CC BY
42
HayKOBHH bîchhk .nHYBME iMeHi C.3. iW^Koro, 2018, T 20, № 84
HayKOBMM BiCHMK ^tBiBCtKoro Ha^OHa^tHoro yHiBepcMTeTy
BeTepMHapHoi Megw^HM Ta öioTexHO^oriw iMeHi C.3. I^M^Koro
Scientific Messenger of Lviv National University of Veterinary Medicine and Biotechnologies
ISSN 2519-2698 print ISSN 2518-1327 online
doi: 10.15421/nvlvet8427 http://nvlvet.com.ua/
UDC 636.597.034:57.017
Shaoxing breed duck polymorphism by microsatellite loci
A.M. Chepiha, S.O. Kostenko, M.S. Doroshenko, P.V. Korol1, O.M. Konoval2, Lu Lizhi3, Huang Xuetao3, Li Liumeng4
National University of Life and Environmental Sciences of Ukraine, Kyiv, Ukraine
'Institute of Animal Breeding and Genetics nd. a. M. V. Zubets of National Academy of Agrarian Science of Ukraine, Chubyns'ke, Ukraine
2Laboratory of quality and safety of agricultural products of the National University of Life and Environmental Sciences of Ukraine, Kyiv, Ukraine
3Institute of Animal Husbandry and Veterinary Science Zhejiang Academy of Agricultural Sciences, Hangzhou, Zhejiang, China
4Zhejiang Generation Biological Science and Technology Co., Ltd., Wangjiajing, Zhuji, Zhejiang, China
Article info
Received '3.02.2018 Received in revised form
09.03.2018 Accepted '3.03.2018
National University of Life and Environmental Sciences of Ukraine, Geroiv Oborony Str., '5, Kyiv, 0304', Ukraine. Tel.: +38-095-309-34-46 E-mail: [email protected]
Institute of Animal Breeding and Genetics nd. a M.V. Zubets of National Academy of Agrarian Science of Ukraine, Pohrebniaka Str., ', Chubyns'ke, 0832', Ukraine.
Laboratory of quality and safety of agricultural products of the National University of Life and Environmental Sciences of Ukraine, Geroiv Oborony Str., '5, Kyiv, 0304', Ukraine.
Institute of Animal Husbandry and Veterinary Science Zhejiang Academy of Agricultural Sciences, '98 Shiqiao Road, Hangzhou, Zhejiang, 3'002', China.
Zhejiang Generation Biological Science and Technology Co., Ltd. ' Gujing Road, Wangjiajing, Zhuji, Zhejiang, 3''8', China.
Chepiha A.M., Kostenko S.O., Doroshenko M.S., Korol P.V., Konoval O.M., Lizhi Lu, Xuetao Huang, Liumeng Li (2018). Efficiency of use technological feed additive. Scientific Messenger of Lviv National University of Veterinary Medicine and Biotechnologies. 20(84), 148-153. doi: 10.15421/nvlvet8427
Microsatellite markers are now been widely used for the detection and description of micropopulation processes occurring in the populations of domestic animals for the effects of various factors of breeding pressure. Microsatellite loci distributed throughout eukaryotic genomes, making them the preferred genetic marker for high resolution genetic mapping. In recent years, rapid advances have been made in the development of molecular genetic maps. High-density linkage maps are now available for many farm animals, such as cattle, pigs, and goats. In contrast, mapping studies in avian species are much less advanced except in the chicken. According to FAO about 70% of ducks are bred in China. This country is a leader in growing ducks. The Shaoxing breed is one of the three major duck breeds in China. Ducks of this breed are characterized by high performance. According to the Bureau of Product Quality, the age of maturity (the beginning of egg laying) in these birds occurs at 130-140 days. The characteristics of the Shaoxing breed include the fact that the peak period of laying eggs lasts from eight to ten months. On average, one duck in 500 days gives from 290 to 310 eggs, which is one of the highest rates for egg breeds. That is why the purpose of our .study was the microsatellite analysis of two populations of Shaoxing breed with 9 locuses was conducted. The selection of birds for the study were carried out on a duck farms in Zhejiang Generation Biological Science and Technology Co., Ltd. and Zhuji Guowei Poultry Development Co, Ltd., and at the laboratory of the Jjejiang Academy of Sciences Institute. Samples collection and DNA preparation: Venous blood samples were collected from 480 ducks (240 ducks of population I and 240 ducks of population II of the Shaoxing breeds) of both populations into 3 ml tubes containing EDTA as anticoagulant agent. In total of 9 investigated loci in the Shaoxing breed population, only one locus was monomorphic (SM010). The number of different alleles (Na) for each polymorphic locus ranged from 2 (SM012) to 13 (APL79, CM011) in population I and from 2 (APL78, SM012) to 7 (APL79) in population II. On average, one locus had 5.889 alleles in population I and 3.889 of alleles in the population II. The effective number of alleles (Ne) was 1.735 in population I and 1.599 in population II. The number of alleles and the expected heterozy-gosity (Hexp) values can provide important information for the discrimination of individuals and breeds. The index of expected heterozygosity in population I was 0.336 and 0.307 in population II. The information index (I) was 0,702 in population I and 0,576 in population II. For each population was found private alleles, in population I 6 alleles and in population II just 4 alleles. The results show high level of polymorphism of the studied populations of ducks. The obtained results can be used in the creation of new lines of ducks.
