Научная статья на тему 'Проверка ассоциации однонуклеотидных полиморфизмов генов KIF6, PALLD, SNX19, MYH15, VAMP8 генетического рискометра ишемической болезни сердца с внезапной сердечной смертью'

Проверка ассоциации однонуклеотидных полиморфизмов генов KIF6, PALLD, SNX19, MYH15, VAMP8 генетического рискометра ишемической болезни сердца с внезапной сердечной смертью Текст научной статьи по специальности «Фундаментальная медицина»

CC BY
140
25
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Ключевые слова
ВНЕЗАПНАЯ СЕРДЕЧНАЯ СМЕРТЬ / SUDDEN CARDIAC DEATH / ОДНОНУКЛЕОТИДНЫЙ ПОЛИМОРФИЗМ / MONONUCLEOTIDE POLYMORPHISM / РИСКОМЕТР / RISKOMETER / ГЕН RS20455 / GENE RS20455 / KIF6 / RS7439293 / PALLD / RS2298566 / SNX19 / RS3900940 / MYH15 / RS1010 / VAMP8

Аннотация научной статьи по фундаментальной медицине, автор научной работы — Максимов В. Н., Иванова А. А., Орлов П. С., Савченко С. В., Воевода М. И.

Цель. Исследование ассоциации однонуклеотидных полиморфизмов rs20455 гена KIF6, rs7439293 гена pALLD, rs2298566 гена SNX19, rs3900940 гена MYH15, rs1010 гена VAMp8, включенных в рискометр ишемической болезни сердца в исследовании корпорации Celera (США), с внезапной сердечной смертью. Материал и методы. В исследование включена группа лиц, умерших внезапной сердечной смертью, сформированная по критериям ВОЗ (n=352, средний возраст 53,3±8,9), контрольная группа, подобранная по полу и возрасту из банка ДНК исследований HAPIEE, MONICA (n=381, средний возраст 53,1±8,3), группа подростков (n=296, средний возраст 15,6±0,9). ДНК выделена методом фенол-хлороформной экстракции из миокарда лиц, умерших внезапной сердечной смертью, и венозной крови лиц, включенных в контрольные группы. Генотипирование выполнено методом Real-time PCR с использованием технологии TaqMan-зондов (Applied Biosystems). Результаты. По частотам генотипов и аллелей полиморфизмов rs7439293 гена pALLD, rs2298566 гена SNX19, rs3900940 гена MYH15 не было найдено статистически значимых различий между группами. В группе лиц старше 50 лет, умерших внезапной сердечной смертью, выявлено статистически значимое уменьшение доли носителей генотипа GG полиморфизма rs20455 гена KIF6 (9,0%) по сравнению с контрольной группой (17,8%) (р=0,009, OШ=0,456, 95% ДИ 0,256-0,810). В группе мужчин старше 50 лет, умерших внезапной сердечной смертью, найдено значимое уменьшение доли носителей генотипа СС (8,0%) (р=0,002, OШ=0,328, 95% ДИ 0,159-0,678) и увеличение доли носителей генотипа СТ (49,6%) (р=0,025, OШ=1,729, 95% ДИ 1,084-2,758) полиморфизма rs1010 гена vAMP8 по сравнению с контрольной группой (21,0%, 36,3%, соответственно). Заключение. Полиморфизмы rs20455 гена KIF6 и rs1010 гена VAMP8 ассоциированы с внезапной сердечной смертью.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по фундаментальной медицине , автор научной работы — Максимов В. Н., Иванова А. А., Орлов П. С., Савченко С. В., Воевода М. И.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Evaluation of the genetic riskometer components KIF6, PALLD, SNX19, MYH15, VAMP8 for ischemic heart disease with sudden cardiac death

Aim. The study of mononucleotide polymorphisms associations rs20455 gene KIF6, rs7439293 gene pALLD, rs2298566 gene SNX19, rs3900940 gene MYH15, rs1010 gene VAMP8, included into the Riskometer of ischemic heart disease of the Celera Corporation (USA), in sudden cardiac death. Material and methods. To the study the group of persons included, died from sudden cardiac death, according to the WHO criteria (n=352, mean age 53,3±8,9 y.), control group from matched by age and gender from DNA bank of HAPIEE, MONICA studies (n=381, mean age 53,1±8,3 y.), adolescents group (n=296, mean age 15,6±0,9 y.). DNA extracted via the phenol-chloroform extraction from myocardium of the dyed due to sudden cardiac death, and from venous blood of controls. Genotyping performed with Real-time PCR method using the Taq-Man-catheters technology (Applied Biosystems). Results. The prevalence of alleles rs7439293 gene pALLD, rs2298566 gene SNX19, rs3900940 gene MYH15 did not statistically significantly differ among the groups. In those died suddenly older than 50 years, there was significant decrease of carriers of GG polymorphism rs20455 gene KIF6 (9,0%) comparing to the controls (17,8%) (р=0,009, OR=0,456, 95% CI 0,256-0,810). In men older 50, died suddenly, there was significant decrease of the carriers of genotype СС (8,0%) (р=0,002, OR=0,328, 95% CI 0,159-0,678) and increase of СТ genotype (49,6%) (р=0,025, OR=1,729, 95% CI 1,084-2,758) polymorphism rs1010 gene VAMP8 comparing to the controls (21,0%, 36,3%, respectively). Conclusion. Polymorphisms rs20455 gene KIF6 and rs1010 gene VAMP8 are associated with sudden cardiac death.

