CC BY
2114. Sato H., Frank D.W ExoU is a potent intracellular phospholipase. Mol. Microbiol. 2004, 53: 1279-1290.
15. Wolska K., Szweda P. Genetic features of clinical Pseudomonas aeruginosa strains. Pol. J. Microbiol. 2009, 58 (3): 255-260.
Поступила 13.10.13 С переработки 27.04.14
Контактная информация: Кузнецова М.В., 614000, Пермь, ул. Ленина, 11, р.т. 212-44-76
© КОЛЛЕКТИВ АВТОРОВ, 2014
Г.И.Алешкин, О.И.Смелкова, Н.В.Тимакова, О.Ю.Добрынина, А.М.Умяров, О.Ю.Русина, А.П.Марков, Т.Н.Большакова
РОЛЬ ЛИЗОГЕНИИ ФАГА L07 В ГЕНЕТИЧЕСКОЙ ИЗМЕНЧИВОСТИ ESCHERICHIA COLI
НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Н.Ф.Гамалеи, Москва
Цель. Определить возможность лизогенизации Escherichia coli однонитевой ДНК (онДНК)-бактериофагом 107 из семейства Microviridae и установить роль лизогении фага 107 в генетической изменчивости этих бактерий. Материалы и методы. Разработана методика лизогенизации E.coli K12 фагом 107. Отработан спот-тест для проверки резистентности полученных лизогенов к фагу 1е7 и определения спонтанной продукции 1е7 лизо-генами. Предложены критерии идентификации фага 107, спонтанно продуцируемого лизогенами E. co1i K12. Сконструирован набор изогенных штаммов E. co1i, отличающихся мутациями в генах ptsI, ptsH и fruA, кодирующих белки фосфоенолпируват (ФЕП):углевод фосфотрансферазной системы (ФТС). Результаты. Показана способность высоковирулентного бактериофага 1е7 к лизогенизации E.co1i. Продемонстрировано снижение титров 107 на мутантах ptsI, ptsH и fruA E. co1i K12, по сравнению с титрами на бактериях дикого типа. При этом установлено, что литический бактериофаг 107 способен с повышенной частотой лизогенизировать мутанты ptsI, ptsH и fruA. Лизогены резистентны к фагам 107, phiX174 рода Microvirus и спонтанно продуцируют 107. Заключение. Бактериофаг 107 из семейства Microviridae способен к лизогенизации E. co1i K12 и вертикальному переносу генома этого литического фага. В результате литический фаг 107 участвует в бактериальной изменчивости как фактор отбора лизогенов в популяции бактерий, соответствующих по фенотипу мутантам ФТС.
Журн.микробиол., 2014, № 6, С. 14—20
Ключевые слова: онДНК-бактериофаг 107, семейство Microviridae, лизогения, Escherichia co1i, фосфоенолпируват:углевод фосфотрансферазная система, мутанты fruA, ptsH, ptsI, генетическая изменчивость
G.I.Aleshkin, O.I.Smelkova, N.V.Timakova, O.Yu.Dobrynina, A.M.Umyarov, O.Yu.Rusina, A.P.Markov, T.N.Bolshakova
ROLE OF PHAGE L07 LYSOGENY IN GENETIC VARIABILITY OF ESCHERICHIA COLI
Gama1eya Research Institute of Epidemio1ogy and Microbio1ogy, Moscow, Russia
Aim. Determine the possibi1ity of1ysogenization of Escherichia coli sing1e strain DNA (ssDNA) by 107 bacteriophage from the Microviridae fami1y and determine the ro1e of phage 107 1ysogeny in genetic variabi1ity of these bacteria. Materials and methods. A method of E. coli K12 1ysogeniza-tion by phage 107 was deve1oped. A spot-test for the contro1 of resistance of the obtained 1ysogens against phage 107 and determination of 1ysogen 107 spontaneous production was worked out. Criteria for phage 107 identification, that is spontaneous1y produced by E. coli K12 1ysogens, were
proposed. A kit of isogenic E. coli strains, that vary by mutations in ptsI, ptsH and fruA genes, that code phosphoenolpyruvate (PEP):carbohydrate phosphotransferase system (PTS) proteins, was constructed. Results. The ability of highly virulent bacteriophage le7 to lysogenize E. coli was shown. A reduction of le7 titers in ptsI, ptsH and fruA E. coli K12 mutants was demonstrated compared with titers in wild-type bacteria. Lytic bacteriophage le7 was also able to lysogenize ptsI, ptsH and fruA mutants at a high frequency. Lysogens are resistant to phages le7, phiX174 of Microvirusgenus and spontaneously produce le7. Conclusion. Bacteriophage le7 ofthe Microviridae family is able to lysogenize E. coli K12 and vertically transfer genome of this lytic phage. As a result, lytic phage le7 takes part in bacterial variability as a factor of lysogen selection in bacteria population corresponding to PTS mutants by phenotype.