Key words: Anas platyrhynchos, polymorphism, Shaoxing breed, microsatellite loci, populations of ducks.
Полiморфiзм качок породи shaoxing за мжросател^ними локусами
A.M. 4enira, С.О. Костенко, М.С. Дорошенко, П.В. Король1, О.М. Коновал2, Лу Л1жи3, Хуанг Цзюяньцяо3, Лi Лiуменг4
Нацюнальний унгверситет бгоресурав i природокористування Украти, Кигв, Украгна
'¡нститут розведення i генетики тварин гменг М. В. Зубця Нацгональног академИ аграрних наук Украти,
Чубинське, Украша
2Лабораторiя якостi i безпеки продукци АПК НУБП Украти, Чабани, Украша
31нститут тваринництва i ветеринара Чжецзянськог Академп Аграрних Наук, Китайська Народна Республгка 4Компашя Чжуцзi Гоувей Полтрi Девелопмент, Китайська Народна Республгка
У статт1 наведет результаты досл^джень генетичног структуры двох популящй качок породи шаость за використання дев 'яти мтросателШних локуЫв. Птицю досл1джували на качиних фермах компант Zhejiang Generation Biological Science and Technology Co., Ltd. та Zhuji Guowei Poultry Development Co, Ltd. за тдтримки лаборатори Poultry Genetics Laboratory of the Zhejiang Academy of Sciences (Zhejiang Province, PRC). Було встановлено, що середне число ефективних алелiв (Ne) на локус у популяци I складало 1,735, а для популяци II - 1,599. Показники тформащйного тдексу становили 0,702 (популящя I) та 0,576 (популящя II). Фактична гетерозиготтсть у популяци I була 0,298, а у популяци II - 0,269. У результатi нашого до^дження для кожног популяци були виявлен приватш алел1 З 9 до^джених локусiв, у популяцИ I було виявлено 6 приватних алелiв, в той час, коли популящя II мала лише 4 локуси. Загалом у популяци I виявлено 23 приватних алелiв, а у популяци II - 5. НайбЫьша кмьюсть приватних алелiв була в локус CMO11 (9), а найменша - 1 алель у локуЫ SMO7 та SM010 в популяци I. Популящя II була бiднiша на приватн алел^ так у локусi APL79 було 2 та по 1 у CM011, SM07, SM010. Отримаж результати свiдчать про високий рiвень внутрШньопородного полiморфiзму шаость, що дозволяе розробку стратегш збереження та використання генетичних ресурсiв качки за використання аналiзу полморфних локуЫв мiкросателiтiв.
Ключовi слова. Anasplatyrhynchos, полiморфiзм, порода шаость, мтросателШм локуси, популяци качок.