Текст научной работы на тему «Проверка ассоциации однонуклеотидных полиморфизмов генов KIF6, PALLD, SNX19, MYH15, VAMP8 генетического рискометра ишемической болезни сердца с внезапной сердечной смертью»

ПРОВЕРКА АССОЦИАЦИИ ОДНОНУКЛЕОТИДНЫХ ПОЛИМОРФИЗМОВ ГЕНОВ К^6, РАSNX19, MYH15, VAMP8 ГЕНЕТИЧЕСКОГО РИСКОМЕТРА ИШЕМИЧЕСКОЙ БОЛЕЗНИ СЕРДЦА С ВНЕЗАПНОЙ СЕРДЕЧНОЙ СМЕРТЬЮ

13 1 12 3 4 12

Максимов В. Н. ' , Иванова А. А. , Орлов П. С. ' , Савченко С. В. ' , Воевода М. И. '

Цель. Исследование ассоциации однонуклеотидных полиморфизмов rs20455 гена KIF6, rs7439293 гена PALLD, rs2298566 гена SNX19, rs3900940 гена MYH15, rs1010 гена VAMP8, включенных в рискометр ишемической болезни сердца в исследовании корпорации Celera (США), с внезапной сердечной смертью.

Материал и методы. В исследование включена группа лиц, умерших внезапной сердечной смертью, сформированная по критериям ВОЗ (n=352, средний возраст — 53,3±8,9), контрольная группа, подобранная по полу и возрасту из банка ДНК исследований HAPIEE, MONICA (n=381, средний возраст — 53,1±8,3), группа подростков (n=296, средний возраст — 15,6±0,9). ДНК выделена методом фенол-хлороформной экстракции из миокарда лиц, умерших внезапной сердечной смертью, и венозной крови лиц, включенных в контрольные группы. Генотипирование выполнено методом Real-time PCR с использованием технологии TaqMan-зондов (Applied Biosystems). Результаты. По частотам генотипов и аллелей полиморфизмов rs7439293 гена PALLD, rs2298566 гена SNX19, rs3900940 гена MYH15 не было найдено статистически значимых различий между группами. В группе лиц старше 50 лет, умерших внезапной сердечной смертью, выявлено статистически значимое уменьшение доли носителей генотипа GG полиморфизма rs20455 гена KIF6 (9,0%) по сравнению с контрольной группой (17,8%) (р=0,009, ОШ=0,456, 95% ДИ 0,256-0,810). В группе мужчин старше 50 лет, умерших внезапной сердечной смертью, найдено значимое уменьшение доли носителей генотипа СС (8,0%) (р=0,002, 0Ш=0,328, 95% ДИ 0,159-0,678) и увеличение доли носителей генотипа СТ (49,6%) (р=0,025, ОШ=1,729, 95% ДИ 1,084-2,758) полиморфизма rs1010 гена VAMP8 по сравнению с контрольной группой (21,0%, 36,3%, соответственно).

Заключение. Полиморфизмы rs20455 гена KIF6 и rs1010 гена VAMP8 ассоциированы с внезапной сердечной смертью.

Российский кардиологический журнал 2015, 10 (126): 12-18

http://dx.doi.org/10.15829/1560-4071-2015-10-12-18

Ключевые слова: внезапная сердечная смерть, однонуклеотидный полиморфизм, рискометр, ген rs20455, KIF6, rs7439293, PALLD, rs2298566, SNX19, rs3900940, MYH15, rs1010, VAMP8.

1ФГБУ Научно-исследовательский институт терапии и профилактической медицины СО РАН, Новосибирск; ^Учреждение РАН — Институт Цитологии и Генетики Сибирского Отделения РАН, Новосибирск; 3ГОУ ВПО Новосибирский государственный медицинский университет Федерального агентства по здравоохранению и социальному развитию; 4ГУЗ Новосибирское областное бюро судебно-медицинской экспертизы, Новосибирск, Россия.

Максимов В. Н. — д.м.н., зав. лабораторией молекулярно-генетических исследований терапевтических заболеваний, Иванова А. А.* — м.н.с. лаборатории молекулярно-генетических исследований терапевтических заболеваний, Орлов П. С. — м.н.с. лаборатории молекулярно-генетических исследований терапевтических заболеваний, Савченко С. В. — д.м.н., профессор кафедры судебной медицины, Воевода М. И. — д.м.н., профессор, член-корр. РАМН, директор.

*Автор, ответственный за переписку (Corresponding author): [email protected]

ВСС — внезапная сердечная смерть, ИБС — ишемическая болезнь сердца, ОНП — однонуклеотидный полиморфизм.