Zh. Mikrobiol. (Moscow), 2014, No. 6, P. 14-20
Key words: ssDNA bacteriophage le7, Microviridae family, lysogeny, Escherichia coli, phosphoenolpyruvate:carbohydrate phosphotransferase system, fruA, ptsH, ptsI mutants, genetic variability
ВВЕДЕНИЕ
Взаимодействие бактериофагов с бактериями-хозяевами является мощным фактором генетической изменчивости бактерий, играющим значительную роль, в частности, в модификации свойств патогенности бактерий и их эволюции. Такого рода изменчивость бактерий связана, прежде всего, с процессами лизогении и лизогенной конверсии и зависящими от них процессами геномных перестроек, формирования и передачи островов патогенности, приводящими к получению бактериями новых генов и свойств [1, 4, 5]. С лизогенией и лизогенной конверсией связаны изменения таких факторов патогенности бактерий, как токсины, адгезины, инвазины, системы секреции, транспорта железа [1, 4, 5, 8, 10,]. Необходимыми условиями для этих процессов являются горизонтальная (от бактерии к бактерии) и вертикальная (от бактерии к ее потомству) передача фаговых геномов [4, 5]. Среди вирусов с однонитевыми ДНК-геномами (онДНК), преобладающих в окружающей человека среде, наиболее распространены онДНК-бактериофаги семейства Microviridae [14]. Они инфицируют энтеробактерии родов Escherichia, Shigella, Salmonella, бактероиды рода Bacteroides [12], а также облигатные паразитические бактерии рода Chlamydia [6]. Эти особенности фагов Microviridae стимулируют интерес к их потенциальной роли в изменчивости бактерий. Однако фаги Microviridae до настоящего времени считаются строго литическими, то есть не способными к лизогенизации бактерий-хозяев, что ограничивает возможность их участия в генетической изменчивости бактерий [13]. В то же время, при геномном анализе представителей семейства Chlamydia, а также рода Bacteroides были выявлены участки гомологии хромосомной ДНК этих микроорганизмов с ДНК провирусов Microviridae [6, 12]. Эти данные позволяли предполагать возможность лизогении фагов Microviridae в бактериях-хозяевах. Для онДНК-бактериофага возможность лизогенизации бактерии-хозяина и лизогенной конверсии была показана на примере бактериофага CTX0 из семейства Inoviridae [8]. В основе этих процессов лежит встраивание фаговой ДНК в хромосомную ДНК и репликации в ее составе [11, 15, 17]. Следует отметить, что репликация онДНК-бактериофага phiX174 Microviridae также может зависеть от репликации хромосомной ДНК бактерии-хозяина E. coli , а не только от фаговых белков инициации репликации [4, 16]. Фаг phiX174 и аналогичный ему по свойствам фаг l07 являются типичными бактериофагами из рода Microvirus семейства Microviridae [7]. Совокупность приведенных данных позволяет предполагать, что существует вероятность лизогении фагов l07 и phiX174, считающихся строго литическими, в бактериях-хозяевах E. coli. Это предположение допускает существование условий в клетках E.coli, оптимальных для потенциальной лизогении фага l07.
Цель настоящей работы состояла в выявлении возможности лизогенизации бактерий E. coli онДНК-бактериофагом 107 из семейства Microviridae и установлении роли такой лизогении в генетической изменчивости этих бактерий.
МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
В работе использовали генетически маркированные штаммы бактерий Escherichia coli K12, Salmonella enterica Typhimurium LT2 и бактериофаги 107, phiX174 рода Microvirus семейства Microviridae, инфицирующие энтеробактерии [3, 15], характеристики которых приведены в табл. 1. В качестве пермиссивных хозяев для фагов в данной работе служили изогенные штаммы E. coli К12, производные штамма GA120 [3] и штамма LBG1623 [2], а непермиссивного хозяина — штамм S. enterica Typhimurium LT2 AG239 [3].
Состав сред, процедуры выращивания бактерий, проверка генетических маркеров бактериальных культур (ауксотрофности и резистентности к антибиотикам) описаны у [Davis R.V et al., 1980]. Конструирование набора изогенных штаммов E.coli, отличающихся мутациями в генах ptsI и ptsH, кодирующих общие компоненты ФЕП:угле-вод фосфотрансферазной системы (ФТС) (фермент I и белок HPr), и в гене fruA фруктозоспецифического компонента ФТС (фермента IICfru) [2, 9], проведено в ходе данной работы. Использовали методику трансдукции бактериофагом Р1 генов ptsI:: kan, ptsH::cam, fruA tet в штамм дикого типа GA120 [Davis R.V. et al., 1980]. Штаммы-доноры мутаций BW25141 ptsI::Kan и BW25141 ptsH::Cam предоставлены нам доктором К.Даценко. Фенотипы мутантов по компонентам ФТС определяли по способности сбраживать углеводы на чашках с индикаторной средой ЭМС и 1% углевода [Davis R.V. et al., 1980].
Размножение и титрование бактериофагов l07, phiX174 проводили по стандартным методикам в модификации [16]. Размножение и титрование фагов проводили в 5 мл стандартного 0,5% L-агара в чашках Петри с диаметром 9 см [Davis R.V. et al., 1980].
Клоны культур E.coli K12, потенциальных лизогенов, несущих профаг l07, отбирали как резистентные к фагу из зон лизиса культур бактериофагом !э7. На 1,5% L-агаре [Davis R.V. et al., 1980] четырехкратно расчищались штрихом: (а) клоны из центров бляшек 1э7 на чувствительных к фагу бактериальных культурах; (б) клоны, выросшие на лизированных фагом l07 культурах бактерий на поверхности 0,5% L-агара [Davis R.V. et al., 1980]. Частоты резистентных к !э7 клонов, потенциальных лизогенов, определяли как отношение количества резистентных клонов в 1 мл 18-часовой культуры, лизированной фагом, к Таблица 1. Штаммы бактерий и бактериофаги, исполь- количеству засеваемых клеток з°ванные в работе бактериальной культуры в 1 мл
среды.
Проверку резистентности мутантов к бактериофагу 1э7 проводили полуколичественным спот-тестом. При этом суспендированные в физиологическом растворе клоны раскапывали на поверхность 0,5% L-агара, на которой предварительно высушивали 0,5 мл физиологического раствора, содержащего 2,5 х 107 фаговых частиц l07, и инкубировали в течение 18 час при 37°C. Резистентные к фагу клоны, включая клон контрольного штамма AG239 (контроль рези-
Бактерии и бактерифаги
E. coli K12
GA120
GA1201
GA1202
GA1203
LBG1623
LBG1657
LBG1605 LBG1103
S.enterica Typh. LT2 AG239 Бактериофаг ki7 Бактериофаг phiX174
Примечание. д.р.
trp ki7s phiX174s trp ki7s phiX174s fruA tet trp ki7s phiX174s ptsH::cam trp ki7s phiX174s ptsI::kan trp ade ilv k>7s phiX174s trp ade ilv k>7s phiX174s fruA tet
trp ilv ki7s phiX174s ptsH5 trp ilv l07s phiX174s ptsI trp l07R phiX174R Лизирует E.coli K12, B, C Мутант K1, лизирующий E.coli K12
- данная работа.
[3] д.р. д.р. д.р. [2] [2]
[2] [2]
[3] [3] [3]
стентности к 1э7), давали рост на поверхности агара, в отличие от контрольных клонов штаммов GA120, GA1203 (контроль чувствительности к 1э7), которые полностью лизировались фагом.