Вступ
Качка - один з найбшьш eKOHOMÍ4HO важливих ви-дiв свшсько! водоплавно! птищ, осшльки слугуе дже-релом для отримання яшсного м'яса, яець та шр'я (Huang et al., 2013; Purwantini et al., 2013; Zhao et al., 2015; Ren et al., 2017). Близько 70% качок розводять у Кита! (Tunca et al., 2015; Zeng et al., 2016), за даними ФАО (2015) ця кра!на е лшером з вирощування молодняку качок. О^м далекосхшних кра!н (В'етнам, Малайзия, 1ндонез1я та ш) також розводять качок деяш европейсьш кра!ни (Франция, Румушя, Польща, Укра!на та ш) (FAO, 2015).
Протягом останшх десятилиъ, найбшьш актуаль-ними були дослщження генетичних особливостей та рiзноманiття велико! рогато! худоби, свиней та курей. Качки залишаються недостатньо вивченими серед свшських тварин, тому актуальним е вивчення !х генетичного полiморфiзму (Seo et al., 2016; Klenovickij et al., 201б).
Мшросателпш маркери е корисним шструментом для дослщження генетично! рiзноманiтностi видiв, тому що вони бшьш полiморфнi, шж iншi генетичш маркери (Seo et al., 2016). 1х використання дозволяе значно пришвидшити процес селекцп (Hlestkina, 2013). Прюритетшсть використання мшросателтгаих маркерiв у генетичних дослщженнях обумовлена тим, що !х полiморфiзм настшьки високий, що дозволяе вщслщковувати передачу хромосом у поколшнях (Tao et al., 2016; Fisinin et al., 2017).
Характеристика генетичного рiзноманiття качок за допомогою використання молекулярних маркерiв е необхшною умовою у розвитку стратегiй нацшених на збереження та використання генетичних ресурав популяцiй (Veeramani et al., 2016). Дослщження або-ригенних порщ качок е важливим питанням для дос-
лщження генетичних ресурав птиш, тдтримки генетичного р1зномашття i покращення господарсько корисних ознак (Seo et al., 2016).
Метою роботи було дослщити полiморфiзм качок породи Shaoxing (шаосшь) за 9 мшросателггними локусами, оскшьки ця порода належить до основних яечних порщ Китаю i характеризуеться високими показниками яечно! продуктивностi. Вiк зрiлостi (початок яйцекладки) у ще! птицi настае на 130-140 день. До особливостей породи Shaoxing вщносять i те, що тковий перiод закладки яець тривае вщ восьми до десяти шсящв. У середньому одна качка за 500 дшв дае вщ 290 до 310 яець, що е одним з найвищих пока-зник1в для птицi яечних порщ (Shaoxing Ducks, 2012).
Для досягнення поставлено! мети нами були видь леш наступнi завдання:
1. Провести аналiз полiморфiзму двох популяцш качок породи шаосшь за 9 мшросателггаими ло-кусами.
2. Визначити особливосп генетичного полiмор-фiзму для дослщжених популяцiй.
3. Виявити наявшсть приватних алелiв у досль джуваних популяцiях.
Матерiал та методи дослщжень
Птицю дослщжували на качиних фермах компанш Zhejiang Generation Biological Science and Technology Co., Ltd. та Zhuji Guowei Poultry Development Co, Ltd. за тдтримки лаборатори Poultry Genetics Laboratory of the Zhejiang Academy of Sciences (Zhejiang Province, PRC).
Зразки венозно! кровi були вщбраш вщ двох популяцш качок (по 240 проб з кожно! популяци) породи шаосшь (птиця з ферми Zhejiang Generation Biological Science and Technology Co., Ltd. - популяшя I, з
Zhuji Guowei Poultry Development Co, Ltd - nonyjaiia II) b npo6ipKH, ^o MicTHjH E^TA, eMHic™ 3 mj.
MiKpocarejiTHHH aHaji3 3a 9 joKycaMH 3gincHWBajH b ja6opaTopii KoMnaHii' Genery Biotechnology. Onuc
Ta6.^H 1
Onuc npaHMepiB MiKpocarejiTHHx joKyciB
HyKjeoTHgHHx nocjigoBHocren BHKopucTaHHx gja aHa-ji3y MiKpocaTejiTiB npaHMepiB HaBegeHo y Ta6jHii 1.