Рукопись получена 25.12.2014 Рецензия получена 22.01.2015 Принята к публикации 28.01.2015

EVALUATION OF THE GENETIC RISKOMETER COMPONENTS KIF6, PALLD, SNX19, MYH15, VAMP8 FOR ISCHEMIC HEART DISEASE WITH SUDDEN CARDIAC DEATH

13 1 12 3 4 12

Maksimov V. N. ' , Ivanova A. A. , Orlov P.S. ' , Savchenko S. V. ' , Voevoda M. I. '

Aim. The study of mononucleotide polymorphisms associations rs20455 gene KIF6, rs7439293 gene PALLD, rs2298566 gene SNX19, rs3900940 gene MYH15, rs1010 gene VAMP8, included into the Riskometer of ischemic heart disease of the Celera Corporation (USA), in sudden cardiac death.

Material and methods. To the study the group of persons included, died from sudden cardiac death, according to the WHO criteria (n=352, mean age — 53,3±8,9 y.), control group from matched by age and gender from DNA bank of HAPIEE, MONICA studies (n=381, mean age — 53,1±8,3 y.), adolescents group (n=296, mean age — 15,6±0,9 y.). DNA extracted via the phenol-chloroform extraction from myocardium of the dyed due to sudden cardiac death, and from venous blood of controls. Genotyping performed with Real-time PCR method using the Taq-Man-catheters technology (Applied Biosystems).

Results. The prevalence of alleles rs7439293 gene PALLD, rs2298566 gene SNX19, rs3900940 gene MYH15 did not statistically significantly differ among the groups. In those died suddenly older than 50 years, there was significant decrease of carriers of GG polymorphism rs20455 gene KIF6 (9,0%) comparing to the controls (17,8%) (p=0,009, OR=0,456, 95% CI 0,256-0,810). In men older 50, died suddenly, there was significant decrease of the carriers of genotype CC (8,0%)

(p=0,002, OR=0,328, 95% CI 0,159-0,678) and increase of CT genotype (49,6%) (p=0,025, OR=1,729, 95% CI 1,084-2,758) polymorphism rs1010 gene VAMP8 comparing to the controls (21,0%, 36,3%, respectively). Conclusion. Polymorphisms rs20455 gene KIF6 and rs1010 gene VAMP8 are associated with sudden cardiac death.

Russ J Cardiol 2015, 10 (126): 12-18

http://dx.doi.org/10.15829/1560-4071-2015-10-12-18

Key words: sudden cardiac death, mononucleotide polymorphism, riskometer, gene rs20455, KIF6, rs7439293, PALLD, rs2298566, SNX19, rs3900940, MYH15, rs1010, VAMP8.

1FSBI Scientific-Research Institute of Therapy and Prevention Medicine of SD RAS, Novosibirsk; 2RAS Institution The Institute of Cytology and Genetics of Siberian RAS Department, Novosibirsk; 3SEI HPE Novosibirsk State Medical University of the Federal Agency for Healthcare and Social Development, Novosibirsk; 4SHI Novosibirsk Regional Bureau of Forensic Medicine, Novosibirsk, Russia.

В 2007г американской корпорацией Celera было проведено крупномасштабное исследование с целью создания генетической шкалы риска ишемической болезни сердца (ИБС) и оценки ее информативности в отношении данной нозологии без учета традиционных факторов риска [1]. В исследование было включено пять однонуклеотидных полиморфизмов (ОНП) rs20455 гена KIF6, rs7439293 гена PALLD, rs2298566 гена SNX19, rs3900940 гена MYH15, rs1010 гена VAMP8. Ранее исследуемые полиморфизмы были найдены ассоциированными с ИБС и инфарктом миокарда по данным ряда исследований, в том числе исследования ARIC (Atherosclerosis Risk in Communities study). В основу исследования Celera легла другая работа по созданию генетической шкалы риска ИБС, в которую были включены 10 ОНП [2]. Но, в ходе ряда исследований случай-контроль, пять из десяти ОНП не подтвердили свою ассоциацию с ИБС, поэтому в исследовании корпорации Celera, целью которого было создание шкалы высокого генетического риска, данные ОНП включены не были. Для каждого участника исследования был проведен расчет индивидуального генетического риска. При наличии носительства патологического гомозиготного генотипа риск увеличивался на 1, при носительстве гетерозиготного генотипа риск не изменялся, а при носи-тельстве непатологического аллеля в гомозиготной форме риск уменьшался на 1. В качестве высокого генетического риска был принят риск 3 и более. При статистической обработке полученных данных оказалось, что высокий генетический риск ассоциирован с ИБС (ОШ=1,64), после учета традиционных факторов риска (дислипидемии, артериальная гипертензия и другие), ассоциация сохранилась почти неизменной (ОШ=1,57). В когорте ARIC лица с высоким генетическим риском ИБС составили 4% [1].

Основной причиной развития внезапной сердечной смерти (ВСС) у лиц среднего возраста и старше является ИБС. Поэтому генетические маркеры риска ИБС могут быть информативными и в отношении риска развития ВСС.

Ген KIF6 (6p21.2) кодирует один из белков суперсемейства кинезинов, которые регулируют внутриклеточный транспорт органелл, протеиновых комплексов и мРНК; rs20455 гена KIF6 ассоциирован с ИБС и инфарктом миокарда по данным нескольких исследований [3-6].

