies.net (updated in January 2015).

5. Nowak J., Mika-Witkovska R., Polak M., ZajkoM., Rogatko-KorosM., Graczyk-Pol E. et al. Allele and extended haplotype polymorphism of HLA-A,-C,-D, DRB1 and DQB1 loci in Polish population and genetic affinities to other populations. Tissue Antigens. 2008; 71: 193—205.

6. Bubnova L.N., Zaitseva G.A., Erokhina L.V., Berkos A.S., Reutova N.V., Belyaeva E.V. et al. A comparative study of HLA-A and HLA-B antigens and haplotype distribution among donors of hematopoieic stem cells. From Russia and German regions. Kletochnaja terapija i transplantacija. 2008; 1: 28—32. (in Russian)

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

7. Boldyreva M.N., Alekseev L.P., Khaitov R.M., Gus'kova I.A., Bogatova O.V., Yankevich et al. HLA-genetic diversity among populations of Russia and FIS. Russians I. Immunologia. 2005; 5: 260—3. (in Russian)

8. Chernikov V.G. Spetial generation. [Osoboe pokolenie]. Vol. 1. Chelyabinsk: Cheljabinskij dom pechati; 2003. (in Russian)

9. Uinuk-Ool T.S., Takezaki N., Sukernik R.I., Nagl S., Klein J. Origin and affinities of indigenous Siberian populations as revealed by HLA class II gene frequencies. Hum. Genet. 2002; 110: 209—26.

10. Arnais-Villena A., Martines-Laso J., Moscoso J., Livshits G., Zamora J., Gomes-Casado E., et al. Genes in Chuvashian population from European Russia: admixture of Central European and Mediterranean populations. Hum. Biol. 2003; 75(3): 375—92.

Поступила 28.09.16 Принята в печать 03.11.16