№ npaHMep HyKjeoTHgHa nocjigoBHicTb npaHMepa Mothb
1 APL79 S1-F CATCCACTAGAACACAGACATT
S1-R ACATCTTTGGCATTTTGAA (TTCC)18
2 APL78 S2-F GAACACAACTGCTTTGCTA
S2-R AACCAAGACAGAATAATCCTTA (GT)9(AT)5
3 APL77 S3-F GTATGACAGCAGACACGGTAA
S3-R TCACTTGCTCTTCACTTTCTTT (GT),Q
4 CMO11 S4-F CATCTTTGGCATTTTGAAG
S4-R CTCCACTAGAACACAGACATT (GGAA)13(GGGA)15
5 SMO7 S5-F GATTCAAATTTGCCGCAGGATTA
S5-R TTTTCACCCAGTTCACTTCAGCC (GT)12
6 SM010 S6-F CATTGTTCATTGTTTCTTCTTCA
S6-R TCCTAGCGACAGCAATTCTAATG (TG)31
7 SMO11 S7-F GCAGTTGTTTTGGAGGACAGACA
S7-R AAATCAACCAAAGAGGCATAGCC (TG)12GA(G)13(AG)5
8 SMO12 S8-F TGTTCATCAAAAGCAGAGAGGGG
S8-R CCTGGTGGGATAGGTTTAAAATG (TG)9Tu
9 SMO13 S9-F GGGCTTGAGGCATACACTCCCTA
S9-R ACCATCTTCCTTTCCTCCCAACC (TG)b(AC)2(TG)2
reHeTHHHHH nojiMop$i3M MiKpocarejiTHHx joKyciB y KanoK nopogH maociHb BH3HanajH 3a gonoMorow no-Ka3HHKiB, ^o po3paxoByBajH 3a $opMyjaMH: Na - 3arajbHa KijbKicTb ajejen, Ne - e^eKTHBHi ajeji,
Ne E 1 - Ne
3a gonoMorow gaHoi $opMyjH Mo^Ha BHpaxyBaTH oiiHKy KijbKocTi nacToTH ajejen b igeajbHin nonyjaiii. ^o3Bojae npoBogHTH KopeKTHe nopiBHaHHa ajejbHoro pi3HoMaHirra joKyciB 3 pi3HHMH nacroTaMH po3nogijy ajejen.
I - iH^opManinHHH iHgeKc,
I = 2 pt ln pt
^e ln - HaTypajbHHH jorapu^M i pi -nacTOTa ajejw ,-. Hobs - cnocrepe^yBaHa reTepo3HroTHicTb,
No. Hets
H0 =-
N
KijbKicTb reTepo3uroT BH3HanaeTbca mjaxoM npaMo-ro nigpaxyHKy, ge N - po3Mip Bu6ipKH. HE -oniKyBaHa reTepo3uroTHicTb,
He = 1 -2 pi
TeHeTHHHe pi3HoMaHirra b Me^ax nonyjaiii po3pa-
i • -2 xoByerbca aK 1 MiHyc cyMa KBagpaTiB nacroT anejen pi
Hexp - o6'cKTHBHa reTepo3uroTHicTb,
UHe = -^-(1 -2 pi) 2n -1
ge pi - nacTOTa anenw i, a n - po3Mip Bu6ipKH. PIC -3MicT nojiMop^Hoi iH^opManii,
n _ n -1 n _ _
PIC -1 -2 p- - 22 2 p- p2
i=1 i=1 j = i + 1
^e n hhcjo anejen, pi HacroTa anenw i, pj nacTOTa ajenw j.
F - IHgeKc ^iKcaiii.
F = HE - Ho
He
noKa3HHKH 3arajbHoro nucja ajejiB (Na), e^eKTHB-hhx ajejiB (Ne), iH^opMaiiHHoro iHgeKcy (I), cnocre-pe^yBaHa reTepo3HroTHicTb (Hobs), oniKyBaHa reTepo-3uroTHicTb (Hexp), Ta iHgeKc ^iKcaiii (F) 6yju po3paxo-BaHi 3a BHKopucTaHHa nporpaMHoro 3a6e3neneHHa npo-rpaMH Genalex 6.5 (Peakall and Smouse, 2012). noKa3-hhk nojiMop$i3My joKyciB (PIC) 6yB po3paxoBaHHH 3a gonoMorow nporpaMH Cervus Bepcii 3.0.7 (Kalinowski et al., 2007).