Спонтанную продукцию бактериофага в потенциальных лизогенах 107 также проверяли спот-тестом. Ресуспендированные в физиологическом растворе клоны, резистентные к 107, раскапывали на поверхность 0,5% L-агара. После высыхания на каждый клон наслаивали суспензию чувствительной к фагу 107 индикаторной культуры GA120 в 0,5% L-агаре и инкубировали 18 час при 37°C. Лизогены определяли по зоне лизиса индикаторной культуры.
Частоту продукции бактериофага у отобранных клонов определяли как отношение количества фаговых частиц в 1 мл 18-часовой культуры клона в L-бульоне к количеству бактерий-лизогенов в 1 мл 18-часовой культуры.
Идентификацию бактериофага 107, спонтанно продуцируемого отобранными клонами штаммов E. coli K12, проводили путем контроля морфологии бляшек фага, титрования фага на культурах пермиссивных и непермиссивных хозяев и проверки одноударной кинетики инактивации бактериофага УФ-светом [11, 15].
Все результаты представляют собой статистически обработанные данные 3 — 5 экспериментов. Математическая и статистическая обработка результатов проведена с использованием пакета Study WKS v.4.5.
РЕЗУЛ ЬТАТЫ
Бактериофаг 107 титруется на культуре GA120, давая крупные прозрачные бляшки (негативные колонии) одинаковой морфологии. Диаметр бляшек при оптимальном разведении фага (около 100 бляшек на чашку Петри) составляет 4 — 6 мм. Как оказалось, также эффективно фаг 107 размножается в штамме LBG1623. Далее была предпринята попытка поиска возможно лизогенных по фагу 107 культур. Для этого из центра фаговых бляшек на газоне штаммов дикого типа GA120 и LBG1623 были отобраны клоны, резистентные к фагу 107. Отдельные колонии отобранных клонов после четырехкратной очистки на 1,5% питательном агаре были подвергнуты анализу их свойств — резистентность к фагу 107, наличие генетических маркеров. Всего было расчищено из бляшек и проверено 84 клона. Проверка резистентности клонов к бактериофагу 107, проведенная полуколичественным спот-тестом, показала, что все отобранные клоны резистентны к бактериофагу. Как оказалось, они все были резистентны и к бактериофагу phiX174, аналогичному по характеристикам фагу 107 и также относящемуся к роду Microvirus [13, 15]. При этом все клоны сохраняли генетические маркеры штамма E.co1i К12. Двадцать девять процентов резистентных к 107 клонов, выделенных из бляшек фага на штамме GA120, продуцируют бактериофаг. Частота спонтанной продукции фага составила от 3,1x10-6 до 2,5x10-4 фаговых частиц на бактериальную клетку. По морфологии бляшек продуцируемый бактериофаг был аналогичен фагу 107. Специфичность заражения бактерий-хозяев этим фагом также
Таблица 2. Фенотипы клонов E.coli, резистентных к бактериофагу 107
Штаммы E.co1i K12 Частота клонов, резистентных к 107, на зараженную фагом клетку Фенотипы клонов, резистентных к 107*
Название Генотип Множественность заражения >2,0 Множественность заражения <0,05 Фенотип Частота возникновения, абс.(%)
GA120 pts+ 0,21х10-5 1,9х10-5 Pts+: G1u+Fru+Lac+ PtsI: G1u- Fru- Lac-FruA: G1u+ Fru- Lac+ 60 (71) 18 (21) 6 (7)
GA1201 fruA 2,4х10-5 4,9х10-5 FruA: G1u+ Fru- Lac+ 84 (100)
GA1202 ptsH 4,2х10-5 8,8х10-5 PtsH: G1u- Fru+ Lac- 84 (100)
GA1203 ptsI 3,6х10-5 8,2х10-5 Ptsl: G1u- Fru- Lac- 84 (100)
Примечание. *Для каждого штамма проверено по 84 клона.