Ген PALLD (4q32.3) кодирует белок палладин, который входит в состав микрофиламентов, контролирует клеточную форму, адгезию, клеточное взаимодействие. rs7439293 гена PALLD исследован в качестве генетического маркера риска атеросклероза сонных артерий и различных его исходов (инфаркт, инсульт, смерть) [7].

Ген SNX19 кодирует сортирующий нексин 19 (11q25), входящий в состав мембраны цитоплазмати-

ческих пузырьков, участвует в процессах клеточного взаимодействия и транспорта протеинов.

Ген MYH15 (3q13.13) кодирует тяжелую цепь миозина. Белок миозин играет важную роль в двигательной активности, входит в состав миофибрилл и мио-зиновых филаментов.

Ген VAMP8 (2p11.2) кодирует протеин SNAP25, который входит в состав белкового комплекса синап-тических пузырьков, rs1010 гена VAMP8 ассоциирован с риском развития ИБС у женщин пожилого возраста [4]. На китайской популяции показано, что Т-аллель полиморфизма является аллелем риска развития ИБС [8].

Ранее в мире исследований ассоциации полиморфизмов rs20455 гена KIF6, rs7439293 гена PALLD, rs2298566 гена SNX19, rs3900940 гена MYH15, rs1010 гена VAMP8 с ВСС проведено не было.

Материал и методы

В группу ВСС (n=352) были включены внезапно умершие лица, подвергнутые судебно-медицинской экспертизе и подходящие по критериям ВСС, по МКБ-10 ВОЗ, которые определяют ВСС как смерть сердечного генеза, наступившую в течение одного часа с момента возникновения первых симптомов, а при отсутствии свидетелей смерти допускается увеличение временного периода до 24 часов. В группу не были включены лица, умершие от инфаркта миокарда, который не относится по МКБ-10 к ВСС. Также из группы ВСС были исключены лица с признаками кардиомиопатий по данным аутопсии. Средний возраст умерших составил 53,30±8,85 лет, женщины составили 30,1%, мужчины — 69,9%. На аутопсии была забрана ткань миокарда в количестве 5-10 г, из которой в дальнейшем методом фенол-хлороформной экстракции выделена ДНК.

Контрольная группа (n=381) была подобрана по полу и возрасту из банка ДНК международных исследований HAPIEE (Health, Alcohol and Psychosocial factors In Eastern Europe) и MONICA (Multinational MONItoring of trends and determinants in CArdiovascular disease). Средний возраст в контрольной группе составил 53,12±8,36 лет, женщин было 32,3%, мужчин — 67,7%.

Группа подростков (n=296) сформирована из учащихся общеобразовательных школ, участвовавших в одномоментном популяционном исследовании школьников, проведенном НИИ терапии СО РАМН в 2003г. Группа подростков сформирована с целью оценки возможной динамики частот генотипов в разных возрастных группах. ДНК подростков выделена методом фенол-хлороформной экстракции из венозной крови. Средний возраст в группе составил 15,59±0,93 лет, девочек было 16,9%, мальчиков — 83,1%.

Генотипирование по выбранным однонуклеотид-ным полиморфизмам выполнено методом ПЦР

Таблица 1

Частоты генотипов полиморфизмов ге20455 гена К^6, ге7439293 гена PALLD, ге2298566 гена SNX19, rs3900940 гена MYH15, ге1010 гена VAMP8

Ген Однонуклеотидный Генотип ВСС Контрольная группа Подростки

полиморфизм n % n % n %

SNX19 rs2298566 AA 18 5,4 14 3,7 16 5,5

AC 108 32,4 125 33,2 94 32,2

CC 207 62,2 238 63,1 182 62,3

Итого: 333 100,0 377 100,0 292 100,0

KIF6 rs20455 AA 148 43,1 141 37,4 115 39,1

AG 160 46,6 170 45,1 142 48,3

GG 35 10,2 66 17,5 37 12,6

Итого: 343 100,0 377 100,0 294 100,0

PALLD rs7439293 AA 114 34,1 128 34,0 103 35,2

AG 180 53,9 195 51,7 146 49,8

GG 40 12,0 54 14,3 44 15,0

Итого: 334 100,0 377 100,0 293 100,0

VAMP8 rs1010 СС 38 11,1 62 16,8 35 11,9

CT 158 46,2 153 41,4 158 53,7

TT 146 42,7 155 41,9 101 34,4

Итого: 342 100,0 370 100,0 294 100,0

MYH15 rs3900940 СС 34 9,9 34 9,2 37 16,6

CT 131 38,1 133 35,9 113 38,4

TT 179 52,0 203 54,9 144 49

Итого: 344 100,0 370 100,0 294 100,0

в реальном времени с использованием технологии TaqMan-зондов (Applied Biosystems, USA) по протоколам фирмы производителя на приборах StepOne Plus и AB 7900НТ (Applied Biosystems, USA). Полученные результаты статистически обработаны с помощью пакета программ SPSS 11.5, определены частоты генотипов, изучаемых ОНП в группе ВСС и в контрольных группах. В контрольной группе и группе подростков с использованием критерия хи-квадрат оценено соответствие наблюдаемых частот генотипов равновесию Харди-Вайнберга. Сравнение групп по частотам генотипов выполнялось с помощью таблиц сопряжённости с использованием крите-2

рия c по Пирсону. В случае четырёхпольных таблиц применяли точный двусторонний критерий Фишера с поправкой Йетса на непрерывность. В качестве уровня значимости использовали p<0,05. Относительный риск ВСС по конкретному генотипу вычисляли как отношение шансов с использованием точного двухстороннего критерия Фишера и критерия хи-квадрат по Пирсону.