Pe3y.bTaTH Ta ix oSroBopeHHH
y Ta6jHiji 2 HaBegeHi pe3yjbTam aHaji3y gBox no-nyjaiin KanoK nopogH maociHb 3a 9 MiKpocaTejiTHHMH joKycaMH.
Cepeg 9 gocjig^eHHx joKyciB y gBox nonyjaiiax KanoK, mohomop^hhm BHaBHBca jHme ogHH joKyc -SM010. KijbKicTb ajejiB (Na) y nojiMop^HHx joKycax KojHBanaca Big 2 (SMO12) go 13 (APL79, CMO11) b nonyjaiii I, i Big 2 (APL78, SMO12) go 7 (APL79) b nonyjaiii II. y cepegHboMy Ha ogHH joKyc y nonyjaiii
I npHxogHjocb 5,889 ( Big 1 go 13) ajejiB, a y nonyjaiii
II - 3,889 (Big 1 go 7) ajejiB. E^eKTHBHe hhcjo ajejiB (Ne) 6yjo 1,735 (Big 1,000 go 2,725) y nonyjaiii I Ta -1,599 ( Big 1,000 go 2,483) y nonyjaiii II.
Таблиця 2
Показники генетичного пол1морф1зму двох популяцш качок породи шаосшь
Pop Locus N Na Ne I Hobs Hexp PIC F
Pop1 APL79 240 13 2,032 1,212 0,408 0,509 0,486 0,196
Pop2 240 7 1,906 0,949 0,383 0,476 0,443 0,194
Pop1 APL78 240 4 1,083 0,201 0,079 0,077 0,076 -0,030
Pop2 240 2 1,004 0,015 0,004 0,004 0,004 -0,002
Pop1 APL77 240 4 2,725 1,111 0,563 0,634 0,560 0,111
Pop2 240 4 2,483 1,037 0,617 0,599 0,514 -0,032
Pop1 CMO11 240 13 2,102 1,259 0,438 0,525 0,503 0,165
Pop2 240 5 1,869 0,915 0,388 0,466 0,435 0,167
Pop1 SMO7 240 5 2,021 0,904 0,529 0,506 0,435 -0,048
Pop2 240 5 2,006 0,820 0,492 0,502 0,407 0,019
Pop1 SM010 240 1 1,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000
Pop2 240 1 1,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000
Pop1 SMO11 240 8 2,456 1,220 0,558 0,594 0,546 0,058
Pop2 240 6 1,764 0,885 0,446 0,434 0,404 -0,030
Pop1 SMO12 240 2 1,096 0,186 0,067 0,088 0,084 0,238
Pop2 240 2 1,047 0,109 0,046 0,045 0,044 -0,023
Pop1 SMO13 240 3 1,102 0,223 0,038 0,092 0,090 0,594
Pop2 240 3 1,309 0,450 0,042 0,236 0,216 0,823
Примтка: Na - число алелш у локуа, Ne - ефективт алел^ I - шформацшний шдекс, Hobs - фактична гетерозиготтсть, Hexp - очжувана гетерозиготтсть, F - шдекс фжсаци, PIC - шдекс жшморфност локусу.
Шформацшний 1ндекс (I) у середньому був 0,702 у популяци I та 0,576 у популяци II. Фактична гетерозиготтсть (Hobs) у популяци I була - 0,298 ( вщ 0,038 до 0,563), а у популяци II цей показник становив 0,269 (вщ 0,004 до 0,617).
Очшувана гетерозиготтсть (Hexp) у популяци I була 0,336 ( вщ 0,077 до 0,634), а у популяци II - 0,307 ( вщ 0,004 до 0,599).
!ндекс фшсацп Райта (F) свщчить про незначний надлишок гетерозигот за локусами у популяци I (APL78, SMO7) та у популяци 2 (APL77, APL78, SMO11, SMO12). У середньому по популяци I !ндекс фшсацп Райта становив 0,161 (вщ 0,048 до 0,594) , а у популяци II - 0,139 ( вщ -0,032 до 0,823).