2. ЖМЭИ 6 № 34
17
Штаммы E.co1i Эффективность размножения фага, титр фаговых частиц/мл (%) Частота клонов, резистентных к 107, на бляшку фага Частота спонтанных продуцентов 107 на клон, резистентный к фагу*
Название Генотип
GA120 pts+ 1,2х109 (100) 4/96 (4,1) 7/24 (29)
GA1201 fruA 0,57х109(48) 46/96(48) 46/46 (100)
GA1202 ptsH 0,61х109(50) 32/96(33) 31/32 (97)
GA1203 ptsI 0,60х109(50) 36/96(38) 33/36 (92)
Примечание. *Количество фаговых частиц в расчете на бактериальную клетку, резистентную к фагу 107, составляло от 3,1х10-6 до 2,5х10-4, независимо от фенотипа клетки.
совпадала со специфично- Таблица 3. Эффективность размножения и лизогенизации бак-
стью заражения фагом 107. териофага107 ва im— E.coll m дикого тшт и
_ мутантах fruA, ptsH и ptsI
Одноударная кинетика инактивации УФ-светом продуцируемого бактериофага соответствовала кинетике инактивации фагов I07, phiX174 и других онДНК-бактерио-фагов рода Microvirus [15]. На основе полученных результатов можно предположить, что отобранные клоны, резистентные к фагу к l07, проявляют свойства лизогенов, несущих 107 в качестве про-фага. Как видно из данных табл. 2, частота отбора этих лизогенов зависят от множественности заражения бактериальных культур фагом 107. Частота снижается при множественности заражения фагом 107 более 2,0 по сравнению с множественностью менее 0,05. Этот феномен может быть связан с особенностями лизиса клеток и феномена лизогении в клетках E. coli К12 при заражении бактерий литическим фагом 107.
Проверка предположительно лизогенных клонов, выделенных при заражении фагом 107 штамма GA120, выявила три фенотипа, различающихся по способности сбраживать углеводы при росте на индикаторной среде ЭМС (табл. 2): 71% резистентных к фагу 107 клонов были способны сбраживать глюкозу, фруктозу и лактозу, что соответствовало исходному фенотипу штамма GA120; 21% отобранных клонов не утилизировал вышеуказанные углеводы, образуя неокрашенные колонии на среде ЭМС. Таким фенотипом обладают мутанты ptsI E.co1i, с повреждённым ферментом I фософотрансферазной системы [2, 9]. Восемь процентов отобранных клонов не сбраживали только фруктозу. Это могло указывать на поражение фруктозоспецифичных компонентов ФТС [2, 9].
Таким образом, можно предположить, что селекция клонов E. co1i К12, резистентных к эффективному лизису фагом 107, приводит к отбору лизогенов, несущих профаг 107 и одновременно демонстрирующих фенотип, характерный для мутантов с поражением компонентов ФТС. Появление такого рода фенотипов среди потенциальных лизогенов E.co1i по фагу 107 позволило высказать предположение о том, что мутационное повреждение компонентов ФТС может давать преимущество лизогенным клеткам кишечной палочки при заражении популяции бактериофагом. С целью проверки этого предположения были сконструированы изогенные штаммы E.co1i, несущие мутации в генах ptsI и ptsH, кодирующих общие компоненты ФТС (фермент I и белок HPr, соответственно) и в гене fruA — фруктозоспецифичного компонента ФТС (фермент IIfru). На полученных изогенных штаммах, производных GA120, были проведены опыты по размножению фага 107. Оказалось, что бактериофаг 107 титруется на культурах GA120, несущих мутационные повреждения компонентов ФТС, давая крупные прозрачные бляшки одинаковой морфологии на штамме дикого типа и мутантных штаммах. В то же время, наблюдалось почти двукратное снижение эффективности титрования бактериофага 107 на клетках с мутациями fruA , ptsI и ptsH по сравнению с эффективностью титрования на штамме дикого типа GA120 (табл. 3).