В контрольной группе на предмет ассоциации с выбранными полиморфизмами рассмотрены параметры внутреннего гомеостаза, такие как холестерин, ЛПВН, ЛПНП, триглицериды, артериальное давление, которые выступают в качестве модифицируемых факторов риска развития ИБС и, следовательно, ВСС. Нормальность распределения параметров

исследовали с использованием теста Колмогорова-Смирнова. При нормальном распределении дальнейшие расчеты производились с использованием теста ANOVA, в остальных случаях использовали тест Кру-скала-Уоллиса. В качестве уровня значимости также использовали p<0,05.

Исследование одобрено этическим комитетом НИИ терапии и профилактической медицины СО РАМН.

Результаты

Частоты генотипов полиморфизмов rs20455 гена KIF6, rs7439293 гена PALLD, rs2298566 гена SNX19, rs3900940 гена MYH15 в контрольной группе и группе подростков находятся в равновесии Харди-Вайнберга (табл. 1). По частотам генотипов rs1010 гена VAMP8

в контрольной группе и группе подростков выявлено

2

отклонение от равновесия Харди-Вайнберга (с =5,08, р<0,005; с =5,11, р<0,005, соответственно). Для исключения ошибок генотипирования rs1010 гена VAMP8, часть образцов ДНК была проверена с помощью секвенирования по Сэнгеру.

Не было найдено статистически значимых различий между группами по частотам генотипов rs7439293 гена PALLD, rs2298566 гена SNX19, rs3900940 гена MYH15.

В группе ВСС обнаружено статистически значимое уменьшение доли носителей генотипа GG поли-

p,%

ВСС; AA; 43,1

ВСС; AG; 46,6

Контрольная

группа; AG; 45,1

Р, %

50,2

ВСС; TT; 40,2

Контрольная группа; TT; 40,5

ВСС; AA; 43,6

Контрольная

ВСС; AG; 47,4

Контрольная

группа; AG; 44,8

■ ВСС

■ Контрольная группа

Рис. 1. Частоты генотипов полиморфизма ге20455 гена KIF6 в группе ВСС и контрольной группе.

Р, %

■ ВСС

■ Контрольная группа

Рис. 2. Частоты генотипов полиморфизма rs20455 гена KIF6 в группе ВСС и контрольной группе старше 50 лет.

р, %

49,6

ВСС; TT; 42,3

Контрольная группа; TT; 42,7

■ ВСС

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

■ Контрольная группа

Рис. 3. Частоты генотипов ге1010 гена VAMP8 в группе ВСС и контрольной группе старше 50 лет.

■ ВСС

■ Контрольная группа

Рис. 4. Частоты генотипов ге1010 гена VAMP8 в группе ВСС и контрольной группе мужчин старше 50 лет.

морфизма rs20455 гена KIF6 (10,2%) по сравнению с контрольной группой (17,5%) (ОШ=0,535, 95% ДИ 0,345-0,831, р=0,005) (рис. 1). При дальнейшем разделении групп по полу и возрасту данное различие сохранялось только в группе лиц старше 50 лет (рис. 2). В группе лиц, умерших ВСС в возрасте старше 50 лет, наблюдалось статистически значимое уменьшение доли носителей генотипа GG полиморфизма rs20455 гена KIF6 (9,0%) по сравнению с контрольной группой (17,8%) (ОШ=0,456, 95% ДИ 0,2560,810, р=0,009). Возраст 50 лет выбран с целью разделения случаев ВСС с предположительно разной патогенетической основой. Как для любого мульти-факторного состояния, для ВСС характерен больший вклад в развитие генетических факторов в более молодом возрасте, тогда как в возрасте старше 50 лет в развитие ВСС вносят вклад другие факторы, в частности ИБС.

По частотам генотипов полиморфизма rs1010 гена VAMP8 не найдено статистически значимых различий

между группой ВСС и контрольной группой. Но при разделении групп по полу и возрасту найдены статистически значимые различия в группе старше 50 лет (рис. 3), в дальнейшем при разделении этой группы по полу ассоциация сохранилась в группе мужчин (рис. 4). Так доля носителей генотипа СТ в группе мужчин старше 50 лет, умерших ВСС (49,6%), значимо больше, чем в контрольной группе соответствующего пола и возраста (36,3%) (ОШ=1,729, 95% ДИ 1,084-2,729, р=0,025). В группе мужчин старше 50 лет, умерших ВСС, доля носителей генотипа СС (8,0%) значимо меньше по сравнению с контрольной группой (21,0%) (ОШ=0,328, 95% ДИ 0,159-0,678, р=0,002).