Вщповщно до даних отриманих Yinhua H. (2005) з дослщжуваних 35 праймер1в у пекшсько! качки, 28 локуав були пол1морфними, а 7 мономорфними. У цшому спостерпали 117 алелей. Частоти цих алел1в варшвали вщ 0,02 до 0,98. Пол1морф1зм шформацш-ного зм1сту (PIC) за 28 локусами варшвав вщ 0,004 до 0,88 (0,42 в середньому) (Yinhua et al., 2005).
Коршт породи качок мають важливе значення з точки зору генетичного р1зномашття i потенцшно цшних господарських ознак. Дослiдження 24 мшроса-телiтних локусiв показав, що полiморфiзм шформа-цiйного змiсту (PIC) становив 0,584. Ва маркери були полiморфнi. Серед 24 мiкросателiтних локуав число алелiв варiювало вщ 3 до 29 (9,38 середне значення). Показники Hops та Hexp становили 0,492 та 0,623, вщповщно (Seo et al., 2016).
Дослщження 9 мшросателгтних локусiв у пекшсько! та мускусно! порщ качок показали, що 3 маркери були мономорфними i 6 полiморфними. Спостережу-ване число алелiв у кожному локуа варшвало вiд 1 до 4. Число ефективних алелiв коливалось вщ 1 до 3,78. Маркери SMO1 i SMO12 не були амплiфiкованi нi в однш з дослщжуваних популяцiй. Маркери SMO7, SMO8 i SMO13 були мономорфними для обох популяцш. Показник загально! гетерозиготностi для пекшсько! породи качок становив 0,53, а для мускусно! 0,44 (Khan Ahmadi et al., 2007).
Дослщження 15 мшросателгтних локуав у породи шаосшь у мюп Чуцзi показало, що середне число алелiв становило 5,93, а у пекшсько! породи 5,73. Очшувана та спостережувана гетерозиготтсть була 0,5609 та 0,4691 вщповщно. Полiморфiзм шформа-цшного змiсту (PIC) становив 0,5540 (Qu et al., 2009).
Вщповщно до даних отриманих Li Hui-Fang у качок породи шаосшь знайшли 177 алелв. Ва досл-дженi мiкросателiтнi локуси були полiморфнi, серед-нiй PIC становив 0,634. Кшьюстъ алелiв на локус коливалась вiд 3 (APH11, APH14 and APL82) до 10 (APL80, CMO11 та CMO12), а середне число алелiв на локус становило 6,1. Для кожного маркеру були дос-лщжеш спостережувана та очшувана гетерозиготтсть. Локус APH07 мав найнижчу очшувану гетерозиготтсть 0.144, а локус CMO12 показав найвищу -0,867 (Hui-Fang et al., 2010).
Таблиця 3
Середш показники статистично! вар1абельност1 популяцш качок породи шаосшь
Pop N Na Ne I Hobs Hexp PIC F
Pop1 Mean 240 5,889 1,735 0,702 0,298 0,336 0,308 0,161
SE 0,000 1,495 0,223 0,178 0,082 0,087 0,081 0,068
Pop2 Mean 240 3,889 1,599 0,576 0,269 0,307 0,274 0,139
SE 0,000 0,676 0,177 0,144 0,081 0,079 0,072 0,097
Total Mean 240 4,889 1,667 0,639 0,283 0,322 0,291 0,150
SE 0,000 0,832 0,139 0,112 0,056 0,057 0,053 0,057
Таблиця 4
Приватш алелi популяцш качок породи шаосшь
Локус Алелi 1 2 3 4 5 6 7 8 9
Популящя 1
CMO11 9 220 224 260 264 268 272 276 280 284
APL79 8 219 223 258 262 265 273 277 281
APL78 2 211 218
SMO11 2 182 208
SMO7 1 188
SM010 1 96
Популящя 2
APL79 2 243 261
CMO11 1 244
SMO7 1 180
SMO10 1 94
Вщповщно до дослщжень Tao Zheng-Rong (2016), 11 мшросателгтних локуав були проанал1зоваш у 7 порщ качок. У породи шаосшь в результат! анал1зу було знайдено всього в середньому ефективних алел1в 12,821, середня оч1кувана гетерозиготтсть становила 0,856, показник (PIC) був 0,845. Ва локуси були по-м1рно або високопол1морфними i виявилися придат-ними для оцшки генетично! рiзноманiтностi качок. Висока генетична рiзноманiтнiсть була виявлена у 7 популящях, а ïx PIC становив вщ 0,310 до 0,960. F-статистичний аналiз показав, що F уах дiлянок склав вщ 0,047 до 0,499, середнiй F становив 0,171, що свщчить про значну велику генетичну рiзницю мгж попу-ляцiями (Fisinin et al., 2017).