Аналогичная закономерность снижения эффективности титрования наблюдается на штаммах E. co1i К12, производных LBG1623 — LBG1605 и LBG1103 , несущих точковые мутации в генах, кодирующих белки ФТС. Среди клонов, резистентных к фагу 107, более 85% продуцируют бактериофаг. При этом частота продукции фаговых
частиц в расчете на бактериальную клетку, резистентную к фагу 107, составляла от 2,1x10-7 до 5,5x10-4 фаговых частиц. Она сравнима с частототой продукции фага 107 лизогенами, отобранными из бляшек фага на культурах E. co1i К12 GA120 и изоген-ных pts-штаммах. По всем критериям проверки бактериофага продуцируемый фаг аналогичен фагу 107. Таким образом, клоны, резистентные к фагу 107, отбираемые при лизисе фагом популяции pts-мутантов E. co1i К12, также проявляют свойства лизоге-нов, несущих 107 в качестве профага. Частота отбора этих клонов также зависит от множественности заражения бактериальных культур фагом 107. Как и в случае дикого типа, частота снижается при множественности заражения фагом 107 более 2,0, по сравнению с множественностью менее 0,05.
ОБСУЖДЕНИЕ
Результаты представленной работы свидетельствуют о том, что строго литический бактериофаг с однонитевой ДНК 107 способен лизогенизировать кишечную палочку. Более того, бактериальные клоны, получающие лизогенные свойства, оказываются резистентными не только к фагу 107, но и к похожему фагу phiX174 из того же рода Microvirus. Это дает основание предполагать, что геномы этих фагов могут встраиваться в общий для них сайт в ДНК хромосомы хозяина при лизогении, препятствуя повторному заражению фагами 107 и phiX174. Бактериальные клоны, обладавшие свойствами лизогенов, были способны продуцировать бактериофаг по характеристикам, а именно: морфологии бляшек, специфичности заражения фагом бактерий-хозяев, одноударной кривой инактивации УФ-светом, не отличающийся от исходного фага 107. Следовательно, считавшийся строго литическим фаг 107 из рода Microvirus не только способен к лизогении в E. co1i, но и сохраняет в процессе вертикальной передачи в лизогенах свои литические свойства.
Возникновение клонов E.co1i, обладающих свойствами лизогенов по фагу 107, сопровождалось появлением фенотипов, характерных для мутантов с нарушениями общих и специфических компонентов ФТС. Можно предположить, что массированное заражение клеток дикого типа высоковирулентным бактериофагом способствует отбору в популяции спонтанных мутантов с повреждениями белков ФТС.
Обнаруженное нами двукратное снижение титра фага при его размножении на культурах мутантов fruA, ptsH и ptsI, по сравнению с титрами, полученными на клетках дикого типа E. co1i, давало основание предположить, что инфекция мутантов каждой второй фаговой частицей не приводит к их лизису, а вполне вероятно, заканчивается лизогенизацией бактерий. Из каждой второй-третьей бляшки фага на газонах мутантов выделены клоны мутантов, не только резистентные к бактериофагу 107, но и спонтанно продуцирующие бактериофаг.
Учитывая это, мы заключаем, что в лизогении 107 у E. co1i К12 решающую роль играют мутации в геноме бактерии-хозяина. Механизм лизогении фага 107 в E. co1i остается не изученным. В качестве модели для механизма лизогении 107 представляется вероятным встраивание онДНК-фага в хромосому бактерии-хозяина, зависящее от активности бактериальных XerC и XerD рекомбиназ. Такая модель описана для лизогении онДНК-бактериофагов CTX0 из семейства Inoviridae [8]. Интеграция онДНК в хромосому описана также для однонитевой транспозиции ДНК. В обоих случаях интеграция происходит в сайты терминации репликации ДНК хромосомы [6, 8, 15].
Обнаруженная повышенная в 10 — 20 раз эффективность лизогении фагом 107 в мутантах E. co1i К12 с нарушениями компонентов ФТС может свидетельствовать о том, что ФТС у бактерий влияет на прохождение литического цикла онДНК-бактериофага. Подтверждает это предположение факт появления среди лизогенов E. co1i К12, выделенных из дикого типа бактерий, обладающих фенотипом, характерным для таких мутантов.
Таким образом, на примере высоковирулентного бактериофага 107 показана воз-
можность лизогенизации, которая оказывается более эффективной при нарушении в клетках-хозяевах компонентов ФТС. Отсюда следует, что действие бактериофагов с онДНК на бактерии может служить фактором селективного давления в популяции. Подобный отбор спонтанных ФТС мутантов в популяции может приводить к изменению многих клеточных функций, контролируемых ФТС системой [1, 2, 9]. Таким образом, установленная нами лизогения фага l07 в E. coli К12 демонстрирует возможность вклада этого фага семейства Microviridae в генетическую изменчивость E. coli.