При сравнении группы подростков с контрольной группой и группой ВСС найдены статистически значимые различия по частотам генотипов rs1010 гена VAMP8 и rs20455 гена KIF6.

По частотам генотипов rs1010 гена VAMP8 наблюдается снижение носителей генотипа СТ в контроль-

р, %

Контрольная

ВСС; TT; 45,6 Контрольная ВСС; CT; 45,2 группа; TT; 44,6

р, %

52 3 группа , CT; 39

64,6

ВСС; AA; 49,5

Контрольная группа; AA;

Подростки Контрольная группа ВСС

Подростки Контрольная группа ВСС

Контрольная группа; AG; 405

ВСС; AG; 40,2

Контрольная группа; GG; 17,2

Подростки; GG;_

14,6 ВСС;

GG; 10,3

Рис. 5. Частоты генотипов ге1010 гена VAMP8 в группе подростков, контроль- Рис. 6. Частоты генотипов ^20455 гена №6 в группе подростков, контрольной группе и группе ВСС (мужской пол). ной группе и группе ВСС (женский пол).

ной группе (41,4%) по сравнению с группой подростков (53,6%) (ОШ=1,636, 95% ДИ 1,202-2,227, р=0,002). При дальнейшем анализе данная ассоциация сохранилась у мужчин исследуемых групп (рис. 5). Так у мужчин контрольной группы доля генотипов СТ меньше по сравнению с группой мальчиков-подростков (ОШ=1,854, 95% ДИ 1,297-2,650, р=0,001). Помимо этого, в контрольной группе мужчин наблюдается увеличение доли носителей генотипов ТТ (44,6%) по сравнению с группой мальчиков-подростков (34,4%) (ОШ=1,544, 95% ДИ 1,075-2,219, р=0,022). Тоже увеличение носителей генотипов ТТ наблюдается и в группе мужчин, умерших ВСС (45,6%), по сравнению с группой мальчиков-подростков (34,4%) (ОШ=1,608, 95% ДИ 1,109-2,329, р=0,014).

По частотам генотипов ге20455 гена К№6 наблюдается статистически значимое различие в контрольной группе женщин и группе девочек-подростков. Сходные различия определяются и между группой девочек-подростков и группой женщин, умерших ВСС (рис. 6). Так в контрольной группе женщин наблюдается увеличение доли носительниц генотипа АА (49,5%) по сравнению с группой девочек-подростков (20,8%) (ОШ=2,779, 95% ДИ 1,264-6,111, р=0,012). В группе женщин, умерших ВСС, и группе девочек-подростков различия сохраняются (ОШ=3,722, 95% ДИ 1,669-8,303, р=0,001). В контрольной группе женщин и в группе женщин, умерших ВСС, статистически значимо меньше носительниц генотипа AG (40,5%, 40,2%, соответственно) по сравнению с группой девочек-подростков (64,6%) (ОШ=0,374, 95% ДИ 0,186-0,751, р=0,006; ОШ=0,369, 95% ДИ 0,180-0,756, р=0,008, соответственно).

По показателям внутреннего гомеостаза с уровнем диастолического артериального давления ассоцииро-

ван rs2298566 гена SNX19, других ассоциаций полиморфизмов с внутренними показателями выявить не удалось.

Обсуждение

В исследование корпорации Celera были включены наиболее информативные в отношении риска развития ИБС полиморфизмы генов на момент исследования: rs20455 гена KIF6, rs7439293 гена PALLD, rs2298566 гена SNX19, rs3900940 гена MYH15, rs1010 гена VAMP8. Из исследования были исключены однонуклеотидные полиморфизмы, которые, хотя бы в одном исследовании, не подтвердили своей ассоциации с ИБС [1, 2]. Исследуемые гены показали неоднократную ассоциацию с ИБС, инфарктом миокарда и нарушениями липидного обмена в крупных многоцентровых исследованиях — например, ARIC, и нескольких исследованиях йцф\случай-контроль [6-8]. Мы предположили, что данные полиморфизмы вносят свой вклад и в развитие ВСС, как одной из форм ИБС. Кроме того, ИБС и ВСС имеют сходную патогенетическую основу. Ранее данные полиморфизмы не были изучены на наличие ассоциации с ВСС.

Согласно полученным нами результатам, полиморфизмы rs7439293 гена PALLD, rs2298566 гена SNX19, rs3900940 гена MYH15 не показали ассоциации с ВСС. Проведенное после исследования Celera исследование случай-контроль rs7439293 гена PALLD не выявило ассоциации полиморфизма с развитием атеросклероза сонных артерий и его фатальными исходами (инфаркт, инсульт, смерть) [7]. Исследований rs2298566 гена SNX19 с риском развития сердечно-сосудистых заболеваний проведено ранее не было; rs3900940 гена MYH15 был найден ассоциированным не только с ИБС, но и с некардиоэмболи-ческим инсультом [9].