У результата нашого дослщження для кожно! популяци були виявленi приватнi алелi. З 9 дослщжених локусiв, у популяци I було виявлено 6 приватних алелiв, в той час, коли популящя II мала лише 4 локуси. Загалом у популяци I виявлено 23 приватних але-лiв а у популяци II - 5 (таблиця 4). Найбшьша кшь-шсть приватних алелiв була в локуа CMO11 (9), а найменша - 1 алель у локуа SMO7 та SM010 в популяци I. Популящя II була бщшша на приватш алел^ так у локуа APL79 було 2 та по 1 у CMO11, SMO7, SM010.
Висновки
Таким чином, в результата проведеного аналiзу генетичного полiморфiзму двох популяцш шдтвердився його високий рiвень використаних нами мшросателгт-них локусiв у качок породи шаосшь.
Показники фактично! гетерозиготшста коливалась вщ 0,225 до 0,825 у популяци I та вщ 0,367 до 0,804 у популяци II. У ходi дослщження були виявлеш приватш алелi для обох популяцш, що вказуе на вщокрем-лешсть цих популяцш i, як результат, можливiсть створення окремих лiнiй з метою !х подальшого використання для селекци.
Вдячностг. This study was supported by the Earmarked Fund for National Waterfowl-industry Technology Research System (CARS-42-06) and the Zhejiang Major Scientific and Technological Project of Agricultural (livestock's) Breeding (grant number 2016C02054-12).
References
Ren, J., Du, X., Zeng, T., Chen, L., Shen, J., Lu, L., & Hu, J. (2017). Divergently expressed gene identification and interaction prediction of long noncoding RNA and mRNA involved in duck reproduction. Animal Reproduction Science. 185, 8-17. doi: 10.1016/ j.anireprosci.2017.07.012.
HayKOBHH bîchhk .nHYBME iMeHi C.3. I^H^KOTO, 2018, T 20, № 84
Huang, Y., Li, Y., Burt, D.W., Chen, H., Zhang, Y. et al. (2013). The duck genome and transcriptome provide insight into an avian influenza virus reservoir species. Nature GeNetics. 45(7), 776-783. doi: 10.1038/ ng.2657.
Purwantini, D., Yuwanta, T., Hartatik, T., & Ismoyowati (2013). Polymorphism of D-Loop Mitochondrial DNA Region and Phylogenetic in Five Indonesian Native Duck Population. International Journal of Poultry Science. 12(1), 55-63. doi: 10.3923/ijps.2013.55.63. "
Zhao, N.N., Lin, S., Wang, Z.Q., & Zhang, T.J. (2015). VLDLR gene polymorphism associated with abdominal fat in Gaoyou domestic duck breed. J. Anim. Sci. 60(4), 178-184. doi: 10.17221/8132-CJAS.
Zeng, T., Chen, L., Du, X., Lai, S.J., Huang, S.P., Liu, Y.L., & Lu, L.Z. (2016). Association analysis between feed efficiency studies and expression of hypothalamic neuropeptide genes in laying ducks. Stichting International Foundation for Animal Genetics. 47(5), 606-609. doi: 10.1111/age.12457.
Tunca, R.I., Taskin, A., & Buyuk, M. (2015). Genetic Analyses of Some Central Anatolian Domestic Duck Populations with Inter Simple Sequence Repeat (ISSR): A Preliminary Study. Pakistan J. Zool. 47(6), 1709-1714. http://zsp.com.pk/pdf47/1709-
1714%20(27)%20QPJZ-0205-2015%204-9-15%202_revised.pdf.
FAO (2015). FOOD AND AGRICULTURE ORGANIZATION OF THE UNITED NATIONS. http://faostat.fao.org/site/573/default.aspx#ancor
Seo, D., Bhuiyan, M.S.A., Sultana, H., Heo, J.M., & Lee, J.H. (2016). Genetic Diversity Analysis of South and East Asian Duck Populations Using Highly Polymorphic Microsatellite Markers. Asian Australas. J. Anim. Sci. 29(4), 471-478. doi: 10.5713/ ajas.15.0915.