ЛИТЕРАТУРА
1. Бондаренко В.М. «Острова» патогенности бактерий. Журн. микробиол. 2001, 4: 6774.
2. Добрынина О.Ю., Умяров А.М., Марков А.П., Большакова Т.Н. Точное исключение транспозона Tn5 в мутантах E.coli K12 с дефектами общего компонента ФТС и субъединиц ДНК-гиразы. Молекулярная генетика, микробиология, вирусология. 2010, 1: 13-16.
3. Aleshkin G.I., Kadzhaev K.V., Markov A.P. High and low UV-dose responses in SOS-induction of the precise excision of transposons Tn1, Tn5, Tn10 in Escherichia coli. Mutation. Res. 1998, 401: 179-191.
4. Brussow H., Canchaya C., Hardt W-D. Phages and the evolution of bacterial pathogens: from genomic rearrangements to lysogenic conversion. Microbiol. Mol. Biol. Rev. 2004, 68 (3): 560-602.
5. Casas V., Maloy S. Role of bacteriophage-encoded exotoxins in the evolution of bacterial pathogens. Future Microbiol. 2011, 6 (12): 1461-1473.
6. Clarke I.N., Cutcliffe L.T., Everson J.S. et al. Chmydia phage Chp2, a skeleton in the phiX174 closet: scaffolding protein and procapsid identification. J. Bacteriol. 2004, 186: 7571-7574.
7. Colasanti J., Denhardt D.T. Mechanism of replication ofbacteriophage phi X174. XXII. Site-specific mutagenesis of the A* gene reveals that A* protein is not essential for phi X174 DNA replication. J. Mol. Biol. 1987, 197 (1): 47-54.
8. Davis B.M., Waldor M.K. Filamentous phages linked to virulence of Vibrio cholerae. Curr. Op. Microbiol. 2003, 6: 35-42.
9. Deutscher J., Francke C., Postma P.W. How phosphotransferase system-related protein phosphorylation regulates carbohydrate metabolism in bacteria. Microbiol. Mol. Biol. Rev. 2006, 70 (4): 939-1031.
10. Huber K.M., Waldor M.K. Filamentous phage integration requires the host recombinases XerC and XerD. Nature. 2002, 417: 656-659.
11. Iliashenko B.N. Sensitivity of the phage and complementary strands of the replicative form of phage ФX174 deoxyribonucleic acid to ultraviolet light. Nature. 1966, 211: 430.
12. Krupovic M., Forterre P. Microviridae goes temperate: Microviruses- related proviruses reside in the genomes of bacteroidetes. PLoS One. 2011, 6 (5): e1983. doi10.371/journal. pone.0019893.
13. Rice K.C., Bayles K.W Molecular control of bacterial death and lysis. Microbiol. Mol. Biol. Rev. 2008, 72 (1): 85-109.
14. Srinivasiah S., Bhavsar J., Thapar K. et al. Phages across the biosphere: contrasts of viruses in soil and aquatic environments. Res. Microbiol. 2008, 159: 349-357.
15. Timakov V.D., Skavronskaya A.G., Iliashenko B.N., Tikhonenko A.S., Favorskaya Ju.N., Borisova N.B. Influence of antisera reacting with deoxyribonucleic acid on the expression of the infectious activity to the single-stranded phage l07 deoxyribonucleic acid. Nature. 1966, 212 (5063): 695-697.
16. Ton-Hoang B., Pasternak C., Siguier P. et al. Single-stranded DNA transposition is coupled to host replication. Cell. 2010, 142: 398-408.
17. Waldor M.K., Mekalanos J.J. Lysogenic conversion by a filamentous phage encoding cholerae toxin. Science. 1996, 272: 1910-1914.
Поступила 27.02.14
Контактная информация: Алешкин Геннадий Иванович, д.м.н., 123098, Москва, ул. Гамалеи, 18