Обнаруженное в группе ВСС статистически значимое уменьшение доли носителей генотипа GG полиморфизма rs20455 гена KIF6 по сравнению с контрольной группой свидетельствует об условно-протектив-ной роли генотипа GG в отношении развития ВСС. Но, так как в ходе дальнейшего анализа выяснилось, что данная закономерность сохраняется только в группе лиц старше 50 лет, можно сделать вывод о большей условно-протективной роли генотипа именно в этой возрастной группе. В двух мировых проспективных исследованиях CARE (Cholesterol and Recurrent Events), WOSCOPS (West of Scotland Coronary Prevention Study) показана ассоциация полиморфизма с риском развития инфаркта миокарда, ИБС и положительная роль статинов, влияющая на этот риск [6]. Также показана ассоциация G аллеля этого полиморфизма с инфарктом миокарда и ИБС у женщин в исследовании Women's Health Study [5]. Ряд исследований случай-контроль не подтвердили описанную в предыдущих публикациях ассоциацию G-аллеля с ИБС и инфарктом миокарда: так, у жителей Коста-Рики G-аллель полиморфизма не увеличивает риск развития инфаркта миокарда, то же отсутствие ассоциации ОНП с ИБС показано в двух крупных рандомизированных исследованиях [10, 11]. Полученные нами результаты не противоречат данным предыдущих мировых исследований, поскольку исследования касались только ИБС и инфаркта миокарда, а ВСС, хотя и имеет сходную патофизиологическую основу с ИБС, но является отдельной нозологической формой со своими патогенетическими особенностями. Кроме того, нами были обнаружены статистически значимые различия между группой подростков, контрольной группой и группой ВСС по частотам генотипов полиморфизма. В контрольной группе женщин и группе женщин, умерших ВСС, наблюдается увеличение доли носительниц генотипа АА по сравнению с группой девочек — подростков. Помимо этого, в контрольной группе женщин и в группе женщин, умерших ВСС, статистически значимо меньше носительниц генотипа AG по сравнению с группой девочек-подростков. Полученные данные свидетельствуют о возрастной динамике частот генотипов в популяции, с возрастом из популяции элиминируются носительницы генотипа AG с соответственным увеличением носительниц генотипа АА в популяции. Но, судя по результатам исследования, данная динамика не обусловлена ВСС.

Также возрастная динамика генотипов показана для полиморфизма rs1010 гена VAMP8.

Наблюдается снижение доли носителей генотипа СТ в контрольной группе по сравнению с подростками, но при дальнейшем анализе данная ассоциация сохранилась только у мужской части исследуемых групп. Так, у мужчин контрольной группы доля носителей генотипа СТ меньше по сравнению с группой мальчиков-подростков. Параллельно с этим в конт-

рольной группе мужчин и группе мужчин, умерших ВСС, наблюдается увеличение доли носителей генотипов ТТ по сравнению с группой мальчиков-подростков. Полученные данные свидетельствуют о выбывании из популяции с возрастом носителей генотипа СТ, с соответствующим увеличением доли носителей генотипа ТТ. Отклонение наблюдаемых частот генотипов от равновесия Харди-Вайнберга в контрольной группе и группе подростков может быть связано с выявленной возрастной динамикой генотипов. Вклад ошибок генотипирования в отклонение от равновесия Харди-Вайнберга в контрольных группах был исключен с помощью секвенирования. Полученные статистически значимые различия в контрольной группе и группе ВСС по частотам генотипов полиморфизма rs1010 гена VAMP8 в группе мужчин старше 50 лет свидетельствуют о вкладе генотипа СТ в развитие ВСС, и об условно-протективной роли генотипа СС в отношении развития ВСС в данной возрастной и половой группе. Роль генотипа СТ в развитии ВСС может объяснять выбывание мужчин — носителей данного генотипа — из популяции с возрастом. Полученные данные не противоречат результатам мировых исследований. Так, в Китае показано, что Т-аллель ассоциирован с риском ИБС [8].

По показателям внутреннего гомеостаза с уровнем диастолического артериального давления ассоциирован rs2298566 гена SNX19. Исследований данного полиморфизма с риском развития других сердечнососудистых заболеваний, кроме исследования Celera, проведено не было, полученная ассоциация может лишь косвенно свидетельствовать о вкладе полиморфизма в развитие артериальной гипертензии.

Заключение

Впервые проведено исследование ассоциации полиморфизмов rs20455 гена KIF6, rs7439293 гена PALLD, rs2298566 гена SNX19, rs3900940 гена MYH15, rs1010 гена VAMP8 с ВСС. Мужчины — носители генотипа СТ rs1010 гена VAMP8 — в возрасте старше 50 лет имеют повышенный риск развития ВСС. Генотип СС rs1010 гена VAMP8 в группе мужчин старше 50 лет и генотип GG полиморфизма rs20455 гена KIF6 в группе старше 50 лет обладают условно-протектив-ной ролью в отношении развития ВСС.

Благодарности. Авторы выражают глубокую признательность академику Юрию Петровичу Никитину и профессору Софье Константиновне Малютиной за предоставленную возможность сформировать контрольную группу на материале когорт HAPIEE и MONICA, а также д.м.н. Диане Вахтанговне Денисовой за предоставленную возможность сформировать группу подростков.