Klenovickij, P.M., Volkova, L.A., Volkova, N.A., Larionova, P.V., Zinov'eva, N.A., & Nikishov, A.A. (2016). Citogeneticheskaja harakteristika muskusnoj utki (CAIRINA MOSCHATA L.). Vestnik RUDN. Agronomija i zhivotnovodstvo. 1, 52-60 (in Russian).
Hlestkina, E.K. (2013). Molekuljarnye markery v geneticheskih issledovanijah i v selekcii. Vavilovskij zhurnal genetiki i selekcii. 17(4/2), 1044-1054 (in Russian).
Tao, Z.-R., Xu, X.-Q., Shen, J.-D., Li, L., Zeng, T., Du, X., Dong, S.-H., & Lu, L.-Z (2016). Analysis of Genetic Diversity and Relationship Among 6 Wild Duck breeds and Shaoxing Partridge Duck (Anas platyrhynchos domestic). Journal of Agricultural
Biotechnology. 24(8), 1173-1180. doi: 10.3969/j.issn.1674-7968.2016.08.008.
Fisinin, V.I., Selionov, M.I., Shinkarenko, L.A., Shherbakova, N.G., & Kononova, L.V. (2017). Issledovanie mikrosatellitnyh lokusov v porodah indeek rossijskoj selekcii. Sel'skohozjajstvennaja biologija. 52, 739-748. doi:
10.15389/agrobiology.2017.4.739rus (in Russian).
Veeramani, P., Prabakaran, R., Sivaselvam, S.N., Sivakumar, T., Selvan, S.T., & Karthickeyan, S.M.K. (2016). Phylogenetic analysis of six duck populations. Indian J. Anim. Res. 50(4), 626-628. doi:10.18805/ ijar.9301.
Shaoxing Ducks (2012). Zhuji: Zhuji Quality and Technique Supervision Bureau. (National Standard of China). [S]: DB 33068/T 02.1.- P.40.
Peakall, R., & Smouse, P.E. (2012). GenAlEx 6.5: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research - an update. Bioinformatics. 28, 2537-2539. doi: 10.1093/bioinformatics/bts460.
Kalinowski, S.T., Taper, M.L., & Marshall, T.C. (2007). Revising how the computer program CERVUS accommodates genotyping error increases success in paternity assignment. Molecular Ecology. 16, 10991106. doi: 10.1111/j.1365-294X.2007.03089.x.
Yinhua, H., Jianfeng, T., Xuebo, C., Bo, T., Xiaoxiang, H., Zhaoliang, L., Jidong, F., Yankun, L., Li, L., Ke, X., Yulong, Z., & Ning, L. (2005). Characterization of 35 novel microsatellite DNA markers from the duck (Anas platyrhynchos) genome and cross-amplification in other birds. Genet. Sel. E. 37, 455-472. doi: 10.1186/1297-9686-37-5-455.
Khan Ahmadi, A., Rahimi, G., Vafaei, A., & Sayyazadeh, H. (2007). Microsatellite Analysis of Genetic Diversity in Pekin (Anas platyrhynchos) and Muscovy (Cairina moschata) Duck Populations. International Journal of Poultry Science. 6(5), 378-382. doi:10.3923/ijps.2007.378.382.
Qu, L.J., Liu, W., Yang, F.X., Hou, Z.C., Zheng, J.X., Xu, G.Y. & Yang, N. (2009). Origin and domestication history of Peking ducks deltermined through microsatellite and mitochondrial marker analysis. Sci China Ser C-Life Sci.- Nov. 52(11), 1030-1035. doi: 10.1007/s11427-009-0145-x.
Hui-Fang, L., Wei-Tao, S., Jing-Ting, S., Kuan-Wei, C., Wen-Qi, Z., Wei, H., & Wen-Juan, X. (2010). Genetic diversity and population structure of 10 Chinese indigenous egg-type duck breeds assessed by microsatellite polymorphism. Journal of Genetics. 89(1), 65-72. doi: 10.1007/s12041-010-0012-3.