Работа поддержана грантом РФФИ № 10-04-01448а.

Литература

1. Bare LA, Morrison AC, Rowland CM, et al. Five common variants identify elevated genetic risk for coronary heart disease. Genetics in medicine 2007; 10: 682-9.

2. Morrison AC, Bare LA, Chambless LE, et al. Prediction of coronary heart disease risk using a genetic risk score: the atherosclerosis risk in communities study. American journal of epidemiology 2007; 1: 28-35.

3. Wu G1, Li GB, Dai B. Association of KIF6 variant with lipid level and angiographic coronary artery disease events risk in the Han Chinese population. Molecules 2012; 17(9): 11269-80.

4. Akao H, Polisecki E, Kajinami K, et al. KIF6, LPA, TAS2R50, and VAMP8 genetic variation, low density lipoprotein cholesterol lowering response to pravastatin, and heart disease risk reduction in the elderly. Atherosclerosis 2012; 220(2): 456-62.

5. Shiffman D, Chasman DI, Zee R, et al. A kinesin family member 6 variant is associated with coronary heart disease in the Women's Health Study. J Am Coll Cardiol 2008; 51(4): 444-8.

6. lakoubova OA, Tong CH, Rowland CM, et al. Association of the Trp719Arg polymorphism in kinesin-like protein 6 with myocardial infarction and coronary heart disease in 2 prospective trials: the CARE and WOSCOPS trials. J Am Coll Cardiol 2008; 51(4): 435-43.

Данные уточнённые критерии вступают в силу для статей, поступивших в редакцию с 01.10.2015.

Причины отказа в первичном рассмотрении (до устранения, но не более двух существенных доработок):

♦ неправильное оформление рукописи согласно общим требованиям;

♦ библиография или текст содержат гиперссылки, свидетельствующие о копировании материала из Интернета;

♦ библиография или текст содержат разнящиеся элементы структуры текста (интервалы, шрифты, кегли и т.п.), что свидетельствует о "лоскутной" его природе;

♦ библиография оформлена разнородно, что свидетельствует о вторичности её содержимого;

♦ проверка в системе Антиплагиат, без учёта библиографии, показала значительную долю заимствованного текста;

♦ опечатки в названии, подзаголовках, именах авторов, свидетельствующие о небрежности и невы-читанности текста перед отправкой;

♦ большое количество ошибок и опечаток в резюме, неадекватная структура резюме, неадекватное содержание резюме — статья далее не рассматривается.

Причины отказа при первичном рассмотрении (до устранения — не более двух раз, или без возможности коррекции):

1) текстологические

♦ язык текста не удовлетворяет критериям научного стиля;

7. Hoke M, Schillinger M, Dick P, et al. Polymorphism of the palladin gene and cardiovascular outcome in patients with atherosclerosis. Eur J Clin Invest 2011; 41(4): 365-71.

8. Duan CC, Xu LX, Chen Q. Association of the polymorphism of synaptobrevins/vesicle-associated membrane proteins 8 gene with coronary heart disease in Chinese Han population. Zhonghua Yi Xue Yi Chuan Xue Za Zhi 2010; 27(3): 329-32.

9. Luke MM, Lalouschek W, Rowland CM, et al. Polymorphisms associated with both noncardioembolic stroke and coronary heart disease: vienna stroke registry. Cerebrovasc Dis 2009; 28(5): 499-504.

10. Bare LA, Ruiz-Narvaéz EA, Tong CH, et al. Investigation of KIF6 Trp719Arg in a case-control study of myocardial infarction: a Costa Rican population. PLoS One 2010; 5(9): e13081.

11. Arsenault BJ, Boekholdt SM, Hovingh GK, et al. The 719Arg variant of KIF6 and cardiovascular outcomes in statin-treated, stable coronary patients of the treating to new targets and incremental decrease in end points through aggressive lipid-lowering prospective studies. Circ Cardiovasc Genet 2012; 5(1): 51-7.

♦ язык текста не даёт целостной и чёткой картины, в нём нет однозначности и ясности цели и методов исследования (для оригинальной статьи), нет чётко поставленной проблемы, не обозначена актуальность и необходимость написания этого текста в общем (для обзора литературы);

♦ русский язык текста (для русскоязычных авторов) грамматически и стилистически не выверен, текст косноязычен;

♦ большое количество ошибок и опечаток, включая пунктуацию.

2) научные

♦ недостаточно обоснованы новизна и актуальность текста, их достаточность для публикации;

♦ недостаточно обоснована ценность проблемы;

♦ библиография содержит преимущественно старые ссылки при наличии достаточного количества современной литературы на данную тему;

♦ в тексте не прочитывается осознанность и критическое осмысление материала авторами, не содержатся указания на ограничения, недостатки работы;

♦ текст не даёт возможности выделить конкретный вопрос, которому он посвящён, и увидеть предлагаемый авторами ответ на этот вопрос;

♦ текст не воспринимается как научно и стилистически законченный, логически завершённый.

Причины отказа после рецензирования зависят от содержания рецензии.

Основные причины отказа в публикации в Российском кардиологическом журнале

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.